Result of FASTA (omim) for pF1KE0893
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0893, 347 aa
  1>>>pF1KE0893 347 - 347 aa - 347 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9399+/-0.000464; mu= 18.5833+/- 0.029
 mean_var=85.3595+/-22.272, 0's: 0 Z-trim(108.0): 283  B-trim: 1049 in 1/52
 Lambda= 0.138819
 statistics sampled from 15657 (16082) to 15657 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.53), E-opt: 0.2 (0.189), width:  16
 Scan time:  6.450

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 1149 240.7 3.3e-63
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 1147 240.3 4.3e-63
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 1147 240.3 4.3e-63
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 1055 221.8 1.5e-57
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 1027 216.2 7.4e-56
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314)  960 202.8 8.2e-52
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311)  940 198.8 1.3e-50
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314)  928 196.4 6.9e-50
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327)  916 194.0 3.8e-49
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312)  880 186.8 5.4e-47
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308)  878 186.4 7.1e-47
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300)  874 185.6 1.2e-46
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317)  874 185.6 1.3e-46
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307)  864 183.6 4.9e-46
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317)  864 183.6   5e-46
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317)  864 183.6   5e-46
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317)  864 183.6   5e-46
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311)  851 181.0   3e-45
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314)  841 179.0 1.2e-44
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309)  789 168.6 1.6e-41
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320)  571 124.9 2.3e-28
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318)  543 119.3 1.1e-26
NP_003848 (OMIM: 603691) galanin receptor type 2 [ ( 387)  214 53.5 8.9e-07
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444)  204 51.6 3.9e-06
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461)  204 51.6   4e-06
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339)  193 49.3 1.5e-05
NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1  ( 326)  191 48.8 1.9e-05
NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326)  191 48.8 1.9e-05
NP_000862 (OMIM: 601109) 5-hydroxytryptamine recep ( 440)  192 49.2 2.1e-05
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318)  190 48.6 2.2e-05
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic  ( 408)  185 47.7 5.2e-05
XP_011535421 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) P ( 671)  187 48.4 5.5e-05
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332)  183 47.2 5.9e-05
NP_000360 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) thyr ( 764)  187 48.4   6e-05
XP_005268094 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) P ( 764)  187 48.4   6e-05
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423)  184 47.5 6.1e-05
XP_011521963 (OMIM: 600446) PREDICTED: adenosine r ( 116)  175 45.2 8.7e-05
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389)  180 46.7  0.0001
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425)  180 46.7 0.00011
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425)  180 46.7 0.00011
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425)  180 46.7 0.00011
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323)  178 46.2 0.00012
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325)  176 45.8 0.00015
NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor  ( 418)  177 46.1 0.00016
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor  ( 428)  177 46.2 0.00016
NP_003605 (OMIM: 603692) galanin receptor type 3 [ ( 368)  174 45.5 0.00022
NP_033611 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359)  170 44.7 0.00038
NP_000676 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359)  170 44.7 0.00038
NP_114438 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 388)  170 44.7  0.0004
NP_004826 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394)  170 44.7  0.0004


>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep  (322 aa)
 initn: 1168 init1: 1147 opt: 1149  Z-score: 1255.7  bits: 240.7 E(85289): 3.3e-63
Smith-Waterman score: 1149; 55.0% identity (80.1% similar) in 311 aa overlap (35-345:9-318)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KE0 YRLKLMKEAVLVKLPFTSLPLLLQTLSRKSRDMEIKNYSSSTSGFILLGLSSNPKLQKPL
                                     : :   : .::.: :.::::: .:. :. :
XP_011                       MGDRRADPRPMSGTN-QSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLL
                                     10         20        30       

           70        80        90       100       110       120    
pF1KE0 FAIFLIMYLLAAVGNVLIIPAIYSDPRLHTPMYFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLS
       :..:: ::: ...::.::: ..  :  ::::::::::::::.::::. . :::::.: . 
XP_011 FVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHIL
        40        50        60        70        80        90       

          130       140       150       160       170       180    
pF1KE0 ETKVISYVGCLAQMYFFMAFGNTDSYLLASMAIDRLVAICNPLHYDVVMKPRHCLLMLLG
       ::..::. :::.:::: . : . :..::: :: :..::.:.:::: . :  . : :.. :
XP_011 ETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAG
       100       110       120       130       140       150       

