Result of FASTA (omim) for pF1KE0636
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0636, 378 aa
  1>>>pF1KE0636 378 - 378 aa - 378 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1604+/-0.000765; mu= 8.9643+/- 0.047
 mean_var=295.1728+/-60.676, 0's: 0 Z-trim(112.4): 2066  B-trim: 118 in 2/49
 Lambda= 0.074651
 statistics sampled from 19022 (21362) to 19022 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.588), E-opt: 0.2 (0.25), width:  16
 Scan time:  7.050

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001070663 (OMIM: 611703) zinc finger protein 43 ( 470) 1153 138.7 2.6e-32
NP_085137 (OMIM: 611703) zinc finger protein 436 [ ( 470) 1153 138.7 2.6e-32
NP_001305065 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3  ( 453) 1144 137.7   5e-32
XP_006716174 (OMIM: 194510) PREDICTED: zinc finger ( 410) 1135 136.7 9.3e-32
XP_016868071 (OMIM: 194510) PREDICTED: zinc finger ( 410) 1135 136.7 9.3e-32
XP_016868072 (OMIM: 194510) PREDICTED: zinc finger ( 410) 1135 136.7 9.3e-32
NP_001265220 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3  ( 410) 1135 136.7 9.3e-32
NP_001265221 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3  ( 410) 1135 136.7 9.3e-32
NP_001305064 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3  ( 446) 1135 136.8 9.7e-32
NP_001265219 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3  ( 446) 1135 136.8 9.7e-32
NP_116313 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 iso ( 446) 1135 136.8 9.7e-32
NP_001265216 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3  ( 446) 1135 136.8 9.7e-32
NP_001265213 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3  ( 446) 1135 136.8 9.7e-32
XP_011540503 (OMIM: 611703) PREDICTED: zinc finger ( 452) 1117 134.8 3.8e-31
XP_011533137 (OMIM: 604082) PREDICTED: zinc finger ( 457) 1056 128.3 3.6e-29
NP_003431 (OMIM: 604082) zinc finger protein 140 i ( 457) 1056 128.3 3.6e-29
NP_001269327 (OMIM: 194500) zinc finger protein 2  ( 387) 1053 127.8 4.1e-29
NP_001275690 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 349) 1051 127.6 4.5e-29
XP_016882739 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1051 127.6 4.5e-29
XP_016882745 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1051 127.6 4.5e-29
XP_016882744 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1051 127.6 4.5e-29
XP_016882742 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1051 127.6 4.5e-29
XP_016882743 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1051 127.6 4.5e-29
NP_001275691 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 349) 1051 127.6 4.5e-29
XP_016882740 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1051 127.6 4.5e-29
NP_001275689 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 349) 1051 127.6 4.5e-29
XP_016882741 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1051 127.6 4.5e-29
XP_016881871 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1051 127.8 5.6e-29
NP_001317411 (OMIM: 613904) zinc finger protein 56 ( 527) 1051 127.8 5.6e-29
XP_016881868 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1051 127.8 5.6e-29
XP_016881869 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1051 127.8 5.6e-29
XP_016881867 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 650) 1051 128.0 6.3e-29
NP_001265438 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 665) 1051 128.0 6.4e-29
NP_001278562 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 665) 1051 128.0 6.4e-29
NP_001265437 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 667) 1051 128.0 6.4e-29
XP_011524841 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1051 128.0 6.5e-29
XP_016881865 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1051 128.0 6.5e-29
NP_689697 (OMIM: 613904) zinc finger protein 569 i ( 686) 1051 128.0 6.5e-29
XP_016881866 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1051 128.0 6.5e-29
NP_001275688 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 691) 1051 128.0 6.5e-29
NP_037388 (OMIM: 606740) zinc finger protein 180 i ( 692) 1051 128.0 6.5e-29
XP_006723109 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1051 128.0 6.6e-29
XP_006723111 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1051 128.0 6.6e-29
XP_011524840 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1051 128.0 6.6e-29
XP_006723110 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1051 128.0 6.6e-29
XP_011525582 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 734) 1051 128.0 6.7e-29
XP_011533135 (OMIM: 604082) PREDICTED: zinc finger ( 458) 1044 127.0 8.8e-29
XP_011533136 (OMIM: 604082) PREDICTED: zinc finger ( 458) 1044 127.0 8.8e-29
XP_005272399 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 542) 1040 126.7 1.3e-28
XP_005272398 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1040 126.8 1.5e-28


