Result of FASTA (omim) for pF1KB6602
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6602, 430 aa
  1>>>pF1KB6602 430 - 430 aa - 430 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0617+/-0.000588; mu= 1.0385+/- 0.036
 mean_var=253.1384+/-50.516, 0's: 0 Z-trim(114.5): 140  B-trim: 330 in 2/53
 Lambda= 0.080611
 statistics sampled from 24251 (24397) to 24251 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.617), E-opt: 0.2 (0.286), width:  16
 Scan time:  7.860

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_000215 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 2668 323.9 4.9e-88
NP_954657 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 2668 323.9 4.9e-88
NP_000517 (OMIM: 125595,131760,131800,131900,14806 ( 472) 1158 148.3 3.9e-35
NP_005548 (OMIM: 148067,167200,613000) keratin, ty ( 473) 1110 142.8 1.8e-33
NP_002267 (OMIM: 148020) keratin, type I cytoskele ( 400) 1108 142.5 1.9e-33
NP_002266 (OMIM: 148030) keratin, type I cytoskele ( 456) 1095 141.0   6e-33
NP_000413 (OMIM: 148069,167210,184500) keratin, ty ( 432) 1091 140.5   8e-33
NP_705694 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 458) 1075 138.7   3e-32
NP_002265 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 420) 1070 138.1 4.3e-32
NP_000412 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) kera ( 584) 1065 137.6 8.1e-32
XP_005257400 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) P ( 624) 1063 137.4   1e-31
XP_011523086 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 463) 1058 136.7 1.2e-31
XP_016880103 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 437) 1046 135.3   3e-31
NP_003762 (OMIM: 604540) keratin, type I cuticular ( 467) 1024 132.7 1.9e-30
XP_016879788 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 494) 1012 131.4 5.1e-30
NP_061889 (OMIM: 607742) keratin, type I cytoskele ( 525) 1012 131.4 5.4e-30
NP_000214 (OMIM: 122100,601687) keratin, type I cy ( 494)  995 129.4   2e-29
NP_002271 (OMIM: 602764) keratin, type I cuticular ( 455)  990 128.8 2.9e-29
XP_011523096 (OMIM: 602764) PREDICTED: keratin, ty ( 455)  990 128.8 2.9e-29
NP_061883 (OMIM: 608218) keratin, type I cytoskele ( 424)  981 127.7 5.6e-29
NP_002269 (OMIM: 602760) keratin, type I cuticular ( 448)  961 125.4 2.9e-28
NP_004129 (OMIM: 602761) keratin, type I cuticular ( 404)  953 124.4 5.2e-28
NP_002268 (OMIM: 601077) keratin, type I cuticular ( 416)  953 124.4 5.3e-28
NP_002270 (OMIM: 602762) keratin, type I cuticular ( 404)  930 121.8 3.3e-27
NP_853513 (OMIM: 616677) keratin, type I cytoskele ( 464)  916 120.2 1.1e-26
XP_006721802 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 427)  910 119.5 1.7e-26
XP_011522762 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 422)  906 119.0 2.4e-26
NP_853515 (OMIM: 616676) keratin, type I cytoskele ( 459)  905 118.9 2.7e-26
XP_011522716 (OMIM: 616646,616760) PREDICTED: kera ( 448)  898 118.1 4.7e-26
NP_000217 (OMIM: 144200,607606) keratin, type I cy ( 623)  900 118.4 5.1e-26
NP_853512 (OMIM: 616646,616760) keratin, type I cy ( 450)  897 118.0 5.1e-26
XP_011523095 (OMIM: 602763) PREDICTED: keratin, ty ( 412)  891 117.2 7.8e-26
NP_066293 (OMIM: 602763) keratin, type I cuticular ( 436)  891 117.2 8.1e-26
NP_056330 (OMIM: 606194) keratin, type I cytoskele ( 422)  855 113.1 1.4e-24
NP_853517 (OMIM: 616675) keratin, type I cytoskele ( 468)  851 112.6 2.1e-24
NP_998821 (OMIM: 616678) keratin, type I cytoskele ( 491)  843 111.7 4.2e-24
NP_872303 (OMIM: 616679) keratin, type I cytoskele ( 431)  819 108.9 2.7e-23
NP_006762 (OMIM: 604542) keratin, type I cuticular ( 456)  819 108.9 2.8e-23
XP_016879678 (OMIM: 616679) PREDICTED: keratin, ty ( 484)  819 108.9 2.9e-23
NP_003761 (OMIM: 604541) keratin, type I cuticular ( 449)  814 108.3 4.1e-23
NP_003371 (OMIM: 116300,193060) vimentin [Homo sap ( 466)  677 92.4 2.6e-18
XP_006717563 (OMIM: 116300,193060) PREDICTED: vime ( 466)  677 92.4 2.6e-18
NP_003562 (OMIM: 603212,611597) phakinin [Homo sap ( 415)  644 88.5 3.5e-17
XP_016862804 (OMIM: 603212,611597) PREDICTED: phak ( 415)  644 88.5 3.5e-17
NP_005547 (OMIM: 148059) keratin, type II cytoskel ( 469)  637 87.7 6.7e-17
NP_001269362 (OMIM: 606194) keratin, type I cytosk ( 285)  632 87.0 6.9e-17
XP_005257257 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285)  632 87.0 6.9e-17
XP_011522897 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285)  632 87.0 6.9e-17
NP_001918 (OMIM: 125660,181400,601419,602067,60476 ( 470)  632 87.2   1e-16
XP_011536627 (OMIM: 148059) PREDICTED: keratin, ty ( 445)  626 86.4 1.6e-16


