Result of FASTA (omim) for pF1KB5978
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5978, 564 aa
  1>>>pF1KB5978 564 - 564 aa - 564 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5620+/-0.000543; mu= -5.6537+/- 0.034
 mean_var=362.5729+/-73.406, 0's: 0 Z-trim(117.6): 162  B-trim: 399 in 1/55
 Lambda= 0.067356
 statistics sampled from 29496 (29670) to 29496 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.675), E-opt: 0.2 (0.348), width:  16
 Scan time: 11.960

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_005545 (OMIM: 148041,615726) keratin, type II c ( 564) 3628 367.2 7.7e-101
NP_775109 (OMIM: 612315,615735) keratin, type II c ( 564) 3594 363.9 7.6e-100
NP_005546 (OMIM: 148042,615728) keratin, type II c ( 564) 3592 363.7 8.7e-100
NP_000415 (OMIM: 131760,131800,131900,131960,14804 ( 590) 2776 284.5 6.7e-76
NP_004684 (OMIM: 609025,612318) keratin, type II c ( 551) 2379 245.9 2.6e-64
NP_476429 (OMIM: 122100,148043) keratin, type II c ( 628) 2169 225.5   4e-58
NP_006112 (OMIM: 113800,139350,144200,146590,60096 ( 644) 2089 217.7 8.8e-56
NP_056932 (OMIM: 616671) keratin, type II cytoskel ( 638) 2061 215.0 5.8e-55
NP_002263 (OMIM: 123940,193900) keratin, type II c ( 520) 2041 213.0 1.9e-54
NP_778253 (OMIM: 611158) keratin, type II cytoskel ( 578) 1994 208.5 4.9e-53
NP_787028 (OMIM: 611160) keratin, type II cytoskel ( 535) 1982 207.3   1e-52
NP_000414 (OMIM: 146800,600194) keratin, type II c ( 639) 1974 206.6   2e-52
NP_778238 (OMIM: 608247) keratin, type II cytoskel ( 540) 1871 196.5 1.9e-49
NP_258259 (OMIM: 608245,615896) keratin, type II c ( 523) 1848 194.2 8.5e-49
NP_542785 (OMIM: 608246) keratin, type II cytoskel ( 511) 1836 193.1 1.9e-48
NP_001139697 (OMIM: 608246) keratin, type II cytos ( 511) 1836 193.1 1.9e-48
NP_778223 (OMIM: 194300,608248,613981,614929) kera ( 529) 1804 190.0 1.7e-47
XP_011536637 (OMIM: 602766) PREDICTED: keratin, ty ( 600) 1768 186.5 2.1e-46
NP_149034 (OMIM: 602766) keratin, type II cuticula ( 600) 1768 186.5 2.1e-46
XP_016874325 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 419) 1730 182.7 2.1e-45
XP_016874238 (OMIM: 608245,615896) PREDICTED: kera ( 441) 1728 182.5 2.5e-45
XP_016874323 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 442) 1728 182.5 2.5e-45
NP_005547 (OMIM: 148059) keratin, type II cytoskel ( 469) 1714 181.2 6.6e-45
NP_002264 (OMIM: 148060) keratin, type II cytoskel ( 483) 1714 181.2 6.7e-45
NP_001243222 (OMIM: 148060) keratin, type II cytos ( 483) 1714 181.2 6.7e-45
NP_001243211 (OMIM: 148060) keratin, type II cytos ( 511) 1714 181.2   7e-45
NP_775487 (OMIM: 611159) keratin, type II cytoskel ( 520) 1622 172.3 3.5e-42
XP_011536627 (OMIM: 148059) PREDICTED: keratin, ty ( 445) 1593 169.4 2.2e-41
NP_149022 (OMIM: 601078) keratin, type II cuticula ( 513) 1522 162.5 2.9e-39
XP_016874324 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 439) 1506 160.9 7.6e-39
XP_016874322 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 445) 1506 160.9 7.7e-39
NP_002274 (OMIM: 602032,602767) keratin, type II c ( 507) 1449 155.4 3.9e-37
NP_002272 (OMIM: 158000,602153) keratin, type II c ( 505) 1432 153.8 1.2e-36
NP_001307127 (OMIM: 158000,601928) keratin, type I ( 486) 1392 149.9 1.8e-35
XP_016874785 (OMIM: 158000,601928) PREDICTED: kera ( 486) 1392 149.9 1.8e-35
XP_005268923 (OMIM: 158000,601928) PREDICTED: kera ( 563) 1392 149.9   2e-35
NP_002273 (OMIM: 158000,602765) keratin, type II c ( 493) 1389 149.6 2.2e-35
NP_001287743 (OMIM: 611159) keratin, type II cytos ( 410) 1268 137.8 6.7e-32
XP_011536590 (OMIM: 611158) PREDICTED: keratin, ty ( 345) 1250 135.9   2e-31
NP_001139698 (OMIM: 608246) keratin, type II cytos ( 469) 1207 131.9 4.5e-30
XP_016874783 (OMIM: 148059) PREDICTED: keratin, ty ( 292) 1082 119.6 1.4e-26
XP_011536591 (OMIM: 611158) PREDICTED: keratin, ty ( 322) 1064 117.8 5.2e-26
NP_001074961 (OMIM: 611161) keratin, type II cytos ( 422) 1061 117.7 7.7e-26
NP_872313 (OMIM: 611161) keratin, type II cytoskel ( 452) 1061 117.7 8.1e-26
XP_016874326 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 271) 1055 116.9 8.4e-26
XP_011536559 (OMIM: 608247) PREDICTED: keratin, ty ( 508)  995 111.3 7.5e-24
NP_001287739 (OMIM: 602032,602767) keratin, type I ( 295)  886 100.5 7.9e-21
XP_011536312 (OMIM: 611159) PREDICTED: keratin, ty ( 488)  869 99.1 3.5e-20
NP_003371 (OMIM: 116300,193060) vimentin [Homo sap ( 466)  777 90.1 1.7e-17
XP_006717563 (OMIM: 116300,193060) PREDICTED: vime ( 466)  777 90.1 1.7e-17


