seq1 = pF1KE0628.tfa, 1116 bp
seq2 = pF1KE0628/gi568815596r_196037450.tfa (gi568815596r:196037450_196263383), 225934 bp

>pF1KE0628 1116
>gi568815596r:196037450_196263383 (Chr2)

(complement)

1-122  (100001-100122)   100% ->
123-335  (106733-106945)   99% ->
336-480  (117329-117473)   100% ->
481-607  (119698-119824)   100% ->
608-656  (122087-122135)   100% ->
657-836  (123585-123764)   99% ->
837-1116  (125655-125934)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGAGGAGGAGATTTGATTGCCGAAGTATTTCAGGCCTACTAACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGAGGAGGAGATTTGATTGCCGAAGTATTTCAGGCCTACTAACTAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AACTCCTCAAATTCCAATAAAAATGGAAAACTTTAATAATTTCTATATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AACTCCTCAAATTCCAATAAAAATGGAAAACTTTAATAATTTCTATATAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTACATCTAAAGAGCTAGGGAG         AGGTAAATTTGCTGTGGTT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| |||||||||||||||
 100101 TTACATCTAAAGAGCTAGGGAGGTA...CAGAGGAAAATTTGCTGTGGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGACAATGTATATCAAAATCTACTGGCCAAGAATATGCTGCAAAATTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106752 AGACAATGTATATCAAAATCTACTGGCCAAGAATATGCTGCAAAATTTCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAAAAAGAGAAGAAGAGGACAGGATTGTCGGGCAGAAATTTTACACGAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 106802 AAAAAAGAGAAGAAGAGGACAGGATTGTCGAGCAGAAATTTTACACGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTGCTGTGCTTGAATTGGCAAAGTCTTGTCCCCGTGTTATTAATCTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106852 TTGCTGTGCTTGAATTGGCAAAGTCTTGTCCCCGTGTTATTAATCTTCAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAGGTCTATGAAAATACAAGTGAAATCATTTTGATATTGGAATA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 106902 GAGGTCTATGAAAATACAAGTGAAATCATTTTGATATTGGAATAGTA...

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    336    TGCTGCAGGTGGAGAAATTTTCAGCCTGTGTTTACCTGAGTTGGCTG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117326 TAGTGCTGCAGGTGGAGAAATTTTCAGCCTGTGTTTACCTGAGTTGGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAATGGTTTCTGAAAATGATGTTATCAGACTCATTAAACAAATACTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117376 AAATGGTTTCTGAAAATGATGTTATCAGACTCATTAAACAAATACTTGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGAGTTTATTATCTACATCAGAATAACATTGTACACCTTGATTTAAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 117426 GGAGTTTATTATCTACATCAGAATAACATTGTACACCTTGATTTAAAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    481        CCACAGAATATATTACTGAGCAGCATATACCCTCTCGGGGACA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117476 A...TAGCCACAGAATATATTACTGAGCAGCATATACCCTCTCGGGGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTAAAATAGTAGATTTTGGAATGTCTCGAAAAATAGGGCATGCGTGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119741 TTAAAATAGTAGATTTTGGAATGTCTCGAAAAATAGGGCATGCGTGTGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTTCGGGAAATCATGGGAACACCAGAATATTTAG         CTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 119791 CTTCGGGAAATCATGGGAACACCAGAATATTTAGGTA...CAGCTCCAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AATCCTGAACTATGATCCCATTACCACAGCAACAGATATGTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 122094 AATCCTGAACTATGATCCCATTACCACAGCAACAGATATGTGGTA...CA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    657  GAATATTGGTATAATAGCATATATGTTGTTAACTCACACATCACCATTT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123584 GGAATATTGGTATAATAGCATATATGTTGTTAACTCACACATCACCATTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTGGGAGAAGATAATCAAGAAACATACCTCAATATCTCTCAAGTTAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 123634 GTGGGAGAAGATAATCAAGAAACATACCTCAATATTTCTCAAGTTAATGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AGATTATTCGGAAGAAACTTTTTCATCAGTTTCACAGCTGGCCACAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123684 AGATTATTCGGAAGAAACTTTTTCATCAGTTTCACAGCTGGCCACAGACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TTATTCAGAGCCTTTTAGTAAAAAATCCAGA         GAAAAGACCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 123734 TTATTCAGAGCCTTTTAGTAAAAAATCCAGAGTA...AAGGAAAAGACCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ACAGCAGAGATATGCCTTTCTCATTCTTGGCTACAGCAGTGGGACTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125665 ACAGCAGAGATATGCCTTTCTCATTCTTGGCTACAGCAGTGGGACTTTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AAACTTGTTTCACCCTGAAGAAACTTCCAGTTCCTCTCAAACTCAGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125715 AAACTTGTTTCACCCTGAAGAAACTTCCAGTTCCTCTCAAACTCAGGATC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ATTCTGTAAGGTCCTCTGAAGACAAGACTTCTAAATCCTCCTGTAATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125765 ATTCTGTAAGGTCCTCTGAAGACAAGACTTCTAAATCCTCCTGTAATGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 ACCTGTGGTGATAGAGAAGACAAAGAGAATATCCCAGAGGATAGCAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125815 ACCTGTGGTGATAGAGAAGACAAAGAGAATATCCCAGAGGATAGCAGCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GGTTTCCAAAAGATTTCGTTTCGATGACTCATTACCCAATCCCCATGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125865 GGTTTCCAAAAGATTTCGTTTCGATGACTCATTACCCAATCCCCATGAAC

   1150     .    :    .    :
   1097 TTGTTTCAGATTTGCTCTGT
        ||||||||||||||||||||
 125915 TTGTTTCAGATTTGCTCTGT