Result of SIM4 for pF1KE3596

seq1 = pF1KE3596.tfa, 2349 bp
seq2 = pF1KE3596/gi568815577r_43316745.tfa (gi568815577r:43316745_43526178), 209434 bp

>pF1KE3596 2349
>gi568815577r:43316745_43526178 (Chr21)

(complement)

1-156  (100001-100156)   100% ->
157-273  (100656-100772)   100% ->
274-337  (104142-104205)   100% ->
338-499  (104380-104541)   100% ->
500-624  (104812-104936)   100% ->
625-748  (105046-105169)   100% ->
749-972  (105722-105945)   100% ->
973-1119  (106174-106320)   100% ->
1120-1245  (106701-106826)   100% ->
1246-1462  (106942-107158)   100% ->
1463-1744  (107638-107919)   100% ->
1745-1976  (108405-108636)   99% ->
1977-2349  (109062-109434)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTTATCATGTCGGAGTTCAGCGCGGACCCCGCGGGCCAGGGTCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTTATCATGTCGGAGTTCAGCGCGGACCCCGCGGGCCAGGGTCAGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGCAGAAGCCCCTCCGGGTGGGTTTTTACGACATCGAGCGGACCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCAGCAGAAGCCCCTCCGGGTGGGTTTTTACGACATCGAGCGGACCCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAAAGGCAACTTCGCGGTGGTGAAGCTGGCGCGGCATCGAGTCACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAAAGGCAACTTCGCGGTGGTGAAGCTGGCGCGGCATCGAGTCACCAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACGCAG         GTTGCAATAAAAATAATTGATAAAACACGATTAGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACGCAGGTG...TAGGTTGCAATAAAAATAATTGATAAAACACGATTAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTCAAGCAATTTGGAGAAAATCTATCGTGAGGTTCAGCTGATGAAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100691 TTCAAGCAATTTGGAGAAAATCTATCGTGAGGTTCAGCTGATGAAGCTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGAACCATCCACACATCATAAAGCTTTACCAG         GTTATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100741 TGAACCATCCACACATCATAAAGCTTTACCAGGTA...TAGGTTATGGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACAAAGGACATGCTTTACATCGTCACTGAATTTGCTAAAAATGGAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104151 ACAAAGGACATGCTTTACATCGTCACTGAATTTGCTAAAAATGGAGAAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTTTG         ATTATTTGACTTCCAACGGGCACCTGAGTGAGAACG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104201 GTTTGGTA...CAGATTATTTGACTTCCAACGGGCACCTGAGTGAGAACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGGCGCGGAAGAAGTTCTGGCAAATCCTGTCGGCCGTGGAGTACTGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104416 AGGCGCGGAAGAAGTTCTGGCAAATCCTGTCGGCCGTGGAGTACTGTCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GACCATCACATCGTCCACCGGGACCTCAAGACCGAGAACCTCCTGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104466 GACCATCACATCGTCCACCGGGACCTCAAGACCGAGAACCTCCTGCTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGGCAACATGGACATCAAGCTGGCAG         ATTTTGGATTTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 104516 TGGCAACATGGACATCAAGCTGGCAGGCA...CAGATTTTGGATTTGGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATTTCTACAAGTCAGGAGAGCCTCTGTCCACGTGGTGTGGGAGCCCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104827 ATTTCTACAAGTCAGGAGAGCCTCTGTCCACGTGGTGTGGGAGCCCCCCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TATGCCGCCCCGGAAGTCTTTGAGGGGAAGGAGTATGAAGGCCCCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104877 TATGCCGCCCCGGAAGTCTTTGAGGGGAAGGAGTATGAAGGCCCCCAGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGACATCTGG         AGCCTGGGCGTGGTGCTGTACGTCCTGGTCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 104927 GGACATCTGGGTA...CAGAGCCTGGGCGTGGTGCTGTACGTCCTGGTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GCGGTTCTCTCCCCTTCGATGGGCCTAACCTGCCGACGCTGAGACAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105077 GCGGTTCTCTCCCCTTCGATGGGCCTAACCTGCCGACGCTGAGACAGCGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTGCTGGAGGGCCGCTTCCGCATCCCCTTCTTCATGTCTCAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 105127 GTGCTGGAGGGCCGCTTCCGCATCCCCTTCTTCATGTCTCAAGGTG...C

