Result of FASTA (omim) for pF1KE0386
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0386, 694 aa
  1>>>pF1KE0386 694 - 694 aa - 694 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7958+/-0.000432; mu= 17.1993+/- 0.027
 mean_var=74.8818+/-14.836, 0's: 0 Z-trim(110.6): 28  B-trim: 43 in 1/49
 Lambda= 0.148213
 statistics sampled from 18992 (19013) to 18992 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.223), width:  16
 Scan time:  9.610

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_997304 (OMIM: 610363) protein-arginine deiminas ( 694) 4691 1013.1       0
NP_036519 (OMIM: 180300,605347) protein-arginine d ( 663) 1507 332.3 3.6e-90
NP_057317 (OMIM: 606755) protein-arginine deiminas ( 664) 1420 313.7 1.4e-84
XP_016856592 (OMIM: 607934) PREDICTED: protein-arg ( 594) 1418 313.3 1.8e-84
NP_031391 (OMIM: 607935) protein-arginine deiminas ( 665) 1347 298.1 7.2e-80
XP_011539873 (OMIM: 606755) PREDICTED: protein-arg ( 626) 1309 290.0 1.9e-77
XP_011539452 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 601) 1083 241.6 6.5e-63
XP_011539454 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 484) 1078 240.5 1.1e-62
XP_011539609 (OMIM: 607934) PREDICTED: protein-arg ( 471) 1059 236.5 1.8e-61
XP_016856952 (OMIM: 606755) PREDICTED: protein-arg ( 485) 1049 234.3 8.3e-61
XP_011539455 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 397)  949 212.9 1.9e-54
XP_011539456 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 397)  949 212.9 1.9e-54
XP_011539458 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 386)  943 211.6 4.6e-54
XP_011539457 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 392)  943 211.6 4.6e-54
XP_011539453 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 563)  943 211.7 6.3e-54
XP_011539874 (OMIM: 606755) PREDICTED: protein-arg ( 421)  890 200.3 1.3e-50
XP_011539459 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: prot ( 366)  796 180.2 1.3e-44
XP_016856590 (OMIM: 607934) PREDICTED: protein-arg ( 612)  397 95.0 9.4e-19
XP_016856591 (OMIM: 607934) PREDICTED: protein-arg ( 612)  397 95.0 9.4e-19
NP_037490 (OMIM: 607934) protein-arginine deiminas ( 663)  397 95.0   1e-18
XP_016855637 (OMIM: 607935) PREDICTED: protein-arg ( 350)  372 89.5 2.4e-17


>>NP_997304 (OMIM: 610363) protein-arginine deiminase ty  (694 aa)
 initn: 4691 init1: 4691 opt: 4691  Z-score: 5419.0  bits: 1013.1 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4691; 100.0% identity (100.0% similar) in 694 aa overlap (1-694:1-694)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 ANTVISEKEDATIWWPLSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLYLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 ANTVISEKEDATIWWPLSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLYLT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 GIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTKKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 GIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTKKV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 IFSEEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYWPQKDNSSTFELVLGPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 IFSEEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYWPQKDNSSTFELVLGPD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 QHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEESQDPSIPETVLYKDTVVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 QHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEESQDPSIPETVLYKDTVVF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 RVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQGFVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNRLGRWLQDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 RVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQGFVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNRLGRWLQDE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 MAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVASMDSIGNLM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 MAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVASMDSIGNLM
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 VSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELYSDWLMTGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 VSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELYSDWLMTGH
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 VDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELRADQLLSNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 VDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELRADQLLSNG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 REAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFCLEKLTNIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 REAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFCLEKLTNIP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE0 SDQQPKRSFARPYFPDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQIKGTCCLEEKICCLLEPLGFKCTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 SDQQPKRSFARPYFPDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQIKGTCCLEEKICCLLEPLGFKCTF
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690    
pF1KE0 INDFDCYLTEVGDICACANIRRVPFAFKWWKMVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 INDFDCYLTEVGDICACANIRRVPFAFKWWKMVP
              670       680       690    

>>NP_036519 (OMIM: 180300,605347) protein-arginine deimi  (663 aa)
 initn: 1729 init1: 952 opt: 1507  Z-score: 1739.8  bits: 332.3 E(85289): 3.6e-90
Smith-Waterman score: 2048; 44.8% identity (73.4% similar) in 688 aa overlap (9-694:1-663)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
               :.  ..:... ..:.::::::::   ::. . ::. :  :.:..:  :..:.
NP_036         MAQGTLIRVTPEQPTHAVCVLGTLTQLDICSSAPEDCTSFSINASPGVVVDI
                       10        20        30        40        50  

               70         80        90       100       110         
pF1KE0 ANTVISEKEDA-TIWWPLSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLYL
       :.   ..:... .  :::.  . .:. :   : :.  .::...:::: .  ::  :.:::
NP_036 AHGPPAKKKSTGSSTWPLDPGVEVTLTMKVASGSTGDQKVQISYYGP-KTPPV-KALLYL
             60        70        80        90        100        110

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 TGIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTKK
       ::.:.:: .:: :.:.:. .   . .. : ::: : ::::::::.  .. ..  : .  .
NP_036 TGVEISLCADITRTGKVKPTRAVKDQRTWTWGPCGQGAILLVNCDRDNLESSAMDCEDDE
              120       130       140       150       160       170

