Result of FASTA (omim) for pF1KE0333
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0333, 633 aa
  1>>>pF1KE0333 633 - 633 aa - 633 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.0632+/-0.000603; mu= -8.7062+/- 0.037
 mean_var=273.9472+/-55.935, 0's: 0 Z-trim(114.4): 26  B-trim: 308 in 1/52
 Lambda= 0.077489
 statistics sampled from 24184 (24203) to 24184 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.617), E-opt: 0.2 (0.284), width:  16
 Scan time: 11.160

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
XP_011539137 (OMIM: 612467) PREDICTED: guanylate-b ( 633) 4113 474.1 6.7e-133
NP_940862 (OMIM: 612467) guanylate-binding protein ( 633) 4113 474.1 6.7e-133
NP_001307186 (OMIM: 612467) guanylate-binding prot ( 503) 3240 376.4 1.3e-103
NP_443173 (OMIM: 612466) guanylate-binding protein ( 640) 2873 335.4 3.6e-91
NP_997281 (OMIM: 612468) guanylate-binding protein ( 638) 2859 333.9 1.1e-90
NP_002044 (OMIM: 600411) guanylate-binding protein ( 592) 2080 246.8 1.7e-64
NP_004111 (OMIM: 600412) guanylate-binding protein ( 591) 2073 246.0 2.8e-64
NP_060754 (OMIM: 600413) guanylate-binding protein ( 595) 2037 242.0 4.6e-63
NP_001127958 (OMIM: 611467) guanylate-binding prot ( 586) 1937 230.8 1.1e-59
NP_443174 (OMIM: 611467) guanylate-binding protein ( 586) 1937 230.8 1.1e-59
NP_001306108 (OMIM: 600413) guanylate-binding prot ( 516) 1701 204.4 8.4e-52
XP_011539535 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 516) 1701 204.4 8.4e-52
XP_005270800 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 516) 1701 204.4 8.4e-52
XP_006710637 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 568) 1603 193.4 1.8e-48
NP_001306110 (OMIM: 600413) guanylate-binding prot ( 544) 1577 190.5 1.3e-47
NP_001306109 (OMIM: 600413) guanylate-binding prot ( 461) 1340 164.0 1.1e-39
XP_016856502 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 461) 1340 164.0 1.1e-39
XP_011539536 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 514)  984 124.2 1.1e-27
XP_016856503 (OMIM: 600413) PREDICTED: guanylate-b ( 380)  763 99.5 2.4e-20


>>XP_011539137 (OMIM: 612467) PREDICTED: guanylate-bindi  (633 aa)
 initn: 4113 init1: 4113 opt: 4113  Z-score: 2507.0  bits: 474.1 E(85289): 6.7e-133
Smith-Waterman score: 4113; 99.1% identity (99.7% similar) in 633 aa overlap (1-633:1-633)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MESGPKMLAPVCQVENNNEQLLVNQQAIQILEKISQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNHLAG
       :::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MESGPKMLAPVCLVENNNEQLLVNQQAIQILEKISQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNHLAG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 QNHGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDPKNDSWIFALAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QNHGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDPKNDSWIFALAV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 LLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRPDGVEDSTEFVSFFPDFLWTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRPDGVEDSTEFVSFFPDFLWTV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 RDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFPRECIRRFFPKRKCFVFDRPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFPRECIRRFFPKRKCFVFDRPT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 NDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKTLREGITVTGNRLGTLAVTYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKTLREGITVTGNRLGTLAVTYV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 EAINSGAVPCLEDAVITLAQRENSAAVQRASDYYSQQMAQRVKFPTDTLQELLDVHAACE
       ::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::.::::::::::.:::::
XP_011 EAINSGAVPCLENAVITLAQRENSAAVQRAADYYSQQMAQRVKLPTDTLQELLDMHAACE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 REAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEESSVQYCQAKLNELSKGLMES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 REAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEESSVQYCQAKLNELSKGLMES
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 ISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVFQRFLESQMVIEESILQSDKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVFQRFLESQMVIEESILQSDKA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 LTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQVKSRKENIAQLKEKLQMEREH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
XP_011 LTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQDKSRKENIAQLKEKLQMEREH
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 LLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKRMIDTTKNDDTPWIARTLDNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKRMIDTTKNDDTPWIARTLDNL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630   
pF1KE0 ADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF
              610       620       630   