>>NP_000215 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskeletal   (430 aa)
 initn: 2668 init1: 2668 opt: 2668  Z-score: 1701.5  bits: 323.9 E(85289): 4.9e-88
Smith-Waterman score: 2668; 100.0% identity (100.0% similar) in 430 aa overlap (1-430:1-430)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSFTTRSTFSTNYRSLGSVQAPSYGARPVSSAASVYAGAGGSGSRISVSRSTSFRGGMGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MSFTTRSTFSTNYRSLGSVQAPSYGARPVSSAASVYAGAGGSGSRISVSRSTSFRGGMGS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 GGLATGIAGGLAGMGGIQNEKETMQSLNDRLASYLDRVRSLETENRRLESKIREHLEKKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GGLATGIAGGLAGMGGIQNEKETMQSLNDRLASYLDRVRSLETENRRLESKIREHLEKKG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 PQVRDWSHYFKIIEDLRAQIFANTVDNARIVLQIDNARLAADDFRVKYETELAMRQSVEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PQVRDWSHYFKIIEDLRAQIFANTVDNARIVLQIDNARLAADDFRVKYETELAMRQSVEN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 DIHGLRKVIDDTNITRLQLETEIEALKEELLFMKKNHEEEVKGLQAQIASSGLTVEVDAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DIHGLRKVIDDTNITRLQLETEIEALKEELLFMKKNHEEEVKGLQAQIASSGLTVEVDAP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 KSQDLAKIMADIRAQYDELARKNREELDKYWSQQIEESTTVVTTQSAEVGAAETTLTELR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KSQDLAKIMADIRAQYDELARKNREELDKYWSQQIEESTTVVTTQSAEVGAAETTLTELR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 RTVQSLEIDLDSMRNLKASLENSLREVEARYALQMEQLNGILLHLESELAQTRAEGQRQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RTVQSLEIDLDSMRNLKASLENSLREVEARYALQMEQLNGILLHLESELAQTRAEGQRQA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 QEYEALLNIKVKLEAEIATYRRLLEDGEDFNLGDALDSSNSMQTIQKTTTRRIVDGKVVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QEYEALLNIKVKLEAEIATYRRLLEDGEDFNLGDALDSSNSMQTIQKTTTRRIVDGKVVS
              370       380       390       400       410       420

