Result of FASTA (ccds) for pF1KB5978
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5978, 564 aa
  1>>>pF1KB5978 564 - 564 aa - 564 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5975+/-0.00133; mu= 0.0625+/- 0.079
 mean_var=299.1784+/-59.244, 0's: 0 Z-trim(110.1): 117  B-trim: 96 in 1/51
 Lambda= 0.074150
 statistics sampled from 11276 (11390) to 11276 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.678), E-opt: 0.2 (0.35), width:  16
 Scan time:  3.720

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12         ( 564) 3628 402.2 8.6e-112
CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12        ( 564) 3594 398.6 1.1e-110
CCDS8828.1 KRT6B gene_id:3854|Hs108|chr12          ( 564) 3592 398.4 1.2e-110
CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12           ( 590) 2776 311.1 2.4e-84
CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12          ( 551) 2379 268.6 1.4e-71
CCDS44895.1 KRT3 gene_id:3850|Hs108|chr12          ( 628) 2169 246.2 8.9e-65
CCDS8836.1 KRT1 gene_id:3848|Hs108|chr12           ( 644) 2089 237.6 3.4e-62
CCDS8838.1 KRT76 gene_id:51350|Hs108|chr12         ( 638) 2061 234.6 2.7e-61
CCDS41787.2 KRT4 gene_id:3851|Hs108|chr12          ( 520) 2041 232.4   1e-60
CCDS8837.1 KRT77 gene_id:374454|Hs108|chr12        ( 578) 1994 227.4 3.6e-59
CCDS8839.1 KRT79 gene_id:338785|Hs108|chr12        ( 535) 1982 226.1 8.4e-59
CCDS8835.1 KRT2 gene_id:3849|Hs108|chr12           ( 639) 1974 225.3 1.7e-58
CCDS8834.1 KRT73 gene_id:319101|Hs108|chr12        ( 540) 1871 214.2 3.2e-55
CCDS8831.1 KRT71 gene_id:112802|Hs108|chr12        ( 523) 1848 211.8 1.7e-54
CCDS8833.1 KRT72 gene_id:140807|Hs108|chr12        ( 511) 1836 210.5 4.1e-54
CCDS8832.1 KRT74 gene_id:121391|Hs108|chr12        ( 529) 1804 207.1 4.5e-53
CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12          ( 600) 1768 203.3 7.1e-52
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12           ( 469) 1714 197.4 3.3e-50
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12           ( 483) 1714 197.4 3.3e-50
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12          ( 511) 1714 197.4 3.5e-50
CCDS8840.1 KRT78 gene_id:196374|Hs108|chr12        ( 520) 1622 187.6 3.2e-47
CCDS8826.1 KRT82 gene_id:3888|Hs108|chr12          ( 513) 1522 176.9 5.3e-44
CCDS8824.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12          ( 507) 1449 169.1 1.2e-41
CCDS31805.1 KRT81 gene_id:3887|Hs108|chr12         ( 505) 1432 167.3 4.1e-41
CCDS41785.1 KRT86 gene_id:3892|Hs108|chr12         ( 486) 1392 163.0 7.8e-40
CCDS8823.1 KRT83 gene_id:3889|Hs108|chr12          ( 493) 1389 162.6 9.9e-40
CCDS73473.1 KRT78 gene_id:196374|Hs108|chr12       ( 410) 1268 149.6 6.8e-36
CCDS53795.1 KRT72 gene_id:140807|Hs108|chr12       ( 469) 1207 143.2 6.9e-34
CCDS41784.1 KRT80 gene_id:144501|Hs108|chr12       ( 422) 1061 127.5 3.2e-29
CCDS8821.2 KRT80 gene_id:144501|Hs108|chr12        ( 452) 1061 127.5 3.4e-29
CCDS73472.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12         ( 295)  886 108.6 1.1e-23
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10            ( 466)  777 97.2 4.8e-20
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17         ( 584)  765 96.0 1.4e-19
CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8           ( 543)  763 95.7 1.5e-19
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2            ( 470)  749 94.2 3.9e-19
CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17          ( 623)  743 93.6 7.4e-19
CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12           ( 470)  734 92.6 1.2e-18
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17          ( 431)  688 87.6 3.4e-17
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17          ( 432)  688 87.6 3.4e-17
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17          ( 438)  688 87.6 3.4e-17
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17         ( 458)  665 85.2 1.9e-16
CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10            ( 499)  660 84.7   3e-16
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8            ( 916)  661 85.0 4.3e-16
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17         ( 420)  652 83.7 4.8e-16
CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17       ( 525)  645 83.1 9.4e-16
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17         ( 473)  629 81.3 2.9e-15
CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17         ( 472)  614 79.7 8.7e-15
CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17         ( 494)  608 79.1 1.4e-14
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17         ( 456)  574 75.4 1.6e-13
CCDS13858.1 NEFH gene_id:4744|Hs108|chr22          (1020)  580 76.4 1.9e-13


