Result of FASTA (ccds) for pF1KB6699
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6699, 304 aa
  1>>>pF1KB6699 304 - 304 aa - 304 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0613+/-0.000757; mu= 12.5396+/- 0.046
 mean_var=88.1834+/-17.717, 0's: 0 Z-trim(110.7): 74  B-trim: 104 in 2/50
 Lambda= 0.136578
 statistics sampled from 11741 (11815) to 11741 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.731), E-opt: 0.2 (0.363), width:  16
 Scan time:  2.700

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS33107.1 KIR2DL3 gene_id:3804|Hs108|chr19       ( 341) 2020 407.5  7e-114
CCDS12904.1 KIR2DL1 gene_id:3802|Hs108|chr19       ( 348) 1887 381.3 5.5e-106
CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19       ( 444) 1635 331.7   6e-91
CCDS12906.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19       ( 455) 1599 324.7 8.3e-89
CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19       ( 438) 1144 235.0 7.9e-62
CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19       ( 273) 1068 219.9 1.7e-57
CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19     ( 410) 1055 217.4 1.4e-56
CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19       ( 342)  916 190.0 2.1e-48
CCDS33105.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19       ( 631)  683 144.3 2.4e-34
CCDS46175.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19       ( 632)  683 144.3 2.4e-34
CCDS62803.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19       ( 634)  673 142.3 9.3e-34
CCDS42615.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19       ( 651)  631 134.0 2.9e-31
CCDS42614.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19       ( 652)  631 134.0 2.9e-31
CCDS42617.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19       ( 650)  629 133.6 3.8e-31
CCDS42616.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19       ( 651)  629 133.6 3.9e-31
CCDS62791.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19       ( 482)  600 127.8 1.6e-29
CCDS62792.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19       ( 510)  600 127.8 1.7e-29
CCDS12886.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19       ( 598)  600 127.9 1.9e-29
CCDS42612.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19       ( 597)  598 127.5 2.5e-29
CCDS42610.1 LILRA6 gene_id:79168|Hs108|chr19       ( 481)  594 126.6 3.6e-29
CCDS12901.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19       ( 489)  579 123.7 2.8e-28
CCDS46179.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19       ( 483)  568 121.5 1.2e-27
CCDS12890.1 LILRA4 gene_id:23547|Hs108|chr19       ( 499)  562 120.4 2.9e-27
CCDS74453.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19       ( 454)  557 119.3 5.3e-27
CCDS12900.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19       ( 466)  557 119.3 5.4e-27
CCDS42611.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19       ( 491)  549 117.8 1.7e-26
CCDS12885.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19       ( 590)  549 117.8   2e-26
CCDS46176.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19       ( 591)  549 117.8   2e-26
CCDS12888.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19      ( 299)  509 109.8 2.7e-24
CCDS12889.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19      ( 287)  493 106.6 2.3e-23
CCDS46182.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19          ( 287)  455 99.1 4.1e-21
CCDS46181.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19          ( 303)  437 95.6   5e-20
CCDS12911.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19          ( 304)  437 95.6   5e-20
CCDS62802.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19       ( 289)  427 93.6 1.9e-19
CCDS46184.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19          ( 339)  368 82.0 6.8e-16
CCDS42626.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19          ( 620)  368 82.2 1.1e-15
CCDS58678.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19          ( 321)  339 76.3 3.4e-14
CCDS62789.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19       ( 271)  319 72.3 4.6e-13
CCDS74444.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19       ( 282)  309 70.4 1.8e-12
CCDS12876.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19       ( 286)  309 70.4 1.9e-12
CCDS12874.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19       ( 252)  293 67.2 1.5e-11
CCDS42622.1 FCAR gene_id:2204|Hs108|chr19          ( 265)  286 65.8 4.1e-11
CCDS12875.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19       ( 263)  283 65.2 6.1e-11
CCDS12873.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19       ( 267)  283 65.2 6.1e-11


