Result of FASTA (ccds) for pF1KE0071
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0071, 723 aa
  1>>>pF1KE0071 723 - 723 aa - 723 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4033+/-0.00121; mu= 16.9068+/- 0.073
 mean_var=224.9847+/-43.009, 0's: 0 Z-trim(111.1): 245  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.085506
 statistics sampled from 11844 (12120) to 11844 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.723), E-opt: 0.2 (0.372), width:  16
 Scan time:  4.110

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5313.1 DLL1 gene_id:28514|Hs108|chr6           ( 723) 5389 678.8 8.1e-195
CCDS45232.1 DLL4 gene_id:54567|Hs108|chr15         ( 685) 2172 281.9 2.3e-75
CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20           (1218) 1771 232.8 2.4e-60
CCDS9999.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14           (1200) 1756 230.9 8.7e-60
CCDS9998.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14           (1238) 1706 224.8 6.3e-58
CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9         (2555) 1001 138.3 1.4e-31
CCDS908.1 NOTCH2 gene_id:4853|Hs108|chr1           (2471)  950 132.0 1.1e-29
CCDS12537.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19         ( 587)  896 124.4 5.1e-28
CCDS12538.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19         ( 618)  896 124.4 5.2e-28
CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6         (2003)  892 124.7 1.4e-27
CCDS33390.1 DNER gene_id:92737|Hs108|chr2          ( 737)  872 121.5 4.5e-27
CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19        (2321)  858 120.6 2.8e-26
CCDS4897.1 DLK2 gene_id:65989|Hs108|chr6           ( 383)  833 116.3 8.7e-26
CCDS9963.1 DLK1 gene_id:8788|Hs108|chr14           ( 383)  830 115.9 1.1e-25
CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10          (1534)  809 114.3 1.5e-24
CCDS81852.1 DLK1 gene_id:8788|Hs108|chr14          ( 310)  794 111.4 2.2e-24
CCDS47445.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6          (3144)  804 114.1 3.3e-24
CCDS78156.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6          (3165)  804 114.1 3.3e-24
CCDS58052.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1          ( 870)  742 105.6 3.3e-22
CCDS58053.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1          (1382)  742 105.9 4.2e-22
CCDS1390.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1           (1406)  742 105.9 4.3e-22
CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4          (1521)  740 105.7 5.3e-22
CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4          (1525)  740 105.7 5.3e-22
CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4           (1529)  740 105.7 5.3e-22
CCDS6852.2 CRB2 gene_id:286204|Hs108|chr9          (1285)  698 100.4 1.7e-20
CCDS48004.1 SVEP1 gene_id:79987|Hs108|chr9         (3571)  691 100.3 5.6e-20
CCDS75461.1 DLK2 gene_id:65989|Hs108|chr6          ( 377)  672 96.4 8.3e-20
CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5          (1530)  620 90.9 1.5e-17
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5           (1523)  614 90.2 2.5e-17
CCDS46562.1 SNED1 gene_id:25992|Hs108|chr2         (1413)  607 89.3 4.4e-17
CCDS53454.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1          (1294)  588 86.9 2.1e-16
CCDS74370.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19         (1557)  550 82.3 6.1e-15
CCDS74368.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19         (1587)  550 82.3 6.1e-15
CCDS74369.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19         (1624)  550 82.3 6.2e-15
CCDS72880.1 NOTCH2NL gene_id:388677|Hs108|chr1     ( 236)  527 78.2 1.5e-14
CCDS4967.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6           ( 594)  515 77.4 7.2e-14
CCDS47446.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6          ( 619)  515 77.4 7.3e-14
CCDS47177.1 FAT1 gene_id:2195|Hs108|chr4           (4588)  520 79.3 1.4e-13
CCDS73268.1 NELL1 gene_id:4745|Hs108|chr11         ( 753)  492 74.7 5.8e-13
CCDS7855.1 NELL1 gene_id:4745|Hs108|chr11          ( 810)  492 74.7 6.1e-13
CCDS73267.1 NELL1 gene_id:4745|Hs108|chr11         ( 838)  492 74.8 6.2e-13
CCDS7113.1 CUBN gene_id:8029|Hs108|chr10           (3623)  482 74.5 3.2e-12
CCDS6811.1 TNC gene_id:3371|Hs108|chr9             (2201)  461 71.6 1.5e-11
CCDS3732.3 FAT4 gene_id:79633|Hs108|chr4           (4981)  458 71.7   3e-11
CCDS34222.1 FBN2 gene_id:2201|Hs108|chr5           (2912)  450 70.4 4.4e-11


>>CCDS5313.1 DLL1 gene_id:28514|Hs108|chr6                (723 aa)
 initn: 5389 init1: 5389 opt: 5389  Z-score: 3611.1  bits: 678.8 E(32554): 8.1e-195
Smith-Waterman score: 5389; 100.0% identity (100.0% similar) in 723 aa overlap (1-723:1-723)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MGSRCALALAVLSALLCQVWSSGVFELKLQEFVNKKGLLGNRNCCRGGAGPPPCACRTFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MGSRCALALAVLSALLCQVWSSGVFELKLQEFVNKKGLLGNRNCCRGGAGPPPCACRTFF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 RVCLKHYQASVSPEPPCTYGSAVTPVLGVDSFSLPDGGGADSAFSNPIRFPFGFTWPGTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RVCLKHYQASVSPEPPCTYGSAVTPVLGVDSFSLPDGGGADSAFSNPIRFPFGFTWPGTF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 SLIIEALHTDSPDDLATENPERLISRLATQRHLTVGEEWSQDLHSSGRTDLKYSYRFVCD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SLIIEALHTDSPDDLATENPERLISRLATQRHLTVGEEWSQDLHSSGRTDLKYSYRFVCD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 EHYYGEGCSVFCRPRDDAFGHFTCGERGEKVCNPGWKGPYCTEPICLPGCDEQHGFCDKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EHYYGEGCSVFCRPRDDAFGHFTCGERGEKVCNPGWKGPYCTEPICLPGCDEQHGFCDKP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 GECKCRVGWQGRYCDECIRYPGCLHGTCQQPWQCNCQEGWGGLFCNQDLNYCTHHKPCKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GECKCRVGWQGRYCDECIRYPGCLHGTCQQPWQCNCQEGWGGLFCNQDLNYCTHHKPCKN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 GATCTNTGQGSYTCSCRPGYTGATCELGIDECDPSPCKNGGSCTDLENSYSCTCPPGFYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GATCTNTGQGSYTCSCRPGYTGATCELGIDECDPSPCKNGGSCTDLENSYSCTCPPGFYG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 KICELSAMTCADGPCFNGGRCSDSPDGGYSCRCPVGYSGFNCEKKIDYCSSSPCSNGAKC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KICELSAMTCADGPCFNGGRCSDSPDGGYSCRCPVGYSGFNCEKKIDYCSSSPCSNGAKC
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 VDLGDAYLCRCQAGFSGRHCDDNVDDCASSPCANGGTCRDGVNDFSCTCPPGYTGRNCSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VDLGDAYLCRCQAGFSGRHCDDNVDDCASSPCANGGTCRDGVNDFSCTCPPGYTGRNCSA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 PVSRCEHAPCHNGATCHERGHRYVCECARGYGGPNCQFLLPELPPGPAVVDLTEKLEGQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PVSRCEHAPCHNGATCHERGHRYVCECARGYGGPNCQFLLPELPPGPAVVDLTEKLEGQG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 GPFPWVAVCAGVILVLMLLLGCAAVVVCVRLRLQKHRPPADPCRGETETMNNLANCQREK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GPFPWVAVCAGVILVLMLLLGCAAVVVCVRLRLQKHRPPADPCRGETETMNNLANCQREK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE0 DISVSIIGATQIKNTNKKADFHGDHSADKNGFKARYPAVDYNLVQDLKGDDTAVRDAHSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DISVSIIGATQIKNTNKKADFHGDHSADKNGFKARYPAVDYNLVQDLKGDDTAVRDAHSK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE0 RDTKCQPQGSSGEEKGTPTTLRGGEASERKRPDSGCSTSKDTKYQSVYVISEEKDECVIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RDTKCQPQGSSGEEKGTPTTLRGGEASERKRPDSGCSTSKDTKYQSVYVISEEKDECVIA
              670       680       690       700       710       720

          
pF1KE0 TEV
       :::
CCDS53 TEV
          

>>CCDS45232.1 DLL4 gene_id:54567|Hs108|chr15              (685 aa)
 initn: 1696 init1: 1291 opt: 2172  Z-score: 1466.6  bits: 281.9 E(32554): 2.3e-75
Smith-Waterman score: 2496; 49.7% identity (70.5% similar) in 739 aa overlap (3-723:5-685)

                 10        20             30        40        50   
pF1KE0   MGSRCALALAVLSALLCQVWS-----SGVFELKLQEFVNKKGLLGNRNCCRGGAGPPP
           :: : . :.:  ::  .:.     ::::.:.::::.:..:.:..   :. :     
CCDS45 MAAASRSASGWALL--LLVALWQQRAAGSGVFQLQLQEFINERGVLASGRPCEPG-----
               10          20        30        40        50        

            60        70        80        90          100       110
pF1KE0 CACRTFFRVCLKHYQASVSPEPPCTYGSAVTPVLGVDSFSLPD---GGGADSAFSNPIRF
         :::::::::::.:: :::  :::.:.. :::::..::.. :   :::      ::...
CCDS45 --CRTFFRVCLKHFQAVVSP-GPCTFGTVSTPVLGTNSFAVRDDSSGGG-----RNPLQL
              60        70         80        90            100     

              120       130         140       150       160        
pF1KE0 PFGFTWPGTFSLIIEALHTDSPDDLATEN--PERLISRLATQRHLTVGEEWSQDLHSSGR
       ::.::::::::::::: :. . :::  :   :. :::..: :  :.::..:  : ..:  
CCDS45 PFNFTWPGTFSLIIEAWHAPG-DDLRPEALPPDALISKIAIQGSLAVGQNWLLDEQTSTL
         110       120        130       140       150       160    