>>CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12              (564 aa)
 initn: 3628 init1: 3628 opt: 3628  Z-score: 2120.5  bits: 402.2 E(32554): 8.6e-112
Smith-Waterman score: 3628; 100.0% identity (100.0% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 VRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 GMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 EELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRAIGGGLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRAIGGGLS
              490       500       510       520       530       540

              550       560    
pF1KB5 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
       ::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
              550       560    

>>CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12             (564 aa)
 initn: 3594 init1: 3594 opt: 3594  Z-score: 2100.8  bits: 398.6 E(32554): 1.1e-110
Smith-Waterman score: 3594; 98.4% identity (100.0% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS88 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 VRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELR
       :::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 VRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 GMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
       .:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 NMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 EELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS88 EELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCASLQAAIADAEQRGEMAL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRAIGGGLS
       :::::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS88 VGQVNVSVVQSTISSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGIGGGFSSSSGRAIGGGLS
              490       500       510       520       530       540

              550       560    
pF1KB5 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
       ::::::::::::::::::::::::
CCDS88 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
              550       560    

>>CCDS8828.1 KRT6B gene_id:3854|Hs108|chr12               (564 aa)
 initn: 3592 init1: 3592 opt: 3592  Z-score: 2099.7  bits: 398.4 E(32554): 1.2e-110
Smith-Waterman score: 3592; 98.6% identity (99.8% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS88 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 VRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELR
       :::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS88 VRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDNIVGERGRLDSELR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 GMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
       .:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 NMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 EELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
       ::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 EELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRAIGGGLS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS88 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRATGGGLS
              490       500       510       520       530       540

              550       560    
pF1KB5 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
       ::::::::::::::::::::::::
CCDS88 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
              550       560    

>>CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12                (590 aa)
 initn: 2642 init1: 2491 opt: 2776  Z-score: 1627.7  bits: 311.1 E(32554): 2.4e-84
Smith-Waterman score: 2867; 77.2% identity (90.3% similar) in 588 aa overlap (3-563:2-589)

               10        20        30        40             50     
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLG-----GACGGAG
         : ....  .:.. :.::. ::  :.:::..:.::: : . :.::.:     :::: .:
CCDS88  MSRQSSVSFRSGGSRSFSTASAITPSVSRTSFTSVSRSGGGGGGGFGRVSLAGACGVGG
                10        20        30        40        50         

          60        70        80        90        100       110    
pF1KB5 FGSRSLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGG-AGSGFGFGGGAGIGFGLGG
       .::::::.:::::::::. .. .. . .:. :::.::::: :::::::::::: ::::::
CCDS88 YGSRSLYNLGGSKRISISTSGGSFRNRFGAGAGGGYGFGGGAGSGFGFGGGAGGGFGLGG
      60        70        80        90       100       110         

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB5 GAGLAGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKF
       :::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::
CCDS88 GAGFGGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPSIQRVRTEEREQIKTLNNKF
     120       130       140       150       160       170         

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB5 ASFIDKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGR
       :::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 ASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGR
     180       190       200       210       220       230         

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB5 LDSELRGMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDE
       ::::::.::::::::::::::::::::.:::::: :::::::::::::::.::.:.: ::
CCDS88 LDSELRNMQDLVEDFKNKYEDEINKRTTAENEFVMLKKDVDAAYMNKVELEAKVDALMDE
     240       250       260       270       280       290         