     180       190       200       210       220        230        
pF1KE0 VIFSEEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYWPQKDN-SSTFELVLG
       :. ::.. ..: :::... :. .. .. ::::... :  :.::.   . . ::   .:::
NP_036 VLDSEDLQDMSLMTLSTKTPKDFFTNHTLVLHVARSEMDKVRVFQATRGKLSSKCSVVLG
              180       190       200       210       220       230

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE0 PDQHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEESQDPSIPETVLYKDTV
       :   .. : . :.. .  :::::.:::...: :::. ..::.. : .  .::.:...:.:
NP_036 PKWPSHYLMVPGGKHNMDFYVEALAFPDTDFPGLITLTISLLDTS-NLELPEAVVFQDSV
              240       250       260       270        280         

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE0 VFRVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQGFVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNRLGRWLQ
       :::::: .. : :: : ::: :  .. . :. .:: :. :.. ...   :. :   .:.:
NP_036 VFRVAPWIMTPNTQPPQEVYACSIFENEDFLKSVTTLAMKAKCKLTICPEEENMDDQWMQ
     290       300       310       320       330       340         

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE0 DEMAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVASMDSIGN
       ::: . : ::::::  ...:.:.   : :::.:  ..: .::. .  .   ....::.::
NP_036 DEMEIGYIQAPHKTLPVVFDSPRNRGLKEFPIKRVMGPDFGYVTRGPQTGGISGLDSFGN
     350       360       370       380       390       400         

      420       430       440       450       460       470        
pF1KE0 LMVSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELYSDWLMT
       : ::::: :.::::::::.:.:.: ::: ..: : ..:.::: ::::::::.:::::: .
NP_036 LEVSPPVTVRGKEYPLGRILFGDSCYPSNDSRQMHQALQDFLSAQQVQAPVKLYSDWLSV
     410       420       430       440       450       460         

      480       490       500       510       520       530        
pF1KE0 GHVDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELRADQLLS
       ::::::. :.:. :.    ::: :::::: .:::::.:.:.::.:.::::. ..      
NP_036 GHVDEFLSFVPAPDR----KGFRLLLASPRSCYKLFQEQQNEGHGEALLFEGIKK-----
     470       480           490       500       510       520     

      540       550       560       570       580       590        
pF1KE0 NGREAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFCLEKLTN
         .. . : ..:....:...: .::.::  ::..:: ::::.:.:::.::::: :.....
NP_036 --KKQQKIKNILSNKTLREHNSFVERCIDWNRELLKRELGLAESDIIDIPQLFKLKEFSK
                530       540       550       560       570        

      600       610       620       630       640       650        
pF1KE0 IPSDQQPKRSFARPYFPDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQIKGTCCLEEKICCLLEPLGFKC
                  :. .::... :.:.::.::::::::: :.: ::::::.: ::::::..:
NP_036 -----------AEAFFPNMVNMLVLGKHLGIPKPFGPVINGRCCLEEKVCSLLEPLGLQC
                 580       590       600       610       620       

      660       670       680       690    
pF1KE0 TFINDFDCYLTEVGDICACANIRRVPFAFKWWKMVP
       ::::::  :  . :..   .:.:: ::.::::.:::
NP_036 TFINDFFTYHIRHGEVHCGTNVRRKPFSFKWWNMVP
       630       640       650       660   

>>NP_057317 (OMIM: 606755) protein-arginine deiminase ty  (664 aa)
 initn: 1600 init1: 667 opt: 1420  Z-score: 1639.3  bits: 313.7 E(85289): 1.4e-84
Smith-Waterman score: 1924; 43.3% identity (73.4% similar) in 689 aa overlap (9-694:1-664)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
               ::.: :...::. :. :::: :.:  .:. : .:.  . : ..:.  : : .
NP_057         MSLQRIVRVSLEHPTSAVCVAGVETLVDIYGSVPEGTEMFEVYGTPGVDIYI
                       10        20        30        40        50  

               70         80        90       100       110         
pF1KE0 ANTVISEKEDA-TIWWPLSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLYL
       . ..   .: : :  : ..      : :.::: ... ..:...:.. .:  :.. :::::
NP_057 SPNMERGRERADTRRWRFDATLEIIVVMNSPSNDLNDSHVQISYHSSHEPLPLAYAVLYL
             60        70        80        90       100       110  

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 TGIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTKK
       : ...::. :.  .:.  .. .   :..:.:::::.:.::::::.  : . ...:.  ..
NP_057 TCVDISLDCDLNCEGR--QDRNFVDKRQWVWGPSGYGGILLVNCDRDDPSCDVQDNCDQH
            120         130       140       150       160       170

     180       190       200       210       220         230       
pF1KE0 VIFSEEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYW--PQKDNSSTFELVL
       :   ... ..: :.: .:::. ..  ..::::::. ..:.:.:.     .:   ... ::
NP_057 VHCLQDLEDMSVMVLRTQGPAALFDDHKLVLHTSSYDAKRAQVFHICGPEDVCEAYRHVL
              180       190       200       210       220       230

