Result of FASTA (ccds) for pF1KB9975
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9975, 531 aa
  1>>>pF1KB9975 531 - 531 aa - 531 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7916+/-0.00108; mu= 18.1413+/- 0.066
 mean_var=115.8058+/-24.229, 0's: 0 Z-trim(106.0): 53  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.119182
 statistics sampled from 8704 (8742) to 8704 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.269), width:  16
 Scan time:  2.220

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS32859.1 PTBP1 gene_id:5725|Hs108|chr19         ( 531) 3427 600.7 1.3e-171
CCDS72830.1 PTBP2 gene_id:58155|Hs108|chr1         ( 532) 2615 461.1 1.4e-129
CCDS754.1 PTBP2 gene_id:58155|Hs108|chr1           ( 531) 2600 458.5 8.6e-129
CCDS42456.1 PTBP1 gene_id:5725|Hs108|chr19         ( 557) 1941 345.2 1.1e-94
CCDS45892.1 PTBP1 gene_id:5725|Hs108|chr19         ( 550) 1931 343.5 3.7e-94
CCDS72828.1 PTBP2 gene_id:58155|Hs108|chr1         ( 537) 1916 340.9 2.2e-93
CCDS72829.1 PTBP2 gene_id:58155|Hs108|chr1         ( 536) 1901 338.3 1.3e-92
CCDS59140.1 PTBP3 gene_id:9991|Hs108|chr9          ( 457) 1203 218.2 1.6e-56
CCDS55332.1 PTBP3 gene_id:9991|Hs108|chr9          ( 524) 1203 218.3 1.7e-56
CCDS6784.1 PTBP3 gene_id:9991|Hs108|chr9           ( 552) 1203 218.3 1.8e-56
CCDS55333.1 PTBP3 gene_id:9991|Hs108|chr9          ( 555) 1203 218.3 1.8e-56
CCDS59141.1 PTBP3 gene_id:9991|Hs108|chr9          ( 558) 1203 218.3 1.8e-56


>>CCDS32859.1 PTBP1 gene_id:5725|Hs108|chr19              (531 aa)
 initn: 3427 init1: 3427 opt: 3427  Z-score: 3194.2  bits: 600.7 E(32554): 1.3e-171
Smith-Waterman score: 3427; 100.0% identity (100.0% similar) in 531 aa overlap (1-531:1-531)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MDGIVPDIAVGTKRGSDELFSTCVTNGPFIMSSNSASAANGNDSKKFKGDSRSAGVPSRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MDGIVPDIAVGTKRGSDELFSTCVTNGPFIMSSNSASAANGNDSKKFKGDSRSAGVPSRV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 IHIRKLPIDVTEGEVISLGLPFGKVTNLLMLKGKNQAFIEMNTEEAANTMVNYYTSVTPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IHIRKLPIDVTEGEVISLGLPFGKVTNLLMLKGKNQAFIEMNTEEAANTMVNYYTSVTPV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 LRGQPIYIQFSNHKELKTDSSPNQARAQAALQAVNSVQSGNLALAASAAAVDAGMAMAGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LRGQPIYIQFSNHKELKTDSSPNQARAQAALQAVNSVQSGNLALAASAAAVDAGMAMAGQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 SPVLRIIVENLFYPVTLDVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVSAQHAKLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SPVLRIIVENLFYPVTLDVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVSAQHAKLS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 LDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDSQPSLDQTMAAAFGLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDSQPSLDQTMAAAFGLS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 VPNVHGALAPLAIPSAAAAAAAAGRIAIPGLAGAGNSVLLVSNLNPERVTPQSLFILFGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VPNVHGALAPLAIPSAAAAAAAAGRIAIPGLAGAGNSVLLVSNLNPERVTPQSLFILFGV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 YGDVQRVKILFNKKENALVQMADGNQAQLAMSHLNGHKLHGKPIRITLSKHQNVQLPREG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YGDVQRVKILFNKKENALVQMADGNQAQLAMSHLNGHKLHGKPIRITLSKHQNVQLPREG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 QEDQGLTKDYGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVSEEDLKVLFSSNGGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QEDQGLTKDYGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVSEEDLKVLFSSNGGV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530 
pF1KB9 VKGFKFFQKDRKMALIQMGSVEEAVQALIDLHNHDLGENHHLRVSFSKSTI
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VKGFKFFQKDRKMALIQMGSVEEAVQALIDLHNHDLGENHHLRVSFSKSTI
              490       500       510       520       530 

