Result of FASTA (ccds) for pF1KE0816
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0816, 226 aa
  1>>>pF1KE0816 226 - 226 aa - 226 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4495+/-0.00105; mu= 13.0582+/- 0.062
 mean_var=154.0864+/-52.307, 0's: 0 Z-trim(105.2): 382  B-trim: 1047 in 2/46
 Lambda= 0.103322
 statistics sampled from 7793 (8295) to 7793 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.255), width:  16
 Scan time:  1.510

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14      ( 324) 1062 170.6   1e-42
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14      ( 330)  967 156.5 1.9e-38
CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14      ( 345)  898 146.2 2.4e-35
CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14     ( 326)  858 140.2 1.5e-33
CCDS76655.1 OR11H2 gene_id:79334|Hs108|chr14       ( 326)  851 139.2   3e-33
CCDS74807.1 OR11H1 gene_id:81061|Hs108|chr22       ( 326)  841 137.7 8.5e-33
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1        ( 312)  715 118.9 3.8e-27
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11          ( 327)  702 117.0 1.5e-26
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1         ( 317)  686 114.6 7.6e-26
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1        ( 325)  680 113.7 1.4e-25
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14       ( 313)  659 110.5 1.2e-24
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6         ( 312)  658 110.4 1.4e-24
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7        ( 311)  646 108.6 4.7e-24
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17        ( 310)  644 108.3 5.7e-24
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1        ( 308)  642 108.0   7e-24
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6        ( 311)  641 107.8 7.8e-24
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15       ( 313)  639 107.6 9.7e-24
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1         ( 314)  638 107.4 1.1e-23
CCDS31541.1 OR6Q1 gene_id:219952|Hs108|chr11       ( 317)  637 107.3 1.2e-23
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9       ( 318)  634 106.8 1.6e-23
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1       ( 322)  634 106.8 1.6e-23
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11      ( 311)  633 106.7 1.8e-23
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1        ( 317)  632 106.5   2e-23
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11      ( 311)  631 106.4 2.2e-23
CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12      ( 312)  631 106.4 2.2e-23
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11       ( 315)  630 106.2 2.5e-23
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11      ( 311)  629 106.1 2.7e-23
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14       ( 313)  627 105.8 3.3e-23
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11       ( 313)  625 105.5 4.1e-23
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12       ( 311)  624 105.3 4.5e-23
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1       ( 317)  624 105.3 4.6e-23
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11       ( 318)  622 105.0 5.7e-23
CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11       ( 323)  619 104.6 7.8e-23
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1       ( 335)  616 104.2 1.1e-22
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9       ( 347)  616 104.2 1.1e-22
CCDS31704.1 OR10G8 gene_id:219869|Hs108|chr11      ( 311)  614 103.8 1.3e-22
CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12      ( 312)  614 103.8 1.3e-22
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6          ( 313)  614 103.8 1.3e-22
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6          ( 321)  614 103.8 1.3e-22
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17         ( 312)  612 103.5 1.6e-22
CCDS58241.1 OR2AP1 gene_id:121129|Hs108|chr12      ( 309)  610 103.2 1.9e-22
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11       ( 315)  609 103.1 2.2e-22
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14       ( 310)  607 102.8 2.6e-22
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11       ( 311)  607 102.8 2.6e-22
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9       ( 319)  606 102.6   3e-22
CCDS30902.1 OR6K2 gene_id:81448|Hs108|chr1         ( 324)  605 102.5 3.3e-22
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7       ( 310)  604 102.3 3.6e-22
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12      ( 316)  604 102.3 3.6e-22
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14        ( 311)  602 102.0 4.4e-22
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11         ( 314)  602 102.0 4.4e-22


>>CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14           (324 aa)
 initn: 1094 init1: 1062 opt: 1062  Z-score: 880.3  bits: 170.6 E(32554): 1e-42
Smith-Waterman score: 1062; 68.1% identity (85.4% similar) in 226 aa overlap (1-226:11-236)

                         10        20        30        40        50
pF1KE0           MNNSQISTVTQFVVLGFPGPWKIQIIFFSMILLVYIFTLTGNMAIICAVR
                 :: :    ::.:..::::: :::::..::..:..:..:: :: ::: :::
CCDS32 MSFFFVDLRPMNRSATHIVTEFILLGFPGCWKIQIFLFSLFLVIYVLTLLGNGAIIYAVR
               10        20        30        40        50        60

