seq1 = pF1KB3144.tfa, 1725 bp seq2 = pF1KB3144/gi568815575r_48930161.tfa (gi568815575r:48930161_49143226), 213066 bp >pF1KB3144 1725 >gi568815575r:48930161_49143226 (ChrX) (complement) 1-116 (100001-100116) 100% -> 117-230 (102659-102772) 100% -> 231-534 (103817-104120) 100% -> 535-780 (104785-105030) 100% -> 781-885 (105113-105217) 100% -> 886-1003 (108976-109093) 100% -> 1004-1060 (109445-109501) 100% -> 1061-1136 (109687-109762) 100% -> 1137-1284 (111683-111830) 100% -> 1285-1725 (112626-113066) 99% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGTCTCATGCGGCCGAACCAGCTCGGGATGGCGTAGAGGCCAGCGCGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGTCTCATGCGGCCGAACCAGCTCGGGATGGCGTAGAGGCCAGCGCGGA 50 . : . : . : . : . : 51 GGGCCCTCGAGCCGTGTTCGTGCTGTTGGAGGAGCGCAGGCCGGCCGACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 GGGCCCTCGAGCCGTGTTCGTGCTGTTGGAGGAGCGCAGGCCGGCCGACT 100 . : . : . : . : . : 101 CGGCTCAGCTGCTCAG CCTGAACTCTTTGCTTCCGGAATCC ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 100101 CGGCTCAGCTGCTCAGGTG...CAGCCTGAACTCTTTGCTTCCGGAATCC 150 . : . : . : . : . : 142 GGGATTGTTGCTGACATAGAATTAGAAAACGTCCTTGATCCTGACAGCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102684 GGGATTGTTGCTGACATAGAATTAGAAAACGTCCTTGATCCTGACAGCTT 200 . : . : . : . : . : 192 CTACGAGCTCAAAAGCCAACCCTTACCCCTTCGCTCAAG CC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|| 102734 CTACGAGCTCAAAAGCCAACCCTTACCCCTTCGCTCAAGGTA...CAGCC 250 . : . : . : . : . : 233 TCCCAATATCACTGCAGGCCACACCAGCCACCCCAGCTACACTCTCTGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103819 TCCCAATATCACTGCAGGCCACACCAGCCACCCCAGCTACACTCTCTGCA 300 . : . : . : . : . : 283 TCGTCTTCTGCAGGGGGCTCCAGGACCCCTGCCATGTCGTCATCTTCTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103869 TCGTCTTCTGCAGGGGGCTCCAGGACCCCTGCCATGTCGTCATCTTCTTC 350 . : . : . : . : . : 333 ATCGAGGGTCTTGCTGCGGCAGCAGCTAATGCGGGCCCAGGCGCAGGAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103919 ATCGAGGGTCTTGCTGCGGCAGCAGCTAATGCGGGCCCAGGCGCAGGAGC 400 . : . : . : . : . : 383 AGGAGAGGCGTGAGCGTCGGGAACAGGCCGCCGCGGCTCCCTTCCCCAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103969 AGGAGAGGCGTGAGCGTCGGGAACAGGCCGCCGCGGCTCCCTTCCCCAGT 450 . : . : . : . : . : 433 CCTGCACCTGCCTCTCCTGCCATCTCTGTGGTTGGCGTCTCTGCTGGGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104019 CCTGCACCTGCCTCTCCTGCCATCTCTGTGGTTGGCGTCTCTGCTGGGGG 500 . : . : . : . : . : 483 CCACACATTGAGCCGTCCACCCCCTGCTCAGGTGCCCAGGGAGGTGCTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104069 CCACACATTGAGCCGTCCACCCCCTGCTCAGGTGCCCAGGGAGGTGCTCA 550 . : . : . : . : . : 533 AG GTGCAGACCCATCTGGAGAACCCAACGCGCTACCACCTG ||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104119 AGGTA...CAGGTGCAGACCCATCTGGAGAACCCAACGCGCTACCACCTG 600 . : . : . : . : . : 574 CAGCAGGCGCGCCGGCAGCAGGTGAAACAGTACCTGTCCACCACACTCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104824 CAGCAGGCGCGCCGGCAGCAGGTGAAACAGTACCTGTCCACCACACTCGG 650 . : . : . : . : . : 624 GCCCAAGCTGGCTTCCCAGGCCCTCACCCCACCGCCGGGGCCCGCAAGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104874 GCCCAAGCTGGCTTCCCAGGCCCTCACCCCACCGCCGGGGCCCGCAAGTG 700 . : . : . : . : . : 674 CCCAGCCACTGCCTGCCCCTGAGGCTGCCCACACTACCGGCCCCACAGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104924 CCCAGCCACTGCCTGCCCCTGAGGCTGCCCACACTACCGGCCCCACAGGC 750 . : . : . : . : . : 724 AGTGCGCCCAACAGCCCCATGGCGCTGCTCACCATCGGGTCCAGCTCAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104974 AGTGCGCCCAACAGCCCCATGGCGCTGCTCACCATCGGGTCCAGCTCAGA 800 . : . : . : . : . : 774 GAAGGAG ATTGATGATGTCATTGATGAGATCATCAGCCTGG |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| 105024 GAAGGAGGTA...TAGATTGATGATGTCATTGATGAGATCATCAGCCTGG 