>>CCDS33107.1 KIR2DL3 gene_id:3804|Hs108|chr19            (341 aa)
 initn: 2020 init1: 2020 opt: 2020  Z-score: 2158.0  bits: 407.5 E(32554): 7e-114
Smith-Waterman score: 2020; 95.7% identity (98.0% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-304)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFEHFLL
       ::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS33 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHFLL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 HREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
       :::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 FQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKTGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS33 FQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSETGN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 PRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDSDEQDHQE
       ::::::::::::: : : .:::::::::: :::::.::::::::::::: ::::::: ::
CCDS33 PRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDSDEQDPQE
              250       260       270       280       290       300

                                                
pF1KB6 VSYA                                     
       :.::                                     
CCDS33 VTYAQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAEP
              310       320       330       340 

>>CCDS12904.1 KIR2DL1 gene_id:3802|Hs108|chr19            (348 aa)
 initn: 2144 init1: 1643 opt: 1887  Z-score: 2016.2  bits: 381.3 E(32554): 5.5e-106
Smith-Waterman score: 1887; 91.4% identity (95.7% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-302)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFEHFLL
       :::.:::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::: ::::::
CCDS12 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 HREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
       :::: ..:::.::::::::::::::::. : :::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS12 HREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVSAPSDPLDI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT
       :: ::::::::::: ::::::::.::::::::::::::::::::::::::. ::::::::
CCDS12 VIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAGPKVNGT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 FQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKTGN
       ::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FQADFPLGPATHGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKTGN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 PRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDSDEQDHQE
       :::::.::::::: : : ::::::::::::::::::::::: :::::.::::::::: ::
CCDS12 PRHLHILIGTSVVIILF-ILLFFLLHRWCSNKKNAAVMDQESAGNRTANSEDSDEQDPQE
              250        260       270       280       290         

                                                        
pF1KB6 VSYA                                             
       :.:                                              
CCDS12 VTYTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAESRSKVVSCP
     300       310       320       330       340        

>>CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19            (444 aa)
 initn: 1635 init1: 1635 opt: 1635  Z-score: 1746.3  bits: 331.7 E(32554): 6e-91
Smith-Waterman score: 1635; 84.7% identity (90.7% similar) in 281 aa overlap (24-304:119-399)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB6        MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV
                                     : :::::::::::::::: : ::::::::.
CCDS42 HAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPVVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDI
       90       100       110       120       130       140        

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB6 RFEHFLLHREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSA
        ::::.::.::  ::  .:.:. :::::::::::::::  :::::::::::::.::::::
CCDS42 MFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSA
      150       160       170       180       190       200        

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB6 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSA
       ::::::::.:: :::::::::::: : :::::::::::::::::::::::: :::::. :
CCDS42 PSDPLDIVVTGPYEKPSLSAQPGPKVQAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHERRLPA
      210       220       230       240       250       260        

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB6 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE
         ::: :::::::::::::::::::::::: ::::::. :::::::::::::.:::::::
CCDS42 VRKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRHSPYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTE
      270       280       290       300       310       320        

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB6 PSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDS
       ::::.:::::::.::::::: : : .::::::: ::::::::::::::::::::.:::::
CCDS42 PSSKSGNPRHLHILIGTSVVIILFILLLFFLLHLWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTANSEDS
      330       340       350       360       370       380        

           300                                                 
pF1KB6 DEQDHQEVSYA                                             
       :::: .::.::                                             
CCDS42 DEQDPEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDTILYTELPNAKPRSKVVSCP
      390       400       410       420       430       440    

>--
 initn: 335 init1: 198 opt: 315  Z-score: 340.6  bits: 71.7 E(32554): 1.2e-12
Smith-Waterman score: 315; 44.7% identity (64.2% similar) in 123 aa overlap (1-123:1-118)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFEHFLL
       ::::::::::::.::.: : :: : . :: : : :. .:     : :.:    ::..:.:
CCDS42 MSLMVVSMACVGLFLVQRAGPHMGGQDKPFLSAWPSAVVPRGGHVTLRCHYRHRFNNFML
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 HREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
       ..:    : .: :   :  . . .:...:.    ::.: : ::  :::   ::::.:. :
CCDS42 YKE----DRIH-IPIFHGRIFQESFNMSPVTTAHAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPVVI
                    70        80        90       100       110     

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT
       ..:                                                         
CCDS42 MVTGNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDIMFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGV
         120       130       140       150       160       170     