               60        70        80        90       100       110
pF1KE0 WDHRLHTPMYVLLANFSFLEIWYVTCTVPNMLVNFFSKTKTISFSGCFTQFHFFFSLGTT
        .  :::::: ::.::.:::::::. :.::::::..::::.::::::: ::.::::::::
CCDS32 CNPLLHTPMYFLLGNFAFLEIWYVSSTIPNMLVNILSKTKAISFSGCFLQFYFFFSLGTT
               70        80        90       100       110       120

              120       130       140       150       160       170
pF1KE0 ECFFLCVMAYDRYLAICHPLHYPSIMTGQLCGILVSLCWLIGFLGHSISIFFIFQLPFCG
       ::.:: ::::::::::::::.::.::: ..:: :::.::::::::. : ::.: ::::::
CCDS32 ECLFLAVMAYDRYLAICHPLQYPAIMTVRFCGKLVSFCWLIGFLGYPIPIFYISQLPFCG
              130       140       150       160       170       180

              180       190       200       210       220          
pF1KE0 PNIIDHFLCDVDPLMALSSAPTHIIGHVFHSVSSLFINLTMVYILGSYTLVLRTVL    
       ::::::::::.::::::: ::. :   .:.. ::: . .: .::: :: :.: .:.    
CCDS32 PNIIDHFLCDMDPLMALSCAPAPITECIFYTQSSLVLFFTSMYILRSYILLLTAVFQVPS
              190       200       210       220       230       240

CCDS32 AAGRRKAFSTCGSHLVVVSLFYGTVMVMYVSPTYGIPTLLQKILTLVYSVTTPLFNPLIY
              250       260       270       280       290       300

>>CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14           (330 aa)
 initn: 960 init1: 960 opt: 967  Z-score: 803.7  bits: 156.5 E(32554): 1.9e-38
Smith-Waterman score: 967; 63.9% identity (83.7% similar) in 227 aa overlap (3-226:21-244)

                                 10        20        30        40  
pF1KE0                   MNNSQISTVTQFVVLGFPGPWKIQIIFFSMILLVYIFTLTGN
                           :  .  ::.::.::: :  ..:  :::.::..:..:: ::
CCDS32 MFFIIHSLVTSVFLTALGPQNRTMHFVTEFVLLGFHGQREMQSCFFSFILVLYLLTLLGN
               10        20        30        40        50        60

             50        60        70        80        90       100  
pF1KE0 MAIICAVRWDHRLHTPMYVLLANFSFLEIWYVTCTVPNMLVNFFSKTKTISFSGCFTQFH
        ::.:::. :.:::::::.::.::.::::::.. ::::::::..:. ::::::::: ::.
CCDS32 GAIVCAVKLDRRLHTPMYILLGNFAFLEIWYISSTVPNMLVNILSEIKTISFSGCFLQFY
               70        80        90       100       110       120

            110       120       130       140       150       160  
pF1KE0 FFFSLGTTECFFLCVMAYDRYLAICHPLHYPSIMTGQLCGILVSLCWLIGFLGHSISIFF
       ::::::::::::: :::::::::::.::::::::::..: ::: .::. ::: . . : .
CCDS32 FFFSLGTTECFFLSVMAYDRYLAICRPLHYPSIMTGKFCIILVCVCWVGGFLCYPVPIVL
              130       140       150       160       170       180

            170       180         190        200       210         
pF1KE0 IFQLPFCGPNIIDHFLCDVDPLMALS--SAP-THIIGHVFHSVSSLFINLTMVYILGSYT
       : ::::::::::::..::  ::.::.  ::: :..: ..:.:   ..:   .. ::::::
CCDS32 ISQLPFCGPNIIDHLVCDPGPLFALACISAPSTELICYTFNS---MIIFGPFLSILGSYT
              190       200       210       220          230       

     220                                                           
pF1KE0 LVLRTVL                                                     
       ::.:.::                                                     
CCDS32 LVIRAVLCIPSGAGRTKAFSTCGSHLMVVSLFYGTLMVMYVSPTSGNPAGMQKIITLVYT
       240       250       260       270       280       290       