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE0 GPDQHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEESQDPSIPETVLYKDT
       : :. .: .  : .  .: :.::...::.: :.::::. :.:...:.. ..  . .. ::
NP_057 GQDKVSYEVPRLHGD-EERFFVEGLSFPDAGFTGLISFHVTLLDDSNE-DFSASPIFTDT
              240        250       260       270        280        

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE0 VVFRVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQGFVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNRLGRWL
       ::::::: .. : :  :::::.::  .   :::.:..:..:.. ...   .  ::  ::.
NP_057 VVFRVAPWIMTPSTLPPLEVYVCRVRNNTCFVDAVAELARKAGCKLTICPQAENRNDRWI
      290       300       310       320       330       340        

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE0 QDEMAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVASMDSIG
       :::: . :.::::::  ...:.:. ..:..::.:  :.: .::. .. .:..:...::.:
NP_057 QDEMELGYVQAPHKTLPVVFDSPRNGELQDFPYKRILGPDFGYVTREPRDRSVSGLDSFG
      350       360       370       380       390       400        

       420       430       440       450       460       470       
pF1KE0 NLMVSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELYSDWLM
       :: ::::: ..::::::::.:::... :.. :: .....::::.::.:: ::::. ::: 
NP_057 NLEVSPPVVANGKEYPLGRILIGGNL-PGSSGRRVTQVVRDFLHAQKVQPPVELFVDWLA
      410       420       430        440       450       460       

       480       490       500       510       520       530       
pF1KE0 TGHVDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELRADQLL
       .::::::. :.:. :     ::: .:::::.::.:::.:::: :.: ::::. .  :. .
NP_057 VGHVDEFLSFVPAPDG----KGFRMLLASPGACFKLFQEKQKCGHGRALLFQGVVDDEQV
       470       480           490       500       510       520   

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pF1KE0 SNGREAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFCLEKLT
           .. .:.:.:....: . :..:..::  ::..:: ::::.: :::.:::::  :   
NP_057 ----KTISINQVLSNKDLINYNKFVQSCIDWNREVLKRELGLAECDIIDIPQLFKTE---
               530       540       550       560       570         

       600       610       620       630       640       650       
pF1KE0 NIPSDQQPKRSFARPYFPDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQIKGTCCLEEKICCLLEPLGFK
                :. :  .::::. :.:.::.::::::::: :.: ::::::.  ::::::..
NP_057 ---------RKKATAFFPDLVNMLVLGKHLGIPKPFGPIINGCCCLEEKVRSLLEPLGLH
                 580       590       600       610       620       

       660       670       680       690    
pF1KE0 CTFINDFDCYLTEVGDICACANIRRVPFAFKWWKMVP
       ::::.::  :    :..   .:. : ::.::::.:::
NP_057 CTFIDDFTPYHMLHGEVHCGTNVCRKPFSFKWWNMVP
       630       640       650       660    

>>XP_016856592 (OMIM: 607934) PREDICTED: protein-arginin  (594 aa)
 initn: 1144 init1: 340 opt: 1418  Z-score: 1637.7  bits: 313.3 E(85289): 1.8e-84
Smith-Waterman score: 1418; 44.0% identity (70.3% similar) in 529 aa overlap (9-529:1-517)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
               :. . ...:::  :.:::::.:.:  .:. . .:.  . : . ::. : . .
XP_016         MAPKRVVQLSLKMPTHAVCVVGVEAHVDIHSDVPKGANSFRVSGSSGVEVFM
                       10        20        30        40        50  

               70         80        90       100       110         
pF1KE0 ANTVISEKED-ATIWWPLSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLYL
       . .    ::  .   :::.  .  .:.. . :  .   :: :.:.: .::  .: .::::
XP_016 VYNRTRVKEPIGKARWPLDTDADMVVSVGTASKELKDFKVRVSYFGEQEDQALGRSVLYL
             60        70        80        90       100       110  

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 TGIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTKK
       ::...:::::  :.:.:. :.    :: : ::: :.::::::::.  :  .. :   :..
XP_016 TGVDISLEVDTGRTGKVKRSQGD--KKTWRWGPEGYGAILLVNCD-RDNHRSAEPDLTHS
            120       130         140       150        160         

     180        190       200       210       220       230        
pF1KE0 VIFS-EEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYWPQKDNS-STFELVL
        ..:  .. ..: : :. .::. .. ...:::..   .::..::.  .  :: : .. ::
XP_016 WLMSLADLQDMSPMLLSCNGPDKLFDSHKLVLNVPFSDSKRVRVFCARGGNSLSDYKQVL
     170       180       190       200       210       220         

       240       250       260       270       280        290      
pF1KE0 GPDQHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEESQDP-SIPETVLYKD
       ::.  .: .    .. .  ::::...::.:.: ::.: :::::    :: ..::..:. :
XP_016 GPQCLSYEVERQPGEQEIKFYVEGLTFPDADFLGLVSLSVSLV----DPGTLPEVTLFTD
     230       240       250       260       270           280     

        300       310       320           330       340       350  
pF1KE0 TVVFRVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQG----FVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNR
       :: ::.:: .. : :: : :.:.:: .. .:    :.. .. :. :.: ...   .  ::
XP_016 TVGFRMAPWIMTPNTQPPEELYVCRVMDTHGSNEKFLEDMSYLTLKANCKLTICPQVENR
         290       300       310       320       330       340     

