seq1 = pF1KE4463.tfa, 1440 bp
seq2 = pF1KE4463/gi568815591r_50363234.tfa (gi568815591r:50363234_50644085), 280852 bp

>pF1KE4463 1440
>gi568815591r:50363234_50644085 (Chr7)

(complement)

1-201  (100001-100201)   99% ->
202-315  (104058-104171)   100% ->
316-435  (106107-106226)   100% ->
436-570  (114744-114878)   100% ->
571-714  (115806-115949)   100% ->
715-781  (140027-140093)   100% ->
782-876  (144844-144938)   100% ->
877-944  (148669-148736)   100% ->
945-1021  (164223-164299)   100% ->
1022-1041  (167443-167462)   100% ->
1042-1140  (173915-174013)   100% ->
1141-1242  (176771-176872)   100% ->
1243-1440  (180655-180852)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACGCAAGTGAATTCCGAAGGAGAGGGAAGGAGATGGTGGATTACGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 100001 ATGAACGCAAGTGAATTCCGAAGGAGAGGGAAGGAGATGGTGGATTACAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCAACTACATGGAAGGCATTGAGGGACGCCAGGTCTACCCTGACGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCAACTACATGGAAGGCATTGAGGGACGCCAGGTCTACCCTGACGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCCCGGGTACCTGCGGCCGCTGATCCCTGCCGCTGCCCCTCAGGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCCCGGGTACCTGCGGCCGCTGATCCCTGCCGCTGCCCCTCAGGAGCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACACGTTTGAGGACATCATCAACGACGTTGAGAAGATAATCATGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACACGTTTGAGGACATCATCAACGACGTTGAGAAGATAATCATGCCTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 G         GTGACGCACTGGCACAGCCCCTACTTCTTCGCCTACTTCC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGTA...CAGGTGACGCACTGGCACAGCCCCTACTTCTTCGCCTACTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCACTGCCAGCTCGTACCCGGCCATGCTTGCGGACATGCTGTGCGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104098 CCACTGCCAGCTCGTACCCGGCCATGCTTGCGGACATGCTGTGCGGGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATTGGCTGCATCGGCTTCTCCTGG         GCGGCAAGCCCAGCATG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 104148 ATTGGCTGCATCGGCTTCTCCTGGGTG...CAGGCGGCAAGCCCAGCATG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CACAGAGCTGGAGACTGTGATGATGGACTGGCTCGGGAAGATGCTGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106124 CACAGAGCTGGAGACTGTGATGATGGACTGGCTCGGGAAGATGCTGGAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TACCAAAGGCATTTTTGAATGAGAAAGCTGGAGAAGGGGGAGGAGTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106174 TACCAAAGGCATTTTTGAATGAGAAAGCTGGAGAAGGGGGAGGAGTGATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAG         GGAAGTGCCAGTGAAGCCACCCTGGTGGCCCTGCTGGC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106224 CAGGTA...TAGGGAAGTGCCAGTGAAGCCACCCTGGTGGCCCTGCTGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CGCTCGGACCAAAGTGATCCATCGGCTGCAGGCAGCGTCCCCAGAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114782 CGCTCGGACCAAAGTGATCCATCGGCTGCAGGCAGCGTCCCCAGAGCTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CACAGGCCGCTATCATGGAGAAGCTGGTGGCTTACTCATCCGATCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 114832 CACAGGCCGCTATCATGGAGAAGCTGGTGGCTTACTCATCCGATCAGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    571       GCACACTCCTCAGTGGAAAGAGCTGGGTTAATTGGTGGAGTGAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114882 ...CAGGCACACTCCTCAGTGGAAAGAGCTGGGTTAATTGGTGGAGTGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ATTAAAAGCCATCCCCTCAGATGGCAACTTCGCCATGCGTGCGTCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115850 ATTAAAAGCCATCCCCTCAGATGGCAACTTCGCCATGCGTGCGTCTGCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGCAGGAAGCCCTGGAGAGAGACAAAGCGGCTGGCCTGATTCCTTTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115900 TGCAGGAAGCCCTGGAGAGAGACAAAGCGGCTGGCCTGATTCCTTTCTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715          ATGGTTGCCACCCTGGGGACCACAACATGCTGCTCCTTTGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115950 GTA...TAGATGGTTGCCACCCTGGGGACCACAACATGCTGCTCCTTTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CAATCTCTTAGAAGTCGGTCCTATCT         GCAACAAGGAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 140068 CAATCTCTTAGAAGTCGGTCCTATCTGTA...TAGGCAACAAGGAAGACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TATGGCTGCACGTTGATGCAGCCTACGCAGGCAGTGCATTCATCTGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144859 TATGGCTGCACGTTGATGCAGCCTACGCAGGCAGTGCATTCATCTGCCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GAGTTCCGGCACCTTCTGAATGGAGTGGAG         TTTGCAGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 144909 GAGTTCCGGCACCTTCTGAATGGAGTGGAGGTA...CAGTTTGCAGATTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 ATTCAACTTTAATCCCCACAAATGGCTATTGGTGAATTTTGACTGTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148680 ATTCAACTTTAATCCCCACAAATGGCTATTGGTGAATTTTGACTGTTCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCATGTG         GGTGAAAAAGAGAACAGACTTAACGGGAGCCTTT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148730 CCATGTGGTA...CAGGGTGAAAAAGAGAACAGACTTAACGGGAGCCTTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AGACTGGACCCCACTTACCTGAAGCACAGCCATCAGGATTCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 164257 AGACTGGACCCCACTTACCTGAAGCACAGCCATCAGGATTCAGGTA...C

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1022   GGCTTATCACTGACTACCGG         CATTGGCAGATACCACTGG
        >>||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 167441 AGGGCTTATCACTGACTACCGGGTA...CAGCATTGGCAGATACCACTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 GCAGAAGATTTCGCTCTTTGAAAATGTGGTTTGTATTTAGGATGTATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173934 GCAGAAGATTTCGCTCTTTGAAAATGTGGTTTGTATTTAGGATGTATGGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GTCAAAGGACTGCAGGCTTATATCCGCAAG         CATGTCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 173984 GTCAAAGGACTGCAGGCTTATATCCGCAAGGTG...AAGCATGTCCAGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 GTCCCATGAGTTTGAGTCACTGGTGCGCCAGGATCCCCGCTTTGAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176782 GTCCCATGAGTTTGAGTCACTGGTGCGCCAGGATCCCCGCTTTGAAATCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 GTGTGGAAGTCATTCTGGGGCTTGTCTGCTTTCGGCTAAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 176832 GTGTGGAAGTCATTCTGGGGCTTGTCTGCTTTCGGCTAAAGGTT...CAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 GGTTCCAACAAAGTGAATGAAGCTCTTCTGCAAAGAATAAACAGTGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180655 GGTTCCAACAAAGTGAATGAAGCTCTTCTGCAAAGAATAAACAGTGCCAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 AAAAATCCACTTGGTTCCATGTCACCTCAGGGACAAGTTTGTCCTGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180705 AAAAATCCACTTGGTTCCATGTCACCTCAGGGACAAGTTTGTCCTGCGCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 TTGCCATCTGTTCTCGCACGGTGGAATCTGCCCATGTGCAGCGGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180755 TTGCCATCTGTTCTCGCACGGTGGAATCTGCCCATGTGCAGCGGGCCTGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1393 GAACACATCAAAGAGCTGGCGGCCGACGTGCTGCGAGCAGAGAGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180805 GAACACATCAAAGAGCTGGCGGCCGACGTGCTGCGAGCAGAGAGGGAG