>>NP_001070663 (OMIM: 611703) zinc finger protein 436 [H  (470 aa)
 initn: 1026 init1: 1026 opt: 1153  Z-score: 701.0  bits: 138.7 E(85289): 2.6e-32
Smith-Waterman score: 1153; 44.0% identity (70.7% similar) in 389 aa overlap (1-378:7-385)

                     10        20        30        40        50    
pF1KE0       MISFQESVTFQDVAVDFTAEEWQLLDCAERTLYWDVMLENYRNLISVGCPI-TK
             : . :  :::.:.:. .: :::. :: :.: :: ::: ::: :..:.   : ..
NP_001 MAATLLMAGSQAPVTFEDMAMYLTREEWRPLDAAQRDLYRDVMQENYGNVVSLDFEIRSE
               10        20        30        40        50        60

            60         70           80        90             100   
pF1KE0 TKVILKVEQGQE-PWMVEGANPHESS---PESDYPLVDEPGKHRESK------DNFLKSV
       ..:  : : ...  . . .  : :..   :::.  .  : : . : .      .....  
NP_001 NEVNPKQEISEDVQFGTTSERPAENAEENPESEEGF--ESGDRSERQWGDLTAEEWVSYP
               70        80        90         100       110        

           110       120       130       140       150       160   
pF1KE0 LLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMRKKSYKSFEKCLPPNLDLLKYNRSYTVENAYECSE
       :   . .:. ...:        . .: .  .   : .    :: ......: .  :.: :
NP_001 LQPVTDLLVHKEVH--------TGIRYHICSHCGKAFSQISDLNRHQKTHTGDRPYKCYE
      120       130               140       150       160       170

           170       180       190       200       210       220   
pF1KE0 CGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQKIHNGERPFVCNDCGKA
       :::.:... :.:.:...:: ..:..::.:::...:..::  :: ::.::.:  ::.:::.
NP_001 CGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQTIHTGEKPHKCNECGKS
              180       190       200       210       220       230

           230       240       250       260       270       280   
pF1KE0 FMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTLEKSFECKECGKTFRYS
       : . ..:. ::: :.::::::: .:::.:. .: . :: ..:: :: .::.:::. :   
NP_001 FCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTGEKPYECNECGRGFSER
              240       250       260       270       280       290

           290       300       310       320       330       340   
pF1KE0 SSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPYSCIECGKAFIKKSHLL
       :.: :: : ::::.::.:  ::: :...: :: :.: ::::::: : :::. : . :::.
NP_001 SDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPYHCNECGENFSRISHLV
              300       310       320       330       340       350

           350       360       370                                 
pF1KE0 RHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT                         
       .:: ::::::::::: :::.::..:.::.::::::                         
NP_001 QHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNECWRSFGERSDLIKHQR
              360       370       380       390       400       410

NP_001 THTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKSFSRSSALIKHKRVHTD
              420       430       440       450       460       470

>--
 initn: 387 init1: 387 opt: 387  Z-score: 255.2  bits: 56.2 E(85289): 1.8e-07
Smith-Waterman score: 387; 58.3% identity (83.3% similar) in 84 aa overlap (295-378:386-469)

          270       280       290       300       310       320    
pF1KE0 HTLEKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGE
                                     :::::.:  : ..::. : :. ::: ::::
NP_001 HTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNECWRSFGERSDLIKHQRTHTGE
         360       370       380       390       400       410     

          330       340       350       360       370         
pF1KE0 KPYSCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT 
       ::: :..:::.: ..:.:. :: .:::::::::..: :.::..: :: :...:: 
NP_001 KPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKSFSRSSALIKHKRVHTD
         420       430       440       450       460       470

>>NP_085137 (OMIM: 611703) zinc finger protein 436 [Homo  (470 aa)
 initn: 1026 init1: 1026 opt: 1153  Z-score: 701.0  bits: 138.7 E(85289): 2.6e-32
Smith-Waterman score: 1153; 44.0% identity (70.7% similar) in 389 aa overlap (1-378:7-385)

                     10        20        30        40        50    
pF1KE0       MISFQESVTFQDVAVDFTAEEWQLLDCAERTLYWDVMLENYRNLISVGCPI-TK
             : . :  :::.:.:. .: :::. :: :.: :: ::: ::: :..:.   : ..
NP_085 MAATLLMAGSQAPVTFEDMAMYLTREEWRPLDAAQRDLYRDVMQENYGNVVSLDFEIRSE
               10        20        30        40        50        60

