Result of FASTA (omim) for pF1KB8364
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8364, 483 aa
  1>>>pF1KB8364 483 - 483 aa - 483 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3068+/-0.000544; mu= -4.5844+/- 0.033
 mean_var=358.6767+/-75.416, 0's: 0 Z-trim(116.4): 151  B-trim: 436 in 2/53
 Lambda= 0.067721
 statistics sampled from 27354 (27509) to 27354 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.644), E-opt: 0.2 (0.323), width:  16
 Scan time: 10.830

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001243222 (OMIM: 148060) keratin, type II cytos ( 483) 2985 306.2 1.4e-82
NP_002264 (OMIM: 148060) keratin, type II cytoskel ( 483) 2985 306.2 1.4e-82
NP_001243211 (OMIM: 148060) keratin, type II cytos ( 511) 2985 306.2 1.4e-82
NP_000415 (OMIM: 131760,131800,131900,131960,14804 ( 590) 1739 184.5   7e-46
NP_005545 (OMIM: 148041,615726) keratin, type II c ( 564) 1715 182.1 3.4e-45
NP_775109 (OMIM: 612315,615735) keratin, type II c ( 564) 1711 181.8 4.5e-45
NP_005546 (OMIM: 148042,615728) keratin, type II c ( 564) 1703 181.0 7.7e-45
NP_004684 (OMIM: 609025,612318) keratin, type II c ( 551) 1696 180.3 1.2e-44
NP_005547 (OMIM: 148059) keratin, type II cytoskel ( 469) 1686 179.2 2.1e-44
NP_476429 (OMIM: 122100,148043) keratin, type II c ( 628) 1652 176.0 2.6e-43
XP_011536627 (OMIM: 148059) PREDICTED: keratin, ty ( 445) 1627 173.4 1.1e-42
NP_002263 (OMIM: 123940,193900) keratin, type II c ( 520) 1595 170.4 1.1e-41
NP_056932 (OMIM: 616671) keratin, type II cytoskel ( 638) 1571 168.1 6.4e-41
NP_006112 (OMIM: 113800,139350,144200,146590,60096 ( 644) 1565 167.5 9.7e-41
NP_787028 (OMIM: 611160) keratin, type II cytoskel ( 535) 1505 161.6   5e-39
NP_000414 (OMIM: 146800,600194) keratin, type II c ( 639) 1506 161.8 5.2e-39
NP_149034 (OMIM: 602766) keratin, type II cuticula ( 600) 1498 161.0 8.6e-39
XP_011536637 (OMIM: 602766) PREDICTED: keratin, ty ( 600) 1498 161.0 8.6e-39
NP_001139697 (OMIM: 608246) keratin, type II cytos ( 511) 1485 159.6 1.9e-38
NP_542785 (OMIM: 608246) keratin, type II cytoskel ( 511) 1485 159.6 1.9e-38
NP_778238 (OMIM: 608247) keratin, type II cytoskel ( 540) 1474 158.6 4.1e-38
NP_778253 (OMIM: 611158) keratin, type II cytoskel ( 578) 1455 156.8 1.5e-37
