Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6551
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6551, 371 aa
1>>>pF1KB6551 371 - 371 aa - 371 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6818+/-0.00116; mu= 3.1557+/- 0.069
mean_var=308.3187+/-60.618, 0's: 0 Z-trim(110.6): 101 B-trim: 13 in 1/52
Lambda= 0.073042
statistics sampled from 11628 (11722) to 11628 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.689), E-opt: 0.2 (0.36), width: 16
Scan time: 3.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32348.1 LUC7L gene_id:55692|Hs108|chr16 ( 371) 2432 269.9 2.5e-72
CCDS10401.1 LUC7L gene_id:55692|Hs108|chr16 ( 325) 2122 237.2 1.6e-62
CCDS43656.1 LUC7L2 gene_id:51631|Hs108|chr7 ( 392) 1769 200.1 2.8e-51
CCDS81921.1 LUC7L gene_id:55692|Hs108|chr16 ( 272) 1756 198.5 5.7e-51
CCDS59085.1 LUC7L2 gene_id:51631|Hs108|chr7 ( 389) 1659 188.5 8.6e-48
CCDS59084.1 LUC7L2 gene_id:100996928|Hs108|chr7 ( 458) 1650 187.6 1.8e-47
CCDS59510.1 LUC7L2 gene_id:51631|Hs108|chr7 ( 391) 1644 186.9 2.6e-47
CCDS11573.1 LUC7L3 gene_id:51747|Hs108|chr17 ( 432) 736 91.3 1.7e-18
CCDS82158.1 LUC7L3 gene_id:51747|Hs108|chr17 ( 489) 736 91.3 1.9e-18
>>CCDS32348.1 LUC7L gene_id:55692|Hs108|chr16 (371 aa)
initn: 2432 init1: 2432 opt: 2432 Z-score: 1412.0 bits: 269.9 E(32554): 2.5e-72
Smith-Waterman score: 2432; 100.0% identity (100.0% similar) in 371 aa overlap (1-371:1-371)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSAQAQMRALLDQLMGTARDGDETRQRVKFTDDRVCKSHLLDCCPHDILAGTRMDLGECT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MSAQAQMRALLDQLMGTARDGDETRQRVKFTDDRVCKSHLLDCCPHDILAGTRMDLGECT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 KIHDLALRADYEIASKERDLFFELDAMDHLESFIAECDRRTELAKKRLAETQEEISAEVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KIHDLALRADYEIASKERDLFFELDAMDHLESFIAECDRRTELAKKRLAETQEEISAEVS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 AKAEKVHELNEEIGKLLAKAEQLGAEGNVDESQKILMEVEKVRAKKKEAEEEYRNSMPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AKAEKVHELNEEIGKLLAKAEQLGAEGNVDESQKILMEVEKVRAKKKEAEEEYRNSMPAS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 SFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKTVAEKQEKRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKTVAEKQEKRN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 QDRLRRREEREREERLSRRSGSRTRDRRRSRSRDRRRRRSRSTSRERRKLSRSRSRDRHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QDRLRRREEREREERLSRRSGSRTRDRRRSRSRDRRRRRSRSTSRERRKLSRSRSRDRHR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 RHRSRSRSHSRGHRRASRDRSAKYKFSRERASREESWESGRSERGPPDWRLESSNGKMAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RHRSRSRSHSRGHRRASRDRSAKYKFSRERASREESWESGRSERGPPDWRLESSNGKMAS
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB6 RRSEEKEAGEI
:::::::::::
CCDS32 RRSEEKEAGEI
370
>>CCDS10401.1 LUC7L gene_id:55692|Hs108|chr16 (325 aa)
initn: 2122 init1: 2122 opt: 2122 Z-score: 1236.1 bits: 237.2 E(32554): 1.6e-62
Smith-Waterman score: 2122; 100.0% identity (100.0% similar) in 325 aa overlap (1-325:1-325)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSAQAQMRALLDQLMGTARDGDETRQRVKFTDDRVCKSHLLDCCPHDILAGTRMDLGECT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MSAQAQMRALLDQLMGTARDGDETRQRVKFTDDRVCKSHLLDCCPHDILAGTRMDLGECT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 KIHDLALRADYEIASKERDLFFELDAMDHLESFIAECDRRTELAKKRLAETQEEISAEVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KIHDLALRADYEIASKERDLFFELDAMDHLESFIAECDRRTELAKKRLAETQEEISAEVS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 