            60         70           80        90             100   
pF1KE0 TKVILKVEQGQE-PWMVEGANPHESS---PESDYPLVDEPGKHRESK------DNFLKSV
       ..:  : : ...  . . .  : :..   :::.  .  : : . : .      .....  
NP_085 NEVNPKQEISEDVQFGTTSERPAENAEENPESEEGF--ESGDRSERQWGDLTAEEWVSYP
               70        80        90         100       110        

           110       120       130       140       150       160   
pF1KE0 LLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMRKKSYKSFEKCLPPNLDLLKYNRSYTVENAYECSE
       :   . .:. ...:        . .: .  .   : .    :: ......: .  :.: :
NP_085 LQPVTDLLVHKEVH--------TGIRYHICSHCGKAFSQISDLNRHQKTHTGDRPYKCYE
      120       130               140       150       160       170

           170       180       190       200       210       220   
pF1KE0 CGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQKIHNGERPFVCNDCGKA
       :::.:... :.:.:...:: ..:..::.:::...:..::  :: ::.::.:  ::.:::.
NP_085 CGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQTIHTGEKPHKCNECGKS
              180       190       200       210       220       230

           230       240       250       260       270       280   
pF1KE0 FMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTLEKSFECKECGKTFRYS
       : . ..:. ::: :.::::::: .:::.:. .: . :: ..:: :: .::.:::. :   
NP_085 FCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTGEKPYECNECGRGFSER
              240       250       260       270       280       290

           290       300       310       320       330       340   
pF1KE0 SSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPYSCIECGKAFIKKSHLL
       :.: :: : ::::.::.:  ::: :...: :: :.: ::::::: : :::. : . :::.
NP_085 SDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPYHCNECGENFSRISHLV
              300       310       320       330       340       350

           350       360       370                                 
pF1KE0 RHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT                         
       .:: ::::::::::: :::.::..:.::.::::::                         
NP_085 QHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNECWRSFGERSDLIKHQR
              360       370       380       390       400       410

NP_085 THTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKSFSRSSALIKHKRVHTD
              420       430       440       450       460       470

>--
 initn: 387 init1: 387 opt: 387  Z-score: 255.2  bits: 56.2 E(85289): 1.8e-07
Smith-Waterman score: 387; 58.3% identity (83.3% similar) in 84 aa overlap (295-378:386-469)

          270       280       290       300       310       320    
pF1KE0 HTLEKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGE
                                     :::::.:  : ..::. : :. ::: ::::
NP_085 HTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNECWRSFGERSDLIKHQRTHTGE
         360       370       380       390       400       410     

          330       340       350       360       370         
pF1KE0 KPYSCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT 
       ::: :..:::.: ..:.:. :: .:::::::::..: :.::..: :: :...:: 
NP_085 KPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKSFSRSSALIKHKRVHTD
         420       430       440       450       460       470

>>NP_001305065 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 isof  (453 aa)
 initn: 998 init1: 998 opt: 1144  Z-score: 696.0  bits: 137.7 E(85289): 5e-32
Smith-Waterman score: 1146; 43.6% identity (70.0% similar) in 390 aa overlap (2-378:52-426)

                                            10        20        30 
pF1KE0                              MISFQESVTFQDVAVDFTAEEWQLLDCAERT
                                     . ::: :::.:::: :  .::. :. :.: 
NP_001 PSQMCIFHPILSDFFGAAIHIPHPEIACQHVLFQELVTFEDVAVYFIRKEWKRLEPAQRD
              30        40        50        60        70        80 

              40        50                     60        70        
pF1KE0 LYWDVMLENYRNLISVGCPITKTK-------------VILKVEQGQEPWMVEGANPHESS
       :: ::::::: :..:.    :.:.             :.:   : .    ..  . .:  
NP_001 LYRDVMLENYGNVFSLDRE-TRTENDQEISEDTRSHGVLLGRFQKDISQGLKFKEAYERE
              90       100        110       120       130       140

       80        90       100       110       120       130        
pF1KE0 PESDYPLVDEPGKHRESKDNFLKSVLLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMRKKSYKSFEK
            :: . ::.. . :       .  :... . :..   .        :...:..: .
NP_001 VSLKRPLGNSPGERLNRK-------MPDFGQVTVEEKLTPRGE-------RSEKYNDFGN
              150              160       170              180      

