seq1 = pF1KB0444.tfa, 2715 bp
seq2 = pF1KB0444/gi568815589r_132275987.tfa (gi568815589r:132275987_132502821), 226835 bp

>pF1KB0444 2715
>gi568815589r:132275987_132502821 (Chr9)

(complement)

1-1367  (100001-101367)   100% ->
1368-1591  (102564-102787)   100% ->
1592-1777  (104496-104681)   99% ->
1778-1856  (106311-106389)   100% ->
1857-1987  (110616-110746)   100% ->
1988-2222  (111991-112225)   100% ->
2223-2312  (114594-114683)   98% ->
2313-2378  (116201-116266)   100% ->
2379-2464  (123678-123763)   100% ->
2465-2715  (126654-126904)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGGAGAATCAAGCAGATTTGAAATCCACACTCCAGTTTCTGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAGGAGAATCAAGCAGATTTGAAATCCACACTCCAGTTTCTGACAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAAAAGAAAAAGTGTTCTATACATAAGGAAAGACCTCAGAAACATTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAAAAGAAAAAGTGTTCTATACATAAGGAAAGACCTCAGAAACATTCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGAAATTTTCAGAGACTCCTCCCTGGTGAATGAACAGTCTCAAATAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGAAATTTTCAGAGACTCCTCCCTGGTGAATGAACAGTCTCAAATAACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGGAGGAAAAAGAGGAAAAAAGATTTCCAGCATCTCATTTCTTCTCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGGAGGAAAAAGAGGAAAAAAGATTTCCAGCATCTCATTTCTTCTCCTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAAAAATCCAGAATCTGTGATGAGACTGCAAATGCCACTTCCACACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAAAAAATCCAGAATCTGTGATGAGACTGCAAATGCCACTTCCACACTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AAAAGAGAAAAAAGAGAAGATATAGTGCTTTGGAGGTGGACGAGGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AAAAGAGAAAAAAGAGAAGATATAGTGCTTTGGAGGTGGACGAGGAAGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGTGTTACAGTTGTCCTTGTGGATAAAGAAAATATTAACAACACACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGTGTTACAGTTGTCCTTGTGGATAAAGAAAATATTAACAACACACCAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCATTTTAGAAAGGATGTTGATGTTGTTTGTGTTGATATGAGCATAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCATTTTAGAAAGGATGTTGATGTTGTTTGTGTTGATATGAGCATAGAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGAAGTTACCAAGAAAGCCTAAAACAGACAAATTTCAGGTACTTGCTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGAAGTTACCAAGAAAGCCTAAAACAGACAAATTTCAGGTACTTGCTAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCACATGCACATAAATCAGAAGCCCTGCACAGTAAAGTTAGGGAGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCACATGCACATAAATCAGAAGCCCTGCACAGTAAAGTTAGGGAGAAAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAATAAAAAGCATCAGAGGAAAGCTGCATCCTGGGAGAGCCAGCGGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAATAAAAAGCATCAGAGGAAAGCTGCATCCTGGGAGAGCCAGCGGGCAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGGACACCCTGCCTCAGTCAGAATCCCACCAGGAGGAGTCCTGGCTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGGACACCCTGCCTCAGTCAGAATCCCACCAGGAGGAGTCCTGGCTTTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTGGGTCCAGGGGGTGAAATTACAGAACTACCAGCATCTGCTCATAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTGGGTCCAGGGGGTGAAATTACAGAACTACCAGCATCTGCTCATAAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CAAGTCTAAGAAAAAAAAGAAAAAGTCCAGTAACCGGGAATATGAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CAAGTCTAAGAAAAAAAAGAAAAAGTCCAGTAACCGGGAATATGAGACAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGGCCATGCCTGAAGGATCGCAAGCAGGCAGAGAGGCCGGGACTGATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGGCCATGCCTGAAGGATCGCAAGCAGGCAGAGAGGCCGGGACTGATATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CAGGAATCCCAGCCTACTGTGGGCTTGGATGATGAAACTCCACAACTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CAGGAATCCCAGCCTACTGTGGGCTTGGATGATGAAACTCCACAACTACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGGACCTACTCACAAAAAAAAGTCTAAGAAAAAAAAGAAGAAAAAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGGACCTACTCACAAAAAAAAGTCTAAGAAAAAAAAGAAGAAAAAGTCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATCACCAGGAATTTGAGGCATTGGCCATGCCTGAAGGATCACAAGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATCACCAGGAATTTGAGGCATTGGCCATGCCTGAAGGATCACAAGTGGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGTGAGGTTGGGGCTGATATGCAGGAATCCCGGCCTGCTGTGGGCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGTGAGGTTGGGGCTGATATGCAGGAATCCCGGCCTGCTGTGGGCCTGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGGTGAAACTGCAGGAATACCAGCACCTGCTTATAAAAACAAGTCTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGGTGAAACTGCAGGAATACCAGCACCTGCTTATAAAAACAAGTCTAAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AAAAAAAGAAAAAGTCCAATCACCAGGAATTTGAGGCAGTGGCCATGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AAAAAAAGAAAAAGTCCAATCACCAGGAATTTGAGGCAGTGGCCATGCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAGAGCCTCGAGAGTGCATACCCTGAAGGATCACAGGTGGGCAGTGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAGAGCCTCGAGAGTGCATACCCTGAAGGATCACAGGTGGGCAGTGAGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TGGGACTGTGGAAGGCAGTACAGCTCTTAAAGGGTTCAAGGAATCCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TGGGACTGTGGAAGGCAGTACAGCTCTTAAAGGGTTCAAGGAATCCAACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GTACAAAGAAGAAGTCTAAGAAAAGGAAGCTTACGTCTGTCAAAAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GTACAAAGAAGAAGTCTAAGAAAAGGAAGCTTACGTCTGTCAAAAGGGCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CGAGTGTCTGGTGATGATTTTTCAGTGCCCAGTAAGAACTCTGAGAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CGAGTGTCTGGTGATGATTTTTCAGTGCCCAGTAAGAACTCTGAGAGCAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 ACTCTTTGATTCAGTAGAAGGTGATGGCGCCATGATGGAAGAAGGTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 ACTCTTTGATTCAGTAGAAGGTGATGGCGCCATGATGGAAGAAGGTGTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AATCTAGGCCCCGACAAAAGAAAACCCAGGCCTGTTTGGCAAGCAAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AATCTAGGCCCCGACAAAAGAAAACCCAGGCCTGTTTGGCAAGCAAGCAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GTGCAAGAGGCGCCAAG         GTTAGAACCTGCAAATGAAGAACA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 101351 GTGCAAGAGGCGCCAAGGTA...TAGGTTAGAACCTGCAAATGAAGAACA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 CAATGTGGAAACAGCTGAAGATTCCGAAATAAGATACTTATCTGCAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102588 CAATGTGGAAACAGCTGAAGATTCCGAAATAAGATACTTATCTGCAGATT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 CAGGAGATGCCGATGATTCAGATGCGGATTTGGGTTCTGCCGTGAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102638 CAGGAGATGCCGATGATTCAGATGCGGATTTGGGTTCTGCCGTGAAACAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 CTTCAGGAGTTCATTCCTAACATCAAGGACAGGGCCACCAGCACAATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102688 CTTCAGGAGTTCATTCCTAACATCAAGGACAGGGCCACCAGCACAATCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 GCGGATGTACCGGGACGACTTGGAACGGTTTAAGGAATTTAAAGCACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102738 GCGGATGTACCGGGACGACTTGGAACGGTTTAAGGAATTTAAAGCACAAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592          GTGTCGCTATTAAATTTGGCAAGTTTTCTGTAAAGGAAAAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102788 GTG...TAGGTGTCGCTATTAAATTTGGCAAGTTTTCTGTAAAGGAAAAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 AAGCAGTTAGAGAAAAATGTGGAAGACTTTCTAGCCCTGACAGGCATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104537 AAGCAGTTAGAGAAAAATGTGGAAGACTTTCTAGCCCTGACAGGCATTGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 GAGTGCAGACAAGCTCCTGTACACGGACAGATATCCTGAGGAAAAATCTG
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104587 GAGTGCAGACAAGCTGCTGTACACGGACAGATATCCTGAGGAAAAATCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1733 TGATCACCAACTTAAAAAGGAGATACTCGTTTAGATTACACATTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 104637 TGATCACCAACTTAAAAAGGAGATACTCGTTTAGATTACACATTGGTA..