>>NP_940862 (OMIM: 612467) guanylate-binding protein 6 i  (633 aa)
 initn: 4113 init1: 4113 opt: 4113  Z-score: 2507.0  bits: 474.1 E(85289): 6.7e-133
Smith-Waterman score: 4113; 99.1% identity (99.7% similar) in 633 aa overlap (1-633:1-633)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MESGPKMLAPVCQVENNNEQLLVNQQAIQILEKISQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNHLAG
       :::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 MESGPKMLAPVCLVENNNEQLLVNQQAIQILEKISQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNHLAG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 QNHGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDPKNDSWIFALAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 QNHGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDPKNDSWIFALAV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 LLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRPDGVEDSTEFVSFFPDFLWTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 LLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRPDGVEDSTEFVSFFPDFLWTV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 RDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFPRECIRRFFPKRKCFVFDRPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 RDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFPRECIRRFFPKRKCFVFDRPT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 NDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKTLREGITVTGNRLGTLAVTYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 NDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKTLREGITVTGNRLGTLAVTYV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 EAINSGAVPCLEDAVITLAQRENSAAVQRASDYYSQQMAQRVKFPTDTLQELLDVHAACE
       ::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::.::::::::::.:::::
NP_940 EAINSGAVPCLENAVITLAQRENSAAVQRAADYYSQQMAQRVKLPTDTLQELLDMHAACE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 REAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEESSVQYCQAKLNELSKGLMES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 REAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEESSVQYCQAKLNELSKGLMES
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 ISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVFQRFLESQMVIEESILQSDKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 ISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVFQRFLESQMVIEESILQSDKA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 LTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQVKSRKENIAQLKEKLQMEREH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
NP_940 LTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQDKSRKENIAQLKEKLQMEREH
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 LLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKRMIDTTKNDDTPWIARTLDNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 LLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKRMIDTTKNDDTPWIARTLDNL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630   
pF1KE0 ADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_940 ADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF
              610       620       630   

>>NP_001307186 (OMIM: 612467) guanylate-binding protein   (503 aa)
 initn: 3240 init1: 3240 opt: 3240  Z-score: 1981.0  bits: 376.4 E(85289): 1.3e-103
Smith-Waterman score: 3240; 99.0% identity (99.8% similar) in 503 aa overlap (131-633:1-503)

              110       120       130       140       150       160
pF1KE0 LGDVEKGDPKNDSWIFALAVLLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRP
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001                               MSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRP
                                             10        20        30

              170       180       190       200       210       220
pF1KE0 DGVEDSTEFVSFFPDFLWTVRDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DGVEDSTEFVSFFPDFLWTVRDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFP
               40        50        60        70        80        90

              230       240       250       260       270       280
pF1KE0 RECIRRFFPKRKCFVFDRPTNDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RECIRRFFPKRKCFVFDRPTNDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKT
              100       110       120       130       140       150

              290       300       310       320       330       340
pF1KE0 LREGITVTGNRLGTLAVTYVEAINSGAVPCLEDAVITLAQRENSAAVQRASDYYSQQMAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.:::::::::
NP_001 LREGITVTGNRLGTLAVTYVEAINSGAVPCLENAVITLAQRENSAAVQRAADYYSQQMAQ
              160       170       180       190       200       210

              350       360       370       380       390       400
pF1KE0 RVKFPTDTLQELLDVHAACEREAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEE
       :::.::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RVKLPTDTLQELLDMHAACEREAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEE
              220       230       240       250       260       270

              410       420       430       440       450       460
pF1KE0 SSVQYCQAKLNELSKGLMESISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSVQYCQAKLNELSKGLMESISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVF
              280       290       300       310       320       330