      140       150       160       170       180       190        
pF1KE0 CLPPNLDLLKYNRSYTVENAYECSECGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSR
        .  : .:....:  . .  ..:.::.:.:..   .:.:.. :: .::.:::.::::.:.
NP_001 SFTVNSNLISHQRLPVGDRPHKCDECSKSFNRTSDLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQ
        190       200       210       220       230       240      

      200       210       220       230       240       250        
pF1KE0 KAHLATHQKIHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSF
       ..::  ::.::.::.:. :.::::.:  .. :..:.:.:::::::::..:::::.:.:..
NP_001 SSHLIQHQRIHTGEKPYECSDCGKTFSCSSALILHRRIHTGEKPYECNECGKTFSWSSTL
        250       260       270       280       290       300      

      260       270       280       290       300       310        
pF1KE0 NQHVKSHTLEKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQ
       ..: . :: :: . :.::::.:  ::.: .:.:.:::::::.:  :::::...: :  ::
NP_001 THHQRIHTGEKPYACNECGKAFSRSSTLIHHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQ
        310       320       330       340       350       360      

      320       330       340       350       360       370        
pF1KE0 RIHTGEKPYSCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT
       ::::::::: :.:::  :  .: :..::  ::::.::::..:::::  .: :. ::.:::
NP_001 RIHTGEKPYECMECGGKFTYSSGLIQHQRIHTGENPYECSECGKAFRYSSALVRHQRIHT
        370       380       390       400       410       420      

NP_001 GEKPLNGIGMSKSSLRVTTELNIREST
        430       440       450   

>>XP_006716174 (OMIM: 194510) PREDICTED: zinc finger pro  (410 aa)
 initn: 1367 init1: 998 opt: 1135  Z-score: 691.1  bits: 136.7 E(85289): 9.3e-32
Smith-Waterman score: 1137; 43.7% identity (70.0% similar) in 387 aa overlap (5-378:12-383)

                      10        20        30        40        50   
pF1KE0        MISFQESVTFQDVAVDFTAEEWQLLDCAERTLYWDVMLENYRNLISVGCPITK
                  :: :::.:::: :  .::. :. :.: :: ::::::: :..:.    :.
XP_006 MLAAALLKAKSQELVTFEDVAVYFIRKEWKRLEPAQRDLYRDVMLENYGNVFSLDRE-TR
               10        20        30        40        50          

                         60        70        80        90       100
pF1KE0 TK-------------VILKVEQGQEPWMVEGANPHESSPESDYPLVDEPGKHRESKDNFL
       :.             :.:   : .    ..  . .:       :: . ::.. . :    
XP_006 TENDQEISEDTRSHGVLLGRFQKDISQGLKFKEAYEREVSLKRPLGNSPGERLNRK----
      60        70        80        90       100       110         

              110       120       130       140       150       160
pF1KE0 KSVLLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMRKKSYKSFEKCLPPNLDLLKYNRSYTVENAYE
          .  :... . :..   .        :...:..: . .  : .:....:  . .  ..
XP_006 ---MPDFGQVTVEEKLTPRGE-------RSEKYNDFGNSFTVNSNLISHQRLPVGDRPHK
            120       130              140       150       160     

              170       180       190       200       210       220
pF1KE0 CSECGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQKIHNGERPFVCNDC
       :.::.:.:..   .:.:.. :: .::.:::.::::.:...::  ::.::.::.:. :.::
XP_006 CDECSKSFNRTSDLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLIQHQRIHTGEKPYECSDC
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              230       240       250       260       270       280
pF1KE0 GKAFMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTLEKSFECKECGKTF
       ::.:  .. :..:.:.:::::::::..:::::.:.:....: . :: :: . :.::::.:
XP_006 GKTFSCSSALILHRRIHTGEKPYECNECGKTFSWSSTLTHHQRIHTGEKPYACNECGKAF
         230       240       250       260       270       280     

              290       300       310       320       330       340
pF1KE0 RYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPYSCIECGKAFIKKS
         ::.: .:.:.:::::::.:  :::::...: :  ::::::::::: :.:::  :  .:
XP_006 SRSSTLIHHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQRIHTGEKPYECMECGGKFTYSS
         290       300       310       320       330       340     

              350       360       370                              
pF1KE0 HLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT                      
        :..::  ::::.::::..:::::  .: :. ::.:::                      
XP_006 GLIQHQRIHTGENPYECSECGKAFRYSSALVRHQRIHTGEKPLNGIGMSKSSLRVTTELN
         350       360       370       380       390       400     

