Result of FASTA (ccds) for pF1KE0026
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0026, 485 aa
  1>>>pF1KE0026 485 - 485 aa - 485 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4600+/-0.0011; mu= 7.9695+/- 0.065
 mean_var=170.6102+/-35.804, 0's: 0 Z-trim(109.3): 151  B-trim: 456 in 1/50
 Lambda= 0.098191
 statistics sampled from 10647 (10823) to 10647 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.708), E-opt: 0.2 (0.332), width:  16
 Scan time:  3.350

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11       ( 485) 3393 493.3 2.5e-139
CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6        ( 488) 1133 173.1   6e-43
CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4        ( 471)  866 135.3 1.4e-31
CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1         ( 477)  847 132.6 9.3e-31
CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1        ( 468)  844 132.1 1.2e-30
CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11        ( 475)  830 130.2 4.9e-30
CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6        ( 481)  808 127.1 4.3e-29
CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11       ( 488)  802 126.2 7.8e-29
CCDS31389.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11       ( 516)  802 126.2 8.1e-29
CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6         ( 465)  790 124.5 2.4e-28
CCDS31391.1 TRIM34 gene_id:53840|Hs108|chr11       ( 488)  762 120.5   4e-27
CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1         ( 486)  757 119.8 6.5e-27
CCDS4676.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6         ( 395)  754 119.3 7.4e-27
CCDS31393.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11        ( 493)  751 119.0 1.2e-26
CCDS376.1 TRIM62 gene_id:55223|Hs108|chr1          ( 475)  743 117.8 2.5e-26
CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4        ( 468)  742 117.7 2.7e-26
CCDS41612.1 TRIM22 gene_id:10346|Hs108|chr11       ( 498)  724 115.2 1.7e-25
CCDS32220.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15      ( 500)  720 114.6 2.5e-25
CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6        ( 503)  719 114.5 2.8e-25
CCDS5678.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7          ( 474)  693 110.8 3.4e-24
CCDS4466.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5         ( 630)  653 105.2 2.1e-22
CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6          ( 513)  647 104.3 3.3e-22
CCDS10498.1 MEFV gene_id:4210|Hs108|chr16          ( 781)  640 103.4 8.9e-22
CCDS475.1 ERMAP gene_id:114625|Hs108|chr1          ( 475)  621 100.6   4e-21
CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6        ( 518)  614 99.6 8.5e-21
CCDS4612.2 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6         ( 535)  609 98.9 1.4e-20
CCDS4611.1 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6         ( 584)  609 98.9 1.5e-20
CCDS31392.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11        ( 326)  604 98.0 1.6e-20
CCDS31394.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11        ( 347)  604 98.0 1.7e-20
CCDS31388.1 TRIM34 gene_id:445372|Hs108|chr11      ( 842)  609 99.1   2e-20
CCDS4678.1 TRIM26 gene_id:7726|Hs108|chr6          ( 539)  603 98.1 2.6e-20
CCDS4614.1 BTN1A1 gene_id:696|Hs108|chr6           ( 526)  587 95.8 1.2e-19
CCDS4465.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5         ( 518)  585 95.5 1.5e-19
CCDS4462.1 TRIM7 gene_id:81786|Hs108|chr5          ( 511)  583 95.2 1.8e-19
CCDS47388.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6        ( 461)  577 94.3 2.9e-19
CCDS4608.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6         ( 513)  577 94.4 3.2e-19
CCDS6056.2 TRIM35 gene_id:23087|Hs108|chr8         ( 493)  568 93.1 7.5e-19
CCDS34654.1 TRIM50 gene_id:135892|Hs108|chr7       ( 487)  558 91.6   2e-18
CCDS56403.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6        ( 313)  543 89.4 6.3e-18
CCDS4607.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6         ( 407)  543 89.5 7.6e-18
CCDS4606.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6         ( 523)  543 89.6 9.1e-18
CCDS56405.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6        ( 466)  512 85.1 1.8e-16
CCDS4613.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6         ( 527)  512 85.2 1.9e-16
CCDS4460.2 BTNL9 gene_id:153579|Hs108|chr5         ( 535)  511 85.0 2.1e-16
CCDS44327.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1        ( 343)  507 84.3 2.3e-16
CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11     ( 449)  500 83.4 5.6e-16
CCDS4677.1 TRIM15 gene_id:89870|Hs108|chr6         ( 465)  500 83.4 5.7e-16
CCDS73363.1 TRIM64 gene_id:120146|Hs108|chr11      ( 449)  495 82.7 9.1e-16
CCDS5679.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7          ( 500)  491 82.2 1.5e-15
CCDS73287.1 TRIM64C gene_id:646754|Hs108|chr11     ( 450)  482 80.9 3.3e-15


