Result of FASTA (ccds) for pF1KB7810
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7810, 595 aa
  1>>>pF1KB7810 595 - 595 aa - 595 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8557+/- 0.001; mu= 7.8763+/- 0.060
 mean_var=145.3265+/-28.826, 0's: 0 Z-trim(110.0): 122  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.106390
 statistics sampled from 11146 (11270) to 11146 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.346), width:  16
 Scan time:  3.590

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5234.1 ESR1 gene_id:2099|Hs108|chr6            ( 595) 4030 630.4 1.9e-180
CCDS9762.1 ESR2 gene_id:2100|Hs108|chr14           ( 530) 1013 167.3 4.3e-41
CCDS32096.1 ESR2 gene_id:2100|Hs108|chr14          ( 495)  838 140.5   5e-33
CCDS55920.1 ESR2 gene_id:2100|Hs108|chr14          ( 481)  828 138.9 1.4e-32
CCDS61470.1 ESR2 gene_id:2100|Hs108|chr14          ( 474)  827 138.8 1.5e-32
CCDS3772.1 NR3C2 gene_id:4306|Hs108|chr4           ( 984)  609 105.5 3.4e-22
CCDS61469.1 ESR2 gene_id:2100|Hs108|chr14          ( 439)  601 104.1   4e-22
CCDS5063.1 NR2E1 gene_id:7101|Hs108|chr6           ( 385)  476 84.8 2.2e-16
CCDS69165.1 NR2E1 gene_id:7101|Hs108|chr6          ( 422)  476 84.9 2.3e-16
CCDS60830.1 ESRRA gene_id:2101|Hs108|chr11         ( 422)  451 81.0 3.3e-15
CCDS41667.1 ESRRA gene_id:2101|Hs108|chr11         ( 423)  451 81.0 3.3e-15
CCDS9850.2 ESRRB gene_id:2103|Hs108|chr14          ( 508)  447 80.5 5.9e-15
CCDS58061.1 ESRRG gene_id:2104|Hs108|chr1          ( 470)  446 80.3 6.2e-15
CCDS1517.1 ESRRG gene_id:2104|Hs108|chr1           ( 435)  443 79.8   8e-15
CCDS41468.1 ESRRG gene_id:2104|Hs108|chr1          ( 458)  443 79.8 8.3e-15
CCDS58060.1 ESRRG gene_id:2104|Hs108|chr1          ( 396)  406 74.1 3.8e-13
CCDS44585.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs108|chr11        ( 402)  398 72.9   9e-13
CCDS7929.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs108|chr11         ( 447)  398 72.9 9.8e-13
CCDS73285.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs108|chr11        ( 453)  398 72.9 9.9e-13
CCDS55873.1 NR1H4 gene_id:9971|Hs108|chr12         ( 476)  386 71.1 3.7e-12
CCDS55876.1 NR1H4 gene_id:9971|Hs108|chr12         ( 486)  386 71.1 3.8e-12
CCDS42316.1 THRA gene_id:7067|Hs108|chr17          ( 410)  384 70.7   4e-12
CCDS58546.1 THRA gene_id:7067|Hs108|chr17          ( 451)  384 70.8 4.4e-12
CCDS9078.1 NR1H4 gene_id:9971|Hs108|chr12          ( 472)  384 70.8 4.5e-12
CCDS55875.1 NR1H4 gene_id:9971|Hs108|chr12         ( 482)  384 70.8 4.6e-12
CCDS11360.1 THRA gene_id:7067|Hs108|chr17          ( 490)  384 70.8 4.7e-12
CCDS8818.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs108|chr12          ( 598)  383 70.7 6.2e-12
CCDS55828.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs108|chr12         ( 611)  383 70.7 6.3e-12
CCDS73471.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs108|chr12         ( 652)  383 70.7 6.6e-12
CCDS54627.1 NR1I2 gene_id:8856|Hs108|chr3          ( 397)  376 69.5 9.2e-12
CCDS14387.1 AR gene_id:367|Hs108|chrX              ( 920)  377 69.9 1.7e-11
CCDS35172.1 RXRA gene_id:6256|Hs108|chr9           ( 462)  369 68.5 2.2e-11
CCDS2641.1 THRB gene_id:7068|Hs108|chr3            ( 461)  362 67.4 4.6e-11
CCDS4768.1 RXRB gene_id:6257|Hs108|chr6            ( 533)  362 67.4 5.2e-11
CCDS59007.1 RXRB gene_id:6257|Hs108|chr6           ( 537)  362 67.4 5.3e-11