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    749   ACTGTGAGAGCCTGATCCGCCGCATGCTGGTGGTGGACCCCGCCAGGC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105720 AGACTGTGAGAGCCTGATCCGCCGCATGCTGGTGGTGGACCCCGCCAGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GCATCACCATCGCCCAGATCCGGCAGCACCGGTGGATGCGGGCTGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105770 GCATCACCATCGCCCAGATCCGGCAGCACCGGTGGATGCGGGCTGAGCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TGCTTGCCGGGACCCGCCTGCCCCGCCTTCTCCGCACACAGCTACACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105820 TGCTTGCCGGGACCCGCCTGCCCCGCCTTCTCCGCACACAGCTACACCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CAACCTGGGCGACTACGATGAGCAGGCGCTGGGTATCATGCAGACCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105870 CAACCTGGGCGACTACGATGAGCAGGCGCTGGGTATCATGCAGACCCTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GCGTGGACCGGCAGAGGACGGTGGAG         TCACTGCAAAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 105920 GCGTGGACCGGCAGAGGACGGTGGAGGTG...CAGTCACTGCAAAACAGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AGCTATAACCACTTTGCTGCCATTTATTACCTCCTCCTTGAGCGGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106189 AGCTATAACCACTTTGCTGCCATTTATTACCTCCTCCTTGAGCGGCTCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GGAGTATCGGAATGCCCAGTGCGCCCGCCCCGGGCCTGCCAGGCAGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106239 GGAGTATCGGAATGCCCAGTGCGCCCGCCCCGGGCCTGCCAGGCAGCCGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GGCCTCGGAGCTCGGACCTCAGTGGTTTGGAG         GTGCCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 106289 GGCCTCGGAGCTCGGACCTCAGTGGTTTGGAGGTG...CAGGTGCCTCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GAAGGTCTTTCCACCGACCCTTTCCGACCTGCCTTGCTGTGCCCGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106710 GAAGGTCTTTCCACCGACCCTTTCCGACCTGCCTTGCTGTGCCCGCAGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GCAGACCTTGGTGCAGTCCGTCCTCCAGGCCGAGATGGACTGTGAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106760 GCAGACCTTGGTGCAGTCCGTCCTCCAGGCCGAGATGGACTGTGAGCTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 AGAGCTCGCTGCAGTGG         CCCTTGTTCTTCCCGGTGGATGCC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 106810 AGAGCTCGCTGCAGTGGGTG...CAGCCCTTGTTCTTCCCGGTGGATGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 AGCTGCAGCGGAGTGTTCCGGCCCCGGCCCGTGTCCCCAAGCAGCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106966 AGCTGCAGCGGAGTGTTCCGGCCCCGGCCCGTGTCCCCAAGCAGCCTGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GGACACAGCCATCAGTGAGGAGGCCAGGCAGGGGCCGGGCCTAGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107016 GGACACAGCCATCAGTGAGGAGGCCAGGCAGGGGCCGGGCCTAGAGGAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 AGCAGGACACGCAGGAGTCCCTGCCCAGCAGCACGGGCCGGAGGCACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107066 AGCAGGACACGCAGGAGTCCCTGCCCAGCAGCACGGGCCGGAGGCACACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 CTGGCCGAGGTCTCCACCCGCCTCTCCCCACTCACCGCGCCAT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 107116 CTGGCCGAGGTCTCCACCCGCCTCTCCCCACTCACCGCGCCATGTA...C