XP_016874323 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 442) 1451 156.2 1.7e-37
XP_016874325 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 419) 1450 156.1 1.7e-37
NP_258259 (OMIM: 608245,615896) keratin, type II c ( 523) 1447 155.9 2.5e-37
XP_016874238 (OMIM: 608245,615896) PREDICTED: kera ( 441) 1435 154.7   5e-37
NP_778223 (OMIM: 194300,608248,613981,614929) kera ( 529) 1426 153.9   1e-36
NP_002274 (OMIM: 602032,602767) keratin, type II c ( 507) 1421 153.4 1.4e-36
NP_149022 (OMIM: 601078) keratin, type II cuticula ( 513) 1388 150.2 1.3e-35
XP_016874785 (OMIM: 158000,601928) PREDICTED: kera ( 486) 1362 147.6 7.4e-35
NP_001307127 (OMIM: 158000,601928) keratin, type I ( 486) 1362 147.6 7.4e-35
XP_005268923 (OMIM: 158000,601928) PREDICTED: kera ( 563) 1362 147.7 8.2e-35
NP_775487 (OMIM: 611159) keratin, type II cytoskel ( 520) 1360 147.4 8.9e-35
NP_002273 (OMIM: 158000,602765) keratin, type II c ( 493) 1357 147.1 1.1e-34
NP_002272 (OMIM: 158000,602153) keratin, type II c ( 505) 1349 146.3 1.8e-34
XP_016874324 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 439) 1249 136.5 1.5e-31
XP_016874322 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 445) 1249 136.5 1.5e-31
NP_001287743 (OMIM: 611159) keratin, type II cytos ( 410) 1111 123.0 1.6e-27
NP_872313 (OMIM: 611161) keratin, type II cytoskel ( 452) 1083 120.3 1.1e-26
NP_001074961 (OMIM: 611161) keratin, type II cytos ( 422) 1078 119.8 1.5e-26
XP_016874783 (OMIM: 148059) PREDICTED: keratin, ty ( 292) 1042 116.1 1.3e-25
XP_011536590 (OMIM: 611158) PREDICTED: keratin, ty ( 345) 1005 112.6 1.9e-24
NP_001139698 (OMIM: 608246) keratin, type II cytos ( 469)  997 111.9 3.9e-24
NP_001287739 (OMIM: 602032,602767) keratin, type I ( 295)  887 101.0 4.9e-21
XP_016874326 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 271)  862 98.5 2.5e-20
XP_011536559 (OMIM: 608247) PREDICTED: keratin, ty ( 508)  864 99.0 3.4e-20
NP_006253 (OMIM: 105400,170710) peripherin [Homo s ( 470)  858 98.3 4.8e-20
XP_005269082 (OMIM: 105400,170710) PREDICTED: peri ( 471)  858 98.3 4.8e-20
NP_003371 (OMIM: 116300,193060) vimentin [Homo sap ( 466)  856 98.1 5.5e-20
XP_006717563 (OMIM: 116300,193060) PREDICTED: vime ( 466)  856 98.1 5.5e-20


