seq1 = pF1KE0932.tfa, 1233 bp seq2 = pF1KE0932/gi568815587f_12664278.tfa (gi568815587f:12664278_13037219), 372942 bp >pF1KE0932 1233 >gi568815587f:12664278_13037219 (Chr11) 1-157 (100001-100157) 100% -> 158-222 (197973-198037) 100% -> 223-285 (200561-200623) 100% -> 286-420 (215431-215565) 100% -> 421-467 (216728-216774) 100% -> 468-529 (217619-217680) 98% -> 530-654 (218724-218848) 100% -> 655-828 (237663-237836) 100% -> 829-969 (260635-260775) 100% -> 970-1122 (265897-266049) 100% -> 1123-1233 (272832-272942) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGAAAGGATGAGTGACTCTGCAGATAAGCCAATTGACAATGATGCAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGAAAGGATGAGTGACTCTGCAGATAAGCCAATTGACAATGATGCAGA 50 . : . : . : . : . : 51 AGGGGTCTGGAGCCCCGACATCGAGCAAAGCTTTCAGGAGGCCCTGGCTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 AGGGGTCTGGAGCCCCGACATCGAGCAAAGCTTTCAGGAGGCCCTGGCTA 100 . : . : . : . : . : 101 TCTATCCACCATGTGGGAGGAGGAAAATCATCTTATCAGACGAAGGCAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 TCTATCCACCATGTGGGAGGAGGAAAATCATCTTATCAGACGAAGGCAAA 150 . : . : . : . : . : 151 ATGTATG GTAGGAATGAATTGATAGCCAGATACATCAAACT |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| 100151 ATGTATGGTA...CAGGTAGGAATGAATTGATAGCCAGATACATCAAACT 200 . : . : . : . : . : 192 CAGGACAGGCAAGACGAGGACCAGAAAACAG GTGTCTAGTC |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| 198007 CAGGACAGGCAAGACGAGGACCAGAAAACAGGTA...CAGGTGTCTAGTC 250 . : . : . : . : . : 233 ACATTCAGGTTCTTGCCAGAAGGAAATCTCGTGATTTTCATTCCAAGCTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 200571 ACATTCAGGTTCTTGCCAGAAGGAAATCTCGTGATTTTCATTCCAAGCTA 300 . : . : . : . : . : 283 AAG GATCAGACTGCAAAGGATAAGGCCCTGCAGCACATGGC |||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 200621 AAGGTA...AAGGATCAGACTGCAAAGGATAAGGCCCTGCAGCACATGGC 350 . : . : . : . : . : 324 GGCCATGTCCTCAGCCCAGATCGTCTCGGCCACTGCCATTCATAACAAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 215469 GGCCATGTCCTCAGCCCAGATCGTCTCGGCCACTGCCATTCATAACAAGC 400 . : . : . : . : . : 374 TGGGGCTGCCTGGGATTCCACGCCCGACCTTCCCAGGGGCGCCGGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>> 215519 TGGGGCTGCCTGGGATTCCACGCCCGACCTTCCCAGGGGCGCCGGGGGTA 450 . : . : . : . : . : 421 TTCTGGCCGGGAATGATTCAAACAGGGCAGCCAGGATCCTCACA ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 215569 ...CAGTTCTGGCCGGGAATGATTCAAACAGGGCAGCCAGGATCCTCACA 500 . : . : . : . : . : 465 AGA TGTCAAGCCTTTTGTGCAGCAGGCCTACCCCATCCAGC |||>>>...