>>CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11            (485 aa)
 initn: 3393 init1: 3393 opt: 3393  Z-score: 2614.8  bits: 493.3 E(32554): 2.5e-139
Smith-Waterman score: 3393; 100.0% identity (100.0% similar) in 485 aa overlap (1-485:1-485)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIPGESQNWGYTCPLC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIPGESQNWGYTCPLC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 RAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLKGDLCERHGEKLKMFCKEDVLIMCEAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLKGDLCERHGEKLKMFCKEDVLIMCEAC
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 SQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQVETR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQVETR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 KQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKLELNHSELIQQSQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKLELNHSELIQQSQV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 LWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKTDCRVLGLREILKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKTDCRVLGLREILKT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 YAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQKLPDNPERFYRYNIVLGSQCISSGRHYW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQKLPDNPERFYRYNIVLGSQCISSGRHYW
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 EVEVGDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVIRLRKGNEYRAGTDEYPILSLPVPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EVEVGDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVIRLRKGNEYRAGTDEYPILSLPVPP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 RRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPYFSPCYSIGTNNTAPLAICS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPYFSPCYSIGTNNTAPLAICS
              430       440       450       460       470       480

            
pF1KE0 LDGED
       :::::
CCDS31 LDGED
            

>>CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6             (488 aa)
 initn: 889 init1: 402 opt: 1133  Z-score: 884.5  bits: 173.1 E(32554): 6e-43
Smith-Waterman score: 1133; 38.1% identity (66.7% similar) in 480 aa overlap (5-478:18-481)

                            10        20        30        40       
pF1KE0              MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIP
                        : .: .  :..: .:. .:.::. :.:::.::..:..  :   
CCDS34 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWW---
               10        20        30        40        50          

        50        60        70        80        90       100       
pF1KE0 GESQNWGYTCPLCRAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLKGDLCERHGEKLKM
        :. .  . ::.::   . :.:::: ::...:: .. :.         .:: .: : :..
CCDS34 -EDLERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSL
         60        70        80        90       100       110      

       110       120       130       140       150       160       
pF1KE0 FCKEDVLIMCEACSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGER
       :: ::   .:  :. :  :.::.:::..:.. ::: .:.. :: :... .:  . . .:.
CCDS34 FCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEE
        120       130       140       150       160       170      

       170       180       190       200       210       220       
pF1KE0 KRTATWKIQVETRKQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKL
       :. .  :  ::.:.:.:. :::.           ::.:  :  . :. :..:  . .:.:
CCDS34 KKPGELKRLVESRRQQILREFEEL----------HRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRL
        180       190       200                 210       220      

       230       240       250       260       270       280       
pF1KE0 ELNHSELIQQSQVLWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKT
       . : ..: .. . : .. ::.. .  .    ::.:.. .:.. .. . ..   .:.::. 
CCDS34 RENAAHLGDKRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEK
        230       240       250       260       270       280      

            290       300       310       320       330        340 
pF1KE0 DC-----RVLGLREILKTYAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQK-LPDNPERF
       .      . ..::.:::   ::: :::.::.  :..::::: :.. .:  . :::.:.::
CCDS34 NFSNFPRQYFALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRF
        290       300       310       320       330       340      

