Result of FASTA (ccds) for pF1KE0636
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0636, 378 aa
  1>>>pF1KE0636 378 - 378 aa - 378 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7503+/-0.00178; mu= 11.1793+/- 0.106
 mean_var=265.4166+/-51.507, 0's: 0 Z-trim(105.4): 966  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.078725
 statistics sampled from 7336 (8399) to 7336 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.258), width:  16
 Scan time:  2.640

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS454.1 ZNF684 gene_id:127396|Hs108|chr1         ( 378) 2651 315.2 6.1e-86
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1          ( 470) 1153 145.2 1.1e-34
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7           ( 446) 1135 143.1 4.6e-34
CCDS9282.1 ZNF140 gene_id:7699|Hs108|chr12         ( 457) 1056 134.2 2.3e-31
CCDS62957.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2           ( 387) 1053 133.7 2.7e-31
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19      ( 527) 1051 133.7 3.7e-31
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 665) 1051 133.8 4.2e-31
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 667) 1051 133.8 4.2e-31
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19      ( 686) 1051 133.9 4.3e-31
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 692) 1051 133.9 4.3e-31
CCDS33131.1 ZNF547 gene_id:284306|Hs108|chr19      ( 402) 1043 132.6   6e-31
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5           ( 461) 1038 132.1 9.6e-31
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8           ( 682) 1040 132.6   1e-30
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19      ( 580) 1038 132.3 1.1e-30
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 616) 1038 132.3 1.1e-30
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19      ( 644) 1038 132.3 1.1e-30
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 658) 1038 132.4 1.2e-30
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 670) 1038 132.4 1.2e-30
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 682) 1038 132.4 1.2e-30
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19      ( 475) 1032 131.5 1.6e-30
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17        ( 502) 1032 131.5 1.6e-30
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12         ( 738) 1034 132.0 1.7e-30
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5        ( 568) 1029 131.2 2.2e-30
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5         ( 604) 1029 131.3 2.3e-30
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5        ( 620) 1029 131.3 2.3e-30
CCDS12861.1 ZNF677 gene_id:342926|Hs108|chr19      ( 584) 1024 130.7 3.3e-30
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9          ( 364) 1016 129.5 4.8e-30
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9           ( 630) 1019 130.2 5.1e-30
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9          ( 631) 1019 130.2 5.1e-30
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9          ( 645) 1019 130.2 5.1e-30
CCDS7195.1 ZNF25 gene_id:219749|Hs108|chr10        ( 456) 1016 129.6 5.4e-30
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9          ( 474) 1016 129.6 5.5e-30
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9           ( 498) 1016 129.7 5.7e-30
CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19      ( 616) 1016 129.8 6.3e-30
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19      ( 647) 1016 129.8 6.5e-30
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3        ( 754) 1017 130.1 6.5e-30
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19        ( 706) 1016 129.9 6.8e-30
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19       ( 670) 1015 129.8 7.2e-30
CCDS12955.1 ZNF530 gene_id:348327|Hs108|chr19      ( 599) 1012 129.3 8.5e-30
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX          ( 779) 1013 129.6 9.1e-30
CCDS12968.1 ZNF606 gene_id:80095|Hs108|chr19       ( 792) 1013 129.6 9.2e-30
CCDS83401.1 ZNF883 gene_id:169834|Hs108|chr9       ( 379) 1007 128.5 9.9e-30
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9        ( 816) 1011 129.4 1.1e-29
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3         ( 544) 1008 128.8 1.1e-29
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9        ( 852) 1011 129.5 1.1e-29
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9        ( 854) 1011 129.5 1.1e-29
CCDS4441.1 ZNF454 gene_id:285676|Hs108|chr5        ( 522) 1007 128.7 1.2e-29
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15       ( 614) 1007 128.8 1.3e-29
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19      ( 717) 1008 129.0 1.3e-29
CCDS12972.1 ZNF329 gene_id:79673|Hs108|chr19       ( 541) 1005 128.5 1.4e-29