              470       480       490       500       510       520
pF1KE0 QRFLESQMVIEESILQSDKALTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: 
NP_001 QRFLESQMVIEESILQSDKALTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQD
              340       350       360       370       380       390

              530       540       550       560       570       580
pF1KE0 KSRKENIAQLKEKLQMEREHLLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KSRKENIAQLKEKLQMEREHLLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKR
              400       410       420       430       440       450

              590       600       610       620       630   
pF1KE0 MIDTTKNDDTPWIARTLDNLADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MIDTTKNDDTPWIARTLDNLADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF
              460       470       480       490       500   

>>NP_443173 (OMIM: 612466) guanylate-binding protein 4 [  (640 aa)
 initn: 2943 init1: 2840 opt: 2873  Z-score: 1757.7  bits: 335.4 E(85289): 3.6e-91
Smith-Waterman score: 2873; 70.1% identity (89.4% similar) in 623 aa overlap (2-624:17-638)

                              10        20        30        40     
pF1KE0                MESGPKMLAPVCQVENNNEQLLVNQQAIQILEKISQPVVVVAIVG
                       ::   :.::.: :::..::: ::..:..::.:::::::::::::
NP_443 MGERTLHAAVPTPGYPESESIMMAPICLVENQEEQLTVNSKALEILDKISQPVVVVAIVG
               10        20        30        40        50        60

          50        60        70        80        90       100     
pF1KE0 LYRTGKSYLMNHLAGQNHGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLVLLDTEGLGDVE
       :::::::::::.:::. .:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
NP_443 LYRTGKSYLMNRLAGKRNGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHLSKPNHTLVLLDTEGLGDVE
               70        80        90       100       110       120

         110       120       130       140       150       160     
pF1KE0 KGDPKNDSWIFALAVLLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRPDGVED
       :..:::::::::::::: :.:::::.:::::::::::::::::.:::.::: :::: .::
NP_443 KSNPKNDSWIFALAVLLSSSFVYNSVSTINHQALEQLHYVTELAELIRAKSCPRPDEAED
              130       140       150       160       170       180

         170       180       190       200       210       220     
pF1KE0 STEFVSFFPDFLWTVRDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFPRECIR
       :.::.::::::.::::::::::::.:.::::::::::::::: :.::..:.::.::::::
NP_443 SSEFASFFPDFIWTVRDFTLELKLDGNPITEDEYLENALKLIPGKNPKIQNSNMPRECIR
              190       200       210       220       230       240

         230       240       250       260       270       280     
pF1KE0 RFFPKRKCFVFDRPTNDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKTLREGI
       .:: ::::::::::::::. : ....: :..:. .:  :.. :::::::::.::::::::
NP_443 HFFRKRKCFVFDRPTNDKQYLNHMDEVPEENLERHFLMQSDNFCSYIFTHAKTKTLREGI
              250       260       270       280       290       300

         290       300       310       320       330       340     
pF1KE0 TVTGNRLGTLAVTYVEAINSGAVPCLEDAVITLAQRENSAAVQRASDYYSQQMAQRVKFP
        :::.:::::.::::.:::::::::::.:: .::: :: ::::::.:.:::::::....:
NP_443 IVTGKRLGTLVVTYVDAINSGAVPCLENAVTALAQLENPAAVQRAADHYSQQMAQQLRLP
              310       320       330       340       350       360

         350       360       370       380       390       400     
pF1KE0 TDTLQELLDVHAACEREAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEESSVQY
       ::::::::::::::::::::.::::::::::.:::::...:  .:::::.:::::.:..:
NP_443 TDTLQELLDVHAACEREAIAVFMEHSFKDENHEFQKKLVDTIEKKKGDFVLQNEEASAKY
              370       380       390       400       410       420

         410       420       430       440       450       460     
pF1KE0 CQAKLNELSKGLMESISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVFQRFLE
       :::.:..::. : :::  : :::::::.::.: :...: ::  ::::::::.::.: ::.
NP_443 CQAELKRLSEHLTESILRGIFSVPGGHNLYLEEKKQVEWDYKLVPRKGVKANEVLQNFLQ
              430       440       450       460       470       480