             350       360       370       380       390       400 
pF1KE0 YRYNIVLGSQCISSGRHYWEVEVGDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVIRLRKG
         :  ::... ..::::::::::::...:..:::...:.::  .   :. :.: .:: .:
CCDS34 TFYPCVLATEGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNG
        350       360       370       380       390       400      

             410       420       430       440       450       460 
pF1KE0 NEYRAGTDEYPILSLPVPPRRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPY
       ..: : :  .  : . : :.:::::.::::  .:::::::  :::.::    :  .: : 
CCDS34 DKYAATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTD-RSHIYTFTD-TFTEKLWPL
        410       420       430       440        450        460    

             470       480     
pF1KE0 FSPCYSIGTNNTAPLAICSLDGED
       : :    : .:.:::.:       
CCDS34 FYPGIRAGRKNAAPLTIRPPTDWE
          470       480        

>>CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4             (471 aa)
 initn: 845 init1: 402 opt: 866  Z-score: 680.3  bits: 135.3 E(32554): 1.4e-31
Smith-Waterman score: 872; 34.6% identity (62.7% similar) in 491 aa overlap (4-484:5-470)

                10        20        30        40        50         
pF1KE0  MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIPGESQNWGYTCPL
           ::::. . :: .::::. .:..:..:.:::.::.::::  :.   ..    . ::.
CCDS38 MEFVTALVN-LQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSWKDLDDT----FPCPV
                10        20        30        40        50         

      60        70        80        90          100       110      
pF1KE0 CRAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLK---GDLCERHGEKLKMFCKEDVLIM
       ::     ...: : :: :..: .. :... .   .   . .::.:.. : .:: .:. :.
CCDS38 CRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKDLEIL
          60        70        80        90       100       110     

        120       130       140       150       160       170      
pF1KE0 CEACSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQ
       :  :: : .:. : . :.. .:  ..  :. .:: :... :.. :. . . ....  : .
CCDS38 CTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVELKKK
         120       130       140       150       160       170     

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE0 VETRKQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKLELNHSELIQ
       :: ... :  :::. . .:...:             : ..: :  . . ::. :  :: .
CCDS38 VEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQE----------MILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSD
         180       190                 200       210       220     

        240       250       260       270       280       290      
pF1KE0 QSQVLWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKTDCRVL----
         ..: ... :.. .: .    .: . . .  . :  .:. :: .:..:      :    
CCDS38 YVSTLKHLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSM--HHKYQNLKCPELFSFRLTKYGFSLPPQY
         230       240       250         260       270       280   

             300       310       320       330       340       350 
pF1KE0 -GLREILKTYAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQKLPDNPERFYRYNIVLGSQ
        :: .:.: . .:: :: .::. .:.:::::: :.:   ....  .:.:::    :::::
CCDS38 SGLDRIIKPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRYERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQ
           290       300       310       320       330       340   

             360       370       380       390        400       410
pF1KE0 CISSGRHYWEVEVGDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVI-RLRKGNEYRAGTDE
        .::::::::::::.. .: ::::.. . :.     :   :::.: :  :..   .:   
CCDS38 RFSSGRHYWEVEVGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKT
           350       360       370       380       390       400   

              420       430       440       450       460       470
pF1KE0 YPILSLPVPPRRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPYFSPCYSIGT
         .: . : : ..:::.:::  :.::::..:  : ..::    :   . :::   :. ::
CCDS38 TQLLPV-VKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMND-RSILYTFNDC-FTEAVWPYF---YT-GT
            410       420       430        440        450          

              480      
pF1KE0 NNTAPLAICSL-DGED
       . . :: :::. :.: 
CCDS38 D-SEPLKICSVSDSER
         460       470 

>>CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1              (477 aa)
 initn: 978 init1: 270 opt: 847  Z-score: 665.7  bits: 132.6 E(32554): 9.3e-31
Smith-Waterman score: 1023; 36.6% identity (65.4% similar) in 494 aa overlap (1-481:1-471)