>>CCDS454.1 ZNF684 gene_id:127396|Hs108|chr1              (378 aa)
 initn: 2651 init1: 2651 opt: 2651  Z-score: 1656.3  bits: 315.2 E(32554): 6.1e-86
Smith-Waterman score: 2651; 100.0% identity (100.0% similar) in 378 aa overlap (1-378:1-378)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MISFQESVTFQDVAVDFTAEEWQLLDCAERTLYWDVMLENYRNLISVGCPITKTKVILKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MISFQESVTFQDVAVDFTAEEWQLLDCAERTLYWDVMLENYRNLISVGCPITKTKVILKV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 EQGQEPWMVEGANPHESSPESDYPLVDEPGKHRESKDNFLKSVLLTFNKILTMERIHHYN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EQGQEPWMVEGANPHESSPESDYPLVDEPGKHRESKDNFLKSVLLTFNKILTMERIHHYN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 MSTSLNPMRKKSYKSFEKCLPPNLDLLKYNRSYTVENAYECSECGKAFKKKFHFIRHEKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MSTSLNPMRKKSYKSFEKCLPPNLDLLKYNRSYTVENAYECSECGKAFKKKFHFIRHEKN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 HTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQKIHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQLVVHQRLHTGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQKIHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQLVVHQRLHTGE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 KPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTLEKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTLEKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 CIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPYSCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPYSCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRC
              310       320       330       340       350       360

              370        
pF1KE0 GKAFSQKSNLIVHQKIHT
       ::::::::::::::::::
CCDS45 GKAFSQKSNLIVHQKIHT
              370        

>>CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1               (470 aa)
 initn: 1026 init1: 1026 opt: 1153  Z-score: 735.9  bits: 145.2 E(32554): 1.1e-34
Smith-Waterman score: 1153; 44.0% identity (70.7% similar) in 389 aa overlap (1-378:7-385)

                     10        20        30        40        50    
pF1KE0       MISFQESVTFQDVAVDFTAEEWQLLDCAERTLYWDVMLENYRNLISVGCPI-TK
             : . :  :::.:.:. .: :::. :: :.: :: ::: ::: :..:.   : ..
CCDS23 MAATLLMAGSQAPVTFEDMAMYLTREEWRPLDAAQRDLYRDVMQENYGNVVSLDFEIRSE
               10        20        30        40        50        60

            60         70           80        90             100   
pF1KE0 TKVILKVEQGQE-PWMVEGANPHESS---PESDYPLVDEPGKHRESK------DNFLKSV
       ..:  : : ...  . . .  : :..   :::.  .  : : . : .      .....  
CCDS23 NEVNPKQEISEDVQFGTTSERPAENAEENPESEEGF--ESGDRSERQWGDLTAEEWVSYP
               70        80        90         100       110        

           110       120       130       140       150       160   
pF1KE0 LLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMRKKSYKSFEKCLPPNLDLLKYNRSYTVENAYECSE
       :   . .:. ...:        . .: .  .   : .    :: ......: .  :.: :
CCDS23 LQPVTDLLVHKEVH--------TGIRYHICSHCGKAFSQISDLNRHQKTHTGDRPYKCYE
      120       130               140       150       160       170

           170       180       190       200       210       220   
pF1KE0 CGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQKIHNGERPFVCNDCGKA
       :::.:... :.:.:...:: ..:..::.:::...:..::  :: ::.::.:  ::.:::.
CCDS23 CGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQTIHTGEKPHKCNECGKS
              180       190       200       210       220       230

           230       240       250       260       270       280   
pF1KE0 FMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTLEKSFECKECGKTFRYS
       : . ..:. ::: :.::::::: .:::.:. .: . :: ..:: :: .::.:::. :   
CCDS23 FCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTGEKPYECNECGRGFSER
              240       250       260       270       280       290

           290       300       310       320       330       340   
pF1KE0 SSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPYSCIECGKAFIKKSHLL
       :.: :: : ::::.::.:  ::: :...: :: :.: ::::::: : :::. : . :::.
CCDS23 SDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPYHCNECGENFSRISHLV
              300       310       320       330       340       350

