seq1 = pF1KE1440.tfa, 1047 bp seq2 = pF1KE1440/gi568815595r_13718947.tfa (gi568815595r:13718947_13979816), 260870 bp >pF1KE1440 1047 >gi568815595r:13718947_13979816 (Chr3) (complement) 1-71 (100001-100071) 100% -> 72-298 (104644-104870) 100% -> 299-570 (125014-125285) 100% -> 571-1047 (160394-160870) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGAACCGGAAAGCGCGGCGCTGCCTGGGCCACCTCTTTCTCAGCCTGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGAACCGGAAAGCGCGGCGCTGCCTGGGCCACCTCTTTCTCAGCCTGGG 50 . : . : . : . : . : 51 CATGGTCTACCTCCGGATCGG TGGCTTCTCCTCAGTGGTAG |||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||| 100051 CATGGTCTACCTCCGGATCGGGTA...CAGTGGCTTCTCCTCAGTGGTAG 100 . : . : . : . : . : 92 CTCTGGGCGCAAGCATCATCTGTAACAAGATCCCAGGCCTGGCTCCCAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104664 CTCTGGGCGCAAGCATCATCTGTAACAAGATCCCAGGCCTGGCTCCCAGA 150 . : . : . : . : . : 142 CAGCGGGCGATCTGCCAGAGCCGGCCCGACGCCATCATCGTCATAGGAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104714 CAGCGGGCGATCTGCCAGAGCCGGCCCGACGCCATCATCGTCATAGGAGA 200 . : . : . : . : . : 192 AGGCTCACAAATGGGCCTGGACGAGTGTCAGTTTCAGTTCCGCAATGGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104764 AGGCTCACAAATGGGCCTGGACGAGTGTCAGTTTCAGTTCCGCAATGGCC 250 . : . : . : . : . : 242 GCTGGAACTGCTCTGCACTGGGAGAGCGCACCGTCTTCGGGAAGGAGCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104814 GCTGGAACTGCTCTGCACTGGGAGAGCGCACCGTCTTCGGGAAGGAGCTC 300 . : . : . : . : . : 292 AAAGTGG GGAGCCGGGAGGCTGCGTTCACCTACGCCATCAT |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| 104864 AAAGTGGGTA...CAGGGAGCCGGGAGGCTGCGTTCACCTACGCCATCAT 350 . : . : . : . : . : 333 TGCCGCCGGCGTGGCCCACGCCATCACAGCTGCCTGTACCCAGGGCAACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125048 TGCCGCCGGCGTGGCCCACGCCATCACAGCTGCCTGTACCCAGGGCAACC 400 . : . : . : . : . : 383 TGAGCGACTGTGGCTGCGACAAAGAGAAGCAAGGCCAGTACCACCGGGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125098 TGAGCGACTGTGGCTGCGACAAAGAGAAGCAAGGCCAGTACCACCGGGAC 450 . : . : . : . : . : 433 GAGGGCTGGAAGTGGGGTGGCTGCTCTGCCGACATCCGCTACGGCATCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125148 GAGGGCTGGAAGTGGGGTGGCTGCTCTGCCGACATCCGCTACGGCATCGG 500 . : . : . : . : . : 483 CTTCGCCAAGGTCTTTGTGGATGCCCGGGAGATCAAGCAGAATGCCCGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125198 CTTCGCCAAGGTCTTTGTGGATGCCCGGGAGATCAAGCAGAATGCCCGGA 550 . : . : . : . : . : 533 CTCTCATGAACTTGCACAACAACGAGGCAGGCCGAAAG ATC ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| 125248 CTCTCATGAACTTGCACAACAACGAGGCAGGCCGAAAGGTA...CAGATC 600 . : . : . : . : . : 574 CTGGAGGAGAACATGAAGCTGGAATGTAAGTGCCACGGCGTGTCAGGCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 160397 CTGGAGGAGAACATGAAGCTGGAATGTAAGTGCCACGGCGTGTCAGGCTC 650 . : . : . : . : . : 624 GTGCACCACCAAGACGTGCTGGACCACACTGCCACAGTTTCGGGAGCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 160447 GTGCACCACCAAGACGTGCTGGACCACACTGCCACAGTTTCGGGAGCTGG 700 . : . : . : . : . : 674 GCTACGTGCTCAAGGACAAGTACAACGAGGCCGTTCACGTGGAGCCTGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 160497 GCTACGTGCTCAAGGACAAGTACAACGAGGCCGTTCACGTGGAGCCTGTG 750 . : . : . : . : . : 724 CGTGCCAGCCGCAACAAGCGGCCCACCTTCCTGAAGATCAAGAAGCCACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 160547 CGTGCCAGCCGCAACAAGCGGCCCACCTTCCTGAAGATCAAGAAGCCACT 800 . : . : . : . : . : 774 GTCGTACCGCAAGCCCATGGACACGGACCTGGTGTACATCGAGAAGTCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 160597 GTCGTACCGCAAGCCCATGGACACGGACCTGGTGTACATCGAGAAGTCGC 850 . : . : . : . : . : 824 CCAACTACTGCGAGGAGGACCCGGTGACCGGCAGTGTGGGCACCCAGGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 160647 CCAACTACTGCGAGGAGGACCCGGTGACCGGCAGTGTGGGCACCCAGGGC 900 . : . : . : . : . : 874 CGCGCCTGCAACAAGACGGCTCCCCAGGCCAGCGGCTGTGACCTCATGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 160697 CGCGCCTGCAACAAGACGGCTCCCCAGGCCAGCGGCTGTGACCTCATGTG 950 . : . : . : . : . : 924 CTGTGGGCGTGGCTACAACACCCACCAGTACGCCCGCGTGTGGCAGTGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 160747 CTGTGGGCGTGGCTACAACACCCACCAGTACGCCCGCGTGTGGCAGTGCA 1000 . : . : . : . : . : 974 ACTGTAAGTTCCACTGGTGCTGCTATGTCAAGTGCAACACGTGCAGCGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 160797 ACTGTAAGTTCCACTGGTGCTGCTATGTCAAGTGCAACACGTGCAGCGAG 1050 . : . : 1024 CGCACGGAGATGTACACGTGCAAG |||||||||||||||||||||||| 160847 CGCACGGAGATGTACACGTGCAAG