Result of FASTA (omim) for pF1KB5994
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5994, 609 aa
  1>>>pF1KB5994 609 - 609 aa - 609 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1796+/-0.000411; mu= 20.6216+/- 0.026
 mean_var=79.0957+/-15.558, 0's: 0 Z-trim(111.3): 34  B-trim: 33 in 1/53
 Lambda= 0.144211
 statistics sampled from 19814 (19847) to 19814 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.233), width:  16
 Scan time:  7.360

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_000468 (OMIM: 103600,615999,616000) serum album ( 609) 4118 867.0       0
NP_001125 (OMIM: 104150,615969,615970) alpha-fetop ( 609) 1727 369.5 1.8e-101
NP_001124 (OMIM: 104145) afamin precursor [Homo sa ( 599) 1452 312.3   3e-84
XP_016863331 (OMIM: 104145) PREDICTED: afamin isof ( 494) 1089 236.7 1.4e-61
XP_016863333 (OMIM: 104145) PREDICTED: afamin isof ( 423)  974 212.7   2e-54
XP_016863332 (OMIM: 104145) PREDICTED: afamin isof ( 425)  963 210.5 9.8e-54
NP_000574 (OMIM: 139200) vitamin D-binding protein ( 474)  593 133.5 1.6e-30
NP_001191235 (OMIM: 139200) vitamin D-binding prot ( 474)  593 133.5 1.6e-30
NP_001191236 (OMIM: 139200) vitamin D-binding prot ( 493)  593 133.5 1.6e-30
XP_006714240 (OMIM: 139200) PREDICTED: vitamin D-b ( 425)  557 126.0 2.6e-28


>>NP_000468 (OMIM: 103600,615999,616000) serum albumin p  (609 aa)
 initn: 4118 init1: 4118 opt: 4118  Z-score: 4631.1  bits: 867.0 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4118; 100.0% identity (100.0% similar) in 609 aa overlap (1-609:1-609)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MKWVTFISLLFLFSSAYSRGVFRRDAHKSEVAHRFKDLGEENFKALVLIAFAQYLQQCPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MKWVTFISLLFLFSSAYSRGVFRRDAHKSEVAHRFKDLGEENFKALVLIAFAQYLQQCPF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 EDHVKLVNEVTEFAKTCVADESAENCDKSLHTLFGDKLCTVATLRETYGEMADCCAKQEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 EDHVKLVNEVTEFAKTCVADESAENCDKSLHTLFGDKLCTVATLRETYGEMADCCAKQEP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 ERNECFLQHKDDNPNLPRLVRPEVDVMCTAFHDNEETFLKKYLYEIARRHPYFYAPELLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ERNECFLQHKDDNPNLPRLVRPEVDVMCTAFHDNEETFLKKYLYEIARRHPYFYAPELLF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 FAKRYKAAFTECCQAADKAACLLPKLDELRDEGKASSAKQRLKCASLQKFGERAFKAWAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FAKRYKAAFTECCQAADKAACLLPKLDELRDEGKASSAKQRLKCASLQKFGERAFKAWAV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 ARLSQRFPKAEFAEVSKLVTDLTKVHTECCHGDLLECADDRADLAKYICENQDSISSKLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ARLSQRFPKAEFAEVSKLVTDLTKVHTECCHGDLLECADDRADLAKYICENQDSISSKLK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 ECCEKPLLEKSHCIAEVENDEMPADLPSLAADFVESKDVCKNYAEAKDVFLGMFLYEYAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ECCEKPLLEKSHCIAEVENDEMPADLPSLAADFVESKDVCKNYAEAKDVFLGMFLYEYAR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 RHPDYSVVLLLRLAKTYETTLEKCCAAADPHECYAKVFDEFKPLVEEPQNLIKQNCELFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RHPDYSVVLLLRLAKTYETTLEKCCAAADPHECYAKVFDEFKPLVEEPQNLIKQNCELFE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 QLGEYKFQNALLVRYTKKVPQVSTPTLVEVSRNLGKVGSKCCKHPEAKRMPCAEDYLSVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QLGEYKFQNALLVRYTKKVPQVSTPTLVEVSRNLGKVGSKCCKHPEAKRMPCAEDYLSVV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 LNQLCVLHEKTPVSDRVTKCCTESLVNRRPCFSALEVDETYVPKEFNAETFTFHADICTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LNQLCVLHEKTPVSDRVTKCCTESLVNRRPCFSALEVDETYVPKEFNAETFTFHADICTL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 SEKERQIKKQTALVELVKHKPKATKEQLKAVMDDFAAFVEKCCKADDKETCFAEEGKKLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SEKERQIKKQTALVELVKHKPKATKEQLKAVMDDFAAFVEKCCKADDKETCFAEEGKKLV
              550       560       570       580       590       600

                
pF1KB5 AASQAALGL
       :::::::::
NP_000 AASQAALGL
                

>>NP_001125 (OMIM: 104150,615969,615970) alpha-fetoprote  (609 aa)
 initn: 2021 init1: 1666 opt: 1727  Z-score: 1942.7  bits: 369.5 E(85289): 1.8e-101
Smith-Waterman score: 1727; 40.0% identity (71.0% similar) in 610 aa overlap (1-609:1-609)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MKWVTFISLLFLFSSAYSRGVFRRDAHKSEVAHRFKDLGEENFKALVLIAFAQYLQQCPF
       ::::  : :.::.. . :: . : .   . .   ..  .: ..  :. : :::..:.  .
NP_001 MKWVESIFLIFLLNFTESRTLHRNEYGIASILDSYQCTAEISLADLATIFFAQFVQEATY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 EDHVKLVNEVTEFAKTCVADESAENCDKSLHTLFGDKLCTVATLRETYGEMADCCAKQEP
       ..  :.:...    .  ..::.. .: ..    : ..::    . : ::. .:::...: 
NP_001 KEVSKMVKDALTAIEKPTGDEQSSGCLENQLPAFLEELCHEKEILEKYGH-SDCCSQSEE
               70        80        90       100       110          