>>CCDS72830.1 PTBP2 gene_id:58155|Hs108|chr1              (532 aa)
 initn: 1888 init1: 1190 opt: 2615  Z-score: 2439.6  bits: 461.1 E(32554): 1.4e-129
Smith-Waterman score: 2615; 75.0% identity (92.3% similar) in 535 aa overlap (1-531:1-532)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MDGIVPDIAVGTKRGSDELFSTCVTNGPFIMSSNSASAANGNDSKKFKGDSRSAGVPSRV
       ::::: ..:::.:::::::.:  : ..:    :. . .:::::::::::...  :.::::
CCDS72 MDGIVTEVAVGVKRGSDELLSGSVLSSPNSNMSSMVVTANGNDSKKFKGEDKMDGAPSRV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 IHIRKLPIDVTEGEVISLGLPFGKVTNLLMLKGKNQAFIEMNTEEAANTMVNYYTSVTPV
       .:::::: .::: :::.::::::::::.::::::::::.:. ::::: ::::::..::: 
CCDS72 LHIRKLPGEVTETEVIALGLPFGKVTNILMLKGKNQAFLELATEEAAITMVNYYSAVTPH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 LRGQPIYIQFSNHKELKTDSSPNQARAQAALQAVNSVQSGNLALAASAAAVDAGMAMAGQ
       ::.::::::.:::::::::.. :: ::::.::::..::..:  :  :...:. . .  .:
CCDS72 LRNQPIYIQYSNHKELKTDNTLNQ-RAQAVLQAVTAVQTANTPL--SGTTVSESAVTPAQ
              130       140        150       160         170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 SPVLRIIVENLFYPVTLDVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVSAQHAKLS
       :::::::..:..::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:::.::.:::.
CCDS72 SPVLRIIIDNMYYPVTLDVLHQIFSKFGAVLKIITFTKNNQFQALLQYGDPVNAQQAKLA
       180       190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290          
pF1KB9 LDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDSQPSLDQTMAAAFG--
       ::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::.::.:: ..::::.  
CCDS72 LDGQNIYNACCTLRIDFSKLVNLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDGQPALDPAIAAAFAKE
       240       250       260       270       280       290       

      300       310       320         330       340       350      
pF1KB9 LSVPNVHGALAPLAIPSAAAAAAAA--GRIAIPGLAGAGNSVLLVSNLNPERVTPQSLFI
        :.  : :::.:::::.::::::::  ::...::....::.:::::::: : ::::::: 
CCDS72 TSLLAVPGALSPLAIPNAAAAAAAAAAGRVGMPGVSAGGNTVLLVSNLNEEMVTPQSLFT
       300       310       320       330       340       350       

        360       370       380       390       400       410      
pF1KB9 LFGVYGDVQRVKILFNKKENALVQMADGNQAQLAMSHLNGHKLHGKPIRITLSKHQNVQL
       ::::::::::::::.:::..::.:::::::.::::.::::.:..:: ::.::::::.:::
CCDS72 LFGVYGDVQRVKILYNKKDSALIQMADGNQSQLAMNHLNGQKMYGKIIRVTLSKHQTVQL
       360       370       380       390       400       410       

        420       430       440       450       460       470      
pF1KB9 PREGQEDQGLTKDYGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVSEEDLKVLFSS
       :::: .:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::..::..
CCDS72 PREGLDDQGLTKDFGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVAEEDLRTLFAN
       420       430       440       450       460       470       

        480       490       500       510       520       530 
pF1KB9 NGGVVKGFKFFQKDRKMALIQMGSVEEAVQALIDLHNHDLGENHHLRVSFSKSTI
       .::.::.:::::.:.::::.::..::::.::::::::..::::::::::::::::
CCDS72 TGGTVKAFKFFQRDHKMALLQMATVEEAIQALIDLHNYNLGENHHLRVSFSKSTI
       480       490       500       510       520       530  

>>CCDS754.1 PTBP2 gene_id:58155|Hs108|chr1                (531 aa)
 initn: 2424 init1: 954 opt: 2600  Z-score: 2425.7  bits: 458.5 E(32554): 8.6e-129
Smith-Waterman score: 2600; 75.0% identity (92.1% similar) in 535 aa overlap (1-531:1-531)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MDGIVPDIAVGTKRGSDELFSTCVTNGPFIMSSNSASAANGNDSKKFKGDSRSAGVPSRV
       ::::: ..:::.:::::::.:  : ..:    :. . .:::::::::::...  :.::::
CCDS75 MDGIVTEVAVGVKRGSDELLSGSVLSSPNSNMSSMVVTANGNDSKKFKGEDKMDGAPSRV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 IHIRKLPIDVTEGEVISLGLPFGKVTNLLMLKGKNQAFIEMNTEEAANTMVNYYTSVTPV
       .:::::: .::: :::.::::::::::.::::::::::.:. ::::: ::::::..::: 
CCDS75 LHIRKLPGEVTETEVIALGLPFGKVTNILMLKGKNQAFLELATEEAAITMVNYYSAVTPH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 LRGQPIYIQFSNHKELKTDSSPNQARAQAALQAVNSVQSGNLALAASAAAVDAGMAMAGQ
       ::.::::::.:::::::::.. :: ::::.::::..::..:  :  :...:. . .  .:
CCDS75 LRNQPIYIQYSNHKELKTDNTLNQ-RAQAVLQAVTAVQTANTPL--SGTTVSESAVTPAQ
              130       140        150       160         170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 SPVLRIIVENLFYPVTLDVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVSAQHAKLS
       :::::::..:..::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:::.::.:::.
CCDS75 SPVLRIIIDNMYYPVTLDVLHQIFSKFGAVLKIITFTKNNQFQALLQYGDPVNAQQAKLA
       180       190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290          
pF1KB9 LDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDSQPSLDQTMAAAFG--
       ::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::.::.:: ..::::.  
CCDS75 LDGQNIYNACCTLRIDFSKLVNLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDGQPALDPAIAAAFAKE
       240       250       260       270       280       290       