           350       360       370                                 
pF1KE0 RHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT                         
       .:: ::::::::::: :::.::..:.::.::::::                         
CCDS23 QHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNECWRSFGERSDLIKHQR
              360       370       380       390       400       410

CCDS23 THTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKSFSRSSALIKHKRVHTD
              420       430       440       450       460       470

>>CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7                (446 aa)
 initn: 998 init1: 998 opt: 1135  Z-score: 725.1  bits: 143.1 E(32554): 4.6e-34
Smith-Waterman score: 1137; 43.7% identity (70.0% similar) in 387 aa overlap (5-378:48-419)

                                         10        20        30    
pF1KE0                           MISFQESVTFQDVAVDFTAEEWQLLDCAERTLYW
                                     :: :::.:::: :  .::. :. :.: :: 
CCDS43 SALPSKVPAFSDKDSLGDEMLAAALLKAKSQELVTFEDVAVYFIRKEWKRLEPAQRDLYR
        20        30        40        50        60        70       

           40        50                     60        70        80 
pF1KE0 DVMLENYRNLISVGCPITKTK-------------VILKVEQGQEPWMVEGANPHESSPES
       ::::::: :..:.    :.:.             :.:   : .    ..  . .:     
CCDS43 DVMLENYGNVFSLDRE-TRTENDQEISEDTRSHGVLLGRFQKDISQGLKFKEAYEREVSL
        80        90        100       110       120       130      

              90       100       110       120       130       140 
pF1KE0 DYPLVDEPGKHRESKDNFLKSVLLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMRKKSYKSFEKCLP
         :: . ::.. . :       .  :... . :..   .        :...:..: . . 
CCDS43 KRPLGNSPGERLNRK-------MPDFGQVTVEEKLTPRGE-------RSEKYNDFGNSFT
        140       150              160              170       180  

             150       160       170       180       190       200 
pF1KE0 PNLDLLKYNRSYTVENAYECSECGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAH
        : .:....:  . .  ..:.::.:.:..   .:.:.. :: .::.:::.::::.:...:
CCDS43 VNSNLISHQRLPVGDRPHKCDECSKSFNRTSDLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSH
            190       200       210       220       230       240  

             210       220       230       240       250       260 
pF1KE0 LATHQKIHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQH
       :  ::.::.::.:. :.::::.:  .. :..:.:.:::::::::..:::::.:.:....:
CCDS43 LIQHQRIHTGEKPYECSDCGKTFSCSSALILHRRIHTGEKPYECNECGKTFSWSSTLTHH
            250       260       270       280       290       300  

             270       280       290       300       310       320 
pF1KE0 VKSHTLEKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIH
        . :: :: . :.::::.:  ::.: .:.:.:::::::.:  :::::...: :  :::::
CCDS43 QRIHTGEKPYACNECGKAFSRSSTLIHHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQRIH
            310       320       330       340       350       360  

             330       340       350       360       370           
pF1KE0 TGEKPYSCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT   
       :::::: :.:::  :  .: :..::  ::::.::::..:::::  .: :. ::.:::   
CCDS43 TGEKPYECMECGGKFTYSSGLIQHQRIHTGENPYECSECGKAFRYSSALVRHQRIHTGEK
            370       380       390       400       410       420  