          190       200       210       220       230       240    
pF1KE0 SYSISHLHSLFRVLLMSRLSFCASHIIKHFFCDTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLAVI
        . ...:. :...:::. :::::.. : :::::. :.::::::::  .......:   :.
XP_011 LWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVM
       160       170       180       190       200       210       

          250       260       270       280       290       300    
pF1KE0 VTPFLCTIFSYLQIIVTVLRIPSAARKWKAFSTCGSHLTAVALFYGSIIYVYFRPLSMYS
       .::::: . ::..:  :::..::.  .:::::::::::..: :::..:: ::: ::: .:
XP_011 ITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHS
       220       230       240       250       260       270       

          310       320       330       340         
pF1KE0 VVRDRVATVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDMKRGLKKLQDRIYR  
       . .: .:::.:::::::::::::::::. .: .:::.  :.    
XP_011 AEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
       280       290       300       310       320  

>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo   (312 aa)
 initn: 1168 init1: 1147 opt: 1147  Z-score: 1253.7  bits: 240.3 E(85289): 4.3e-63
Smith-Waterman score: 1147; 55.6% identity (81.1% similar) in 302 aa overlap (44-345:7-308)

            20        30        40        50        60        70   
pF1KE0 VLVKLPFTSLPLLLQTLSRKSRDMEIKNYSSSTSGFILLGLSSNPKLQKPLFAIFLIMYL
                                     ::.: :.::::: .:. :. ::..:: :::
NP_036                         MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYL
                                       10        20        30      

            80        90       100       110       120       130   
pF1KE0 LAAVGNVLIIPAIYSDPRLHTPMYFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSETKVISYVG
        ...::.::: ..  :  ::::::::::::::.::::. . :::::.: . ::..::. :
NP_036 ATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCG
         40        50        60        70        80        90      

           140       150       160       170       180       190   
pF1KE0 CLAQMYFFMAFGNTDSYLLASMAIDRLVAICNPLHYDVVMKPRHCLLMLLGSYSISHLHS
       ::.:::: . : . :..::: :: :..::.:.:::: . :  . : :.. : . ...:. 
NP_036 CLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNV
        100       110       120       130       140       150      

           200       210       220       230       240       250   
pF1KE0 LFRVLLMSRLSFCASHIIKHFFCDTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLAVIVTPFLCTIF
       :...:::. :::::.. : :::::. :.::::::::  .......:   :..::::: . 
NP_036 LLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILA
        160       170       180       190       200       210      

           260       270       280       290       300       310   
pF1KE0 SYLQIIVTVLRIPSAARKWKAFSTCGSHLTAVALFYGSIIYVYFRPLSMYSVVRDRVATV
       ::..:  :::..::.  .:::::::::::..: :::..:: ::: ::: .:. .: .:::
NP_036 SYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATV
        220       230       240       250       260       270      

           320       330       340         
pF1KE0 MYTVVTPMLNPFIYSLRNKDMKRGLKKLQDRIYR  
       .:::::::::::::::::. .: .:::.  :.    
NP_036 LYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
        280       290       300       310  

>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep  (312 aa)
 initn: 1168 init1: 1147 opt: 1147  Z-score: 1253.7  bits: 240.3 E(85289): 4.3e-63
Smith-Waterman score: 1147; 55.6% identity (81.1% similar) in 302 aa overlap (44-345:7-308)

            20        30        40        50        60        70   
pF1KE0 VLVKLPFTSLPLLLQTLSRKSRDMEIKNYSSSTSGFILLGLSSNPKLQKPLFAIFLIMYL
                                     ::.: :.::::: .:. :. ::..:: :::
XP_011                         MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYL
                                       10        20        30      

            80        90       100       110       120       130   
pF1KE0 LAAVGNVLIIPAIYSDPRLHTPMYFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSETKVISYVG
        ...::.::: ..  :  ::::::::::::::.::::. . :::::.: . ::..::. :
XP_011 ATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCG
         40        50        60        70        80        90      

           140       150       160       170       180       190   
pF1KE0 CLAQMYFFMAFGNTDSYLLASMAIDRLVAICNPLHYDVVMKPRHCLLMLLGSYSISHLHS
       ::.:::: . : . :..::: :: :..::.:.:::: . :  . : :.. : . ...:. 
XP_011 CLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNV
        100       110       120       130       140       150      