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB5 INFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAES
       :::.. ..::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::
CCDS88 INFMKMFFDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIANRSRTEAES
     300       310       320       330       340       350         

          360       370       380       390       400       410    
pF1KB5 WYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQ
       :::::::::: :::::::::::::.::.:.::::::::.:::.::::::::: :::::::
CCDS88 WYQTKYEELQQTAGRHGDDLRNTKHEISEMNRMIQRLRAEIDNVKKQCANLQNAIADAEQ
     360       370       380       390       400       410         

          420       430       440       450       460       470    
pF1KB5 RGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEEC
       :::.:::::.:::  ::.::::::::.::::.:::::::.::::::::::::::::::::
CCDS88 RGELALKDARNKLAELEEALQKAKQDMARLLREYQELMNTKLALDVEIATYRKLLEGEEC
     420       430       440       450       460       470         

          480       490       500                 510              
pF1KB5 RLNGEGVGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLG----------LGGGSSYSY-------
       ::.::::: :::::: :.::::::..:: :.:::          :.:::: ::       
CCDS88 RLSGEGVGPVNISVVTSSVSSGYGSGSGYGGGLGGGLGGGLGGGLAGGSSGSYYSSSSGG
     480       490       500       510       520       530         

          520        530       540       550       560    
pF1KB5 ---GSGLGVGG-GFSSSSGRAIGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
          :.::.::: :::.::::..: :..: ::.::..:...:.::::::.: 
CCDS88 VGLGGGLSVGGSGFSASSGRGLGVGFGSGGGSSSSVKFVSTTSSSRKSFKS
     540       550       560       570       580       590

>>CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12               (551 aa)
 initn: 2534 init1: 2121 opt: 2379  Z-score: 1398.5  bits: 268.6 E(32554): 1.4e-71
Smith-Waterman score: 2577; 72.3% identity (89.5% similar) in 573 aa overlap (3-564:2-551)

               10        20        30        40          50        
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSR-GSGGLGG-ACGGAGFGS
         : ...:  .:.::::::..::  :...:: ::::::.::  ::::::  . .::.:::
CCDS88  MSRQSSITFQSGSRRGFSTTSAITPAAGRSRFSSVSVARSAAGSGGLGRISSAGASFGS
                10        20        30        40        50         

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB5 RSLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGL
       ::::.:::.::.::.: . .  .:.:.::.. .:   ..::::.:::.:           
CCDS88 RSLYNLGGAKRVSINGCGSSCRSGFGGRASNRFG---VNSGFGYGGGVG-----------
      60        70        80        90          100                

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB5 AGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFI
        :::.::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 -GGFSGPSFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLHLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFI
          110       120       130       140       150       160    

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB5 DKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSE
       :::::::::::::::::.::::::..::::::::::..: ..:::::.::. :::::..:
CCDS88 DKVRFLEQQNKVLETKWALLQEQGSRTVRQNLEPLFDSYTSELRRQLESITTERGRLEAE
          170       180       190       200       210       220    

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB5 LRGMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFL
       ::.:::.::::: .::::::::::::::::.:::::::::::::::.::. .: .::::.
CCDS88 LRNMQDVVEDFKVRYEDEINKRTAAENEFVALKKDVDAAYMNKVELEAKVKSLPEEINFI
          230       240       250       260       270       280    

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB5 RALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQT
       ....::::::.::...::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::
CCDS88 HSVFDAELSQLQTQVGDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAESWYQT
          290       300       310       320       330       340    

      360       370       380       390       400       410        
pF1KB5 KYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEM
       :::::::::::::::::::::::.:.::::::::.::: :::::..::.::::::::::.
CCDS88 KYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEISEMNRMIQRLRAEIDSVKKQCSSLQTAIADAEQRGEL
          350       360       370       380       390       400    

      420       430       440       450       460       470        
pF1KB5 ALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNG
       :::::. ::  ::.::::::::.::::.:::::::.::::::::::::::::::::::.:
CCDS88 ALKDARAKLVDLEEALQKAKQDMARLLREYQELMNIKLALDVEIATYRKLLEGEECRLSG
          410       420       430       440       450       460    

