Result of FASTA (omim) for pF1KE0288
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0288, 313 aa
  1>>>pF1KE0288 313 - 313 aa - 313 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0316+/-0.00046; mu= 17.0078+/- 0.029
 mean_var=78.4425+/-20.671, 0's: 0 Z-trim(109.3): 318  B-trim: 2114 in 2/47
 Lambda= 0.144810
 statistics sampled from 16872 (17418) to 16872 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.557), E-opt: 0.2 (0.204), width:  16
 Scan time:  6.470

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309)  888 195.6 1.1e-49
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311)  856 188.9 1.1e-47
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317)  845 186.7 5.5e-47
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314)  835 184.6 2.3e-46
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317)  816 180.6 3.7e-45
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317)  816 180.6 3.7e-45
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317)  816 180.6 3.7e-45
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314)  800 177.2 3.7e-44
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327)  796 176.4 6.8e-44
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312)  785 174.1 3.2e-43
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314)  785 174.1 3.2e-43
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312)  783 173.7 4.3e-43
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312)  783 173.7 4.3e-43
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322)  783 173.7 4.4e-43
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308)  776 172.2 1.2e-42
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307)  767 170.3 4.3e-42
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300)  763 169.5 7.6e-42
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312)  718 160.1 5.3e-39
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312)  709 158.2 1.9e-38
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311)  708 158.0 2.2e-38
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318)  523 119.4 9.8e-27
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320)  512 117.1 4.8e-26
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370)  204 52.8 1.3e-06
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370)  204 52.8 1.3e-06
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin  ( 370)  204 52.8 1.3e-06
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370)  204 52.8 1.3e-06
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin  ( 388)  204 52.8 1.3e-06
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin  ( 388)  204 52.8 1.3e-06
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin  ( 388)  204 52.8 1.3e-06
NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399)  204 52.8 1.3e-06
NP_000698 (OMIM: 600264) vasopressin V1b receptor  ( 424)  192 50.3 7.9e-06
XP_016883344 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin  ( 365)  190 49.9 9.5e-06
NP_001305783 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 365)  190 49.9 9.5e-06
NP_001154888 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339)  187 49.2 1.4e-05
NP_001154889 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339)  187 49.2 1.4e-05
NP_001154887 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 367)  187 49.2 1.5e-05
XP_016859322 (OMIM: 603071) PREDICTED: uracil nucl ( 367)  187 49.2 1.5e-05
NP_005282 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cystein ( 367)  187 49.2 1.5e-05
NP_005152 (OMIM: 600052) apelin receptor [Homo sap ( 380)  187 49.3 1.5e-05
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351)  184 48.6 2.2e-05
NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297)  183 48.3 2.3e-05
XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297)  183 48.3 2.3e-05
NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297)  183 48.3 2.3e-05
NP_001006628 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466)  185 48.9 2.3e-05
XP_011514071 (OMIM: 118493) PREDICTED: muscarinic  ( 466)  185 48.9 2.3e-05
NP_001006627 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466)  185 48.9 2.3e-05
NP_001006633 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466)  185 48.9 2.3e-05
NP_000730 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholine  ( 466)  185 48.9 2.3e-05
NP_001006629 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466)  185 48.9 2.3e-05
NP_001006631 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466)  185 48.9 2.3e-05


>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H  (309 aa)
 initn: 857 init1: 492 opt: 888  Z-score: 1013.2  bits: 195.6 E(85289): 1.1e-49
Smith-Waterman score: 888; 42.8% identity (74.9% similar) in 299 aa overlap (5-303:3-299)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARPM
           : . .: :.: :.    ... ..:: ::.:::.: .: .::..:. :.: : . ::
NP_001   MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSL-GSPM
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 YIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLMA
       :. :. :: ::   ::. .: :. .   : : : :.::..:..  ::.:... .: :.::
NP_001 YLSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMA
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 YDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFFC
       ::.:.:::.::.: ..:.  . :::.. .::.: .:...: .. :.::.:::: .:.:.:
NP_001 YDHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMC
       120       130       140       150       160       170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 DIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRAFS
       :.  .: :::.:: . ::   .. : .    :.:.:.::. .:   :: :. ..:..:.:
NP_001 DLNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYV-VILCSLRTHSLEARHKALS
       180       190       200       210        220       230      

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 TCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETNSPLDGAAALVPTAITPFLNPLIYTLRNQEVKLAL
       :: .:.::: ...::: :.:.:: .. :.: :.:.  : :::.::::::::.: ..: :.
NP_001 TCVSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAI
        240       250       260       270       280       290      