>>CCDS5234.1 ESR1 gene_id:2099|Hs108|chr6                 (595 aa)
 initn: 4030 init1: 4030 opt: 4030  Z-score: 3353.1  bits: 630.4 E(32554): 1.9e-180
Smith-Waterman score: 4030; 100.0% identity (100.0% similar) in 595 aa overlap (1-595:1-595)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MTMTLHTKASGMALLHQIQGNELEPLNRPQLKIPLERPLGEVYLDSSKPAVYNYPEGAAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 MTMTLHTKASGMALLHQIQGNELEPLNRPQLKIPLERPLGEVYLDSSKPAVYNYPEGAAY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 EFNAAAAANAQVYGQTGLPYGPGSEAAAFGSNGLGGFPPLNSVSPSPLMLLHPPPQLSPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 EFNAAAAANAQVYGQTGLPYGPGSEAAAFGSNGLGGFPPLNSVSPSPLMLLHPPPQLSPF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 LQPHGQQVPYYLENEPSGYTVREAGPPAFYRPNSDNRRQGGRERLASTNDKGSMAMESAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 LQPHGQQVPYYLENEPSGYTVREAGPPAFYRPNSDNRRQGGRERLASTNDKGSMAMESAK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 ETRYCAVCNDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGHNDYMCPATNQCTIDKNRRKSCQAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 ETRYCAVCNDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGHNDYMCPATNQCTIDKNRRKSCQAC
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 RLRKCYEVGMMKGGIRKDRRGGRMLKHKRQRDDGEGRGEVGSAGDMRAANLWPSPLMIKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 RLRKCYEVGMMKGGIRKDRRGGRMLKHKRQRDDGEGRGEVGSAGDMRAANLWPSPLMIKR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 SKKNSLALSLTADQMVSALLDAEPPILYSEYDPTRPFSEASMMGLLTNLADRELVHMINW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 SKKNSLALSLTADQMVSALLDAEPPILYSEYDPTRPFSEASMMGLLTNLADRELVHMINW
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 AKRVPGFVDLTLHDQVHLLECAWLEILMIGLVWRSMEHPGKLLFAPNLLLDRNQGKCVEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 AKRVPGFVDLTLHDQVHLLECAWLEILMIGLVWRSMEHPGKLLFAPNLLLDRNQGKCVEG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 MVEIFDMLLATSSRFRMMNLQGEEFVCLKSIILLNSGVYTFLSSTLKSLEEKDHIHRVLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 MVEIFDMLLATSSRFRMMNLQGEEFVCLKSIILLNSGVYTFLSSTLKSLEEKDHIHRVLD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 KITDTLIHLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSHIRHMSNKGMEHLYSMKCKNVVPLYDLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 KITDTLIHLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSHIRHMSNKGMEHLYSMKCKNVVPLYDLL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590     
pF1KB7 LEMLDAHRLHAPTSRGGASVEETDQSHLATAGSTSSHSLQKYYITGEAEGFPATV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 LEMLDAHRLHAPTSRGGASVEETDQSHLATAGSTSSHSLQKYYITGEAEGFPATV
              550       560       570       580       590     

>>CCDS9762.1 ESR2 gene_id:2100|Hs108|chr14                (530 aa)
 initn: 1276 init1: 641 opt: 1013  Z-score: 851.2  bits: 167.3 E(32554): 4.3e-41
Smith-Waterman score: 1593; 48.2% identity (72.0% similar) in 558 aa overlap (27-578:17-529)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MTMTLHTKASGMALLHQIQGNELEPLNRPQLKIPLERPLGEVYLDSSKPAVYNYPEGAAY
                                 :  :  .:::.  : .:. ::   : .. :  :.
CCDS97           MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEH--GSIYIPSS--YVDSHHEYPAM
                         10        20          30          40      

               70         80        90       100       110         
pF1KB7 EFNAAAAANAQVYGQ-TGLPYGPGSEAAAFGSNGLGGFPPLNSVSPSPLMLLHPPPQLSP
        : . :. : .. .. :.:  ::: .                  . :: .:   : .:::
CCDS97 TFYSPAVMNYSIPSNVTNLEGGPGRQ------------------TTSPNVLWPTPGHLSP
         50        60        70                          80        