              130        140       150       160       170         
pF1KB5 ERNECFLQHKDDNP-NLPRLVRPEVDVMCTAFHDNEETFLKKYLYEIARRHPYFYAPELL
        :..::: ::  .: ..: .  ::  . : :.....:::..:..::::::::..::: .:
NP_001 GRHNCFLAHKKPTPASIPLFQVPEPVTSCEAYEEDRETFMNKFIYEIARRHPFLYAPTIL
     120       130       140       150       160       170         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB5 FFAKRYKAAFTECCQAADKAACLLPKLDELRDEGKASSAKQRLKCASLQKFGERAFKAWA
       ..: ::   .  ::.: . . :.  :   .  : . ::  ..  :: ...:: :.:.: .
NP_001 LWAARYDKIIPSCCKAENAVECFQTKAATVTKELRESSLLNQHACAVMKNFGTRTFQAIT
     180       190       200       210       220       230         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB5 VARLSQRFPKAEFAEVSKLVTDLTKVHTECCHGDLLECADDRADLAKYICENQDSISSKL
       :..:::.: :..:.:..::: :...:: .::.::.:.: .:   . .::: .::..:.:.
NP_001 VTKLSQKFTKVNFTEIQKLVLDVAHVHEHCCRGDVLDCLQDGEKIMSYICSQQDTLSNKI
     240       250       260       270       280       290         

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB5 KECCEKPLLEKSHCIAEVENDEMPADLPSLAADFVESKDVCKNYAEAKDVFLGMFLYEYA
        :::.   ::...:: ..:::: :  :      :. ..:  .  .  :..::. :..::.
NP_001 TECCKLTTLERGQCIIHAENDEKPEGLSPNLNRFLGDRDFNQFSSGEKNIFLASFVHEYS
     300       310       320       330       340       350         

     360       370       380       390       400       410         
pF1KB5 RRHPDYSVVLLLRLAKTYETTLEKCCAAADPHECYAKVFDEFKPLVEEPQNLIKQNCELF
       ::::. .: ..::.:: :.  ::::  . .: ::  :  .:..  ..: : : :..: ::
NP_001 RRHPQLAVSVILRVAKGYQELLEKCFQTENPLECQDKGEEELQKYIQESQALAKRSCGLF
     360       370       380       390       400       410         

     420       430       440       450       460       470         
pF1KB5 EQLGEYKFQNALLVRYTKKVPQVSTPTLVEVSRNLGKVGSKCCKHPEAKRMPCAEDYLSV
       ..:::: .:::.:: ::::.::...  :. ..:... ... ::.  : : . :.:   ..
NP_001 QKLGEYYLQNAFLVAYTKKAPQLTSSELMAITRKMAATAATCCQLSEDKLLACGEGAADI
     420       430       440       450       460       470         

     480       490       500       510       520       530         
pF1KB5 VLNQLCVLHEKTPVSDRVTKCCTESLVNRRPCFSALEVDETYVPKEFNAETFTFHADICT
       ....::. :: :::.  : .::: : .:::::::.: :::::::  :. . : :: :.: 
NP_001 IIGHLCIRHEMTPVNPGVGQCCTSSYANRRPCFSSLVVDETYVPPAFSDDKFIFHKDLCQ
     480       490       500       510       520       530         

     540       550       560       570       580       590         
pF1KB5 LSEKERQIKKQTALVELVKHKPKATKEQLKAVMDDFAAFVEKCCKADDKETCFAEEGKKL
        .    :  ::  :..:::.::. :.:::.::. ::....::::.....:.::::::.::
NP_001 AQGVALQTMKQEFLINLVKQKPQITEEQLEAVIADFSGLLEKCCQGQEQEVCFAEEGQKL
     540       550       560       570       580       590         

     600         
pF1KB5 VAASQAALGL
       .. ..::::.
NP_001 ISKTRAALGV
     600         

>>NP_001124 (OMIM: 104145) afamin precursor [Homo sapien  (599 aa)
 initn: 1413 init1: 1023 opt: 1452  Z-score: 1633.6  bits: 312.3 E(85289): 3e-84
Smith-Waterman score: 1452; 35.5% identity (69.0% similar) in 603 aa overlap (1-599:4-597)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB5    MKWVTFISLLFLFSSAYSRGVFRRDAHKSEVAHRFKDLGEENFKALVLIAFAQYLQQ
          .: . :: .::... . .  .  :: .. . ...:    :.:.. ...::::::.:.
NP_001 MKLLKLTGFIFFLFFLTESLTLPTQPRDIENFNSTQKFI---EDNIEYITIIAFAQYVQE
               10        20        30           40        50       

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB5 CPFEDHVKLVNEVTEFAKTCVADESAENCDKSLHTLFGDKLCTVATLRETYGEMADCCAK
         ::.  :::....:.   :.::..  .:.:  .... .:.:..  : . .. .. ::.:
NP_001 ATFEEMEKLVKDMVEYKDRCMADKTLPECSKLPNNVLQEKICAMEGLPQKHN-FSHCCSK
        60        70        80        90       100        110      