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pF1KE0 LGRWLQDEMAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVAS
         ::.:::: : : .::::.  ...:.:.   : .::.:  :.: .::. ..      .:
XP_016 NDRWIQDEMEFGYIEAPHKSFPVVFDSPRNRGLKDFPYKRILGPDFGYVTREIPLPGPSS
         350       360       370       380       390       400     

            420       430       440       450       460       470  
pF1KE0 MDSIGNLMVSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELY
       .::.::: ::::: : : ::::::.:::::: :.. :: :....:.:: :::::::::::
XP_016 LDSFGNLDVSPPVTVGGTEYPLGRILIGSSF-PKSGGRQMARAVRNFLKAQQVQAPVELY
         410       420       430        440       450       460    

            480       490       500       510       520       530  
pF1KE0 SDWLMTGHVDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELR
       :::: .::::::. :.::.:    .::: ::::::::: :::.::..::::.:  ::   
XP_016 SDWLSVGHVDEFLTFVPTSD----QKGFRLLLASPSACLKLFQEKKEEGYGEAAQFDGPL
          470       480           490       500       510       520

            540       550       560       570       580       590  
pF1KE0 ADQLLSNGREAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFC
                                                                   
XP_016 MGGGVPGPHPRRGKAQEVMSAPGAGQCQACSCSHSPLISLPSSLSLFTEVETEAQKGELA
              530       540       550       560       570       580

>>NP_031391 (OMIM: 607935) protein-arginine deiminase ty  (665 aa)
 initn: 1601 init1: 697 opt: 1347  Z-score: 1554.9  bits: 298.1 E(85289): 7.2e-80
Smith-Waterman score: 1851; 44.1% identity (68.8% similar) in 690 aa overlap (9-694:1-665)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
               :  .  ..:.  : :.:: :::: .  :. . ::   : :... : .: ..:
NP_031         MLRERTVRLQYGSRVEAVYVLGTYLWTDVYSAAPAGAQTFSLKHSEHVWVEV
                       10        20        30        40        50  

                 70        80        90       100       110        
pF1KE0 ANTVISEK--EDATIWWPLSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLY
       .    .:.   ..   : ::  :   : :.. :  ...:::.:.::  . . :.  : :.
NP_031 VRDGEAEEVATNGKQRWLLSPSTTLRVTMSQASTEASSDKVTVNYYDEEGSIPIDQAGLF
             60        70        80        90       100       110  

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE0 LTGIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTK
       ::.::.::.::  :.: :: .. :.:  .: ::: : ::::::::.        :: . .
NP_031 LTAIEISLDVDADRDGVVEKNNPKKA--SWTWGPEGQGAILLVNCDRETPWLPKEDCRDE
            120       130         140       150       160       170

      180       190       200       210       220        230       
pF1KE0 KVIFSEEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYWPQKDN-SSTFELVL
       ::  .:.. ..::: : ..::. .   :..::. :  .: :. :.. ..   .. .  .:
NP_031 KVYSKEDLKDMSQMILRTKGPDRLPAGYEIVLYISMSDSDKVGVFYVENPFFGQRYIHIL
              180       190       200       210       220       230

       240       250       260       270       280        290      
pF1KE0 GPDQHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEE-SQDPSIPETVLYKD
       :  .  ...   :.  .  :.::.. ::.  ::::.:  :::.:  .::  :: : .. :
NP_031 GRRKLYHVVKYTGGSAELLFFVEGLCFPDEGFSGLVSIHVSLLEYMAQD--IPLTPIFTD
              240       250       260       270         280        

        300       310       320       330       340       350      
pF1KE0 TVVFRVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQGFVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNRLGRW
       ::.::.:: .. :    :. :..:   .   :.  : .: ::.: ..   ..  ::  ::
NP_031 TVIFRIAPWIMTPNILPPVSVFVCCMKDNYLFLKEVKNLVEKTNCELKVCFQYLNRGDRW
      290       300       310       320       330       340        

        360       370       380       390       400       410      
pF1KE0 LQDEMAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVASMDSI
       .:::. : : .::::   ..::.:. ..: .::.:  :.: .::. ..   ..:.:.::.
NP_031 IQDEIEFGYIEAPHKGFPVVLDSPRDGNLKDFPVKELLGPDFGYVTREPLFESVTSLDSF
      350       360       370       380       390       400        

        420       430       440       450       460       470      
pF1KE0 GNLMVSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELYSDWL
       ::: ::::: :.:: :::::.:::::: : . :: :.:..:::: :::::::::::::::
NP_031 GNLEVSPPVTVNGKTYPLGRILIGSSF-PLSGGRRMTKVVRDFLKAQQVQAPVELYSDWL
      410       420       430        440       450       460       

        480       490       500       510       520       530      
pF1KE0 MTGHVDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELRADQL
        .::::::: :.:      : : ::::.:: ::::::::::::.:.:.:..:  : .   
NP_031 TVGHVDEFMSFVPI----PGTKKFLLLMASTSACYKLFREKQKDGHGEAIMFKGLGG---
       470       480           490       500       510       520   

        540       550       560       570       580       590      
pF1KE0 LSNGREAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFCLEKL
       .:. :   ::...:..::: ..: : ..:.  :::::: ::::.:::::..: :: ... 
NP_031 MSSKR--ITINKILSNESLVQENLYFQRCLDWNRDILKKELGLTEQDIIDLPALFKMDE-
                530       540       550       560       570        