           200       210       220       230       240       250   
pF1KE0 LFRVLLMSRLSFCASHIIKHFFCDTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLAVIVTPFLCTIF
       :...:::. :::::.. : :::::. :.::::::::  .......:   :..::::: . 
XP_011 LLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILA
        160       170       180       190       200       210      

           260       270       280       290       300       310   
pF1KE0 SYLQIIVTVLRIPSAARKWKAFSTCGSHLTAVALFYGSIIYVYFRPLSMYSVVRDRVATV
       ::..:  :::..::.  .:::::::::::..: :::..:: ::: ::: .:. .: .:::
XP_011 SYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATV
        220       230       240       250       260       270      

           320       330       340         
pF1KE0 MYTVVTPMLNPFIYSLRNKDMKRGLKKLQDRIYR  
       .:::::::::::::::::. .: .:::.  :.    
XP_011 LYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
        280       290       300       310  

>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo   (312 aa)
 initn: 1043 init1: 884 opt: 1055  Z-score: 1154.1  bits: 221.8 E(85289): 1.5e-57
Smith-Waterman score: 1055; 52.3% identity (81.2% similar) in 304 aa overlap (44-347:7-309)

            20        30        40        50        60        70   
pF1KE0 VLVKLPFTSLPLLLQTLSRKSRDMEIKNYSSSTSGFILLGLSSNPKLQKPLFAIFLIMYL
                                     :  : :.:::.: .:. :. :: .:: :::
NP_002                         MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYL
                                       10        20        30      

            80        90       100       110       120       130   
pF1KE0 LAAVGNVLIIPAIYSDPRLHTPMYFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSETKVISYVG
       ...::::::: :: :: :::::.::::.:::: :. :.:  .::::::. :..:.:::.:
NP_002 VTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVYFFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAG
         40        50        60        70        80        90      

           140       150       160       170       180       190   
pF1KE0 CLAQMYFFMAFGNTDSYLLASMAIDRLVAICNPLHYDVVMKPRHCLLMLLGSYSISHLHS
       ::.:.::....   :. .:: :: :: :::: :::: ..:.:. :.:.:   . .: :..
NP_002 CLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAYDRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYG
        100       110       120       130       140       150      

           200       210       220       230       240       250   
pF1KE0 LFRVLLMSRLSFCASHIIKHFFCDTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLAVIVTPFLCTIF
       :...:::.:..::.:. :...::.   .:...::. . .. :...    ... ::  .:.
NP_002 LIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIFCEMYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVII
        160       170       180       190       200       210      

           260       270       280       290       300       310   
pF1KE0 SYLQIIVTVLRIPSAARKWKAFSTCGSHLTAVALFYGSIIYVYFRPLSMYSVVRDRVATV
       ::. :: ..:::::...:.::::::.::: ::.::::.. .::..::  ::: .: ::::
NP_002 SYVLIIRAILRIPSVSKKYKAFSTCASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSV-KDSVATV
        220       230       240       250       260        270     

           320       330       340          
pF1KE0 MYTVVTPMLNPFIYSLRNKDMKRGLKKLQDRIYR   
       ::.:::::.::::::::::::. .: .: :. ..   
NP_002 MYAVVTPMMNPFIYSLRNKDMHGALGRLLDKHFKRLT
         280       290       300       310  

>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho  (312 aa)
 initn: 1122 init1: 1007 opt: 1027  Z-score: 1123.8  bits: 216.2 E(85289): 7.4e-56
Smith-Waterman score: 1027; 51.9% identity (77.9% similar) in 308 aa overlap (37-344:1-307)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KE0 LKLMKEAVLVKLPFTSLPLLLQTLSRKSRDMEIKNYSSSTSGFILLGLSSNPKLQKPLFA
                                     :: .: .   : :.:::::..:.::  ::.
NP_001                               MEAENLTE-LSKFLLLGLSDDPELQPVLFG
                                              10        20         

         70        80        90       100       110       120      
pF1KE0 IFLIMYLLAAVGNVLIIPAIYSDPRLHTPMYFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSET
       .:: :::....::.::: :. :: .::::::::::::::.:::: .. ::::::.. ...
NP_001 LFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARS
      30        40        50        60        70        80         

