seq1 = pF1KE3591.tfa, 1269 bp seq2 = pF1KE3591/gi568815595f_33197663.tfa (gi568815595f:33197663_33485605), 287943 bp >pF1KE3591 1269 >gi568815595f:33197663_33485605 (Chr3) 1-65 (100000-100063) 98% -> 66-120 (161305-161359) 100% -> 121-195 (161621-161695) 100% -> 196-290 (166963-167057) 100% -> 291-359 (175430-175498) 100% -> 360-455 (175598-175693) 100% -> 456-582 (175916-176042) 100% -> 583-657 (176185-176259) 100% -> 658-788 (177626-177756) 100% -> 789-849 (179611-179671) 100% -> 850-894 (180441-180485) 100% -> 895-951 (181023-181079) 100% -> 952-1164 (186327-186539) 100% -> 1165-1269 (187839-187943) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGTTTTCTCAAACAATGATGAAGGCCTTATTAACAAAAAGTTACCCAA |-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100000 A GGTTTTCTCAAACAATGATGAAGGCCTTATTAACAAAAAGTTACCCAA 50 . : . : . : . : . : 51 AGAACTTCTGTTAAG AATATTTTCCTTCTTGGATATAGTAA |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| 100049 AGAACTTCTGTTAAGGTA...TAGAATATTTTCCTTCTTGGATATAGTAA 100 . : . : . : . : . : 92 CTTTGTGCCGATGTGCACAGATTTCCAAG GCTTGGAACATC |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||| 161331 CTTTGTGCCGATGTGCACAGATTTCCAAGGTA...CAGGCTTGGAACATC 150 . : . : . : . : . : 133 TTAGCCCTGGATGGAAGCAACTGGCAAAGAATAGATCTTTTTAACTTTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 161633 TTAGCCCTGGATGGAAGCAACTGGCAAAGAATAGATCTTTTTAACTTTCA 200 . : . : . : . : . : 183 AACAGATGTAGAG GGTCGAGTGGTGGAAAATATCTCGAAGC |||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||| 161683 AACAGATGTAGAGGTA...AAGGGTCGAGTGGTGGAAAATATCTCGAAGC 250 . : . : . : . : . : 224 GATGCGGTGGATTCCTGAGGAAGCTCAGCTTGCGAGGCTGCATTGGTGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 166991 GATGCGGTGGATTCCTGAGGAAGCTCAGCTTGCGAGGCTGCATTGGTGTT 300 . : . : . : . : . : 274 GGGGATTCCTCCTTGAA GACCTTTGCACAGAACTGCCGAAA |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| 167041 GGGGATTCCTCCTTGAAGTA...TAGGACCTTTGCACAGAACTGCCGAAA 350 . : . : . : . : . : 315 CATTGAACATTTGAACCTCAATGGATGCACAAAAATCACTGACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 175454 CATTGAACATTTGAACCTCAATGGATGCACAAAAATCACTGACAGGTA.. 400 . : . : . : . : . : 360 CACGTGTTATAGCCTTAGCAGATTCTGTTCCAAGCTGAAACATCTG .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 175504 .CAGCACGTGTTATAGCCTTAGCAGATTCTGTTCCAAGCTGAAACATCTG 450 . : . : . : . : . : 406 GATCTGACCTCCTGTGTGTCTATTACAAACAGCTCCTTGAAGGGGATCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 175644 GATCTGACCTCCTGTGTGTCTATTACAAACAGCTCCTTGAAGGGGATCAG 500 . : . : . : . : . : 456 TGAGGGCTGCCGAAACCTGGAGTACCTGAACCTCTCTTGGT >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 175694 GTA...CAGTGAGGGCTGCCGAAACCTGGAGTACCTGAACCTCTCTTGGT 550 . : . : . : . : . : 497 GTGATCAGATCACGAAGGATGGCATCGAGGCACTGGTGCGAGGTTGTCGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 175957 