Result of FASTA (ccds) for pF1KE1398
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1398, 1102 aa
  1>>>pF1KE1398     1102 - 1102 aa - 1102 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5020+/-0.00102; mu= 16.0656+/- 0.061
 mean_var=91.9199+/-18.184, 0's: 0 Z-trim(104.5): 85  B-trim: 75 in 1/52
 Lambda= 0.133773
 statistics sampled from 7942 (8029) to 7942 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.593), E-opt: 0.2 (0.24), width:  16
 Scan time:  2.050

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS32385.1 USP7 gene_id:7874|Hs109|chr16          (1102) 7533 1465.0       0
CCDS66941.1 USP7 gene_id:7874|Hs109|chr16          (1086) 7364 1432.4       0
CCDS41619.1 USP47 gene_id:55031|Hs109|chr11        (1287)  618 130.5 2.4e-29
CCDS60725.1 USP47 gene_id:55031|Hs109|chr11        (1355)  618 130.5 2.6e-29
CCDS81554.1 USP47 gene_id:55031|Hs109|chr11        (1375)  618 130.5 2.6e-29
CCDS46547.1 USP40 gene_id:55230|Hs109|chr2         (1247)  451 98.3 1.2e-19
CCDS42686.1 USP34 gene_id:9736|Hs109|chr2          (3546)  373 83.4   1e-14
CCDS59462.1 USP17L21 gene_id:100287478|Hs109|chr4  ( 530)  333 75.3 4.1e-13
CCDS59456.1 USP17L12 gene_id:100287205|Hs109|chr4  ( 530)  333 75.3 4.1e-13
CCDS77901.1 USP17L15 gene_id:100288520|Hs109|chr4  ( 559)  333 75.4 4.3e-13
CCDS59460.1 USP17L19 gene_id:100287404|Hs109|chr4  ( 530)  332 75.1 4.7e-13
CCDS59459.1 USP17L18 gene_id:100287364|Hs109|chr4  ( 530)  332 75.1 4.7e-13
CCDS59455.1 USP17L11 gene_id:100287178|Hs109|chr4  ( 530)  332 75.1 4.7e-13
CCDS43713.1 USP17L2 gene_id:377630|Hs109|chr8      ( 530)  329 74.6   7e-13
CCDS59457.1 USP17L13 gene_id:100287238|Hs109|chr4  ( 530)  326 74.0   1e-12
CCDS59461.1 USP17L20 gene_id:100287441|Hs109|chr4  ( 530)  326 74.0   1e-12
CCDS59470.1 USP17L29 gene_id:728405|Hs109|chr4     ( 530)  326 74.0   1e-12
CCDS59466.1 USP17L26 gene_id:728379|Hs109|chr4     ( 530)  326 74.0   1e-12
CCDS59464.1 USP17L24 gene_id:728369|Hs109|chr4     ( 530)  326 74.0   1e-12
CCDS59471.1 USP17L30 gene_id:728419|Hs109|chr4     ( 530)  326 74.0   1e-12
CCDS59468.1 USP17L27 gene_id:728393|Hs109|chr4     ( 530)  326 74.0   1e-12
CCDS59469.1 USP17L28 gene_id:728400|Hs109|chr4     ( 530)  326 74.0   1e-12
CCDS59463.1 USP17L22 gene_id:100287513|Hs109|chr4  ( 530)  326 74.0   1e-12
CCDS59458.1 USP17L17 gene_id:100287327|Hs109|chr4  ( 530)  326 74.0   1e-12
CCDS59465.1 USP17L25 gene_id:728373|Hs109|chr4     ( 530)  326 74.0   1e-12
CCDS59454.1 USP17L10 gene_id:100287144|Hs109|chr4  ( 530)  325 73.8 1.2e-12
CCDS78301.1 USP17L3 gene_id:645836|Hs109|chr8      ( 530)  324 73.6 1.4e-12
CCDS59467.1 USP17L5 gene_id:728386|Hs109|chr4      ( 530)  321 73.0   2e-12
CCDS78300.1 USP17L8 gene_id:392188|Hs109|chr8      ( 530)  321 73.0   2e-12
CCDS44154.2 USP24 gene_id:23358|Hs109|chr1         (2620)  327 74.5 3.7e-12
CCDS78298.1 USP17L1 gene_id:401447|Hs109|chr8      ( 530)  316 72.1   4e-12
CCDS78299.1 USP17L4 gene_id:645402|Hs109|chr8      ( 530)  315 71.9 4.5e-12
CCDS31952.1 USP12 gene_id:219333|Hs109|chr13       ( 370)  291 67.2 8.2e-11


