seq1 = pF1KE3612.tfa, 345 bp seq2 = pF1KE3612/gi568815595r_42158101.tfa (gi568815595r:42158101_42363630), 205530 bp >pF1KE3612 345 >gi568815595r:42158101_42363630 (Chr3) (complement) 1-214 (100001-100214) 100% -> 215-345 (105400-105530) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGAACAGCGGCGTGTGCCTGTGCGTGCTGATGGCGGTACTGGCGGCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGAACAGCGGCGTGTGCCTGTGCGTGCTGATGGCGGTACTGGCGGCTGG 50 . : . : . : . : . : 51 CGCCCTGACGCAGCCGGTGCCTCCCGCAGATCCCGCGGGCTCCGGGCTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 CGCCCTGACGCAGCCGGTGCCTCCCGCAGATCCCGCGGGCTCCGGGCTGC 100 . : . : . : . : . : 101 AGCGGGCAGAGGAGGCGCCCCGTAGGCAGCTGAGGGTATCGCAGAGAACG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 AGCGGGCAGAGGAGGCGCCCCGTAGGCAGCTGAGGGTATCGCAGAGAACG 150 . : . : . : . : . : 151 GATGGCGAGTCCCGAGCGCACCTGGGCGCCCTGCTGGCAAGATACATCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100151 GATGGCGAGTCCCGAGCGCACCTGGGCGCCCTGCTGGCAAGATACATCCA 200 . : . : . : . : . : 201 GCAGGCCCGGAAAG CTCCTTCTGGACGAATGTCCATCGTTA ||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||| 100201 GCAGGCCCGGAAAGGTA...TAGCTCCTTCTGGACGAATGTCCATCGTTA 250 . : . : . : . : . : 242 AGAACCTGCAGAACCTGGACCCCAGCCACAGGATAAGTGACCGGGACTAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105427 AGAACCTGCAGAACCTGGACCCCAGCCACAGGATAAGTGACCGGGACTAC 300 . : . : . : . : . : 292 ATGGGCTGGATGGATTTTGGCCGTCGCAGTGCCGAGGAGTATGAGTACCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105477 ATGGGCTGGATGGATTTTGGCCGTCGCAGTGCCGAGGAGTATGAGTACCC 350 342 CTCC |||| 105527 CTCC