      300       310       320         330       340       350      
pF1KB9 LSVPNVHGALAPLAIPSAAAAAAAA--GRIAIPGLAGAGNSVLLVSNLNPERVTPQSLFI
        :.  : :::.:::::.::::::::  ::...::....::.:::::::: : ::::::: 
CCDS75 TSLLAVPGALSPLAIPNAAAAAAAAAAGRVGMPGVSAGGNTVLLVSNLNEEMVTPQSLFT
       300       310       320       330       340       350       

        360       370       380       390       400       410      
pF1KB9 LFGVYGDVQRVKILFNKKENALVQMADGNQAQLAMSHLNGHKLHGKPIRITLSKHQNVQL
       ::::::::::::::.:::..::.:::::::.::::.::::.:..:: ::.::::::.:::
CCDS75 LFGVYGDVQRVKILYNKKDSALIQMADGNQSQLAMNHLNGQKMYGKIIRVTLSKHQTVQL
       360       370       380       390       400       410       

        420       430       440       450       460       470      
pF1KB9 PREGQEDQGLTKDYGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVSEEDLKVLFSS
       :::: .:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::..::..
CCDS75 PREGLDDQGLTKDFGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVAEEDLRTLFAN
       420       430       440       450       460       470       

        480       490       500       510       520       530 
pF1KB9 NGGVVKGFKFFQKDRKMALIQMGSVEEAVQALIDLHNHDLGENHHLRVSFSKSTI
       .::.::.::::: :.::::.::..::::.::::::::..::::::::::::::::
CCDS75 TGGTVKAFKFFQ-DHKMALLQMATVEEAIQALIDLHNYNLGENHHLRVSFSKSTI
       480        490       500       510       520       530 

>>CCDS42456.1 PTBP1 gene_id:5725|Hs108|chr19              (557 aa)
 initn: 1918 init1: 1918 opt: 1941  Z-score: 1813.0  bits: 345.2 E(32554): 1.1e-94
Smith-Waterman score: 3365; 95.3% identity (95.3% similar) in 557 aa overlap (1-531:1-557)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MDGIVPDIAVGTKRGSDELFSTCVTNGPFIMSSNSASAANGNDSKKFKGDSRSAGVPSRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MDGIVPDIAVGTKRGSDELFSTCVTNGPFIMSSNSASAANGNDSKKFKGDSRSAGVPSRV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 IHIRKLPIDVTEGEVISLGLPFGKVTNLLMLKGKNQAFIEMNTEEAANTMVNYYTSVTPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IHIRKLPIDVTEGEVISLGLPFGKVTNLLMLKGKNQAFIEMNTEEAANTMVNYYTSVTPV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 LRGQPIYIQFSNHKELKTDSSPNQARAQAALQAVNSVQSGNLALAASAAAVDAGMAMAGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LRGQPIYIQFSNHKELKTDSSPNQARAQAALQAVNSVQSGNLALAASAAAVDAGMAMAGQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 SPVLRIIVENLFYPVTLDVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVSAQHAKLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SPVLRIIVENLFYPVTLDVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVSAQHAKLS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290          
pF1KB9 LDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDSQPSLDQTMAAAFG--
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::  
CCDS42 LDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDSQPSLDQTMAAAFGAP
              250       260       270       280       290       300

                              300       310       320       330    
pF1KB9 ------------------------LSVPNVHGALAPLAIPSAAAAAAAAGRIAIPGLAGA
                               ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GIISASPYAGAGFPPTFAIPQAAGLSVPNVHGALAPLAIPSAAAAAAAAGRIAIPGLAGA
              310       320       330       340       350       360