      170       180       190       200       210       220        
pF1KE0 TDLKYSYRFVCDEHYYGEGCSVFCRPRDDAFGHFTCGERGEKVCNPGWKGPYCTEPICLP
       : :.:::: .:...:::..:: .:. :.: :::..:   :.  : ::: : :: .:::: 
CCDS45 TRLRYSYRVICSDNYYGDNCSRLCKKRNDHFGHYVCQPDGNLSCLPGWTGEYCQQPICLS
          170       180       190       200       210       220    

      230       240       250       260       270       280        
pF1KE0 GCDEQHGFCDKPGECKCRVGWQGRYCDECIRYPGCLHGTCQQPWQCNCQEGWGGLFCNQD
       :: ::.:.:.::.:: :: ::::: :.::: . :: ::::. ::::.:.::::::::.::
CCDS45 GCHEQNGYCSKPAECLCRPGWQGRLCNECIPHNGCRHGTCSTPWQCTCDEGWGGLFCDQD
          230       240       250       260       270       280    

      290       300       310       320       330       340        
pF1KE0 LNYCTHHKPCKNGATCTNTGQGSYTCSCRPGYTGATCELGIDECDPSPCKNGGSCTDLEN
       :::::::.::::::::.:.:: ::::.:::::::. ::: ..::: .::.::::: : :.
CCDS45 LNYCTHHSPCKNGATCSNSGQRSYTCTCRPGYTGVDCELELSECDSNPCRNGGSCKDQED
          290       300       310       320       330       340    

      350       360       370       380        390       400       
pF1KE0 SYSCTCPPGFYGKICELSAMTCADGPCFNGGRCSDSPDGG-YSCRCPVGYSGFNCEKKID
       .: : ::::.::  :: :...:::.:::::: : .  .:. :.:.:: ...: :::::.:
CCDS45 GYHCLCPPGYYGLHCEHSTLSCADSPCFNGGSCRERNQGANYACECPPNFTGSNCEKKVD
          350       360       370       380       390       400    

       410       420       430       440       450       460       
pF1KE0 YCSSSPCSNGAKCVDLGDAYLCRCQAGFSGRHCDDNVDDCASSPCANGGTCRDGVNDFSC
        :.:.::.::..:.. : . .:::. ::.: .:. .:.::: .:::.::::.:  : . :
CCDS45 RCTSNPCANGGQCLNRGPSRMCRCRPGFTGTYCELHVSDCARNPCAHGGTCHDLENGLMC
          410       420       430       440       450       460    

       470       480         490         500       510       520   
pF1KE0 TCPPGYTGRNCSA--PVSRCEHAPCHNGATCHE--RGHRYVCECARGYGGPNCQFLLPEL
       ::: :..:: : .   .. :  .:: : :::.       .::.:  :. :  :.: .  :
CCDS45 TCPAGFSGRRCEVRTSIDACASSPCFNRATCYTDLSTDTFVCNCPYGFVGSRCEFPVG-L
          470       480       490       500       510       520    

           530       540       550        560       570       580  
pF1KE0 PPGPAVVDLTEKLEGQGGPFPWVAVCAGVIL-VLMLLLGCAAVVVCVRLRLQKHRPPADP
       ::.                ::::::  :: : ::..::: .::.:  .:::..   : : 
CCDS45 PPS----------------FPWVAVSLGVGLAVLLVLLGMVAVAV-RQLRLRR---PDD-
                           530       540       550           560   

            590       600       610       620        630       640 
pF1KE0 CRGETETMNNLANCQREKDISVSIIGATQIKNTNKKADFHGDHSADK-NGFKARYPAVDY
         :  :.::::.. :..     ..: :.:.::::.: ... : . :: :  : .  ..::
CCDS45 --GSREAMNNLSDFQKD-----NLIPAAQLKNTNQKKELEVDCGLDKSNCGKQQNHTLDY
              570            580       590       600       610     

             650        660       670       680       690       700
pF1KE0 NLVQDLKGDDTAV-RDAHSKRDTKCQPQGSSGEEKGTPTTLRGGEASERKRPDSGCSTSK
       ::.    :  :   .  :: .        : ::.  .:  :.. :  :  : .. ::  .
CCDS45 NLAPGPLGRGTMPGKFPHSDK--------SLGEK--APLRLHS-EKPE-CRISAICSP-R
         620       630               640          650        660   

              710       720   
pF1KE0 DTKYQSVYVISEEKDECVIATEV
       :. :::: .::::..::::::::
CCDS45 DSMYQSVCLISEERNECVIATEV
            670       680     

>>CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20                (1218 aa)
 initn: 2203 init1: 962 opt: 1771  Z-score: 1196.8  bits: 232.8 E(32554): 2.4e-60
Smith-Waterman score: 1784; 41.3% identity (64.8% similar) in 576 aa overlap (2-531:11-576)

                        10         20        30        40        50
pF1KE0          MGSRCALALAVLSALLCQV-WSSGVFELKLQEFVNKKGLLGNRNCCRGGAG
                 :   .: ::.: ::  .:  .:: :::..  . : .: : : ::: ::: 
CCDS13 MRSPRTRGRSGRPLSLLLALLCALRAKVCGASGQFELEILSMQNVNGELQNGNCC-GGAR
               10        20        30        40        50          

                     60        70        80        90       100    
pF1KE0 PP---PCA---CRTFFRVCLKHYQASVSPEPPCTYGSAVTPVLGVDSFSLPDGGGADSAF
        :    :.   : :.:.::::.::. :.   ::..::. :::.: ..:.:  . : :   
CCDS13 NPGDRKCTRDECDTYFKVCLKEYQSRVTAGGPCSFGSGSTPVIGGNTFNLKASRGND---
      60        70        80        90       100       110         

          110       120       130       140       150       160    
pF1KE0 SNPIRFPFGFTWPGTFSLIIEALHTDSPDDLATENPERLISRLATQRHLTVGEEWSQDLH
        : : .::.:.:: ...:..::   :: .:  : .:. .: . . .  .. ...:.   .
CCDS13 RNRIVLPFSFAWPRSYTLLVEAW--DSSND--TVQPDSIIEKASHSGMINPSRQWQTLKQ
        120       130         140         150       160       170  

          170       180       190       200       210       220    
pF1KE0 SSGRTDLKYSYRFVCDEHYYGEGCSVFCRPRDDAFGHFTCGERGEKVCNPGWKGPYCTEP
       ..: . ..:. : .::..::: ::. ::::::: :::..: . :.:.:  :: :: :.. 
CCDS13 NTGVAHFEYQIRVTCDDYYYGFGCNKFCRPRDDFFGHYACDQNGNKTCMEGWMGPECNRA
            180       190       200       210       220       230  

          230       240       250       260       270       280    
pF1KE0 ICLPGCDEQHGFCDKPGECKCRVGWQGRYCDECIRYPGCLHGTCQQPWQCNCQEGWGGLF
       ::  ::. .:: :  ::.:.:. :::: :::.:: .:::.:: :..:::: :. .::: .
CCDS13 ICRQGCSPKHGSCKLPGDCRCQYGWQGLYCDKCIPHPGCVHGICNEPWQCLCETNWGGQL
            240       250       260       270       280       290  

          290       300       310                                  
pF1KE0 CNQDLNYCTHHKPCKNGATCTNTGQGSYTCSC----------------------------
       :..:::::  :.:: ::.::.:::  .: :::                            
CCDS13 CDKDLNYCGTHQPCLNGGTCSNTGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCK
            300       310       320       330       340       350  

                  320       330       340       350       360      
pF1KE0 ----------RPGYTGATCELGIDECDPSPCKNGGSCTDLENSYSCTCPPGFYGKICELS
                  ::.:: ::  .::.:.:. :..::.: :: :...:.::: . :: :.:.
CCDS13 ETSLGFECECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLD
            360       370       380       390       400       410  

        370       380       390       400       410       420      
pF1KE0 AMTCADGPCFNGGRCSDSPDGGYSCRCPVGYSGFNCEKKIDYCSSSPCSNGAKCVDLGDA
       :  :   :: :.  :..   ..: : :  :. : ::. .:. : .. :.: :.: :: ..
CCDS13 ANECEAKPCVNAKSCKNLI-ASYYCDCLPGWMGQNCDININDCLGQ-CQNDASCRDLVNG
            420       430        440       450        460       470

        430       440       450       460       470       480      
pF1KE0 YLCRCQAGFSGRHCDDNVDDCASSPCANGGTCRDGVNDFSCTCPPGYTGRNCSAPVSRCE
       : : :  :..: ::. ..:.:::.:: ::: :.. .: :.: :: :..:  :.  .. ::
CCDS13 YRCICPPGYAGDHCERDIDECASNPCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYCE
              480       490       500       510       520       530

        490       500       510       520        530       540     
pF1KE0 HAPCHNGATCHERGHRYVCECARGYGGPNCQFLLPELPPGPA-VVDLTEKLEGQGGPFPW
         ::.::: :..:.  : :.: . : : ::. :  .    :  :.:              
CCDS13 PNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMASNDTPEG
              540       550       560       570       580       590

         550       560       570       580       590       600     
pF1KE0 VAVCAGVILVLMLLLGCAAVVVCVRLRLQKHRPPADPCRGETETMNNLANCQREKDISVS
                                                                   
CCDS13 VRYISSNVCGPHGKCKSQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNS
              600       610       620       630       640       650

>--
 initn: 927 init1: 641 opt: 862  Z-score: 590.8  bits: 120.6 E(32554): 1.4e-26
Smith-Waterman score: 862; 37.2% identity (62.4% similar) in 298 aa overlap (245-531:578-872)