         470       480       490       500       510       520     
pF1KE0 SQMVIEESILQSDKALTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQVKSRKE
       ::.:.::::::::::::  :::.:..:: :::::::::::..: .::::.:::: .: .:
NP_443 SQVVVEESILQSDKALTAGEKAIAAERAMKEAAEKEQELLREKQKEQQQMMEAQERSFQE
              490       500       510       520       530       540

         530       540       550       560       570       580     
pF1KE0 NIAQLKEKLQMEREHLLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKRMIDTT
        .::...::. :::.::::.  .:.:  :::.. :.: :.:: :..: ::.:.:. :..:
NP_443 YMAQMEKKLEEERENLLREHERLLKHKLKVQEEMLKEEFQKKSEQLNKEINQLKEKIEST
              550       560       570       580       590       600

         590       600       610       620       630   
pF1KE0 KNDDTPWIARTLDNLADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF
       ::..   . . ::  .. . . : . .::.: :.: ..:         
NP_443 KNEQLR-LLKILDMASNIMIVTLPGASKLLGVGTKYLGSRI       
               610       620       630       640       

>>NP_997281 (OMIM: 612468) guanylate-binding protein 7 [  (638 aa)
 initn: 2884 init1: 2851 opt: 2859  Z-score: 1749.3  bits: 333.9 E(85289): 1.1e-90
Smith-Waterman score: 2859; 69.0% identity (88.3% similar) in 632 aa overlap (1-632:1-632)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MESGPKMLAPVCQVENNNEQLLVNQQAIQILEKISQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNHLAG
       : :  .: .::: .::.. .:.::..:..::  :.:::::::::::::::::::::.:::
NP_997 MASEIHMPGPVCLTENTKGHLVVNSEALEILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 QNHGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDPKNDSWIFALAV
       .:.::::: ::.:::::::::::::::::::::.:::::::::.::.:::.:::::::::
NP_997 KNKGFPLGCTVKSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLILLDTEGLGDMEKSDPKSDSWIFALAV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 LLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRPDGVEDSTEFVSFFPDFLWTV
       :: :.::::::.::::::::::::::::::::.::: :::: ::::.:::::::::.:::
NP_997 LLSSSFVYNSMGTINHQALEQLHYVTELTELIRAKSCPRPDEVEDSSEFVSFFPDFIWTV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 RDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFPRECIRRFFPKRKCFVFDRPT
       :::::::::.:::::::::::::::::.:.::..:.:: ::: ::.::::.:::::::: 
NP_997 RDFTLELKLDGHPITEDEYLENALKLISGKNPQIQNSNKPREWIRHFFPKQKCFVFDRPI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 NDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKTLREGITVTGNRLGTLAVTYV
       ::: :: ..:.: : ::: .:: :.. :::::::::.:::::::: ::::::: :. ::.
NP_997 NDKKLLLHVEEVREDQLDSNFQMQSENFCSYIFTHAKTKTLREGILVTGNRLGMLVETYL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 EAINSGAVPCLEDAVITLAQRENSAAVQRASDYYSQQMAQRVKFPTDTLQELLDVHAACE
       .::::::.::::.:. .::: :::::::::...:::::::.:.::::::::::::::.::
NP_997 DAINSGATPCLENAMAVLAQCENSAAVQRAANHYSQQMAQQVRFPTDTLQELLDVHAVCE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 REAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEESSVQYCQAKLNELSKGLMES
       :::::.:::.::::..::::::...:  .:: ::.:::::.:..::::.:..::. : ::
NP_997 REAIAVFMEYSFKDKSQEFQKKLVDTMEKKKEDFVLQNEEASAKYCQAELKRLSELLTES
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 ISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVFQRFLESQMVIEESILQSDKA
       :: :.: :::::..:.:.:..:::::  :::::::: ::.: ::.::.::::::::::::
NP_997 ISRGTFFVPGGHNIYLEAKKKIEQDYTLVPRKGVKADEVLQSFLQSQVVIEESILQSDKA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 LTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQVKSRKENIAQLKEKLQMEREH
       ::  :::.:. .:::::::::::::.:: .::::.:::: .: .:::::::.:.. :::.
NP_997 LTAGEKAIAAKQAKKEAAEKEQELLRQKQKEQQQMMEAQERSFQENIAQLKKKMEREREN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 LLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKRMIDTTKNDDTPWIARTLDNL
        .::   :: : .:: .. : ::::. .: .: ::...:..:....:..   ... ::  
NP_997 YMRELRKMLSHKMKVLEELLTEGFKEIFESLNEEINRLKEQIEAAENEEPSVFSQILDVA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630        
pF1KE0 ADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF     
       .. . : : . :::.  :.: .::: .. . :      
NP_997 GSIFIAALPGAAKLVDLGMKILSSLCNRLRNPGKKIIS
              610       620       630        