850 . : . : . : . : . : 815 AGTCCAGTTACAATGATGAAATGCTCAGCTATCTGCCCGGAGGCACCACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105147 AGTCCAGTTACAATGATGAAATGCTCAGCTATCTGCCCGGAGGCACCACA 900 . : . : . : . : . : 865 GGACTGCAGCTCCCCAGCACG CTGCCTGTGTCAGGGAATCT |||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||| 105197 GGACTGCAGCTCCCCAGCACGGTG...CAGCTGCCTGTGTCAGGGAATCT 950 . : . : . : . : . : 906 GCTTGATGTGTACAGTAGTCAAGGCGTGGCCACACCAGCCATCACTGTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108996 GCTTGATGTGTACAGTAGTCAAGGCGTGGCCACACCAGCCATCACTGTCA 1000 . : . : . : . : . : 956 GCAACTCCTGCCCAGCTGAGCTGCCCAACATCAAACGGGAGATCTCTG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>> 109046 GCAACTCCTGCCCAGCTGAGCTGCCCAACATCAAACGGGAGATCTCTGGT 1050 . : . : . : . : . : 1004 AGACCGAGGCAAAGGCCCTTTTGAAGGAACGGCAGAAGAAAGA >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109096 A...CAGAGACCGAGGCAAAGGCCCTTTTGAAGGAACGGCAGAAGAAAGA 1100 . : . : . : . : . : 1047 CAATCACAACCTAA TTGAGCGTCGCAGGCGATTCAACATTA ||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||| 109488 CAATCACAACCTAAGTA...AAGTTGAGCGTCGCAGGCGATTCAACATTA 1150 . : . : . : . : . : 1088 ACGACAGGATCAAGGAACTGGGCACTCTCATCCCTAAGTCCAGTGACCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||> 109714 ACGACAGGATCAAGGAACTGGGCACTCTCATCCCTAAGTCCAGTGACCCG 1200 . : . : . : . : . : 1137 GGAGATGCGCTGGAACAAGGGCACCATCCTGAAGGCCTCTGT >>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109764 TG...CAGGGAGATGCGCTGGAACAAGGGCACCATCCTGAAGGCCTCTGT 1250 . : . : . : . : . : 1179 GGATTATATCCGCAAGCTGCAGAAGGAGCAGCAGCGCTCCAAAGACCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 111725 GGATTATATCCGCAAGCTGCAGAAGGAGCAGCAGCGCTCCAAAGACCTGG 1300 . : . : . : . : . : 1229 AGAGCCGGCAGCGATCCCTGGAGCAGGCCAACCGCAGCCTGCAGCTCCGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 111775 AGAGCCGGCAGCGATCCCTGGAGCAGGCCAACCGCAGCCTGCAGCTCCGA 1350 . : . : . : . : . : 1279 ATTCAG GAACTAGAACTGCAGGCCCAGATCCATGGCCTGCC ||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||| 111825 ATTCAGGTT...CAGGAACTAGAACTGCAGGCCCAGATCCATGGCCTGCC 1400 . : . : . : . : . : 1320 AGTGCCTCCCACTCCAGGGCTGCTTTCCTTGGCCACGACTTCGGCTTCTG ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112661 AGTACCTCCCACTCCAGGGCTGCTTTCCTTGGCCACGACTTCGGCTTCTG 1450 . : . : . : . : . : 1370 ACAGCCTCAAGCCAGAGCAGCTGGACATTGAGGAGGAGGGCAGGCCAGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112711 ACAGCCTCAAGCCAGAGCAGCTGGACATTGAGGAGGAGGGCAGGCCAGGC 1500 . : . : . : . : . : 1420 GCAGCAACGTTCCATGTAGGGGGGGGACCTGCCCAGAATGCTCCCCATCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112761 GCAGCAACGTTCCATGTAGGGGGGGGACCTGCCCAGAATGCTCCCCATCA 1550 . : . : . : . : . : 1470 GCAGCCCCCTGCACCGCCCTCAGATGCCCTTCTGGACCTGCACTTTCCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112811 GCAGCCCCCTGCACCGCCCTCAGATGCCCTTCTGGACCTGCACTTTCCCA 1600 . : . : . : . : . : 1520 GCGACCACCTGGGGGACCTGGGAGACCCCTTCCACCTGGGGCTGGAGGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112861 GCGACCACCTGGGGGACCTGGGAGACCCCTTCCACCTGGGGCTGGAGGAC 1650 . : . : . : . : . : 1570 ATTCTGATGGAGGAGGAGGAGGGGGTGGTGGGAGGACTGTCGGGGGGTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112911 ATTCTGATGGAGGAGGAGGAGGGGGTGGTGGGAGGACTGTCGGGGGGTGC 1700 . : . : . : . : . : 1620 CCTGTCCCCACTGCGGGCTGCCTCCGATCCCCTGCTCTCTTCAGTGTCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112961 CCTGTCCCCACTGCGGGCTGCCTCCGATCCCCTGCTCTCTTCAGTGTCCC 1750 . : . : . : . : . : 1670 CTGCTGTCTCCAAGGCCAGCAGCCGCCGCAGCAGCTTCAGCATGGAAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113011 CTGCTGTCTCCAAGGCCAGCAGCCGCCGCAGCAGCTTCAGCATGGAAGAG 1800 . 1720 GAGTCC |||||| 113061 GAGTCC