XP_006 IREST
         410

>>XP_016868071 (OMIM: 194510) PREDICTED: zinc finger pro  (410 aa)
 initn: 1367 init1: 998 opt: 1135  Z-score: 691.1  bits: 136.7 E(85289): 9.3e-32
Smith-Waterman score: 1137; 43.7% identity (70.0% similar) in 387 aa overlap (5-378:12-383)

                      10        20        30        40        50   
pF1KE0        MISFQESVTFQDVAVDFTAEEWQLLDCAERTLYWDVMLENYRNLISVGCPITK
                  :: :::.:::: :  .::. :. :.: :: ::::::: :..:.    :.
XP_016 MLAAALLKAKSQELVTFEDVAVYFIRKEWKRLEPAQRDLYRDVMLENYGNVFSLDRE-TR
               10        20        30        40        50          

                         60        70        80        90       100
pF1KE0 TK-------------VILKVEQGQEPWMVEGANPHESSPESDYPLVDEPGKHRESKDNFL
       :.             :.:   : .    ..  . .:       :: . ::.. . :    
XP_016 TENDQEISEDTRSHGVLLGRFQKDISQGLKFKEAYEREVSLKRPLGNSPGERLNRK----
      60        70        80        90       100       110         

              110       120       130       140       150       160
pF1KE0 KSVLLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMRKKSYKSFEKCLPPNLDLLKYNRSYTVENAYE
          .  :... . :..   .        :...:..: . .  : .:....:  . .  ..
XP_016 ---MPDFGQVTVEEKLTPRGE-------RSEKYNDFGNSFTVNSNLISHQRLPVGDRPHK
            120       130              140       150       160     

              170       180       190       200       210       220
pF1KE0 CSECGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQKIHNGERPFVCNDC
       :.::.:.:..   .:.:.. :: .::.:::.::::.:...::  ::.::.::.:. :.::
XP_016 CDECSKSFNRTSDLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLIQHQRIHTGEKPYECSDC
         170       180       190       200       210       220     

              230       240       250       260       270       280
pF1KE0 GKAFMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTLEKSFECKECGKTF
       ::.:  .. :..:.:.:::::::::..:::::.:.:....: . :: :: . :.::::.:
XP_016 GKTFSCSSALILHRRIHTGEKPYECNECGKTFSWSSTLTHHQRIHTGEKPYACNECGKAF
         230       240       250       260       270       280     

              290       300       310       320       330       340
pF1KE0 RYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPYSCIECGKAFIKKS
         ::.: .:.:.:::::::.:  :::::...: :  ::::::::::: :.:::  :  .:
XP_016 SRSSTLIHHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQRIHTGEKPYECMECGGKFTYSS
         290       300       310       320       330       340     

              350       360       370                              
pF1KE0 HLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT                      
        :..::  ::::.::::..:::::  .: :. ::.:::                      
XP_016 GLIQHQRIHTGENPYECSECGKAFRYSSALVRHQRIHTGEKPLNGIGMSKSSLRVTTELN
         350       360       370       380       390       400     

XP_016 IREST
         410

>>XP_016868072 (OMIM: 194510) PREDICTED: zinc finger pro  (410 aa)
 initn: 1367 init1: 998 opt: 1135  Z-score: 691.1  bits: 136.7 E(85289): 9.3e-32
Smith-Waterman score: 1137; 43.7% identity (70.0% similar) in 387 aa overlap (5-378:12-383)

                      10        20        30        40        50   
pF1KE0        MISFQESVTFQDVAVDFTAEEWQLLDCAERTLYWDVMLENYRNLISVGCPITK
                  :: :::.:::: :  .::. :. :.: :: ::::::: :..:.    :.
XP_016 MLAAALLKAKSQELVTFEDVAVYFIRKEWKRLEPAQRDLYRDVMLENYGNVFSLDRE-TR
               10        20        30        40        50          

                         60        70        80        90       100
pF1KE0 TK-------------VILKVEQGQEPWMVEGANPHESSPESDYPLVDEPGKHRESKDNFL
       :.             :.:   : .    ..  . .:       :: . ::.. . :    
XP_016 TENDQEISEDTRSHGVLLGRFQKDISQGLKFKEAYEREVSLKRPLGNSPGERLNRK----
      60        70        80        90       100       110         

              110       120       130       140       150       160
pF1KE0 KSVLLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMRKKSYKSFEKCLPPNLDLLKYNRSYTVENAYE
          .  :... . :..   .        :...:..: . .  : .:....:  . .  ..
XP_016 ---MPDFGQVTVEEKLTPRGE-------RSEKYNDFGNSFTVNSNLISHQRLPVGDRPHK
            120       130              140       150       160     