>>CCDS32385.1 USP7 gene_id:7874|Hs109|chr16               (1102 aa)
 initn: 7533 init1: 7533 opt: 7533  Z-score: 7854.0  bits: 1465.0 E(33420):    0
Smith-Waterman score: 7533; 100.0% identity (100.0% similar) in 1102 aa overlap (1-1102:1-1102)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MNHQQQQQQQKAGEQQLSEPEDMEMEAGDTDDPPRITQNPVINGNVALSDGHNTAEEDME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MNHQQQQQQQKAGEQQLSEPEDMEMEAGDTDDPPRITQNPVINGNVALSDGHNTAEEDME
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 DDTSWRSEATFQFTVERFSRLSESVLSPPCFVRNLPWKIMVMPRFYPDRPHQKSVGFFLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DDTSWRSEATFQFTVERFSRLSESVLSPPCFVRNLPWKIMVMPRFYPDRPHQKSVGFFLQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 CNAESDSTSWSCHAQAVLKIINYRDDEKSFSRRISHLFFHKENDWGFSNFMAWSEVTDPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CNAESDSTSWSCHAQAVLKIINYRDDEKSFSRRISHLFFHKENDWGFSNFMAWSEVTDPE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 KGFIDDDKVTFEVFVQADAPHGVAWDSKKHTGYVGLKNQGATCYMNSLLQTLFFTNQLRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KGFIDDDKVTFEVFVQADAPHGVAWDSKKHTGYVGLKNQGATCYMNSLLQTLFFTNQLRK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 AVYMMPTEGDDSSKSVPLALQRVFYELQHSDKPVGTKKLTKSFGWETLDSFMQHDVQELC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AVYMMPTEGDDSSKSVPLALQRVFYELQHSDKPVGTKKLTKSFGWETLDSFMQHDVQELC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 RVLLDNVENKMKGTCVEGTIPKLFRGKMVSYIQCKEVDYRSDRREDYYDIQLSIKGKKNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RVLLDNVENKMKGTCVEGTIPKLFRGKMVSYIQCKEVDYRSDRREDYYDIQLSIKGKKNI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 FESFVDYVAVEQLDGDNKYDAGEHGLQEAEKGVKFLTLPPVLHLQLMRFMYDPQTDQNIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FESFVDYVAVEQLDGDNKYDAGEHGLQEAEKGVKFLTLPPVLHLQLMRFMYDPQTDQNIK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 INDRFEFPEQLPLDEFLQKTDPKDPANYILHAVLVHSGDNHGGHYVVYLNPKGDGKWCKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 INDRFEFPEQLPLDEFLQKTDPKDPANYILHAVLVHSGDNHGGHYVVYLNPKGDGKWCKF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 DDDVVSRCTKEEAIEHNYGGHDDDLSVRHCTNAYMLVYIRESKLSEVLQAVTDHDIPQQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DDDVVSRCTKEEAIEHNYGGHDDDLSVRHCTNAYMLVYIRESKLSEVLQAVTDHDIPQQL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE1 VERLQEEKRIEAQKRKERQEAHLYMQVQIVAEDQFCGHQGNDMYDEEKVKYTVFKVLKNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VERLQEEKRIEAQKRKERQEAHLYMQVQIVAEDQFCGHQGNDMYDEEKVKYTVFKVLKNS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE1 SLAEFVQSLSQTMGFPQDQIRLWPMQARSNGTKRPAMLDNEADGNKTMIELSDNENPWTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SLAEFVQSLSQTMGFPQDQIRLWPMQARSNGTKRPAMLDNEADGNKTMIELSDNENPWTI
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE1 FLETVDPELAASGATLPKFDKDHDVMLFLKMYDPKTRSLNYCGHIYTPISCKIRDLLPVM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FLETVDPELAASGATLPKFDKDHDVMLFLKMYDPKTRSLNYCGHIYTPISCKIRDLLPVM
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE1 CDRAGFIQDTSLILYEEVKPNLTERIQDYDVSLDKALDELMDGDIIVFQKDDPENDNSEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CDRAGFIQDTSLILYEEVKPNLTERIQDYDVSLDKALDELMDGDIIVFQKDDPENDNSEL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE1 PTAKEYFRDLYHRVDVIFCDKTIPNDPGFVVTLSNRMNYFQVAKTVAQRLNTDPMLLQFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PTAKEYFRDLYHRVDVIFCDKTIPNDPGFVVTLSNRMNYFQVAKTVAQRLNTDPMLLQFF
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE1 KSQGYRDGPGNPLRHNYEGTLRDLLQFFKPRQPKKLYYQQLKMKITDFENRRSFKCIWLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KSQGYRDGPGNPLRHNYEGTLRDLLQFFKPRQPKKLYYQQLKMKITDFENRRSFKCIWLN
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE1 SQFREEEITLYPDKHGCVRDLLEECKKAVELGEKASGKLRLLEIVSYKIIGVHQEDELLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SQFREEEITLYPDKHGCVRDLLEECKKAVELGEKASGKLRLLEIVSYKIIGVHQEDELLE
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE1 CLSPATSRTFRIEEIPLDQVDIDKENEMLVTVAHFHKEVFGTFGIPFLLRIHQGEHFREV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CLSPATSRTFRIEEIPLDQVDIDKENEMLVTVAHFHKEVFGTFGIPFLLRIHQGEHFREV
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE1 MKRIQSLLDIQEKEFEKFKFAIVMMGRHQYINEDEYEVNLKDFEPQPGNMSHPRPWLGLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MKRIQSLLDIQEKEFEKFKFAIVMMGRHQYINEDEYEVNLKDFEPQPGNMSHPRPWLGLD
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100  
pF1KE1 HFNKAPKRSRYTYLEKAIKIHN
       ::::::::::::::::::::::
CCDS32 HFNKAPKRSRYTYLEKAIKIHN
             1090      1100  

>>CCDS66941.1 USP7 gene_id:7874|Hs109|chr16               (1086 aa)
 initn: 7364 init1: 7364 opt: 7364  Z-score: 7677.8  bits: 1432.4 E(33420):    0
Smith-Waterman score: 7364; 99.9% identity (100.0% similar) in 1078 aa overlap (25-1102:9-1086)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MNHQQQQQQQKAGEQQLSEPEDMEMEAGDTDDPPRITQNPVINGNVALSDGHNTAEEDME
                               .:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66                 MAGNHRLGLEAGDTDDPPRITQNPVINGNVALSDGHNTAEEDME
                               10        20        30        40    

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 DDTSWRSEATFQFTVERFSRLSESVLSPPCFVRNLPWKIMVMPRFYPDRPHQKSVGFFLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 DDTSWRSEATFQFTVERFSRLSESVLSPPCFVRNLPWKIMVMPRFYPDRPHQKSVGFFLQ
           50        60        70        80        90       100    

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 CNAESDSTSWSCHAQAVLKIINYRDDEKSFSRRISHLFFHKENDWGFSNFMAWSEVTDPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 CNAESDSTSWSCHAQAVLKIINYRDDEKSFSRRISHLFFHKENDWGFSNFMAWSEVTDPE
          110       120       130       140       150       160    