>>NP_002044 (OMIM: 600411) guanylate-binding protein 1 [  (592 aa)
 initn: 2107 init1: 966 opt: 2080  Z-score: 1279.1  bits: 246.8 E(85289): 1.7e-64
Smith-Waterman score: 2080; 52.6% identity (81.3% similar) in 588 aa overlap (1-586:1-587)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MESGPKMLAPVCQVENNNEQLLVNQQAIQILEKISQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNHLAG
       : :  .: .:.: .::.: .:..: .:..::  :.::.::::::::::::::::::.:::
NP_002 MASEIHMTGPMCLIENTNGRLMANPEALKILSAITQPMVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 QNHGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDPKNDSWIFALAV
       ...:: :::::::.::::::::::::.::.: :::::::::::::::: .::::::::::
NP_002 KKKGFSLGSTVQSHTKGIWMWCVPHPKKPGHILVLLDTEGLGDVEKGDNQNDSWIFALAV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150         160       170        
pF1KE0 LLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSP--RPDGVEDSTEFVSFFPDFLW
       :: :::::::..:::.::..::.::::::. :..::::    . ::::..::::::::.:
NP_002 LLSSTFVYNSIGTINQQAMDQLYYVTELTHRIRSKSSPDENENEVEDSADFVSFFPDFVW
              130       140       150       160       170       180

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE0 TVRDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFPRECIRRFFPKRKCFVFDR
       :.:::.:.:. .:.:.: ::::  .::: .:.. . .: :.:: :::.::::.:::::::
NP_002 TLRDFSLDLEADGQPLTPDEYLTYSLKLKKGTSQKDETFNLPRLCIRKFFPKKKCFVFDR
              190       200       210       220       230       240

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE0 PTNDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKTLREGITVTGNRLGTLAVT
       :.. . : :..::.....:::.: .:.  ::::::....::::  :: :.: :: .:..:
NP_002 PVHRRKL-AQLEKLQDEELDPEFVQQVADFCSYIFSNSKTKTLSGGIQVNGPRLESLVLT
               250       260       270       280       290         

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE0 YVEAINSGAVPCLEDAVITLAQRENSAAVQRASDYYSQQMAQRVKFPTDTLQELLDVHAA
       ::.::.:: .::.:.::..::: :::::::.:  .: :::.:.:..::.:::::::.:  
NP_002 YVNAISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVQKAIAHYEQQMGQKVQLPTETLQELLDLHRD
     300       310       320       330       340       350         

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE0 CEREAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEESSVQYCQAKLNELSKGLM
        ::::: .:.. :::: .. :::..     .:. ::  ::.:.: . :.: :. . . : 
NP_002 SEREAIEVFIRSSFKDVDHLFQKELAAQLEKKRDDFCKQNQEASSDRCSALLQVIFSPLE
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pF1KE0 ESISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVFQRFLESQMVIEESILQSD
       : ..:: .: :::..:...  . ... :.. ::::..:.:..: .:.:.  . ..:::.:
NP_002 EEVKAGIYSKPGGYRLFVQKLQDLKKKYYEEPRKGIQAEEILQTYLKSKESMTDAILQTD
     420       430       440       450       460       470         