          220       230       240       250       260           270
pF1KE0 GWKGPYCTEPICLPGCDEQHGFCDKPGECKCRVGWQGRYCDECIRYPG---CL-HGTCQQ
                                     : :.  .    : .:: .   :  :: :..
CCDS13 FCKCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMASNDTPEGVRYISSNVCGPHGKCKS
       550       560       570       580       590       600       

                  280       290       300       310       320      
pF1KE0 P----WQCNCQEGWGGLFCNQDLNYCTHHKPCKNGATCTNTGQGSYTCSCRPGYTGATCE
            . :.:..:. : .:....: : . .::.::.:: . : .:: : :  :. :: ::
CCDS13 QSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDC-ESNPCRNGGTCID-GVNSYKCICSDGWEGAYCE
       610       620       630        640        650       660     

        330       340       350       360       370       380      
pF1KE0 LGIDECDPSPCKNGGSCTDLENSYSCTCPPGFYGKICELSAMTCADGPCFNGGRCSDSPD
        .:..:. .::.:::.: :: :.. : :  :. :: :.     : .. : ::: : :  :
CCDS13 TNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATCNNGGTCYDEGD
         670       680       690       700       710       720     

        390       400        410       420       430       440     
pF1KE0 GGYSCRCPVGYSGFNCE-KKIDYCSSSPCSNGAKCVDLGDAYLCRCQAGFSGRHCDDNVD
       . ..: :: :. : .:.  . . :  .:: ::. ::  :... : :. :. :  : .:..
CCDS13 A-FKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTCVVNGESFTCVCKEGWEGPICAQNTN
          730       740       750       760       770       780    

         450       460       470       480       490       500     
pF1KE0 DCASSPCANGGTCRDGVNDFSCTCPPGYTGRNCSAPVSRCEHAPCHNGATCHERGHRYVC
       ::.  :: :.::: :: : . : : ::..: .:   ...:. .::  :::: .. . : :
CCDS13 DCSPHPCYNSGTCVDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININECQSSPCAFGATCVDEINGYRC
          790       800       810       820       830       840    

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pF1KE0 ECARGYGGPNCQFLL--PELPPGPAVVDLTEKLEGQGGPFPWVAVCAGVILVLMLLLGCA
        :  :..: .:: .   : .  : .. :                                
CCDS13 VCPPGHSGAKCQEVSGRPCITMGSVIPDGAKWDDDCNTCQCLNGRIACSKVWCGPRPCLL
          850       860       870       880       890       900    

>>CCDS9999.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14                (1200 aa)
 initn: 1892 init1: 1002 opt: 1756  Z-score: 1186.9  bits: 230.9 E(32554): 8.7e-60
Smith-Waterman score: 1796; 43.9% identity (64.7% similar) in 556 aa overlap (9-542:13-560)

                   10        20         30        40        50     
pF1KE0     MGSRCALALAVLSALLCQVWSS-GVFELKLQEFVNKKGLLGNRNCCRGGAGPP---
                   : .: ::  :.    : :::.:. . : .: : .  :: : .      
CCDS99 MRAQGRGRLPRRLLLLLALWVQAARPMGYFELQLSALRNVNGELLSGACCDGDGRTTRAG
               10        20        30        40        50        60

                60        70        80        90       100         
pF1KE0 PCA---CRTFFRVCLKHYQASVSPEPPCTYGSAVTPVLGVDSFSLPDGGGA-DSAFS---
        :.   : :. :::::.:::.:.:  ::.:: ..::::: .:: :: .:.: : : .   
CCDS99 GCGHDECDTYVRVCLKEYQAKVTPTGPCSYGHGATPVLGGNSFYLPPAGAAGDRARARAR
               70        80        90       100       110       120

                110       120       130       140       150        
pF1KE0 -----NP--IRFPFGFTWPGTFSLIIEALHTDSPDDLATENPERLISRLATQRHLTVGEE
            .:  . .:: :.:: .:.::.::   :.    .: : : :: :..    ..  ..
CCDS99 AGGDQDPGLVVIPFQFAWPRSFTLIVEAWDWDND---TTPNEELLIERVSHAGMINPEDR
              130       140       150          160       170       

      160        170       180       190       200       210       
pF1KE0 WSQDLHSSGRT-DLKYSYRFVCDEHYYGEGCSVFCRPRDDAFGHFTCGERGEKVCNPGWK
       : ..:: ::..  :. . :  :::.::.  :. :::::.: :::.:: . :.:.:  :: 
CCDS99 W-KSLHFSGHVAHLELQIRVRCDENYYSATCNKFCRPRNDFFGHYTCDQYGNKACMDGWM
        180       190       200       210       220       230      

       220       230       240       250       260       270       
pF1KE0 GPYCTEPICLPGCDEQHGFCDKPGECKCRVGWQGRYCDECIRYPGCLHGTCQQPWQCNCQ
       :  : : .:  ::.  :: :  ::::.:  :::::.::::. ::::.::.: .::::::.
CCDS99 GKECKEAVCKQGCNLLHGGCTVPGECRCSYGWQGRFCDECVPYPGCVHGSCVEPWQCNCE
        240       250       260       270       280       290      

       280       290       300       310       320       330       
pF1KE0 EGWGGLFCNQDLNYCTHHKPCKNGATCTNTGQGSYTCSCRPGYTGATCELGIDECDPSPC
        .::::.:..:::::  :.:: ::.:: :.   .: :.:  ::.: .:: .   :  .::
CCDS99 TNWGGLLCDKDLNYCGSHHPCTNGGTCINAEPDQYRCTCPDGYSGRNCEKAEHACTSNPC
        300       310       320       330       340       350      

       340       350       360       370       380       390       
pF1KE0 KNGGSCTDLENSYSCTCPPGFYGKICELSAMTCADGPCFNGGRCSDSPDGGYSCRCPVGY
        ::::: .. ... : :: :. :  : :.   ::..::  :: : :. :: . : ::  .
CCDS99 ANGGSCHEVPSGFECHCPSGWSGPTCALDIDECASNPCAAGGTCVDQVDG-FECICPEQW
        360       370       380       390       400        410     

       400       410       420       430       440       450       
pF1KE0 SGFNCEKKIDYCSSSPCSNGAKCVDLGDAYLCRCQAGFSGRHCDDNVDDCASSPCANGGT
        : .:.  .. : .. :..:. : :: ..: : :  ::.::::. . :.:::::: .:: 
CCDS99 VGATCQLDVNDCRGQ-CQHGGTCKDLVNGYQCVCPRGFGGRHCELERDECASSPCHSGGL
         420       430        440       450       460       470    

       460       470       480       490       500       510       
pF1KE0 CRDGVNDFSCTCPPGYTGRNCSAPVSRCEHAPCHNGATCHERGHRYVCECARGYGGPNCQ
       :.: .. : : :: :..:  : . :. :: .::.::: :..    : : :   .:: ::.
CCDS99 CEDLADGFHCHCPQGFSGPLCEVDVDLCEPSPCRNGARCYNLEGDYYCACPDDFGGKNCS
          480       490       500       510       520       530    

       520          530       540       550       560       570    
pF1KE0 FLLPELP-PGPA--VVDLTEKLEGQGGPFPWVAVCAGVILVLMLLLGCAAVVVCVRLRLQ
         .:. : :: :  :.:   .  : : :                                
CCDS99 --VPREPCPGGACRVIDGCGSDAGPGMPGTAASGVCGPHGRCVSQPGGNFSCICDSGFTG
            540       550       560       570       580       590  

>--
 initn: 645 init1: 645 opt: 842  Z-score: 577.5  bits: 118.2 E(32554): 7.6e-26
Smith-Waterman score: 842; 37.4% identity (58.5% similar) in 294 aa overlap (265-549:571-851)

          240       250       260        270          280       290
pF1KE0 GFCDKPGECKCRVGWQGRYCDECIRYPGCLHGTC-QQP---WQCNCQEGWGGLFCNQDLN
                                     :: : .::   ..: :. :. : .:.....
CCDS99 PGGACRVIDGCGSDAGPGMPGTAASGVCGPHGRCVSQPGGNFSCICDSGFTGTYCHENID
              550       560       570       580       590       600

              300       310       320       330       340       350
pF1KE0 YCTHHKPCKNGATCTNTGQGSYTCSCRPGYTGATCELGIDECDPSPCKNGGSCTDLENSY
        :   .::.::.:: .    .. : :  :. :  :. . ..: :.::.. : : :: :..
CCDS99 DCLG-QPCRNGGTCIDE-VDAFRCFCPSGWEGELCDTNPNDCLPDPCHSRGRCYDLVNDF
               610        620       630       640       650        

              360       370       380       390       400          
pF1KE0 SCTCPPGFYGKICELSAMTCADGPCFNGGRCSDSPDGGYSCRCPVGYSGFNCE-KKIDYC
        :.:  :. :: :.   . :    : ::: : :: :  . : :: :..: .:   : . :
CCDS99 YCACDDGWKGKTCHSREFQCDAYTCSNGGTCYDSGDT-FRCACPPGWKGSTCAVAKNSSC
      660       670       680       690        700       710       

     410       420       430       440       450       460         
pF1KE0 SSSPCSNGAKCVDLGDAYLCRCQAGFSGRHCDDNVDDCASSPCANGGTCRDGVNDFSCTC
         .:: ::. ::  : .. : :. :. :: :  :..::   :: ::: : :::: : : :
CCDS99 LPNPCVNGGTCVGSGASFSCICRDGWEGRTCTHNTNDCNPLPCYNGGICVDGVNWFRCEC
       720       730       740       750       760       770       

     470       480       490       500       510       520         
pF1KE0 PPGYTGRNCSAPVSRCEHAPCHNGATCHERGHRYVCECARGYGGPNCQFLLPELPPGPAV
        ::..: .:   ...:. .::  :::: .. . : : :  : .:: ::           :
CCDS99 APGFAGPDCRINIDECQSSPCAYGATCVDEINGYRCSCPPGRAGPRCQ----------EV
       780       790       800       810       820                 