       120       130           140       150       160       170   
pF1KB5 QEPERNECFLQHKDDN----PNLPRLVRPEVDVMCTAFHDNEETFLKKYLYEIARRHPYF
        . .:  ::. .: ..    : .: :  ::    : :...:.:..:...:::.:::.:. 
NP_001 VDAQRRLCFFYNKKSDVGFLPPFPTL-DPEEK--CQAYESNRESLLNHFLYEVARRNPFV
        120       130       140          150       160       170   

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB5 YAPELLFFAKRYKAAFTECCQAADKAACLLPKLDELRDEGKASSAKQRLKCASLQKFGER
       .:: ::  : ... .   ::.  .:. ::  .   . .  :: :. :.  :..: ::: .
NP_001 FAPTLLTVAVHFEEVAKSCCEEQNKVNCLQTRAIPVTQYLKAFSSYQKHVCGALLKFGTK
           180       190       200       210       220       230   

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB5 AFKAWAVARLSQRFPKAEFAEVSKLVTDLTKVHTECCHGDLLECADDRADLAKYICENQD
       . .   .: :::.::: :: :. .:: :... .  ::.::...:  : . . ..:: .::
NP_001 VVHFIYIAILSQKFPKIEFKELISLVEDVSSNYDGCCEGDVVQCIRDTSKVMNHICSKQD
           240       250       260       270       280       290   

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB5 SISSKLKECCEKPLLEKSHCIAEVENDEMPADLPSLAADFVESKDVCKNYAEAKDVFLGM
       :::::.:::::: . :...:: . ..:. : ::    . :..:..::..     :.:.. 
NP_001 SISSKIKECCEKKIPERGQCIINSNKDDRPKDLSLREGKFTDSENVCQERDADPDTFFAK
           300       310       320       330       340       350   

           360       370       380       390       400       410   
pF1KB5 FLYEYARRHPDYSVVLLLRLAKTYETTLEKCCAAADPHECYAKVFDEFKPLVEEPQNLIK
       : .::.::::: :.  :::... :.  :..:: . .:  ::  . :.:.  .:.  ....
NP_001 FTFEYSRRHPDLSIPELLRIVQIYKDLLRNCCNTENPPGCYRYAEDKFNETTEKSLKMVQ
           360       370       380       390       400       410   

           420       430       440       450       460       470   
pF1KB5 QNCELFEQLGEYKFQNALLVRYTKKVPQVSTPTLVEVSRNLGKVGSKCCKHPEAKRMPCA
       :.:. :..::.  ..   :.: :: .::.::  :: .....  . . ::   :  .. :.
NP_001 QECKHFQNLGKDGLKYHYLIRLTKIAPQLSTEELVSLGEKMVTAFTTCCTLSE--EFACV
           420       430       440       450       460         470 

           480       490       500       510       520       530   
pF1KB5 EDYLSVVLNQLCVLHEKTPVSDRVTKCCTESLVNRRPCFSALEVDETYVPKEFNAETFTF
       ..  ..:...:: ..:.  ..  : .::  ... ::::: .:..:.::::  :. . :::
NP_001 DNLADLVFGELCGVNENRTINPAVDHCCKTNFAFRRPCFESLKADKTYVPPPFSQDLFTF
             480       490       500       510       520       530 

           540       550       560       570       580       590   
pF1KB5 HADICTLSEKERQIKKQTALVELVKHKPKATKEQLKAVMDDFAAFVEKCCKADDKETCFA
       :::.:  ...: : : .  ::.::: : . : :.:.... .::  :.:::::.. :.:: 
NP_001 HADMCQSQNEELQRKTDRFLVNLVKLKHELTDEELQSLFTNFANVVDKCCKAESPEVCFN
             540       550       560       570       580       590 

           600         
pF1KB5 EEGKKLVAASQAALGL
       ::. :.          
NP_001 EESPKIGN        
                       

>>XP_016863331 (OMIM: 104145) PREDICTED: afamin isoform   (494 aa)
 initn: 1022 init1: 1022 opt: 1089  Z-score: 1226.5  bits: 236.7 E(85289): 1.4e-61
Smith-Waterman score: 1089; 33.8% identity (67.4% similar) in 485 aa overlap (1-481:4-479)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB5    MKWVTFISLLFLFSSAYSRGVFRRDAHKSEVAHRFKDLGEENFKALVLIAFAQYLQQ
          .: . :: .::... . .  .  :: .. . ...:    :.:.. ...::::::.:.
XP_016 MKLLKLTGFIFFLFFLTESLTLPTQPRDIENFNSTQKFI---EDNIEYITIIAFAQYVQE
               10        20        30           40        50       

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB5 CPFEDHVKLVNEVTEFAKTCVADESAENCDKSLHTLFGDKLCTVATLRETYGEMADCCAK
         ::.  :::....:.   :.::..  .:.:  .... .:.:..  : . .. .. ::.:
XP_016 ATFEEMEKLVKDMVEYKDRCMADKTLPECSKLPNNVLQEKICAMEGLPQKHN-FSHCCSK
        60        70        80        90       100        110      

       120       130           140       150       160       170   
pF1KB5 QEPERNECFLQHKDDN----PNLPRLVRPEVDVMCTAFHDNEETFLKKYLYEIARRHPYF
        . .:  ::. .: ..    : .: :  ::    : :...:.:..:...:::.:::.:. 
XP_016 VDAQRRLCFFYNKKSDVGFLPPFPTL-DPEEK--CQAYESNRESLLNHFLYEVARRNPFV
        120       130       140          150       160       170   