              430
pF1KB6 ETNDTKVLRH
       ::::::::::
NP_000 ETNDTKVLRH
              430

>>NP_954657 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskeletal   (430 aa)
 initn: 2668 init1: 2668 opt: 2668  Z-score: 1701.5  bits: 323.9 E(85289): 4.9e-88
Smith-Waterman score: 2668; 100.0% identity (100.0% similar) in 430 aa overlap (1-430:1-430)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSFTTRSTFSTNYRSLGSVQAPSYGARPVSSAASVYAGAGGSGSRISVSRSTSFRGGMGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_954 MSFTTRSTFSTNYRSLGSVQAPSYGARPVSSAASVYAGAGGSGSRISVSRSTSFRGGMGS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 GGLATGIAGGLAGMGGIQNEKETMQSLNDRLASYLDRVRSLETENRRLESKIREHLEKKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_954 GGLATGIAGGLAGMGGIQNEKETMQSLNDRLASYLDRVRSLETENRRLESKIREHLEKKG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 PQVRDWSHYFKIIEDLRAQIFANTVDNARIVLQIDNARLAADDFRVKYETELAMRQSVEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_954 PQVRDWSHYFKIIEDLRAQIFANTVDNARIVLQIDNARLAADDFRVKYETELAMRQSVEN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 DIHGLRKVIDDTNITRLQLETEIEALKEELLFMKKNHEEEVKGLQAQIASSGLTVEVDAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_954 DIHGLRKVIDDTNITRLQLETEIEALKEELLFMKKNHEEEVKGLQAQIASSGLTVEVDAP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 KSQDLAKIMADIRAQYDELARKNREELDKYWSQQIEESTTVVTTQSAEVGAAETTLTELR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_954 KSQDLAKIMADIRAQYDELARKNREELDKYWSQQIEESTTVVTTQSAEVGAAETTLTELR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 RTVQSLEIDLDSMRNLKASLENSLREVEARYALQMEQLNGILLHLESELAQTRAEGQRQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_954 RTVQSLEIDLDSMRNLKASLENSLREVEARYALQMEQLNGILLHLESELAQTRAEGQRQA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 QEYEALLNIKVKLEAEIATYRRLLEDGEDFNLGDALDSSNSMQTIQKTTTRRIVDGKVVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_954 QEYEALLNIKVKLEAEIATYRRLLEDGEDFNLGDALDSSNSMQTIQKTTTRRIVDGKVVS
              370       380       390       400       410       420

              430
pF1KB6 ETNDTKVLRH
       ::::::::::
NP_954 ETNDTKVLRH
              430

>>NP_000517 (OMIM: 125595,131760,131800,131900,148066,16  (472 aa)
 initn: 618 init1: 482 opt: 1158  Z-score: 751.9  bits: 148.3 E(85289): 3.9e-35
Smith-Waterman score: 1171; 48.2% identity (78.2% similar) in 427 aa overlap (17-428:38-461)

                             10        20          30            40
pF1KB6               MSFTTRSTFSTNYRSLGSVQAPS-YGAR-PVSSAASVYAGA----G
                                     :: .::: ::.   :::.    .::    :
NP_000 FTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSSRFSSGGAYGLGG
        10        20        30        40        50        60       

               50           60           70          80        90  
pF1KB6 GSGSRISVSRST---SFRGGMGSG---GLATGIAGGLAGMGG--IQNEKETMQSLNDRLA
       : :. .: : :.   .: ::.:.:   ::. :..::.::  :  . .:: :::.::::::
NP_000 GYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQNLNDRLA
        70        80        90       100       110       120       

            100       110       120        130       140       150 
pF1KB6 SYLDRVRSLETENRRLESKIREHLEKKGP-QVRDWSHYFKIIEDLRAQIFANTVDNARIV
       ::::.::.::  :  :: :::.  ... : ...:.: ::: ::::: .:.. ::::: ..
NP_000 SYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIEDLRNKILTATVDNANVL
       130       140       150       160       170       180       

             160       170       180       190       200       210 
pF1KB6 LQIDNARLAADDFRVKYETELAMRQSVENDIHGLRKVIDDTNITRLQLETEIEALKEELL
       ::::::::::::::.:::::: .:.::: ::.:::.:.:. ...: .:: .::.::::: 
NP_000 LQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIESLKEELA
       190       200       210       220       230       240       

             220       230       240       250       260       270 
pF1KB6 FMKKNHEEEVKGLQAQIASSGLTVEVDAPKSQDLAKIMADIRAQYDELARKNREELDKYW
       ..:::::::...:..:.... ..::.::  . ::..:. ..: ::...:.:::.. ....
NP_000 YLKKNHEEEMNALRGQVGGD-VNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEEWF
       250       260        270       280       290       300      

             280       290       300       310       320       330 
pF1KB6 SQQIEESTTVVTTQSAEVGAAETTLTELRRTVQSLEIDLDSMRNLKASLENSLREVEARY
         . :: .  :.:.:  : .... ..:::::.:.:::.:.:. ..::::::::.:...::
NP_000 FTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLENSLEETKGRY
        310       320       330       340       350       360      

