Result of SIM4 for pF1KE1183

seq1 = pF1KE1183.tfa, 2109 bp
seq2 = pF1KE1183/gi568815584f_105338670.tfa (gi568815584f:105338670_105570212), 231543 bp

>pF1KE1183 2109
>gi568815584f:105338670_105570212 (Chr14)

1-28  (81367-81394)   100% ->
29-96  (100003-100070)   100% ->
97-190  (106749-106842)   100% ->
191-241  (110690-110740)   100% ->
242-368  (111389-111515)   99% ->
369-432  (111592-111655)   100% ->
433-550  (115524-115641)   100% ->
551-653  (119601-119703)   100% ->
654-753  (121689-121788)   100% ->
754-942  (122096-122284)   100% ->
943-1017  (124515-124589)   100% ->
1018-1076  (124824-124882)   100% ->
1077-1192  (125363-125478)   100% ->
1193-1344  (125747-125898)   100% ->
1345-1534  (126005-126194)   100% ->
1535-1624  (126425-126514)   100% ->
1625-1777  (127757-127909)   100% ->
1778-1809  (130798-130829)   96% ->
1810-1961  (131172-131323)   100% ->
1962-2109  (131396-131543)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGCCAACATGTACAGGGTCGGAG         ACTACGTCTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
  81367 ATGGCCGCCAACATGTACAGGGTCGGAGGTA...CAGACTACGTCTACTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGAGAACTCCTCCAGCAACCCATACCTGATCCGGAGAATCGAGGAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100016 TGAGAACTCCTCCAGCAACCCATACCTGATCCGGAGAATCGAGGAGCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACAAG         ACGGCCAATGGGAACGTGGAGGCCAAAGTGGTGTGC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100066 ACAAGGTA...CAGACGGCCAATGGGAACGTGGAGGCCAAAGTGGTGTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TTCTACCGGAGGCGGGACATCTCCAGCACCCTCATCGCCCTGGCCGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106785 TTCTACCGGAGGCGGGACATCTCCAGCACCCTCATCGCCCTGGCCGACAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCACGCAA         CCCTGTCAGTCTGCTATAAGGCCGGACCGGGGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 106835 GCACGCAAGTG...TAGCCCTGTCAGTCTGCTATAAGGCCGGACCGGGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 CGGACAACGGCGAGGAAG         GGGAAATAGAAGAGGAAATGGAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 110723 CGGACAACGGCGAGGAAGGTA...CAGGGGAAATAGAAGAGGAAATGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 AATCCGGAAATGGTGGACCTGCCCGAGAAACTAAAGCACCAGCTGCGGCA
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111412 AACCCGGAAATGGTGGACCTGCCCGAGAAACTAAAGCACCAGCTGCGGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TCGGGAGCTGTTCCTCTCCCGGCAGCTGGAGTCTCTGCCCGCCACGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111462 TCGGGAGCTGTTCCTCTCCCGGCAGCTGGAGTCTCTGCCCGCCACGCACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TCAG         GGGCAAGTGCAGCGTCACCCTGCTCAACGAGACCGAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111512 TCAGGTA...CAGGGGCAAGTGCAGCGTCACCCTGCTCAACGAGACCGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 TCGCTCAAGTCCTACCTGGAGCGGGAG         GATTTCTTCTTCTA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 111629 TCGCTCAAGTCCTACCTGGAGCGGGAGGTG...CAGGATTTCTTCTTCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 TTCTCTAGTCTACGACCCACAGCAGAAGACCCTGCTGGCAGATAAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115538 TTCTCTAGTCTACGACCCACAGCAGAAGACCCTGCTGGCAGATAAAGGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 AGATTCGAGTAGGAAACCGGTACCAGGCAGACATCACCGACTTGTTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115588 AGATTCGAGTAGGAAACCGGTACCAGGCAGACATCACCGACTTGTTAAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GAAG         GCGAGGAGGATGGCCGAGACCAGTCCAGGTTGGAGAC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115638 