     530       540           550       560       570       580     
pF1KE0 VDLTEKLEGQGGPFP----WVAVCAGVILVLMLLLGCAAVVVCVRLRLQKHRPPADPCRG
       . . ..  ..: :::    ::  :                                    
CCDS99 IGFGRSCWSRGTPFPHGSSWVEDCNSCRCLDGRRDCSKVWCGWKPCLLAGQPEALSAQCP
       830       840       850       860       870       880       

>>CCDS9998.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14                (1238 aa)
 initn: 1524 init1: 1002 opt: 1706  Z-score: 1153.4  bits: 224.8 E(32554): 6.3e-58
Smith-Waterman score: 1746; 42.8% identity (65.1% similar) in 538 aa overlap (9-527:13-544)

                   10        20         30        40        50     
pF1KE0     MGSRCALALAVLSALLCQVWSS-GVFELKLQEFVNKKGLLGNRNCCRGGAGPP---
                   : .: ::  :.    : :::.:. . : .: : .  :: : .      
CCDS99 MRAQGRGRLPRRLLLLLALWVQAARPMGYFELQLSALRNVNGELLSGACCDGDGRTTRAG
               10        20        30        40        50        60

                60        70        80        90       100         
pF1KE0 PCA---CRTFFRVCLKHYQASVSPEPPCTYGSAVTPVLGVDSFSLPDGGGA-DSAFS---
        :.   : :. :::::.:::.:.:  ::.:: ..::::: .:: :: .:.: : : .   
CCDS99 GCGHDECDTYVRVCLKEYQAKVTPTGPCSYGHGATPVLGGNSFYLPPAGAAGDRARARAR
               70        80        90       100       110       120

                110       120       130       140       150        
pF1KE0 -----NP--IRFPFGFTWPGTFSLIIEALHTDSPDDLATENPERLISRLATQRHLTVGEE
            .:  . .:: :.:: .:.::.::   :.    .: : : :: :..    ..  ..
CCDS99 AGGDQDPGLVVIPFQFAWPRSFTLIVEAWDWDND---TTPNEELLIERVSHAGMINPEDR
              130       140       150          160       170       

      160        170       180       190       200       210       
pF1KE0 WSQDLHSSGRT-DLKYSYRFVCDEHYYGEGCSVFCRPRDDAFGHFTCGERGEKVCNPGWK
       : ..:: ::..  :. . :  :::.::.  :. :::::.: :::.:: . :.:.:  :: 
CCDS99 W-KSLHFSGHVAHLELQIRVRCDENYYSATCNKFCRPRNDFFGHYTCDQYGNKACMDGWM
        180       190       200       210       220       230      

       220       230       240       250       260       270       
pF1KE0 GPYCTEPICLPGCDEQHGFCDKPGECKCRVGWQGRYCDECIRYPGCLHGTCQQPWQCNCQ
       :  : : .:  ::.  :: :  ::::.:  :::::.::::. ::::.::.: .::::::.
CCDS99 GKECKEAVCKQGCNLLHGGCTVPGECRCSYGWQGRFCDECVPYPGCVHGSCVEPWQCNCE
        240       250       260       270       280       290      

       280       290       300       310       320       330       
pF1KE0 EGWGGLFCNQDLNYCTHHKPCKNGATCTNTGQGSYTCSCRPGYTGATCELGIDECDPSPC
        .::::.:..:::::  :.:: ::.:: :.   .: :.:  ::.: .:: .   :  .::
CCDS99 TNWGGLLCDKDLNYCGSHHPCTNGGTCINAEPDQYRCTCPDGYSGRNCEKAEHACTSNPC
        300       310       320       330       340       350      

       340       350       360       370       380       390       
pF1KE0 KNGGSCTDLENSYSCTCPPGFYGKICELSAMTCADGPCFNGGRCSDSPDGGYSCRCPVGY
        ::::: .. ... : :: :. :  : :.   ::..::  :: : :. :: . : ::  .
CCDS99 ANGGSCHEVPSGFECHCPSGWSGPTCALDIDECASNPCAAGGTCVDQVDG-FECICPEQW
        360       370       380       390       400        410     

       400       410       420       430       440       450       
pF1KE0 SGFNCEKKIDYCSSSPCSNGAKCVDLGDAYLCRCQAGFSGRHCDDNVDDCASSPCANGGT
        : .:.   . : ..:: :. .: .:  .: : :  :..: .:  ::.::  . : .:::
CCDS99 VGATCQLDANECEGKPCLNAFSCKNLIGGYYCDCIPGWKGINCHINVNDC-RGQCQHGGT
         420       430       440       450       460        470    

       460       470       480       490       500       510       
pF1KE0 CRDGVNDFSCTCPPGYTGRNCSAPVSRCEHAPCHNGATCHERGHRYVCECARGYGGPNCQ
       :.: :: ..:.:: :. ::.:    ..:  .:::.:. :.. .  . :.: .:..:: :.
CCDS99 CKDLVNGYQCVCPRGFGGRHCELERDECASSPCHSGGLCEDLADGFHCHCPQGFSGPLCE
          480       490       500       510       520       530    

       520       530       540       550       560       570       
pF1KE0 FLLPELPPGPAVVDLTEKLEGQGGPFPWVAVCAGVILVLMLLLGCAAVVVCVRLRLQKHR
         .    :.:                                                  
CCDS99 VDVDLCEPSPCRNGARCYNLEGDYYCACPDDFGGKNCSVPREPCPGGACRVIDGCGSDAG
          540       550       560       570       580       590    

>--
 initn: 645 init1: 645 opt: 859  Z-score: 588.7  bits: 120.3 E(32554): 1.8e-26
Smith-Waterman score: 860; 35.7% identity (54.4% similar) in 373 aa overlap (183-549:552-889)

            160       170       180       190       200       210  
pF1KE0 LTVGEEWSQDLHSSGRTDLKYSYRFVCDEHYYGEGCSVFCRPRDDAFGHFTCGERGEKVC
                                     :  :: . .:   :: ::  .:.   :  :
CCDS99 CHCPQGFSGPLCEVDVDLCEPSPCRNGARCYNLEG-DYYCACPDD-FGGKNCSVPREP-C
             530       540       550        560        570         

            220       230       240        250       260       270 
pF1KE0 NPGWKGPYCTEPICLPGCDEQHGFCDKPGECKCRV-GWQGRYCDECIRYPGCLHGTCQQP
        ::  :  :     . ::  . :    ::     : : .::    :.  ::   :.    
CCDS99 -PG--GA-CR---VIDGCGSDAGP-GMPGTAASGVCGPHGR----CVSQPG---GN----
       580             590        600       610                    

             280       290       300       310       320       330 
pF1KE0 WQCNCQEGWGGLFCNQDLNYCTHHKPCKNGATCTNTGQGSYTCSCRPGYTGATCELGIDE
       ..: :. :. : .:..... :   .::.::.:: .    .. : :  :. :  :. . ..
CCDS99 FSCICDSGFTGTYCHENIDDCLG-QPCRNGGTCIDE-VDAFRCFCPSGWEGELCDTNPND
     620       630       640        650        660       670       

             340       350       360       370       380       390 
pF1KE0 CDPSPCKNGGSCTDLENSYSCTCPPGFYGKICELSAMTCADGPCFNGGRCSDSPDGGYSC
       : :.::.. : : :: :.. :.:  :. :: :.   . :    : ::: : :: :  . :
CCDS99 CLPDPCHSRGRCYDLVNDFYCACDDGWKGKTCHSREFQCDAYTCSNGGTCYDSGDT-FRC
       680       690       700       710       720       730       

             400        410       420       430       440       450
pF1KE0 RCPVGYSGFNCE-KKIDYCSSSPCSNGAKCVDLGDAYLCRCQAGFSGRHCDDNVDDCASS
        :: :..: .:   : . :  .:: ::. ::  : .. : :. :. :: :  :..::   
CCDS99 ACPPGWKGSTCAVAKNSSCLPNPCVNGGTCVGSGASFSCICRDGWEGRTCTHNTNDCNPL
        740       750       760       770       780       790      

              460       470       480       490       500       510
pF1KE0 PCANGGTCRDGVNDFSCTCPPGYTGRNCSAPVSRCEHAPCHNGATCHERGHRYVCECARG
       :: ::: : :::: : : : ::..: .:   ...:. .::  :::: .. . : : :  :
CCDS99 PCYNGGICVDGVNWFRCECAPGFAGPDCRINIDECQSSPCAYGATCVDEINGYRCSCPPG
        800       810       820       830       840       850      

              520       530       540           550       560      
pF1KE0 YGGPNCQFLLPELPPGPAVVDLTEKLEGQGGPFP----WVAVCAGVILVLMLLLGCAAVV
        .:: ::           :. . ..  ..: :::    ::  :                 
CCDS99 RAGPRCQ----------EVIGFGRSCWSRGTPFPHGSSWVEDCNSCRCLDGRRDCSKVWC
        860                 870       880       890       900      

        570       580       590       600       610       620      
pF1KE0 VCVRLRLQKHRPPADPCRGETETMNNLANCQREKDISVSIIGATQIKNTNKKADFHGDHS
                                                                   
CCDS99 GWKPCLLAGQPEALSAQCPLGQRCLEKAPGQCLRPPCEAWGECGAEEPPSTPCLPRSGHL
        910       920       930       940       950       960      

>>CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9              (2555 aa)
 initn: 1396 init1: 540 opt: 1001  Z-score: 680.3  bits: 138.3 E(32554): 1.4e-31
Smith-Waterman score: 1065; 39.6% identity (61.4% similar) in 376 aa overlap (163-516:726-1094)

            140       150       160       170       180       190  
pF1KE0 DDLATENPERLISRLATQRHLTVGEEWSQDLHSSGRTDLKYSYRFVCDEHYYGEGCSV--
                                     .:.. : .:. .:.  ::  . : .:..  
CCDS43 GINGFTCRCPEGYHDPTCLSEVNECNSNPCVHGACRDSLN-GYKCDCDPGWSGTNCDINN
         700       710       720       730        740       750    