             340       350       360       370       380       390 
pF1KB6 ALQMEQLNGILLHLESELAQTRAEGQRQAQEYEALLNIKVKLEAEIATYRRLLEDGEDFN
        .:. :.. ..  .: .::: : : ..: :::. ::..:..:: :::::::::: ::: .
NP_000 CMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLE-GEDAH
        370       380       390       400       410       420      

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pF1KB6 LGDALDSSNSMQTIQKTTTRRIVDGKVVSETNDTKVLRH         
       :...  ::.:... . :.. : .  ::. ...: ::.           
NP_000 LSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVM-DVHDGKVVSTHEQVLRTKN
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>>NP_005548 (OMIM: 148067,167200,613000) keratin, type I  (473 aa)
 initn: 571 init1: 474 opt: 1110  Z-score: 721.7  bits: 142.8 E(85289): 1.8e-33
Smith-Waterman score: 1132; 46.0% identity (76.6% similar) in 428 aa overlap (17-426:38-456)

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                                     :: .::: ::      .:  :..:   .:.
NP_005 FTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSRFSSGGACGLGGG
        10        20        30        40        50        60       

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pF1KB6 GGSGSRISVSRSTSFRGGMGSGGLATGIAGGL-AGMGG---------IQNEKETMQSLND
        :.:   : : ...: ::.: :::..:..::: ::.::         . .:: :::.:::
NP_005 YGGGFSSSSSFGSGFGGGYG-GGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQNLND
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pF1KB6 RLASYLDRVRSLETENRRLESKIREHLEKKGP-QVRDWSHYFKIIEDLRAQIFANTVDNA
       :::::::.::.::  :  :: :::.  ... : ...:.: ::: ::::: .:.: :..::
NP_005 RLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIKDYSPYFKTIEDLRNKIIAATIENA
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pF1KB6 RIVLQIDNARLAADDFRVKYETELAMRQSVENDIHGLRKVIDDTNITRLQLETEIEALKE
       . .::::::::::::::.::: :::.::.:: :..:::.:.:. ...: .:: .::.:::
NP_005 QPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKE
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      210       220       230       240       250       260        
pF1KB6 ELLFMKKNHEEEVKGLQAQIASSGLTVEVDAPKSQDLAKIMADIRAQYDELARKNREELD
       :: ...::::::. .:..: ... ..::.::  . ::..:. ..: ::...:.:::.. .
NP_005 ELAYLRKNHEEEMLALRGQ-TGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAEKNRRDAE
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      270       280       290       300       310       320        
pF1KB6 KYWSQQIEESTTVVTTQSAEVGAAETTLTELRRTVQSLEIDLDSMRNLKASLENSLREVE
        .. .. :: .  :...:  : .... .:::::..:.:::.:.:. ..::::::::.:..
NP_005 TWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLENSLEETK
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pF1KB6 ARYALQMEQLNGILLHLESELAQTRAEGQRQAQEYEALLNIKVKLEAEIATYRRLLEDGE
       .:: .:. :..:..  .: .::: : : ..:.:::. ::..:..:: :::::::::: ::
NP_005 GRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYRRLLE-GE
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      390       400       410       420       430             
pF1KB6 DFNLGDALDSSNSMQTIQKTTTRRIVDGKVVSETNDTKVLRH             
       : .:      :... . :. ..:..  ..  : . .:.                 
NP_005 DAHL------SSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS
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>>NP_002267 (OMIM: 148020) keratin, type I cytoskeletal   (400 aa)
 initn: 571 init1: 494 opt: 1108  Z-score: 721.4  bits: 142.5 E(85289): 1.9e-33
Smith-Waterman score: 1108; 46.7% identity (78.7% similar) in 394 aa overlap (2-389:3-389)