      480       490       500        510               520         
pF1KB5 EGVGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSG-LGLGGGSSYSY--------GSGLGVGGGFSS
       :::. :::::: ::.:::::..:..:.: :::::::.::.        :.::: :.:::.
CCDS88 EGVSPVNISVVTSTLSSGYGSGSSIGGGNLGLGGGSGYSFTTSGGHSLGAGLG-GSGFSA
          470       480       490       500       510        520   

     530       540       550       560    
pF1KB5 SSGRAIGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
       .:.:    ::   ::..:..:...:.:::.::: :
CCDS88 TSNR----GL---GGSGSSVKFVSTTSSSQKSYTH
                  530       540       550 

>>CCDS44895.1 KRT3 gene_id:3850|Hs108|chr12               (628 aa)
 initn: 2038 init1: 1559 opt: 2169  Z-score: 1276.4  bits: 246.2 E(32554): 8.9e-65
Smith-Waterman score: 2249; 63.9% identity (80.5% similar) in 606 aa overlap (9-560:7-610)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
               .. ... .:::. :: . : ::  .: :. : . :.:. :   :..::::::
CCDS44   MSRQASKTSGGGSQGFSGRSAVVSGSSR--MSCVAHSGGAGGGAYGFRSGAGGFGSRS
                 10        20          30        40        50      

               70                      80        90                
pF1KB5 LYGLGGSKRISI------------GGG--SCAISGGYGSRAGGSYG--FGGA-------G
       ::.:::.: :::            :::  :::..::::.  :..::  :::.       :
CCDS44 LYNLGGNKSISISVAAGGSRAGGFGGGRSSCAFAGGYGGGFGSGYGGGFGGGFGGGRGMG
         60        70        80        90       100       110      

       100               110       120       130               140 
pF1KB5 SGFG----FGGGAGIG----FGLGGGAGLAGGFGGPGFPVCP--------PGGIQEVTVN
       .:::    :::..:.:    ::  :: : .:::::::    :        ::::::::.:
CCDS44 GGFGGAGGFGGAGGFGGAGGFGGPGGFGGSGGFGGPGSLGSPGGFGPGGFPGGIQEVTIN
        120       130       140       150       160       170      

             150       160       170       180       190       200 
pF1KB5 QSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQ
       :::: :::..::: : .:.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:
CCDS44 QSLLQPLNVEIDPQIGQVKAQEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWNLLQQQ
        180       190       200       210       220       230      

               210       220       230       240       250         
pF1KB5 GTKTVR--QNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELRGMQDLVEDFKNKYEDEINK
       ::...   .:::::::..:: ::  ::.:.::::::::::..:.:::::::.::::::::
CCDS44 GTSSISGTNNLEPLFENHINYLRSYLDNILGERGRLDSELKNMEDLVEDFKKKYEDEINK
        240       250       260       270       280       290      

     260       270       280       290       300       310         
pF1KB5 RTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVV
       ::::::::::::::::.:::::::::::.:.: :::.:::.::::::::::.::::::::
CCDS44 RTAAENEFVTLKKDVDSAYMNKVELQAKVDALIDEIDFLRTLYDAELSQMQSHISDTSVV
        300       310       320       330       340       350      

     320       330       340       350       360       370         
pF1KB5 LSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQ
       :::::::.::::::::::.::::.:::::.::::. ::::  :::.:::::::::::::.
CCDS44 LSMDNNRSLDLDSIIAEVRAQYEDIAQRSKAEAEALYQTKLGELQTTAGRHGDDLRNTKS
        360       370       380       390       400       410      

     380       390       400       410       420       430         
pF1KB5 EIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQ
       :: :.::::::::.::. :::: ::::.:::.:::.::::::::. ::. :. :::.::.
CCDS44 EIIELNRMIQRLRAEIEGVKKQNANLQTAIAEAEQHGEMALKDANAKLQELQAALQQAKD
        420       430       440       450       460       470      

     440       450       460       470       480       490         
pF1KB5 DLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNISVVQSTVSS----
       ::::::..:::::::::::::::::::::::::: :..::  . :.::::.:...:    
CCDS44 DLARLLRDYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEEYRMSGECPSAVSISVVSSSTTSASAG
        480       490       500       510       520       530      