               10        20        30        40            50      
pF1KE0 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIP----GESQNWG-Y
       :. . :.. . ::..: ::. .. .:.   :::.::..:..  ::      :. .  : .
CCDS15 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF
               10        20        30        40        50        60

          60        70        80        90       100       110     
pF1KE0 TCPLCRAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLKGDLCERHGEKLKMFCKEDVLI
        :: ::     ::: ::  :..:.:   . . :::.  : :::..: : ::.::..:   
CCDS15 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAE---MAQQHPGLQ-KQDLCQEHHEPLKLFCQKDQSP
               70        80           90        100       110      

         120       130       140       150       160       170     
pF1KE0 MCEACSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKI
       .: .: .: ::. : :.: :...  :: .:.: .:.:...  .. .:.. :..  : :. 
CCDS15 ICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQG
        120       130       140       150       160       170      

         180       190        200       210       220       230    
pF1KE0 QVETRKQSIVWEFEKYQ-RLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKLELNHSEL
       .:. :.. :: ::::..  :.:..:   : : :        :. :  :: ..:. . . :
CCDS15 KVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQ---RLLQA--------LETEEEETASRLRESVACL
        180       190       200                  210       220     

          240       250        260       270         280       290 
pF1KE0 IQQSQVLWRMIAELKERS-QRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPE--PISLELKTDCRV
        .:.. :  .. .:.::: : :.. ::::..: :.:... :.: ::  : . . .: :::
CCDS15 DRQGHSLELLLLQLEERSTQGPLQ-MLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPT-RPRTVCRV
         230       240        250       260       270        280   

             300       310       320       330        340       350
pF1KE0 LGLREILKTYAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQKLP-DNPERFYRYNIVLGS
        :  :.:. .  ::  :  .::  :.. :.:.: . :.. .     . .::  :  ..:.
CCDS15 PGQIEVLRGFLEDVVPDATSAYPYLLLYESRQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQ
           290       300       310       320       330       340   

              360          370       380       390       400       
pF1KE0 QCISSGRHYWEVEV---GDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVIRLRKGNEYRAG
         .::::::::: .   :: . :.::::..::.::. :   :. ::::..: ::..: . 
CCDS15 TAFSSGRHYWEVGMNITGD-ALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLST
           350       360        370       380       390       400  

       410       420       430       440       450       460       
pF1KE0 TDEYPILSLPVPPRRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPYFSPCYS
        .    . :  :: ..:::.:.:: ..:::.:.: :::. :. .  ::: : :.:  :  
CCDS15 FSALTPVMLMEPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSD-GSHLHTYSQATFPGPLQPFF--C--
            410       420       430        440       450           

       470       480       
pF1KE0 IGTNNTAPLAICSLDGED  
       .:. ... ..: ..      
CCDS15 LGAPKSGQMVISTVTMWVKG
       460       470       

>>CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1             (468 aa)
 initn: 1173 init1: 572 opt: 844  Z-score: 663.5  bits: 132.1 E(32554): 1.2e-30
Smith-Waterman score: 1283; 42.7% identity (66.5% similar) in 483 aa overlap (1-483:1-459)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIPGESQNWGYTCPLC
       :    :   . ::..: ::. .. .:.  ::::.::. :.   :  :    .  :.:: :
CCDS31 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQP----EGPYACPEC
               10        20        30        40            50      

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 RAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLKGDLCERHGEKLKMFCKEDVLIMCEAC
       :     ::::::  ::...: .:  ::::   .   .:  : : :  :: ... ..: ::
CCDS31 RELSPQRNLRPNRPLAKMAEMAR--RLHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAAC
         60        70          80        90       100       110    

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 SQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQVETR
        .: :: :: : :..:.: . : .:...::::.:....:  ...   .  . :. .::..
CCDS31 ERSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQ
          120       130       140       150       160       170    