               200       210          220          230         240 
pF1KE0 -FCRPRDDAFGHFTCGERGEK---VCNPGWKGPYCTEPI--CLPG-CDEQHGFC--DKPG
         :.    . :  :: .       .:  :..:: :   :  :  . : .: : :  :  :
CCDS43 NECESNPCVNGG-TCKDMTSGYVCTCREGFSGPNCQTNINECASNPCLNQ-GTCIDDVAG
          760        770       780       790       800        810  

              250           260        270            280       290
pF1KE0 -ECKCRVGWQGRYCD----ECIRYPGCLHG-TCQQP-----WQCNCQEGWGGLFCNQDLN
        .:.: . . :  :.     :   : : .:  :.:      ..: :  :: :  :. :.:
CCDS43 YKCNCLLPYTGATCEVVLAPCAPSP-CRNGGECRQSEDYESFSCVCPTGWQGQTCEVDIN
            820       830        840       850       860       870 

              300       310       320       330       340       350
pF1KE0 YCTHHKPCKNGATCTNTGQGSYTCSCRPGYTGATCELGIDECDPSPCKNGGSCTDLENSY
        :.  .::..::.: :: .:.: : :. ::.: .::  ::.: :.::.:::::::  :. 
CCDS43 ECVL-SPCRHGASCQNT-HGGYRCHCQAGYSGRNCETDIDDCRPNPCHNGGSCTDGINTA
              880        890       900       910       920         

              360       370       380       390       400       410
pF1KE0 SCTCPPGFYGKICELSAMTCADGPCFNGGRCSDSPDGGYSCRCPVGYSGFNCEKKIDYCS
        : : ::: : .:: .   ::. :: ::. :.:  :. :.: ::.:.::..::..   :.
CCDS43 FCDCLPGFRGTFCEEDINECASDPCRNGANCTDCVDS-YTCTCPAGFSGIHCENNTPDCT
     930       940       950       960        970       980        

              420       430       440       450       460       470
pF1KE0 SSPCSNGAKCVDLGDAYLCRCQAGFSGRHCDDNVDDCASSPCANGGTCRDGVNDFSCTCP
        : : ::. :::  ... : :  ::.: .:. .:..: :.:: .::::.:: ... ::::
CCDS43 ESSCFNGGTCVDGINSFTCLCPPGFTGSYCQHDVNECDSQPCLHGGTCQDGCGSYRCTCP
      990      1000      1010      1020      1030      1040        

              480       490       500       510       520       530
pF1KE0 PGYTGRNCSAPVSRCEHAPCHNGATCHERGHRYVCECARGYGGPNCQFLLPELPPGPAVV
        :::: ::.  :  :. .::.::. : .   .: :::  :. :  :              
CCDS43 QGYTGPNCQNLVHWCDSSPCKNGGKCWQTHTQYRCECPSGWTGLYCDVPSVSCEVAAQRQ
     1050      1060      1070      1080      1090      1100        

              540       550       560       570       580       590
pF1KE0 DLTEKLEGQGGPFPWVAVCAGVILVLMLLLGCAAVVVCVRLRLQKHRPPADPCRGETETM
                                                                   
CCDS43 GVDVARLCQHGGLCVDAGNTHHCRCQAGYTGSYCEDLVDECSPSPCQNGATCTDYLGGYS
     1110      1120      1130      1140      1150      1160        

>--
 initn: 1051 init1: 473 opt: 924  Z-score: 629.0  bits: 128.8 E(32554): 1e-28
Smith-Waterman score: 1018; 36.4% identity (63.0% similar) in 376 aa overlap (174-527:278-649)

           150       160       170       180       190          200
pF1KE0 ISRLATQRHLTVGEEWSQDLHSSGRTDLKYSYRFVCDEHYYGEGCSV---FCRPRDDAFG
                                     .:   :  .. :. :.     :.   .:  
CCDS43 GFTGQNCEENIDDCPGNNCKNGGACVDGVNTYNCRCPPEWTGQYCTEDVDECQLMPNACQ
       250       260       270       280       290       300       

                  210       220         230        240         250 
pF1KE0 HF-TC-GERG--EKVCNPGWKGPYCTEPI--CLPGCDEQHGFC-DKPGE--CKCRVGWQG
       .  :: . .:  . ::  :: :  :.: :  :  .   . . : :. .   :.:  :  :
CCDS43 NGGTCHNTHGGYNCVCVNGWTGEDCSENIDDCASAACFHGATCHDRVASFYCECPHGRTG
       310       320       330       340       350       360       

                260         270           280       290        300 
pF1KE0 RYC---DECIRYPGCLHGT-CQ-QPWQ----CNCQEGWGGLFCNQDLNYCT-HHKPCKNG
         :   : ::  : : .:. :. .: .    :.:  :. :  :.::.. :.   .::...
CCDS43 LLCHLNDACISNP-CNEGSNCDTNPVNGKAICTCPSGYTGPACSQDVDECSLGANPCEHA
       370       380        390       400       410       420      

             310       320       330       340       350       360 
pF1KE0 ATCTNTGQGSYTCSCRPGYTGATCELGIDECDPSPCKNGGSCTDLENSYSCTCPPGFYGK
       . : ::  ::. :.:  ::::  ::. ..::  .::.: ..: :  . ..: : ::. : 
CCDS43 GKCINT-LGSFECQCLQGYTGPRCEIDVNECVSNPCQNDATCLDQIGEFQCICMPGYEGV
        430        440       450       460       470       480     

             370       380       390       400       410       420 
pF1KE0 ICELSAMTCADGPCFNGGRCSDSPDGGYSCRCPVGYSGFNCEKKIDYCSSSPCSNGAKCV
        ::...  ::..::...::: :. .  ..:.::.:..:  :.  .: :.:.::.:::::.
CCDS43 HCEVNTDECASSPCLHNGRCLDKINE-FQCECPTGFTGHLCQYDVDECASTPCKNGAKCL
         490       500       510        520       530       540    

             430       440       450       460       470       480 
pF1KE0 DLGDAYLCRCQAGFSGRHCDDNVDDCASSPCANGGTCRDGVNDFSCTCPPGYTGRNCSAP
       :  ..: : :  :..: ::. ..:.:  .:: . :.:.:::  :.: : :::::..: . 
CCDS43 DGPNTYTCVCTEGYTGTHCEVDIDECDPDPC-HYGSCKDGVATFTCLCRPGYTGHHCETN
          550       560       570        580       590       600   

             490       500       510       520       530       540 
pF1KE0 VSRCEHAPCHNGATCHERGHRYVCECARGYGGPNCQFLLPELPPGPAVVDLTEKLEGQGG
       ...:   ::..:.::..: . :.: : .:  ::::.. : .   .:              
CCDS43 INECSSQPCRHGGTCQDRDNAYLCFCLKGTTGPNCEINLDDCASSPCDSGTCLDKIDGYE
           610       620       630       640       650       660   

             550       560       570       580       590       600 
pF1KE0 PFPWVAVCAGVILVLMLLLGCAAVVVCVRLRLQKHRPPADPCRGETETMNNLANCQREKD
                                                                   
CCDS43 CACEPGYTGSMCNINIDECAGNPCHNGGTCEDGINGFTCRCPEGYHDPTCLSEVNECNSN
           670       680       690       700       710       720   

>--
 initn: 389 init1: 298 opt: 564  Z-score: 389.0  bits: 84.4 E(32554): 2.4e-15
Smith-Waterman score: 716; 37.1% identity (58.0% similar) in 264 aa overlap (217-463:20-277)

        190       200       210       220           230       240  
pF1KE0 GCSVFCRPRDDAFGHFTCGERGEKVCNPGWKGPYCTEP--ICLPG--CDEQHGFCDKPGE
                                     .:: :..:   :: :  :.  .:       
CCDS43            MPPLLAPLLCLALLPALAARGPRCSQPGETCLNGGKCEAANG----TEA
                          10        20        30        40         

            250          260              270       280       290  
pF1KE0 CKCRVGWQGRYCDE---CIRYPGCLHGTCQ-------QPWQCNCQEGWGGLFCNQDLNYC
       : :  .. :  :..   :.  :    :::.         . :.:  :..: .:   :.  
CCDS43 CVCGGAFVGPRCQDPNPCLSTPCKNAGTCHVVDRRGVADYACSCALGFSGPLCLTPLDNA
          50        60        70        80        90       100     

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE0 THHKPCKNGATCTNTGQGSYTCSCRPGYTGATCELGIDECDPSPCKNGGSCTDLENSYSC
          .::.::.::       : : : ::..: .:. . : :  .:: :::.:  .: :: :
CCDS43 CLTNPCRNGGTCDLLTLTEYKCRCPPGWSGKSCQQA-DPCASNPCANGGQCLPFEASYIC
         110       120       130       140        150       160    

            360       370         380       390       400       410
pF1KE0 TCPPGFYGKICELSAMTCADGP--CFNGGRCSDSPDGGYSCRCPVGYSGFNCEKKIDYCS
        :::.:.:  :. ..  :.. :  : .:: : .   :.: : : . ..: :::.    ::
CCDS43 HCPPSFHGPTCRQDVNECGQKPGLCRHGGTCHNEV-GSYRCVCRATHTGPNCERPYVPCS
          170       180       190        200       210       220   

              420        430       440       450       460         
pF1KE0 SSPCSNGAKCVDLGDA-YLCRCQAGFSGRHCDDNVDDCASSPCANGGTCRDGVNDFSCTC
        :::.::. :   ::. . : :  ::.:..:..:.::: .. : :::.: ::::      
CCDS43 PSPCQNGGTCRPTGDVTHECACLPGFTGQNCEENIDDCPGNNCKNGGACVDGVNTYNCRC
           230       240       250       260       270       280   