GAAGGTA...TAGGCGAGGAGGATGGCCGAGACCAGTCCAGGTTGGAGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 CCAGGTGTGGGAGGCGCACAACCCACTCACAGACAAGCAGATCGACCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119638 CCAGGTGTGGGAGGCGCACAACCCACTCACAGACAAGCAGATCGACCAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 TCCTGGTGGTGGCCCG         CTCTGTGGGCACCTTCGCACGGGCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 119688 TCCTGGTGGTGGCCCGGTG...CAGCTCTGTGGGCACCTTCGCACGGGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 CTGGACTGCAGCAGCTCCGTCCGACAGCCCAGCCTGCACATGAGCGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121714 CTGGACTGCAGCAGCTCCGTCCGACAGCCCAGCCTGCACATGAGCGCCGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 AGCTGCCTCCCGAGACATCACCCTG         TTCCACGCCATGGATA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 121764 AGCTGCCTCCCGAGACATCACCCTGGTA...CAGTTCCACGCCATGGATA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 CTCTCCACAAGAACATCTACGACATCTCCAAGGCCATCTCGGCGCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122112 CTCTCCACAAGAACATCTACGACATCTCCAAGGCCATCTCGGCGCTGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 CCGCAGGGCGGGCCCGTGCTCTGCAGGGACGAGATGGAGGAGTGGTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122162 CCGCAGGGCGGGCCCGTGCTCTGCAGGGACGAGATGGAGGAGTGGTCTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 ATCAGAGGCCAACCTTTTCGAGGAAGCCCTGGAAAAATATGGGAAGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122212 ATCAGAGGCCAACCTTTTCGAGGAAGCCCTGGAAAAATATGGGAAGGATT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TCACGGACATTCAGCAAGATTTT         CTCCCGTGGAAGTCGCTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 122262 TCACGGACATTCAGCAAGATTTTGTG...CAGCTCCCGTGGAAGTCGCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 ACCAGCATCATTGAGTACTACTACATGTGGAAGACCACCGACAGATACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124533 ACCAGCATCATTGAGTACTACTACATGTGGAAGACCACCGACAGATACGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 GCAGCAG         AAACGCTTGAAAGCAGCTGAAGCTGAGAGCAAGT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124583 GCAGCAGGTG...AAGAAACGCTTGAAAGCAGCTGAAGCTGAGAGCAAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 TAAAGCAAGTTTATATTCCCAACTA         TAACAAGCCAAATCCG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 124858 TAAAGCAAGTTTATATTCCCAACTAGTA...AAGTAACAAGCCAAATCCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 AACCAAATCAGCGTCAACAACGTCAAGGCCGGTGTGGTGAACGGCACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125379 AACCAAATCAGCGTCAACAACGTCAAGGCCGGTGTGGTGAACGGCACGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 GGCGCCGGGCCAGAGCCCTGGGGCTGGCCGGGCCTGCGAGAGCTGTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125429 GGCGCCGGGCCAGAGCCCTGGGGCTGGCCGGGCCTGCGAGAGCTGTTACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193          CCACACAGTCTTACCAGTGGTATTCTTGGGGTCCCCCTAAC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125479 GTA...TAGCCACACAGTCTTACCAGTGGTATTCTTGGGGTCCCCCTAAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234 ATGCAGTGTCGTCTCTGCGCATCTTGTTGGACATATTGGAAGAAATATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125788 ATGCAGTGTCGTCTCTGCGCATCTTGTTGGACATATTGGAAGAAATATGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 TGGCTTGAAAATGCCAACCCGGTTAGATGGAGAGAGGCCAGGACCAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125838 TGGCTTGAAAATGCCAACCCGGTTAGATGGAGAGAGGCCAGGACCAAACC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 GCAGTAACATG         