         500       510               520        530       540      
pF1KB5 GYGGASGVGSGLGLGGG--------SSYSYGSGLGVGGGFSS-SSGRAIGGGLSSVGGGS
       ::::. : : : :::::        :... :.: :.::::.. ::: . :.:..:..:. 
CCDS44 GYGGGYGGGMGGGLGGGFSAGGGSGSGFGRGGGGGIGGGFGGGSSGFSGGSGFGSISGAR
        540       550       560       570       580       590      

        550       560                  
pF1KB5 STIKYTTTSSSSRKSYKH              
         ..    ::.: .                  
CCDS44 YGVSGGGFSSASNRGGSIKFSQSSQSSQRYSR
        600       610       620        

>>CCDS8836.1 KRT1 gene_id:3848|Hs108|chr12                (644 aa)
 initn: 2175 init1: 1974 opt: 2089  Z-score: 1230.0  bits: 237.6 E(32554): 3.4e-62
Smith-Waterman score: 2197; 62.6% identity (82.0% similar) in 589 aa overlap (3-563:2-588)

               10        20        30        40        50          
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAG-----
         : . . ::   :  :::..:: . . .:   :: :. :: :.::  ..:::.:     
CCDS88  MSRQFSSRSGYRSGGGFSSGSAGIINYQRRTTSS-STRRSGGGGGRFSSCGGGGGSFGA
                10        20        30         40        50        

             60        70             80        90        100      
pF1KB5 ---FGSRSLYGLGGSKRISI----GGG-SCAISGGYGSRAGGSYGFGGAG-SGFGFGGGA
          :::::: .::::: :::    ::: . ...::::. . :. ::::.: .: :.:::.
CCDS88 GGGFGSRSLVNLGGSKSISISVARGGGRGSGFGGGYGGGGFGGGGFGGGGFGGGGIGGGG
       60        70        80        90       100       110        

        110       120            130       140       150       160 
pF1KB5 GIGFGLGGGAGLAGGFGGPGF-----PVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRA
         ::: :::.  .::::: :.     ::::::::::::.::::: :::..::: ::.:..
CCDS88 FGGFGSGGGGFGGGGFGGGGYGGGYGPVCPPGGIQEVTINQSLLQPLNVEIDPEIQKVKS
      120       130       140       150       160       170        

             170       180       190       200       210       220 
pF1KB5 EEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNL
       .::::::.:::.:::::::::::::::.::.::: :::.  :.:  .:::: ::..::::
CCDS88 REREQIKSLNNQFASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQVDTSTRTHNLEPYFESFINNL
      180       190       200       210       220       230        

             230       240       250       260       270       280 
pF1KB5 RRQLDSIVGERGRLDSELRGMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNK
       ::..:.. ....::::::..:::.:::..::::::::::: :::::::.:::::.:::.:
CCDS88 RRRVDQLKSDQSRLDSELKNMQDMVEDYRNKYEDEINKRTNAENEFVTIKKDVDGAYMTK
      240       250       260       270       280       290        

             290       300       310       320       330       340 
pF1KB5 VELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQY
       :.:::: :.: .::.:: :::.::::::::.::.:.:.:::::::.::::::::::::::
CCDS88 VDLQAKLDNLQQEIDFLTALYQAELSQMQTQISETNVILSMDNNRSLDLDSIIAEVKAQY
      300       310       320       330       340       350        

             350       360       370       380       390       400 
pF1KB5 EEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQ
       :.:::.:.::::: ::.::::::.:::::::..::.: ::.:.::.:::::::::.::::
CCDS88 EDIAQKSKAEAESLYQSKYEELQITAGRHGDSVRNSKIEISELNRVIQRLRSEIDNVKKQ
      360       370       380       390       400       410        

             410       420       430       440       450       460 
pF1KB5 CANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVE
        .::: .:.::::::: :::::::::. ::::::.::.::::::..::::::.:::::.:
CCDS88 ISNLQQSISDAEQRGENALKDAKNKLNDLEDALQQAKEDLARLLRDYQELMNTKLALDLE
      420       430       440       450       460       470        