          340       350       360       370       380       390    
pF1KB9 GNSVLLVSNLNPERVTPQSLFILFGVYGDVQRVKILFNKKENALVQMADGNQAQLAMSHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GNSVLLVSNLNPERVTPQSLFILFGVYGDVQRVKILFNKKENALVQMADGNQAQLAMSHL
              370       380       390       400       410       420

          400       410       420       430       440       450    
pF1KB9 NGHKLHGKPIRITLSKHQNVQLPREGQEDQGLTKDYGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NGHKLHGKPIRITLSKHQNVQLPREGQEDQGLTKDYGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSA
              430       440       450       460       470       480

          460       470       480       490       500       510    
pF1KB9 TLHLSNIPPSVSEEDLKVLFSSNGGVVKGFKFFQKDRKMALIQMGSVEEAVQALIDLHNH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TLHLSNIPPSVSEEDLKVLFSSNGGVVKGFKFFQKDRKMALIQMGSVEEAVQALIDLHNH
              490       500       510       520       530       540

          520       530 
pF1KB9 DLGENHHLRVSFSKSTI
       :::::::::::::::::
CCDS42 DLGENHHLRVSFSKSTI
              550       

>>CCDS45892.1 PTBP1 gene_id:5725|Hs108|chr19              (550 aa)
 initn: 1902 init1: 1902 opt: 1931  Z-score: 1803.8  bits: 343.5 E(32554): 3.7e-94
Smith-Waterman score: 3379; 96.5% identity (96.5% similar) in 550 aa overlap (1-531:1-550)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MDGIVPDIAVGTKRGSDELFSTCVTNGPFIMSSNSASAANGNDSKKFKGDSRSAGVPSRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MDGIVPDIAVGTKRGSDELFSTCVTNGPFIMSSNSASAANGNDSKKFKGDSRSAGVPSRV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 IHIRKLPIDVTEGEVISLGLPFGKVTNLLMLKGKNQAFIEMNTEEAANTMVNYYTSVTPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IHIRKLPIDVTEGEVISLGLPFGKVTNLLMLKGKNQAFIEMNTEEAANTMVNYYTSVTPV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 LRGQPIYIQFSNHKELKTDSSPNQARAQAALQAVNSVQSGNLALAASAAAVDAGMAMAGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LRGQPIYIQFSNHKELKTDSSPNQARAQAALQAVNSVQSGNLALAASAAAVDAGMAMAGQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 SPVLRIIVENLFYPVTLDVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVSAQHAKLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SPVLRIIVENLFYPVTLDVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVSAQHAKLS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290          
pF1KB9 LDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDSQPSLDQTMAAAF---
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::   
CCDS45 LDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDSQPSLDQTMAAAFASP
              250       260       270       280       290       300

                       300       310       320       330       340 
pF1KB9 ----------------GLSVPNVHGALAPLAIPSAAAAAAAAGRIAIPGLAGAGNSVLLV
                       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YAGAGFPPTFAIPQAAGLSVPNVHGALAPLAIPSAAAAAAAAGRIAIPGLAGAGNSVLLV
              310       320       330       340       350       360

             350       360       370       380       390       400 
pF1KB9 SNLNPERVTPQSLFILFGVYGDVQRVKILFNKKENALVQMADGNQAQLAMSHLNGHKLHG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SNLNPERVTPQSLFILFGVYGDVQRVKILFNKKENALVQMADGNQAQLAMSHLNGHKLHG
              370       380       390       400       410       420

             410       420       430       440       450       460 
pF1KB9 KPIRITLSKHQNVQLPREGQEDQGLTKDYGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KPIRITLSKHQNVQLPREGQEDQGLTKDYGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNI
              430       440       450       460       470       480

             470       480       490       500       510       520 
pF1KB9 PPSVSEEDLKVLFSSNGGVVKGFKFFQKDRKMALIQMGSVEEAVQALIDLHNHDLGENHH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PPSVSEEDLKVLFSSNGGVVKGFKFFQKDRKMALIQMGSVEEAVQALIDLHNHDLGENHH
              490       500       510       520       530       540