     120       130       140       150         160        170      
pF1KB7 FLQPHGQQVPYYLENEPSGYTVREAGPPAFYRP-NSDN-RRQGGRERLAS-TNDKGSMAM
       ..  : :    : : . : .   ::       : : .. .:. . .: :: ..  ::   
CCDS97 LVV-HRQLSHLYAEPQKSPWC--EARSLEHTLPVNRETLKRKVSGNRCASPVTGPGS---
       90        100         110       120       130       140     

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB7 ESAKETRYCAVCNDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGHNDYMCPATNQCTIDKNRRKS
          .....::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS97 --KRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGHNDYICPATNQCTIDKNRRKS
              150       160       170       180       190       200

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB7 CQACRLRKCYEVGMMKGGIRKDRRGGRMLKHKRQRDDGEGRGEVGSAGDMRAANLWPSPL
       ::::::::::::::.: : :..: : :.....:. :.     ..  ::  . ..   .: 
CCDS97 CQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADE-----QLHCAGKAKRSG-GHAPR
              210       220       230            240        250    

        300       310       320        330       340       350     
pF1KB7 MIKRSKKNSLALSLTADQMVSALLDAEPP-ILYSEYDPTRPFSEASMMGLLTNLADRELV
       .     .. :  .:. .:.: .::.:::: .: :.  :. ::.:::::  ::.:::.:::
CCDS97 V-----RELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISR--PSAPFTEASMMMSLTKLADKELV
               260       270       280         290       300       

         360       370       380       390       400       410     
pF1KB7 HMINWAKRVPGFVDLTLHDQVHLLECAWLEILMIGLVWRSMEHPGKLLFAPNLLLDRNQG
       :::.:::..::::.:.: :::.:::  :.:.::.::.:::..:::::.:::.:.:::..:
CCDS97 HMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDLVLDRDEG
       310       320       330       340       350       360       

         420       430       440       450       460       470     
pF1KB7 KCVEGMVEIFDMLLATSSRFRMMNLQGEEFVCLKSIILLNSGVYTFLSSTLKSLEEKDHI
       :::::..:::::::::.:::: ..:: .:..:.:..:::::..: ....:  .   .   
CCDS97 KCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDADSSRKLA
       370       380       390       400       410       420       

         480       490       500       510       520       530     
pF1KB7 HRVLDKITDTLIHLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSHIRHMSNKGMEHLYSMKCKNVVP
       : .:. .::.:. ..::.:.. ::: .:::.::..:::.:: :::::::: .::::::::
CCDS97 H-LLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHASNKGMEHLLNMKCKNVVP
        430       440       450       460       470       480      

         540       550        560       570       580       590    
pF1KB7 LYDLLLEMLDAHRLHA-PTSRGGASVEETDQSHLATAGSTSSHSLQKYYITGEAEGFPAT
       .::::::::.:: :..  .:  :.    ...:. .  :: . .:                
CCDS97 VYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSK-SKEGSQNPQSQ               
        490       500       510        520       530               