>>CCDS12906.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19            (455 aa)
 initn: 1599 init1: 1599 opt: 1599  Z-score: 1707.8  bits: 324.7 E(32554): 8.3e-89
Smith-Waterman score: 1599; 84.0% identity (90.4% similar) in 281 aa overlap (24-304:119-399)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB6        MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV
                                     : :::::::::::::.:: :::::::::::
CCDS12 HAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDV
       90       100       110       120       130       140        

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB6 RFEHFLLHREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSA
        ::::.:::::  .:  .:.:. :::::::::::::.:  ::::::::::: ::::::::
CCDS12 MFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPLMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSA
      150       160       170       180       190       200        

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB6 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSA
       :::::::::::::::::::::::::: :::.::::::: ::::.:::::::::::::. :
CCDS12 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSWSSYDIYHLSREGEAHERRLRA
      210       220       230       240       250       260        

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB6 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE
        :::: ::::::::::::::::::::::::  :  :::::::::::::::::.:::::::
CCDS12 VPKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRALPCVWSNSSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTE
      270       280       290       300       310       320        

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB6 PSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDS
       ::::.:  :::::::::::: . : .::::::.::::::::::::::::::.:::: .::
CCDS12 PSSKSGICRHLHVLIGTSVVIFLFILLLFFLLYRWCSNKKNAAVMDQEPAGDRTVNRQDS
      330       340       350       360       370       380        

           300                                                     
pF1KB6 DEQDHQEVSYA                                                 
       :::: :::.::                                                 
CCDS12 DEQDPQEVTYAQLDHCVFIQRKISRPSQRPKTPLTDTSVYTELPNAEPRSKVVSCPRAPQ
      390       400       410       420       430       440        

>--
 initn: 323 init1: 192 opt: 336  Z-score: 362.8  bits: 75.8 E(32554): 6.9e-14
Smith-Waterman score: 336; 48.0% identity (62.6% similar) in 123 aa overlap (1-123:1-118)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFEHFLL
       ::: :::::::::::::::::  : . :: : :.:. .:     : :::     :..:.:
CCDS12 MSLTVVSMACVGFFLLQGAWPLMGGQDKPFLSARPSTVVPRGGHVALQCHYRRGFNNFML
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 HREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
       ..:    :  : .   :  . . .: .::.    :::::: ::  ::    ::::.:: :
CCDS12 YKE----DRSH-VPIFHGRIFQESFIMGPVTPAHAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVI
                    70        80        90       100       110     

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT
       ..:                                                         
CCDS12 MVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDVMFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGV
         120       130       140       150       160       170     

>>CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19            (438 aa)
 initn: 1144 init1: 1144 opt: 1144  Z-score: 1223.5  bits: 235.0 E(32554): 7.9e-62
Smith-Waterman score: 1440; 78.6% identity (84.3% similar) in 281 aa overlap (24-304:119-382)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB6        MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV
                                     : :::::::::::::.:: :::::::::::
CCDS58 HAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDV
       90       100       110       120       130       140        

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB6 RFEHFLLHREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSA
        ::::.:::::  .:  .:.:. :::::::::::::.:  ::::::::::: ::::::::
CCDS58 MFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPLMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSA
      150       160       170       180       190       200        

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB6 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSA
       :::::::::::::::::::::::::: :::.::::::: ::::.:::::::::::::. :
CCDS58 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSWSSYDIYHLSREGEAHERRLRA
      210       220       230       240       250       260        

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB6 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE
        :::: ::::::::::::::::::::::::  :  ::::::::::::::           
CCDS58 VPKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRALPCVWSNSSDPLLVSVTGIC---------
      270       280       290       300       310                  

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB6 PSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDS
               :::::::::::: . : .::::::.::::::::::::::::::.:::: .::
CCDS58 --------RHLHVLIGTSVVIFLFILLLFFLLYRWCSNKKNAAVMDQEPAGDRTVNRQDS
             320       330       340       350       360       370 

           300                                                     
pF1KB6 DEQDHQEVSYA                                                 
       :::: :::.::                                                 
CCDS58 DEQDPQEVTYAQLDHCVFIQRKISRPSQRPKTPLTDTSVYTELPNAEPRSKVVSCPRAPQ
             380       390       400       410       420       430 