             530 
pF1KB9 LRVSFSKSTI
       ::::::::::
CCDS45 LRVSFSKSTI
              550

>>CCDS72828.1 PTBP2 gene_id:58155|Hs108|chr1              (537 aa)
 initn: 2513 init1: 1190 opt: 1916  Z-score: 1790.0  bits: 340.9 E(32554): 2.2e-93
Smith-Waterman score: 2620; 74.6% identity (91.5% similar) in 540 aa overlap (1-531:1-537)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MDGIVPDIAVGTKRGSDELFSTCVTNGPFIMSSNSASAANGNDSKKFKGDSRSAGVPSRV
       ::::: ..:::.:::::::.:  : ..:    :. . .:::::::::::...  :.::::
CCDS72 MDGIVTEVAVGVKRGSDELLSGSVLSSPNSNMSSMVVTANGNDSKKFKGEDKMDGAPSRV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 IHIRKLPIDVTEGEVISLGLPFGKVTNLLMLKGKNQAFIEMNTEEAANTMVNYYTSVTPV
       .:::::: .::: :::.::::::::::.::::::::::.:. ::::: ::::::..::: 
CCDS72 LHIRKLPGEVTETEVIALGLPFGKVTNILMLKGKNQAFLELATEEAAITMVNYYSAVTPH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 LRGQPIYIQFSNHKELKTDSSPNQARAQAALQAVNSVQSGNLALAASAAAVDAGMAMAGQ
       ::.::::::.:::::::::.. :: ::::.::::..::..:  :  :...:. . .  .:
CCDS72 LRNQPIYIQYSNHKELKTDNTLNQ-RAQAVLQAVTAVQTANTPL--SGTTVSESAVTPAQ
              130       140        150       160         170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 SPVLRIIVENLFYPVTLDVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVSAQHAKLS
       :::::::..:..::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:::.::.:::.
CCDS72 SPVLRIIIDNMYYPVTLDVLHQIFSKFGAVLKIITFTKNNQFQALLQYGDPVNAQQAKLA
       180       190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290          
pF1KB9 LDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDSQPSLDQTMAAAF---
       ::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::.::.:: ..::::   
CCDS72 LDGQNIYNACCTLRIDFSKLVNLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDGQPALDPAIAAAFAKE
       240       250       260       270       280       290       

           300       310       320         330       340       350 
pF1KB9 ----GLSVPNVHGALAPLAIPSAAAAAAAA--GRIAIPGLAGAGNSVLLVSNLNPERVTP
           :: :  : :::.:::::.::::::::  ::...::....::.:::::::: : :::
CCDS72 TSLLGLPVAAVPGALSPLAIPNAAAAAAAAAAGRVGMPGVSAGGNTVLLVSNLNEEMVTP
       300       310       320       330       340       350       

             360       370       380       390       400       410 
pF1KB9 QSLFILFGVYGDVQRVKILFNKKENALVQMADGNQAQLAMSHLNGHKLHGKPIRITLSKH
       :::: ::::::::::::::.:::..::.:::::::.::::.::::.:..:: ::.:::::
CCDS72 QSLFTLFGVYGDVQRVKILYNKKDSALIQMADGNQSQLAMNHLNGQKMYGKIIRVTLSKH
       360       370       380       390       400       410       

             420       430       440       450       460       470 
pF1KB9 QNVQLPREGQEDQGLTKDYGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVSEEDLK
       :.::::::: .:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.
CCDS72 QTVQLPREGLDDQGLTKDFGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVAEEDLR
       420       430       440       450       460       470       

             480       490       500       510       520       530 
pF1KB9 VLFSSNGGVVKGFKFFQKDRKMALIQMGSVEEAVQALIDLHNHDLGENHHLRVSFSKSTI
       .::...::.::.:::::.:.::::.::..::::.::::::::..::::::::::::::::
CCDS72 TLFANTGGTVKAFKFFQRDHKMALLQMATVEEAIQALIDLHNYNLGENHHLRVSFSKSTI
       480       490       500       510       520       530       

>>CCDS72829.1 PTBP2 gene_id:58155|Hs108|chr1              (536 aa)
 initn: 2311 init1: 954 opt: 1901  Z-score: 1776.1  bits: 338.3 E(32554): 1.3e-92
Smith-Waterman score: 2605; 74.6% identity (91.3% similar) in 540 aa overlap (1-531:1-536)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MDGIVPDIAVGTKRGSDELFSTCVTNGPFIMSSNSASAANGNDSKKFKGDSRSAGVPSRV
       ::::: ..:::.:::::::.:  : ..:    :. . .:::::::::::...  :.::::
CCDS72 MDGIVTEVAVGVKRGSDELLSGSVLSSPNSNMSSMVVTANGNDSKKFKGEDKMDGAPSRV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 IHIRKLPIDVTEGEVISLGLPFGKVTNLLMLKGKNQAFIEMNTEEAANTMVNYYTSVTPV
       .:::::: .::: :::.::::::::::.::::::::::.:. ::::: ::::::..::: 
CCDS72 LHIRKLPGEVTETEVIALGLPFGKVTNILMLKGKNQAFLELATEEAAITMVNYYSAVTPH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 LRGQPIYIQFSNHKELKTDSSPNQARAQAALQAVNSVQSGNLALAASAAAVDAGMAMAGQ
       ::.::::::.:::::::::.. :: ::::.::::..::..:  :  :...:. . .  .:
CCDS72 LRNQPIYIQYSNHKELKTDNTLNQ-RAQAVLQAVTAVQTANTPL--SGTTVSESAVTPAQ
              130       140        150       160         170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 SPVLRIIVENLFYPVTLDVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVSAQHAKLS
       :::::::..:..::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:::.::.:::.
CCDS72 SPVLRIIIDNMYYPVTLDVLHQIFSKFGAVLKIITFTKNNQFQALLQYGDPVNAQQAKLA
       180       190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290          
pF1KB9 LDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDSQPSLDQTMAAAF---
       ::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::.::.:: ..::::   
CCDS72 LDGQNIYNACCTLRIDFSKLVNLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDGQPALDPAIAAAFAKE
       240       250       260       270       280       290       