>>CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14           (345 aa)
 initn: 898 init1: 898 opt: 898  Z-score: 747.9  bits: 146.2 E(32554): 2.4e-35
Smith-Waterman score: 898; 59.6% identity (79.4% similar) in 223 aa overlap (4-226:42-264)

                                          10        20        30   
pF1KE0                            MNNSQISTVTQFVVLGFPGPWKIQIIFFSMILL
                                     :. :: : :..:::: : . ::..: .. .
CCDS32 NLIPHLCLHRHSVIAGAFTIHRHMKIFNSPSNSSTFTGFILLGFPCPREGQILLFVLFTV
              20        30        40        50        60        70 

            40        50        60        70        80        90   
pF1KE0 VYIFTLTGNMAIICAVRWDHRLHTPMYVLLANFSFLEIWYVTCTVPNMLVNFFSKTKTIS
       ::..:: :: .:::::.::.:::.:::.:::::::::: ::: :::.::.::.: :: ::
CCDS32 VYLLTLMGNGSIICAVHWDQRLHAPMYILLANFSFLEICYVTSTVPSMLANFLSDTKIIS
              80        90       100       110       120       130 

           100       110       120       130       140       150   
pF1KE0 FSGCFTQFHFFFSLGTTECFFLCVMAYDRYLAICHPLHYPSIMTGQLCGILVSLCWLIGF
       ::::: ::.::::::.:::::: :::.:::::::.::.::.::: .::  ::  ::..::
CCDS32 FSGCFLQFYFFFSLGSTECFFLAVMAFDRYLAICRPLRYPTIMTRRLCTNLVVNCWVLGF
             140       150       160       170       180       190 

           160       170       180       190       200       210   
pF1KE0 LGHSISIFFIFQLPFCGPNIIDHFLCDVDPLMALSSAPTHIIGHVFHSVSSLFINLTMVY
       .   : :  : :. :::  ::::::::  ::..:.     .:  ::  .: : . . ...
CCDS32 IWFLIPIVNISQMSFCGSRIIDHFLCDPAPLLTLTCKKGPVIELVFSVLSPLPVFMLFLF
             200       210       220       230       240       250 

           220                                                     
pF1KE0 ILGSYTLVLRTVL                                               
       :.:::.::.:.::                                               
CCDS32 IVGSYALVVRAVLRVPSAAGRRKAFSTCGSHLAVVSLFYGSVLVMYGSPPSKNEAGKQKT
             260       270       280       290       300       310 

>>CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14          (326 aa)
 initn: 858 init1: 858 opt: 858  Z-score: 715.9  bits: 140.2 E(32554): 1.5e-33
Smith-Waterman score: 858; 57.3% identity (80.0% similar) in 225 aa overlap (3-226:18-241)

                              10        20        30        40     
pF1KE0                MNNSQISTVTQFVVLGFPGPWKIQIIFFSMILLVYIFTLTGNMAI
                        ::... :..:.. ::   : :::..::..  .: .:.::: ::
CCDS32 MCPLTLQVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFTCEWTIQIFLFSLFTTTYALTITGNGAI
               10        20        30        40        50        60

          50         60        70        80        90       100    
pF1KE0 ICAVRW-DHRLHTPMYVLLANFSFLEIWYVTCTVPNMLVNFFSKTKTISFSGCFTQFHFF
          : : : :::::::..:.::::::::::. :::.:::::.:. :.:::.::: ::.::
CCDS32 AF-VLWCDWRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFYFF
                70        80        90       100       110         

          110       120       130       140       150       160    
pF1KE0 FSLGTTECFFLCVMAYDRYLAICHPLHYPSIMTGQLCGILVSLCWLIGFLGHSISIFFIF
       :::::.::..: :::.:.:::::.:: ::.::::.::. :: :::. :::   : : .: 
CCDS32 FSLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLCAKLVILCWVCGFLWFLIPIVLIS
     120       130       140       150       160       170         

          170       180       190       200       210       220    
pF1KE0 QLPFCGPNIIDHFLCDVDPLMALSSAPTHIIGHVFHSVSSLFINLTMVYILGSYTLVLRT
       :.:::::::::: .::  : .::. . .  :    ...::: :  ....:.:::::::..
CCDS32 QMPFCGPNIIDHVVCDPGPRFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVLKA
     180       190       200       210       220       230         