>>NP_001243222 (OMIM: 148060) keratin, type II cytoskele  (483 aa)
 initn: 2985 init1: 2985 opt: 2985  Z-score: 1603.7  bits: 306.2 E(85289): 1.4e-82
Smith-Waterman score: 2985; 99.8% identity (99.8% similar) in 483 aa overlap (1-483:1-483)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSRISSSSFSRVGSSNFRGGLGGGYGGASGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSRISSSSFSRVGSSNFRGGLGGGYGGASGM
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 GGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 TKWSLLQQQKTARSNMDNMFESYINNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TKWSLLQQQKTARSNMDNMFESYINNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 DEINKRTEMENEFVLIKKDVDVAYMNKVELESRLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQIS
       ::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DEINKRTEMENEFVLIKKDVDEAYMNKVELESRLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQIS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 DTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 RRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAAL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 QRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLESGMQNMSIHTKTTSGYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLESGMQNMSIHTKTTSGYA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 GGLSSAYGGLTSPGLSYSLGSSFGSGAGSSSFSRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGLSSAYGGLTSPGLSYSLGSSFGSGAGSSSFSRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDV
              430       440       450       460       470       480

          
pF1KB8 LPK
       :::
NP_001 LPK
          

>>NP_002264 (OMIM: 148060) keratin, type II cytoskeletal  (483 aa)
 initn: 2985 init1: 2985 opt: 2985  Z-score: 1603.7  bits: 306.2 E(85289): 1.4e-82
Smith-Waterman score: 2985; 99.8% identity (99.8% similar) in 483 aa overlap (1-483:1-483)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSRISSSSFSRVGSSNFRGGLGGGYGGASGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSRISSSSFSRVGSSNFRGGLGGGYGGASGM
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 GGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 TKWSLLQQQKTARSNMDNMFESYINNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TKWSLLQQQKTARSNMDNMFESYINNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 DEINKRTEMENEFVLIKKDVDVAYMNKVELESRLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQIS
       ::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DEINKRTEMENEFVLIKKDVDEAYMNKVELESRLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQIS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 DTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 RRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAAL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 QRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLESGMQNMSIHTKTTSGYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLESGMQNMSIHTKTTSGYA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 GGLSSAYGGLTSPGLSYSLGSSFGSGAGSSSFSRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GGLSSAYGGLTSPGLSYSLGSSFGSGAGSSSFSRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDV
              430       440       450       460       470       480

          
pF1KB8 LPK
       :::
NP_002 LPK
          

>>NP_001243211 (OMIM: 148060) keratin, type II cytoskele  (511 aa)
 initn: 2985 init1: 2985 opt: 2985  Z-score: 1603.4  bits: 306.2 E(85289): 1.4e-82
Smith-Waterman score: 2985; 99.8% identity (99.8% similar) in 483 aa overlap (1-483:29-511)

                                           10        20        30  
pF1KB8                             MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSR
                                   ::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MNGVSWSQDLQEGISAWFGPPASTPASTMSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSR
               10        20        30        40        50        60

             40        50        60        70        80        90  
pF1KB8 ISSSSFSRVGSSNFRGGLGGGYGGASGMGGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISSSSFSRVGSSNFRGGLGGGYGGASGMGGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEK
               70        80        90       100       110       120

            100       110       120       130       140       150  
pF1KB8 EQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLETKWSLLQQQKTARSNMDNMFESYINNLRRQLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLETKWSLLQQQKTARSNMDNMFESYINNLRRQLE
              130       140       150       160       170       180

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB8 TLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYEDEINKRTEMENEFVLIKKDVDVAYMNKVELES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
NP_001 TLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYEDEINKRTEMENEFVLIKKDVDEAYMNKVELES
              190       200       210       220       230       240

            220       230       240       250       260       270  
pF1KB8 RLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIAN
              250       260       270       280       290       300

            280       290       300       310       320       330  
pF1KB8 RSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDLRRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDLRRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLE
              310       320       330       340       350       360

            340       350       360       370       380       390  
pF1KB8 AAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAALQRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAALQRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYR
              370       380       390       400       410       420

            400       410       420       430       440       450  
pF1KB8 KLLEGEESRLESGMQNMSIHTKTTSGYAGGLSSAYGGLTSPGLSYSLGSSFGSGAGSSSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLLEGEESRLESGMQNMSIHTKTTSGYAGGLSSAYGGLTSPGLSYSLGSSFGSGAGSSSF
              430       440       450       460       470       480

            460       470       480   
pF1KB8 SRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDVLPK
       :::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDVLPK
              490       500       510 

>>NP_000415 (OMIM: 131760,131800,131900,131960,148040,17  (590 aa)
 initn: 1352 init1: 1295 opt: 1739  Z-score: 944.7  bits: 184.5 E(85289): 7e-46
Smith-Waterman score: 1739; 62.1% identity (83.4% similar) in 470 aa overlap (1-458:74-536)

                                             10        20        30
pF1KB8                               MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPG
                                     .:: ..  :.. .  :  : .. .. .: :
NP_000 GGFGRVSLAGACGVGGYGSRSLYNLGGSKRISISTSGGSFR-NRFGAGAGGGYGFGGGAG
            50        60        70        80         90       100  

                    40        50        60        70        80     
pF1KB8 SRI-----SSSSFSRVGSSNFRGGLGGGYGGASGMGGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQ
       : .     ....:.  :...: ::.::    .   :::  ::::::::.:: :..::.::
NP_000 SGFGFGGGAGGGFGLGGGAGFGGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPSIQ
            110       120       130       140       150       160  