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB5 YAPELLFFAKRYKAAFTECCQAADKAACLLPKLDELRDEGKASSAKQRLKCASLQKFGER
       .:: ::  : ... .   ::.  .:. ::  .   . .  :: :. :.  :..: ::: .
XP_016 FAPTLLTVAVHFEEVAKSCCEEQNKVNCLQTRAIPVTQYLKAFSSYQKHVCGALLKFGTK
           180       190       200       210       220       230   

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB5 AFKAWAVARLSQRFPKAEFAEVSKLVTDLTKVHTECCHGDLLECADDRADLAKYICENQD
       . .   .: :::.::: :: :. .:: :... .  ::.::...:  : . . ..:: .::
XP_016 VVHFIYIAILSQKFPKIEFKELISLVEDVSSNYDGCCEGDVVQCIRDTSKVMNHICSKQD
           240       250       260       270       280       290   

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB5 SISSKLKECCEKPLLEKSHCIAEVENDEMPADLPSLAADFVESKDVCKNYAEAKDVFLGM
       :::::.:::::: . :...:: . ..:. : ::    . :..:..::..     :.:.. 
XP_016 SISSKIKECCEKKIPERGQCIINSNKDDRPKDLSLREGKFTDSENVCQERDADPDTFFAK
           300       310       320       330       340       350   

           360       370       380       390       400       410   
pF1KB5 FLYEYARRHPDYSVVLLLRLAKTYETTLEKCCAAADPHECYAKVFDEFKPLVEEPQNLIK
       : .::.::::: :.  :::... :.  :..:: . .:  ::  . :.:.  .:.  ....
XP_016 FTFEYSRRHPDLSIPELLRIVQIYKDLLRNCCNTENPPGCYRYAEDKFNETTEKSLKMVQ
           360       370       380       390       400       410   

           420       430       440       450       460       470   
pF1KB5 QNCELFEQLGEYKFQNALLVRYTKKVPQVSTPTLVEVSRNLGKVGSKCCKHPEAKRMPCA
       :.:. :..::.  ..   :.: :: .::.::  :: .....  . . ::   :  .. :.
XP_016 QECKHFQNLGKDGLKYHYLIRLTKIAPQLSTEELVSLGEKMVTAFTTCCTLSE--EFACV
           420       430       440       450       460         470 

           480       490       500       510       520       530   
pF1KB5 EDYLSVVLNQLCVLHEKTPVSDRVTKCCTESLVNRRPCFSALEVDETYVPKEFNAETFTF
       ..   : :                                                    
XP_016 DNLTCVNLRMRSFRGRQTGFLST                                     
             480       490                                         

>>XP_016863333 (OMIM: 104145) PREDICTED: afamin isoform   (423 aa)
 initn: 886 init1: 886 opt: 974  Z-score: 1098.1  bits: 212.7 E(85289): 2e-54
Smith-Waterman score: 974; 34.4% identity (68.2% similar) in 418 aa overlap (1-414:4-414)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB5    MKWVTFISLLFLFSSAYSRGVFRRDAHKSEVAHRFKDLGEENFKALVLIAFAQYLQQ
          .: . :: .::... . .  .  :: .. . ...:    :.:.. ...::::::.:.
XP_016 MKLLKLTGFIFFLFFLTESLTLPTQPRDIENFNSTQKFI---EDNIEYITIIAFAQYVQE
               10        20        30           40        50       

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB5 CPFEDHVKLVNEVTEFAKTCVADESAENCDKSLHTLFGDKLCTVATLRETYGEMADCCAK
         ::.  :::....:.   :.::..  .:.:  .... .:.:..  : . .. .. ::.:
XP_016 ATFEEMEKLVKDMVEYKDRCMADKTLPECSKLPNNVLQEKICAMEGLPQKHN-FSHCCSK
        60        70        80        90       100        110      

       120       130           140       150       160       170   
pF1KB5 QEPERNECFLQHKDDN----PNLPRLVRPEVDVMCTAFHDNEETFLKKYLYEIARRHPYF
        . .:  ::. .: ..    : .: :  ::    : :...:.:..:...:::.:::.:. 
XP_016 VDAQRRLCFFYNKKSDVGFLPPFPTL-DPEEK--CQAYESNRESLLNHFLYEVARRNPFV
        120       130       140          150       160       170   

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB5 YAPELLFFAKRYKAAFTECCQAADKAACLLPKLDELRDEGKASSAKQRLKCASLQKFGER
       .:: ::  : ... .   ::.  .:. ::  .   . .  :: :. :.  :..: ::: .
XP_016 FAPTLLTVAVHFEEVAKSCCEEQNKVNCLQTRAIPVTQYLKAFSSYQKHVCGALLKFGTK
           180       190       200       210       220       230   

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB5 AFKAWAVARLSQRFPKAEFAEVSKLVTDLTKVHTECCHGDLLECADDRADLAKYICENQD
       . .   .: :::.::: :: :. .:: :... .  ::.::...:  : . . ..:: .::
XP_016 VVHFIYIAILSQKFPKIEFKELISLVEDVSSNYDGCCEGDVVQCIRDTSKVMNHICSKQD
           240       250       260       270       280       290   