AKAEKVHELNEEIGKLLAKAEQLGAEGNVDESQKILMEVEKVRAKKKEAEEEYRNSMPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AKAEKVHELNEEIGKLLAKAEQLGAEGNVDESQKILMEVEKVRAKKKEAEEEYRNSMPAS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 SFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKTVAEKQEKRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKTVAEKQEKRN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 QDRLRRREEREREERLSRRSGSRTRDRRRSRSRDRRRRRSRSTSRERRKLSRSRSRDRHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QDRLRRREEREREERLSRRSGSRTRDRRRSRSRDRRRRRSRSTSRERRKLSRSRSRDRHR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 RHRSRSRSHSRGHRRASRDRSAKYKFSRERASREESWESGRSERGPPDWRLESSNGKMAS
:::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RHRSRSRSHSRGHRRASRDRSAKYK
310 320
>>CCDS43656.1 LUC7L2 gene_id:51631|Hs108|chr7 (392 aa)
initn: 1577 init1: 1577 opt: 1769 Z-score: 1034.1 bits: 200.1 E(32554): 2.8e-51
Smith-Waterman score: 1817; 73.0% identity (88.8% similar) in 392 aa overlap (1-371:1-392)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSAQAQMRALLDQLMGTARDGDETRQRVKFTDDRVCKSHLLDCCPHDILAGTRMDLGECT
:::::::::.:::::::.:::: ::::.::.::::::::::.:::::.:.:::::::::
CCDS43 MSAQAQMRAMLDQLMGTSRDGDTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLSGTRMDLGECL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 KIHDLALRADYEIASKERDLFFELDAMDHLESFIAECDRRTELAKKRLAETQEEISAEVS
:.:::::::::::::::.:.::::::::::.::::.::::::.::::::::::::::::.
CCDS43 KVHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAETQEEISAEVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 AKAEKVHELNEEIGKLLAKAEQLGAEGNVDESQKILMEVEKVRAKKKEAEEEYRNSMPAS
::::.::::::::::::::.:::::::::.::::.. ::::.::::.:::: ::::::::
CCDS43 AKAERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAEEVYRNSMPAS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 SFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKTVAEKQEKRN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::..:...:::::::::
CCDS43 SFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAEKQEKRN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB6 QDRLRRREEREREERLS-RRSGSRTRDRRRSRSRDRRRRRSRSTSRERRKLSRSRSRDRH
:.::.:::::::::: . ::: :.... .:::::..::.:::: ::::.. .::.::...
CCDS43 QERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSMSRERKRRTRSKSREKR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KB6 RRHRSRS--RSHSRGHRRA---SRDRS---AKYKFSRERASREE--SWESGRS--ERGPP
.:::::: ::.::.:.:. ::::: .: . :.:: .. : . :: .:.:
CCDS43 HRHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSSKERFRDQDLASCDRDRSSRDRSPR
310 320 330 340 350 360
350 360 370
pF1KB6 DW-------RLESSNGKMASRRS-EEKEAGEI
: ::.::. .::: ::.:::::
CCDS43 DRDRKDKKRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI
370 380 390
>>CCDS81921.1 LUC7L gene_id:55692|Hs108|chr16 (272 aa)
initn: 1756 init1: 1756 opt: 1756 Z-score: 1028.5 bits: 198.5 E(32554): 5.7e-51
Smith-Waterman score: 1756; 100.0% identity (100.0% similar) in 272 aa overlap (54-325:1-272)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 TRQRVKFTDDRVCKSHLLDCCPHDILAGTRMDLGECTKIHDLALRADYEIASKERDLFFE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MDLGECTKIHDLALRADYEIASKERDLFFE
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 LDAMDHLESFIAECDRRTELAKKRLAETQEEISAEVSAKAEKVHELNEEIGKLLAKAEQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LDAMDHLESFIAECDRRTELAKKRLAETQEEISAEVSAKAEKVHELNEEIGKLLAKAEQL
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 GAEGNVDESQKILMEVEKVRAKKKEAEEEYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GAEGNVDESQKILMEVEKVRAKKKEAEEEYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDND
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 RRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKTVAEKQEKRNQDRLRRREEREREERLSRRSGSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKTVAEKQEKRNQDRLRRREEREREERLSRRSGSR
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 TRDRRRSRSRDRRRRRSRSTSRERRKLSRSRSRDRHRRHRSRSRSHSRGHRRASRDRSAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TRDRRRSRSRDRRRRRSRSTSRERRKLSRSRSRDRHRRHRSRSRSHSRGHRRASRDRSAK
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370
pF1KB6 YKFSRERASREESWESGRSERGPPDWRLESSNGKMASRRSEEKEAGEI
::
CCDS81 YK
>>CCDS59085.1 LUC7L2 gene_id:51631|Hs108|chr7 (389 aa)
initn: 1462 init1: 1462 opt: 1659 Z-score: 971.5 bits: 188.5 E(32554): 8.6e-48
Smith-Waterman score: 1707; 70.0% identity (87.6% similar) in 387 aa overlap (7-371:3-389)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSAQAQMRALLDQLMGTA-RDGDETRQRVKFTDDRVCKSHLLDCCPHDILAGTRMDLGEC
... : ...:.. : :: ::::.::.::::::::::.:::::.:.:::::::::
CCDS59 MVIHSQLKKIQGASERMGDTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLSGTRMDLGEC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 TKIHDLALRADYEIASKERDLFFELDAMDHLESFIAECDRRTELAKKRLAETQEEISAEV
:.:::::::::::::::.:.::::::::::.::::.::::::.::::::::::::::::
CCDS59 LKVHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAETQEEISAEV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 SAKAEKVHELNEEIGKLLAKAEQLGAEGNVDESQKILMEVEKVRAKKKEAEEEYRNSMPA
.::::.::::::::::::::.:::::::::.::::.. ::::.::::.:::: :::::::
CCDS59 AAKAERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAEEVYRNSMPA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 SSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKTVAEKQEKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::..:...::::::::
CCDS59 SSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAEKQEKR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 NQDRLRRREEREREERLS-RRSGSRTRDRRRSRSRDRRRRRSRSTSRERRKLSRSRSRDR
::.::.:::::::::: . ::: :.... .:::::..::.:::: ::::.. .::.::..
CCDS59 NQERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSMSRERKRRTRSKSREK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB6 HRRHRSRS--RSHSRGHRRA---SRDRS---AKYKFSRERASREE--SWESGRS--ERGP
..:::::: ::.::.:.:. ::::: .: . :.:: .. : . :: .:.:
CCDS59 RHRHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSSKERFRDQDLASCDRDRSSRDRSP
300 310 320 330 340 350
350 360 370
pF1KB6 PDW-------RLESSNGKMASRRS-EEKEAGEI
: ::.::. .::: ::.:::::
CCDS59 RDRDRKDKKRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI
360 370 380
>>CCDS59084.1 LUC7L2 gene_id:100996928|Hs108|chr7 (458 aa)
initn: 1458 init1: 1458 opt: 1650 Z-score: 965.6 bits: 187.6 E(32554): 1.8e-47
Smith-Waterman score: 1698; 72.0% identity (88.2% similar) in 372 aa overlap (21-371:87-458)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSAQAQMRALLDQLMGTARDGDETRQRVKFTDDRVCKSHLLDCCPHDILA
:: ::::.::.::::::::::.:::::.:.
CCDS59 HELHFQAATYLCLLRSIRKHVALHQEFHGKGDTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLS
60 70 80 90 100 110
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 GTRMDLGECTKIHDLALRADYEIASKERDLFFELDAMDHLESFIAECDRRTELAKKRLAE
::::::::: :.:::::::::::::::.:.::::::::::.::::.::::::.:::::::
CCDS59 GTRMDLGECLKVHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAE
120 130 140 150 160 170
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 TQEEISAEVSAKAEKVHELNEEIGKLLAKAEQLGAEGNVDESQKILMEVEKVRAKKKEAE
:::::::::.::::.::::::::::::::.:::::::::.::::.. ::::.::::.:::
CCDS59 TQEEISAEVAAKAERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAE
180 190 200 210 220 230
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 EEYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRK
: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::..:..