          90       100       110       120         130       140   
pF1KB8 AVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLETKWSLLQQQ--KTARSNMDNMFESY
        :::.:.:::::::::::::::::::::::::.:.:::.:::.:  ::.:.:.. .::.:
NP_000 RVRTEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQY
            170       180       190       200       210       220  

           150       160       170       180       190       200   
pF1KB8 INNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYEDEINKRTEMENEFVLIKKDVDVA
       ::::::::...  :. .:..:: ::: :::::::::::::::::  :::::..:::::.:
NP_000 INNLRRQLDSIVGERGRLDSELRNMQDLVEDFKNKYEDEINKRTTAENEFVMLKKDVDAA
            230       240       250       260       270       280  

           210       220       230       240       250       260   
pF1KB8 YMNKVELESRLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEV
       ::::::::.....: :::::...... :. ..:...:::::::::::.:.::.:::::::
NP_000 YMNKVELEAKVDALMDEINFMKMFFDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEV
            290       300       310       320       330       340  

           270       280       290       300       310       320   
pF1KB8 KAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDLRRTKTEISEMNRNISRLQAEIEG
       :::::.::::::.:::: :: ::::::. ::.:::::: :: ::::::: :.::.:::..
NP_000 KAQYEEIANRSRTEAESWYQTKYEELQQTAGRHGDDLRNTKHEISEMNRMIQRLRAEIDN
            350       360       370       380       390       400  

           330       340       350       360       370       380   
pF1KB8 LKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAALQRAKQDMARQLREYQELMNVKLA
       .: : :.:. ::::::::::::.:::  ::.::: :::.::::::: :::::::::.:::
NP_000 VKKQCANLQNAIADAEQRGELALKDARNKLAELEEALQKAKQDMARLLREYQELMNTKLA
            410       420       430       440       450       460  

           390       400          410        420       430         
pF1KB8 LDIEIATYRKLLEGEESRLES---GMQNMSIHTKT-TSGYAGGLSSAYGGLTSPGLSYSL
       ::.::::::::::::: :: .   :  :.:. :.. .:::..:  :.:::    ::. .:
NP_000 LDVEIATYRKLLEGEECRLSGEGVGPVNISVVTSSVSSGYGSG--SGYGG----GLGGGL
            470       480       490       500         510          

     440        450       460       470       480                  
pF1KB8 GSSFGSG-AGSSSFSRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDVLPK               
       :...:.: ::.:: :  :::                                        
NP_000 GGGLGGGLAGGSSGSYYSSSSGGVGLGGGLSVGGSGFSASSGRGLGVGFGSGGGSSSSVK
        520       530       540       550       560       570      

>>NP_005545 (OMIM: 148041,615726) keratin, type II cytos  (564 aa)
 initn: 1739 init1: 1284 opt: 1715  Z-score: 932.3  bits: 182.1 E(85289): 3.4e-45
Smith-Waterman score: 1720; 62.3% identity (81.6% similar) in 478 aa overlap (9-461:67-535)

                                     10        20        30        
pF1KB8                       MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSRISSS-S
                                     : ..: .:    .: . ..: ::: ..: .
NP_005 SVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRSLYGLGGSKRISIGG----GSCAISGGYGSRAGGSYG
         40        50        60        70            80        90  

        40               50        60                  70        80
pF1KB8 FSRVGSS-NFRGG------LGGGYGGASGMGG----------ITAVTVNQSLLSPLVLEV
       :. .::. .: ::      :::: : :.:.::          :  ::::::::.:: :..
NP_005 FGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQI
            100       110       120       130       140       150  

               90       100       110       120         130        
pF1KB8 DPNIQAVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLETKWSLLQQQ--KTARSNMDN
       ::.:: ::..:.:::::::::::::::::::::::::.:::::.:::.:  ::.:.:.. 
NP_005 DPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEP
            160       170       180       190       200       210  

      140       150       160       170       180       190        
pF1KB8 MFESYINNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYEDEINKRTEMENEFVLIKK
       .::.:::::::::...  :. .:..:: .:: :::::::::::::::::  ::::: .::
NP_005 LFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELRGMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKK
            220       230       240       250       260       270  