     470       480       490       500       510       520         
pF1KE0 PPGYTGRNCSAPVSRCEHAPCHNGATCHERGHRYVCECARGYGGPNCQFLLPELPPGPAV
                                                                   
CCDS43 PPEWTGQYCTEDVDECQLMPNACQNGGTCHNTHGGYNCVCVNGWTGEDCSENIDDCASAA
           290       300       310       320       330       340   

>>CCDS908.1 NOTCH2 gene_id:4853|Hs108|chr1                (2471 aa)
 initn: 921 init1: 521 opt: 950  Z-score: 646.4  bits: 132.0 E(32554): 1.1e-29
Smith-Waterman score: 1021; 32.9% identity (51.3% similar) in 593 aa overlap (16-549:519-1098)

                              10        20         30        40    
pF1KE0                MGSRCALALAVLSALLCQVWSSG-VFELKLQEFVNKKGLLGNRNC
                                     ::    .: : .. ...  .   : : .  
CCDS90 VHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTPCLNGAK--
      490       500       510       520       530       540        

           50        60        70        80        90          100 
pF1KE0 CRGGAGPPPCACRTFFRVCLKHYQASVSPEPPCTYGSAVTPVLGVDSFSL---PDGGGA-
       :    .   : : : :   : . . .     :: .:.      :.::..    :   :: 
CCDS90 CIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHGQCQD---GIDSYTCICNPGYMGAI
        550       560       570       580          590       600   

                          110          120       130       140     
pF1KE0 -----DSAFSNP-------IRFPFGFT---WPGTFSLIIEALHTDSPDDLATENPE-RLI
            :  .:.:       : .  :.     ::: ..  :     . :: :. ::  . :
CCDS90 CSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQCNCQPGTSGVNCEI----NFDDCAS-NPCIHGI
           610       620       630       640           650         

          150             160              170         180         
pF1KE0 SRLATQRHLTV------GEEWSQDLHS-------SGRTDLK--YSYRFVCDEHYYGEGCS
          . .:.  :      :.. . :.         .: : ..   ..: .: :  .  .: 
CCDS90 CMDGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSCY
      660       670       680       690       700       710        

     190          200       210        220         230         240 
pF1KE0 V---FCRPRDDAFGHFTCGERGEK-VCNPGWKGPYCT--EPICLPGCDEQHGFCDK--PG
            :       :. : :  : : .:. :: :  :   .  :: .  .. : ::.   :
CCDS90 SQVNECLSNPCIHGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNPCQNGGTCDNLVNG
      720       730       740       750       760       770        

              250           260        270          280       290  
pF1KE0 -ECKCRVGWQGRYC----DECIRYPGCLH-GTCQQP---WQCNCQEGWGGLFCNQDLNYC
        .: :. :..:  :    :::   : ::. ::: .    . :.:   . :  :.  :  :
CCDS90 YRCTCKKGFKGYNCQVNIDECASNP-CLNQGTCFDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPC
      780       790       800        810       820       830       

            300        310       320       330       340       350 
pF1KE0 THHKPCKNGATCTNTGQ-GSYTCSCRPGYTGATCELGIDECDPSPCKNGGSCTDLENSYS
       . . ::.:.:.: .. .  :::: : ::. :  : . ::::  .:: : : : . ..:: 
CCDS90 SPN-PCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLCHNTQGSYM
       840        850       860       870       880       890      

             360       370       380       390       400       410 
pF1KE0 CTCPPGFYGKICELSAMTCADGPCFNGGRCSDSPDGGYSCRCPVGYSGFNCEKKIDYCSS
       : ::::: :  :: .   :  .:: ::: : :. .  .:: :  :..: .:.  .. : :
CCDS90 CECPPGFSGMDCEEDIDDCLANPCQNGGSCMDGVNT-FSCLCLPGFTGDKCQTDMNECLS
        900       910       920       930        940       950     

             420       430       440       450       460       470 
pF1KE0 SPCSNGAKCVDLGDAYLCRCQAGFSGRHCDDNVDDCASSPCANGGTCRDGVNDFSCTCPP
        ::.::. : :  ..: :.:::::.: ::..:...:. : : ::::: ::.:.::: :: 
CCDS90 EPCKNGGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFNGGTCVDGINSFSCLCPV
         960       970       980       990      1000      1010     

             480       490       500       510       520       530 
pF1KE0 GYTGRNCSAPVSRCEHAPCHNGATCHERGHRYVCECARGYGGPNCQFLLPELPPGPAVVD
       :.::  :   ...:   :: : .:: .    : : :  :: : ::: :.     .:    
CCDS90 GFTGSFCLHEINECSSHPCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNK
        1020      1030      1040      1050      1060      1070     

                540         550       560       570       580      
pF1KE0 LT---EKLEGQG-GPFPWV-AVCAGVILVLMLLLGCAAVVVCVRLRLQKHRPPADPCRGE
        :   .: :.:   :  :. : :                                     
CCDS90 GTCVQKKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGVLVEHLCQHSGVCINAGNTHYC
        1080      1090      1100      1110      1120      1130     

>--
 initn: 847 init1: 439 opt: 882  Z-score: 601.1  bits: 123.6 E(32554): 3.7e-27
Smith-Waterman score: 889; 35.5% identity (57.4% similar) in 392 aa overlap (179-541:92-477)

      150       160       170       180           190           200
pF1KE0 TQRHLTVGEEWSQDLHSSGRTDLKYSYRFVCDEHYYGEGC----SVFC---RP-RDDAFG
                                     :   . :: :    :  :   ::  . .  
CCDS90 CQHRDPCEKNRCQNGGTCVAQAMLGKATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGTC
              70        80        90       100       110       120 

              210       220        230       240          250      
pF1KE0 HFTCGERGEKVCNPGWKGPYCT-EPICLPGCDEQHGFCDKPGE---CKCRVGWQGRYCD-
       :.   .  : .:. :. :  :     ::     . . :   ..   ::: .:. :. :. 
CCDS90 HMLSRDTYECTCQVGFTGKECQWTDACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCET
             130       140       150       160       170       180 

            260         270          280       290       300       
pF1KE0 ---ECIRYPG-CLHG-TCQQ-P--WQCNCQEGWGGLFCNQDLNYCTHHKPCKNGATCTNT
          ::   :: : :: :: . :  .::.: .:. : .:..    :.  .:: ::.:: .:
CCDS90 DVNEC-DIPGHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQGFTGQYCDSLYVPCAP-SPCVNGGTCRQT
              190       200       210       220        230         

       310       320       330       340       350       360       
pF1KE0 GQGSYTCSCRPGYTGATCELGIDECDPSPCKNGGSCTDLENSYSCTCPPGFYGKICELSA
       :. .. :.: ::. :.::: .::.:    :.::: :.:  :.:.: ::: . :..:  ..
CCDS90 GDFTFECNCLPGFEGSTCERNIDDCPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDV
     240       250       260       270       280       290         

       370         380       390       400       410       420     
pF1KE0 MTCADGP--CFNGGRCSDSPDGGYSCRCPVGYSGFNCEKKIDYCSSSPCSNGAKCVDLGD
         :   :  : ::: :..  .:::.: :  :.:: .: ..:: :. . :. :. :.:   
CCDS90 DECLLQPNACQNGGTCANR-NGGYGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVA
     300       310        320       330       340       350        

         430       440        450        460        470       480  
pF1KE0 AYLCRCQAGFSGRHCDDNVDD-CASSPCANGGTC-RDGVN-DFSCTCPPGYTGRNCSAPV
       .. : :  : .:  :  ..:: : :.:: .:. :  . .: .. :::: :: : .:.  :
CCDS90 SFSCMCPEGKAGLLC--HLDDACISNPCHKGALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDV
      360       370         380       390       400       410      

               490       500       510       520       530         
pF1KE0 SRCEHA---PCHNGATCHERGHRYVCECARGYGGPNCQFLLPELPPGPAVVDLTEKLEGQ
       ..:  :   ::.... : .    . ::: .::.:: :.. . :    :   : :  :.  
CCDS90 DECAMANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATC-LDKI
        420       430       440       450       460       470      

     540       550       560       570       580       590         
pF1KE0 GGPFPWVAVCAGVILVLMLLLGCAAVVVCVRLRLQKHRPPADPCRGETETMNNLANCQRE
       ::                                                          
CCDS90 GGFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDD
         480       490       500       510       520       530     

>--
 initn: 812 init1: 420 opt: 864  Z-score: 589.1  bits: 121.4 E(32554): 1.7e-26
Smith-Waterman score: 873; 39.9% identity (60.5% similar) in 306 aa overlap (263-525:1120-1422)

            240       250       260        270          280        
pF1KE0 QHGFCDKPGECKCRVGWQGRYCDECIRYPGCLH-GTCQQPWQ---CNCQEGWGGLFCNQD
                                     : : :.: .  .   :.:  :. : .:...
CCDS90 PSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGVLVEHLCQHSGVCINAGNTHYCQCPLGYTGSYCEEQ
    1090      1100      1110      1120      1130      1140         

      290       300       310       320       330       340        
pF1KE0 LNYCTHHKPCKNGATCTNTGQGSYTCSCRPGYTGATCELGIDECDPSPCKNGGSCTDLEN
       :. :. . ::..::::..   :.: : : ::: :..::  .:::. .::.:::.: :: :
CCDS90 LDECASN-PCQHGATCSDF-IGGYRCECVPGYQGVNCEYEVDECQNQPCQNGGTCIDLVN
    1150       1160       1170      1180      1190      1200       

      350       360       370        380       390       400       
pF1KE0 SYSCTCPPGFYGKICELSAMTCADGP-CFNGGRCSDSPDGGYSCRCPVGYSGFNCEKKID
        ..:.::::  : .:: .   :: :: :.:::.: :   :::::::  :..:  ::  :.
CCDS90 HFKCSCPPGTRGLLCEENIDDCARGPHCLNGGQCMDRI-GGYSCRCLPGFAGERCEGDIN
      1210      1220      1230      1240       1250      1260      