             470       480       490       500       510           
pF1KB5 IATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLG-GGSSY-----
       ::::: :::::: :..:: . .:..::  : .. . ::. : :.: : : :::::     
CCDS88 IATYRTLLEGEESRMSGECAPNVSVSVSTSHTTISGGGSRG-GGGGGYGSGGSSYGSGGG
      480       490       500       510        520       530       

         520         530       540        550       560            
pF1KB5 SYGSGLGVGGGFSS--SSGRAIGGGLSSVG-GGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH        
       ::::: : ::: .:  :.: . :.: .: : ::..  . .  :.::  .:.         
CCDS88 SYGSGGGGGGGRGSYGSGGSSYGSGGGSYGSGGGGGGHGSYGSGSSSGGYRGGSGGGGGG
       540       550       560       570       580       590       

CCDS88 SSGGRGSGGGSSGGSIGGRGSSSGGVKSSGGSSSVKFVSTTYSGVTR
       600       610       620       630       640    

>>CCDS8838.1 KRT76 gene_id:51350|Hs108|chr12              (638 aa)
 initn: 2108 init1: 1855 opt: 2061  Z-score: 1213.9  bits: 234.6 E(32554): 2.7e-61
Smith-Waterman score: 2219; 66.4% identity (80.8% similar) in 590 aa overlap (9-559:8-584)

               10        20        30        40        50          
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACG---GAG-F
               .: :.  .:::. :: . : :: .     :.:: :.::  ::::   ::: :
CCDS88  MNRQVCKKSFSGRSQGFSGRSAVVSGSSRMS----CVARSGGAGG--GACGFRSGAGSF
                10        20        30            40          50   

         60        70                      80        90            
pF1KB5 GSRSLYGLGGSKRISI------------GGG--SCAISGGYGSRAGGSYG--FGGA-GSG
       ::::::.::..: :::            :::  ::...::::.  :::::  :::. : :
CCDS88 GSRSLYNLGSNKSISISVAAGSSRAGGFGGGRSSCGFAGGYGGGFGGSYGGGFGGGRGVG
            60        70        80        90       100       110   

     100       110         120            130       140       150  
pF1KB5 FGFGGGAGIGFGLGG--GAGLAGG---FGGPG-F-PVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQI
        ::::..:.: : ::  : :. ::   ::::: : :   ::::::: :::::: :::..:
CCDS88 SGFGGAGGFG-GAGGFGGPGVFGGPGSFGGPGGFGPGGFPGGIQEVIVNQSLLQPLNVEI
           120        130       140       150       160       170  

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB5 DPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEP
       :: : .:.:.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.: : .  ..:::
CCDS88 DPQIGQVKAQEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWELLQQQTTGSGPSSLEP
            180       190       200       210       220       230  

            220       230       240       250       260       270  
pF1KB5 LFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELRGMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKK
        ::.::. : .::::..:::: :..::..:::::::::.::::::::::::::::: :::
CCDS88 CFESYISFLCKQLDSLLGERGNLEGELKSMQDLVEDFKKKYEDEINKRTAAENEFVGLKK
            240       250       260       270       280       290  

            280       290       300       310       320       330  
pF1KB5 DVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDS
       :::::.:::::::::.:.::::..:::.::. ::::::.: ::::::::::::: ::: :
CCDS88 DVDAAFMNKVELQAKVDSLTDEVSFLRTLYEMELSQMQSHASDTSVVLSMDNNRCLDLGS
            300       310       320       330       340       350  

            340       350       360       370       380       390  
pF1KB5 IIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLR
       :::::.::::::::::..:::. ::::  :::.:::::::::::::.:: :.::::::::
CCDS88 IIAEVRAQYEEIAQRSKSEAEALYQTKLGELQTTAGRHGDDLRNTKSEIMELNRMIQRLR
            360       370       380       390       400       410  

            400       410       420       430       440       450  
pF1KB5 SEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELM
       .::..:::: ::::.:::.::::::::::::. ::. :. ::::::.::::::..:::::
CCDS88 AEIENVKKQNANLQTAIAEAEQRGEMALKDANAKLQDLQTALQKAKDDLARLLRDYQELM
            420       430       440       450       460       470  