        600       610       620       630       640       650      
pF1KE0 TNIPSDQQPKRSFARPYFPDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQIKGTCCLEEKICCLLEPLGF
            :..     :: .::... :::. :.::::::::::..  :::: ..  ::::::.
NP_031 -----DHR-----ARAFFPNMVNMIVLDKDLGIPKPFGPQVEEECCLEMHVRGLLEPLGL
            580            590       600       610       620       

        660       670       680       690    
pF1KE0 KCTFINDFDCYLTEVGDICACANIRRVPFAFKWWKMVP
       .::::.:.. :   .:..   .:.:: ::.::::.:::
NP_031 ECTFIDDISAYHKFLGEVHCGTNVRRKPFTFKWWHMVP
       630       640       650       660     

>>XP_011539873 (OMIM: 606755) PREDICTED: protein-arginin  (626 aa)
 initn: 1480 init1: 667 opt: 1309  Z-score: 1511.4  bits: 290.0 E(85289): 1.9e-77
Smith-Waterman score: 1813; 43.5% identity (74.0% similar) in 650 aa overlap (48-694:2-626)

        20        30        40        50        60        70       
pF1KE0 SLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDVANTVISEKEDA-TIWWP
                                     : ..:.  : : .. ..   .: : :  : 
XP_011                              MFEVYGTPGVDIYISPNMERGRERADTRRWR
                                            10        20        30 

         80        90       100       110       120       130      
pF1KE0 LSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLYLTGIEVSLEVDIYRNGQV
       ..      : :.::: ... ..:...:.. .:  :.. :::::: ...::. :.  .:. 
XP_011 FDATLEIIVVMNSPSNDLNDSHVQISYHSSHEPLPLAYAVLYLTCVDISLDCDLNCEGR-
              40        50        60        70        80        90 

        140       150       160       170       180       190      
pF1KE0 EMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTKKVIFSEEITNLSQMTLNV
        .. .   :..:.:::::.:.::::::.  : . ...:.  ..:   ... ..: :.: .
XP_011 -QDRNFVDKRQWVWGPSGYGGILLVNCDRDDPSCDVQDNCDQHVHCLQDLEDMSVMVLRT
               100       110       120       130       140         

        200       210       220         230       240       250    
pF1KE0 QGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYW--PQKDNSSTFELVLGPDQHAYTLALLGNHLK
       :::. ..  ..::::::. ..:.:.:.     .:   ... ::: :. .: .  : .  .
XP_011 QGPAALFDDHKLVLHTSSYDAKRAQVFHICGPEDVCEAYRHVLGQDKVSYEVPRLHGD-E
     150       160       170       180       190       200         

          260       270       280       290       300       310    
pF1KE0 ETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEESQDPSIPETVLYKDTVVFRVAPCVFIPCTQVP
       : :.::...::.: :.::::. :.:...:.. ..  . .. ::::::::: .. : :  :
XP_011 ERFFVEGLSFPDAGFTGLISFHVTLLDDSNE-DFSASPIFTDTVVFRVAPWIMTPSTLPP
      210       220       230        240       250       260       

          320       330       340       350       360       370    
pF1KE0 LEVYLCRELQLQGFVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNRLGRWLQDEMAFCYTQAPHKTTS
       ::::.::  .   :::.:..:..:.. ...   .  ::  ::.:::: . :.::::::  
XP_011 LEVYVCRVRNNTCFVDAVAELARKAGCKLTICPQAENRNDRWIQDEMELGYVQAPHKTLP
       270       280       290       300       310       320       

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pF1KE0 LILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVASMDSIGNLMVSPPVKVQGKEYPL
       ...:.:. ..:..::.:  :.: .::. .. .:..:...::.::: ::::: ..::::::
XP_011 VVFDSPRNGELQDFPYKRILGPDFGYVTREPRDRSVSGLDSFGNLEVSPPVVANGKEYPL
       330       340       350       360       370       380       

          440       450       460       470       480       490    
pF1KE0 GRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELYSDWLMTGHVDEFMCFIPTDDKN
       ::.:::... :.. :: .....::::.::.:: ::::. ::: .::::::. :.:. :  
XP_011 GRILIGGNL-PGSSGRRVTQVVRDFLHAQKVQPPVELFVDWLAVGHVDEFLSFVPAPD--
       390        400       410       420       430       440      

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pF1KE0 EGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELRADQLLSNGREAKTIDQLLADES
        :: :: .:::::.::.:::.:::: :.: ::::. .  :. .    .. .:.:.:....
XP_011 -GK-GFRMLLASPGACFKLFQEKQKCGHGRALLFQGVVDDEQV----KTISINQVLSNKD
            450       460       470       480           490        

          560       570       580       590       600       610    
pF1KE0 LKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFCLEKLTNIPSDQQPKRSFARPYF
       : . :..:..::  ::..:: ::::.: :::.:::::  :.          :.. :  .:
XP_011 LINYNKFVQSCIDWNREVLKRELGLAECDIIDIPQLFKTER----------KKATA--FF
      500       510       520       530                 540        