CCDS59 EVYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKR
240 250 260 270 280 290
240 250 260 270 280
pF1KB6 TVAEKQEKRNQDRLRRREEREREERLS-RRSGSRTRDRRRSRSRDRRRRRSRSTSRERRK
.::::::::::.::.:::::::::: . ::: :.... .:::::..::.:::: ::::..
CCDS59 VVAEKQEKRNQERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSMSRERKR
300 310 320 330 340 350
290 300 310 320 330
pF1KB6 LSRSRSRDRHRRHRSRS--RSHSRGHRRA---SRDRS---AKYKFSRERASREE--SWES
.::.::....:::::: ::.::.:.:. ::::: .: . :.:: .. : .
CCDS59 RTRSKSREKRHRHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSSKERFRDQDLASCDR
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370
pF1KB6 GRS--ERGPPDW-------RLESSNGKMASRRS-EEKEAGEI
:: .:.: : ::.::. .::: ::.:::::
CCDS59 DRSSRDRSPRDRDRKDKKRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI
420 430 440 450
>>CCDS59510.1 LUC7L2 gene_id:51631|Hs108|chr7 (391 aa)
initn: 1450 init1: 1450 opt: 1644 Z-score: 962.9 bits: 186.9 E(32554): 2.6e-47
Smith-Waterman score: 1692; 69.6% identity (86.2% similar) in 392 aa overlap (7-371:1-391)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSAQAQMRALLDQLMGTARDG------DETRQRVKFTDDRVCKSHLLDCCPHDILAGTRM
: : :. :.:..: . : ::::.::.::::::::::.:::::.:.::::
CCDS59 MPAYLN-LQGSVRKAPHSPSRDTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLSGTRM
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 DLGECTKIHDLALRADYEIASKERDLFFELDAMDHLESFIAECDRRTELAKKRLAETQEE
::::: :.:::::::::::::::.:.::::::::::.::::.::::::.:::::::::::
CCDS59 DLGECLKVHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAETQEE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 ISAEVSAKAEKVHELNEEIGKLLAKAEQLGAEGNVDESQKILMEVEKVRAKKKEAEEEYR
:::::.::::.::::::::::::::.:::::::::.::::.. ::::.::::.:::: ::
CCDS59 ISAEVAAKAERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAEEVYR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 NSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKTVAE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::..:...:::
CCDS59 NSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 KQEKRNQDRLRRREEREREERLS-RRSGSRTRDRRRSRSRDRRRRRSRSTSRERRKLSRS
:::::::.::.:::::::::: . ::: :.... .:::::..::.:::: ::::.. .::
CCDS59 KQEKRNQERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSMSRERKRRTRS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB6 RSRDRHRRHRSRS--RSHSRGHRRA---SRDRS---AKYKFSRERASREE--SWESGRS-
.::....:::::: ::.::.:.:. ::::: .: . :.:: .. : . ::
CCDS59 KSREKRHRHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSSKERFRDQDLASCDRDRSS
300 310 320 330 340 350
350 360 370
pF1KB6 -ERGPPDW-------RLESSNGKMASRRS-EEKEAGEI
.:.: : ::.::. .::: ::.:::::
CCDS59 RDRSPRDRDRKDKKRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI
360 370 380 390
>>CCDS11573.1 LUC7L3 gene_id:51747|Hs108|chr17 (432 aa)
initn: 1180 init1: 346 opt: 736 Z-score: 445.3 bits: 91.3 E(32554): 1.7e-18
Smith-Waterman score: 748; 36.0% identity (68.3% similar) in 375 aa overlap (10-367:7-380)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSAQAQMRALLDQLMGTARD--GDETRQRVKFTDDRVCKSHLLDCCPHDILAGTRMDLGE
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