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB5 SISSKLKECCEKPLLEKSHCIAEVENDEMPADLPSLAADFVESKDVCKNYAEAKDVFLGM
       :::::.:::::: . :...:: . ..:. : ::    . :..:..::..     :.:.. 
XP_016 SISSKIKECCEKKIPERGQCIINSNKDDRPKDLSLREGKFTDSENVCQERDADPDTFFAK
           300       310       320       330       340       350   

           360       370       380       390       400       410   
pF1KB5 FLYEYARRHPDYSVVLLLRLAKTYETTLEKCCAAADPHECYAKVFDEFKPLVEEPQNLIK
       : .::.::::: :.  :::... :.  :..:: . .:  ::  . :.:.  .:.  ....
XP_016 FTFEYSRRHPDLSIPELLRIVQIYKDLLRNCCNTENPPGCYRYAEDKFNETTEKSLKMVQ
           360       370       380       390       400       410   

           420       430       440       450       460       470   
pF1KB5 QNCELFEQLGEYKFQNALLVRYTKKVPQVSTPTLVEVSRNLGKVGSKCCKHPEAKRMPCA
       :                                                           
XP_016 QEFTSSGSRR                                                  
           420                                                     

>>XP_016863332 (OMIM: 104145) PREDICTED: afamin isoform   (425 aa)
 initn: 886 init1: 886 opt: 963  Z-score: 1085.7  bits: 210.5 E(85289): 9.8e-54
Smith-Waterman score: 963; 34.4% identity (68.0% similar) in 416 aa overlap (1-412:4-412)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB5    MKWVTFISLLFLFSSAYSRGVFRRDAHKSEVAHRFKDLGEENFKALVLIAFAQYLQQ
          .: . :: .::... . .  .  :: .. . ...:    :.:.. ...::::::.:.
XP_016 MKLLKLTGFIFFLFFLTESLTLPTQPRDIENFNSTQKFI---EDNIEYITIIAFAQYVQE
               10        20        30           40        50       

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB5 CPFEDHVKLVNEVTEFAKTCVADESAENCDKSLHTLFGDKLCTVATLRETYGEMADCCAK
         ::.  :::....:.   :.::..  .:.:  .... .:.:..  : . .. .. ::.:
XP_016 ATFEEMEKLVKDMVEYKDRCMADKTLPECSKLPNNVLQEKICAMEGLPQKHN-FSHCCSK
        60        70        80        90       100        110      

       120       130           140       150       160       170   
pF1KB5 QEPERNECFLQHKDDN----PNLPRLVRPEVDVMCTAFHDNEETFLKKYLYEIARRHPYF
        . .:  ::. .: ..    : .: :  ::    : :...:.:..:...:::.:::.:. 
XP_016 VDAQRRLCFFYNKKSDVGFLPPFPTL-DPEEK--CQAYESNRESLLNHFLYEVARRNPFV
        120       130       140          150       160       170   

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB5 YAPELLFFAKRYKAAFTECCQAADKAACLLPKLDELRDEGKASSAKQRLKCASLQKFGER
       .:: ::  : ... .   ::.  .:. ::  .   . .  :: :. :.  :..: ::: .
XP_016 FAPTLLTVAVHFEEVAKSCCEEQNKVNCLQTRAIPVTQYLKAFSSYQKHVCGALLKFGTK
           180       190       200       210       220       230   

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB5 AFKAWAVARLSQRFPKAEFAEVSKLVTDLTKVHTECCHGDLLECADDRADLAKYICENQD
       . .   .: :::.::: :: :. .:: :... .  ::.::...:  : . . ..:: .::
XP_016 VVHFIYIAILSQKFPKIEFKELISLVEDVSSNYDGCCEGDVVQCIRDTSKVMNHICSKQD
           240       250       260       270       280       290   

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB5 SISSKLKECCEKPLLEKSHCIAEVENDEMPADLPSLAADFVESKDVCKNYAEAKDVFLGM
       :::::.:::::: . :...:: . ..:. : ::    . :..:..::..     :.:.. 
XP_016 SISSKIKECCEKKIPERGQCIINSNKDDRPKDLSLREGKFTDSENVCQERDADPDTFFAK
           300       310       320       330       340       350   

           360       370       380       390       400       410   
pF1KB5 FLYEYARRHPDYSVVLLLRLAKTYETTLEKCCAAADPHECYAKVFDEFKPLVEEPQNLIK
       : .::.::::: :.  :::... :.  :..:: . .:  ::  . :.:.  .:.  ... 
XP_016 FTFEYSRRHPDLSIPELLRIVQIYKDLLRNCCNTENPPGCYRYAEDKFNETTEKSLKMLP
           360       370       380       390       400       410   

           420       430       440       450       460       470   
pF1KB5 QNCELFEQLGEYKFQNALLVRYTKKVPQVSTPTLVEVSRNLGKVGSKCCKHPEAKRMPCA
                                                                   