       410         420       430       440       450       460     
pF1KE0 YCSSSPCSN-GA-KCVDLGDAYLCRCQAGFSGRHCDDNVDDCASSPCANGGTCRDGVN--
        : :.:::. :.  :..: . ::: :...:.::::.  :: : . :: :::::  . :  
CCDS90 ECLSNPCSSEGSLDCIQLTNDYLCVCRSAFTGRHCETFVDVCPQMPCLNGGTCAVASNMP
       1270      1280      1290      1300      1310      1320      

            470       480                                    490   
pF1KE0 -DFSCTCPPGYTGRNCSA------------------------PVSR-----CEHAPCHNG
         : : ::::..:  :..                        :  :     :  .::..:
CCDS90 DGFICRCPPGFSGARCQSSCGQVKCRKGEQCVHTASGPRCFCPSPRDCESGCASSPCQHG
       1330      1340      1350      1360      1370      1380      

           500         510       520         530       540         
pF1KE0 ATCHERGH--RYVCECARGYGGPNCQFLL--PELPPGPAVVDLTEKLEGQGGPFPWVAVC
       ..:: . .   : :.::  ..:  :..    :  ::                        
CCDS90 GSCHPQRQPPYYSCQCAPPFSGSRCELYTAPPSTPPATCLSQYCADKARDGVCDEACNSH
       1390      1400      1410      1420      1430      1440      

     550       560       570       580       590       600         
pF1KE0 AGVILVLMLLLGCAAVVVCVRLRLQKHRPPADPCRGETETMNNLANCQREKDISVSIIGA
                                                                   
CCDS90 ACQWDGGDCSLTMENPWANCSSPLPCWDYINNQCDELCNTVECLFDNFECQGNSKTCKYD
       1450      1460      1470      1480      1490      1500      

>>CCDS12537.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19              (587 aa)
 initn: 1613 init1: 542 opt: 896  Z-score: 616.6  bits: 124.4 E(32554): 5.1e-28
Smith-Waterman score: 1265; 36.6% identity (56.9% similar) in 573 aa overlap (7-572:10-518)

                  10          20        30        40        50     
pF1KE0    MGSRCALALAVLSAL--LCQVWSSGVFELKLQEFVNKKGLLGNRNCCRGGAGPPPCA
                :. .:. ::  : :.  .:::::... :    :  . :. :  .:  :   
CCDS12 MVSPRMSGLLSQTVILALIFLPQTRPAGVFELQIHSFGPGPGPGAPRSPC--SARLP---
               10        20        30        40        50          

          60        70        80        90       100        110    
pF1KE0 CRTFFRVCLKHYQASVSPEPPCTYGSAVTPVLGVDSFSLPDGGGADSAFSNPI-RFPFGF
       :: :::::::   .  . : ::. :.:..    : . . : . . :  . . . . ::  
CCDS12 CRLFFRVCLKPGLSEEAAESPCALGAALSARGPVYTEQ-PGAPAPDLPLPDGLLQVPFRD
          60        70        80        90        100       110    

          120       130       140        150       160       170   
pF1KE0 TWPGTFSLIIEALHTDSPDDLATENPE-RLISRLATQRHLTVGEEWSQDLHSSGRTDLKY
       .::::::.:::. . .  :...  .:   :..:.: .:.:..:  :..:.. .:  .:..
CCDS12 AWPGTFSFIIETWREELGDQIG--GPAWSLLARVAGRRRLAAGGPWARDIQRAGAWELRF
          120       130         140       150       160       170  

           180       190       200       210       220        230  
pF1KE0 SYRFVCDEHYYGEGCSVFCRPRDDAFGHFTCGERGEKVCNPGWKGPYCTEP-ICLPGCDE
       :::  :.    : .:. .::::.   .   ::  : . : :      :  : .:  ::. 
CCDS12 SYRARCEPPAVGTACTRLCRPRS---APSRCGP-GLRPCAP--LEDECEAPLVCRAGCSP
            180       190          200          210       220      

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE0 QHGFCDKPGECKCRVGWQGRYCDECIRYPGCLHGTCQQPWQCNCQEGWGGLFCNQDLNYC
       .::::..::::.:  :: :  :   .   .::     .:      .:             
CCDS12 EHGFCEQPGECRCLEGWTGPLCTVPVSTSSCL-----SP------RG-------------
        230       240       250            260                     

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE0 THHKPCKNGATCTNTGQGSYTCSCRPGYTGATCELGIDECDPSPCKNGGSCTDLENSYSC
           : .  . :   : :       :             :: .:: :::::..   :. :
CCDS12 ----PSSATTGCLVPGPG-------P-------------CDGNPCANGGSCSETPRSFEC
                270                           280       290        

            360       370       380         390       400       410
pF1KE0 TCPPGFYGKICELSAMTCADGPCFNGGRC--SDSPDGGYSCRCPVGYSGFNCEKKIDYCS
       ::: ::::  ::.:..::::::::::: :  . .::..: :.:: :..: ::::..: ::
CCDS12 TCPRGFYGLRCEVSGVTCADGPCFNGGLCVGGADPDSAYICHCPPGFQGSNCEKRVDRCS
      300       310       320       330       340       350        

              420       430       440       450       460       470
pF1KE0 SSPCSNGAKCVDLGDAYLCRCQAGFSGRHCDDNVDDCASSPCANGGTCRDGVNDFSCTCP
        .:: ::. :.::: :  :::.:::.: .:. ..::::.  ::::::: .: .   :.: 
CCDS12 LQPCRNGGLCLDLGHALRCRCRAGFAGPRCEHDLDDCAGRACANGGTCVEGGGAHRCSCA
      360       370       380       390       400       410        

              480       490       500       510       520       530
pF1KE0 PGYTGRNCSAPVSRCEHAPCHNGATCHERGHRYVCECARGYGGPNCQFLLPELPPGPAVV
        :. ::.:   .. :   :: .:. :. .    :: :: :: :  :.:  :  : : ...
CCDS12 LGFGGRDCRERADPCAARPCAHGGRCYAHFSGLVCACAPGYMGARCEF--PVHPDGASAL
      420       430       440       450       460         470      

              540       550       560       570       580       590
pF1KE0 DLTEKLEGQGGPFPWVAVCAGVILVLMLLLGCAAVVVCVRLRLQKHRPPADPCRGETETM
         .      : :  ..   :  .::   . : : ..: :: :                  
CCDS12 PAAPPGLRPGDPQRYLLPPALGLLVAAGVAGAALLLVHVRRRGHSQDAGSRLLAGTPEPS
        480       490       500       510       520       530      

              600       610       620       630       640       650
pF1KE0 NNLANCQREKDISVSIIGATQIKNTNKKADFHGDHSADKNGFKARYPAVDYNLVQDLKGD
                                                                   
CCDS12 VHALPDALNNLRTQEGSGDGPSSSVDWNRPEDVDPQGIYVISAPSIYAREA         
        540       550       560       570       580                

>>CCDS12538.1 DLL3 gene_id:10683|Hs108|chr19              (618 aa)
 initn: 1613 init1: 542 opt: 896  Z-score: 616.4  bits: 124.4 E(32554): 5.2e-28
Smith-Waterman score: 1265; 36.6% identity (56.9% similar) in 573 aa overlap (7-572:10-518)

                  10          20        30        40        50     
pF1KE0    MGSRCALALAVLSAL--LCQVWSSGVFELKLQEFVNKKGLLGNRNCCRGGAGPPPCA
                :. .:. ::  : :.  .:::::... :    :  . :. :  .:  :   
CCDS12 MVSPRMSGLLSQTVILALIFLPQTRPAGVFELQIHSFGPGPGPGAPRSPC--SARLP---
               10        20        30        40        50          

          60        70        80        90       100        110    
pF1KE0 CRTFFRVCLKHYQASVSPEPPCTYGSAVTPVLGVDSFSLPDGGGADSAFSNPI-RFPFGF
       :: :::::::   .  . : ::. :.:..    : . . : . . :  . . . . ::  
CCDS12 CRLFFRVCLKPGLSEEAAESPCALGAALSARGPVYTEQ-PGAPAPDLPLPDGLLQVPFRD
          60        70        80        90        100       110    

          120       130       140        150       160       170   
pF1KE0 TWPGTFSLIIEALHTDSPDDLATENPE-RLISRLATQRHLTVGEEWSQDLHSSGRTDLKY
       .::::::.:::. . .  :...  .:   :..:.: .:.:..:  :..:.. .:  .:..
CCDS12 AWPGTFSFIIETWREELGDQIG--GPAWSLLARVAGRRRLAAGGPWARDIQRAGAWELRF
          120       130         140       150       160       170  

           180       190       200       210       220        230  
pF1KE0 SYRFVCDEHYYGEGCSVFCRPRDDAFGHFTCGERGEKVCNPGWKGPYCTEP-ICLPGCDE
       :::  :.    : .:. .::::.   .   ::  : . : :      :  : .:  ::. 
CCDS12 SYRARCEPPAVGTACTRLCRPRS---APSRCGP-GLRPCAP--LEDECEAPLVCRAGCSP
            180       190          200          210       220      

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE0 QHGFCDKPGECKCRVGWQGRYCDECIRYPGCLHGTCQQPWQCNCQEGWGGLFCNQDLNYC
       .::::..::::.:  :: :  :   .   .::     .:      .:             
CCDS12 EHGFCEQPGECRCLEGWTGPLCTVPVSTSSCL-----SP------RG-------------
        230       240       250            260                     

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE0 THHKPCKNGATCTNTGQGSYTCSCRPGYTGATCELGIDECDPSPCKNGGSCTDLENSYSC
           : .  . :   : :       :             :: .:: :::::..   :. :
CCDS12 ----PSSATTGCLVPGPG-------P-------------CDGNPCANGGSCSETPRSFEC
                270                           280       290        