>--
 initn: 323 init1: 192 opt: 336  Z-score: 363.1  bits: 75.8 E(32554): 6.6e-14
Smith-Waterman score: 336; 48.0% identity (62.6% similar) in 123 aa overlap (1-123:1-118)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFEHFLL
       ::: :::::::::::::::::  : . :: : :.:. .:     : :::     :..:.:
CCDS58 MSLTVVSMACVGFFLLQGAWPLMGGQDKPFLSARPSTVVPRGGHVALQCHYRRGFNNFML
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 HREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
       ..:    :  : .   :  . . .: .::.    :::::: ::  ::    ::::.:: :
CCDS58 YKE----DRSH-VPIFHGRIFQESFIMGPVTPAHAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVI
                    70        80        90       100       110     

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT
       ..:                                                         
CCDS58 MVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDVMFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGV
         120       130       140       150       160       170     

>>CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19            (273 aa)
 initn: 1042 init1: 949 opt: 1068  Z-score: 1145.6  bits: 219.9 E(32554): 1.7e-57
Smith-Waterman score: 1068; 60.8% identity (75.8% similar) in 273 aa overlap (1-273:3-270)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB6   MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFEHF
         ::  :. .::.:::: :..: : : . ::   : :. .: .   : :.:     :. :
CCDS42 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB6 LLHREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPL
        :..    :: .  . : .. .   .: :.:.    :::::: :   ::: . ::::.::
CCDS42 TLYK----KDGVP-VPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPL
                    70        80        90       100       110     

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB6 DIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVN
        :..:::::::::.:.::::: :::.:::::::.::.:.::::::::::: :. : :..:
CCDS42 VIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSIN
         120       130       140       150       160       170     

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB6 GTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKT
       ::::::::::::::: ::::::::. ::::::. :::: ::::::::.::::::::: ::
CCDS42 GTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKT
         180       190       200       210       220       230     

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB6 GNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDSDEQDH
       :  ::::..:  ::. : :::: :::::::::.::                         
CCDS42 GIARHLHAVIRYSVAIILFTILPFFLLHRWCSKKKMLL                      
         240       250       260       270                         

      300    
pF1KB6 QEVSYA

>>CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19          (410 aa)
 initn: 1663 init1: 1055 opt: 1055  Z-score: 1129.2  bits: 217.4 E(32554): 1.4e-56
Smith-Waterman score: 1374; 73.7% identity (84.7% similar) in 281 aa overlap (24-304:119-382)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB6        MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV
                                     :::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS12 HAGTYRCCSSHPHSPTGWSAPSNPVVIMVTGVHRKPSLLAHPGPLVKSGETVILQCWSDV
       90       100       110       120       130       140        

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB6 RFEHFLLHREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSA
       :::.:::::::  .: :.:.:. ::. :..:.:.:::   :::::::.::::: ::.:::
CCDS12 RFERFLLHREGITEDPLRLVGQLHDAGSQVNYSMGPMTPALAGTYRCFGSVTHLPYELSA
      150       160       170       180       190       200        

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB6 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSA
       ::::::::..::: :::::::::::: :::.::::::::: .:.::::::.:: : :..:
CCDS12 PSDPLDIVVVGLYGKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSLFDIYHLSREAEAGELRLTA
      210       220       230       240       250       260        

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB6 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE
         .:::::::.:::::.::::.::::::::  :. ::. :::: ::::::          
CCDS12 VLRVNGTFQANFPLGPVTHGGNYRCFGSFRALPHAWSDPSDPLPVSVTGNS---------
      270       280       290       300       310                  

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB6 PSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDS
               :.:::::::::: :::.:::::::::::.:::::.::::::::::::: :::
CCDS12 --------RNLHVLIGTSVVIIPFAILLFFLLHRWCANKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDS
             320       330       340       350       360       370 

           300                                
pF1KB6 DEQDHQEVSYA                            
       :::: :::.::                            
CCDS12 DEQDPQEVTYAQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDTSV
             380       390       400       410