        
pF1KB7 V

>>CCDS32096.1 ESR2 gene_id:2100|Hs108|chr14               (495 aa)
 initn: 1276 init1: 641 opt: 838  Z-score: 706.4  bits: 140.5 E(32554): 5e-33
Smith-Waterman score: 1418; 46.6% identity (71.6% similar) in 517 aa overlap (27-535:17-489)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MTMTLHTKASGMALLHQIQGNELEPLNRPQLKIPLERPLGEVYLDSSKPAVYNYPEGAAY
                                 :  :  .:::.  : .:. ::   : .. :  :.
CCDS32           MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEH--GSIYIPSS--YVDSHHEYPAM
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pF1KB7 EFNAAAAANAQVYGQ-TGLPYGPGSEAAAFGSNGLGGFPPLNSVSPSPLMLLHPPPQLSP
        : . :. : .. .. :.:  ::: .                  . :: .:   : .:::
CCDS32 TFYSPAVMNYSIPSNVTNLEGGPGRQ------------------TTSPNVLWPTPGHLSP
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pF1KB7 FLQPHGQQVPYYLENEPSGYTVREAGPPAFYRP-NSDN-RRQGGRERLAS-TNDKGSMAM
       ..  : :    : : . : .   ::       : : .. .:. . .: :: ..  ::   
CCDS32 LVV-HRQLSHLYAEPQKSPWC--EARSLEHTLPVNRETLKRKVSGNRCASPVTGPGS---
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pF1KB7 ESAKETRYCAVCNDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGHNDYMCPATNQCTIDKNRRKS
          .....::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS32 --KRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGHNDYICPATNQCTIDKNRRKS
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pF1KB7 CQACRLRKCYEVGMMKGGIRKDRRGGRMLKHKRQRDDGEGRGEVGSAGDMRAANLWPSPL
       ::::::::::::::.: : :..: : :.....:. :.     ..  ::  . ..   .: 
CCDS32 CQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADE-----QLHCAGKAKRSG-GHAPR
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pF1KB7 MIKRSKKNSLALSLTADQMVSALLDAEPP-ILYSEYDPTRPFSEASMMGLLTNLADRELV
       .     .. :  .:. .:.: .::.:::: .: :.  :. ::.:::::  ::.:::.:::
CCDS32 V-----RELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISR--PSAPFTEASMMMSLTKLADKELV
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pF1KB7 HMINWAKRVPGFVDLTLHDQVHLLECAWLEILMIGLVWRSMEHPGKLLFAPNLLLDRNQG
       :::.:::..::::.:.: :::.:::  :.:.::.::.:::..:::::.:::.:.:::..:
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pF1KB7 KCVEGMVEIFDMLLATSSRFRMMNLQGEEFVCLKSIILLNSGVYTFLSSTLKSLEEKDHI
       :::::..:::::::::.:::: ..:: .:..:.:..:::::..: ....:  .   .   
CCDS32 KCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDADSSRKLA
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pF1KB7 HRVLDKITDTLIHLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSHIRHM-SNKGMEHL--YSMKCKN
       : .:. .::.:. ..::.:.. ::: .:::.::..:::.::  ..:. . :  ..:: ..
CCDS32 H-LLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHARAEKASQTLTSFGMKMET
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pF1KB7 VVPLYDLLLEMLDAHRLHAPTSRGGASVEETDQSHLATAGSTSSHSLQKYYITGEAEGFP
       ..:                                                         
CCDS32 LLPEATMEQ                                                   
        490                                                        

>>CCDS55920.1 ESR2 gene_id:2100|Hs108|chr14               (481 aa)
 initn: 1276 init1: 641 opt: 828  Z-score: 698.3  bits: 138.9 E(32554): 1.4e-32
Smith-Waterman score: 1408; 47.0% identity (71.1% similar) in 508 aa overlap (27-529:17-479)

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pF1KB7 MTMTLHTKASGMALLHQIQGNELEPLNRPQLKIPLERPLGEVYLDSSKPAVYNYPEGAAY
                                 :  :  .:::.  : .:. ::   : .. :  :.
CCDS55           MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEH--GSIYIPSSY--VDSHHEYPAM
                         10        20          30          40      

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pF1KB7 EFNAAAAANAQVYGQ-TGLPYGPGSEAAAFGSNGLGGFPPLNSVSPSPLMLLHPPPQLSP
        : . :. : .. .. :.:  ::: .                  . :: .:   : .:::
CCDS55 TFYSPAVMNYSIPSNVTNLEGGPGRQ------------------TTSPNVLWPTPGHLSP
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pF1KB7 FLQPHGQQVPYYLENEPSGYTVREAGPPAFYRP-NSDN-RRQGGRERLAS-TNDKGSMAM
        :  : :    : : . : .   ::       : : .. .:. . .: :: ..  ::   
CCDS55 -LVVHRQLSHLYAEPQKSPWC--EARSLEHTLPVNRETLKRKVSGNRCASPVTGPGS---
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pF1KB7 ESAKETRYCAVCNDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGHNDYMCPATNQCTIDKNRRKS
          .....::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS55 --KRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGHNDYICPATNQCTIDKNRRKS
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pF1KB7 CQACRLRKCYEVGMMKGGIRKDRRGGRMLKHKRQRDDGEGRGEVGSAGDMRAANLWPSPL
       ::::::::::::::.: : :..: : :.....:. :.     ..  ::  . ..   .: 
CCDS55 CQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADE-----QLHCAGKAKRSG-GHAPR
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pF1KB7 MIKRSKKNSLALSLTADQMVSALLDAEPP-ILYSEYDPTRPFSEASMMGLLTNLADRELV
       .     .. :  .:. .:.: .::.:::: .: :.  :. ::.:::::  ::.:::.:::
CCDS55 V-----RELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISR--PSAPFTEASMMMSLTKLADKELV
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pF1KB7 HMINWAKRVPGFVDLTLHDQVHLLECAWLEILMIGLVWRSMEHPGKLLFAPNLLLDRNQG
       :::.:::..::::.:.: :::.:::  :.:.::.::.:::..:::::.:::.:.:::..:
CCDS55 HMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDLVLDRDEG
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pF1KB7 KCVEGMVEIFDMLLATSSRFRMMNLQGEEFVCLKSIILLNSGVYTFLSSTLKSLEEKDHI
       :::::..:::::::::.:::: ..:: .:..:.:..:::::..: ....:  .   .   
CCDS55 KCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDADSSRKLA
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pF1KB7 HRVLDKITDTLIHLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSHIRHMSNKGMEHLYSMKCKNVVP
       : .:. .::.:. ..::.:.. ::: .:::.::..:::.:: .  : ...  .:      
CCDS55 H-LLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRH-ARWGEKQFIHLKLS    
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pF1KB7 LYDLLLEMLDAHRLHAPTSRGGASVEETDQSHLATAGSTSSHSLQKYYITGEAEGFPATV