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 KQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKLELNHSELIQQSQV
       .:... :::. .::: ...   .::       :  :..:  :.. .:. . ..: :::  
CCDS31 RQNVLGEFERLRRLLAEEE---QQL-------LQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAH
          180       190                 200       210       220    

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 LWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKTDCRVLGLREILKT
       : ..::::. : : :.  .::::...: : .. .:: :: . .::.: ::: :: : :. 
CCDS31 LAELIAELEGRCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRR
          230       240       250       260       270       280    

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 YAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQKLPDNPERFYRYNIVLGSQCISSGRHYW
       . .:: ::::::  .::.::::. :. ::  : :::.::::     :::.. ..::::::
CCDS31 FRGDVTLDPDTANPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYW
          290       300       310       320       330       340    

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 EVEVGDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVIRLRKGNEYRAGTDEYPILSLPVPP
       :::::::. :.::::..::.:::   ::   :::.. .  :. :  ...:  .  :  ::
CCDS31 EVEVGDRTSWALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVFL-GSYY--NSSERALAPLRDPP
          350       360       370       380          390       400 

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 RRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPYFSPCYSIGTNNTAPLAICS
       ::::::.::::  .:::..:: :: .: ::. :: : : : :::  :    . .:..:: 
CCDS31 RRVGIFLDYEAGHLSFYSATD-GSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSS----SPTPMTICR
             410       420        430       440           450      

                   
pF1KE0 LDGED       
         :         
CCDS31 PKGGSGDTLAPQ
        460        

>>CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11             (475 aa)
 initn: 1300 init1: 777 opt: 830  Z-score: 652.7  bits: 130.2 E(32554): 4.9e-30
Smith-Waterman score: 1305; 42.9% identity (69.5% similar) in 482 aa overlap (1-482:1-466)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIPGESQNWGYTCPLC
       :  .: .  . :::.::::.  . ::.::.::::::. :.: .      ... : .::.:
CCDS44 MASAARLTMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQECISQV------GKGGGSVCPVC
               10        20        30        40              50    

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 RAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLKGDLCERHGEKLKMFCKEDVLIMCEAC
       :     .::::: ::::.:.... .  .   : .:. :  :::.:..::..:   .: .:
CCDS44 RQRFLLKNLRPNRQLANMVNNLKEISQEAREGTQGERCAVHGERLHLFCEKDGKALCWVC
           60        70        80        90       100       110    

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 SQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQVETR
       .:: .:. :..::.:..: ::. .:. :: .:...:: : ::::    . : ::  :::.
CCDS44 AQSRKHRDHAMVPLEEAAQEYQEKLQVALGELRRKQELAEKLEVEIAIKRADWKKTVETQ
          120       130       140       150       160       170    

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 KQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKLELNHSELIQQSQV
       :. :  :: . . .: ...  .:::          :...  : .. :  ....: ::::.
CCDS44 KSRIHAEFVQQKNFLVEEE--QRQL--------QELEKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQA
          180       190                 200       210       220    

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 LWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKTDCRVLGLREILKT
       : ..:.:: .: .  .  .::..  ::.::.::.:.. .  : ::.. :.: ::...:.:
CCDS44 LQELISELDRRCHSSALELLQEVIIVLERSESWNLKDLDITSPELRSVCHVPGLKKMLRT
          230       240       250       260       270       280    

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 YAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQKLPDNPERFYRYNIVLGSQCISSGRHYW
        :. . ::::::   ::.::::..:. :::.:..: : :::  : .:::.: . ::.:::
CCDS44 CAVHITLDPDTANPWLILSEDRRQVRLGDTQQSIPGNEERFDSYPMVLGAQHFHSGKHYW
          290       300       310       320       330       340    

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 EVEVGDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVIRLRKGNEYRAGTDEYPILSLPVPP
       ::.:  .  : ::::...: ::    :: . :::.: : . ..:.:::     : : :::
CCDS44 EVDVTGKEAWDLGVCRDSVRRKGHFLLSSKSGFWTIWLWNKQKYEAGTYPQTPLHLQVPP
          350       360       370       380       390       400    