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1463   GTATAGTCGTCTCCCCCTCCACCACGGCAAGTCCTGCAGAGGGAACCA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107636 AGGTATAGTCGTCTCCCCCTCCACCACGGCAAGTCCTGCAGAGGGAACCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 GCTCTGACAGTTGTCTGACCTTCTCTGCGAGCAAAAGCCCCGCGGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107686 GCTCTGACAGTTGTCTGACCTTCTCTGCGAGCAAAAGCCCCGCGGGGCTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 AGTGGCACCCCGGCCACTCAGGGGCTGCTGGGCGCCTGCTCCCCGGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107736 AGTGGCACCCCGGCCACTCAGGGGCTGCTGGGCGCCTGCTCCCCGGTCAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 GCTGGCCTCGCCCTTCCTGGGGTCGCAGTCCGCCACCCCAGTGCTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107786 GCTGGCCTCGCCCTTCCTGGGGTCGCAGTCCGCCACCCCAGTGCTGCAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 CTCAGGGGGGCTTGGGAGGAGCTGTTCTGCTCCCTGTCAGCTTCCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107836 CTCAGGGGGGCTTGGGAGGAGCTGTTCTGCTCCCTGTCAGCTTCCAGGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 GGACGGCGGGCGTCGGACACCTCACTGACTCAAG         GGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 107886 GGACGGCGGGCGTCGGACACCTCACTGACTCAAGGTG...CAGGGCTGAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 GGCCTTTCGGCAGCAGCTGAGGAAGACCACGCGGACCAAAGGGTTTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108412 GGCCTTTCGGCAGCAGCTGAGGAAGACCACGCGGACCAAAGGGTTTCTGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 GACTGAACAAAATCAAGGGGCTGGCTCGCCAGGTGTGCCAGGTCCCTGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||
 108462 GACTGAACAAAATCAAGGGGCTGGCTCGCCAGGTGTGCCAGGCCCCCGCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 AGCCGGGCCAGCAGGGGCGGCCTGAGCCCCTTCCACGCCCCTGCACAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108512 AGCCGGGCCAGCAGGGGCGGCCTGAGCCCCTTCCACGCCCCTGCACAGAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 CCCAGGCCTGCACGGCGGCGCAGCCGGCAGCCGGGAGGGCTGGAGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108562 CCCAGGCCTGCACGGCGGCGCAGCCGGCAGCCGGGAGGGCTGGAGCCTGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 TGGAGGAGGTGCTAGAGCAGCAGAG         GCTGCTCCAGTTACAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 108612 TGGAGGAGGTGCTAGAGCAGCAGAGGTA...CAGGCTGCTCCAGTTACAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 CACCACCCGGCCGCTGCACCCGGCTGCTCCCAGGCCCCCCAGCCGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109078 CACCACCCGGCCGCTGCACCCGGCTGCTCCCAGGCCCCCCAGCCGGCCCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 TGCCCCGTTTGTGATCGCCCCCTGTGATGGCCCTGGGGCTGCCCCGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109128 TGCCCCGTTTGTGATCGCCCCCTGTGATGGCCCTGGGGCTGCCCCGCTCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 CCAGCACCCTCCTCACGTCGGGGCTCCCGCTGCTGCCGCCCCCACTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109178 CCAGCACCCTCCTCACGTCGGGGCTCCCGCTGCTGCCGCCCCCACTCCTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2143 CAGACCGGCGCGTCCCCGGTGGCCTCAGCGGCGCAGCTCCTGGACACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109228 CAGACCGGCGCGTCCCCGGTGGCCTCAGCGGCGCAGCTCCTGGACACACA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2193 CCTGCACATTGGCACCGGCCCCACCGCCCTCCCCGCTGTGCCCCCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109278 CCTGCACATTGGCACCGGCCCCACCGCCCTCCCCGCTGTGCCCCCACCAC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2243 GCCTGGCCAGGCTGGCCCCAGGTTGTGAGCCCCTGGGGCTGCTGCAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109328 GCCTGGCCAGGCTGGCCCCAGGTTGTGAGCCCCTGGGGCTGCTGCAGGGG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2293 GACTGTGAGATGGAGGACCTGATGCCCTGCTCCCTAGGCACGTTTGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109378 GACTGTGAGATGGAGGACCTGATGCCCTGCTCCCTAGGCACGTTTGTCCT

   2450     .
   2343 GGTGCAG
        |||||||
 109428 GGTGCAG

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