              310   
pF1KE0 KRMLRSPRTPSEV
       ...          
NP_001 RKLCSRKDISGDK
        300         

>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor   (311 aa)
 initn: 850 init1: 654 opt: 856  Z-score: 977.1  bits: 188.9 E(85289): 1.1e-47
Smith-Waterman score: 856; 41.8% identity (74.7% similar) in 304 aa overlap (3-304:6-308)

                  10        20        30        40        50       
pF1KE0    MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHA
            ..:..    :::.:.    .:....::  ...:..: .:::.:.:  . : .::.
NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE0 RPMYIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYT
        :::.::. :: .:.  ..  .:.:..:.    : : ..::. ::::   ::.:.: : .
NP_001 -PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLV
                70        80        90       100       110         

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE0 LMAYDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDY
       .:.:::: :.:.::.: :::  ..  ::....:..:  ..::.. .:: .: ::  :::.
NP_001 VMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDH
     120       130       140       150       160       170         

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE0 FFCDIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRR
       :::..::.:::.:.:: ::::. ..  .. :   . ::: ::  :..::::.... : ..
NP_001 FFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQK
     180       190       200       210       220       230         

       240       250       260       270         280       290     
pF1KE0 AFSTCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETNSPLDGAA--ALVPTAITPFLNPLIYTLRNQE
       .:.:::::. .:.....:   .::.: ...  : .   ::  :..:: ::::::::::. 
NP_001 VFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKV
     240       250       260       270       280       290         

         300       310   
pF1KE0 VKLALKRMLRSPRTPSEV
       :. :.::..         
NP_001 VRGAVKRLMGWE      
     300       310       

>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo  (317 aa)
 initn: 821 init1: 641 opt: 845  Z-score: 964.5  bits: 186.7 E(85289): 5.5e-47
Smith-Waterman score: 845; 43.7% identity (74.8% similar) in 302 aa overlap (5-302:5-304)

               10         20        30        40        50         
pF1KE0 MERINSTLLTAFILTGIP-YPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARP
           : : .. ::: ..   : ....:.:. :. ::..:  :: ::.... ::: ::. :
NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHS-P
               10        20        30        40        50          

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE0 MYIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLM
       ::.::  :: ...... .:::... ..      : : ::..:.::. :.: ..::: . :
NP_835 MYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATM
      60        70        80        90       100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 AYDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFF
       :::::.:::.::.:::.:. .  : :.:..:. :   ...:.   : .:.:: :.:..::
NP_835 AYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFF
     120       130       140       150       160       170         

     180       190       200        210       220       230        
pF1KE0 CDIPAVLRLACADTTVNELVTFVD-IGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRA
       :: : ::.:.::::.. :. ..:  : ::.  :. ::: :: .:  :::.: .: :...:
NP_835 CDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCL-LILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKA
     180       190       200       210        220       230        

      240       250       260        270        280       290      
pF1KE0 FSTCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETN-SPLDGAA-ALVPTAITPFLNPLIYTLRNQEV
       ::::..:. ::...:.  .. :. :..: :: .    .:  :..::.:::.::.:::.::
NP_835 FSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEV
      240       250       260       270       280       290        

        300       310     
pF1KE0 KLALKRMLRSPRTPSEV  
       : ::.:             
NP_835 KNALSRTFHKVLALRNCIP
      300       310       

>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo   (314 aa)
 initn: 831 init1: 589 opt: 835  Z-score: 953.3  bits: 184.6 E(85289): 2.3e-46
Smith-Waterman score: 835; 39.9% identity (70.9% similar) in 313 aa overlap (1-311:1-312)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARPM
       : : : : :: :.: :.   :.:. ..:.::..:: :: :::: ... .  : .::. ::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHT-PM
               10        20        30        40        50          

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 YIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLMA
       :.::. :: .:.  :. :.:... ..    : : :.::  :.::.  :..:.:.:. :::
NP_003 YFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMA
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 YDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFFC
       :::: :::.:: : ..:.  .   ..:::. :: ..  ...  .  : .:  : . .:::
NP_003 YDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFC
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 DIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRAFS
       : : ...:.:.:: ..: .. .  :: ... . .:: ::  .. .:. .:...::.::::
NP_003 DSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFS
     180       190       200       210       220       230         

              250       260         270       280       290        
pF1KE0 TCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETNSPL--DGAAALVPTAITPFLNPLIYTLRNQEVKL
       ::..:.:.. ..:. : . :::: ..  :  : .:..  :.. :.::::::.::..::: 
NP_003 TCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKK
     240       250       260       270       280       290         