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 KGFIDDDKVTFEVFVQADAPHGVAWDSKKHTGYVGLKNQGATCYMNSLLQTLFFTNQLRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KGFIDDDKVTFEVFVQADAPHGVAWDSKKHTGYVGLKNQGATCYMNSLLQTLFFTNQLRK
          170       180       190       200       210       220    

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 AVYMMPTEGDDSSKSVPLALQRVFYELQHSDKPVGTKKLTKSFGWETLDSFMQHDVQELC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 AVYMMPTEGDDSSKSVPLALQRVFYELQHSDKPVGTKKLTKSFGWETLDSFMQHDVQELC
          230       240       250       260       270       280    

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 RVLLDNVENKMKGTCVEGTIPKLFRGKMVSYIQCKEVDYRSDRREDYYDIQLSIKGKKNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RVLLDNVENKMKGTCVEGTIPKLFRGKMVSYIQCKEVDYRSDRREDYYDIQLSIKGKKNI
          290       300       310       320       330       340    

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 FESFVDYVAVEQLDGDNKYDAGEHGLQEAEKGVKFLTLPPVLHLQLMRFMYDPQTDQNIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 FESFVDYVAVEQLDGDNKYDAGEHGLQEAEKGVKFLTLPPVLHLQLMRFMYDPQTDQNIK
          350       360       370       380       390       400    

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 INDRFEFPEQLPLDEFLQKTDPKDPANYILHAVLVHSGDNHGGHYVVYLNPKGDGKWCKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 INDRFEFPEQLPLDEFLQKTDPKDPANYILHAVLVHSGDNHGGHYVVYLNPKGDGKWCKF
          410       420       430       440       450       460    

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 DDDVVSRCTKEEAIEHNYGGHDDDLSVRHCTNAYMLVYIRESKLSEVLQAVTDHDIPQQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 DDDVVSRCTKEEAIEHNYGGHDDDLSVRHCTNAYMLVYIRESKLSEVLQAVTDHDIPQQL
          470       480       490       500       510       520    

              550       560       570       580       590       600
pF1KE1 VERLQEEKRIEAQKRKERQEAHLYMQVQIVAEDQFCGHQGNDMYDEEKVKYTVFKVLKNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VERLQEEKRIEAQKRKERQEAHLYMQVQIVAEDQFCGHQGNDMYDEEKVKYTVFKVLKNS
          530       540       550       560       570       580    

              610       620       630       640       650       660
pF1KE1 SLAEFVQSLSQTMGFPQDQIRLWPMQARSNGTKRPAMLDNEADGNKTMIELSDNENPWTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SLAEFVQSLSQTMGFPQDQIRLWPMQARSNGTKRPAMLDNEADGNKTMIELSDNENPWTI
          590       600       610       620       630       640    

              670       680       690       700       710       720
pF1KE1 FLETVDPELAASGATLPKFDKDHDVMLFLKMYDPKTRSLNYCGHIYTPISCKIRDLLPVM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 FLETVDPELAASGATLPKFDKDHDVMLFLKMYDPKTRSLNYCGHIYTPISCKIRDLLPVM
          650       660       670       680       690       700    

              730       740       750       760       770       780
pF1KE1 CDRAGFIQDTSLILYEEVKPNLTERIQDYDVSLDKALDELMDGDIIVFQKDDPENDNSEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 CDRAGFIQDTSLILYEEVKPNLTERIQDYDVSLDKALDELMDGDIIVFQKDDPENDNSEL
          710       720       730       740       750       760    

              790       800       810       820       830       840
pF1KE1 PTAKEYFRDLYHRVDVIFCDKTIPNDPGFVVTLSNRMNYFQVAKTVAQRLNTDPMLLQFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PTAKEYFRDLYHRVDVIFCDKTIPNDPGFVVTLSNRMNYFQVAKTVAQRLNTDPMLLQFF
          770       780       790       800       810       820    

              850       860       870       880       890       900
pF1KE1 KSQGYRDGPGNPLRHNYEGTLRDLLQFFKPRQPKKLYYQQLKMKITDFENRRSFKCIWLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KSQGYRDGPGNPLRHNYEGTLRDLLQFFKPRQPKKLYYQQLKMKITDFENRRSFKCIWLN
          830       840       850       860       870       880    

              910       920       930       940       950       960
pF1KE1 SQFREEEITLYPDKHGCVRDLLEECKKAVELGEKASGKLRLLEIVSYKIIGVHQEDELLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SQFREEEITLYPDKHGCVRDLLEECKKAVELGEKASGKLRLLEIVSYKIIGVHQEDELLE
          890       900       910       920       930       940    

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE1 CLSPATSRTFRIEEIPLDQVDIDKENEMLVTVAHFHKEVFGTFGIPFLLRIHQGEHFREV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 CLSPATSRTFRIEEIPLDQVDIDKENEMLVTVAHFHKEVFGTFGIPFLLRIHQGEHFREV
          950       960       970       980       990      1000    

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE1 MKRIQSLLDIQEKEFEKFKFAIVMMGRHQYINEDEYEVNLKDFEPQPGNMSHPRPWLGLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MKRIQSLLDIQEKEFEKFKFAIVMMGRHQYINEDEYEVNLKDFEPQPGNMSHPRPWLGLD
         1010      1020      1030      1040      1050      1060    

             1090      1100  
pF1KE1 HFNKAPKRSRYTYLEKAIKIHN
       ::::::::::::::::::::::
CCDS66 HFNKAPKRSRYTYLEKAIKIHN
         1070      1080      

>>CCDS41619.1 USP47 gene_id:55031|Hs109|chr11             (1287 aa)
 initn: 675 init1: 229 opt: 618  Z-score: 640.4  bits: 130.5 E(33420): 2.4e-29
Smith-Waterman score: 726; 32.7% identity (57.9% similar) in 492 aa overlap (207-622:93-570)

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE1 TDPEKGFIDDDKVTFEVFVQADAPHGVAWDSKKHTGYVGLKNQGATCYMNSLLQTLFFTN
                                     .:..:::::: ::. :::.::::::::.: 
CCDS41 DRFIGPLPREGSGGSTSDYVSQSYSYSSILNKSETGYVGLVNQAMTCYLNSLLQTLFMTP
             70        80        90       100       110       120  