>>NP_005545 (OMIM: 148041,615726) keratin, type II cytos  (564 aa)
 initn: 3628 init1: 3628 opt: 3628  Z-score: 1931.4  bits: 367.2 E(85289): 7.7e-101
Smith-Waterman score: 3628; 100.0% identity (100.0% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 VRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 GMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 EELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRAIGGGLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRAIGGGLS
              490       500       510       520       530       540

              550       560    
pF1KB5 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
       ::::::::::::::::::::::::
NP_005 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
              550       560    

>>NP_775109 (OMIM: 612315,615735) keratin, type II cytos  (564 aa)
 initn: 3594 init1: 3594 opt: 3594  Z-score: 1913.5  bits: 363.9 E(85289): 7.6e-100
Smith-Waterman score: 3594; 98.4% identity (100.0% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
NP_775 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
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               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB5 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
NP_775 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB5 VRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELR
       :::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 VRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 GMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
       .:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 NMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 EELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
NP_775 EELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCASLQAAIADAEQRGEMAL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRAIGGGLS
       :::::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
NP_775 VGQVNVSVVQSTISSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGIGGGFSSSSGRAIGGGLS
              490       500       510       520       530       540

              550       560    
pF1KB5 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
       ::::::::::::::::::::::::
NP_775 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
              550       560    

>>NP_005546 (OMIM: 148042,615728) keratin, type II cytos  (564 aa)
 initn: 3592 init1: 3592 opt: 3592  Z-score: 1912.5  bits: 363.7 E(85289): 8.7e-100
Smith-Waterman score: 3592; 98.6% identity (99.8% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
NP_005 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
NP_005 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 VRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELR
       :::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
NP_005 VRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDNIVGERGRLDSELR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 GMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
       .:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
              310       320       330       340       350       360

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pF1KB5 EELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
       ::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
              370       380       390       400       410       420

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pF1KB5 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRAIGGGLS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
NP_005 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRATGGGLS
              490       500       510       520       530       540

              550       560    
pF1KB5 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
       ::::::::::::::::::::::::
NP_005 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
              550       560    

>>NP_000415 (OMIM: 131760,131800,131900,131960,148040,17  (590 aa)
 initn: 2642 init1: 2491 opt: 2776  Z-score: 1483.7  bits: 284.5 E(85289): 6.7e-76
Smith-Waterman score: 2867; 77.2% identity (90.3% similar) in 588 aa overlap (3-563:2-589)