        130       140       150       160       170       180      
pF1KE0 KVISYVGCLAQMYFFMAFGNTDSYLLASMAIDRLVAICNPLHYDVVMKPRHCLLMLLGSY
       : :::.:::.:.::.: :.. :..::: :: ::.::::.:::: :.:.:  : :..:.:.
NP_001 KDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAYDRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASW
      90       100       110       120       130       140         

        190       200       210       220       230       240      
pF1KE0 SISHLHSLFRVLLMSRLSFCASHIIKHFFCDTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLAVIVT
        :    :: ..:::.::.: ..  : ::::.   :::..::.:  ...:... :  . : 
NP_001 FIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCEPAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVF
     150       160       170       180       190       200         

        250       260       270       280       290       300      
pF1KE0 PFLCTIFSYLQIIVTVLRIPSAARKWKAFSTCGSHLTAVALFYGSIIYVYFRPLSMYSVV
       :    .::: ::. ... . :.  :.:::::::::: .:.::::. . ::.     .:  
NP_001 PVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFSTCGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQ
     210       220       230       240       250       260         

        310       320       330       340         
pF1KE0 RDRVATVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDMKRGLKKLQDRIYR  
        . .:.:::..::::::::::::::::.: .:..: .:     
NP_001 SSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGALERLLSRADSCP
     270       280       290       300       310  

>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo   (314 aa)
 initn: 999 init1: 953 opt: 960  Z-score: 1051.2  bits: 202.8 E(85289): 8.2e-52
Smith-Waterman score: 960; 47.7% identity (75.8% similar) in 302 aa overlap (40-341:6-306)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KE0 MKEAVLVKLPFTSLPLLLQTLSRKSRDMEIKNYSSSTSGFILLGLSSNPKLQKPLFAIFL
                                     .::.  :  :::::. . :.::  :: .::
NP_006                          MEFTDRNYTLVTE-FILLGFPTRPELQIVLFLMFL
                                        10         20        30    

      70        80        90       100       110       120         
pF1KE0 IMYLLAAVGNVLIIPAIYSDPRLHTPMYFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSETKVI
        .: .  .::. ..  :  ::.:.::::::::::::.:.:. . ::::::::::::.: :
NP_006 TLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSI
           40        50        60        70        80        90    

     130       140       150       160       170       180         
pF1KE0 SYVGCLAQMYFFMAFGNTDSYLLASMAIDRLVAICNPLHYDVVMKPRHCLLMLLGSYSIS
       :: ::  :.::: .:..:.:..::.:: :: ::::::: : :::.   :. ... ::  .
NP_006 SYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGG
          100       110       120       130       140       150    

     190       200       210       220       230       240         
pF1KE0 HLHSLFRVLLMSRLSFCASHIIKHFFCDTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLAVIVTPFL
       .. :: .. .   :..: ...:.:::::  :.:::::.::. .. .. :   .: .  :.
NP_006 NMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFI
          160       170       180       190       200       210    

     250       260       270       280       290       300         
pF1KE0 CTIFSYLQIIVTVLRIPSAARKWKAFSTCGSHLTAVALFYGSIIYVYFRPLSMYSVVRDR
         :.::. :...::.: : . . :.::::.::::.:... :.....: ::  .::   :.
NP_006 IIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDK
          220       230       240       250       260       270    

     310       320       330       340         
pF1KE0 VATVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDMKRGLKKLQDRIYR  
       . .:.::.  :.:::.::::::::.: . .:.        
NP_006 IISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
          280       290       300       310    

>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H  (311 aa)
 initn: 983 init1: 940 opt: 940  Z-score: 1029.6  bits: 198.8 E(85289): 1.3e-50
Smith-Waterman score: 940; 48.3% identity (74.7% similar) in 296 aa overlap (49-344:13-308)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KE0 PFTSLPLLLQTLSRKSRDMEIKNYSSSTSGFILLGLSSNPKLQKPLFAIFLIMYLLAAVG
                                     :::::.:. :.. : ::.:::..:. . . 
NP_001                   MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAW
                                 10        20        30        40  