        240         250       260       270        280       290   
pF1KE1 QLRKAVYMMPTEG--DDSSKSVPLALQRVFYELQHSDK-PVGTKKLTKSFGWETLDSFMQ
       ..:.:.:    :   .:   :.:  :::.:  :: : :  . :  .:.::::.. ....:
CCDS41 EFRNALYKWEFEESEEDPVTSIPYQLQRLFVLLQTSKKRAIETTDVTRSFGWDSSEAWQQ
            130       140       150       160       170       180  

           300       310       320       330       340       350   
pF1KE1 HDVQELCRVLLDNVENKMKGTCVEGTIPKLFRGKMVSYIQCKEVDYRSDRREDYYDIQLS
       :::::::::..: .:.: : :     : .:..::. .:..: :  :.. : . : :: : 
CCDS41 HDVQELCRVMFDALEQKWKQTEQADLINELYQGKLKDYVRCLECGYEGWRIDTYLDIPLV
            190       200       210       220       230       240  

             360           370       380        390       400      
pF1KE1 IK--GKKNIFESFVD----YVAVEQLDGDNKYDAGEHGLQ-EAEKGVKFLTLPPVLHLQL
       :.  :... : :  .    ..  : ::: :.:   .   . .:.::..:: .: .: :::
CCDS41 IRPYGSSQAFASVEEALHAFIQPEILDGPNQYFCERCKKKCDARKGLRFLHFPYLLTLQL
            250       260       270       280       290       300  

        410       420       430       440                          
pF1KE1 MRFMYDPQTDQNIKINDRFEFPEQLPLDEFLQKTDPKDPAN-------------------
        :: .:  : . ::.:::. :::.: .. :..  : :.: .                   
CCDS41 KRFDFDYTTMHRIKLNDRMTFPEELDMSTFIDVEDEKSPQTESCTDSGAENEGSCHSDQM
            310       320       330       340       350       360  

                                           450       460       470 
pF1KE1 ------------------------------------YILHAVLVHSGDNHGGHYVVYLNP
                                           : : .:.::::.  :::: . .. 
CCDS41 SNDFSNDDGVDEGICLETNSGTEKISKSGLEKNSLIYELFSVMVHSGSAAGGHYYACIKS
            370       380       390       400       410       420  

             480       490       500       510                 520 
pF1KE1 KGDGKWCKFDDDVVSRCTKEEAIEHNYGGHDDDLSVRHC-----TNAYMLVY-----IRE
        .: .: .:.:. ::: :.:. :....:: . . .         ::::::.:      :.
CCDS41 FSDEQWYSFNDQHVSRITQED-IKKTHGGSSGSRGYYSSAFASSTNAYMLIYRLKDPARN
            430       440        450       460       470       480 

             530       540       550       560       570       580 
pF1KE1 SKLSEVLQAVTDHDIPQQLVERLQEEKRIEAQKRKERQEAHLYMQVQIVAEDQFCGHQGN
       .:. ::       . :... . .:.:...: :....:.  .   ....     :: :  .
CCDS41 AKFLEV------DEYPEHIKNLVQKERELEEQEKRQREIERNTCKIKL-----FCLHPTK
                   490       500       510       520            530

             590       600        610       620       630       640
pF1KE1 DMYDEEKVKYTVFKVLKNS-SLAEFVQSLSQTMGFPQDQIRLWPMQARSNGTKRPAMLDN
       ... :.:..    :.::..  .:  ...: ...  : :  ::                  
CCDS41 QVMMENKLEVHKDKTLKEAVEMAYKMMDLEEVI--PLDCCRLVKYDEFHDYLERSYEGEE
              540       550       560         570       580        

              650       660       670       680       690       700
pF1KE1 EADGNKTMIELSDNENPWTIFLETVDPELAASGATLPKFDKDHDVMLFLKMYDPKTRSLN
                                                                   
CCDS41 DTPMGLLLGGVKSTYMFDLLLETRKPDQVFQSYKPGEVMVKVHVVDLKAESVAAPITVRA
      590       600       610       620       630       640        

>>CCDS60725.1 USP47 gene_id:55031|Hs109|chr11             (1355 aa)
 initn: 675 init1: 229 opt: 618  Z-score: 640.0  bits: 130.5 E(33420): 2.6e-29
Smith-Waterman score: 726; 32.7% identity (57.9% similar) in 492 aa overlap (207-622:161-638)

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE1 TDPEKGFIDDDKVTFEVFVQADAPHGVAWDSKKHTGYVGLKNQGATCYMNSLLQTLFFTN
                                     .:..:::::: ::. :::.::::::::.: 
CCDS60 DRFIGPLPREGSGGSTSDYVSQSYSYSSILNKSETGYVGLVNQAMTCYLNSLLQTLFMTP
              140       150       160       170       180       190

        240         250       260       270        280       290   
pF1KE1 QLRKAVYMMPTEG--DDSSKSVPLALQRVFYELQHSDK-PVGTKKLTKSFGWETLDSFMQ
       ..:.:.:    :   .:   :.:  :::.:  :: : :  . :  .:.::::.. ....:
CCDS60 EFRNALYKWEFEESEEDPVTSIPYQLQRLFVLLQTSKKRAIETTDVTRSFGWDSSEAWQQ
              200       210       220       230       240       250

           300       310       320       330       340       350   
pF1KE1 HDVQELCRVLLDNVENKMKGTCVEGTIPKLFRGKMVSYIQCKEVDYRSDRREDYYDIQLS
       :::::::::..: .:.: : :     : .:..::. .:..: :  :.. : . : :: : 
CCDS60 HDVQELCRVMFDALEQKWKQTEQADLINELYQGKLKDYVRCLECGYEGWRIDTYLDIPLV
              260       270       280       290       300       310