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 RRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPYFSPCYSIGTNNTAPLAICS
        .::::.::::  .::::.:: :: :..: .  : : : :.::: .. : .:::::..: 
CCDS44 CQVGIFLDYEAGMVSFYNITDHGSLIYSFSECAFTGPLRPFFSPGFNDGGKNTAPLTLCP
          410       420       430       440       450       460    

                  
pF1KE0 LDGED      
       :.         
CCDS44 LNIGSQGSTDY
          470     

>>CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6             (481 aa)
 initn: 918 init1: 358 opt: 808  Z-score: 635.8  bits: 127.1 E(32554): 4.3e-29
Smith-Waterman score: 978; 34.2% identity (65.2% similar) in 485 aa overlap (1-462:1-468)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIPGESQNWGYTCPLC
       :  .: : ....:: ::::.  ::::..:::::.::..::.   :::: . . . :::::
CCDS34 MASAASVTSLADEVNCPICQGTLREPVTIDCGHNFCRACLTRYCEIPGPDLEESPTCPLC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90        100       110         
pF1KE0 RAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGL-KGDLCERHGEKLKMFCKEDVLIMCEA
       . : .: ..:::::::::::... :.:   .:: . :.:..::::. .::..: . .: .
CCDS34 KEPFRPGSFRPNWQLANVVENIERLQLVSTLGLGEEDVCQEHGEKIYFFCEDDEMQLCVV
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 CSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQVET
       : .. :: .:..  .::.:  :. ..:. :. :.::.::  ...  : ::  .   :: :
CCDS34 CREAGEHATHTMRFLEDAAAPYREQIHKCLKCLRKEREEIQEIQSRENKRMQVLLTQVST
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE0 RKQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKLELNHSELIQQSQ
       ..:... :: . ...::..:          .  ::.:. . .. ...   .. .:.  ..
CCDS34 KRQQVISEFAHLRKFLEEQQ----------SILLAQLESQDGDILRQR--DEFDLLVAGE
              190       200                 210         220        

     240         250       260       270       280       290       
pF1KE0 V--LWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKTDCR-----VL
       .  .  .: ::.:...::.: .: ::. .: : .. . ..:  .: ::    :     .:
CCDS34 ICRFSALIEELEEKNERPARELLTDIRSTLIRCETRKCRKPVAVSPELGQRIRDFPQQAL
      230       240       250       260       270       280        

            300                  310       320       330       340 
pF1KE0 GLREILKTY-----------AADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQKLPDNPERF
        :.. .: .            : . :::.:.. .:..:::..:....   :. ::::.::
CCDS34 PLQREMKMFLEKLCFELDYEPAHISLDPQTSHPKLLLSEDHQRAQFSYKWQNSPDNPQRF
      290       300       310       320       330       340        

             350       360       370          380       390        
pF1KE0 YRYNIVLGSQCISSGRHYWEVEVGDRSEWG---LGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVIRL
        : . ::.   :..::: : : . : .. :   .:: ...:.::  . : :. : :..::
CCDS34 DRATCVLAHTGITGGRHTWVVSI-DLAHGGSCTVGVVSEDVQRKGELRLRPEEGVWAVRL
      350       360       370        380       390       400       

      400       410        420       430       440       450       
pF1KE0 RKGNEYRAGTDEYPI-LSLPVPPRRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGR
         :  . ..   .:  :.:   ::.: . .:::.  ..: :..     :.::    :  .
CCDS34 AWG--FVSALGSFPTRLTLKEQPRQVRVSLDYEVGWVTFTNAVT-REPIYTFTA-SFTRK
       410         420       430       440        450        460   

       460       470       480     
pF1KE0 LLPYFSPCYSIGTNNTAPLAICSLDGED
       ..:.:                       
CCDS34 VIPFFGLWGRGSSFSLSS          
           470       480           