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pF1KB6  MSFTTR-STFSTNYRSLGSVQAPSYGARPVSSAASVYAGAGGSGSRISVSR--STSFRG
         :.. : :. .... .::.  .  .:   .  : :...:.:: :  .: .:  :.:  :
NP_002 MTSYSYRQSSATSSFGGLGG-GSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSSG
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pF1KB6 --GMGSGGLATGIAGGLAGMGGIQNEKETMQSLNDRLASYLDRVRSLETENRRLESKIRE
         : : ::. :.  : :::     ::: :::.::::::::::.::.::. : .:: :::.
NP_002 AYGGGYGGVLTASDGLLAG-----NEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRD
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pF1KB6 HLEKKGP-QVRDWSHYFKIIEDLRAQIFANTVDNARIVLQIDNARLAADDFRVKYETELA
         .:.::   ::.:::.  :.::: .:.. :..:.:::::::::::::::::.:.::: :
NP_002 WYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQA
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pF1KB6 MRQSVENDIHGLRKVIDDTNITRLQLETEIEALKEELLFMKKNHEEEVKGLQAQIASSGL
       .:.::: ::.:::.:.:. ...: .:: .::.::::: ..:::::::.. :..:.... .
NP_002 LRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQ-V
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pF1KB6 TVEVDAPKSQDLAKIMADIRAQYDELARKNREELDKYWSQQIEESTTVVTTQSAEVGAAE
       .::::.  . :::::..:.:.::. .:..::.. . ..... :: .  :. .. ..  ..
NP_002 SVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSR
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pF1KB6 TTLTELRRTVQSLEIDLDSMRNLKASLENSLREVEARYALQMEQLNGILLHLESELAQTR
       . .:.::::.:.:::.:.:. ..::.::..: :.:::.. :. ......  .:..:...:
NP_002 SEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVR
           300       310       320       330       340       350   

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pF1KB6 AEGQRQAQEYEALLNIKVKLEAEIATYRRLLEDGEDFNLGDALDSSNSMQTIQKTTTRRI
       :...:: :::. :..:: .:: :::::: :::  ::                        
NP_002 ADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL             
           360       370       380       390       400             

           420       430
pF1KB6 VDGKVVSETNDTKVLRH

>>NP_002266 (OMIM: 148030) keratin, type I cytoskeletal   (456 aa)
 initn: 1143 init1: 439 opt: 1095  Z-score: 712.5  bits: 141.0 E(85289): 6e-33
Smith-Waterman score: 1107; 45.3% identity (78.5% similar) in 413 aa overlap (25-420:40-450)

                     10        20        30        40        50    
pF1KB6       MSFTTRSTFSTNYRSLGSVQAPSYGARPVSSAASVYAGAGGSGSRISVSRSTSF
                                     :.: .:.... ....:..:.  .  :  .:
NP_002 SSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSGGGYGGGMRVCGF
      10        20        30        40        50        60         

           60           70               80        90       100    
pF1KB6 RGGMGS---GGLATGIAGGLAGM-----GGIQ--NEKETMQSLNDRLASYLDRVRSLETE
        :: ::   ::.. :..::..:      ::.   ::: :::.::::::::::.::.::  
NP_002 GGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLASYLDKVRALEEA
      70        80        90       100       110       120         

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pF1KB6 NRRLESKIREHLEKKGPQVR--DWSHYFKIIEDLRAQIFANTVDNARIVLQIDNARLAAD
       :  :: ::..  .:. :     :.:.::: ::.:: .:.:.:.::.:..:.:::::::::
NP_002 NADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRVILEIDNARLAAD
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pF1KB6 DFRVKYETELAMRQSVENDIHGLRKVIDDTNITRLQLETEIEALKEELLFMKKNHEEEVK
       :::.:::.:::.::.:: ::.:::.:.:. ...: .:: .::.:.::: ..:::::::.:
NP_002 DFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEELAYLKKNHEEEMK
     190       200       210       220       230       240         