             360           370       380        390       400      
pF1KE1 IK--GKKNIFESFVD----YVAVEQLDGDNKYDAGEHGLQ-EAEKGVKFLTLPPVLHLQL
       :.  :... : :  .    ..  : ::: :.:   .   . .:.::..:: .: .: :::
CCDS60 IRPYGSSQAFASVEEALHAFIQPEILDGPNQYFCERCKKKCDARKGLRFLHFPYLLTLQL
              320       330       340       350       360       370

        410       420       430       440                          
pF1KE1 MRFMYDPQTDQNIKINDRFEFPEQLPLDEFLQKTDPKDPAN-------------------
        :: .:  : . ::.:::. :::.: .. :..  : :.: .                   
CCDS60 KRFDFDYTTMHRIKLNDRMTFPEELDMSTFIDVEDEKSPQTESCTDSGAENEGSCHSDQM
              380       390       400       410       420       430

                                           450       460       470 
pF1KE1 ------------------------------------YILHAVLVHSGDNHGGHYVVYLNP
                                           : : .:.::::.  :::: . .. 
CCDS60 SNDFSNDDGVDEGICLETNSGTEKISKSGLEKNSLIYELFSVMVHSGSAAGGHYYACIKS
              440       450       460       470       480       490

             480       490       500       510                 520 
pF1KE1 KGDGKWCKFDDDVVSRCTKEEAIEHNYGGHDDDLSVRHC-----TNAYMLVY-----IRE
        .: .: .:.:. ::: :.:. :....:: . . .         ::::::.:      :.
CCDS60 FSDEQWYSFNDQHVSRITQED-IKKTHGGSSGSRGYYSSAFASSTNAYMLIYRLKDPARN
              500       510        520       530       540         

             530       540       550       560       570       580 
pF1KE1 SKLSEVLQAVTDHDIPQQLVERLQEEKRIEAQKRKERQEAHLYMQVQIVAEDQFCGHQGN
       .:. ::       . :... . .:.:...: :....:.  .   ....     :: :  .
CCDS60 AKFLEV------DEYPEHIKNLVQKERELEEQEKRQREIERNTCKIKL-----FCLHPTK
     550             560       570       580       590             

             590       600        610       620       630       640
pF1KE1 DMYDEEKVKYTVFKVLKNS-SLAEFVQSLSQTMGFPQDQIRLWPMQARSNGTKRPAMLDN
       ... :.:..    :.::..  .:  ...: ...  : :  ::                  
CCDS60 QVMMENKLEVHKDKTLKEAVEMAYKMMDLEEVI--PLDCCRLVKYDEFHDYLERSYEGEE
      600       610       620       630         640       650      

              650       660       670       680       690       700
pF1KE1 EADGNKTMIELSDNENPWTIFLETVDPELAASGATLPKFDKDHDVMLFLKMYDPKTRSLN
                                                                   
CCDS60 DTPMGLLLGGVKSTYMFDLLLETRKPDQVFQSYKPGEVMVKVHVVDLKAESVAAPITVRA
        660       670       680       690       700       710      

>>CCDS81554.1 USP47 gene_id:55031|Hs109|chr11             (1375 aa)
 initn: 675 init1: 229 opt: 618  Z-score: 639.9  bits: 130.5 E(33420): 2.6e-29
Smith-Waterman score: 726; 32.7% identity (57.9% similar) in 492 aa overlap (207-622:181-658)

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE1 TDPEKGFIDDDKVTFEVFVQADAPHGVAWDSKKHTGYVGLKNQGATCYMNSLLQTLFFTN
                                     .:..:::::: ::. :::.::::::::.: 
CCDS81 DRFIGPLPREGSGGSTSDYVSQSYSYSSILNKSETGYVGLVNQAMTCYLNSLLQTLFMTP
              160       170       180       190       200       210

        240         250       260       270        280       290   
pF1KE1 QLRKAVYMMPTEG--DDSSKSVPLALQRVFYELQHSDK-PVGTKKLTKSFGWETLDSFMQ
       ..:.:.:    :   .:   :.:  :::.:  :: : :  . :  .:.::::.. ....:
CCDS81 EFRNALYKWEFEESEEDPVTSIPYQLQRLFVLLQTSKKRAIETTDVTRSFGWDSSEAWQQ
              220       230       240       250       260       270

           300       310       320       330       340       350   
pF1KE1 HDVQELCRVLLDNVENKMKGTCVEGTIPKLFRGKMVSYIQCKEVDYRSDRREDYYDIQLS
       :::::::::..: .:.: : :     : .:..::. .:..: :  :.. : . : :: : 
CCDS81 HDVQELCRVMFDALEQKWKQTEQADLINELYQGKLKDYVRCLECGYEGWRIDTYLDIPLV
              280       290       300       310       320       330

             360           370       380        390       400      
pF1KE1 IK--GKKNIFESFVD----YVAVEQLDGDNKYDAGEHGLQ-EAEKGVKFLTLPPVLHLQL
       :.  :... : :  .    ..  : ::: :.:   .   . .:.::..:: .: .: :::
CCDS81 IRPYGSSQAFASVEEALHAFIQPEILDGPNQYFCERCKKKCDARKGLRFLHFPYLLTLQL
              340       350       360       370       380       390

        410       420       430       440                          
pF1KE1 MRFMYDPQTDQNIKINDRFEFPEQLPLDEFLQKTDPKDPAN-------------------
        :: .:  : . ::.:::. :::.: .. :..  : :.: .                   
CCDS81 KRFDFDYTTMHRIKLNDRMTFPEELDMSTFIDVEDEKSPQTESCTDSGAENEGSCHSDQM
              400       410       420       430       440       450

                                           450       460       470 
pF1KE1 ------------------------------------YILHAVLVHSGDNHGGHYVVYLNP
                                           : : .:.::::.  :::: . .. 
CCDS81 SNDFSNDDGVDEGICLETNSGTEKISKSGLEKNSLIYELFSVMVHSGSAAGGHYYACIKS
              460       470       480       490       500       510