CCDS43 PLNGIGMSKSSLRVTTELNIREST
            430       440      

>>CCDS9282.1 ZNF140 gene_id:7699|Hs108|chr12              (457 aa)
 initn: 856 init1: 856 opt: 1056  Z-score: 676.5  bits: 134.2 E(32554): 2.3e-31
Smith-Waterman score: 1057; 43.1% identity (66.5% similar) in 394 aa overlap (5-378:3-380)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MISFQESVTFQDVAVDFTAEEWQLLDCAERTLYWDVMLENYRNLISVGCPITKTKVILKV
           : ::::.:::.::. :::. :. :.: ::  :::::: .:.:.:  :.:  :.  .
CCDS92   MSQGSVTFRDVAIDFSQEEWKWLQPAQRDLYRCVMLENYGHLVSLGLSISKPDVVSLL
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90       100        110         
pF1KE0 EQGQEPWMVEGANPHESSPESDYPLVDEPGKHRESKDNFLKSVLLT-FNKILTMERIHHY
       :::.:::.  :    .   . :   :.: .   : ::   :.:.    .. : ::::   
CCDS92 EQGKEPWL--G----KREVKRDLFSVSESSG--EIKDFSPKNVIYDDSSQYLIMERI---
       60              70        80          90       100          

     120       130       140       150                          160
pF1KE0 NMSTSLNPMRKKSYKSFEKCLPPNLDLLKYNRS-------------------YTVENAYE
           : .:. . :.:.  ::   . ..:. :..                    :::  : 
CCDS92 ---LSQGPVYS-SFKGGWKC-KDHTEMLQENQGCIRKVTVSHQEALAQHMNISTVERPYG
          110        120        130       140       150       160  

              170       180       190       200       210       220
pF1KE0 CSECGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQKIHNGERPFVCNDC
       : ::::.: ..: .. :...:: .::. :..:::..:. ..:. :: ::.:..:  :.::
CCDS92 CHECGKTFGRRFSLVLHQRTHTGEKPYACKECGKTFSQISNLVKHQMIHTGKKPHECKDC
            170       180       190       200       210       220  

              230       240       250       260       270       280
pF1KE0 GKAFMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTLEKSFECKECGKTF
       .:.: . . :. ::: :::::::::..:::.:.  :....: . :  .:.. :..:::.:
CCDS92 NKTFSYLSFLIEHQRTHTGEKPYECTECGKAFSRASNLTRHQRIHIGKKQYICRKCGKAF
            230       240       250       260       270       280  

              290       300       310       320       330       340
pF1KE0 RYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPYSCIECGKAFIKKS
         .: : .:.  :::::::.:: :::::   : :. :: ::: . :: : :: :::  .:
CCDS92 SSGSELIRHQITHTGEKPYECIECGKAFRRFSHLTRHQSIHTTKTPYECNECRKAFRCHS
            290       300       310       320       330       340  

              350       360       370                              
pF1KE0 HLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT                      
        :..::  :.::: :::..:::.:. ...:: : : ::                      
CCDS92 FLIKHQRIHAGEKLYECDECGKVFTWHASLIQHTKSHTGEKPYACAECDKAFSRSFSLIL
            350       360       370       380       390       400  

CCDS92 HQRTHTGEKPYVCKVCNKSFSWSSNLAKHQRTHTLDNPYEYENSFNYHSFLTEHQ
            410       420       430       440       450       

>>CCDS62957.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2                (387 aa)
 initn: 1635 init1: 878 opt: 1053  Z-score: 675.4  bits: 133.7 E(32554): 2.7e-31
Smith-Waterman score: 1053; 43.5% identity (70.1% similar) in 375 aa overlap (5-375:11-379)

                     10        20        30        40        50    
pF1KE0       MISFQESVTFQDVAVDFTAEEWQLLDCAERTLYWDVMLENYRNLISVGCPITKT
                 ::::::.:::: :: :::. :   .: :: .:::::: ...:.    :: 
CCDS62 MAAVSPTTRCQESVTFEDVAVVFTDEEWSRLVPIQRDLYKEVMLENYNSIVSLDWE-TKP
               10        20        30        40        50          

           60        70        80            90       100       110
pF1KE0 KVILKVEQGQEPWMVEGANPHESSPESDYPLVDEP----GKHRESKDNFLKSVLLTFNKI
       ..    .. .:  . :  .  ..::      :  :    : ...: ..  ..  :. .: 
CCDS62 EIHDASDKKSEGSLRECLG--RQSPLCPKFEVHTPNGRMGTEKQSPSGETRKKSLSRDKG
      60        70          80        90       100       110       

