seq1 = pF1KE1011.tfa, 684 bp seq2 = pF1KE1011/gi568815595r_72278388.tfa (gi568815595r:72278388_72546623), 268236 bp >pF1KE1011 684 >gi568815595r:72278388_72546623 (Chr3) (complement) 27-158 (99999-100128) 98% -> 159-335 (167197-167373) 100% -> 336-434 (167486-167584) 100% -> 435-684 (167987-168236) 100% 0 . : . : . : . : . : 27 GACCAGGCCAAAAAGACAAGCGAAACCTGCCGCAGACGAAGGGTTTTGGG ||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 99999 GA AGGCCAAAAAGACAAGCGAAACCTGCCGCAGACGAAGGGTTTTGGG 50 . : . : . : . : . : 77 ATTGTAGCGTCTGCACCTTCAGAAACAGTGCTGAAGCCTTTAAATGCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100047 ATTGTAGCGTCTGCACCTTCAGAAACAGTGCTGAAGCCTTTAAATGCAGC 100 . : . : . : . : . : 127 ATCTGCGATGTGAGGAAAGGCACCTCCACCAG AAAACCTCG ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| 100097 ATCTGCGATGTGAGGAAAGGCACCTCCACCAGGTA...CAGAAAACCTCG 150 . : . : . : . : . : 168 GATCAATTCTCAGCTGGTGGCACAACAAGTGGCACAACAGTATGCCACCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 167206 GATCAATTCTCAGCTGGTGGCACAACAAGTGGCACAACAGTATGCCACCC 200 . : . : . : . : . : 218 CACCACCCCCTAAAAAGGAGAAGAAGGAGAAAGTTGAAAAGCAGGACAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 167256 CACCACCCCCTAAAAAGGAGAAGAAGGAGAAAGTTGAAAAGCAGGACAAA 250 . : . : . : . : . : 268 GAGAAACCTGAGAAAGACAAGGAAATTAGTCCTAGTGTTACCAAGAAAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 167306 GAGAAACCTGAGAAAGACAAGGAAATTAGTCCTAGTGTTACCAAGAAAAA 300 . : . : . : . : . : 318 TACCAACAAGAAAACCAA ACCAAAGTCTGACATTCTGAAAG ||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||| 167356 TACCAACAAGAAAACCAAGTA...TAGACCAAAGTCTGACATTCTGAAAG 350 . : . : . : . : . : 359 ATCCTCCTAGTGAAGCAAACAGCATACAGTCTGCAAATGCTACAACAAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 167509 ATCCTCCTAGTGAAGCAAACAGCATACAGTCTGCAAATGCTACAACAAAG 400 . : . : . : . : . : 409 ACCAGCGAAACAAATCACACCTCAAG GCCCCGGCTGAAAAA ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 167559 ACCAGCGAAACAAATCACACCTCAAGGTA...TAGGCCCCGGCTGAAAAA 450 . : . : . : . : . : 450 CGTGGACAGGAGCACTGCACAGCAGTTGGCAGTAACTGTGGGCAACGTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 168002 CGTGGACAGGAGCACTGCACAGCAGTTGGCAGTAACTGTGGGCAACGTCA 500 . : . : . : . : . : 500 CCGTCATTATCACAGACTTTAAGGAAAAGACTCGCTCCTCATCGACATCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 168052 CCGTCATTATCACAGACTTTAAGGAAAAGACTCGCTCCTCATCGACATCC 550 . : . : . : . : . : 550 TCATCCACAGTGACCTCCAGTGCAGGGTCAGAACAGCAGAACCAGAGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 168102 TCATCCACAGTGACCTCCAGTGCAGGGTCAGAACAGCAGAACCAGAGCAG 600 . : . : . : . : . : 600 CTCGGGGTCAGAGAGCACAGACAAGGGCTCCTCCCGTTCCTCCACGCCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 168152 CTCGGGGTCAGAGAGCACAGACAAGGGCTCCTCCCGTTCCTCCACGCCAA 650 . : . : . : . 650 AGGGCGACATGTCAGCAGTCAATGATGAATCTTTC ||||||||||||||||||||||||||||||||||| 168202 AGGGCGACATGTCAGCAGTCAATGATGAATCTTTC