           300       310       320         330       340       350 
pF1KB9 ----GLSVPNVHGALAPLAIPSAAAAAAAA--GRIAIPGLAGAGNSVLLVSNLNPERVTP
           :: :  : :::.:::::.::::::::  ::...::....::.:::::::: : :::
CCDS72 TSLLGLPVAAVPGALSPLAIPNAAAAAAAAAAGRVGMPGVSAGGNTVLLVSNLNEEMVTP
       300       310       320       330       340       350       

             360       370       380       390       400       410 
pF1KB9 QSLFILFGVYGDVQRVKILFNKKENALVQMADGNQAQLAMSHLNGHKLHGKPIRITLSKH
       :::: ::::::::::::::.:::..::.:::::::.::::.::::.:..:: ::.:::::
CCDS72 QSLFTLFGVYGDVQRVKILYNKKDSALIQMADGNQSQLAMNHLNGQKMYGKIIRVTLSKH
       360       370       380       390       400       410       

             420       430       440       450       460       470 
pF1KB9 QNVQLPREGQEDQGLTKDYGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVSEEDLK
       :.::::::: .:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.
CCDS72 QTVQLPREGLDDQGLTKDFGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVAEEDLR
       420       430       440       450       460       470       

             480       490       500       510       520       530 
pF1KB9 VLFSSNGGVVKGFKFFQKDRKMALIQMGSVEEAVQALIDLHNHDLGENHHLRVSFSKSTI
       .::...::.::.::::: :.::::.::..::::.::::::::..::::::::::::::::
CCDS72 TLFANTGGTVKAFKFFQ-DHKMALLQMATVEEAIQALIDLHNYNLGENHHLRVSFSKSTI
       480       490        500       510       520       530      

>>CCDS59140.1 PTBP3 gene_id:9991|Hs108|chr9               (457 aa)
 initn: 1812 init1: 1096 opt: 1203  Z-score: 1128.3  bits: 218.2 E(32554): 1.6e-56
Smith-Waterman score: 2177; 74.5% identity (86.6% similar) in 462 aa overlap (97-531:2-457)

         70        80        90       100       110       120      
pF1KB9 PIDVTEGEVISLGLPFGKVTNLLMLKGKNQAFIEMNTEEAANTMVNYYTSVTPVLRGQPI
                                     ::.:: .:::: ::::::: .:: ::.::.
CCDS59                              MAFLEMASEEAAVTMVNYYTPITPHLRSQPV
                                            10        20        30 

        130       140       150       160       170       180      
pF1KB9 YIQFSNHKELKTDSSPNQARAQAALQAVNSVQSGNLALAASAAAVDAGMAMAGQSPVLRI
       :::.:::.:::::. :::::::::::::..::::.:::  :..  . : .. ::::::::
CCDS59 YIQYSNHRELKTDNLPNQARAQAALQAVSAVQSGSLAL--SGGPSNEGTVLPGQSPVLRI
              40        50        60          70        80         

        190       200       210       220       230       240      
pF1KB9 IVENLFYPVTLDVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVSAQHAKLSLDGQNI
       :.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:..::..::::::
CCDS59 IIENLFYPVTLEVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVNAHYAKMALDGQNI
      90       100       110       120       130       140         

        250       260       270       280       290                
pF1KB9 YNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDSQPSLDQTMAAAFG--------
       ::::::::::::::::::::::::::::.:: :::.::.::::.  ::::::        
CCDS59 YNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSLEPPMAAAFGAPGIISSP
     150       160       170       180       190       200         

                        300       310       320       330          
pF1KB9 ------------------LSVPNVHGALAPLAIPSAAAAAAAAGRIAIPGLAGA-GNSVL
                         :::: : :::.::.: :.:..    ::.:::: .:  :::::
CCDS59 YAGAAGFAPAIGFPQATGLSVPAVPGALGPLTITSSAVT----GRMAIPGASGIPGNSVL
     210       220       230       240           250       260     