      200       210       220       230       240       250        
pF1KB8 DVDVAYMNKVELESRLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDMDS
       :::.::::::::... . ::::::::: ::. :. ..:..::::::::::::.:.::.::
NP_005 DVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDS
            280       290       300       310       320       330  

      260       270       280       290       300       310        
pF1KB8 IIAEVKAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDLRRTKTEISEMNRNISRLQ
       ::::::::::.::.:::::::: :: ::::::  ::.:::::: :: ::.:.:: :.::.
NP_005 IIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLR
            340       350       360       370       380       390  

      320       330       340       350       360       370        
pF1KB8 AEIEGLKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAALQRAKQDMARQLREYQELM
       .::. .: : :.:.:::::::::::.:.:::. ::  :: :::.::::.:: :.::::::
NP_005 SEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELM
            400       410       420       430       440       450  

      380       390       400          410        420       430    
pF1KB8 NVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLES---GMQNMSI-HTKTTSGYAGGLSSAYGGL-TSP
       :::::::.::::::::::::: ::..   :. :.:. .. ..::: :: :.. .::  . 
NP_005 NVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNISVVQSTVSSGY-GGASGVGSGLGLGG
            460       470       480       490        500       510 

           440       450       460       470       480          
pF1KB8 GLSYSLGSSFGSGAGSSSFSRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDVLPK       
       : ::: ::..: :.: ::    ::.::.                             
NP_005 GSSYSYGSGLGVGGGFSS----SSGRAIGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
             520           530       540       550       560    

>>NP_775109 (OMIM: 612315,615735) keratin, type II cytos  (564 aa)
 initn: 1735 init1: 1287 opt: 1711  Z-score: 930.2  bits: 181.8 E(85289): 4.5e-45
Smith-Waterman score: 1716; 62.3% identity (81.2% similar) in 478 aa overlap (9-461:67-535)

                                     10        20        30        
pF1KB8                       MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSRISSS-S
                                     : ..: .:    .: . ..: ::: ..: .
NP_775 SVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRSLYGLGGSKRISIGG----GSCAISGGYGSRAGGSYG
         40        50        60        70            80        90  

        40               50        60                  70        80
pF1KB8 FSRVGSS-NFRGG------LGGGYGGASGMGG----------ITAVTVNQSLLSPLVLEV
       :. .::. .: ::      :::: : :.:.::          :  ::::::::.:: :..
NP_775 FGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQI
            100       110       120       130       140       150  

               90       100       110       120         130        
pF1KB8 DPNIQAVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLETKWSLLQQQ--KTARSNMDN
       :: :: ::..:.:::::::::::::::::::::::::.:.:::.:::.:  ::.:.:.. 
NP_775 DPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEP
            160       170       180       190       200       210  

      140       150       160       170       180       190        
pF1KB8 MFESYINNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYEDEINKRTEMENEFVLIKK
       .::.:::::::::...  :. .:..:: ::: ::::.::::::::::::  ::::: .::
NP_775 LFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELRNMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKK
            220       230       240       250       260       270  

      200       210       220       230       240       250        
pF1KB8 DVDVAYMNKVELESRLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDMDS
       :::.::::::::... . ::::::::: ::. :. ..:..::::::::::::.:.::.::
NP_775 DVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDS
            280       290       300       310       320       330  

      260       270       280       290       300       310        
pF1KB8 IIAEVKAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDLRRTKTEISEMNRNISRLQ
       ::::::::::.::.:::::::: :: ::::::  ::.:::::: :: ::.:.:: :.::.
NP_775 IIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLR
            340       350       360       370       380       390  

      320       330       340       350       360       370        
pF1KB8 AEIEGLKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAALQRAKQDMARQLREYQELM
       .::. .: : :::.:::::::::::.:.:::. ::  :: :::.::::.:: :.::::::
NP_775 SEIDHVKKQCASLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELM
            400       410       420       430       440       450  