          620       630       640       650       660       670    
pF1KE0 PDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQIKGTCCLEEKICCLLEPLGFKCTFINDFDCYLTEVGDI
       :::. :.:.::.::::::::: :.: ::::::.  ::::::..::::.::  :    :..
XP_011 PDLVNMLVLGKHLGIPKPFGPIINGCCCLEEKVRSLLEPLGLHCTFIDDFTPYHMLHGEV
        550       560       570       580       590       600      

          680       690    
pF1KE0 CACANIRRVPFAFKWWKMVP
          .:. : ::.::::.:::
XP_011 HCGTNVCRKPFSFKWWNMVP
        610       620      

>>XP_011539452 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: protein-  (601 aa)
 initn: 1793 init1: 741 opt: 1083  Z-score: 1250.5  bits: 241.6 E(85289): 6.5e-63
Smith-Waterman score: 1751; 41.4% identity (67.4% similar) in 688 aa overlap (9-694:1-601)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
               :.  ..:... ..:.::::::::   ::. . ::. :  :.:..:  :..:.
XP_011         MAQGTLIRVTPEQPTHAVCVLGTLTQLDICSSAPEDCTSFSINASPGVVVDI
                       10        20        30        40        50  

               70         80        90       100       110         
pF1KE0 ANTVISEKEDA-TIWWPLSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLYL
       :.   ..:... .  :::.  . .:. :   : :.  .::...:::: .  ::  :.:::
XP_011 AHGPPAKKKSTGSSTWPLDPGVEVTLTMKVASGSTGDQKVQISYYGP-KTPPV-KALLYL
             60        70        80        90        100        110

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 TGIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTKK
       ::..                                                :.:     
XP_011 TGVD------------------------------------------------LQD-----
                                                                   

     180       190       200       210       220        230        
pF1KE0 VIFSEEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYWPQKDN-SSTFELVLG
                .: :::... :. .. .. ::::... :  :.::.   . . ::   .:::
XP_011 ---------MSLMTLSTKTPKDFFTNHTLVLHVARSEMDKVRVFQATRGKLSSKCSVVLG
                120       130       140       150       160        

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE0 PDQHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEESQDPSIPETVLYKDTV
       :   .. : . :.. .  :::::.:::...: :::. ..::.. : .  .::.:...:.:
XP_011 PKWPSHYLMVPGGKHNMDFYVEALAFPDTDFPGLITLTISLLDTS-NLELPEAVVFQDSV
      170       180       190       200       210        220       

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE0 VFRVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQGFVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNRLGRWLQ
       :::::: .. : :: : ::: :  .. . :. .:: :. :.. ...   :. :   .:.:
XP_011 VFRVAPWIMTPNTQPPQEVYACSIFENEDFLKSVTTLAMKAKCKLTICPEEENMDDQWMQ
       230       240       250       260       270       280       

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE0 DEMAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVASMDSIGN
       ::: . : ::::::  ...:.:.   : :::.:  ..: .::. .  .   ....::.::
XP_011 DEMEIGYIQAPHKTLPVVFDSPRNRGLKEFPIKRVMGPDFGYVTRGPQTGGISGLDSFGN
       290       300       310       320       330       340       

      420       430       440       450       460       470        
pF1KE0 LMVSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELYSDWLMT
       : ::::: :.::::::::.:.:.: ::: ..: : ..:.::: ::::::::.:::::: .
XP_011 LEVSPPVTVRGKEYPLGRILFGDSCYPSNDSRQMHQALQDFLSAQQVQAPVKLYSDWLSV
       350       360       370       380       390       400       

      480       490       500       510       520       530        
pF1KE0 GHVDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELRADQLLS
       ::::::. :.:. :.    ::: :::::: .:::::.:.:.::.:.::::. ..      
XP_011 GHVDEFLSFVPAPDR----KGFRLLLASPRSCYKLFQEQQNEGHGEALLFEGIKK-----
       410       420           430       440       450             

      540       550       560       570       580       590        
pF1KE0 NGREAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFCLEKLTN
         .. . : ..:....:...: .::.::  ::..:: ::::.:.:::.::::: :.....
XP_011 --KKQQKIKNILSNKTLREHNSFVERCIDWNRELLKRELGLAESDIIDIPQLFKLKEFSK
        460       470       480       490       500       510      

      600       610       620       630       640       650        
pF1KE0 IPSDQQPKRSFARPYFPDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQIKGTCCLEEKICCLLEPLGFKC
                  :. .::... :.:.::.::::::::: :.: ::::::.: ::::::..:
XP_011 -----------AEAFFPNMVNMLVLGKHLGIPKPFGPVINGRCCLEEKVCSLLEPLGLQC
                   520       530       540       550       560     

      660       670       680       690    
pF1KE0 TFINDFDCYLTEVGDICACANIRRVPFAFKWWKMVP
       ::::::  :  . :..   .:.:: ::.::::.:::
XP_011 TFINDFFTYHIRHGEVHCGTNVRRKPFSFKWWNMVP
         570       580       590       600 

>>XP_011539454 (OMIM: 180300,605347) PREDICTED: protein-  (484 aa)
 initn: 1578 init1: 741 opt: 1078  Z-score: 1246.2  bits: 240.5 E(85289): 1.1e-62
Smith-Waterman score: 1619; 47.1% identity (74.8% similar) in 507 aa overlap (189-694:1-484)