            460       470       480       490                500   
pF1KB5 NVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNISVVQSTVS-SG--------YGGASGV
       :::::::::::::::::::::::..::  . : ::::....: ::        .::.:: 
CCDS88 NVKLALDVEIATYRKLLEGEECRMSGECQSAVCISVVSNVTSTSGSSGSSRGVFGGVSGS
            480       490       500       510       520       530  

           510       520       530       540         550       560 
pF1KB5 GSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRAIGGGLSS--VGGGSSTIKYTTTSSSSRKS
       ::: :  :::: : .:: ::.::  :.::    ::.::  .:: .:. .: ..::.::  
CCDS88 GSG-GYKGGSSSSSSSGYGVSGG--SGSGY---GGVSSGSTGGRGSSGSYQSSSSGSRLG
             540       550            560       570       580      

                                                           
pF1KB5 YKH                                                 
                                                           
CCDS88 GAGSISVSHSGMGSSSGSIQTSGGSGYKSGGGGSTSIRFSQTTSSSQHSSTK
        590       600       610       620       630        

>>CCDS41787.2 KRT4 gene_id:3851|Hs108|chr12               (520 aa)
 initn: 2085 init1: 1875 opt: 2041  Z-score: 1203.4  bits: 232.4 E(32554): 1e-60
Smith-Waterman score: 2132; 67.2% identity (85.6% similar) in 521 aa overlap (16-535:13-510)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
                      :::: .:: . : .:..:::::.:     :: .: :...::::::
CCDS41    MIARQQCVRGGPRGFSCGSAIVGGGKRGAFSSVSMS-----GG-AGRCSSGGFGSRS
                  10        20        30              40        50 

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
       ::.: :.: ::.   : :     ::: :.   :::::   ::: :   ::: :: .:  .
CCDS41 LYNLRGNKSISM---SVA-----GSRQGAC--FGGAG---GFGTG---GFG-GGFGGSFS
              60                70             80            90    

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
       : ::::::::: :::::::.::::::::...::: ::.::.::::::: :::::::::::
CCDS41 GKGGPGFPVCPAGGIQEVTINQSLLTPLHVEIDPEIQKVRTEEREQIKLLNNKFASFIDK
          100       110       120       130       140       150    

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 VRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELR
       :.:::::::::::::.:::.: : :  .::::::: :.. ::.:::.. ...:::.:::.
CCDS41 VQFLEQQNKVLETKWNLLQQQTTTTSSKNLEPLFETYLSVLRKQLDTLGNDKGRLQSELK
          160       170       180       190       200       210    

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 GMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
        ::: :::::.:::.::::::::::.::.:::::::::.:::::.::.:.:.::::::..
CCDS41 TMQDSVEDFKTKYEEEINKRTAAENDFVVLKKDVDAAYLNKVELEAKVDSLNDEINFLKV
          220       230       240       250       260       270    

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
       ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::::. :::: 
CCDS41 LYDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVRAQYEEIAQRSKAEAEALYQTKV
          280       290       300       310       320       330    

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 EELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
       ..::... .:::.:.:::.::::.::::::::.::...:::: .::...:::::::: ::
CCDS41 QQLQISVDQHGDNLKNTKSEIAELNRMIQRLRAEIENIKKQCQTLQVSVADAEQRGENAL
          340       350       360       370       380       390    

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
       :::..:   :: :::.::..:::.:.::::::.::::::.::::::::::::: :..:: 
CCDS41 KDAHSKRVELEAALQQAKEELARMLREYQELMSVKLALDIEIATYRKLLEGEEYRMSGEC
          400       410       420       430       440       450    

              490        500       510       520       530         
pF1KB5 VGQVNISVVQ-STVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRAIGGGL
        . :.::::. :: ..: .:. : :::.::..: . . :::.: ::. :.::.  :    
CCDS41 QSAVSISVVSGSTSTGGISGGLGSGSGFGLSSGFGSGSGSGFGFGGSVSGSSSSKIISTT
          460       470       480       490       500       510    