              120       130       140       150       160       170
pF1KE0 LTMERIHHYNMSTSLNPMRKKSYKSFEKCLPPNLDLLKYNRSYTVENAYECSECGKAFKK
       :  .     ..   :.  :..  ..  : .  . .: ...:..: :. :.: ::::::..
CCDS62 LRRRSALSREI---LTKERHQECSDCGKTFFDHSSLTRHQRTHTGEKPYDCRECGKAFSH
       120          130       140       150       160       170    

              180       190       200       210       220       230
pF1KE0 KFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQKIHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQL
       .  . ::  .:: ..:.::. :.::.  .. :..::.::.::.:: ::.:::::. ...:
CCDS62 RSSLSRHLMSHTGESPYECSVCSKAFFDRSSLTVHQRIHTGEKPFQCNECGKAFFDRSSL
          180       190       200       210       220       230    

              240       250       260       270       280       290
pF1KE0 VVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTLEKSFECKECGKTFRYSSSLYKHS
       . :::.::::.:::: ::::.:. .: ...:   :: .: .::.::::.:   ::: .:.
CCDS62 TRHQRIHTGESPYECHQCGKAFSQKSILTRHQLIHTGRKPYECNECGKAFYGVSSLNRHQ
          240       250       260       270       280       290    

              300       310       320       330       340       350
pF1KE0 RFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPYSCIECGKAFIKKSHLLRHQITHT
       . :.:.  :::  ::::: . : :. ::.::::.::: : :::::: .. .: ::: .::
CCDS62 KAHAGDPRYQCNECGKAFFDRSSLTQHQKIHTGDKPYECSECGKAFSQRCRLTRHQRVHT
          300       310       320       330       340       350    

              360       370             
pF1KE0 GEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT     
       ::::.::. :::.::.::..: ::.        
CCDS62 GEKPFECTVCGKVFSSKSSVIQHQRRYAKQGID
          360       370       380       

>>CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19           (527 aa)
 initn: 1031 init1: 1031 opt: 1051  Z-score: 672.9  bits: 133.7 E(32554): 3.7e-31
Smith-Waterman score: 1051; 46.1% identity (73.5% similar) in 321 aa overlap (58-378:46-358)

        30        40        50        60        70        80       
pF1KE0 AERTLYWDVMLENYRNLISVGCPITKTKVILKVEQGQEPWMVEGANPHESSPESDYPLVD
                                     :... :..:.   .     :  :.      
CCDS82 GNSSSHFVITPFKCNHCGKGFNQTLDLIRHLRIHTGEKPYECSNCRKAFSHKEKLIKHYK
          20        30        40        50        60        70     

        90       100       110       120       130       140       
pF1KE0 EPGKHRESKDNFLKSVLLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMRKKSYKSFEKCLPPNLDLL
         ....  : :   .... .....  .:::     :. .:.   . :  :: .  . .:.
CCDS82 IHSREQSYKCNECGKAFIKMSNLIRHQRIH-----TGEKPY---ACKECEKSFSQKSNLI
          80        90       100            110          120       

       150       160       170       180       190       200       
pF1KE0 KYNRSYTVENAYECSECGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQK
        ... .: :. :::.::::::..:  .: :.: :: .::. ::.::::. : : :: :..
CCDS82 DHEKIHTGEKPYECNECGKAFSQKQSLIAHQKVHTGEKPYACNECGKAFPRIASLALHMR
       130       140       150       160       170       180       

       210       220       230       240       250       260       
pF1KE0 IHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTL
        :.::.:. :. ::::: . ..:..: :.:::::::::..:::.:. .:... :..::: 
CCDS82 SHTGEKPYKCDKCGKAFSQFSMLIIHVRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSALTVHMRSHTG
       190       200       210       220       230       240       