XP_016 HQAHEDSSPTLH                                                
           420                                                     

>>NP_000574 (OMIM: 139200) vitamin D-binding protein iso  (474 aa)
 initn: 424 init1: 302 opt: 593  Z-score: 669.1  bits: 133.5 E(85289): 1.6e-30
Smith-Waterman score: 596; 25.4% identity (58.3% similar) in 472 aa overlap (1-462:1-453)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MKWVTFISLLFLFSSAYSRGVFRRDAHKSEVAHRFKDLGEENFKALVLIAFAQYLQQCPF
       :: :  . :   :. :  ::   :: .:..: ..:. ::.:.: .: :. ... . .  :
NP_000 MKRVLVLLLAVAFGHALERG---RDYEKNKVCKEFSHLGKEDFTSLSLVLYSRKFPSGTF
               10        20           30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 EDHVKLVNEVTEFAKTCVADESAENCDKSLHTLFGDKLCTVATLRETYGEMADCCAKQEP
       :.  .::.::. ....: :. .  .:  .  . .. : :   .   ..   :.::.:.  
NP_000 EQVSQLVKEVVSLTEACCAEGADPDCYDTRTSALSAKSCESNSPFPVHPGTAECCTKEGL
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 ERNECFLQHKDDNPNLPRLVRPEVDVMCTAFHDNEETFLKKYLYEIARRHPYFYAPELLF
       ::. :.   : .  ..:  :.:  : .: ::. . . . .....: .    :  ::  :.
NP_000 ERKLCMAALKHQPQEFPTYVEPTNDEICEAFRKDPKEYANQFMWEYSTN--YGQAPLSLL
       120       130       140       150       160         170     

                190       200       210       220       230        
pF1KB5 --FAKRYKAAFTECCQAADKAACLLPKLDELRDEGKASSAKQRLKCASLQKFGERAFKAW
         ..: : .    :: .:. ..:.: .  .:.  .  .. ..:. :..   .::.  .  
NP_000 VSYTKSYLSMVGSCCTSASPTVCFLKERLQLKHLSLLTTLSNRV-CSQYAAYGEKKSRLS
         180       190       200       210        220       230    

      240       250       260       270        280       290       
pF1KB5 AVARLSQRFPKAEFAEVSKLVTDLTKVHTECCHGDLLEC-ADDRADLAKYICENQDSISS
        . .:.:. : :.. .:  :. :.:.. ..::..   .: : .  . .  .:.: .. .:
NP_000 NLIKLAQKVPTADLEDVLPLAEDITNILSKCCESASEDCMAKELPEHTVKLCDNLSTKNS
          240       250       260       270       280       290    

       300        310       320       330       340       350      
pF1KB5 KLKECC-EKPLLEKSHCIAEVENDEMPADLPSLAADFVESKDVCKNYAEAKDVFLGMFLY
       :...:: ::  ..   :   .   ..: .::..  ..  .:::: . ...:   .  . .
NP_000 KFEDCCQEKTAMDVFVCTYFMPAAQLP-ELPDV--ELPTNKDVC-DPGNTK--VMDKYTF
          300       310       320          330        340          

        360         370       380       390       400        410   
pF1KB5 EYARR-H-PDYSVVLLLRLAKTYETTLEKCCAAADPHECYAKVFDEFKPLVE-EPQNLIK
       : .:: : :.   :.: .. .    .: .:: . :   :    :.   ::.. : ...: 
NP_000 ELSRRTHLPE---VFLSKVLEPTLKSLGECCDVEDSTTC----FNAKGPLLKKELSSFID
      350          360       370       380           390       400 

           420          430       440       450       460       470
pF1KB5 QNCELFEQLGEYKF---QNALLVRYTKKVPQVSTPTLVEVSRNLGKVGSKCCKHPEAKRM
       .. ::  . .:  :   .. :  :   :.:...   :...  . .  .:.::        
NP_000 KGQELCADYSENTFTEYKKKLAERLKAKLPDATPTELAKLVNKHSDFASNCCSINSPPLY
             410       420       430       440       450       460 

              480       490       500       510       520       530
pF1KB5 PCAEDYLSVVLNQLCVLHEKTPVSDRVTKCCTESLVNRRPCFSALEVDETYVPKEFNAET
                                                                   
NP_000 CDSEIDAELKNIL                                               
             470                                                   

>>NP_001191235 (OMIM: 139200) vitamin D-binding protein   (474 aa)
 initn: 424 init1: 302 opt: 593  Z-score: 669.1  bits: 133.5 E(85289): 1.6e-30
Smith-Waterman score: 596; 25.4% identity (58.3% similar) in 472 aa overlap (1-462:1-453)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MKWVTFISLLFLFSSAYSRGVFRRDAHKSEVAHRFKDLGEENFKALVLIAFAQYLQQCPF
       :: :  . :   :. :  ::   :: .:..: ..:. ::.:.: .: :. ... . .  :
NP_001 MKRVLVLLLAVAFGHALERG---RDYEKNKVCKEFSHLGKEDFTSLSLVLYSRKFPSGTF
               10        20           30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 EDHVKLVNEVTEFAKTCVADESAENCDKSLHTLFGDKLCTVATLRETYGEMADCCAKQEP
       :.  .::.::. ....: :. .  .:  .  . .. : :   .   ..   :.::.:.  
NP_001 EQVSQLVKEVVSLTEACCAEGADPDCYDTRTSALSAKSCESNSPFPVHPGTAECCTKEGL
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 ERNECFLQHKDDNPNLPRLVRPEVDVMCTAFHDNEETFLKKYLYEIARRHPYFYAPELLF
       ::. :.   : .  ..:  :.:  : .: ::. . . . .....: .    :  ::  :.
NP_001 ERKLCMAALKHQPQEFPTYVEPTNDEICEAFRKDPKEYANQFMWEYSTN--YGQAPLSLL
       120       130       140       150       160         170     