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1778     GTAGGAACATTGCCCGGCCCTGGAAACTTATATACTATCGAGCAAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104687 .TAGGTAGGAACATTGCCCGGCCCTGGAAACTTATATACTATCGAGCAAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 GAAGATGTTCGATGTCAACAATTACAAAGGCAG         GTATAGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 106357 GAAGATGTTCGATGTCAACAATTACAAAGGCAGGTA...TAGGTATAGCG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1865 AAGGAGATACTGAGAAGTTAAAGATGTACCATTCTCTCCTTGGGAATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110624 AAGGAGATACTGAGAAGTTAAAGATGTACCATTCTCTCCTTGGGAATGAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1915 TGGAAGACGATTGGTGAGATGGTGGCCCGAAGTAGCCTCTCCGTGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110674 TGGAAGACGATTGGTGAGATGGTGGCCCGAAGTAGCCTCTCCGTGGCCCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1965 CAAGTTCTCACAGATCAGCAGTC         AAAGAAATCGTGGTGCTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 110724 CAAGTTCTCACAGATCAGCAGTCGTA...CAGAAAGAAATCGTGGTGCTT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2006 GGAGTAAGTCTGAAACCCGGAAACTAATCAAGGCTGTCGAAGAAGTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112009 GGAGTAAGTCTGAAACCCGGAAACTAATCAAGGCTGTCGAAGAAGTGATT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2056 CTGAAGAAGATGTCTCCCCAGGAGTTAAAAGAGGTGGATTCCAAACTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112059 CTGAAGAAGATGTCTCCCCAGGAGTTAAAAGAGGTGGATTCCAAACTCCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2106 AGAAAATCCTGAAAGTTGCCTATCAATTGTTCGGGAAAAACTCTACAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112109 AGAAAATCCTGAAAGTTGCCTATCAATTGTTCGGGAAAAACTCTACAAGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2156 GCATATCTTGGGTAGAAGTAGAAGCTAAAGTGCAAACCAGAAATTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112159 GCATATCTTGGGTAGAAGTAGAAGCTAAAGTGCAAACCAGAAATTGGATG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2206 CAGTGTAAAAGTAAGTG         GACAGAAATTCTAACCAAGAGGAT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 112209 CAGTGTAAAAGTAAGTGGTA...TAGGACAGAAATTCTAACCAAGAGGAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2247 GACTAATGGTCGGCGTATATACTATGGCATGAATGCCCTGCGGGCCAAGG
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 114618 GACTAATGGTCGGCGTATCTACTATGGCATGAATGCCCTGCGGGCCAAGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2297 TCAGCCTTATTGAAAG         GTTGTATGAAATAAATGTGGAAGAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 114668 TCAGCCTTATTGAAAGGTA...CAGGTTGTATGAAATAAATGTGGAAGAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2338 ACTAATGAAATAGACTGGGAAGATCTTGCTAGTGCCATAGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 116226 ACTAATGAAATAGACTGGGAAGATCTTGCTAGTGCCATAGGGTA...AAG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2379 TGATGTTCCTCCATCTTACGTTCAAACTAAATTTTCTAGGCTGAAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123678 TGATGTTCCTCCATCTTACGTTCAAACTAAATTTTCTAGGCTGAAAGCTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2429 TCTATGTTCCATTTTGGCAGAAAAAGACTTTTCCAG         AGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 123728 TCTATGTTCCATTTTGGCAGAAAAAGACTTTTCCAGGTT...TAGAGATC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2470 ATCGACTACCTTTATGAGACGACTCTACCTTTGCTGAAGGAAAAGTTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126659 ATCGACTACCTTTATGAGACGACTCTACCTTTGCTGAAGGAAAAGTTAGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2520 AAAAATGATGGAGAAAAAAGGCACTAAAATCCAGACTCCTGCAGCACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126709 AAAAATGATGGAGAAAAAAGGCACTAAAATCCAGACTCCTGCAGCACCCA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2570 AGCAAGTTTTCCCATTTCGAGACATCTTTTATTATGAAGACGATAGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126759 AGCAAGTTTTCCCATTTCGAGACATCTTTTATTATGAAGACGATAGTGAA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2620 GGAGAGGACATAGAAAAAGAAAGCGAAGGCCAGGCGCCATGCATGGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126809 GGAGAGGACATAGAAAAAGAAAGCGAAGGCCAGGCGCCATGCATGGCTCA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2670 CGCCTGTAATTCCAGTACTTTGGGAGGCCAAGGCCGGTGGATCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126859 CGCCTGTAATTCCAGTACTTTGGGAGGCCAAGGCCGGTGGATCATC