>>CCDS61470.1 ESR2 gene_id:2100|Hs108|chr14               (474 aa)
 initn: 1276 init1: 641 opt: 827  Z-score: 697.6  bits: 138.8 E(32554): 1.5e-32
Smith-Waterman score: 1407; 47.7% identity (71.7% similar) in 495 aa overlap (27-516:17-467)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MTMTLHTKASGMALLHQIQGNELEPLNRPQLKIPLERPLGEVYLDSSKPAVYNYPEGAAY
                                 :  :  .:::.  : .:. ::   : .. :  :.
CCDS61           MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEH--GSIYIPSSY--VDSHHEYPAM
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               70         80        90       100       110         
pF1KB7 EFNAAAAANAQVYGQ-TGLPYGPGSEAAAFGSNGLGGFPPLNSVSPSPLMLLHPPPQLSP
        : . :. : .. .. :.:  ::: .                  . :: .:   : .:::
CCDS61 TFYSPAVMNYSIPSNVTNLEGGPGRQ------------------TTSPNVLWPTPGHLSP
         50        60        70                          80        

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pF1KB7 FLQPHGQQVPYYLENEPSGYTVREAGPPAFYRP-NSDN-RRQGGRERLAS-TNDKGSMAM
       ..  : :    : : . : .   ::       : : .. .:. . .: :: ..  ::   
CCDS61 LVV-HRQLSHLYAEPQKSPWC--EARSLEHTLPVNRETLKRKVSGNRCASPVTGPGS---
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pF1KB7 ESAKETRYCAVCNDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGHNDYMCPATNQCTIDKNRRKS
          .....::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS61 --KRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGHNDYICPATNQCTIDKNRRKS
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pF1KB7 CQACRLRKCYEVGMMKGGIRKDRRGGRMLKHKRQRDDGEGRGEVGSAGDMRAANLWPSPL
       ::::::::::::::.: : :..: : :.....:. :.     ..  ::  . ..   .: 
CCDS61 CQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADE-----QLHCAGKAKRSG-GHAPR
              210       220       230            240        250    

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pF1KB7 MIKRSKKNSLALSLTADQMVSALLDAEPP-ILYSEYDPTRPFSEASMMGLLTNLADRELV
       .     .. :  .:. .:.: .::.:::: .: :.  :. ::.:::::  ::.:::.:::
CCDS61 V-----RELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISR--PSAPFTEASMMMSLTKLADKELV
               260       270       280         290       300       

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pF1KB7 HMINWAKRVPGFVDLTLHDQVHLLECAWLEILMIGLVWRSMEHPGKLLFAPNLLLDRNQG
       :::.:::..::::.:.: :::.:::  :.:.::.::.:::..:::::.:::.:.:::..:
CCDS61 HMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDLVLDRDEG
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pF1KB7 KCVEGMVEIFDMLLATSSRFRMMNLQGEEFVCLKSIILLNSGVYTFLSSTLKSLEEKDHI
       :::::..:::::::::.:::: ..:: .:..:.:..:::::..: ....:  .   .   
CCDS61 KCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDADSSRKLA
       370       380       390       400       410       420       

         480       490       500       510       520       530     
pF1KB7 HRVLDKITDTLIHLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSHIRHMSNKGMEHLYSMKCKNVVP
       : .:. .::.:. ..::.:.. ::: .:::.::..:::.::                   
CCDS61 H-LLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHARSCVYK            
        430       440       450       460       470                