               10        20        30        40             50     
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLG-----GACGGAG
         : ....  .:.. :.::. ::  :.:::..:.::: : . :.::.:     :::: .:
NP_000  MSRQSSVSFRSGGSRSFSTASAITPSVSRTSFTSVSRSGGGGGGGFGRVSLAGACGVGG
                10        20        30        40        50         

          60        70        80        90        100       110    
pF1KB5 FGSRSLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGG-AGSGFGFGGGAGIGFGLGG
       .::::::.:::::::::. .. .. . .:. :::.::::: :::::::::::: ::::::
NP_000 YGSRSLYNLGGSKRISISTSGGSFRNRFGAGAGGGYGFGGGAGSGFGFGGGAGGGFGLGG
      60        70        80        90       100       110         

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB5 GAGLAGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKF
       :::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::
NP_000 GAGFGGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPSIQRVRTEEREQIKTLNNKF
     120       130       140       150       160       170         

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB5 ASFIDKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGR
       :::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGR
     180       190       200       210       220       230         

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB5 LDSELRGMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDE
       ::::::.::::::::::::::::::::.:::::: :::::::::::::::.::.:.: ::
NP_000 LDSELRNMQDLVEDFKNKYEDEINKRTTAENEFVMLKKDVDAAYMNKVELEAKVDALMDE
     240       250       260       270       280       290         

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB5 INFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAES
       :::.. ..::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::
NP_000 INFMKMFFDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIANRSRTEAES
     300       310       320       330       340       350         

          360       370       380       390       400       410    
pF1KB5 WYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQ
       :::::::::: :::::::::::::.::.:.::::::::.:::.::::::::: :::::::
NP_000 WYQTKYEELQQTAGRHGDDLRNTKHEISEMNRMIQRLRAEIDNVKKQCANLQNAIADAEQ
     360       370       380       390       400       410         

          420       430       440       450       460       470    
pF1KB5 RGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEEC
       :::.:::::.:::  ::.::::::::.::::.:::::::.::::::::::::::::::::
NP_000 RGELALKDARNKLAELEEALQKAKQDMARLLREYQELMNTKLALDVEIATYRKLLEGEEC
     420       430       440       450       460       470         

          480       490       500                 510              
pF1KB5 RLNGEGVGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLG----------LGGGSSYSY-------
       ::.::::: :::::: :.::::::..:: :.:::          :.:::: ::       
NP_000 RLSGEGVGPVNISVVTSSVSSGYGSGSGYGGGLGGGLGGGLGGGLAGGSSGSYYSSSSGG
     480       490       500       510       520       530         

          520        530       540       550       560    
pF1KB5 ---GSGLGVGG-GFSSSSGRAIGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
          :.::.::: :::.::::..: :..: ::.::..:...:.::::::.: 
NP_000 VGLGGGLSVGGSGFSASSGRGLGVGFGSGGGSSSSVKFVSTTSSSRKSFKS
     540       550       560       570       580       590

>>NP_004684 (OMIM: 609025,612318) keratin, type II cytos  (551 aa)
 initn: 2534 init1: 2121 opt: 2379  Z-score: 1275.6  bits: 245.9 E(85289): 2.6e-64
Smith-Waterman score: 2577; 72.3% identity (89.5% similar) in 573 aa overlap (3-564:2-551)

               10        20        30        40          50        
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSR-GSGGLGG-ACGGAGFGS
         : ...:  .:.::::::..::  :...:: ::::::.::  ::::::  . .::.:::
NP_004  MSRQSSITFQSGSRRGFSTTSAITPAAGRSRFSSVSVARSAAGSGGLGRISSAGASFGS
                10        20        30        40        50         

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB5 RSLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGL
       ::::.:::.::.::.: . .  .:.:.::.. .:   ..::::.:::.:           
NP_004 RSLYNLGGAKRVSINGCGSSCRSGFGGRASNRFG---VNSGFGYGGGVG-----------
      60        70        80        90          100                

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB5 AGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFI
        :::.::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 -GGFSGPSFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLHLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFI
          110       120       130       140       150       160    

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB5 DKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSE
       :::::::::::::::::.::::::..::::::::::..: ..:::::.::. :::::..:
NP_004 DKVRFLEQQNKVLETKWALLQEQGSRTVRQNLEPLFDSYTSELRRQLESITTERGRLEAE
          170       180       190       200       210       220    