            230       240       250       260       270       280  
pF1KB6 GLQAQIASSGLTVEVDAPKSQDLAKIMADIRAQYDELARKNREELDKYWSQQIEESTTVV
        ...:.:.. ..::.::  . ::....:..: ::. .:.:::.... .. .. :: .  :
NP_002 EFSSQLAGQ-VNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDVEAWFFSKTEELNKEV
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pF1KB6 TTQSAEVGAAETTLTELRRTVQSLEIDLDSMRNLKASLENSLREVEARYALQMEQLNGIL
       ....  . ...: .:.::::.: :::.:.:. ..::.::::: :.: ::: :..:..:..
NP_002 ASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAETECRYATQLQQIQGLI
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pF1KB6 LHLESELAQTRAEGQRQAQEYEALLNIKVKLEAEIATYRRLLEDGEDFNLG-----DALD
         ::..:.. : : . : :::. ::.::..:: :::::: ::: :.: ...     .: .
NP_002 GGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLE-GQDAKMAGIGIREASS
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pF1KB6 SSNSMQTIQKTTTRRIVDGKVVSETNDTKVLRH
       .... ..  . .... :::.:::          
NP_002 GGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI    
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>>NP_000413 (OMIM: 148069,167210,184500) keratin, type I  (432 aa)
 initn: 540 init1: 488 opt: 1091  Z-score: 710.3  bits: 140.5 E(85289): 8e-33
Smith-Waterman score: 1091; 47.7% identity (76.4% similar) in 394 aa overlap (32-420:37-422)

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pF1KB6 SFTTRSTFSTNYRSLGSVQAPSYGARPVSSAASVYAG-AGGSGSRI---SVSRSTSFRGG
                                     :.:   : ::: :: .   : :   :: .:
NP_000 QFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRLGSAGGLGSTLGGSSYSSCYSFGSG
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pF1KB6 MGSGGLATGIAGGLAGMGGIQNEKETMQSLNDRLASYLDRVRSLETENRRLESKIREHLE
        : :.   :. : :::     .:: :::.::::::::::.::.::  : .:: :::.  .
NP_000 GGYGSSFGGVDGLLAG-----GEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQ
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pF1KB6 KKGP-QVRDWSHYFKIIEDLRAQIFANTVDNARIVLQIDNARLAADDFRVKYETELAMRQ
       ...:  .::.:.:.. ::.:. .:.. ::::: :.::::::::::::::.:.::: :.: 
NP_000 RQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRL
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        180       190       200       210       220       230      
pF1KB6 SVENDIHGLRKVIDDTNITRLQLETEIEALKEELLFMKKNHEEEVKGLQAQIASSGLTVE
       ::: ::.:::.:.:. ...: .:: .:: ::::: ..:::::::...:..:...  ..::
NP_000 SVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGE-INVE
             190       200       210       220       230        240

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB6 VDAPKSQDLAKIMADIRAQYDELARKNREELDKYWSQQIEESTTVVTTQSAEVGAAETTL
       .::  . ::..:. ..: ::...:.:::.. . .. .. :: .  :.:.:  : .... .
NP_000 MDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEI
              250       260       270       280       290       300

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB6 TELRRTVQSLEIDLDSMRNLKASLENSLREVEARYALQMEQLNGILLHLESELAQTRAEG
       .:::::.:.:::.:.:. ..:::::..: :.: :: .:. :..:..  .: .::: : : 
NP_000 SELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEM
              310       320       330       340       350       360

        360       370       380       390       400       410      
pF1KB6 QRQAQEYEALLNIKVKLEAEIATYRRLLEDGEDFNLGDALDSSNSMQTIQKTTTRRIVDG
       ..: :::. ::..:..:: :::::::::: ::: .: .      . . . .: .... ::
NP_000 EQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLE-GEDAHLTQYKKEPVTTRQV-RTIVEEVQDG
              370       380        390       400        410        

        420       430
pF1KB6 KVVSETNDTKVLRH
       ::.:          
NP_000 KVISSREQVHQTTR
      420       430  

>>NP_705694 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cytosk  (458 aa)
 initn: 1070 init1: 437 opt: 1075  Z-score: 699.9  bits: 138.7 E(85289): 3e-32
Smith-Waterman score: 1076; 45.0% identity (76.1% similar) in 431 aa overlap (7-423:30-446)

                                      10        20        30       
pF1KB6                        MSFTTRSTFSTNYRSLGSVQAPSYGARPVSSAASVYA
                                    :: :: . : ::  : .::       ..:  
NP_705 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGGGRGVSTCSTRFVSGGS--AGGYG-------GGVSC
               10        20        30        40                 50 

         40        50        60        70                  80      
pF1KB6 G-AGGSGSRISVSRSTSFRGGMGSGGLATGIAGGLAGM--------GGIQ--NEKETMQS
       : .::.:: .. . . .. ::.: :::. :..::.::         ::.   ::: :::.
NP_705 GFGGGAGSGFGGGYGGGLGGGYG-GGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQN
              60        70         80        90       100       110