>>CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11            (488 aa)
 initn: 1112 init1: 582 opt: 802  Z-score: 631.1  bits: 126.2 E(32554): 7.8e-29
Smith-Waterman score: 1202; 38.8% identity (68.7% similar) in 492 aa overlap (1-468:1-478)

               10        20        30        40          50        
pF1KE0 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLS--GLWEIPGESQNWGYTCP
       :   .::. : :::.::::. .: ::.:::::::::..:..  :   . :  :.   .::
CCDS31 MTSPVLVD-IREEVTCPICLELLTEPLSIDCGHSFCQACITPNGRESVIG--QEGERSCP
                10        20        30        40          50       

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE0 LCRAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLKGDLCERHGEKLKMFCKEDVLIMCE
       .:..  :: ::::: .:::.:...: . : ::  ::. ::  :::::..::.::  ..: 
CCDS31 VCQTSYQPGNLRPNRHLANIVRRLREVVLGPGKQLKAVLCADHGEKLQLFCQEDGKVICW
        60        70        80        90       100       110       

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE0 ACSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQVE
        : .: ::..: .  .:.:: ::. ...:.:..::.:..:: :: .  :.. ..:: :.:
CCDS31 LCERSQEHRGHHTFLVEEVAQEYQEKFQESLKKLKNEEQEAEKLTAFIREKKTSWKNQME
       120       130       140       150       160       170       

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE0 TRKQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKLELNHSELIQQS
        ..  :  ::.. . .:.. .  .:.:         .:..:  . .. .:  ...:..:.
CCDS31 PERCRIQTEFNQLRNILDRVE--QREL--------KKLEQEEKKGLRIIEEAENDLVHQT
       180       190         200               210       220       

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE0 QVLWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKTDCRVLGLREIL
       : : ..:..:..: :  .  .:::...: .::. :.:..:: .  .:..  :.  :...:
CCDS31 QSLRELISDLERRCQGSTMELLQDVSDVTERSEFWTLRKPEALPTKLRSMFRAPDLKRML
       230       240       250       260       270       280       

               300       310       320       330       340         
pF1KE0 K---------TYAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQKLPDNPERFYRYNIVLG
       .         .: .:: :.: ::   :.....:..:..  .. . :.  :. :  . :::
CCDS31 RVCRELTDVQSYWVDVTLNPHTANLNLVLAKNRRQVRFVGAKVSGPSCLEKHYDCS-VLG
       290       300       310       320       330       340       

     350       360       370                  380       390        
pF1KE0 SQCISSGRHYWEVEVGDRSEWGLGVCKQNV-----------DRKEVVYLSPHYGFWVIRL
       :: .:::.:::::.:. .. : ::::....           ...     .:. :.::: :
CCDS31 SQHFSSGKHYWEVDVAKKTAWILGVCSNSLGPTFSFNHFAQNHSAYSRYQPQSGYWVIGL
        350       360       370       380       390       400      

      400       410         420       430       440       450      
pF1KE0 RKGNEYRAGTDEYP--ILSLPVPPRRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPG
       ....::::  :  :  .::. :::::::.:.::::  .::::::. :  :.:: .: :: 
CCDS31 QHNHEYRAYEDSSPSLLLSMTVPPRRVGVFLDYEAGTVSFYNVTNHGFPIYTFSKYYFPT
        410       420       430       440       450       460      

        460       470       480     
pF1KE0 RLLPYFSPCYSIGTNNTAPLAICSLDGED
        : :::.::  .                 
CCDS31 TLCPYFNPCNCVIPMTLRRPSS       
        470       480               

>>CCDS31389.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11            (516 aa)
 initn: 1112 init1: 582 opt: 802  Z-score: 630.8  bits: 126.2 E(32554): 8.1e-29
Smith-Waterman score: 1202; 38.8% identity (68.7% similar) in 492 aa overlap (1-468:29-506)