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB5 LRGMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFL
       ::.:::.::::: .::::::::::::::::.:::::::::::::::.::. .: .::::.
NP_004 LRNMQDVVEDFKVRYEDEINKRTAAENEFVALKKDVDAAYMNKVELEAKVKSLPEEINFI
          230       240       250       260       270       280    

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB5 RALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQT
       ....::::::.::...::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::
NP_004 HSVFDAELSQLQTQVGDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAESWYQT
          290       300       310       320       330       340    

      360       370       380       390       400       410        
pF1KB5 KYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEM
       :::::::::::::::::::::::.:.::::::::.::: :::::..::.::::::::::.
NP_004 KYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEISEMNRMIQRLRAEIDSVKKQCSSLQTAIADAEQRGEL
          350       360       370       380       390       400    

      420       430       440       450       460       470        
pF1KB5 ALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNG
       :::::. ::  ::.::::::::.::::.:::::::.::::::::::::::::::::::.:
NP_004 ALKDARAKLVDLEEALQKAKQDMARLLREYQELMNIKLALDVEIATYRKLLEGEECRLSG
          410       420       430       440       450       460    

      480       490       500        510               520         
pF1KB5 EGVGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSG-LGLGGGSSYSY--------GSGLGVGGGFSS
       :::. :::::: ::.:::::..:..:.: :::::::.::.        :.::: :.:::.
NP_004 EGVSPVNISVVTSTLSSGYGSGSSIGGGNLGLGGGSGYSFTTSGGHSLGAGLG-GSGFSA
          470       480       490       500       510        520   

     530       540       550       560    
pF1KB5 SSGRAIGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
       .:.:    ::   ::..:..:...:.:::.::: :
NP_004 TSNR----GL---GGSGSSVKFVSTTSSSQKSYTH
                  530       540       550 

>>NP_476429 (OMIM: 122100,148043) keratin, type II cytos  (628 aa)
 initn: 2038 init1: 1559 opt: 2169  Z-score: 1164.6  bits: 225.5 E(85289): 4e-58
Smith-Waterman score: 2249; 63.9% identity (80.5% similar) in 606 aa overlap (9-560:7-610)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
               .. ... .:::. :: . : ::  .: :. : . :.:. :   :..::::::
NP_476   MSRQASKTSGGGSQGFSGRSAVVSGSSR--MSCVAHSGGAGGGAYGFRSGAGGFGSRS
                 10        20          30        40        50      

               70                      80        90                
pF1KB5 LYGLGGSKRISI------------GGG--SCAISGGYGSRAGGSYG--FGGA-------G
       ::.:::.: :::            :::  :::..::::.  :..::  :::.       :
NP_476 LYNLGGNKSISISVAAGGSRAGGFGGGRSSCAFAGGYGGGFGSGYGGGFGGGFGGGRGMG
         60        70        80        90       100       110      

       100               110       120       130               140 
pF1KB5 SGFG----FGGGAGIG----FGLGGGAGLAGGFGGPGFPVCP--------PGGIQEVTVN
       .:::    :::..:.:    ::  :: : .:::::::    :        ::::::::.:
NP_476 GGFGGAGGFGGAGGFGGAGGFGGPGGFGGSGGFGGPGSLGSPGGFGPGGFPGGIQEVTIN
        120       130       140       150       160       170      

             150       160       170       180       190       200 
pF1KB5 QSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQ
       :::: :::..::: : .:.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:
NP_476 QSLLQPLNVEIDPQIGQVKAQEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWNLLQQQ
        180       190       200       210       220       230      

               210       220       230       240       250         
pF1KB5 GTKTVR--QNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELRGMQDLVEDFKNKYEDEINK
       ::...   .:::::::..:: ::  ::.:.::::::::::..:.:::::::.::::::::
NP_476 GTSSISGTNNLEPLFENHINYLRSYLDNILGERGRLDSELKNMEDLVEDFKKKYEDEINK
        240       250       260       270       280       290      

     260       270       280       290       300       310         
pF1KB5 RTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVV
       ::::::::::::::::.:::::::::::.:.: :::.:::.::::::::::.::::::::
NP_476 RTAAENEFVTLKKDVDSAYMNKVELQAKVDALIDEIDFLRTLYDAELSQMQSHISDTSVV
        300       310       320       330       340       350      