         90       100       110        120         130       140   
pF1KB6 LNDRLASYLDRVRSLETENRRLESKIRE-HLEKKGPQV--RDWSHYFKIIEDLRAQIFAN
       :::::::::..::.::  :  :: :::. :: :..:    ::.: :.: ::.:: .:.. 
NP_705 LNDRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHL-KQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTA
              120       130       140        150       160         

           150       160       170       180       190       200   
pF1KB6 TVDNARIVLQIDNARLAADDFRVKYETELAMRQSVENDIHGLRKVIDDTNITRLQLETEI
       :..: :..:.::::::::::::.:::.:::.::::: ::.:::.:.:. .... .:: .:
NP_705 TIENNRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQI
     170       180       190       200       210       220         

           210       220       230       240       250       260   
pF1KB6 EALKEELLFMKKNHEEEVKGLQAQIASSGLTVEVDAPKSQDLAKIMADIRAQYDELARKN
       :.:.::: .::::::::.: .. :.... ..::.::  . ::....:..: ::. .:..:
NP_705 ESLNEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQ-VNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERN
     230       240       250        260       270       280        

           270       280       290       300       310       320   
pF1KB6 REELDKYWSQQIEESTTVVTTQSAEVGAAETTLTELRRTVQSLEIDLDSMRNLKASLENS
       :.. ....  .  : .  :.:..: . ...: .::::::.:.:::.:.:. ..::.:::.
NP_705 RRDAEEWFHAKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENT
      290       300       310       320       330       340        

           330       340       350       360       370       380   
pF1KB6 LREVEARYALQMEQLNGILLHLESELAQTRAEGQRQAQEYEALLNIKVKLEAEIATYRRL
       . :.: :::::..:..:..  .:..:.. :.: . : :::. ::.::..:: :::::: :
NP_705 VAETECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSL
      350       360       370       380       390       400        

           390       400       410       420       430     
pF1KB6 LEDGEDFNLGDALDSSNSMQTIQKTTTRRIVDGKVVSETNDTKVLRH     
       :: :.: ..  .. :: .  . ..:..    ...:.. .:            
NP_705 LE-GQDAKMI-GFPSSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP
      410         420       430       440       450        

>>NP_002265 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cytosk  (420 aa)
 initn: 1069 init1: 436 opt: 1070  Z-score: 697.2  bits: 138.1 E(85289): 4.3e-32
Smith-Waterman score: 1071; 47.6% identity (77.3% similar) in 397 aa overlap (7-389:30-413)

                                      10        20        30       
pF1KB6                        MSFTTRSTFSTNYRSLGSVQAPSYGARPVSSAASVYA
                                    :: :: . : ::  : .::.       .:  
NP_002 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGGGRGVSTCSTRFVSGGS--AGGYGG-------GVSC
               10        20        30        40                 50 

         40        50        60        70                  80      
pF1KB6 G-AGGSGSRISVSRSTSFRGGMGSGGLATGIAGGLAGM--------GGIQ--NEKETMQS
       : .::.:: .. . . .. ::.: :::. :..::.::         ::.   ::: :::.
NP_002 GFGGGAGSGFGGGYGGGLGGGYG-GGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQN
              60        70         80        90       100       110

         90       100       110        120         130       140   
pF1KB6 LNDRLASYLDRVRSLETENRRLESKIRE-HLEKKGPQV--RDWSHYFKIIEDLRAQIFAN
       :::::::::..::.::  :  :: :::. :: :..:    ::.: :.: ::.:: .:.. 
NP_002 LNDRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHL-KQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTA
              120       130       140        150       160         

           150       160       170       180       190       200   
pF1KB6 TVDNARIVLQIDNARLAADDFRVKYETELAMRQSVENDIHGLRKVIDDTNITRLQLETEI
       :..: :..:.::::::::::::.:::.:::.::::: ::.:::.:.:. .... .:: .:
NP_002 TIENNRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQI
     170       180       190       200       210       220         

           210       220       230       240       250       260   
pF1KB6 EALKEELLFMKKNHEEEVKGLQAQIASSGLTVEVDAPKSQDLAKIMADIRAQYDELARKN
       :.:.::: .::::::::.: .. :.... ..::.::  . ::....:..: ::. .:..:
NP_002 ESLNEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQ-VNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERN
     230       240       250        260       270       280        