      380       390       400          410        420       430    
pF1KB8 NVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLES---GMQNMSI-HTKTTSGYAGGLSSAYGGL-TSP
       :::::::.::::::::::::: ::..   :. :.:. ..  .::: :: :.. .::  . 
NP_775 NVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNVSVVQSTISSGY-GGASGVGSGLGLGG
            460       470       480       490        500       510 

           440       450       460       470       480          
pF1KB8 GLSYSLGSSFGSGAGSSSFSRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDVLPK       
       : ::: ::..: :.: ::    ::.::.                             
NP_775 GSSYSYGSGLGIGGGFSS----SSGRAIGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
             520           530       540       550       560    

>>NP_005546 (OMIM: 148042,615728) keratin, type II cytos  (564 aa)
 initn: 1336 init1: 1281 opt: 1703  Z-score: 926.0  bits: 181.0 E(85289): 7.7e-45
Smith-Waterman score: 1708; 62.3% identity (81.3% similar) in 477 aa overlap (9-460:67-534)

                                     10        20        30        
pF1KB8                       MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSRISSS-S
                                     : ..: .:    .: . ..: ::: ..: .
NP_005 SVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRSLYGLGGSKRISIGG----GSCAISGGYGSRAGGSYG
         40        50        60        70            80        90  

        40               50        60                  70        80
pF1KB8 FSRVGSS-NFRGG------LGGGYGGASGMGG----------ITAVTVNQSLLSPLVLEV
       :. .::. .: ::      :::: : :.:.::          :  ::::::::.:: :..
NP_005 FGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQI
            100       110       120       130       140       150  

               90       100       110       120         130        
pF1KB8 DPNIQAVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLETKWSLLQQQ--KTARSNMDN
       :: :: ::..:.:::::::::::::::::::::::::.:.:::.:::.:  ::.:.:.. 
NP_005 DPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEP
            160       170       180       190       200       210  

      140       150       160       170       180       190        
pF1KB8 MFESYINNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYEDEINKRTEMENEFVLIKK
       .::.:::::::::...  :. .:..:: ::: ::::.::::::::::::  ::::: .::
NP_005 LFEQYINNLRRQLDNIVGERGRLDSELRNMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKK
            220       230       240       250       260       270  

      200       210       220       230       240       250        
pF1KB8 DVDVAYMNKVELESRLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDMDS
       :::.::::::::... . ::::::::: ::. :. ..:..::::::::::::.:.::.::
NP_005 DVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDS
            280       290       300       310       320       330  

      260       270       280       290       300       310        
pF1KB8 IIAEVKAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDLRRTKTEISEMNRNISRLQ
       ::::::::::.::.:::::::: :: ::::::  ::.:::::: :: ::.:.:: :.::.
NP_005 IIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLR
            340       350       360       370       380       390  

      320       330       340       350       360       370        
pF1KB8 AEIEGLKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAALQRAKQDMARQLREYQELM
       .::. .: : :.:.:::::::::::.:.:::. ::  :: :::.::::.:: :.::::::
NP_005 SEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELM
            400       410       420       430       440       450  

      380       390       400          410        420       430    
pF1KB8 NVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLES---GMQNMSI-HTKTTSGYAGGLSSAYGGL-TSP
       :::::::.::::::::::::: ::..   :. :.:. .. ..::: :: :.. .::  . 
NP_005 NVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNISVVQSTVSSGY-GGASGVGSGLGLGG
            460       470       480       490        500       510 

           440       450       460       470       480          
pF1KB8 GLSYSLGSSFGSGAGSSSFSRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDVLPK       
       : ::: ::..: :.: ::    ::.::                              
NP_005 GSSYSYGSGLGVGGGFSS----SSGRATGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
             520           530       540       550       560    

>>NP_004684 (OMIM: 609025,612318) keratin, type II cytos  (551 aa)
 initn: 1396 init1: 1245 opt: 1696  Z-score: 922.4  bits: 180.3 E(85289): 1.2e-44
Smith-Waterman score: 1723; 63.2% identity (83.1% similar) in 462 aa overlap (11-457:70-526)