AGTCCCCACGGCCTCCCAGCCCGGAGCAGC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 125888 GCAGTAACATGGTA...CAGAGTCCCCACGGCCTCCCAGCCCGGAGCAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1375 GGGAGCCCCAAGTTTGCCATGAAGACCAGGCAGGCTTTCTATCTGCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126035 GGGAGCCCCAAGTTTGCCATGAAGACCAGGCAGGCTTTCTATCTGCACAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1425 GACGAAGCTGACGCGGATCGCCCGGCGCCTGTGCCGTGAGATCCTGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126085 GACGAAGCTGACGCGGATCGCCCGGCGCCTGTGCCGTGAGATCCTGCGCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1475 CGTGGCACGCTGCGCGGCACCCCTACCTGCCCATCAACAGCGCGGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126135 CGTGGCACGCTGCGCGGCACCCCTACCTGCCCATCAACAGCGCGGCCATC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 AAGGCCGAGT         GCACGGCGCGGCTGCCCGAAGCCTCCCAGAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 126185 AAGGCCGAGTGTG...CAGGCACGGCGCGGCTGCCCGAAGCCTCCCAGAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1566 CCCGCTGGTGCTGAAGCAGGCGGTACGCAAGCCGCTGGAAGCCGTGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126456 CCCGCTGGTGCTGAAGCAGGCGGTACGCAAGCCGCTGGAAGCCGTGCTTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1616 GGTATCTTG         AGACCCACCCCCGCCCCCCCAAGCCTGACCCC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 126506 GGTATCTTGGTG...CAGAGACCCACCCCCGCCCCCCCAAGCCTGACCCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1657 GTGAAAAGCGTGTCCAGCGTGCTCAGCAGCCTGACGCCCGCCAAGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127789 GTGAAAAGCGTGTCCAGCGTGCTCAGCAGCCTGACGCCCGCCAAGGTGGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 CCCCGTCATCAACAACGGCTCCCCCACCATCCTGGGCAAGCGCAGCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127839 CCCCGTCATCAACAACGGCTCCCCCACCATCCTGGGCAAGCGCAGCTACG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1757 AGCAGCACAACGGGGTGGACG         GTCTGGCAAACCACGGACAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 127889 AGCAGCACAACGGGGTGGACGGTG...CAGGTCTGGCAAACCACGGACAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1798 ACCAGGCACATG         GGACCAAGCCGGAACCTCCTGCTCAACGG
         |||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 130818 GCCAGGCACATGGTA...CAGGGACCAAGCCGGAACCTCCTGCTCAACGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1839 GAAGTCCTACCCCACCAAAGTGCGCCTGATCCGGGGGGGCTCCCTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131201 GAAGTCCTACCCCACCAAAGTGCGCCTGATCCGGGGGGGCTCCCTGCCCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1889 CAGTCAAGCGGCGGCGGATGAACTGGATCGACGCCCCGGATGACGTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131251 CAGTCAAGCGGCGGCGGATGAACTGGATCGACGCCCCGGATGACGTGTTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1939 TACATGGCCACAGAGGAGACCAG         GAAGATCCGCAAGCTGCT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 131301 TACATGGCCACAGAGGAGACCAGGTG...CAGGAAGATCCGCAAGCTGCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1980 CTCATCCTCGGAAACCAAGCGTGCTGCCCGCCGGCCCTACAAGCCCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131414 CTCATCCTCGGAAACCAAGCGTGCTGCCCGCCGGCCCTACAAGCCCATCG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2030 CCCTGCGCCAGAGCCAGGCCCTGCCGCCGCGGCCACCGCCACCTGCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131464 CCCTGCGCCAGAGCCAGGCCCTGCCGCCGCGGCCACCGCCACCTGCGCCC

   2250     .    :    .    :    .    :
   2080 GTCAACGACGAGCCCATCGTCATCGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 131514 GTCAACGACGAGCCCATCGTCATCGAGGAC

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