                                                                   
pF1KE0 VL                                                          
       ::                                                          
CCDS32 VLGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSSLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVTPL
     240       250       260       270       280       290         

>>CCDS76655.1 OR11H2 gene_id:79334|Hs108|chr14            (326 aa)
 initn: 851 init1: 851 opt: 851  Z-score: 710.3  bits: 139.2 E(32554): 3e-33
Smith-Waterman score: 851; 57.3% identity (80.0% similar) in 225 aa overlap (3-226:18-241)

                              10        20        30        40     
pF1KE0                MNNSQISTVTQFVVLGFPGPWKIQIIFFSMILLVYIFTLTGNMAI
                        ::... :..:.. ::   : :::..::..  .: .:.::: ::
CCDS76 MCPLTLHVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFSCEWTIQIFLFSLFTTIYALTITGNGAI
               10        20        30        40        50        60

          50         60        70        80        90       100    
pF1KE0 ICAVRW-DHRLHTPMYVLLANFSFLEIWYVTCTVPNMLVNFFSKTKTISFSGCFTQFHFF
          : : :.:::::::..:.::::::::::. :::.:::::.:. :.:::.::: ::.::
CCDS76 AF-VLWCDRRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFYFF
                70        80        90       100       110         

          110       120       130       140       150       160    
pF1KE0 FSLGTTECFFLCVMAYDRYLAICHPLHYPSIMTGQLCGILVSLCWLIGFLGHSISIFFIF
       :::::.::..: :::.:.:::::.:: ::.::::.: . :: :::. :::   : : .: 
CCDS76 FSLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLYAKLVILCWVCGFLWFLIPIVLIS
     120       130       140       150       160       170         

          170       180       190       200       210       220    
pF1KE0 QLPFCGPNIIDHFLCDVDPLMALSSAPTHIIGHVFHSVSSLFINLTMVYILGSYTLVLRT
       : :::::::::: .::  ::.::. . .  :    ...::: :  ....:.:::::::..
CCDS76 QKPFCGPNIIDHVVCDPGPLFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVLKA
     180       190       200       210       220       230         

                                                                   
pF1KE0 VL                                                          
       ::                                                          
CCDS76 VLGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSPLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVTPL
     240       250       260       270       280       290         

>>CCDS74807.1 OR11H1 gene_id:81061|Hs108|chr22            (326 aa)
 initn: 872 init1: 841 opt: 841  Z-score: 702.2  bits: 137.7 E(32554): 8.5e-33
Smith-Waterman score: 841; 56.4% identity (80.0% similar) in 225 aa overlap (3-226:18-241)

                              10        20        30        40     
pF1KE0                MNNSQISTVTQFVVLGFPGPWKIQIIFFSMILLVYIFTLTGNMAI
                        ::... :..:.. ::   : :::..::..  .: .:.::: ::
CCDS74 MCPLTLQVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFSCEWTIQIFLFSLFTTTYALTITGNGAI
               10        20        30        40        50        60

          50         60        70        80        90       100    
pF1KE0 ICAVRW-DHRLHTPMYVLLANFSFLEIWYVTCTVPNMLVNFFSKTKTISFSGCFTQFHFF
          : : :.:::::::..:.::::::::::. :::.:::::.:. :.:::.::: ::.::
CCDS74 AF-VLWCDRRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFYFF
                70        80        90       100       110         

          110       120       130       140       150       160    
pF1KE0 FSLGTTECFFLCVMAYDRYLAICHPLHYPSIMTGQLCGILVSLCWLIGFLGHSISIFFIF
       :::::.::..: :::.:.:::::.:: ::.::::.: . :: :::. :::   : : .: 
CCDS74 FSLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLYAKLVILCWVCGFLWFLIPIVLIS
     120       130       140       150       160       170         

          170       180       190       200       210       220    
pF1KE0 QLPFCGPNIIDHFLCDVDPLMALSSAPTHIIGHVFHSVSSLFINLTMVYILGSYTLVLRT
       :.:::::::::: .::  : .::. . .  :    ...::: :  ....:.:::::::..
CCDS74 QMPFCGPNIIDHVVCDPGPRFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVLKA
     180       190       200       210       220       230         