      160       170       180       190       200       210        
pF1KE0 LLVNCNPADVGQQLEDKKTKKVIFSEEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESK
                                     .: :::... :. .. .. ::::... :  
XP_011                               MSLMTLSTKTPKDFFTNHTLVLHVARSEMD
                                             10        20        30

      220        230       240       250       260       270       
pF1KE0 KARVYWPQKDN-SSTFELVLGPDQHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSV
       :.::.   . . ::   .::::   .. : . :.. .  :::::.:::...: :::. ..
XP_011 KVRVFQATRGKLSSKCSVVLGPKWPSHYLMVPGGKHNMDFYVEALAFPDTDFPGLITLTI
               40        50        60        70        80        90

       280       290       300       310       320       330       
pF1KE0 SLVEESQDPSIPETVLYKDTVVFRVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQGFVDTVTKLSE
       ::.. : .  .::.:...:.::::::: .. : :: : ::: :  .. . :. .:: :. 
XP_011 SLLDTS-NLELPEAVVFQDSVVFRVAPWIMTPNTQPPQEVYACSIFENEDFLKSVTTLAM
               100       110       120       130       140         

       340       350       360       370       380       390       
pF1KE0 KSNSQVASVYEDPNRLGRWLQDEMAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPG
       :.. ...   :. :   .:.:::: . : ::::::  ...:.:.   : :::.:  ..: 
XP_011 KAKCKLTICPEEENMDDQWMQDEMEIGYIQAPHKTLPVVFDSPRNRGLKEFPIKRVMGPD
     150       160       170       180       190       200         

       400       410       420       430       440       450       
pF1KE0 IGYMIQDTEDHKVASMDSIGNLMVSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLR
       .::. .  .   ....::.::: ::::: :.::::::::.:.:.: ::: ..: : ..:.
XP_011 FGYVTRGPQTGGISGLDSFGNLEVSPPVTVRGKEYPLGRILFGDSCYPSNDSRQMHQALQ
     210       220       230       240       250       260         

       460       470       480       490       500       510       
pF1KE0 DFLYAQQVQAPVELYSDWLMTGHVDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREK
       ::: ::::::::.:::::: .::::::. :.:. :    .::: :::::: .:::::.:.
XP_011 DFLSAQQVQAPVKLYSDWLSVGHVDEFLSFVPAPD----RKGFRLLLASPRSCYKLFQEQ
     270       280       290       300           310       320     

       520       530       540       550       560       570       
pF1KE0 QKEGYGDALLFDELRADQLLSNGREAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTEL
       :.::.:.::::. ..        .. . : ..:....:...: .::.::  ::..:: ::
XP_011 QNEGHGEALLFEGIKK-------KKQQKIKNILSNKTLREHNSFVERCIDWNRELLKREL
         330       340              350       360       370        

       580       590       600       610       620       630       
pF1KE0 GLVEQDIIEIPQLFCLEKLTNIPSDQQPKRSFARPYFPDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQI
       ::.:.:::.::::: :.....           :. .::... :.:.::.::::::::: :
XP_011 GLAESDIIDIPQLFKLKEFSK-----------AEAFFPNMVNMLVLGKHLGIPKPFGPVI
      380       390                  400       410       420       

       640       650       660       670       680       690    
pF1KE0 KGTCCLEEKICCLLEPLGFKCTFINDFDCYLTEVGDICACANIRRVPFAFKWWKMVP
       .: ::::::.: ::::::..:::::::  :  . :..   .:.:: ::.::::.:::
XP_011 NGRCCLEEKVCSLLEPLGLQCTFINDFFTYHIRHGEVHCGTNVRRKPFSFKWWNMVP
       430       440       450       460       470       480    

>>XP_011539609 (OMIM: 607934) PREDICTED: protein-arginin  (471 aa)
 initn: 1022 init1: 339 opt: 1059  Z-score: 1224.4  bits: 236.5 E(85289): 1.8e-61
Smith-Waterman score: 1059; 40.1% identity (67.7% similar) in 449 aa overlap (9-449:1-441)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
               :. . ...:::  :.:::::.:.:  .:. . .:.  . : . ::. : . .
XP_011         MAPKRVVQLSLKMPTHAVCVVGVEAHVDIHSDVPKGANSFRVSGSSGVEVFM
                       10        20        30        40        50  

               70         80        90       100       110         
pF1KE0 ANTVISEKED-ATIWWPLSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLYL
       . .    ::  .   :::.  .  .:.. . :  .   :: :.:.: .::  .: .::::
XP_011 VYNRTRVKEPIGKARWPLDTDADMVVSVGTASKELKDFKVRVSYFGEQEDQALGRSVLYL
             60        70        80        90       100       110  

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 TGIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTKK
       ::...:::::  :.:.:. :  .  :: : ::: :.::::::::.  :  .. :   :..
XP_011 TGVDISLEVDTGRTGKVKRS--QGDKKTWRWGPEGYGAILLVNCD-RDNHRSAEPDLTHS
            120       130         140       150        160         

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pF1KE0 VIFS-EEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYWPQKDNS-STFELVL
        ..:  .. ..: : :. .::. .. ...:::..   .::..::.  .  :: : .. ::
XP_011 WLMSLADLQDMSPMLLSCNGPDKLFDSHKLVLNVPFSDSKRVRVFCARGGNSLSDYKQVL
     170       180       190       200       210       220         