                                   10        20        30        40
pF1KB8                     MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSRISSSSFSR
                                     .:: .:     . :  :: :.: .:. :. 
NP_004 SAAGSGGLGRISSAGASFGSRSLYNLGGAKRVSING----CGSSCRSGFGGR-ASNRFGV
      40        50        60        70            80         90    

               50            60        70        80        90      
pF1KB8 VGSSNFRGGLGGGYGGAS----GMGGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEKEQIK
        .. .. ::.:::..: :      :::  ::::::::.:: :..::.:: ::..:.::::
NP_004 NSGFGYGGGVGGGFSGPSFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLHLQIDPTIQRVRAEEREQIK
          100       110       120       130       140       150    

        100       110       120         130       140       150    
pF1KB8 TLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLETKWSLLQQQ--KTARSNMDNMFESYINNLRRQLETL
       :::::::::::::::::::::.:::::.:::.:  .:.:.:.. .:.:: ..::::::..
NP_004 TLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWALLQEQGSRTVRQNLEPLFDSYTSELRRQLESI
          160       170       180       190       200       210    

          160       170       180       190       200       210    
pF1KB8 GQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYEDEINKRTEMENEFVLIKKDVDVAYMNKVELESRL
         :. .::::: ::: .::::: .:::::::::  ::::: .:::::.:::::::::...
NP_004 TTERGRLEAELRNMQDVVEDFKVRYEDEINKRTAAENEFVALKKDVDAAYMNKVELEAKV
          220       230       240       250       260       270    

          220       230       240       250       260       270    
pF1KB8 EGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIANRS
       ..: .::::...... :. .::.:..::::::::::.:.::.::::::::::::::::::
NP_004 KSLPEEINFIHSVFDAELSQLQTQVGDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEDIANRS
          280       290       300       310       320       330    

          280       290       300       310       320       330    
pF1KB8 RAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDLRRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLEAA
       :::::: :: ::::::  ::.:::::: :: ::::::: :.::.:::...: : .::..:
NP_004 RAEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEISEMNRMIQRLRAEIDSVKKQCSSLQTA
          340       350       360       370       380       390    

          340       350       360       370       380       390    
pF1KB8 IADAEQRGELAIKDANAKLSELEAALQRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYRKL
       :::::::::::.::: ::: .:: :::.::::::: :::::::::.:::::.::::::::
NP_004 IADAEQRGELALKDARAKLVDLEEALQKAKQDMARLLREYQELMNIKLALDVEIATYRKL
          400       410       420       430       440       450    

          400          410        420       430            440     
pF1KB8 LEGEESRLES-GMQ--NMSIHTKT-TSGYAGGLSSAYGGLTSPGLS-YSL----GSSFGS
       ::::: :: . :..  :.:. :.: .:::..: : . :.:   : : ::.    : :.:.
NP_004 LEGEECRLSGEGVSPVNISVVTSTLSSGYGSGSSIGGGNLGLGGGSGYSFTTSGGHSLGA
          460       470       480       490       500       510    

         450       460       470       480   
pF1KB8 GAGSSSFSRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDVLPK
       : :.:.:: ::.                          
NP_004 GLGGSGFSATSNRGLGGSGSSVKFVSTTSSSQKSYTH 
          520       530       540       550  

>>NP_005547 (OMIM: 148059) keratin, type II cytoskeletal  (469 aa)
 initn: 1279 init1: 1235 opt: 1686  Z-score: 918.0  bits: 179.2 E(85289): 2.1e-44
Smith-Waterman score: 1686; 62.7% identity (82.0% similar) in 472 aa overlap (9-470:6-469)