       80        90       100       110       120       130        
pF1KE0 NVLIIPAIYSDPRLHTPMYFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSETKVISYVGCLAQM
       :. .:  :  : .::::::::::::::.:.:. .  ::::: :.:.: ..:..:::. :.
NP_001 NLSLIVLIRMDSHLHTPMYFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQY
             50        60        70        80        90       100  

      140       150       160       170       180       190        
pF1KE0 YFFMAFGNTDSYLLASMAIDRLVAICNPLHYDVVMKPRHCLLMLLGSYSISHLHSLFRVL
       ..: ..: ..: :...:: :: .:::::: :. .:.:  :. :.::.:  .   :::.. 
NP_001 FIFSTMGLSESCLMTAMAYDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIG
            110       120       130       140       150       160  

      200       210       220       230       240       250        
pF1KE0 LMSRLSFCASHIIKHFFCDTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLAVIVTPFLCTIFSYLQI
        . .: ::.:..:.:::::   .: :::.::   :...   :.   ..  :  ..::  :
NP_001 ALLQLHFCGSNVIRHFFCDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYI
            170       180       190       200       210       220  

      260       270       280       290       300       310        
pF1KE0 IVTVLRIPSAARKWKAFSTCGSHLTAVALFYGSIIYVYFRPLSMYSVVRDRVATVMYTVV
        .....: ::  . :::.::.::::::.::: : :.::.   :  :   :: :.:.::::
NP_001 GISIMKITSAKGRSKAFNTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVV
            230       240       250       260       270       280  

      320       330       340       
pF1KE0 TPMLNPFIYSLRNKDMKRGLKKLQDRIYR
        :::::.:::::::..: .::.:: :   
NP_001 IPMLNPLIYSLRNKEIKDALKRLQKRKCC
            290       300       310 

>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo   (314 aa)
 initn: 971 init1: 897 opt: 928  Z-score: 1016.6  bits: 196.4 E(85289): 6.9e-50
Smith-Waterman score: 928; 46.8% identity (76.3% similar) in 308 aa overlap (37-344:1-307)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KE0 LKLMKEAVLVKLPFTSLPLLLQTLSRKSRDMEIKNYSSSTSGFILLGLSSNPKLQKPLFA
                                     :  :::.: :  :.::::... .::  :: 
NP_003                               MTRKNYTSLTE-FVLLGLADTLELQIILFL
                                             10         20         

         70        80        90       100       110       120      
pF1KE0 IFLIMYLLAAVGNVLIIPAIYSDPRLHTPMYFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSET
       .::..: :...::. .:  :  : .:::::::::.::::.:.: .:.:.::::...::: 
NP_003 FFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMYFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEK
      30        40        50        60        70        80         

        130       140       150       160       170       180      
pF1KE0 KVISYVGCLAQMYFFMAFGNTDSYLLASMAIDRLVAICNPLHYDVVMKPRHCLLMLLGSY
       :.::..::. :::::.....:.  :.. :: :: .::: :: :...:.    : :  :..
NP_003 KTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAYDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAF
      90       100       110       120       130       140         

        190       200       210       220       230       240      
pF1KE0 SISHLHSLFRVLLMSRLSFCASHIIKHFFCDTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLAVIVT
       . . :. .  .  .: :::: :..:.:::::. :..:::::::  .. .    . . :: 
NP_003 AAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCDSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVG
     150       160       170       180       190       200         

        250       260       270       280       290       300      
pF1KE0 PFLCTIFSYLQIIVTVLRIPSAARKWKAFSTCGSHLTAVALFYGSIIYVYFRPLSMYSVV
        .:  . ::  .. ... . :.  . .:::::.:::::. :::.. ::.:.:: : ::. 
NP_003 TLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFSTCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLN
     210       220       230       240       250       260         

        310       320       330       340           
pF1KE0 RDRVATVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDMKRGLKKLQDRIYR    
       .:.::.:.:::: :::::.:::::.:..:..: .. .:       
NP_003 QDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKALANVISRKRTSSFL
     270       280       290       300       310    

>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo   (327 aa)
 initn: 960 init1: 668 opt: 916  Z-score: 1003.4  bits: 194.0 E(85289): 3.8e-49
Smith-Waterman score: 916; 44.4% identity (77.1% similar) in 306 aa overlap (37-338:1-306)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KE0 LKLMKEAVLVKLPFTSLPLLLQTLSRKSRDMEIKNYSSSTSGFILLGLSSNPKLQKPLFA
                                     :: .:.:. .: :.:::. .   ::  :::
NP_003                               MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFA
                                             10        20        30