     340       350       360       370       380       390         
pF1KB9 LVSNLNPERVTPQSLFILFGVYGDVQRVKILFNKKENALVQMADGNQAQLAMSHLNGHKL
       ::.::::. .::..:::::::::::.::::.:::::::::::::.:::::::.::.:..:
CCDS59 LVTNLNPDLITPHGLFILFGVYGDVHRVKIMFNKKENALVQMADANQAQLAMNHLSGQRL
         270       280       290       300       310       320     

     400       410       420       430       440       450         
pF1KB9 HGKPIRITLSKHQNVQLPREGQEDQGLTKDYGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLS
       .:: .: :::::: ::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 YGKVLRATLSKHQAVQLPREGQEDQGLTKDFSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLS
         330       340       350       360       370       380     

     460       470       480       490       500       510         
pF1KB9 NIPPSVSEEDLKVLFSSNGGVVKGFKFFQKDRKMALIQMGSVEEAVQALIDLHNHDLGEN
       ::::::. .::: ::   :  ::.::::::::::::::.::::::.::::.:::::::::
CCDS59 NIPPSVTVDDLKNLFIEAGCSVKAFKFFQKDRKMALIQLGSVEEAIQALIELHNHDLGEN
         390       400       410       420       430       440     

     520       530 
pF1KB9 HHLRVSFSKSTI
       ::::::::::::
CCDS59 HHLRVSFSKSTI
         450       

>>CCDS55332.1 PTBP3 gene_id:9991|Hs108|chr9               (524 aa)
 initn: 1869 init1: 1096 opt: 1203  Z-score: 1127.6  bits: 218.3 E(32554): 1.7e-56
Smith-Waterman score: 2465; 73.8% identity (86.3% similar) in 531 aa overlap (31-531:1-524)

               10        20        30           40        50       
pF1KB9 MDGIVPDIAVGTKRGSDELFSTCVTNGPFIMSSNSASA---ANGNDSKKFKGDSRSAGVP
                                     :.:.. :.   :::::::::: : :    :
CCDS55                               MNSSTPSTGVYANGNDSKKFKRD-RPPCSP
                                             10        20          

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB9 SRVIHIRKLPIDVTEGEVISLGLPFGKVTNLLMLKGKNQAFIEMNTEEAANTMVNYYTSV
       :::.:.::.: ::::.:.:::::::::::::::::::.:::.:: .:::: ::::::: .
CCDS55 SRVLHLRKIPCDVTEAEIISLGLPFGKVTNLLMLKGKSQAFLEMASEEAAVTMVNYYTPI
      30        40        50        60        70        80         

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB9 TPVLRGQPIYIQFSNHKELKTDSSPNQARAQAALQAVNSVQSGNLALAASAAAVDAGMAM
       :: ::.::.:::.:::.:::::. :::::::::::::..::::.:::  :..  . : ..
CCDS55 TPHLRSQPVYIQYSNHRELKTDNLPNQARAQAALQAVSAVQSGSLAL--SGGPSNEGTVL
      90       100       110       120       130         140       

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB9 AGQSPVLRIIVENLFYPVTLDVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVSAQHA
        :::::::::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:..:
CCDS55 PGQSPVLRIIIENLFYPVTLEVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVNAHYA
       150       160       170       180       190       200       

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB9 KLSLDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDSQPSLDQTMAAAF
       :..::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::.::.::::.  :::::
CCDS55 KMALDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSLEPPMAAAF
       210       220       230       240       250       260       

                                 300       310       320       330 
pF1KB9 G--------------------------LSVPNVHGALAPLAIPSAAAAAAAAGRIAIPGL
       :                          :::: : :::.::.: :.:.    .::.:::: 
CCDS55 GAPGIISSPYAGAAGFAPAIGFPQATGLSVPAVPGALGPLTITSSAV----TGRMAIPGA
       270       280       290       300       310           320   

              340       350       360       370       380       390
pF1KB9 AGA-GNSVLLVSNLNPERVTPQSLFILFGVYGDVQRVKILFNKKENALVQMADGNQAQLA
       .:  :::::::.::::. .::..:::::::::::.::::.:::::::::::::.::::::
CCDS55 SGIPGNSVLLVTNLNPDLITPHGLFILFGVYGDVHRVKIMFNKKENALVQMADANQAQLA
           330       340       350       360       370       380   

              400       410       420       430       440       450
pF1KB9 MSHLNGHKLHGKPIRITLSKHQNVQLPREGQEDQGLTKDYGNSPLHRFKKPGSKNFQNIF
       :.::.:..:.:: .: :::::: ::::::::::::::::..:::::::::::::::::::
CCDS55 MNHLSGQRLYGKVLRATLSKHQAVQLPREGQEDQGLTKDFSNSPLHRFKKPGSKNFQNIF
           390       400       410       420       430       440   