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pF1KE0 KALTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQVKSRKENIAQLKEKLQMER
       ..::..:: . :.:.: :.:.   ..:..  ....:.:: . .: .:.. :: ::.. .:
NP_002 QTLTEKEKEIEVERVKAESAQASAKMLQEMQRKNEQMMEQKERSYQEHLKQLTEKMENDR
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pF1KE0 EHLLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKRMIDTTKNDDTPWIARTLD
        .::.::   :    . :.. :.:::.:. . :. ::....  .   :            
NP_002 VQLLKEQERTLALKLQEQEQLLKEGFQKESRIMKNEIQDLQTKMRRRKACTIS       
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pF1KE0 NLADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF

>>NP_004111 (OMIM: 600412) guanylate-binding protein 2 [  (591 aa)
 initn: 2100 init1: 1121 opt: 2073  Z-score: 1274.9  bits: 246.0 E(85289): 2.8e-64
Smith-Waterman score: 2073; 53.9% identity (82.3% similar) in 566 aa overlap (10-575:10-574)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MESGPKMLAPVCQVENNNEQLLVNQQAIQILEKISQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNHLAG
                :.  ..:.. ::.:: .:..::  :.:::::::::::::::::::::.:::
NP_004 MAPEINLPGPMSLIDNTKGQLVVNPEALKILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
               10        20        30        40        50        60

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pF1KE0 QNHGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDPKNDSWIFALAV
       ...:: :::::.:.::::::::::::.::.:::::::::::::.:::: .:::::::::.
NP_004 KKNGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDIEKGDNENDSWIFALAI
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pF1KE0 LLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRPDGVEDSTEFVSFFPDFLWTV
       :: ::::::::.:::.::..:::::::::. :::.:::  ..:.::..:::::: :.::.
NP_004 LLSSTFVYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTDRIKANSSPGNNSVDDSADFVSFFPAFVWTL
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pF1KE0 RDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFPRECIRRFFPKRKCFVFDRPT
       :::::::...:.::: :.::: .::: .:.. . .. : :: :::.::::::::::: :.
NP_004 RDFTLELEVDGEPITADDYLELSLKLRKGTDKKSKSFNDPRLCIRKFFPKRKCFVFDWPA
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pF1KE0 NDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKTLREGITVTGNRLGTLAVTYV
         :  ::..:...:..:.: : ::.  :::::..:. .:::  :: :.: :: .:..:::
NP_004 -PKKYLAHLEQLKEEELNPDFIEQVAEFCSYILSHSNVKTLSGGIPVNGPRLESLVLTYV
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pF1KE0 EAINSGAVPCLEDAVITLAQRENSAAVQRASDYYSQQMAQRVKFPTDTLQELLDVHAACE
       .::.:: .::.:.::..::: ::::::..:  .: :::.:.:..::.:::::::.:   :
NP_004 NAISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVEKAIAHYEQQMGQKVQLPTETLQELLDLHRDSE
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pF1KE0 REAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEESSVQYCQAKLNELSKGLMES
       :::: .::..:::: .: ::.:.      .. ::  :: ..: . :.: :...   : :.
NP_004 REAIEVFMKNSFKDVDQMFQRKLGAQLEARRDDFCKQNSKASSDCCMALLQDIFGPLEED
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pF1KE0 ISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVFQRFLESQMVIEESILQSDKA
       .. :.:: :::..:. .  ..... :.::::::..::::....:::.  . ...::.:..
NP_004 VKQGTFSKPGGYRLFTQKLQELKNKYYQVPRKGIQAKEVLKKYLESKEDVADALLQTDQS
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pF1KE0 LTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQVKSRKENIAQLKEKLQMEREH
       :...:::. :.: : :.::  ...:..  ......:: . :: .:.. :: ::.. .: .
NP_004 LSEKEKAIEVERIKAESAEAAKKMLEEIQKKNEEMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMERDRAQ
     480       490       500       510       520       530         