             480       490       500       510                 520 
pF1KE1 KGDGKWCKFDDDVVSRCTKEEAIEHNYGGHDDDLSVRHC-----TNAYMLVY-----IRE
        .: .: .:.:. ::: :.:. :....:: . . .         ::::::.:      :.
CCDS81 FSDEQWYSFNDQHVSRITQED-IKKTHGGSSGSRGYYSSAFASSTNAYMLIYRLKDPARN
              520       530        540       550       560         

             530       540       550       560       570       580 
pF1KE1 SKLSEVLQAVTDHDIPQQLVERLQEEKRIEAQKRKERQEAHLYMQVQIVAEDQFCGHQGN
       .:. ::       . :... . .:.:...: :....:.  .   ....     :: :  .
CCDS81 AKFLEV------DEYPEHIKNLVQKERELEEQEKRQREIERNTCKIKL-----FCLHPTK
     570             580       590       600       610             

             590       600        610       620       630       640
pF1KE1 DMYDEEKVKYTVFKVLKNS-SLAEFVQSLSQTMGFPQDQIRLWPMQARSNGTKRPAMLDN
       ... :.:..    :.::..  .:  ...: ...  : :  ::                  
CCDS81 QVMMENKLEVHKDKTLKEAVEMAYKMMDLEEVI--PLDCCRLVKYDEFHDYLERSYEGEE
      620       630       640       650         660       670      

              650       660       670       680       690       700
pF1KE1 EADGNKTMIELSDNENPWTIFLETVDPELAASGATLPKFDKDHDVMLFLKMYDPKTRSLN
                                                                   
CCDS81 DTPMGLLLGGVKSTYMFDLLLETRKPDQVFQSYKPGEVMVKVHVVDLKAESVAAPITVRA
        680       690       700       710       720       730      

>>CCDS46547.1 USP40 gene_id:55230|Hs109|chr2              (1247 aa)
 initn: 428 init1: 217 opt: 451  Z-score: 466.4  bits: 98.3 E(33420): 1.2e-19
Smith-Waterman score: 577; 29.3% identity (59.9% similar) in 444 aa overlap (208-628:47-474)

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE1 DPEKGFIDDDKVTFEVFVQADAPHGVAWDSKKHTGYVGLKNQGATCYMNSLLQTLFFTNQ
                                     .. :.  :..:::.:::.::::::: :: .
CCDS46 LFEEEYSTVSNNQYGKGKKLKTKALEPPAPREFTNLSGIRNQGGTCYLNSLLQTLHFTPE
         20        30        40        50        60        70      

       240           250             260       270        280      
pF1KE1 LRKAVYMM-PTE-G--DDSSKS------VPLALQRVFYELQHSDKPVG-TKKLTKSFGWE
       .:.:.. . : : :  .:..:       .:: :::.: .:   :. .. :  :: :::: 
CCDS46 FREALFSLGPEELGLFEDKDKPDAKVRIIPLQLQRLFAQLLLLDQEAASTADLTDSFGWT
         80        90       100       110       120       130      

        290       300       310       320       330       340      
pF1KE1 TLDSFMQHDVQELCRVLLDNVENKMKGTCVEGTIPKLFRGKMVSYIQCKEVDYRSDRRED
       . . . ::::::: :.:.. .:... ::  .  : .:..: .:. : :::    :.:.::
CCDS46 SNEEMRQHDVQELNRILFSALETSLVGTSGHDLIYRLYHGTIVNQIVCKECKNVSERQED
        140       150       160       170       180       190      

        350       360        370       380        390       400    
pF1KE1 YYDIQLSIKGKKNIFESFVD-YVAVEQLDGDNKYDAGEHG-LQEAEKGVKFLTLPPVLHL
       . :. ...:. ... ... . ::  : .: :: :  :    : .: :..:.  ::: : .
CCDS46 FLDLTVAVKNVSGLEDALWNMYVEEEVFDCDNLYHCGTCDRLVKAAKSAKLRKLPPFLTV
        200       210       220       230       240       250      

          410       420       430       440         450       460  
pF1KE1 QLMRFMYDPQTDQNIKINDRFEFPEQLPLDEFLQKTDPKDPANYI--LHAVLVHSGDNHG
       .:.:: .:    .  : .. . :: .. :  : ....  :  .::  : .:..:.:  .:
CCDS46 SLLRFNFDFVKCERYKETSCYTFPLRINLKPFCEQSE-LDDLEYIYDLFSVIIHKGGCYG
        260       270       280       290        300       310     

            470        480       490       500       510       520 
pF1KE1 GHYVVYLNPKGD-GKWCKFDDDVVSRCTKEEAIEHNYGGHDDDLSVRHCTNAYMLVYIRE
       ::: ::..     :.: .:...     .: ..   :    ...  . :       . ..:
CCDS46 GHYHVYIKDVDHLGNW-QFQEE----KSKPDV---NLKDLQSEEEIDHPLMILKAILLEE
         320       330            340          350       360       

             530       540         550       560       570         
pF1KE1 SKLSEVLQAVTDHDIPQQLVERL--QEEKRIEAQKRKERQEAHLYMQVQIVAEDQFCGH-
       ..:  : :      . :.:....  . .:. . :.   :.  .:. :. ... :.   . 
CCDS46 NNLIPVDQ------LGQKLLKKIGISWNKKYRKQHGPLRKFLQLHSQIFLLSSDESTVRL
       370             380       390       400       410       420 

       580          590       600       610       620       630    
pF1KE1 -QGNDMY---DEEKVKYTVFKVLKNSSLAEFVQSLSQTMGFPQDQIRLWPMQARSNGTKR
        .....    : ..    .::.:   :   . .:.:    :  .. .. :.. .      
CCDS46 LKNSSLQAESDFQRNDQQIFKMLPPES-PGLNNSISCPHWFDINDSKVQPIREKDIEQQF
             430       440        450       460       470       480