                190       200       210       220       230        
pF1KB5 --FAKRYKAAFTECCQAADKAACLLPKLDELRDEGKASSAKQRLKCASLQKFGERAFKAW
         ..: : .    :: .:. ..:.: .  .:.  .  .. ..:. :..   .::.  .  
NP_001 VSYTKSYLSMVGSCCTSASPTVCFLKERLQLKHLSLLTTLSNRV-CSQYAAYGEKKSRLS
         180       190       200       210        220       230    

      240       250       260       270        280       290       
pF1KB5 AVARLSQRFPKAEFAEVSKLVTDLTKVHTECCHGDLLEC-ADDRADLAKYICENQDSISS
        . .:.:. : :.. .:  :. :.:.. ..::..   .: : .  . .  .:.: .. .:
NP_001 NLIKLAQKVPTADLEDVLPLAEDITNILSKCCESASEDCMAKELPEHTVKLCDNLSTKNS
          240       250       260       270       280       290    

       300        310       320       330       340       350      
pF1KB5 KLKECC-EKPLLEKSHCIAEVENDEMPADLPSLAADFVESKDVCKNYAEAKDVFLGMFLY
       :...:: ::  ..   :   .   ..: .::..  ..  .:::: . ...:   .  . .
NP_001 KFEDCCQEKTAMDVFVCTYFMPAAQLP-ELPDV--ELPTNKDVC-DPGNTK--VMDKYTF
          300       310       320          330        340          

        360         370       380       390       400        410   
pF1KB5 EYARR-H-PDYSVVLLLRLAKTYETTLEKCCAAADPHECYAKVFDEFKPLVE-EPQNLIK
       : .:: : :.   :.: .. .    .: .:: . :   :    :.   ::.. : ...: 
NP_001 ELSRRTHLPE---VFLSKVLEPTLKSLGECCDVEDSTTC----FNAKGPLLKKELSSFID
      350          360       370       380           390       400 

           420          430       440       450       460       470
pF1KB5 QNCELFEQLGEYKF---QNALLVRYTKKVPQVSTPTLVEVSRNLGKVGSKCCKHPEAKRM
       .. ::  . .:  :   .. :  :   :.:...   :...  . .  .:.::        
NP_001 KGQELCADYSENTFTEYKKKLAERLKAKLPDATPTELAKLVNKHSDFASNCCSINSPPLY
             410       420       430       440       450       460 

              480       490       500       510       520       530
pF1KB5 PCAEDYLSVVLNQLCVLHEKTPVSDRVTKCCTESLVNRRPCFSALEVDETYVPKEFNAET
                                                                   
NP_001 CDSEIDAELKNIL                                               
             470                                                   

>>NP_001191236 (OMIM: 139200) vitamin D-binding protein   (493 aa)
 initn: 424 init1: 302 opt: 593  Z-score: 668.8  bits: 133.5 E(85289): 1.6e-30
Smith-Waterman score: 596; 25.4% identity (58.3% similar) in 472 aa overlap (1-462:20-472)

                                  10        20        30        40 
pF1KB5                    MKWVTFISLLFLFSSAYSRGVFRRDAHKSEVAHRFKDLGEE
                          :: :  . :   :. :  ::   :: .:..: ..:. ::.:
NP_001 MLWSWSEERGGAARLSGRKMKRVLVLLLAVAFGHALERG---RDYEKNKVCKEFSHLGKE
               10        20        30           40        50       

              50        60        70        80        90       100 
pF1KB5 NFKALVLIAFAQYLQQCPFEDHVKLVNEVTEFAKTCVADESAENCDKSLHTLFGDKLCTV
       .: .: :. ... . .  ::.  .::.::. ....: :. .  .:  .  . .. : :  
NP_001 DFTSLSLVLYSRKFPSGTFEQVSQLVKEVVSLTEACCAEGADPDCYDTRTSALSAKSCES
        60        70        80        90       100       110       

             110       120       130       140       150       160 
pF1KB5 ATLRETYGEMADCCAKQEPERNECFLQHKDDNPNLPRLVRPEVDVMCTAFHDNEETFLKK
        .   ..   :.::.:.  ::. :.   : .  ..:  :.:  : .: ::. . . . ..
NP_001 NSPFPVHPGTAECCTKEGLERKLCMAALKHQPQEFPTYVEPTNDEICEAFRKDPKEYANQ
       120       130       140       150       160       170       

             170       180         190       200       210         
pF1KB5 YLYEIARRHPYFYAPELLF--FAKRYKAAFTECCQAADKAACLLPKLDELRDEGKASSAK
       ...: .    :  ::  :.  ..: : .    :: .:. ..:.: .  .:.  .  .. .
NP_001 FMWEYSTN--YGQAPLSLLVSYTKSYLSMVGSCCTSASPTVCFLKERLQLKHLSLLTTLS
       180         190       200       210       220       230     

     220       230       240       250       260       270         
pF1KB5 QRLKCASLQKFGERAFKAWAVARLSQRFPKAEFAEVSKLVTDLTKVHTECCHGDLLEC-A
       .:. :..   .::.  .   . .:.:. : :.. .:  :. :.:.. ..::..   .: :
NP_001 NRV-CSQYAAYGEKKSRLSNLIKLAQKVPTADLEDVLPLAEDITNILSKCCESASEDCMA
          240       250       260       270       280       290    

      280       290       300        310       320       330       
pF1KB5 DDRADLAKYICENQDSISSKLKECC-EKPLLEKSHCIAEVENDEMPADLPSLAADFVESK
        .  . .  .:.: .. .::...:: ::  ..   :   .   ..: .::..  ..  .:
NP_001 KELPEHTVKLCDNLSTKNSKFEDCCQEKTAMDVFVCTYFMPAAQLP-ELPDV--ELPTNK
          300       310       320       330       340          350 