                                                                   
pF1KE0 VL                                                          
       .:                                                          
CCDS74 MLGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSSLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVTPL
     240       250       260       270       280       290         

>>CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1             (312 aa)
 initn: 715 init1: 715 opt: 715  Z-score: 600.9  bits: 118.9 E(32554): 3.8e-27
Smith-Waterman score: 715; 47.3% identity (75.2% similar) in 226 aa overlap (1-226:1-226)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MNNSQISTVTQFVVLGFPGPWKIQIIFFSMILLVYIFTLTGNMAIICAVRWDHRLHTPMY
       :.... : :..:..::::    .:: .: ..::.:..:. ::. :. .:  : :::::::
CCDS30 MDTGNWSQVAEFIILGFPHLQGVQIYLFLLLLLIYLMTVLGNLLIFLVVCLDSRLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 VLLANFSFLEIWYVTCTVPNMLVNFFSKTKTISFSGCFTQFHFFFSLGTTECFFLCVMAY
        ... .:: :. :.. :.:.::.:..:. ::::::::. :..:: :::.:::..: .:::
CCDS30 HFVSILSFSELGYTAATIPKMLANLLSEKKTISFSGCLLQIYFFHSLGATECYLLTAMAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 DRYLAICHPLHYPSIMTGQLCGILVSLCWLIGFLGHSISIFFIFQLPFCGPNIIDHFLCD
       :::::::.:::::..::  ::. ..  ::: :. :  . : .: .::::::: :.: .::
CCDS30 DRYLAICRPLHYPTLMTPTLCAEIAIGCWLGGLAGPVVEISLISRLPFCGPNRIQHVFCD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220                    
pF1KE0 VDPLMALSSAPTHIIGHVFHSVSSLFINLTMVYILGSYTLVLRTVL              
         :...:. . : :   :   ..:  :  :.. :: ::. .. :::              
CCDS30 FPPVLSLACTDTSINVLVDFVINSCKILATFLLILCSYVQIICTVLRIPSAAGKRKAIST
              190       200       210       220       230       240

CCDS30 CASHFTVVLIFYGSILSMYVQLKKSYSLDYDQALAVVYSVLTPFLNPFIYSLRNKEIKEA
              250       260       270       280       290       300

>>CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11               (327 aa)
 initn: 699 init1: 416 opt: 702  Z-score: 590.3  bits: 117.0 E(32554): 1.5e-26
Smith-Waterman score: 702; 47.5% identity (74.0% similar) in 223 aa overlap (9-226:10-231)

                10        20        30        40        50         
pF1KE0  MNNSQISTVTQFVVLGFPGPWKIQIIFFSMILLVYIFTLTGNMAIICAVRWDHRLHTPM
                :..::.::::.:  .:...:...::.:...:: :  :: :.:    :: ::
CCDS77 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80            90       100       110     
pF1KE0 YVLLANFSFLEIWYVTCTVPNMLVNFF-SKT---KTISFSGCFTQFHFFFSLGTTECFFL
       : .:::.::::::::: :.:.::..:  ::    . ::: ::.::..::..:: ::: .:
CCDS77 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
               70        80        90       100       110       120

         120       130       140       150       160       170     
pF1KE0 CVMAYDRYLAICHPLHYPSIMTGQLCGILVSLCWLIGFLGHSISIFFIFQLPFCGPNIID
        :::::::.:::.::::: :..:.::  ...  :  ::    ...:.:  : .::::::.
CCDS77 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN
              130       140       150       160       170       180

         180       190       200       210        220              
pF1KE0 HFLCDVDPLMALSSAPTHIIGHVFHSVSSLFINLTMVYILG-SYTLVLRTVL        
       ::.:::.::. :: .     ...   . ..:: :  . . : ::. .  .:.        
CCDS77 HFFCDVSPLLNLSCTDMST-AELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGR
              190        200       210       220       230         

CCDS77 YKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRN
     240       250       260       270       280       290         