              170       180       190       200       210       220
pF1KE0 CSECGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQKIHNGERPFVCNDC
       :.::.:.:..   .:.:.. :: .::.:::.::::.:...::  ::.::.::.:. :.::
XP_016 CDECSKSFNRTSDLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLIQHQRIHTGEKPYECSDC
         170       180       190       200       210       220     

              230       240       250       260       270       280
pF1KE0 GKAFMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTLEKSFECKECGKTF
       ::.:  .. :..:.:.:::::::::..:::::.:.:....: . :: :: . :.::::.:
XP_016 GKTFSCSSALILHRRIHTGEKPYECNECGKTFSWSSTLTHHQRIHTGEKPYACNECGKAF
         230       240       250       260       270       280     

              290       300       310       320       330       340
pF1KE0 RYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPYSCIECGKAFIKKS
         ::.: .:.:.:::::::.:  :::::...: :  ::::::::::: :.:::  :  .:
XP_016 SRSSTLIHHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQRIHTGEKPYECMECGGKFTYSS
         290       300       310       320       330       340     

              350       360       370                              
pF1KE0 HLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT                      
        :..::  ::::.::::..:::::  .: :. ::.:::                      
XP_016 GLIQHQRIHTGENPYECSECGKAFRYSSALVRHQRIHTGEKPLNGIGMSKSSLRVTTELN
         350       360       370       380       390       400     

XP_016 IREST
         410

>>NP_001265220 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 isof  (410 aa)
 initn: 1367 init1: 998 opt: 1135  Z-score: 691.1  bits: 136.7 E(85289): 9.3e-32
Smith-Waterman score: 1137; 43.7% identity (70.0% similar) in 387 aa overlap (5-378:12-383)

                      10        20        30        40        50   
pF1KE0        MISFQESVTFQDVAVDFTAEEWQLLDCAERTLYWDVMLENYRNLISVGCPITK
                  :: :::.:::: :  .::. :. :.: :: ::::::: :..:.    :.
NP_001 MLAAALLKAKSQELVTFEDVAVYFIRKEWKRLEPAQRDLYRDVMLENYGNVFSLDRE-TR
               10        20        30        40        50          

                         60        70        80        90       100
pF1KE0 TK-------------VILKVEQGQEPWMVEGANPHESSPESDYPLVDEPGKHRESKDNFL
       :.             :.:   : .    ..  . .:       :: . ::.. . :    
NP_001 TENDQEISEDTRSHGVLLGRFQKDISQGLKFKEAYEREVSLKRPLGNSPGERLNRK----
      60        70        80        90       100       110         

              110       120       130       140       150       160
pF1KE0 KSVLLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMRKKSYKSFEKCLPPNLDLLKYNRSYTVENAYE
          .  :... . :..   .        :...:..: . .  : .:....:  . .  ..
NP_001 ---MPDFGQVTVEEKLTPRGE-------RSEKYNDFGNSFTVNSNLISHQRLPVGDRPHK
            120       130              140       150       160     

              170       180       190       200       210       220
pF1KE0 CSECGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQKIHNGERPFVCNDC
       :.::.:.:..   .:.:.. :: .::.:::.::::.:...::  ::.::.::.:. :.::
NP_001 CDECSKSFNRTSDLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLIQHQRIHTGEKPYECSDC
         170       180       190       200       210       220     

              230       240       250       260       270       280
pF1KE0 GKAFMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTLEKSFECKECGKTF
       ::.:  .. :..:.:.:::::::::..:::::.:.:....: . :: :: . :.::::.:
NP_001 GKTFSCSSALILHRRIHTGEKPYECNECGKTFSWSSTLTHHQRIHTGEKPYACNECGKAF
         230       240       250       260       270       280     

              290       300       310       320       330       340
pF1KE0 RYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPYSCIECGKAFIKKS
         ::.: .:.:.:::::::.:  :::::...: :  ::::::::::: :.:::  :  .:
NP_001 SRSSTLIHHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQRIHTGEKPYECMECGGKFTYSS
         290       300       310       320       330       340     

              350       360       370                              
pF1KE0 HLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT                      
        :..::  ::::.::::..:::::  .: :. ::.:::                      
NP_001 GLIQHQRIHTGENPYECSECGKAFRYSSALVRHQRIHTGEKPLNGIGMSKSSLRVTTELN
         350       360       370       380       390       400     