     540       550       560    
pF1KB5 SSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
                                
CCDS41 TLNKRR                   
          520                   

>>CCDS8837.1 KRT77 gene_id:374454|Hs108|chr12             (578 aa)
 initn: 1968 init1: 1729 opt: 1994  Z-score: 1175.7  bits: 227.4 E(32554): 3.6e-59
Smith-Waterman score: 1994; 59.1% identity (82.3% similar) in 560 aa overlap (12-563:13-561)

                10        20        30        40        50         
pF1KB5  MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSR
                   : ::: .:..:.   : .  . .::  .:.: .:: : .  : :::::
CCDS88 MSHQFSSQSAFSSMSRRVYSTSSSAGSGGGSPAVGSVCYARGRCGGG-GYGIHGRGFGSR
               10        20        30        40         50         

      60        70        80        90       100        110        
pF1KB5 SLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGG-GAGIGFGLGGGAGL
       :::.::::. :::.  . . ::    ..::  :::: : ::: :. ::: ::: ::: : 
CCDS88 SLYNLGGSRSISINLMGRSTSGF--CQGGGVGGFGG-GRGFGVGSTGAG-GFG-GGGFGG
      60        70        80          90        100         110    

      120            130       140       150       160       170   
pF1KB5 AG----GFGGPGF-PVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNK
       ::    .::  :: : ::::::::::.::::: ::.:..:: :::....::::: .::::
CCDS88 AGFGTSNFGLGGFGPYCPPGGIQEVTINQSLLEPLHLEVDPEIQRIKTQEREQIMVLNNK
          120       130       140       150       160       170    

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB5 FASFIDKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERG
       :::::::::::::::.::.::: :::. .:.:  .:::::.:.::..::::.: . .:. 
CCDS88 FASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQVNTSTGTNNLEPLLENYIGDLRRQVDLLSAEQM
          180       190       200       210       220       230    

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB5 RLDSELRGMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTD
       : ..:.:.:::.:::.:.::::::::::..::.::.:::::::::..::.:....:::: 
CCDS88 RQNAEVRSMQDVVEDYKSKYEDEINKRTGSENDFVVLKKDVDAAYVSKVDLESRVDTLTG
          240       250       260       270       280       290    

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB5 EINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAE
       :.:::. :. .::::.:::::::.:.:::::::.:::::::  :..::: :::::. :::
CCDS88 EVNFLKYLFLTELSQVQTHISDTNVILSMDNNRSLDLDSIIDAVRTQYELIAQRSKDEAE
          300       310       320       330       340       350    

           360       370       380       390       400       410   
pF1KB5 SWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAE
       . :::::.:::.:::::::::.:.:.::::.:: .:::..::..::::  ..:. :.:::
CCDS88 ALYQTKYQELQITAGRHGDDLKNSKMEIAELNRTVQRLQAEISNVKKQIEQMQSLISDAE
          360       370       380       390       400       410    

           420       430       440       450       460       470   
pF1KB5 QRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEE
       .:::.::.:: .::. ::.:::..:..:::::..:: ...:::.:::::::::.::::::
CCDS88 ERGEQALQDAWQKLQDLEEALQQSKEELARLLRDYQAMLGVKLSLDVEIATYRQLLEGEE
          420       430       440       450       460       470    

           480       490         500       510       520       530 
pF1KB5 CRLNGEGVGQVNISVVQSTVS--SGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSS
        :..::  ..:.::: .: ::  .: ::... ::: : ::::. .::.: .  ::  .. 
CCDS88 SRMSGELQSHVSISVQNSQVSVNGGAGGGGSYGSG-GYGGGSGGGYGGGRSYRGG--GAR
          480       490       500        510       520         530 

             540       550       560                    
pF1KB5 GRAIGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH                
       ::. ::  :. :::...  :  .. :.: : .                 
CCDS88 GRSGGGYGSGCGGGGGS--YGGSGRSGRGSSRVQIIQTSTNTSHRRILE
             540         550       560       570        




564 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 10:06:19 2016 done: Sat Nov  5 10:06:19 2016
 Total Scan time:  3.720 Total Display time:  0.120

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com