         70        80        90       100       110       120      
pF1KE0 IFLIMYLLAAVGNVLIIPAIYSDPRLHTPMYFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSET
       ..:. :.:. . :.::: :: .   :: ::::::.:.::..: ..:: .::::..:..  
NP_003 LLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPMYFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSK
               40        50        60        70        80        90

            130       140       150       160       170       180  
pF1KE0 K----VISYVGCLAQMYFFMAFGNTDSYLLASMAIDRLVAICNPLHYDVVMKPRHCLLML
       .    .::. ::..:.:::...: :.  ::: :: :: .::: :::: :... : :. : 
NP_003 QDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLLAVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMA
              100       110       120       130       140       150

            190       200       210       220       230       240  
pF1KE0 LGSYSISHLHSLFRVLLMSRLSFCASHIIKHFFCDTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLA
        ::.. .   :. .:.:.: ::.:. .::.:::::..:.:.:::.: :..... .  .. 
NP_003 AGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIINHFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIF
              160       170       180       190       200       210

            250       260       270       280       290       300  
pF1KE0 VIVTPFLCTIFSYLQIIVTVLRIPSAARKWKAFSTCGSHLTAVALFYGSIIYVYFRPLSM
       ... :.  :  ::. :  .:..::::: ..::::::.::::.: .::.. :..: :: ..
NP_003 ILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRYKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKAL
              220       230       240       250       260       270

            310       320       330       340                   
pF1KE0 YSVVRDRVATVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDMKRGLKKLQDRIYR            
        .   .....:.:.:..:.:::.:: :::...::.:                     
NP_003 SAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
              280       290       300       310       320       

>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo   (312 aa)
 initn: 901 init1: 880 opt: 880  Z-score: 964.7  bits: 186.8 E(85289): 5.4e-47
Smith-Waterman score: 880; 44.6% identity (74.5% similar) in 298 aa overlap (44-341:5-302)

            20        30        40        50        60        70   
pF1KE0 VLVKLPFTSLPLLLQTLSRKSRDMEIKNYSSSTSGFILLGLSSNPKLQKPLFAIFLIMYL
                                     ::: ::.:::.: .: :.. ::.. :  ::
NP_009                           MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYL
                                         10        20        30    

            80        90       100       110       120       130   
pF1KE0 LAAVGNVLIIPAIYSDPRLHTPMYFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSETKVISYVG
       :. :::.:::     ::.::.:::::::::::.:.::::  ::.::::. .  :.::.. 
NP_009 LTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMYFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLD
           40        50        60        70        80        90    

           140       150       160       170       180       190   
pF1KE0 CLAQMYFFMAFGNTDSYLLASMAIDRLVAICNPLHYDVVMKPRHCLLMLLGSYSISHLHS
       : .:...:...:.:.  ::. ::.:: ::.:.:::: ....:: :  .   .. :. ..:
NP_009 CSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVES
          100       110       120       130       140       150    

           200       210       220       230       240       250   
pF1KE0 LFRVLLMSRLSFCASHIIKHFFCDTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLAVIVTPFLCTIF
       . ..    .: :: .. .  : :..  ...::: ::: ... : . .. ..:.:.   . 
NP_009 VVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILV
          160       170       180       190       200       210    

           260       270       280       290       300       310   
pF1KE0 SYLQIIVTVLRIPSAARKWKAFSTCGSHLTAVALFYGSIIYVYFRPLSMYSVVRDRVATV
       ::  :  .:::: ::  . :::.::.::::.:.:::.:.: ::..: . :.  : .   .
NP_009 SYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGL
          220       230       240       250       260       270    

           320       330       340           
pF1KE0 MYTVVTPMLNPFIYSLRNKDMKRGLKKLQDRIYR    
       .:.: :: :::.::.::::.. :....:          
NP_009 FYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRAFRRLLGKEMGLTQS
          280       290       300       310  




347 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 03:57:55 2016 done: Sat Nov  5 03:57:56 2016
 Total Scan time:  6.450 Total Display time:  0.030

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com