           270       280       290       300       310       320   
pF1KB6 REELDKYWSQQIEESTTVVTTQSAEVGAAETTLTELRRTVQSLEIDLDSMRNLKASLENS
       :.. ....  .  : .  :.:..: . ...: .::::::.:.:::.:.:. ..::.:::.
NP_002 RRDAEEWFHAKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENT
      290       300       310       320       330       340        

           330       340       350       360       370       380   
pF1KB6 LREVEARYALQMEQLNGILLHLESELAQTRAEGQRQAQEYEALLNIKVKLEAEIATYRRL
       . :.: :::::..:..:..  .:..:.. :.: . : :::. ::.::..:: :::::: :
NP_002 VAETECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSL
      350       360       370       380       390       400        

           390       400       410       420       430
pF1KB6 LEDGEDFNLGDALDSSNSMQTIQKTTTRRIVDGKVVSETNDTKVLRH
       :: :.:                                         
NP_002 LE-GQDAKKRQPP                                  
      410        420                                  

>>NP_000412 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) keratin,  (584 aa)
 initn: 1018 init1: 424 opt: 1065  Z-score: 692.2  bits: 137.6 E(85289): 8.1e-32
Smith-Waterman score: 1075; 47.6% identity (77.1% similar) in 393 aa overlap (10-393:71-461)

                                    10        20         30        
pF1KB6                      MSFTTRSTFSTNYRSLGSVQAPSY-GARPVSSAASVYAG
                                     : .: .::.  . :. :.   :: .. :.:
NP_000 GSLGGGFSSGGFSGGSFSRGSSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGG
               50        60        70        80        90       100

       40        50          60        70          80        90    
pF1KB6 AGGSGSRISVSRST-SFRGG-MGSGGLATGIAGGLAGMGGIQ--NEKETMQSLNDRLASY
       . :.::  . : .  :: :: .:.::.. :..::..: ::.   ::: :::.::::::::
NP_000 SFGGGSFGGGSFGGGSFGGGGFGGGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASY
              110       120       130       140       150       160

          100       110       120           130       140       150
pF1KB6 LDRVRSLETENRRLESKIREHLEKKGP----QVRDWSHYFKIIEDLRAQIFANTVDNARI
       ::.::.::  : .::.::.:  ::.:     . ::.:.:.: :.::. ::.  :.::: :
NP_000 LDKVRALEESNYELEGKIKEWYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANI
              170       180       190       200       210       220

              160       170       180       190       200       210
pF1KB6 VLQIDNARLAADDFRVKYETELAMRQSVENDIHGLRKVIDDTNITRLQLETEIEALKEEL
       .::::::::::::::.:::.:.:.::::: ::.:::.:.:. ..:. .:: .::.: :::
NP_000 LLQIDNARLAADDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEEL
              230       240       250       260       270       280

              220       230       240       250       260       270
pF1KB6 LFMKKNHEEEVKGLQAQIASSGLTVEVDAPKSQDLAKIMADIRAQYDELARKNREELDKY
        ..:::::::.: :. ..... ..::..:  . ::.... ..:.::..::..::.. . .
NP_000 AYLKKNHEEEMKDLR-NVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAW
              290        300       310       320       330         

              280       290       300       310       320       330
pF1KB6 WSQQIEESTTVVTTQSAEVGAAETTLTELRRTVQSLEIDLDSMRNLKASLENSLREVEAR
       .... .: :: . ..  .... .. .:::::.::.:::.:.:.  :: ::: :: :.:.:
NP_000 FNEKSKELTTEIDNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGR
     340       350       360       370       380       390         

              340       350       360       370       380       390
pF1KB6 YALQMEQLNGILLHLESELAQTRAEGQRQAQEYEALLNIKVKLEAEIATYRRLLEDGEDF
       : .:. :... .  :: .: : ::: . :  ::. ::.::..:: :: ::: ::: ::  
NP_000 YCVQLSQIQAQISALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLE-GEGS
     400       410       420       430       440       450         

              400       410       420       430                    
pF1KB6 NLGDALDSSNSMQTIQKTTTRRIVDGKVVSETNDTKVLRH                    
       . :                                                         
NP_000 SGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGGGSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSS
      460       470       480       490       500       510        




430 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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