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pF1KB7 LYDLLLEMLDAHRLHAPTSRGGASVEETDQSHLATAGSTSSHSLQKYYITGEAEGFPATV

>>CCDS3772.1 NR3C2 gene_id:4306|Hs108|chr4                (984 aa)
 initn: 576 init1: 328 opt: 609  Z-score: 512.0  bits: 105.5 E(32554): 3.4e-22
Smith-Waterman score: 620; 26.8% identity (57.4% similar) in 538 aa overlap (49-544:445-964)

       20        30        40        50          60        70      
pF1KB7 QGNELEPLNRPQLKIPLERPLGEVYLDSSKPAVYNYP--EGAAYEFNAAAAANAQVYGQT
                                     :.:  .:  .:. . :      . . :. .
CCDS37 SKINSDSSFSVPIKQESTKHSCSGTSFKGNPTVNPFPFMDGSYFSF----MDDKDYYSLS
          420       430       440       450       460           470

           80        90                100       110       120     
pF1KB7 GL--PYGPGSEAAAFGSN---GL------GGFPPLNSVSPSPLMLLHPPPQLSPFLQPHG
       :.  :  :: ..   ::.   :.      :.. :  :.  : .. ..   :   :    :
CCDS37 GILGPPVPGFDGNCEGSGFPVGIKQEPDDGSYYPEASIPSSAIVGVNSGGQ--SFHYRIG
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pF1KB7 QQVPYYLENEPSGYTVREAG--PPA-----FYRPNSD--NRRQGGRERL------ASTND
        :    :       . .. .  ::.      .. ..:  .::. :   :      .:.. 
CCDS37 AQGTISLSRSARDQSFQHLSSFPPVNTLVESWKSHGDLSSRRSDGYPVLEYIPENVSSST
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pF1KB7 KGSMAMESAKETRYCAVCNDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGHNDYMCPATNQCTID
         :..  :.. .. : ::.: ::: :::: .: .::.::::...:...:.: . :.: ::
CCDS37 LRSVSTGSSRPSKICLVCGDEASGCHYGVVTCGSCKVFFKRAVEGQHNYLCAGRNDCIID
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pF1KB7 KNRRKSCQACRLRKCYEVGMMKGGIRKDRRGGRMLK-HKRQRDDGEG--------RGEVG
       : :::.: ::::.:: ..:: . : ::... :..   :..: .. .           : :
CCDS37 KIRRKNCPACRLQKCLQAGM-NLGARKSKKLGKLKGIHEEQPQQQQPPPPPPPPQSPEEG
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pF1KB7 SAGDMRAANLWPSPLMIKRSKKNSLALSLTADQMVSALLDAEPPILYSEYDPTRPFSEAS
       ..  . :    ::       . .... .:: .  : .: . :: :.:. :: ..: .  .
CCDS37 TT--YIAPAKEPSVNTALVPQLSTISRALTPSP-VMVLENIEPEIVYAGYDSSKPDTAEN
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pF1KB7 MMGLLTNLADRELVHMINWAKRVPGFVDLTLHDQVHLLECAWLEILMIGLVWRSMEHPGK
       ... :. :: ........::: .::: .: :.::. :.. .:. .  ..: :::..: ..
CCDS37 LLSTLNRLAGKQMIQVVKWAKVLPGFKNLPLEDQITLIQYSWMCLSSFALSWRSYKHTNS
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pF1KB7 --LLFAPNLLLDRNQGKCVEGMVEIFDMLLATSSRFRMMNLQGEEFVCLKSIILLNSGVY
         : :::.:...... .   .: :. . .   : .:  ..:  ::.. .: ..::..   
CCDS37 QFLYFAPDLVFNEEKMHQ-SAMYELCQGMHQISLQFVRLQLTFEEYTIMKVLLLLSTIPK
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pF1KB7 TFLSSTLKSLEEKDHIHRVLDKITDTLIHLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSHIRHMSN
         :.:     : . .  . : :       ...:   .  :. ::. ::  .:. .. . .
CCDS37 DGLKSQAAFEEMRTNYIKELRK-------MVTKCPNNSGQSWQRFYQLTKLLDSMHDLVS
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pF1KB7 KGMEH-LYSMKCKNV--VPLYDLLLEMLDAHRLHAPTSRGGASVEETDQSHLATAGSTSS
         .:  .:... ...  : .  .:.:..                                
CCDS37 DLLEFCFYTFRESHALKVEFPAMLVEIISDQLPKVESGNAKPLYFHRK            
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>>CCDS61469.1 ESR2 gene_id:2100|Hs108|chr14               (439 aa)
 initn: 966 init1: 569 opt: 601  Z-score: 510.6  bits: 104.1 E(32554): 4e-22
Smith-Waterman score: 960; 38.4% identity (57.0% similar) in 558 aa overlap (27-578:17-438)