              460       470       480       490       500       510
pF1KB9 PPSATLHLSNIPPSVSEEDLKVLFSSNGGVVKGFKFFQKDRKMALIQMGSVEEAVQALID
       :::::::::::::::. .::: ::   :  ::.::::::::::::::.::::::.::::.
CCDS55 PPSATLHLSNIPPSVTVDDLKNLFIEAGCSVKAFKFFQKDRKMALIQLGSVEEAIQALIE
           450       460       470       480       490       500   

              520       530 
pF1KB9 LHNHDLGENHHLRVSFSKSTI
       :::::::::::::::::::::
CCDS55 LHNHDLGENHHLRVSFSKSTI
           510       520    

>>CCDS6784.1 PTBP3 gene_id:9991|Hs108|chr9                (552 aa)
 initn: 1991 init1: 1096 opt: 1203  Z-score: 1127.3  bits: 218.3 E(32554): 1.8e-56
Smith-Waterman score: 2610; 73.7% identity (86.4% similar) in 559 aa overlap (1-531:1-552)

                10        20        30        40        50         
pF1KB9 MDGIVPD-IAVGTKRGSDELFSTCVTNGPFIMSSNSASAANGNDSKKFKGDSRSAGVPSR
       :::.: : :.:: :::::::.:. . :::: :.:.. :.:::::::::: : :    :::
CCDS67 MDGVVTDLITVGLKRGSDELLSSGIINGPFTMNSSTPSTANGNDSKKFKRD-RPPCSPSR
               10        20        30        40        50          

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB9 VIHIRKLPIDVTEGEVISLGLPFGKVTNLLMLKGKNQAFIEMNTEEAANTMVNYYTSVTP
       :.:.::.: ::::.:.:::::::::::::::::::.:::.:: .:::: ::::::: .::
CCDS67 VLHLRKIPCDVTEAEIISLGLPFGKVTNLLMLKGKSQAFLEMASEEAAVTMVNYYTPITP
      60        70        80        90       100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB9 VLRGQPIYIQFSNHKELKTDSSPNQARAQAALQAVNSVQSGNLALAASAAAVDAGMAMAG
        ::.::.:::.:::.:::::. :::::::::::::..::::.:::  :..  . : .. :
CCDS67 HLRSQPVYIQYSNHRELKTDNLPNQARAQAALQAVSAVQSGSLAL--SGGPSNEGTVLPG
     120       130       140       150       160         170       

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB9 QSPVLRIIVENLFYPVTLDVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVSAQHAKL
       ::::::::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:..::.
CCDS67 QSPVLRIIIENLFYPVTLEVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVNAHYAKM
       180       190       200       210       220       230       

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB9 SLDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDSQPSLDQTMAAAFG-
       .::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::.::.::::.  :::::: 
CCDS67 ALDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSLEPPMAAAFGA
       240       250       260       270       280       290       

                               300       310       320       330   
pF1KB9 -------------------------LSVPNVHGALAPLAIPSAAAAAAAAGRIAIPGLAG
                                :::: : :::.::.: :.:.    .::.:::: .:
CCDS67 PGIISSPYAGAAGFAPAIGFPQATGLSVPAVPGALGPLTITSSAV----TGRMAIPGASG
       300       310       320       330       340           350   

            340       350       360       370       380       390  
pF1KB9 A-GNSVLLVSNLNPERVTPQSLFILFGVYGDVQRVKILFNKKENALVQMADGNQAQLAMS
         :::::::.::::. .::..:::::::::::.::::.:::::::::::::.:::::::.
CCDS67 IPGNSVLLVTNLNPDLITPHGLFILFGVYGDVHRVKIMFNKKENALVQMADANQAQLAMN
           360       370       380       390       400       410   

            400       410       420       430       440       450  
pF1KB9 HLNGHKLHGKPIRITLSKHQNVQLPREGQEDQGLTKDYGNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPP
       ::.:..:.:: .: :::::: ::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::
CCDS67 HLSGQRLYGKVLRATLSKHQAVQLPREGQEDQGLTKDFSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPP
           420       430       440       450       460       470   

            460       470       480       490       500       510  
pF1KB9 SATLHLSNIPPSVSEEDLKVLFSSNGGVVKGFKFFQKDRKMALIQMGSVEEAVQALIDLH
       :::::::::::::. .::: ::   :  ::.::::::::::::::.::::::.::::.::
CCDS67 SATLHLSNIPPSVTVDDLKNLFIEAGCSVKAFKFFQKDRKMALIQLGSVEEAIQALIELH
           480       490       500       510       520       530   

            520       530 
pF1KB9 NHDLGENHHLRVSFSKSTI
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CCDS67 NHDLGENHHLRVSFSKSTI
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