>>CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1              (317 aa)
 initn: 683 init1: 683 opt: 686  Z-score: 577.5  bits: 114.6 E(32554): 7.6e-26
Smith-Waterman score: 686; 44.2% identity (74.3% similar) in 226 aa overlap (1-226:1-226)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MNNSQISTVTQFVVLGFPGPWKIQIIFFSMILLVYIFTLTGNMAIICAVRWDHRLHTPMY
       :.. . :....:: ::: .   ..  .: ..::.:.::. ::: :. ..: :  ::::::
CCDS30 MDQYNHSSLAEFVFLGFASVGYVRGWLFVLLLLAYLFTICGNMLIFSVIRLDAALHTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 VLLANFSFLEIWYVTCTVPNMLVNFFSKTKTISFSGCFTQFHFFFSLGTTECFFLCVMAY
        ... .::::.::.. :.:.:: :..:. :::::.::. : .:: :::..::..: .:::
CCDS30 HFVSVLSFLELWYTATTIPKMLSNILSEKKTISFAGCLLQTYFFHSLGASECYLLTAMAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 DRYLAICHPLHYPSIMTGQLCGILVSLCWLIGFLGHSISIFFIFQLPFCGPNIIDHFLCD
       :::::::.::::: :::  ::. ... ::  :::     ...  :::::. : :.:..::
CCDS30 DRYLAICRPLHYPIIMTTTLCAKMAAACWTCGFLCPISEVILASQLPFCAYNEIQHIFCD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220                    
pF1KE0 VDPLMALSSAPTHIIGHVFHSVSSLFINLTMVYILGSYTLVLRTVL              
         ::..:.   :     :  ......: .:. .:. ::. .. .::              
CCDS30 FPPLLSLACKDTSANILVDFAINAFIILITFFFIMISYARIIGAVLKIKTASGRKKAFST
              190       200       210       220       230       240

CCDS30 CASHLAVVLIFFGSIIFMYVRLKKSYSLTLDRTLAIVYSVLTPMVNPIIYSLRNKEIIKA
              250       260       270       280       290       300

>>CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1             (325 aa)
 initn: 678 init1: 659 opt: 680  Z-score: 572.6  bits: 113.7 E(32554): 1.4e-25
Smith-Waterman score: 680; 43.6% identity (75.0% similar) in 220 aa overlap (7-226:12-231)

                    10        20        30        40        50     
pF1KE0      MNNSQISTVTQFVVLGFPGPWKIQIIFFSMILLVYIFTLTGNMAIICAVRWDHRL
                  ...:.:..::::    .:..:::..: .:..::  :. :: :.. : .:
CCDS30 MTTIILEVDNHTVTTRFILLGFPTRPAFQLLFFSIFLATYLLTLLENLLIILAIHSDGQL
               10        20        30        40        50        60

          60        70        80        90       100       110     
pF1KE0 HTPMYVLLANFSFLEIWYVTCTVPNMLVNFFSKTKTISFSGCFTQFHFFFSLGTTECFFL
       : ::: .:...::::.::::   :.:::.:.:. :.:::.::.::..:: ..  :: ..:
CCDS30 HKPMYFFLSHLSFLEMWYVTVISPKMLVDFLSHDKSISFNGCMTQLYFFVTFVCTEYILL
               70        80        90       100       110       120

         120       130       140       150       160       170     
pF1KE0 CVMAYDRYLAICHPLHYPSIMTGQLCGILVSLCWLIGFLGHSISIFFIFQLPFCGPNIID
        .::.:::.:::.::.:: :::.:::: :.. ::. :..   :.. :: :: .::   :.
CCDS30 AIMAFDRYVAICNPLRYPVIMTNQLCGTLAGGCWFCGLMTAMIKMVFIAQLHYCGMPQIN
              130       140       150       160       170       180

         180       190       200       210       220               
pF1KE0 HFLCDVDPLMALSSAPTHIIGHVFHSVSSLFINLTMVYILGSYTLVLRTVL         
       :..::..::. .:   .     :   .. . : . .  ...::. .: :.:         
CCDS30 HYFCDISPLLNVSCEDASQAEMVDFFLALMVIAIPLCVVVASYAAILATILRIPSAQGRQ
              190       200       210       220       230       240

CCDS30 KAFSTCASHLTVVILFYSMTLFTYARPKLMYAYNSNKVVSVLYTVIVPLLNPIIYCLRNH
              250       260       270       280       290       300




226 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 03:19:30 2016 done: Sat Nov  5 03:19:30 2016
 Total Scan time:  1.510 Total Display time:  0.000

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com