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pF1KB7 MTMTLHTKASGMALLHQIQGNELEPLNRPQLKIPLERPLGEVYLDSSKPAVYNYPEGAAY
                                 :  :  .:::.  : .:. ::   : .. :  :.
CCDS61           MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEH--GSIYIPSS--YVDSHHEYPAM
                         10        20          30          40      

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pF1KB7 EFNAAAAANAQVYGQ-TGLPYGPGSEAAAFGSNGLGGFPPLNSVSPSPLMLLHPPPQLSP
        : . :. : .. .. :.:  ::: .                  . :: .:   : .:::
CCDS61 TFYSPAVMNYSIPSNVTNLEGGPGRQ------------------TTSPNVLWPTPGHLSP
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pF1KB7 FLQPHGQQVPYYLENEPSGYTVREAGPPAFYRP-NSDN-RRQGGRERLAS-TNDKGSMAM
       ..  : :    : : . : .   ::       : : .. .:. . .: :: ..  ::   
CCDS61 LVV-HRQLSHLYAEPQKSPWC--EARSLEHTLPVNRETLKRKVSGNRCASPVTGPGS---
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pF1KB7 ESAKETRYCAVCNDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGHNDYMCPATNQCTIDKNRRKS
          .....::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS61 --KRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGHNDYICPATNQCTIDKNRRKS
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pF1KB7 CQACRLRKCYEVGMMKGGIRKDRRGGRMLKHKRQRDDGEGRGEVGSAGDMRAANLWPSPL
       ::::::::::::::.: : :..: : :.....:. :.     ..  ::  . ..   .: 
CCDS61 CQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADE-----QLHCAGKAKRSG-GHAPR
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pF1KB7 MIKRSKKNSLALSLTADQMVSALLDAEPP-ILYSEYDPTRPFSEASMMGLLTNLADRELV
       .     .. :  .:. .:.: .::.:::: .: :.  :. ::.:::::  ::.:::.:::
CCDS61 V-----RELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISR--PSAPFTEASMMMSLTKLADKELV
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pF1KB7 HMINWAKRVPGFVDLTLHDQVHLLECAWLEILMIGLVWRSMEHPGKLLFAPNLLLDRNQG
       :::.:::..::.  :.   :                                   :    
CCDS61 HMISWAKKIPGMYPLVTATQ-----------------------------------D----
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pF1KB7 KCVEGMVEIFDMLLATSSRFRMMNLQGEEFVCLKSIILLNSGVYTFLSSTLKSLEEKDHI
                     : ::: .. .:                                   
CCDS61 --------------ADSSR-KLAHL-----------------------------------
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pF1KB7 HRVLDKITDTLIHLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSHIRHMSNKGMEHLYSMKCKNVVP
          :. .::.:. ..::.:.. ::: .:::.::..:::.:: :::::::: .::::::::
CCDS61 ---LNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHASNKGMEHLLNMKCKNVVP
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pF1KB7 LYDLLLEMLDAHRLHA-PTSRGGASVEETDQSHLATAGSTSSHSLQKYYITGEAEGFPAT
       .::::::::.:: :..  .:  :.    ...:. .  :: . .:                
CCDS61 VYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSK-SKEGSQNPQSQ               
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pF1KB7 V

>>CCDS5063.1 NR2E1 gene_id:7101|Hs108|chr6                (385 aa)
 initn: 483 init1: 189 opt: 476  Z-score: 407.8  bits: 84.8 E(32554): 2.2e-16
Smith-Waterman score: 574; 31.8% identity (60.6% similar) in 371 aa overlap (185-543:16-379)