     320       330       340       350       360       370         
pF1KB5 LSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQ
       :::::::.::::::::::.::::.:::::.::::. ::::  :::.:::::::::::::.
NP_476 LSMDNNRSLDLDSIIAEVRAQYEDIAQRSKAEAEALYQTKLGELQTTAGRHGDDLRNTKS
        360       370       380       390       400       410      

     380       390       400       410       420       430         
pF1KB5 EIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQ
       :: :.::::::::.::. :::: ::::.:::.:::.::::::::. ::. :. :::.::.
NP_476 EIIELNRMIQRLRAEIEGVKKQNANLQTAIAEAEQHGEMALKDANAKLQELQAALQQAKD
        420       430       440       450       460       470      

     440       450       460       470       480       490         
pF1KB5 DLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNISVVQSTVSS----
       ::::::..:::::::::::::::::::::::::: :..::  . :.::::.:...:    
NP_476 DLARLLRDYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEEYRMSGECPSAVSISVVSSSTTSASAG
        480       490       500       510       520       530      

         500       510               520        530       540      
pF1KB5 GYGGASGVGSGLGLGGG--------SSYSYGSGLGVGGGFSS-SSGRAIGGGLSSVGGGS
       ::::. : : : :::::        :... :.: :.::::.. ::: . :.:..:..:. 
NP_476 GYGGGYGGGMGGGLGGGFSAGGGSGSGFGRGGGGGIGGGFGGGSSGFSGGSGFGSISGAR
        540       550       560       570       580       590      

        550       560                  
pF1KB5 STIKYTTTSSSSRKSYKH              
         ..    ::.: .                  
NP_476 YGVSGGGFSSASNRGGSIKFSQSSQSSQRYSR
        600       610       620        

>>NP_006112 (OMIM: 113800,139350,144200,146590,600962,60  (644 aa)
 initn: 2175 init1: 1974 opt: 2089  Z-score: 1122.4  bits: 217.7 E(85289): 8.8e-56
Smith-Waterman score: 2197; 62.6% identity (82.0% similar) in 589 aa overlap (3-563:2-588)

               10        20        30        40        50          
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAG-----
         : . . ::   :  :::..:: . . .:   :: :. :: :.::  ..:::.:     
NP_006  MSRQFSSRSGYRSGGGFSSGSAGIINYQRRTTSS-STRRSGGGGGRFSSCGGGGGSFGA
                10        20        30         40        50        

             60        70             80        90        100      
pF1KB5 ---FGSRSLYGLGGSKRISI----GGG-SCAISGGYGSRAGGSYGFGGAG-SGFGFGGGA
          :::::: .::::: :::    ::: . ...::::. . :. ::::.: .: :.:::.
NP_006 GGGFGSRSLVNLGGSKSISISVARGGGRGSGFGGGYGGGGFGGGGFGGGGFGGGGIGGGG
       60        70        80        90       100       110        

        110       120            130       140       150       160 
pF1KB5 GIGFGLGGGAGLAGGFGGPGF-----PVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRA
         ::: :::.  .::::: :.     ::::::::::::.::::: :::..::: ::.:..
NP_006 FGGFGSGGGGFGGGGFGGGGYGGGYGPVCPPGGIQEVTINQSLLQPLNVEIDPEIQKVKS
      120       130       140       150       160       170        

             170       180       190       200       210       220 
pF1KB5 EEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNL
       .::::::.:::.:::::::::::::::.::.::: :::.  :.:  .:::: ::..::::
NP_006 REREQIKSLNNQFASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQVDTSTRTHNLEPYFESFINNL
      180       190       200       210       220       230        

             230       240       250       260       270       280 
pF1KB5 RRQLDSIVGERGRLDSELRGMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNK
       ::..:.. ....::::::..:::.:::..::::::::::: :::::::.:::::.:::.:
NP_006 RRRVDQLKSDQSRLDSELKNMQDMVEDYRNKYEDEINKRTNAENEFVTIKKDVDGAYMTK
      240       250       260       270       280       290        

             290       300       310       320       330       340 
pF1KB5 VELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQY
       :.:::: :.: .::.:: :::.::::::::.::.:.:.:::::::.::::::::::::::
NP_006 VDLQAKLDNLQQEIDFLTALYQAELSQMQTQISETNVILSMDNNRSLDLDSIIAEVKAQY
      300       310       320       330       340       350        