>--
 initn: 361 init1: 236 opt: 353  Z-score: 381.6  bits: 79.1 E(32554): 6.2e-15
Smith-Waterman score: 353; 48.0% identity (66.7% similar) in 123 aa overlap (1-123:1-118)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFEHFLL
       ::::::::::::::::.: ::: : . :: : : :: .:.  . : ::: : . :..: :
CCDS12 MSLMVVSMACVGFFLLEGPWPHVGGQDKPFLSAWPGTVVSEGQHVTLQCRSRLGFNEFSL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 HREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
        .:    : .  . : .. . . .: .::.    :::::: .:  :::   ::::.:. :
CCDS12 SKE----DGMP-VPELYNRIFRNSFLMGPVTPAHAGTYRCCSSHPHSPTGWSAPSNPVVI
                    70        80        90       100       110     

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT
       ..:                                                         
CCDS12 MVTGVHRKPSLLAHPGPLVKSGETVILQCWSDVRFERFLLHREGITEDPLRLVGQLHDAG
         120       130       140       150       160       170     

>>CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19            (342 aa)
 initn: 890 init1: 797 opt: 916  Z-score: 982.3  bits: 190.0 E(32554): 2.1e-48
Smith-Waterman score: 1001; 54.9% identity (68.4% similar) in 304 aa overlap (1-304:3-266)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB6   MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFEHF
         ::  :. .::.:::: :..: : : . ::   : :. .: .   : :.:     :. :
CCDS42 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB6 LLHREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPL
        :..    :: .  . : .. .   .: :.:.    :::::: :   ::: . ::::.::
CCDS42 TLYK----KDGVP-VPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPL
                    70        80        90       100       110     

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB6 DIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVN
        :..:::::::::.:.::::: :::.:::::::.::.:.::::::::::: :. : :..:
CCDS42 VIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSIN
         120       130       140       150       160       170     

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB6 GTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKT
       ::::::::::::::: ::::::::. ::::::. :::: ::::::::.::::::::: ::
CCDS42 GTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKT
         180       190       200       210       220       230     

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB6 GNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDSDEQDH
                                          .::::.:::::.:::: ::::::: 
CCDS42 -----------------------------------DAAVMNQEPAGHRTVNREDSDEQDP
                                            240       250       260

      300                                                          
pF1KB6 QEVSYA                                                      
       :::.::                                                      
CCDS42 QEVTYAQLDHCIFTQRKITGPSQRSKRPSTDTSVCIELPNAEPRALSPAHEHHSQALMGS
              270       280       290       300       310       320

>>CCDS33105.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19            (631 aa)
 initn: 999 init1: 402 opt: 683  Z-score: 730.3  bits: 144.3 E(32554): 2.4e-34
Smith-Waterman score: 687; 43.1% identity (69.4% similar) in 281 aa overlap (24-292:220-495)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB6        MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV
                                     :: ::::::.  ::..   ... ::: :::
CCDS33 HRWRFTCYYYYTNTPWVWSHPSDPLEILPSGVSRKPSLLTLQGPVLAPGQSLTLQCGSDV
     190       200       210       220       230       240         

            60        70         80        90       100       110  
pF1KB6 RFEHFLLHREGKYKDTLHLIGEH-HDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLS
        ...:.:..::. .: :.  :.. . :.:.:::..::. .. .: :::::. . :  . :
CCDS33 GYDRFVLYKEGE-RDFLQRPGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSS-EWS
     250       260        270       280       290       300        

            120        130       140       150       160       170 
pF1KB6 APSDPLDIVITG-LYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRF
       ::::::::.::: .:.  :::::::::: .::..:: :.::. .: . :..:: ::    
CCDS33 APSDPLDILITGQIYDTVSLSAQPGPTVASGENMTLLCQSRGYFDTFLLTKEGAAHPPLR
       310       320       330       340       350       360       

             180       190         200       210       220         
pF1KB6 SAGPKVNGTFQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWP
         .      .::.::..:.:  :.:::::.::  ..:.  :  :.:: . :.:. ..:  
CCDS33 LRSMYGAHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSRSSNPHLLSFPSEPLELMVSGHSGGSSL
       370       380       390       400       410       420       

     230       240       250       260               270       280 
pF1KB6 SPTEPSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLL--------HRWCSNKKNAAVMDQE
        :: : :  :  :.:.::::.::. . . .::.:::        ::  ...:.     :.
CCDS33 PPTGPPSTPGLGRYLEVLIGVSVAFVLLLFLLLFLLLLRQRHSKHRTSDQRKTDF---QR
       430       440       450       460       470       480       