      300       310   
pF1KE0 ALKRMLRSPRTPSEV
       ::  ..   :: :  
NP_003 ALANVISRKRTSSFL
     300       310    

>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo   (317 aa)
 initn: 798 init1: 587 opt: 816  Z-score: 931.8  bits: 180.6 E(85289): 3.7e-45
Smith-Waterman score: 816; 43.4% identity (73.8% similar) in 302 aa overlap (5-304:5-305)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARPM
           :.: .. ::: :.      :. .::.:...:..: ::: ::.. .  : :::. ::
NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHT-PM
               10        20        30        40        50          

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 YIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLMA
       :.::  ::..:.: .. .::.:. .:    : ::: .:.:::.:   ::. .  : ..::
NP_036 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 YDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFFC
       ::::.:.:. ::: ..: . : : :.  .:..: : . .:. .::.::.:  . .:.. :
NP_036 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 DIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRAFS
       .. ::.::::.::. ::.. .:.  :.. . : :.::::::::..::.:.. .::..:: 
NP_036 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
     180       190       200       210       220       230         

              250       260        270       280        290        
pF1KE0 TCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETN-SPLDGAAALVPTAI-TPFLNPLIYTLRNQEVKL
       ::..:.:::.. :    : :..:... : :.     :  :: ::.:::.::.:::.::: 
NP_036 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
     240       250       260       270       280       290         

      300       310      
pF1KE0 ALKRMLRSPRTPSEV   
       : ...:            
NP_036 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
     300       310       

>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep  (317 aa)
 initn: 798 init1: 587 opt: 816  Z-score: 931.8  bits: 180.6 E(85289): 3.7e-45
Smith-Waterman score: 816; 43.4% identity (73.8% similar) in 302 aa overlap (5-304:5-305)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARPM
           :.: .. ::: :.      :. .::.:...:..: ::: ::.. .  : :::. ::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHT-PM
               10        20        30        40        50          

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 YIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLMA
       :.::  ::..:.: .. .::.:. .:    : ::: .:.:::.:   ::. .  : ..::
XP_011 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 YDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFFC
       ::::.:.:. ::: ..: . : : :.  .:..: : . .:. .::.::.:  . .:.. :
XP_011 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 DIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRAFS
       .. ::.::::.::. ::.. .:.  :.. . : :.::::::::..::.:.. .::..:: 
XP_011 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
     180       190       200       210       220       230         

              250       260        270       280        290        
pF1KE0 TCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETN-SPLDGAAALVPTAI-TPFLNPLIYTLRNQEVKL
       ::..:.:::.. :    : :..:... : :.     :  :: ::.:::.::.:::.::: 
XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
     240       250       260       270       280       290         

      300       310      
pF1KE0 ALKRMLRSPRTPSEV   
       : ...:            
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
     300       310       

>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep  (317 aa)
 initn: 798 init1: 587 opt: 816  Z-score: 931.8  bits: 180.6 E(85289): 3.7e-45
Smith-Waterman score: 816; 43.4% identity (73.8% similar) in 302 aa overlap (5-304:5-305)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARPM
           :.: .. ::: :.      :. .::.:...:..: ::: ::.. .  : :::. ::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHT-PM
               10        20        30        40        50          

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 YIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLMA
       :.::  ::..:.: .. .::.:. .:    : ::: .:.:::.:   ::. .  : ..::
XP_011 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 YDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFFC
       ::::.:.:. ::: ..: . : : :.  .:..: : . .:. .::.::.:  . .:.. :
XP_011 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 DIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRAFS
       .. ::.::::.::. ::.. .:.  :.. . : :.::::::::..::.:.. .::..:: 
XP_011 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
     180       190       200       210       220       230         

              250       260        270       280        290        
pF1KE0 TCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETN-SPLDGAAALVPTAI-TPFLNPLIYTLRNQEVKL
       ::..:.:::.. :    : :..:... : :.     :  :: ::.:::.::.:::.::: 
XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
     240       250       260       270       280       290         

      300       310      
pF1KE0 ALKRMLRSPRTPSEV   
       : ...:            
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
     300       310       

>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho  (314 aa)
 initn: 790 init1: 561 opt: 800  Z-score: 913.8  bits: 177.2 E(85289): 3.7e-44
Smith-Waterman score: 800; 41.5% identity (74.9% similar) in 311 aa overlap (1-308:1-309)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MERINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARPM
       :.  :..  : ::: :.    .:. ..:: ... :.:: .::  :...   ::.::. ::
NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHT-PM
               10        20        30        40        50          

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 YIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLMA
       :.::. :: .:.:...  .:.:..:..   : : . ::. ::...  ::...:.: ..::
NP_001 YFFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMA
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 YDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFFC
       ::: .:::.::.: :.:. .:   ::. .:  :  ..  .. .:.::: :: ..::.:. 
NP_001 YDRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLR
     120       130       140       150       160       170         