             350       360       370       380       390       400 
pF1KB5 EEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQ
       :.:::.:.::::: ::.::::::.:::::::..::.: ::.:.::.:::::::::.::::
NP_006 EDIAQKSKAEAESLYQSKYEELQITAGRHGDSVRNSKIEISELNRVIQRLRSEIDNVKKQ
      360       370       380       390       400       410        

             410       420       430       440       450       460 
pF1KB5 CANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVE
        .::: .:.::::::: :::::::::. ::::::.::.::::::..::::::.:::::.:
NP_006 ISNLQQSISDAEQRGENALKDAKNKLNDLEDALQQAKEDLARLLRDYQELMNTKLALDLE
      420       430       440       450       460       470        

             470       480       490       500       510           
pF1KB5 IATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLG-GGSSY-----
       ::::: :::::: :..:: . .:..::  : .. . ::. : :.: : : :::::     
NP_006 IATYRTLLEGEESRMSGECAPNVSVSVSTSHTTISGGGSRG-GGGGGYGSGGSSYGSGGG
      480       490       500       510        520       530       

         520         530       540        550       560            
pF1KB5 SYGSGLGVGGGFSS--SSGRAIGGGLSSVG-GGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH        
       ::::: : ::: .:  :.: . :.: .: : ::..  . .  :.::  .:.         
NP_006 SYGSGGGGGGGRGSYGSGGSSYGSGGGSYGSGGGGGGHGSYGSGSSSGGYRGGSGGGGGG
       540       550       560       570       580       590       

NP_006 SSGGRGSGGGSSGGSIGGRGSSSGGVKSSGGSSSVKFVSTTYSGVTR
       600       610       620       630       640    

>>NP_056932 (OMIM: 616671) keratin, type II cytoskeletal  (638 aa)
 initn: 2108 init1: 1855 opt: 2061  Z-score: 1107.8  bits: 215.0 E(85289): 5.8e-55
Smith-Waterman score: 2219; 66.4% identity (80.8% similar) in 590 aa overlap (9-559:8-584)

               10        20        30        40        50          
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACG---GAG-F
               .: :.  .:::. :: . : :: .     :.:: :.::  ::::   ::: :
NP_056  MNRQVCKKSFSGRSQGFSGRSAVVSGSSRMS----CVARSGGAGG--GACGFRSGAGSF
                10        20        30            40          50   

         60        70                      80        90            
pF1KB5 GSRSLYGLGGSKRISI------------GGG--SCAISGGYGSRAGGSYG--FGGA-GSG
       ::::::.::..: :::            :::  ::...::::.  :::::  :::. : :
NP_056 GSRSLYNLGSNKSISISVAAGSSRAGGFGGGRSSCGFAGGYGGGFGGSYGGGFGGGRGVG
            60        70        80        90       100       110   

     100       110         120            130       140       150  
pF1KB5 FGFGGGAGIGFGLGG--GAGLAGG---FGGPG-F-PVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQI
        ::::..:.: : ::  : :. ::   ::::: : :   ::::::: :::::: :::..:
NP_056 SGFGGAGGFG-GAGGFGGPGVFGGPGSFGGPGGFGPGGFPGGIQEVIVNQSLLQPLNVEI
           120        130       140       150       160       170  

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB5 DPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEP
       :: : .:.:.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.: : .  ..:::
NP_056 DPQIGQVKAQEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWELLQQQTTGSGPSSLEP
            180       190       200       210       220       230  

            220       230       240       250       260       270  
pF1KB5 LFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELRGMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKK
        ::.::. : .::::..:::: :..::..:::::::::.::::::::::::::::: :::
NP_056 CFESYISFLCKQLDSLLGERGNLEGELKSMQDLVEDFKKKYEDEINKRTAAENEFVGLKK
            240       250       260       270       280       290  

            280       290       300       310       320       330  
pF1KB5 DVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDS
       :::::.:::::::::.:.::::..:::.::. ::::::.: ::::::::::::: ::: :
NP_056 DVDAAFMNKVELQAKVDSLTDEVSFLRTLYEMELSQMQSHASDTSVVLSMDNNRCLDLGS
            300       310       320       330       340       350  