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pF1KE0 LLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKRMIDTTKNDDTPWIARTLDNL
       :. ::   :    . :.  :.:::... .... .:                         
NP_004 LMAEQEKTLALKLQEQERLLKEGFENESKRLQKDIWDIQMRSKSLEPICNIL        
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pF1KE0 ADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF

>>NP_060754 (OMIM: 600413) guanylate-binding protein 3 i  (595 aa)
 initn: 2097 init1: 1127 opt: 2037  Z-score: 1253.1  bits: 242.0 E(85289): 4.6e-63
Smith-Waterman score: 2037; 52.1% identity (80.7% similar) in 576 aa overlap (7-582:7-581)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MESGPKMLAPVCQVENNNEQLLVNQQAIQILEKISQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNHLAG
             : .:.: .::.: .:..: .:..::  :.:::::::::::::::::::::.:::
NP_060 MAPEIHMTGPMCLIENTNGELVANPEALKILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
               10        20        30        40        50        60

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pF1KE0 QNHGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDPKNDSWIFALAV
       .:.:: :::::.:.::::::::::::.::.::::::::::::::.::: .::::::.:::
NP_060 KNKGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEGLGDVKKGDNQNDSWIFTLAV
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pF1KE0 LLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRPDGVEDSTEFVSFFPDFLWTV
       :: ::.:::::.:::.::..::.::::::. :..::::  .  :::..::::::::.::.
NP_060 LLSSTLVYNSMGTINQQAMDQLYYVTELTHRIRSKSSPDENENEDSADFVSFFPDFVWTL
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pF1KE0 RDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFPRECIRRFFPKRKCFVFDRPT
       :::.:.:. .:.:.: ::::: .::: ::.. . .. :.:: :::.::::.:::::: : 
NP_060 RDFSLDLEADGQPLTPDEYLEYSLKLTQGTSQKDKNFNLPRLCIRKFFPKKKCFVFDLPI
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pF1KE0 NDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKTLREGITVTGNRLGTLAVTYV
       . . : :..::.....:::.: .:.  ::::::....::::  :: :.: :: .:..::.
NP_060 HRRKL-AQLEKLQDEELDPEFVQQVADFCSYIFSNSKTKTLSGGIKVNGPRLESLVLTYI
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pF1KE0 EAINSGAVPCLEDAVITLAQRENSAAVQRASDYYSQQMAQRVKFPTDTLQELLDVHAACE
       .::. : .::.:.::..::: :::::::.:  .:.:::.:.:..:..:::::::.: . :
NP_060 NAISRGDLPCMENAVLALAQIENSAAVQKAIAHYDQQMGQKVQLPAETLQELLDLHRVSE
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pF1KE0 REAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMNKKGDFLLQNEESSVQYCQAKLNELSKGLMES
       :::  ..:..:::: .. ::::.     .:. ::  ::.:.: . :.: :. . . : : 
NP_060 REATEVYMKNSFKDVDHLFQKKLAAQLDKKRDDFCKQNQEASSDRCSALLQVIFSPLEEE
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pF1KE0 ISAGSFSVPGGHKLYMETKERIEQDYWQVPRKGVKAKEVFQRFLESQMVIEESILQSDKA
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NP_060 VKAGIYSKPGGYCLFIQKLQDLEKKYYEEPRKGIQAEEILQTYLKSKESVTDAILQTDQI
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pF1KE0 LTDREKAVAVDRAKKEAAEKEQELLKQKLQEQQQQMEAQVKSRKENIAQLKEKLQMEREH
       ::..:: . :. .: :.:.   .....   . ::.:: . :: .:.. :: ::.. :: .
NP_060 LTEKEKEIEVECVKAESAQASAKMVEEMQIKYQQMMEEKEKSYQEHVKQLTEKMERERAQ
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pF1KE0 LLREQIMMLEHTQKVQNDWLHEGFKKKYEEMNAEISQFKRMIDTTKNDDTPWIARTLDNL
       ::.::   :    . :   :.:  . .  ... ::..... .                  
NP_060 LLEEQEKTLTSKLQEQARVLKERCQGESTQLQNEIQKLQKTLKKKTKRYMSHKLKI    
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              610       620       630   
pF1KE0 ADELTAILSAPAKLIGHGVKGVSSLFKKHKLPF