       270       280       290       300       310       320       
pF1KE0 EKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPY
       :: .::::: :.: .....  :...:: ::::.:  ::::: . : :: :::::::::::
CCDS82 EKPYECKECRKAFSHKKNFITHQKIHTREKPYECNECGKAFIQMSNLVRHQRIHTGEKPY
       250       260       270       280       290       300       

       330       340       350       360       370                 
pF1KE0 SCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT         
        : :::::: .::.:. :.  :.::::::::.::::::::.:.:.:::.::         
CCDS82 ICKECGKAFSQKSNLIAHEKIHSGEKPYECNECGKAFSQKQNFITHQKVHTGEKPYDCNE
       310       320       330       340       350       360       

CCDS82 CGKAFSQIASLTLHLRSHTGEKPYECDKCGKAFSQCSLLNLHMRSHTGEKPYVCNECGKA
       370       380       390       400       410       420       

>--
 initn: 736 init1: 736 opt: 736  Z-score: 479.5  bits: 97.9 E(32554): 2.2e-20
Smith-Waterman score: 736; 59.5% identity (79.2% similar) in 168 aa overlap (211-378:359-526)

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 HTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQKIHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQLVVHQRLHTGE
                                     ::.:. ::.::::: . :.:..: : ::::
CCDS82 HSGEKPYECNECGKAFSQKQNFITHQKVHTGEKPYDCNECGKAFSQIASLTLHLRSHTGE
      330       340       350       360       370       380        

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 KPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTLEKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQ
       :::::..:::.:.  : .: :..::: :: . :.::::.:   .::  : : :::::::.
CCDS82 KPYECDKCGKAFSQCSLLNLHMRSHTGEKPYVCNECGKAFSQRTSLIVHMRGHTGEKPYE
      390       400       410       420       430       440        

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 CIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPYSCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRC
       :  :::::...: :. : : ::::::..: .::::: . : :  :.  :::::::.: .:
CCDS82 CNKCGKAFSQSSSLTIHIRGHTGEKPFDCSKCGKAFSQISSLTLHMRKHTGEKPYHCIEC
      450       460       470       480       490       500        

              370         
pF1KE0 GKAFSQKSNLIVHQKIHT 
       ::::::::.:. ::.::: 
CCDS82 GKAFSQKSHLVRHQRIHTH
      510       520       

>>CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19             (665 aa)
 initn: 1039 init1: 1039 opt: 1051  Z-score: 671.9  bits: 133.8 E(32554): 4.2e-31
Smith-Waterman score: 1051; 51.9% identity (80.7% similar) in 264 aa overlap (116-378:370-629)

          90       100       110       120        130       140    
pF1KE0 VDEPGKHRESKDNFLKSVLLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMR-KKSYKSFEKCLPPNL
                                     . :    :. .:.: ..  ::: .    . 
CCDS62 HLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFSRSSHLVSHQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQ----SY
     340       350       360       370       380       390         

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pF1KE0 DLLKYNRSYTVENAYECSECGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLAT
        :. ..:..: :. :::..:::.:......: :...:: .::.:::.:::.. .. .: .
CCDS62 VLVVHQRTHTGEKPYECNQCGKSFRQSYKLIAHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIA
         400       410       420       430       440       450     

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pF1KE0 HQKIHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKS
       ::.::.::.:. ::.:::.: .. .::.::: ::::::.::.::::.:.:.:..  : ..
CCDS62 HQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYKLVAHQRTHTGEKPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRT
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pF1KE0 HTLEKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGE
       :: :: .::.::::.:  :: :  :.:.:::::::.:  :::.:... :::.::: ::::
CCDS62 HTGEKPYECSECGKSFNRSSHLVMHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGE
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pF1KE0 KPYSCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT      
       ::: : .:::.: ..: : .:: :::::::.:::.:::.:: .. :::::. ::      
CCDS62 KPYECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPFECNQCGKTFSLSARLIVHQRTHTGEKPFT
         580       590       600       610       620       630     