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pF1KB7 DNRRQGGRERLASTNDKGSMAMESAKETRYCAVCNDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQ
                                     : ::.: .:: ::::..:.::..::::::.
CCDS50                MSKPAGSTSRILDIPCKVCGDRSSGKHYGVYACDGCSGFFKRSIR
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pF1KB7 GHNDYMCPATNQ--CTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMMKGGIRKDRRGGRMLKHKRQRD
        .  :.: . ::  : .::..:..:.::::.:: ::.: : .....: : :    ..:  
CCDS50 RNRTYVCKSGNQGGCPVDKTHRNQCRACRLKKCLEVNMNKDAVQHER-GPRTSTIRKQVA
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pF1KB7 ---DGEGRGEVGSAGDMRAANLWPSPLM---IKRSKKNSL---ALSLTADQMVSALLDAE
           :. . : :.:. . .: : :.: .   . . . ..:   :.: : .... . :   
CCDS50 LYFRGH-KEENGAAAHFPSAAL-PAPAFFTAVTQLEPHGLELAAVSTTPERQTLVSLAQP
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pF1KB7 PPILYSEYDPTRPFSEASMMGLLTNLADRELVHMINWAKRVPGFVDLTLHDQVHLLECAW
        :    : . :  .        . . : : :   :.::: ::.:  :.:.::. ::: ::
CCDS50 TPKYPHEVNGTPMYLYEVATESVCESAARLLFMSIKWAKSVPAFSTLSLQDQLMLLEDAW
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pF1KB7 LEILMIGLV-WRSMEHPGKLLFAPNLLLDRNQGKCVEGMVEIFDMLLATSSRFRMMNLQG
        :....:.. :      . :: . ..  : .... .. ..  .. :  . .:::.. :..
CCDS50 RELFVLGIAQWAIPVDANTLLAVSGMNGDNTDSQKLNKIISEIQALQEVVARFRQLRLDA
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pF1KB7 EEFVCLKSIILLNSGVYTFLSSTLKSLEEKDHIHRVLDKITDTLIHLMAKAGLTLQQQHQ
        ::.::: :. ... : :  .: :.:...   :  . :.   ::   .         :  
CCDS50 TEFACLKCIVTFKA-VPTHSGSELRSFRNAAAIAALQDEAQLTLNSYIHT---RYPTQPC
            290        300       310       320       330           

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pF1KB7 RLAQLLLILSHIRHMSNKGMEHLYSMKCKNVVPLYDLLLEMLDAHRLHAPTSRGGASVEE
       :...:::.:  .: .: . .:...  :  . ::.  :: .:                   
CCDS50 RFGKLLLLLPALRSISPSTIEEVFFKKTIGNVPITRLLSDMYKSSDI             
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            570       580       590     
pF1KB7 TDQSHLATAGSTSSHSLQKYYITGEAEGFPATV

>>CCDS69165.1 NR2E1 gene_id:7101|Hs108|chr6               (422 aa)
 initn: 512 init1: 189 opt: 476  Z-score: 407.2  bits: 84.9 E(32554): 2.3e-16
Smith-Waterman score: 574; 31.8% identity (60.6% similar) in 371 aa overlap (185-543:53-416)

          160       170       180       190       200       210    
pF1KB7 DNRRQGGRERLASTNDKGSMAMESAKETRYCAVCNDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQ
                                     : ::.: .:: ::::..:.::..::::::.
CCDS69 PGPGLGFPLGSGLPWPSLLESPGGRILDIPCKVCGDRSSGKHYGVYACDGCSGFFKRSIR
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pF1KB7 GHNDYMCPATNQ--CTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMMKGGIRKDRRGGRMLKHKRQRD
        .  :.: . ::  : .::..:..:.::::.:: ::.: : .....: : :    ..:  
CCDS69 RNRTYVCKSGNQGGCPVDKTHRNQCRACRLKKCLEVNMNKDAVQHER-GPRTSTIRKQVA
             90       100       110       120        130       140 

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pF1KB7 ---DGEGRGEVGSAGDMRAANLWPSPLM---IKRSKKNSL---ALSLTADQMVSALLDAE
           :. . : :.:. . .: : :.: .   . . . ..:   :.: : .... . :   
CCDS69 LYFRGH-KEENGAAAHFPSAAL-PAPAFFTAVTQLEPHGLELAAVSTTPERQTLVSLAQP
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pF1KB7 PPILYSEYDPTRPFSEASMMGLLTNLADRELVHMINWAKRVPGFVDLTLHDQVHLLECAW
        :    : . :  .        . . : : :   :.::: ::.:  :.:.::. ::: ::
CCDS69 TPKYPHEVNGTPMYLYEVATESVCESAARLLFMSIKWAKSVPAFSTLSLQDQLMLLEDAW
     200       210       220       230       240       250         

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