              190       200        210       220       230         
pF1KE0 DIPAVLRLACADTTVNELVTFV-DIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRAF
       ..::..:.::..:.. : ..::  .:::. : . .:::::  :..:.:.:..:.::..::
NP_001 EMPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVL-SPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAF
     180       190       200        210       220       230        

     240       250       260       270         280       290       
pF1KE0 STCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETNSPLDGAAALV--PTAITPFLNPLIYTLRNQEVK
       .:::.:.:::...:    ..:..: ..:  : .  :.   . .::.::::::::::.:::
NP_001 GTCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVK
      240       250       260       270       280       290        

       300       310   
pF1KE0 LALKRMLRSPRTPSEV
        :: :.: . :     
NP_001 GALGRLLLGKRELGKE
      300       310    

>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo   (327 aa)
 initn: 693 init1: 540 opt: 796  Z-score: 909.0  bits: 176.4 E(85289): 6.8e-44
Smith-Waterman score: 796; 39.6% identity (70.8% similar) in 308 aa overlap (1-300:1-306)

                10        20        30        40        50         
pF1KE0 ME-RINSTLLTAFILTGIPYPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARP
       :: : .:  .. :.: :.: :  :..:.:....: :.:.   : ::....     :: .:
NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLH-KP
               10        20        30        40        50          

      60        70        80        90            100       110    
pF1KE0 MYIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKP-----IPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCF
       ::.::. .: ...   .. .:... .: .: :      : : ::..::::.  :: :.: 
NP_003 MYFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGF-VGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECV
      60        70        80         90       100       110        

          120       130       140       150       160       170    
pF1KE0 LYTLMAYDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQ
       : ..::::::.::: ::.:::.....: . ..::.: .:   . ....:   : ::::: 
NP_003 LLAVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNI
      120       130       140       150       160       170        

          180       190       200       210       220       230    
pF1KE0 VDYFFCDIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADG
       ...::::.  .: :.:.: .. ::. :.    .. . .:.   ::. :  :...: .: :
NP_003 INHFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAG
      180       190       200       210       220       230        

          240       250       260       270         280       290  
pF1KE0 RRRAFSTCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETNSPLDGA--AALVPTAITPFLNPLIYTLR
       : .:::::..:.::: ..:.   ::: ::.. : .:    .... ..:.:.:::.:: ::
NP_003 RYKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLR
      240       250       260       270       280       290        

            300       310           
pF1KE0 NQEVKLALKRMLRSPRTPSEV        
       ::::: ::                     
NP_003 NQEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
      300       310       320       

>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo   (312 aa)
 initn: 792 init1: 605 opt: 785  Z-score: 896.9  bits: 174.1 E(85289): 3.2e-43
Smith-Waterman score: 785; 41.3% identity (72.1% similar) in 305 aa overlap (4-304:2-303)

               10         20        30        40        50         
pF1KE0 MERINSTLLTAFILTGIP-YPLRLRTLFFVFFFLIYILTQLGNLLILITVWADPRLHARP
          .:..   .:.: :.  .:   :::: : .   :.:: .:: ::..    ::.::. :
NP_009   MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVL-TSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHS-P
                 10        20        30         40        50       

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE0 MYIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLM
       ::.::. :: .:. ...  ::....:.    : : :  : .:....  ::.:.:.: :.:
NP_009 MYFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVM
         60        70        80        90       100       110      

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 AYDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFF
       :.:::.:.::::.: ...  .:   :.. ::. : .....:.  :..::.:   ::: : 
NP_009 AFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFV
        120       130       140       150       160       170      

     180       190        200       210       220       230        
pF1KE0 CDIPAVLRLACADTTVNEL-VTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRA
       :..::..::.: ::. ::. :. ... ..:.  .::::.::  :  :.:::..: :::.:
NP_009 CEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVP-LSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKA
        180       190       200        210       220       230     

      240       250       260       270         280       290      
pF1KE0 FSTCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETNSPLDGAA--ALVPTAITPFLNPLIYTLRNQEV
       :.::..:.::::..:     .::.:..    . .   .:  .. :: ::::::::::.::
NP_009 FGTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEV
         240       250       260       270       280       290     

        300       310   
pF1KE0 KLALKRMLRSPRTPSEV
         :..:.:         
NP_009 TRAFRRLLGKEMGLTQS
         300       310  




313 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 17:35:20 2016 done: Thu Nov  3 17:35:21 2016
 Total Scan time:  6.470 Total Display time:  0.000

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com