          640       650       660       670       680       690    
pF1KE1 PAMLDNEADGNKTMIELSDNENPWTIFLETVDPELAASGATLPKFDKDHDVMLFLKMYDP
                                                                   
CCDS46 QGKESAYMLFYRKSQLQRPPEARANPRYGVPCHLLNEMDAANIELQTKRAECDSANNTFE
              490       500       510       520       530       540

>>CCDS42686.1 USP34 gene_id:9736|Hs109|chr2               (3546 aa)
 initn: 317 init1: 138 opt: 373  Z-score: 378.0  bits: 83.4 E(33420): 1e-14
Smith-Waterman score: 452; 26.1% identity (53.4% similar) in 498 aa overlap (195-645:1871-2354)

          170       180       190       200       210              
pF1KE1 WGFSNFMAWSEVTDPEKGFIDDDKVTFEVFVQADAPHGVAWDSKKHTG------YVGLKN
                                     .:. ::.   ::   :        .::: :
CCDS42 RAAAYDLLVEMVKGSVENYRLIHNWVMAQHMQSHAPY--KWDYWPHEDVRAECRFVGLTN
             1850      1860      1870        1880      1890        

      220       230       240       250       260       270        
pF1KE1 QGATCYMNSLLQTLFFTNQLRKAVYMMPTEGDDSSKSVPLALQRVFYELQHSD-KPVGTK
        :::::. : .: :..  . :.::.      : . :.. : ::..:  :..:. :  . .
CCDS42 LGATCYLASTIQQLYMIPEARQAVFTAKYSEDMKHKTTLLELQKMFTYLMESECKAYNPR
     1900      1910      1920      1930      1940      1950        

       280         290       300       310       320       330     
pF1KE1 KLTKSFGWET--LDSFMQHDVQELCRVLLDNVENKMKGTCVEGTIPKLFRGKMVSYIQCK
        . :..  .   :..  :.:. :.   :. ..: .:.   ...:. .:: : ... .   
CCDS42 PFCKTYTMDKQPLNTGEQKDMTEFFTDLITKIE-EMSPE-LKNTVKSLFGGVITNNVVSL
     1960      1970      1980      1990        2000      2010      

         340       350       360       370       380        390    
pF1KE1 EVDYRSDRREDYYDIQLSIKGKKNIFESFVDYVAVEQLDGDNKYDAGEHGLQ-EAEKGVK
       . .. :.  :..: .. ..   :::.::. . .  . :.::: :  .. : . .::: . 
CCDS42 DCEHVSQTAEEFYTVRCQVADMKNIYESLDEVTIKDTLEGDNMYTCSHCGKKVRAEKRAC
       2020      2030      2040      2050      2060      2070      

          400       410       420       430            440         
pF1KE1 FLTLPPVLHLQLMRFMYDPQTDQNIKINDRFEFPEQLPL----DEFLQ-KTD--------
       :  :: .: .. ::. ..  : .. :.: .: :: .: .    ..::. :..        
CCDS42 FKKLPRILSFNTMRYTFNMVTMMKEKVNTHFSFPLRLDMTPYTEDFLMGKSERKEGFKEV
       2080      2090      2100      2110      2120      2130      

                  450       460           470         480          
pF1KE1 ---PKDPANYI--LHAVLVHSGDNHGGHYVVYL----NPKG--DGKWCKFDD--------
           ::  .:   : .: ::.:   ::::  ..    ::..  ..::  :.:        
CCDS42 SDHSKDSESYEYDLIGVTVHTGTADGGHYYSFIRDIVNPHAYKNNKWYLFNDAEVKPFDS
       2140      2150      2160      2170      2180      2190      

             490       500          510       520       530        
pF1KE1 -DVVSRCTKEEAIEHNYGGHDD---DLSVRHCTNAYMLVYIRESKLSEVLQAVTDHDIPQ
        ...:.:   :   ..: .  :   :.: ..  .:::: : :     :  .     :. .
CCDS42 AQLASECFGGEMTTKTYDSVTDKFMDFSFEKTHSAYMLFYKRMEPEEENGREYK-FDVSS
       2200      2210      2220      2230      2240      2250      

      540       550       560       570       580       590        
pF1KE1 QLVERLQEEKRIEAQKRKERQEAHLYMQVQIVAEDQFCGHQGNDMYDEEKVKYTVFKVLK
       .:.: . ...    : ..  .  : :.  .     :.:.   . . : . :.  . :.  
CCDS42 ELLEWIWHDNMQFLQDKNIFE--HTYFGFMW----QLCSCIPSTLPDPKAVSLMTAKLST
        2260      2270        2280          2290      2300         

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pF1KE1 NSSLAEFVQSLSQ-TMGFPQDQIRLWPMQARSNGTKRPAMLDNEADGNKTMIELSDNENP
       .  :  :..:  . ::    . :.:   :  .. .    .::  :: .            
CCDS42 SFVLETFIHSKEKPTM---LQWIELLTKQFNNSQAACEWFLDRMADDDWWPMQILIKCPN
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pF1KE1 WTIFLETVDPELAASGATLPKFDKDHDVMLFLKMYDPKTRSLNYCGHIYTPISCKIRDLL
                                                                   
CCDS42 QIVRQMFQRLCIHVIQRLRPVHAHLYLQPGMEDGSDDMDTSVEDIGGRSCVTRFVRTLLL
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       .  : ... .        ..   . :....  :  .:  .. :. .:     :    :..
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         :. . .. : .   :... : : .   : ..: :   : :.: .    ::  . : ::
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        :.:.. ... ... . :  :.:.:.: :  :   ::.:   : . .::   :: : : :
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       :    ..  : ::    ..:: : .. .... .   :  :.:.:::::.: . :.:::  
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       :.. . .:.: :.::  :.  .   .. ..               ::.: ::..:.  . 
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        ..:.    :. :  .  ...  ... ...                              
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>>CCDS59456.1 USP17L12 gene_id:100287205|Hs109|chr4       (530 aa)
 initn: 157 init1:  86 opt: 333  Z-score: 349.1  bits: 75.3 E(33420): 4.1e-13
Smith-Waterman score: 339; 26.7% identity (54.7% similar) in 360 aa overlap (215-557:81-411)