NP_001 IREST
         410

>>NP_001265221 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 isof  (410 aa)
 initn: 1367 init1: 998 opt: 1135  Z-score: 691.1  bits: 136.7 E(85289): 9.3e-32
Smith-Waterman score: 1137; 43.7% identity (70.0% similar) in 387 aa overlap (5-378:12-383)

                      10        20        30        40        50   
pF1KE0        MISFQESVTFQDVAVDFTAEEWQLLDCAERTLYWDVMLENYRNLISVGCPITK
                  :: :::.:::: :  .::. :. :.: :: ::::::: :..:.    :.
NP_001 MLAAALLKAKSQELVTFEDVAVYFIRKEWKRLEPAQRDLYRDVMLENYGNVFSLDRE-TR
               10        20        30        40        50          

                         60        70        80        90       100
pF1KE0 TK-------------VILKVEQGQEPWMVEGANPHESSPESDYPLVDEPGKHRESKDNFL
       :.             :.:   : .    ..  . .:       :: . ::.. . :    
NP_001 TENDQEISEDTRSHGVLLGRFQKDISQGLKFKEAYEREVSLKRPLGNSPGERLNRK----
      60        70        80        90       100       110         

              110       120       130       140       150       160
pF1KE0 KSVLLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMRKKSYKSFEKCLPPNLDLLKYNRSYTVENAYE
          .  :... . :..   .        :...:..: . .  : .:....:  . .  ..
NP_001 ---MPDFGQVTVEEKLTPRGE-------RSEKYNDFGNSFTVNSNLISHQRLPVGDRPHK
            120       130              140       150       160     

              170       180       190       200       210       220
pF1KE0 CSECGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQKIHNGERPFVCNDC
       :.::.:.:..   .:.:.. :: .::.:::.::::.:...::  ::.::.::.:. :.::
NP_001 CDECSKSFNRTSDLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLIQHQRIHTGEKPYECSDC
         170       180       190       200       210       220     

              230       240       250       260       270       280
pF1KE0 GKAFMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTLEKSFECKECGKTF
       ::.:  .. :..:.:.:::::::::..:::::.:.:....: . :: :: . :.::::.:
NP_001 GKTFSCSSALILHRRIHTGEKPYECNECGKTFSWSSTLTHHQRIHTGEKPYACNECGKAF
         230       240       250       260       270       280     

              290       300       310       320       330       340
pF1KE0 RYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPYSCIECGKAFIKKS
         ::.: .:.:.:::::::.:  :::::...: :  ::::::::::: :.:::  :  .:
NP_001 SRSSTLIHHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQRIHTGEKPYECMECGGKFTYSS
         290       300       310       320       330       340     

              350       360       370                              
pF1KE0 HLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT                      
        :..::  ::::.::::..:::::  .: :. ::.:::                      
NP_001 GLIQHQRIHTGENPYECSECGKAFRYSSALVRHQRIHTGEKPLNGIGMSKSSLRVTTELN
         350       360       370       380       390       400     

NP_001 IREST
         410

>>NP_001305064 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 isof  (446 aa)
 initn: 998 init1: 998 opt: 1135  Z-score: 690.8  bits: 136.8 E(85289): 9.7e-32
Smith-Waterman score: 1137; 43.7% identity (70.0% similar) in 387 aa overlap (5-378:48-419)

                                         10        20        30    
pF1KE0                           MISFQESVTFQDVAVDFTAEEWQLLDCAERTLYW
                                     :: :::.:::: :  .::. :. :.: :: 
NP_001 SALPSKVPAFSDKDSLGDEMLAAALLKAKSQELVTFEDVAVYFIRKEWKRLEPAQRDLYR
        20        30        40        50        60        70       

           40        50                     60        70        80 
pF1KE0 DVMLENYRNLISVGCPITKTK-------------VILKVEQGQEPWMVEGANPHESSPES
       ::::::: :..:.    :.:.             :.:   : .    ..  . .:     
NP_001 DVMLENYGNVFSLDRE-TRTENDQEISEDTRSHGVLLGRFQKDISQGLKFKEAYEREVSL
        80        90        100       110       120       130      

              90       100       110       120       130       140 
pF1KE0 DYPLVDEPGKHRESKDNFLKSVLLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMRKKSYKSFEKCLP
         :: . ::.. . :       .  :... . :..   .        :...:..: . . 
NP_001 KRPLGNSPGERLNRK-------MPDFGQVTVEEKLTPRGE-------RSEKYNDFGNSFT
        140       150              160              170       180  