CCDS62 CIQCGKAFINSYKLIRHQATHTEEKLYECN
         640       650       660     

>>CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19             (667 aa)
 initn: 1039 init1: 1039 opt: 1051  Z-score: 671.9  bits: 133.8 E(32554): 4.2e-31
Smith-Waterman score: 1051; 51.9% identity (80.7% similar) in 264 aa overlap (116-378:372-631)

          90       100       110       120        130       140    
pF1KE0 VDEPGKHRESKDNFLKSVLLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMR-KKSYKSFEKCLPPNL
                                     . :    :. .:.: ..  ::: .    . 
CCDS62 HLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFSRSSHLVSHQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQ----SY
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pF1KE0 DLLKYNRSYTVENAYECSECGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLAT
        :. ..:..: :. :::..:::.:......: :...:: .::.:::.:::.. .. .: .
CCDS62 VLVVHQRTHTGEKPYECNQCGKSFRQSYKLIAHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIA
       400       410       420       430       440       450       

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pF1KE0 HQKIHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKS
       ::.::.::.:. ::.:::.: .. .::.::: ::::::.::.::::.:.:.:..  : ..
CCDS62 HQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYKLVAHQRTHTGEKPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRT
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pF1KE0 HTLEKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGE
       :: :: .::.::::.:  :: :  :.:.:::::::.:  :::.:... :::.::: ::::
CCDS62 HTGEKPYECSECGKSFNRSSHLVMHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGE
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pF1KE0 KPYSCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT      
       ::: : .:::.: ..: : .:: :::::::.:::.:::.:: .. :::::. ::      
CCDS62 KPYECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPFECNQCGKTFSLSARLIVHQRTHTGEKPFT
       580       590       600       610       620       630       

CCDS62 CIQCGKAFINSYKLIRHQATHTEEKLYECN
       640       650       660       

>>CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19           (686 aa)
 initn: 1031 init1: 1031 opt: 1051  Z-score: 671.8  bits: 133.9 E(32554): 4.3e-31
Smith-Waterman score: 1051; 46.1% identity (73.5% similar) in 321 aa overlap (58-378:205-517)

        30        40        50        60        70        80       
pF1KE0 AERTLYWDVMLENYRNLISVGCPITKTKVILKVEQGQEPWMVEGANPHESSPESDYPLVD
                                     :... :..:.   .     :  :.      
CCDS12 GNSSSHFVITPFKCNHCGKGFNQTLDLIRHLRIHTGEKPYECSNCRKAFSHKEKLIKHYK
          180       190       200       210       220       230    

        90       100       110       120       130       140       
pF1KE0 EPGKHRESKDNFLKSVLLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMRKKSYKSFEKCLPPNLDLL
         ....  : :   .... .....  .:::     :. .:.   . :  :: .  . .:.
CCDS12 IHSREQSYKCNECGKAFIKMSNLIRHQRIH-----TGEKPY---ACKECEKSFSQKSNLI
          240       250       260            270          280      

       150       160       170       180       190       200       
pF1KE0 KYNRSYTVENAYECSECGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQK
        ... .: :. :::.::::::..:  .: :.: :: .::. ::.::::. : : :: :..
CCDS12 DHEKIHTGEKPYECNECGKAFSQKQSLIAHQKVHTGEKPYACNECGKAFPRIASLALHMR
        290       300       310       320       330       340      

       210       220       230       240       250       260       
pF1KE0 IHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTL
        :.::.:. :. ::::: . ..:..: :.:::::::::..:::.:. .:... :..::: 
CCDS12 SHTGEKPYKCDKCGKAFSQFSMLIIHVRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSALTVHMRSHTG
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pF1KE0 EKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPY
       :: .::::: :.: .....  :...:: ::::.:  ::::: . : :: :::::::::::
CCDS12 EKPYECKECRKAFSHKKNFITHQKIHTREKPYECNECGKAFIQMSNLVRHQRIHTGEKPY
        410       420       430       440       450       460      

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pF1KE0 SCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT         
        : :::::: .::.:. :.  :.::::::::.::::::::.:.:.:::.::         
CCDS12 ICKECGKAFSQKSNLIAHEKIHSGEKPYECNECGKAFSQKQNFITHQKVHTGEKPYDCNE
        470       480       490       500       510       520      