>>> ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 216772 AGAGTA...CAGCGTCAAGCCTTTTGTGCAGCAGGCCTACCCCATCCAGC 550 . : . : . : . : . : 506 CAGCGGTCACAGCCCCCATTCCAG GGTTTGAGCCTGCATCG ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 217657 CAGCGGTCACAGCCCCCATTCCAGGTG...CAGGGTTTGAGCCTGCATCG 600 . : . : . : . : . : 547 GCCCCAGCTCCCTCAGTCCCTGCCTGGCAAGGTCGCTCCATTGGCACAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 218741 GCCCCAGCTCCCTCAGTCCCTGCCTGGCAAGGTCGCTCCATTGGCACAAC 650 . : . : . : . : . : 597 CAAGCTTCGCCTGGTGGAATTTTCAGCTTTTCTCGAGCAGCAGCGAGACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 218791 CAAGCTTCGCCTGGTGGAATTTTCAGCTTTTCTCGAGCAGCAGCGAGACC 700 . : . : . : . : . : 647 CAGACTCG TACAACAAACACCTCTTCGTGCACATTGGGCAT ||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||| 218841 CAGACTCGGTG...CAGTACAACAAACACCTCTTCGTGCACATTGGGCAT 750 . : . : . : . : . : 688 GCCAACCATTCTTACAGTGACCCATTGCTTGAATCAGTGGACATTCGTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 237696 GCCAACCATTCTTACAGTGACCCATTGCTTGAATCAGTGGACATTCGTCA 800 . : . : . : . : . : 738 GATTTATGACAAATTTCCTGAAAAGAAAGGTGGCTTAAAGGAACTGTTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 237746 GATTTATGACAAATTTCCTGAAAAGAAAGGTGGCTTAAAGGAACTGTTTG 850 . : . : . : . : . : 788 GAAAGGGCCCTCAAAATGCCTTCTTCCTCGTAAAATTCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> 237796 GAAAGGGCCCTCAAAATGCCTTCTTCCTCGTAAAATTCTGGGTG...CAG 900 . : . : . : . : . : 829 GCTGATTTAAACTGCAATATTCAAGATGATGCTGGGGCTTTTTATGGTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 260635 GCTGATTTAAACTGCAATATTCAAGATGATGCTGGGGCTTTTTATGGTGT 950 . : . : . : . : . : 879 AACCAGTCAGTACGAGAGTTCTGAAAATATGACAGTCACCTGTTCCACCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 260685 AACCAGTCAGTACGAGAGTTCTGAAAATATGACAGTCACCTGTTCCACCA 1000 . : . : . : . : . : 929 AAGTTTGCTCCTTTGGGAAGCAAGTAGTAGAAAAAGTAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> 260735 AAGTTTGCTCCTTTGGGAAGCAAGTAGTAGAAAAAGTAGAGGTA...CAG 1050 . : . : . : . : . : 970 ACGGAGTATGCAAGGTTTGAGAATGGCCGATTTGTATACCGAATAAACCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 265897 ACGGAGTATGCAAGGTTTGAGAATGGCCGATTTGTATACCGAATAAACCG 1100 . : . : . : . : . : 1020 CTCCCCAATGTGTGAATATATGATCAACTTCATCCACAAGCTCAAACACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 265947 CTCCCCAATGTGTGAATATATGATCAACTTCATCCACAAGCTCAAACACT 1150 . : . : . : . : . : 1070 TACCAGAGAAATATATGATGAACAGTGTTTTGGAAAACTTCACAATTTTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 265997 TACCAGAGAAATATATGATGAACAGTGTTTTGGAAAACTTCACAATTTTA 1200 . : . : . : . : . : 1120 TTG GTGGTAACAAACAGGGATACACAAGAAACTCTACTCTG |||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 266047 TTGGTA...CAGGTGGTAACAAACAGGGATACACAAGAAACTCTACTCTG 1250 . : . : . : . : . : 1161 CATGGCCTGTGTGTTTGAAGTTTCAAATAGTGAACACGGAGCACAACATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 272870 CATGGCCTGTGTGTTTGAAGTTTCAAATAGTGAACACGGAGCACAACATC 1300 . : . : 1211 ATATTTACAGGCTTGTAAAGGAC ||||||||||||||||||||||| 272920 ATATTTACAGGCTTGTAAAGGAC