       340       350       360         370       380       390     
pF1KB5 DVCKNYAEAKDVFLGMFLYEYARR-H-PDYSVVLLLRLAKTYETTLEKCCAAADPHECYA
       ::: . ...:   .  . .: .:: : :.   :.: .. .    .: .:: . :   :  
NP_001 DVC-DPGNTK--VMDKYTFELSRRTHLPE---VFLSKVLEPTLKSLGECCDVEDSTTC--
              360         370          380       390       400     

         400        410       420          430       440       450 
pF1KB5 KVFDEFKPLVE-EPQNLIKQNCELFEQLGEYKF---QNALLVRYTKKVPQVSTPTLVEVS
         :.   ::.. : ...: .. ::  . .:  :   .. :  :   :.:...   :... 
NP_001 --FNAKGPLLKKELSSFIDKGQELCADYSENTFTEYKKKLAERLKAKLPDATPTELAKLV
             410       420       430       440       450       460 

             460       470       480       490       500       510 
pF1KB5 RNLGKVGSKCCKHPEAKRMPCAEDYLSVVLNQLCVLHEKTPVSDRVTKCCTESLVNRRPC
        . .  .:.::                                                 
NP_001 NKHSDFASNCCSINSPPLYCDSEIDAELKNIL                            
             470       480       490                               

>>XP_006714240 (OMIM: 139200) PREDICTED: vitamin D-bindi  (425 aa)
 initn: 424 init1: 302 opt: 557  Z-score: 629.2  bits: 126.0 E(85289): 2.6e-28
Smith-Waterman score: 561; 25.8% identity (58.5% similar) in 434 aa overlap (1-427:1-415)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MKWVTFISLLFLFSSAYSRGVFRRDAHKSEVAHRFKDLGEENFKALVLIAFAQYLQQCPF
       :: :  . :   :. :  ::   :: .:..: ..:. ::.:.: .: :. ... . .  :
XP_006 MKRVLVLLLAVAFGHALERG---RDYEKNKVCKEFSHLGKEDFTSLSLVLYSRKFPSGTF
               10        20           30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 EDHVKLVNEVTEFAKTCVADESAENCDKSLHTLFGDKLCTVATLRETYGEMADCCAKQEP
       :.  .::.::. ....: :. .  .:  .  . .. : :   .   ..   :.::.:.  
XP_006 EQVSQLVKEVVSLTEACCAEGADPDCYDTRTSALSAKSCESNSPFPVHPGTAECCTKEGL
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 ERNECFLQHKDDNPNLPRLVRPEVDVMCTAFHDNEETFLKKYLYEIARRHPYFYAPELLF
       ::. :.   : .  ..:  :.:  : .: ::. . . . .....: .    :  ::  :.
XP_006 ERKLCMAALKHQPQEFPTYVEPTNDEICEAFRKDPKEYANQFMWEYSTN--YGQAPLSLL
       120       130       140       150       160         170     

                190       200       210       220       230        
pF1KB5 --FAKRYKAAFTECCQAADKAACLLPKLDELRDEGKASSAKQRLKCASLQKFGERAFKAW
         ..: : .    :: .:. ..:.: .  .:.  .  .. ..:. :..   .::.  .  
XP_006 VSYTKSYLSMVGSCCTSASPTVCFLKERLQLKHLSLLTTLSNRV-CSQYAAYGEKKSRLS
         180       190       200       210        220       230    

      240       250       260       270        280       290       
pF1KB5 AVARLSQRFPKAEFAEVSKLVTDLTKVHTECCHGDLLEC-ADDRADLAKYICENQDSISS
        . .:.:. : :.. .:  :. :.:.. ..::..   .: : .  . .  .:.: .. .:
XP_006 NLIKLAQKVPTADLEDVLPLAEDITNILSKCCESASEDCMAKELPEHTVKLCDNLSTKNS
          240       250       260       270       280       290    

       300        310       320       330       340       350      
pF1KB5 KLKECC-EKPLLEKSHCIAEVENDEMPADLPSLAADFVESKDVCKNYAEAKDVFLGMFLY
       :...:: ::  ..   :   .   ..: .::..  ..  .:::: . ...:   .  . .
XP_006 KFEDCCQEKTAMDVFVCTYFMPAAQLP-ELPDV--ELPTNKDVC-DPGNTK--VMDKYTF
          300       310       320          330        340          

        360         370       380       390       400        410   
pF1KB5 EYARR-H-PDYSVVLLLRLAKTYETTLEKCCAAADPHECYAKVFDEFKPLVE-EPQNLIK
       : .:: : :.   :.: .. .    .: .:: . :   :    :.   ::.. : ...: 
XP_006 ELSRRTHLPE---VFLSKVLEPTLKSLGECCDVEDSTTC----FNAKGPLLKKELSSFID
      350          360       370       380           390       400 

           420       430       440       450       460       470   
pF1KB5 QNCELFEQLGEYKFQNALLVRYTKKVPQVSTPTLVEVSRNLGKVGSKCCKHPEAKRMPCA
       .. ::  . .:  :                                              
XP_006 KGQELCADYSENTFTEYKKKLMLN                                    
             410       420                                         




609 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Mon Nov  7 19:33:03 2016 done: Mon Nov  7 19:33:04 2016
 Total Scan time:  7.360 Total Display time:  0.080

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com