            340       350       360       370       380       390  
pF1KB5 IIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLR
       :::::.::::::::::..:::. ::::  :::.:::::::::::::.:: :.::::::::
NP_056 IIAEVRAQYEEIAQRSKSEAEALYQTKLGELQTTAGRHGDDLRNTKSEIMELNRMIQRLR
            360       370       380       390       400       410  

            400       410       420       430       440       450  
pF1KB5 SEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELM
       .::..:::: ::::.:::.::::::::::::. ::. :. ::::::.::::::..:::::
NP_056 AEIENVKKQNANLQTAIAEAEQRGEMALKDANAKLQDLQTALQKAKDDLARLLRDYQELM
            420       430       440       450       460       470  

            460       470       480       490                500   
pF1KB5 NVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNISVVQSTVS-SG--------YGGASGV
       :::::::::::::::::::::::..::  . : ::::....: ::        .::.:: 
NP_056 NVKLALDVEIATYRKLLEGEECRMSGECQSAVCISVVSNVTSTSGSSGSSRGVFGGVSGS
            480       490       500       510       520       530  

           510       520       530       540         550       560 
pF1KB5 GSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRAIGGGLSS--VGGGSSTIKYTTTSSSSRKS
       ::: :  :::: : .:: ::.::  :.::    ::.::  .:: .:. .: ..::.::  
NP_056 GSG-GYKGGSSSSSSSGYGVSGG--SGSGY---GGVSSGSTGGRGSSGSYQSSSSGSRLG
             540       550            560       570       580      

                                                           
pF1KB5 YKH                                                 
                                                           
NP_056 GAGSISVSHSGMGSSSGSIQTSGGSGYKSGGGGSTSIRFSQTTSSSQHSSTK
        590       600       610       620       630        

>>NP_002263 (OMIM: 123940,193900) keratin, type II cytos  (520 aa)
 initn: 2085 init1: 1875 opt: 2041  Z-score: 1098.4  bits: 213.0 E(85289): 1.9e-54
Smith-Waterman score: 2132; 67.2% identity (85.6% similar) in 521 aa overlap (16-535:13-510)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
                      :::: .:: . : .:..:::::.:     :: .: :...::::::
NP_002    MIARQQCVRGGPRGFSCGSAIVGGGKRGAFSSVSMS-----GG-AGRCSSGGFGSRS
                  10        20        30              40        50 

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
       ::.: :.: ::.   : :     ::: :.   :::::   ::: :   ::: :: .:  .
NP_002 LYNLRGNKSISM---SVA-----GSRQGAC--FGGAG---GFGTG---GFG-GGFGGSFS
              60                70             80            90    

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
       : ::::::::: :::::::.::::::::...::: ::.::.::::::: :::::::::::
NP_002 GKGGPGFPVCPAGGIQEVTINQSLLTPLHVEIDPEIQKVRTEEREQIKLLNNKFASFIDK
          100       110       120       130       140       150    

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 VRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELR
       :.:::::::::::::.:::.: : :  .::::::: :.. ::.:::.. ...:::.:::.
NP_002 VQFLEQQNKVLETKWNLLQQQTTTTSSKNLEPLFETYLSVLRKQLDTLGNDKGRLQSELK
          160       170       180       190       200       210    

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 GMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
        ::: :::::.:::.::::::::::.::.:::::::::.:::::.::.:.:.::::::..
NP_002 TMQDSVEDFKTKYEEEINKRTAAENDFVVLKKDVDAAYLNKVELEAKVDSLNDEINFLKV
          220       230       240       250       260       270    

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
       ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::::. :::: 
NP_002 LYDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVRAQYEEIAQRSKAEAEALYQTKV
          280       290       300       310       320       330    

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 EELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
       ..::... .:::.:.:::.::::.::::::::.::...:::: .::...:::::::: ::
NP_002 QQLQISVDQHGDNLKNTKSEIAELNRMIQRLRAEIENIKKQCQTLQVSVADAEQRGENAL
          340       350       360       370       380       390    

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
       :::..:   :: :::.::..:::.:.::::::.::::::.::::::::::::: :..:: 
NP_002 KDAHSKRVELEAALQQAKEELARMLREYQELMSVKLALDIEIATYRKLLEGEEYRMSGEC
          400       410       420       430       440       450    