CCDS12 CGKAFSQIASLTLHLRSHTGEKPYECDKCGKAFSQCSLLNLHMRSHTGEKPYVCNECGKA
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>--
 initn: 736 init1: 736 opt: 736  Z-score: 478.4  bits: 98.1 E(32554): 2.5e-20
Smith-Waterman score: 736; 59.5% identity (79.2% similar) in 168 aa overlap (211-378:518-685)

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 HTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLATHQKIHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQLVVHQRLHTGE
                                     ::.:. ::.::::: . :.:..: : ::::
CCDS12 HSGEKPYECNECGKAFSQKQNFITHQKVHTGEKPYDCNECGKAFSQIASLTLHLRSHTGE
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pF1KE0 KPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKSHTLEKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQ
       :::::..:::.:.  : .: :..::: :: . :.::::.:   .::  : : :::::::.
CCDS12 KPYECDKCGKAFSQCSLLNLHMRSHTGEKPYVCNECGKAFSQRTSLIVHMRGHTGEKPYE
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pF1KE0 CIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGEKPYSCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRC
       :  :::::...: :. : : ::::::..: .::::: . : :  :.  :::::::.: .:
CCDS12 CNKCGKAFSQSSSLTIHIRGHTGEKPFDCSKCGKAFSQISSLTLHMRKHTGEKPYHCIEC
       610       620       630       640       650       660       

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pF1KE0 GKAFSQKSNLIVHQKIHT 
       ::::::::.:. ::.::: 
CCDS12 GKAFSQKSHLVRHQRIHTH
       670       680      

>>CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19             (692 aa)
 initn: 1039 init1: 1039 opt: 1051  Z-score: 671.7  bits: 133.9 E(32554): 4.3e-31
Smith-Waterman score: 1051; 51.9% identity (80.7% similar) in 264 aa overlap (116-378:397-656)

          90       100       110       120        130       140    
pF1KE0 VDEPGKHRESKDNFLKSVLLTFNKILTMERIHHYNMSTSLNPMR-KKSYKSFEKCLPPNL
                                     . :    :. .:.: ..  ::: .    . 
CCDS12 HLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFSRSSHLVSHQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQ----SY
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pF1KE0 DLLKYNRSYTVENAYECSECGKAFKKKFHFIRHEKNHTRKKPFECNDCGKAYSRKAHLAT
        :. ..:..: :. :::..:::.:......: :...:: .::.:::.:::.. .. .: .
CCDS12 VLVVHQRTHTGEKPYECNQCGKSFRQSYKLIAHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIA
            430       440       450       460       470       480  

          210       220       230       240       250       260    
pF1KE0 HQKIHNGERPFVCNDCGKAFMHKAQLVVHQRLHTGEKPYECSQCGKTFTWNSSFNQHVKS
       ::.::.::.:. ::.:::.: .. .::.::: ::::::.::.::::.:.:.:..  : ..
CCDS12 HQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYKLVAHQRTHTGEKPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRT
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pF1KE0 HTLEKSFECKECGKTFRYSSSLYKHSRFHTGEKPYQCIICGKAFGNTSVLVTHQRIHTGE
       :: :: .::.::::.:  :: :  :.:.:::::::.:  :::.:... :::.::: ::::
CCDS12 HTGEKPYECSECGKSFNRSSHLVMHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGE
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pF1KE0 KPYSCIECGKAFIKKSHLLRHQITHTGEKPYECNRCGKAFSQKSNLIVHQKIHT      
       ::: : .:::.: ..: : .:: :::::::.:::.:::.:: .. :::::. ::      
CCDS12 KPYECSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPFECNQCGKTFSLSARLIVHQRTHTGEKPFT
            610       620       630       640       650       660  

CCDS12 CIQCGKAFINSYKLIRHQATHTEEKLYECN
            670       680       690  




378 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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