          190       200       210       220       230       240    
pF1KE1 DDDKVTFEVFVQADAPHGVAWDSKKHTGYVGLKNQGATCYMNSLLQTLFFTNQLRKAVYM
                                     ::.:.: :::.:. :: : .:  :  : ::
CCDS59 LCDDLAPVARQLAPREKLPLSNRRPAAVGAGLQNMGNTCYVNASLQCLTYTPPL--ANYM
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pF1KE1 MPTEGDDSSK--------SVPLALQRVFYELQHSDKPVGTKKLTKSFG---WETLDSFMQ
       .  : ... .        ..   . :....  :  .:  .. :. .:     :    :..
CCDS59 LSREHSQTCHRHKGCMLCTMQAHITRALHNPGHVIQP--SQALAAGFHRGKQEDAHEFLM
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pF1KE1 HDVQELCRVLLDN---VENKMKGTCVEGTIPKLFRGKMVSYIQCKEVDYRSDRREDYYDI
         :. . .. : .   :... : : .   : ..: :   : :.: .    ::  . : ::
CCDS59 FTVDAMKKACLPGHKQVDHHSKDTTL---IHQIFGGYWRSQIKCLHCHGISDTFDPYLDI
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        :.:.. ... ... . :  :.:.:.: :  :   ::.:   : . .::   :: : : :
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       :    ..  : ::    ..:: : .. .... .   :  :.:.:::::.: . :.:::  
CCDS59 F---SDVTGN-KIAKNVQYPECLDMQPYMSQPNT-GPLVYVLYAVLVHAGWSCHNGHYFS
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pF1KE1 YLNPKGDGKWCKFDDDVVSRCTKEEAIEHNYGGHDDDLSVRHCTNAYMLVYIRESKLSEV
       :.. . .:.: :.::  :.  .   .. ..               ::.: ::..:.  . 
CCDS59 YVKAQ-EGQWYKMDDAEVTASSITSVLSQQ---------------AYVLFYIQKSEWERH
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        ..:.    :. :  .  ...  ... ...                              
CCDS59 SESVSRGREPRALGAEDTDRRATQGELKRDHPCLQAPELDEHLVERATQESTLDHWKFLQ
             390       400       410       420       430       440 

>>CCDS77901.1 USP17L15 gene_id:100288520|Hs109|chr4       (559 aa)
 initn: 157 init1:  86 opt: 333  Z-score: 348.8  bits: 75.4 E(33420): 4.3e-13
Smith-Waterman score: 339; 27.1% identity (55.1% similar) in 361 aa overlap (215-557:81-411)

          190       200       210       220       230       240    
pF1KE1 DDDKVTFEVFVQADAPHGVAWDSKKHTGYVGLKNQGATCYMNSLLQTLFFTNQLRKAVYM
                                     ::.:.: :::.:. :: : .:  :  : ::
CCDS77 LCDDLAPVARQLAPREKLPLSSRRPAAVGAGLQNMGNTCYVNASLQCLTYTPPL--ANYM
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pF1KE1 MPTEGDDSSK--------SVPLALQRVFYELQHSDKPVGTKKLTKSFG---WETLDSFMQ
       .  : ... .        ..   . :....  :  .:  .. :. .:     :    :..
CCDS77 LSREHSQTCHRHKGCMLCTMQAHITRALHNPGHVIQP--SQALAAGFHRGKQEDAHEFLM
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pF1KE1 HDVQELCRVLLDN---VENKMKGTCVEGTIPKLFRGKMVSYIQCKEVDYRSDRREDYYDI
         :. . .. : .   :... : : .   : ..: :   : :.: .    ::  . : ::
CCDS77 FTVDAMKKACLPGHKQVDHHSKDTTL---IHQIFGGYWRSQIKCLHCHGISDTFDPYLDI
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pF1KE1 QLSIKGKKNIFESFVDYVAVEQLDGDNKYDAGEHGLQEAEKGVKFLTL---PPVLHLQLM
        :.:.. ... ... . :  :.:.:.: :  :   ::.:  . : :::     :: : : 
CCDS77 ALDIQAAQSVQQALEQLVKPEELNGENAYHCGVC-LQRAPAS-KTLTLHTSAKVLILVLK
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       ::    ..  : ::.   ..:: : .  ....:. . :  :.:.:::::.: . :.::: 
CCDS77 RF---SDVTGN-KIDKNVQYPECLDMKLYMSQTN-SGPLVYVLYAVLVHAGWSCHNGHYF
                 290       300       310        320       330      

        470       480       490       500       510       520      
pF1KE1 VYLNPKGDGKWCKFDDDVVSRCTKEEAIEHNYGGHDDDLSVRHCTNAYMLVYIRESKLSE
        :.. . .:.: :.::  :.  .   .. ..               ::.: ::..:.  .
CCDS77 SYVKAQ-EGQWYKMDDAEVTASSITSVLSQQ---------------AYVLFYIQKSEWER
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pF1KE1 VLQAVTDHDIPQQLVERLQEEKRIEAQKRKERQEAHLYMQVQIVAEDQFCGHQGNDMYDE
         ..:.    :. :  .  ...  ... ...                             
CCDS77 HSESVSRGREPRALGAEDTDRRATQGELKRDHPCLQAPELDEHLVERATQESTLDHWKFL
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pF1KE1 EKVKYTVFKVLKNSSLAEFVQSLSQTMGFPQDQIRLWPMQARSNGTKRPAMLDNEADGNK
                                                                   
CCDS77 QEQNKTKPEFNVRKVEGTLPPDVLVIHQSKYKCGMKNHHPEQQSSLLNLSSTTPTHQESM
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1102 residues in 1 query   sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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