             150       160       170       180       190       200 
pF1KE0 PNLDLLKYNRSYTVENAYECSECGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAH
        : .:....:  . .  ..:.::.:.:..   .:.:.. :: .::.:::.::::.:...:
NP_001 VNSNLISHQRLPVGDRPHKCDECSKSFNRTSDLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSH
            190       200       210       220       230       240  

             210       220       230       240       250       260 
pF1KE0 LATHQKIHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQH
       :  ::.::.::.:. :.::::.:  .. :..:.:.:::::::::..:::::.:.:....:
NP_001 LIQHQRIHTGEKPYECSDCGKTFSCSSALILHRRIHTGEKPYECNECGKTFSWSSTLTHH
            250       260       270       280       290       300  

             270       280       290       300       310       320 
pF1KE0 VKSHTLEKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIH
        . :: :: . :.::::.:  ::.: .:.:.:::::::.:  :::::...: :  :::::
NP_001 QRIHTGEKPYACNECGKAFSRSSTLIHHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQRIH
            310       320       330       340       350       360  

             330       340       350       360       370           
pF1KE0 TGEKPYSCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT   
       :::::: :.:::  :  .: :..::  ::::.::::..:::::  .: :. ::.:::   
NP_001 TGEKPYECMECGGKFTYSSGLIQHQRIHTGENPYECSECGKAFRYSSALVRHQRIHTGEK
            370       380       390       400       410       420  

NP_001 PLNGIGMSKSSLRVTTELNIREST
            430       440      

>>NP_001265219 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 isof  (446 aa)
 initn: 998 init1: 998 opt: 1135  Z-score: 690.8  bits: 136.8 E(85289): 9.7e-32
Smith-Waterman score: 1137; 43.7% identity (70.0% similar) in 387 aa overlap (5-378:48-419)

                                         10        20        30    
pF1KE0                           MISFQESVTFQDVAVDFTAEEWQLLDCAERTLYW
                                     :: :::.:::: :  .::. :. :.: :: 
NP_001 SALPSKVPAFSDKDSLGDEMLAAALLKAKSQELVTFEDVAVYFIRKEWKRLEPAQRDLYR
        20        30        40        50        60        70       

           40        50                     60        70        80 
pF1KE0 DVMLENYRNLISVGCPITKTK-------------VILKVEQGQEPWMVEGANPHESSPES
       ::::::: :..:.    :.:.             :.:   : .    ..  . .:     
NP_001 DVMLENYGNVFSLDRE-TRTENDQEISEDTRSHGVLLGRFQKDISQGLKFKEAYEREVSL
        80        90        100       110       120       130      

              90       100       110       120       130       140 
pF1KE0 DYPLVDEPGKHRESKDNFLKSVLLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMRKKSYKSFEKCLP
         :: . ::.. . :       .  :... . :..   .        :...:..: . . 
NP_001 KRPLGNSPGERLNRK-------MPDFGQVTVEEKLTPRGE-------RSEKYNDFGNSFT
        140       150              160              170       180  

             150       160       170       180       190       200 
pF1KE0 PNLDLLKYNRSYTVENAYECSECGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAH
        : .:....:  . .  ..:.::.:.:..   .:.:.. :: .::.:::.::::.:...:
NP_001 VNSNLISHQRLPVGDRPHKCDECSKSFNRTSDLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSH
            190       200       210       220       230       240  

             210       220       230       240       250       260 
pF1KE0 LATHQKIHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQH
       :  ::.::.::.:. :.::::.:  .. :..:.:.:::::::::..:::::.:.:....:
NP_001 LIQHQRIHTGEKPYECSDCGKTFSCSSALILHRRIHTGEKPYECNECGKTFSWSSTLTHH
            250       260       270       280       290       300  

             270       280       290       300       310       320 
pF1KE0 VKSHTLEKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIH
        . :: :: . :.::::.:  ::.: .:.:.:::::::.:  :::::...: :  :::::
NP_001 QRIHTGEKPYACNECGKAFSRSSTLIHHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQRIH
            310       320       330       340       350       360  

             330       340       350       360       370           
pF1KE0 TGEKPYSCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT   
       :::::: :.:::  :  .: :..::  ::::.::::..:::::  .: :. ::.:::   
NP_001 TGEKPYECMECGGKFTYSSGLIQHQRIHTGENPYECSECGKAFRYSSALVRHQRIHTGEK
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