            360       370       380         390       400       410
pF1KE0 TCPPGFYGKICELSAMTCADGPCFNGGRC--SDSPDGGYSCRCPVGYSGFNCEKKIDYCS
       ::: ::::  ::.:..::::::::::: :  . .::..: :.:: :..: ::::..: ::
CCDS12 TCPRGFYGLRCEVSGVTCADGPCFNGGLCVGGADPDSAYICHCPPGFQGSNCEKRVDRCS
      300       310       320       330       340       350        

              420       430       440       450       460       470
pF1KE0 SSPCSNGAKCVDLGDAYLCRCQAGFSGRHCDDNVDDCASSPCANGGTCRDGVNDFSCTCP
        .:: ::. :.::: :  :::.:::.: .:. ..::::.  ::::::: .: .   :.: 
CCDS12 LQPCRNGGLCLDLGHALRCRCRAGFAGPRCEHDLDDCAGRACANGGTCVEGGGAHRCSCA
      360       370       380       390       400       410        

              480       490       500       510       520       530
pF1KE0 PGYTGRNCSAPVSRCEHAPCHNGATCHERGHRYVCECARGYGGPNCQFLLPELPPGPAVV
        :. ::.:   .. :   :: .:. :. .    :: :: :: :  :.:  :  : : ...
CCDS12 LGFGGRDCRERADPCAARPCAHGGRCYAHFSGLVCACAPGYMGARCEF--PVHPDGASAL
      420       430       440       450       460         470      

              540       550       560       570       580       590
pF1KE0 DLTEKLEGQGGPFPWVAVCAGVILVLMLLLGCAAVVVCVRLRLQKHRPPADPCRGETETM
         .      : :  ..   :  .::   . : : ..: :: :                  
CCDS12 PAAPPGLRPGDPQRYLLPPALGLLVAAGVAGAALLLVHVRRRGHSQDAGSRLLAGTPEPS
        480       490       500       510       520       530      

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pF1KE0 NNLANCQREKDISVSIIGATQIKNTNKKADFHGDHSADKNGFKARYPAVDYNLVQDLKGD
                                                                   
CCDS12 VHALPDALNNLRTQEGSGDGPSSSVDWNRPEDVDPQGIYVISAPSIYAREVATPLFPPLH
        540       550       560       570       580       590      

>>CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6              (2003 aa)
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     140       150       160       170       180       190         
pF1KE0 PERLISRLATQRHLTVGEEWSQDLHSSGRTDLKYSYRFVCDEHYYGEGCSV-FCRPRDDA
                                     ::  ..  .:   . :. : : .: : .  
CCDS34 KCLPGFEGPRCQTEVDECLSDPCPVGASCLDLPGAFFCLCPSGFTGQLCEVPLCAP-NLC
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pF1KE0 FGHFTCGERGEK---VCNPGWKGPYCTEPICLPGCDEQHGFCDKPGECKCRVGWQGRYCD
         .  : .. .:   .:  :  .: :. :    .:  .:: :.. . : : ::: :  :.
CCDS34 QPKQICKDQKDKANCLCPDG--SPGCAPP--EDNCTCHHGHCQRSS-CVCDVGWTGPECE
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pF1KE0 E----CIRYPGCLHG-TCQ-QP--WQCNCQEGWGGLFCNQDLNYCTHHKPCKNGATCTNT
            ::  : : :: ::  ::  ..:.:  :. :  :..... : :  :: ::..: : 
CCDS34 AELGGCISAP-CAHGGTCYPQPSGYNCTCPTGYTGPTCSEEMTAC-HSGPCLNGGSC-NP
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pF1KE0 GQGSYTCSCRPGYTGATCELGIDECDPSPCKNGGSCTDLENSYSCTCPPGFYGKICELSA
       . :.: :.: :..::  :. . : :  .:: :::.:..  ...:: :  :: :  :: . 
CCDS34 SPGGYYCTCPPSHTGPQCQTSTDYCVSAPCFNGGTCVNRPGTFSCLCAMGFQGPRCEGKL
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pF1KE0 M-TCADGPCFNGGRCSDSPDGGYSCRCPVGYSGFNCEKKIDYCSSSPCSNGAKCVDLGDA
         .:::.:: : . :.:::.:   : ::.::.: .:.  .: :...::  ...:.. : .
CCDS34 RPSCADSPCRNRATCQDSPQGPR-CLCPTGYTGGSCQTLMDLCAQKPCPRNSHCLQTGPS
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pF1KE0 YLCRCQAGFSGRHCDDNVDDC----------ASSPCANGGTCRDGVNDFSCTCPPGYTGR
       . : :  :..:  :.  ...:          .:: : ::: : :.  .. : ::::. : 
CCDS34 FHCLCLQGWTGPLCNLPLSSCQKAALSQGIDVSSLCHNGGLCVDSGPSYFCHCPPGFQGS
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pF1KE0 NCSAPVSRCEHAPCHNGATCHERGHRYVCECARGYGGPNCQFLLPELPPGPAVVDLTEKL
        :.  :. ::  ::.:::::  .   :.:.:: :: : ::                    
CCDS34 LCQDHVNPCESRPCQNGATCMAQPSGYLCQCAPGYDGQNCSKELDACQSQPCHNHGTCTP
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pF1KE0 EGQGGPFPWVAVCAGVILVLMLLLGCAAVVVCVRLRLQKHRPPADPCRGETETMNNLANC
                                                                   
CCDS34 KPGGFHCACPPGFVGLRCEGDVDECLDQPCHPTGTAACHSLANAFYCQCLPGHTGQWCEV
         990      1000      1010      1020      1030      1040     

>--
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         10        20        30        40        50         60     
pF1KE0 LALAVLSALLCQVWSSGVFELKLQEFVNKKGLLGNRNCCRGGAGP-PPCACRTFFRVCLK
                                     :. :.: :      : ::  :    : :  
CCDS34 GSCQALLPAPLGLPSSPSPLTPSFLCTCLPGFTGER-CQAKLEDPCPPSFCSKRGR-C--
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pF1KE0 HYQASVSPEPPCTYGSAVTPVLGVDSFSLPD--GGGADSAFSNPIRF--PFGFTWPGTFS
       : :::  :.  :  : .       :  :     .::.  :    :.   : ::   .   
CCDS34 HIQASGRPQCSCMPGWTGEQCQLRDFCSANPCVNGGVCLATYPQIQCHCPPGFEGHACER
           140       150       160       170       180       190   

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pF1KE0 LIIEALHTDSPDDLATENPERLISRLATQRHLTVGEEWSQDLHSSGRTDLKYSYRFVCDE
        . : ..  .:   .:   . : :    :    ::.:       . : .:. .    :  
CCDS34 DVNECFQDPGPCPKGTSCHNTLGS---FQCLCPVGQE-------GPRCELRAGP---CPP
           200       210          220              230          240

             190       200       210       220         230         
pF1KE0 HYYGEGCSVFCRPRDDAFGHFTCGERGEKVCNPGWKGPYC-TEP-ICLPGCDEQHGFCDK
       .  ..: .    :. :.  :. :      .: ::. :: : ..:  :.    .. : :. 
CCDS34 RGCSNGGTCQLMPEKDSTFHL-C------LCPPGFIGPDCEVNPDNCVSHQCQNGGTCQD
              250       260              270       280       290   

     240          250           260          270          280      
pF1KE0 PGE---CKCRVGWQGRYC----DECIRY--PGCLHG-TCQQP---WQCNCQEGWGGLFCN
         .   : :   : :  :    :::     : : .: :::.    ..: :  ::::  :.
CCDS34 GLDTYTCLCPETWTGWDCSEDVDECETQGPPHCRNGGTCQNSAGSFHCVCVSGWGGTSCE
           300       310       320       330       340       350   

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pF1KE0 QDLNYCTHHKPCKNGATCTNTGQGSYTCSCRPGYTGATCELGIDECDPSPCKNGGSCTD-
       ..:. :     :  :.:: .   ::..: : :: ::  :.:  : :  .::.. ..:.  
CCDS34 ENLDDCIA-ATCAPGSTCIDR-VGSFSCLCPPGRTGLLCHLE-DMCLSQPCHGDAQCSTN
           360        370        380       390        400       410

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pF1KE0 -LENSYSCTCPPGFYGKICELSAMTC-----ADGPCFNGGRCSDSPDGGYSCRCPVGYSG
        : .:  : : ::. :  :. .   :     . .:: .:: : ..: :...: :: ::.:
CCDS34 PLTGSTLCLCQPGYSGPTCHQDLDECLMAQQGPSPCEHGGSCLNTP-GSFNCLCPPGYTG
              420       430       440       450        460         

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pF1KE0 FNCEKKIDYCSSSPCSNGAKCVDLGDAYLCRCQAGFSGRHCDDNVDDCASSPCANGGTCR
         ::   . : :.::  :. :.::  .. : :  :. :. :. ....:::.:: : . :.
CCDS34 SRCEADHNECLSQPCHPGSTCLDLLATFHCLCPPGLEGQLCEVETNECASAPCLNHADCH
     470       480       490       500       510       520         

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pF1KE0 DGVNDFSCTCPPGYTGRNCSAPVSRCEHAPCHNGATCHERGHRYVCECARGYGGPNCQFL
       : .: :.: : ::..:  :   ...:. .:: ::. :...   . :.:  :. :: ::  
CCDS34 DLLNGFQCICLPGFSGTRCEEDIDECRSSPCANGGQCQDQPGAFHCKCLPGFEGPRCQTE
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pF1KE0 LPELPPGPAVVDLTEKLEGQGGPFPWVAVCAGVILVLMLLLGCAAVVVCVRLRLQKHRPP
       . :    :  :                                                 
CCDS34 VDECLSDPCPVGASCLDLPGAFFCLCPSGFTGQLCEVPLCAPNLCQPKQICKDQKDKANC
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723 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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