seq1 = pF1KB8350.tfa, 798 bp
seq2 = pF1KB8350/gi568815596r_19252278.tfa (gi568815596r:19252278_19453805), 201528 bp

>pF1KB8350 798
>gi568815596r:19252278_19453805 (Chr2)

(complement)

1-665  (100001-100665)   100% ->
666-798  (101396-101528)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCAGCAAAACCTTGCCGGCGCCGGTGCCTATCCACCCTTCCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCAGCAAAACCTTGCCGGCGCCGGTGCCTATCCACCCTTCCCTGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCACCAACTACTCCTTCCTTCAGGCAGTGAACGGCCTGCCCACAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTCACCAACTACTCCTTCCTTCAGGCAGTGAACGGCCTGCCCACAGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTTCGGACCATCTGCCCAACCTGTATGGTTTCAGCGCGTTGCACGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTTCGGACCATCTGCCCAACCTGTATGGTTTCAGCGCGTTGCACGCTGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CACCTGCATCAGTGGACGCTGGGCTACCCGGCCATGCACTTGCCGCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CACCTGCATCAGTGGACGCTGGGCTACCCGGCCATGCACTTGCCGCGCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTCTTTCTCCAAAGTGCCGGGCACGGTGTCCAGCTTGGTGGATGCGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTCTTTCTCCAAAGTGCCGGGCACGGTGTCCAGCTTGGTGGATGCGCGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCAGCTGCCCGCCTTTCCCTGGTTCCCTCATGTCATTCAACCCAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCCAGCTGCCCGCCTTTCCCTGGTTCCCTCATGTCATTCAACCCAAGCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGATCACCGCTGGAGGCAGCGTTCCAGCGCTCAAGACCAAGCCGCGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGATCACCGCTGGAGGCAGCGTTCCAGCGCTCAAGACCAAGCCGCGCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGATTTTGCCAACCTGGCCTTGGCAGCAACGCAAGAAGATCCGGCCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGATTTTGCCAACCTGGCCTTGGCAGCAACGCAAGAAGATCCGGCCAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCGGTCGCGGGGAGGGCCCAGGCTCCCCTGCAGGTGGGCTGGGTGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCGGTCGCGGGGAGGGCCCAGGCTCCCCTGCAGGTGGGCTGGGTGCCCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTCGACGTGACCAAGCTGTCTCCAGAAAAGAAGCCCACAAGGGGACGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTCGACGTGACCAAGCTGTCTCCAGAAAAGAAGCCCACAAGGGGACGTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCCTTCCAAGACCAAGAAGGAATTCGTCTGCAAGTTCTGTGGCCGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCCTTCCAAGACCAAGAAGGAATTCGTCTGCAAGTTCTGTGGCCGCCACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCACCAAGTCCTACAACCTACTTATCCATGAGCGGACGCACACCGACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCACCAAGTCCTACAACCTACTTATCCATGAGCGGACGCACACCGACGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CGGCCCTACACCTGTGACATCTGCCACAAAGCCTTCCGGAGGCAAGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CGGCCCTACACCTGTGACATCTGCCACAAAGCCTTCCGGAGGCAAGACCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCTGCGAGACCACAG         ATATATTCACTCCAAAGAGAAGCCCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCTGCGAGACCACAGGTG...CAGATATATTCACTCCAAAGAGAAGCCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TCAAGTGTCAAGAGTGTGGGAAAGGATTCTGCCAGTCCAGGACTCTCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101422 TCAAGTGTCAAGAGTGTGGGAAAGGATTCTGCCAGTCCAGGACTCTCGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GTCCACAAGACGCTACACTCACAGGTGAAGGAGCTCAAAACCTCCAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101472 GTCCACAAGACGCTACACTCACAGGTGAAGGAGCTCAAAACCTCCAAGAT

    800     .
    792 CAAATGC
        |||||||
 101522 CAAATGC