>>NP_001127958 (OMIM: 611467) guanylate-binding protein   (586 aa)
 initn: 1934 init1: 1059 opt: 1937  Z-score: 1192.8  bits: 230.8 E(85289): 1.1e-59
Smith-Waterman score: 1937; 50.9% identity (79.3% similar) in 584 aa overlap (7-589:7-581)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MESGPKMLAPVCQVENNNEQLLVNQQAIQILEKISQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNHLAG
             :  :.: .:: :::: :::.:..::  :.:::::::::::::::::::::.:::
NP_001 MALEIHMSDPMCLIENFNEQLKVNQEALEILSAITQPVVVVAIVGLYRTGKSYLMNKLAG
               10        20        30        40        50        60

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pF1KE0 QNHGFPLGSTVQSETKGIWMWCVPHPSKPNHTLVLLDTEGLGDVEKGDPKNDSWIFALAV
       .:.:: ..:::::.:::::.::::::. ::::::::::::::::::.: :::  :::::.
NP_001 KNKGFSVASTVQSHTKGIWIWCVPHPNWPNHTLVLLDTEGLGDVEKADNKNDIQIFALAL
               70        80        90       100       110       120

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pF1KE0 LLCSTFVYNSMSTINHQALEQLHYVTELTELIKAKSSPRPDGVEDSTEFVSFFPDFLWTV
       :: ::::::... :.. :.. :: :::::.:.::..::  : ::: .. .:::::..::.
NP_001 LLSSTFVYNTVNKIDQGAIDLLHNVTELTDLLKARNSPDLDRVEDPADSASFFPDLVWTL
              130       140       150       160       170       180

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pF1KE0 RDFTLELKLNGHPITEDEYLENALKLIQGNNPRVQTSNFPRECIRRFFPKRKCFVFDRPT
       ::: : :...:. .: ::::::.:.  ::.. :::. :.:: ::..::::.:::.:: :.
NP_001 RDFCLGLEIDGQLVTPDEYLENSLRPKQGSDQRVQNFNLPRLCIQKFFPKKKCFIFDLPA
              190       200       210       220       230       240

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pF1KE0 NDKDLLANIEKVSEKQLDPKFQEQTNIFCSYIFTHARTKTLREGITVTGNRLGTLAVTYV
       ..: : :..: . . .:.:.: .:.. ::::::.:. ::::  :: :.:.:: .:..:::
NP_001 HQKKL-AQLETLPDDELEPEFVQQVTEFCSYIFSHSMTKTLPGGIMVNGSRLKNLVLTYV
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pF1KE0 EAINSGAVPCLEDAVITLAQRENSAAVQRASDYYSQQMAQRVKFPTDTLQELLDVHAACE
       .::.:: .::.:.::..:::::::::::.:  .:.:::.:.:..: .:::::::.: . :
NP_001 NAISSGDLPCIENAVLALAQRENSAAVQKAIAHYDQQMGQKVQLPMETLQELLDLHRTSE
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pF1KE0 REAIAIFMEHSFKDENQEFQKKFMETTMN-KKGDFLLQNEESSVQYCQAKLNELSKGLME
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       ... : .: ::::.:...  :...  :.. ::::..:.::.:..:.:.  . ..:::.:.
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       :::. ::     ..: :: . : . :    ....:.:. . . ..:.. :.    .. ..
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       . : ::  : :. .. :   :   :. . . . .:... .:   :..:::          
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       .:.:: ..:::::.:::::.::::::. ::::::::::::::::::.: :::  :::::.
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       :: ::::::... :.. :.. :: :::::.:.::..::  : ::: .. .:::::..::.
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NP_443 NAISSGDLPCIENAVLALAQRENSAAVQKAIAHYDQQMGQKVQLPMETLQELLDLHRTSE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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