               10        20             30        40        50     
pF1KB8 MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSY-----TSGPGSRISSSSFSRVGSSNFRGGLGGGYG
               :  : ::   :::.:.      .. ::. ..:::.  .:.:  : .. ..::
NP_005    MSIHFSSPVFTSRSAAFSGRGAQVRLSSARPGG-LGSSSLYGLGASRPRVAVRSAYG
                  10        20        30         40        50      

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB8 GASGMGGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQ
       :  : .::  ::.:::::.:: :..::..: :: .:.:::::::::::::::::::::::
NP_005 GPVG-AGIREVTINQSLLAPLRLDADPSLQRVRQEESEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQ
         60         70        80        90       100       110     

         120       130        140       150       160       170    
pF1KB8 NKMLETKWSLLQQQKTARSN-MDNMFESYINNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGLVED
       ::.:::::.:::.::.:.:. . ..::. : .:: :::.:  .  .::::: .:: .:::
NP_005 NKLLETKWTLLQEQKSAKSSRLPDIFEAQIAGLRGQLEALQVDGGRLEAELRSMQDVVED
         120       130       140       150       160       170     

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB8 FKNKYEDEINKRTEMENEFVLIKKDVDVAYMNKVELESRLEGLTDEINFLRQLYEEEIRE
       ::::::::::.::  :::::..:::::.:::.:::::.....:.::::::: : : :. :
NP_005 FKNKYEDEINHRTAAENEFVVLKKDVDAAYMSKVELEAKVDALNDEINFLRTLNETELTE
         180       190       200       210       220       230     

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB8 LQSQISDTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAG
       :::::::::::::::::::::.:.::::::::::..:. ::::::. :: :.: ::. ::
NP_005 LQSQISDTSVVLSMDNSRSLDLDGIIAEVKAQYEEMAKCSRAEAEAWYQTKFETLQAQAG
         240       250       260       270       280       290     

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB8 KHGDDLRRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLS
       ::::::: :..::::::: :.::::::...:.:::.::::::.::.:::::.::: ::  
NP_005 KHGDDLRNTRNEISEMNRAIQRLQAEIDNIKNQRAKLEAAIAEAEERGELALKDARAKQE
         300       310       320       330       340       350     

          360       370       380       390       400          410 
pF1KB8 ELEAALQRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLES---GMQNMSI
       ::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: .   :  :.:.
NP_005 ELEAALQRGKQDMARQLREYQELMSVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLAGDGVGAVNISV
         360       370       380       390       400       410     

             420        430       440       450       460       470
pF1KB8 HTKTTSGYAGGLSSAYG-GLTSPGLSYSLGSSFGSGAGSSSFSRTSSSRAVVVKKIETRD
        ..:     :: ::. : :::  :   : . ::.:.:: . . .. : :.. ...  .::
NP_005 MNST-----GGSSSGGGIGLTLGGTMGSNALSFSSSAGPG-LLKAYSIRTASASRRSARD
              420       430       440       450        460         

              480   
pF1KB8 GKLVSESSDVLPK

>>NP_476429 (OMIM: 122100,148043) keratin, type II cytos  (628 aa)
 initn: 1618 init1: 1241 opt: 1652  Z-score: 898.5  bits: 176.0 E(85289): 2.6e-43
Smith-Waterman score: 1652; 60.8% identity (83.3% similar) in 449 aa overlap (16-454:127-566)

                              10        20        30        40     
pF1KB8                MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSRISSSSFSRVGSSN
                                     :  .:.. .  .:::.  .:..:.  :: .
NP_476 FGSGYGGGFGGGFGGGRGMGGGFGGAGGFGGAGGFGGAGGFGGPGGFGGSGGFGGPGSLG
        100       110       120       130       140       150      

          50         60        70        80        90       100    
pF1KB8 FRGGLG-GGYGGASGMGGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEKEQIKTLNNKFAS
         ::.: ::. :     ::  ::.:::::.:: .:.::.:  :..::.::::::::::::
NP_476 SPGGFGPGGFPG-----GIQEVTINQSLLQPLNVEIDPQIGQVKAQEREQIKTLNNKFAS
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