             290       300                                         
pF1KB6 PAGNRTVNSEDSDEQDHQEVSYA                                     
       :::   .. .:                                                 
CCDS33 PAGAAETEPKDRGLLRRSSPAADVQEENLYAAVKDTQSEDRVELDSQSPHDEDPQAVTYA
          490       500       510       520       530       540    

>--
 initn: 312 init1: 197 opt: 440  Z-score: 471.5  bits: 96.4 E(32554): 6.1e-20
Smith-Waterman score: 440; 34.7% identity (63.5% similar) in 222 aa overlap (1-218:1-216)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFEHFLL
       :.  .... :.:. :   .  . :   ::.: :.:: ...    : . : .... ... :
CCDS33 MTPALTALLCLGLSLGPRTRMQAGPFPKPTLWAEPGSVISWGSPVTIWCQGSLEAQEYQL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 HREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
        .::. .   .  ..  .  .:: :::  : :  :: :::.    .:    : :::::..
CCDS33 DKEGSPEPWDR--NNPLEPKNKARFSIPSMTQHHAGRYRCH---YYSSAGWSEPSDPLEL
               70          80        90          100       110     

              130       140       150       160         170        
pF1KB6 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHE--RRFSAGPKVN
       :.::.:.::.::: :.:.: .: ..:: :.:...:  . : .::: :.  : ...    .
CCDS33 VMTGFYNKPTLSALPSPVVASGGNMTLRCGSQKGYHHFVLMKEGE-HQLPRTLDSQQLHS
         120       130       140       150       160        170    

      180       190         200       210       220       230      
pF1KB6 GTFQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSS
       : ::: ::.::.:  :   . :.  . ..:. ::. :::: .                  
CCDS33 GGFQALFPVGPVTPSHRWRFTCYYYYTNTPWVWSHPSDPLEILPSGVSRKPSLLTLQGPV
          180       190       200       210       220       230    

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB6 KTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDSDEQ
                                                                   
CCDS33 LAPGQSLTLQCGSDVGYDRFVLYKEGERDFLQRPGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQY
          240       250       260       270       280       290    

>>CCDS46175.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19            (632 aa)
 initn: 999 init1: 402 opt: 683  Z-score: 730.2  bits: 144.3 E(32554): 2.4e-34
Smith-Waterman score: 687; 43.1% identity (69.4% similar) in 281 aa overlap (24-292:220-495)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB6        MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV
                                     :: ::::::.  ::..   ... ::: :::
CCDS46 HRWRFTCYYYYTNTPWVWSHPSDPLEILPSGVSRKPSLLTLQGPVLAPGQSLTLQCGSDV
     190       200       210       220       230       240         

            60        70         80        90       100       110  
pF1KB6 RFEHFLLHREGKYKDTLHLIGEH-HDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLS
        ...:.:..::. .: :.  :.. . :.:.:::..::. .. .: :::::. . :  . :
CCDS46 GYDRFVLYKEGE-RDFLQRPGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSS-EWS
     250       260        270       280       290       300        

            120        130       140       150       160       170 
pF1KB6 APSDPLDIVITG-LYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRF
       ::::::::.::: .:.  :::::::::: .::..:: :.::. .: . :..:: ::    
CCDS46 APSDPLDILITGQIYDTVSLSAQPGPTVASGENMTLLCQSRGYFDTFLLTKEGAAHPPLR
       310       320       330       340       350       360       

             180       190         200       210       220         
pF1KB6 SAGPKVNGTFQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWP
         .      .::.::..:.:  :.:::::.::  ..:.  :  :.:: . :.:. ..:  
CCDS46 LRSMYGAHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSRSSNPHLLSFPSEPLELMVSGHSGGSSL
       370       380       390       400       410       420       

     230       240       250       260               270       280 
pF1KB6 SPTEPSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLL--------HRWCSNKKNAAVMDQE
        :: : :  :  :.:.::::.::. . . .::.:::        ::  ...:.     :.
CCDS46 PPTGPPSTPGLGRYLEVLIGVSVAFVLLLFLLLFLLLLRQRHSKHRTSDQRKTDF---QR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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