       240       250       260       270       280        290      
pF1KE0 GPDQHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEESQDP-SIPETVLYKD
       ::.  .: .    .. .  ::::...::.:.: ::.: :::::    :: ..::..:. :
XP_011 GPQCLSYEVERQPGEQEIKFYVEGLTFPDADFLGLVSLSVSLV----DPGTLPEVTLFTD
     230       240       250       260       270           280     

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pF1KE0 TVVFRVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQG----FVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNR
       :: ::.:: .. : :: : :.:.:: .. .:    :.. .. :. :.: ...   .  ::
XP_011 TVGFRMAPWIMTPNTQPPEELYVCRVMDTHGSNEKFLEDMSYLTLKANCKLTICPQVENR
         290       300       310       320       330       340     

            360       370       380       390       400       410  
pF1KE0 LGRWLQDEMAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVAS
         ::.:::: : : .::::.  ...:.:.   : .::.:  :.: .::. ..      .:
XP_011 NDRWIQDEMEFGYIEAPHKSFPVVFDSPRNRGLKDFPYKRILGPDFGYVTREIPLPGPSS
         350       360       370       380       390       400     

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pF1KE0 MDSIGNLMVSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELY
       .::.::: ::::: : : ::::::.:::::: :.: :                       
XP_011 LDSFGNLDVSPPVTVGGTEYPLGRILIGSSF-PKASGCSWLAPALASNSSKRRKKRVMGR
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pF1KE0 SDWLMTGHVDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELR
                                                                   
XP_011 QPSLMVL                                                     
          470                                                      

>>XP_016856952 (OMIM: 606755) PREDICTED: protein-arginin  (485 aa)
 initn: 1244 init1: 530 opt: 1049  Z-score: 1212.6  bits: 234.3 E(85289): 8.3e-61
Smith-Waterman score: 1553; 47.0% identity (76.0% similar) in 508 aa overlap (189-694:1-485)

      160       170       180       190       200       210        
pF1KE0 LLVNCNPADVGQQLEDKKTKKVIFSEEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESK
                                     .: :.: .:::. ..  ..::::::. ..:
XP_016                               MSVMVLRTQGPAALFDDHKLVLHTSSYDAK
                                             10        20        30

      220         230       240       250       260       270      
pF1KE0 KARVYW--PQKDNSSTFELVLGPDQHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYS
       .:.:.     .:   ... ::: :. .: .  : .  .: :.::...::.: :.::::. 
XP_016 RAQVFHICGPEDVCEAYRHVLGQDKVSYEVPRLHGD-EERFFVEGLSFPDAGFTGLISFH
               40        50        60         70        80         

        280       290       300       310       320       330      
pF1KE0 VSLVEESQDPSIPETVLYKDTVVFRVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQGFVDTVTKLS
       :.:...:.. ..  . .. ::::::::: .. : :  :::::.::  .   :::.:..:.
XP_016 VTLLDDSNE-DFSASPIFTDTVVFRVAPWIMTPSTLPPLEVYVCRVRNNTCFVDAVAELA
      90        100       110       120       130       140        

        340       350       360       370       380       390      
pF1KE0 EKSNSQVASVYEDPNRLGRWLQDEMAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSP
       .:.. ...   .  ::  ::.:::: . :.::::::  ...:.:. ..:..::.:  :.:
XP_016 RKAGCKLTICPQAENRNDRWIQDEMELGYVQAPHKTLPVVFDSPRNGELQDFPYKRILGP
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        .::. .. .:..:...::.::: ::::: ..::::::::.:::... :.. :: .....
XP_016 DFGYVTREPRDRSVSGLDSFGNLEVSPPVVANGKEYPLGRILIGGNL-PGSSGRRVTQVV
      210       220       230       240       250        260       

        460       470       480       490       500       510      
pF1KE0 RDFLYAQQVQAPVELYSDWLMTGHVDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFRE
       ::::.::.:: ::::. ::: .::::::. :.:. :   :: :: .:::::.::.:::.:
XP_016 RDFLHAQKVQPPVELFVDWLAVGHVDEFLSFVPAPD---GK-GFRMLLASPGACFKLFQE
       270       280       290       300           310       320   

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pF1KE0 KQKEGYGDALLFDELRADQLLSNGREAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTE
       ::: :.: ::::. .  :. .    .. .:.:.:....: . :..:..::  ::..:: :
XP_016 KQKCGHGRALLFQGVVDDEQV----KTISINQVLSNKDLINYNKFVQSCIDWNREVLKRE
           330       340           350       360       370         

        580       590       600       610       620       630      
pF1KE0 LGLVEQDIIEIPQLFCLEKLTNIPSDQQPKRSFARPYFPDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQ
       :::.: :::.:::::  :.          :.. :  .::::. :.:.::.::::::::: 
XP_016 LGLAECDIIDIPQLFKTER----------KKATA--FFPDLVNMLVLGKHLGIPKPFGPI
     380       390                 400         410       420       

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pF1KE0 IKGTCCLEEKICCLLEPLGFKCTFINDFDCYLTEVGDICACANIRRVPFAFKWWKMVP
       :.: ::::::.  ::::::..::::.::  :    :..   .:. : ::.::::.:::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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