              490        500       510       520       530         
pF1KB5 VGQVNISVVQ-STVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRAIGGGL
        . :.::::. :: ..: .:. : :::.::..: . . :::.: ::. :.::.  :    
NP_002 QSAVSISVVSGSTSTGGISGGLGSGSGFGLSSGFGSGSGSGFGFGGSVSGSSSSKIISTT
          460       470       480       490       500       510    

     540       550       560    
pF1KB5 SSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
                                
NP_002 TLNKRR                   
          520                   

>>NP_778253 (OMIM: 611158) keratin, type II cytoskeletal  (578 aa)
 initn: 1968 init1: 1729 opt: 1994  Z-score: 1073.1  bits: 208.5 E(85289): 4.9e-53
Smith-Waterman score: 1994; 59.1% identity (82.3% similar) in 560 aa overlap (12-563:13-561)

                10        20        30        40        50         
pF1KB5  MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSR
                   : ::: .:..:.   : .  . .::  .:.: .:: : .  : :::::
NP_778 MSHQFSSQSAFSSMSRRVYSTSSSAGSGGGSPAVGSVCYARGRCGGG-GYGIHGRGFGSR
               10        20        30        40         50         

      60        70        80        90       100        110        
pF1KB5 SLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGG-GAGIGFGLGGGAGL
       :::.::::. :::.  . . ::    ..::  :::: : ::: :. ::: ::: ::: : 
NP_778 SLYNLGGSRSISINLMGRSTSGF--CQGGGVGGFGG-GRGFGVGSTGAG-GFG-GGGFGG
      60        70        80          90        100         110    

      120            130       140       150       160       170   
pF1KB5 AG----GFGGPGF-PVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNK
       ::    .::  :: : ::::::::::.::::: ::.:..:: :::....::::: .::::
NP_778 AGFGTSNFGLGGFGPYCPPGGIQEVTINQSLLEPLHLEVDPEIQRIKTQEREQIMVLNNK
          120       130       140       150       160       170    

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB5 FASFIDKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERG
       :::::::::::::::.::.::: :::. .:.:  .:::::.:.::..::::.: . .:. 
NP_778 FASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQVNTSTGTNNLEPLLENYIGDLRRQVDLLSAEQM
          180       190       200       210       220       230    

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB5 RLDSELRGMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTD
       : ..:.:.:::.:::.:.::::::::::..::.::.:::::::::..::.:....:::: 
NP_778 RQNAEVRSMQDVVEDYKSKYEDEINKRTGSENDFVVLKKDVDAAYVSKVDLESRVDTLTG
          240       250       260       270       280       290    

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB5 EINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAE
       :.:::. :. .::::.:::::::.:.:::::::.:::::::  :..::: :::::. :::
NP_778 EVNFLKYLFLTELSQVQTHISDTNVILSMDNNRSLDLDSIIDAVRTQYELIAQRSKDEAE
          300       310       320       330       340       350    

           360       370       380       390       400       410   
pF1KB5 SWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAE
       . :::::.:::.:::::::::.:.:.::::.:: .:::..::..::::  ..:. :.:::
NP_778 ALYQTKYQELQITAGRHGDDLKNSKMEIAELNRTVQRLQAEISNVKKQIEQMQSLISDAE
          360       370       380       390       400       410    

           420       430       440       450       460       470   
pF1KB5 QRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEE
       .:::.::.:: .::. ::.:::..:..:::::..:: ...:::.:::::::::.::::::
NP_778 ERGEQALQDAWQKLQDLEEALQQSKEELARLLRDYQAMLGVKLSLDVEIATYRQLLEGEE
          420       430       440       450       460       470    

           480       490         500       510       520       530 
pF1KB5 CRLNGEGVGQVNISVVQSTVS--SGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSS
        :..::  ..:.::: .: ::  .: ::... ::: : ::::. .::.: .  ::  .. 
NP_778 SRMSGELQSHVSISVQNSQVSVNGGAGGGGSYGSG-GYGGGSGGGYGGGRSYRGG--GAR
          480       490       500        510       520         530 

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pF1KB5 GRAIGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH                
       ::. ::  :. :::...  :  .. :.: : .                 
NP_778 GRSGGGYGSGCGGGGGS--YGGSGRSGRGSSRVQIIQTSTNTSHRRILE
             540         550       560       570        




564 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 10:06:19 2016 done: Sat Nov  5 10:06:21 2016
 Total Scan time: 11.960 Total Display time:  0.140

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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