                                           10        20        30  
pF1KE0                             MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCG
                                   :   .::. : :::.::::. .: ::.:::::
CCDS31 MCGSERILQAGNILEIRVGQAGARRVATMTSPVLVD-IREEVTCPICLELLTEPLSIDCG
               10        20        30         40        50         

             40          50        60        70        80        90
pF1KE0 HSFCHSCLS--GLWEIPGESQNWGYTCPLCRAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPG
       ::::..:..  :   . :  :.   .::.:..  :: ::::: .:::.:...: . : ::
CCDS31 HSFCQACITPNGRESVIG--QEGERSCPVCQTSYQPGNLRPNRHLANIVRRLREVVLGPG
      60        70          80        90       100       110       

              100       110       120       130       140       150
pF1KE0 MGLKGDLCERHGEKLKMFCKEDVLIMCEACSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALE
         ::. ::  :::::..::.::  ..:  : .: ::..: .  .:.:: ::. ...:.:.
CCDS31 KQLKAVLCADHGEKLQLFCQEDGKVICWLCERSQEHRGHHTFLVEEVAQEYQEKFQESLK
       120       130       140       150       160       170       

              160       170       180       190       200       210
pF1KE0 HLKKEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQVETRKQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVA
       .::.:..:: :: .  :.. ..:: :.: ..  :  ::.. . .:.. .  .:.:     
CCDS31 KLKNEEQEAEKLTAFIREKKTSWKNQMEPERCRIQTEFNQLRNILDRVE--QREL-----
       180       190       200       210       220         230     

              220       230       240       250       260       270
pF1KE0 AALASLQREAAETMQKLELNHSELIQQSQVLWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRS
           .:..:  . .. .:  ...:..:.: : ..:..:..: :  .  .:::...: .::
CCDS31 ---KKLEQEEKKGLRIIEEAENDLVHQTQSLRELISDLERRCQGSTMELLQDVSDVTERS
                 240       250       260       270       280       

              280       290                300       310       320 
pF1KE0 KSWSLQQPEPISLELKTDCRVLGLREILK---------TYAADVRLDPDTAYSRLIVSED
       . :.:..:: .  .:..  :.  :...:.         .: .:: :.: ::   :.....
CCDS31 EFWTLRKPEALPTKLRSMFRAPDLKRMLRVCRELTDVQSYWVDVTLNPHTANLNLVLAKN
       290       300       310       320       330       340       

             330       340       350       360       370           
pF1KE0 RKRVHYGDTNQKLPDNPERFYRYNIVLGSQCISSGRHYWEVEVGDRSEWGLGVCKQNV--
       :..:..  .. . :.  :. :  . ::::: .:::.:::::.:. .. : ::::....  
CCDS31 RRQVRFVGAKVSGPSCLEKHYDCS-VLGSQHFSSGKHYWEVDVAKKTAWILGVCSNSLGP
       350       360       370        380       390       400      

              380       390       400       410         420        
pF1KE0 ---------DRKEVVYLSPHYGFWVIRLRKGNEYRAGTDEYP--ILSLPVPPRRVGIFVD
                ...     .:. :.::: :....::::  :  :  .::. :::::::.:.:
CCDS31 TFSFNHFAQNHSAYSRYQPQSGYWVIGLQHNHEYRAYEDSSPSLLLSMTVPPRRVGVFLD
        410       420       430       440       450       460      

      430       440       450       460       470       480     
pF1KE0 YEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPYFSPCYSIGTNNTAPLAICSLDGED
       :::  .::::::. :  :.:: .: ::  : :::.::  .                 
CCDS31 YEAGTVSFYNVTNHGFPIYTFSKYYFPTTLCPYFNPCNCVIPMTLRRPSS       
        470       480       490       500       510             

>>CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6              (465 aa)
 initn: 1024 init1: 391 opt: 790  Z-score: 622.2  bits: 124.5 E(32554): 2.4e-28
Smith-Waterman score: 1023; 35.3% identity (67.3% similar) in 468 aa overlap (1-462:1-450)

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