GTGATCAGATCACGAAGGATGGCATCGAGGCACTGGTGCGAGGTTGTCGA 600 . : . : . : . : . : 547 GGCCTGAAAGCCCTGCTCCTGAGGGGCTGCACACAG TTAGA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||| 176007 GGCCTGAAAGCCCTGCTCCTGAGGGGCTGCACACAGGTA...CAGTTAGA 650 . : . : . : . : . : 588 AGATGAAGCTCTGAAACACATTCAGAATTACTGCCATGAGCTTGTGAGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 176190 AGATGAAGCTCTGAAACACATTCAGAATTACTGCCATGAGCTTGTGAGCC 700 . : . : . : . : . : 638 TCAACTTGCAGTCCTGCTCA CGTATCACGGATGAAGGTGTG ||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||| 176240 TCAACTTGCAGTCCTGCTCAGTA...CAGCGTATCACGGATGAAGGTGTG 750 . : . : . : . : . : 679 GTGCAGATATGCAGGGGCTGTCACCGGCTACAGGCTCTCTGCCTTTCGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 177647 GTGCAGATATGCAGGGGCTGTCACCGGCTACAGGCTCTCTGCCTTTCGGG 800 . : . : . : . : . : 729 TTGCAGCAACCTCACAGATGCCTCTCTTACAGCCCTGGGTTTGAACTGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 177697 TTGCAGCAACCTCACAGATGCCTCTCTTACAGCCCTGGGTTTGAACTGTC 850 . : . : . : . : . : 779 CGCGACTGCA AATTTTGGAGGCTGCCCGATGCTCCCATTTG ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 177747 CGCGACTGCAGTG...CAGAATTTTGGAGGCTGCCCGATGCTCCCATTTG 900 . : . : . : . : . : 820 ACTGACGCAGGTTTTACACTTTTAGCTCGG AATTGCCACGA ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 179642 ACTGACGCAGGTTTTACACTTTTAGCTCGGGTA...CAGAATTGCCACGA 950 . : . : . : . : . : 861 ATTGGAGAAGATGGATCTTGAAGAATGCATCCTG ATAACCG ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| 180452 ATTGGAGAAGATGGATCTTGAAGAATGCATCCTGGTG...CAGATAACCG 1000 . : . : . : . : . : 902 ACAGCACACTCATCCAGCTCTCCATTCACTGTCCTAAACTGCAAGCCCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 181030 ACAGCACACTCATCCAGCTCTCCATTCACTGTCCTAAACTGCAAGCCCTG 1050 . : . : . : . : . : 952 AGCCTGTCCCACTGTGAACTCATCACAGATGATGGGATCCT >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 181080 GTG...CAGAGCCTGTCCCACTGTGAACTCATCACAGATGATGGGATCCT 1100 . : . : . : . : . : 993 GCACCTGAGCAACAGTACCTGTGGCCATGAGAGGCTGCGGGTACTGGAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 186368 GCACCTGAGCAACAGTACCTGTGGCCATGAGAGGCTGCGGGTACTGGAGT 1150 . : . : . : . : . : 1043 TGGACAACTGCCTCCTCATCACTGATGTGGCCCTGGAACACCTAGAGAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 186418 TGGACAACTGCCTCCTCATCACTGATGTGGCCCTGGAACACCTAGAGAAC 1200 . : . : . : . : . : 1093 TGCCGAGGCCTGGAGCGCCTCGAGCTGTACGACTGCCAGCAGGTTACCCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 186468 TGCCGAGGCCTGGAGCGCCTCGAGCTGTACGACTGCCAGCAGGTTACCCG 1250 . : . : . : . : . : 1143 TGCAGGCATCAAGCGGATGCGG GCTCAGCTCCCTCATGTCA ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 186518 TGCAGGCATCAAGCGGATGCGGGTA...CAGGCTCAGCTCCCTCATGTCA 1300 . : . : . : . : . : 1184 AAGTCCACGCCTACTTTGCTCCCGTCACCCCACCGACAGCAGTGGCAGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 187858 AAGTCCACGCCTACTTTGCTCCCGTCACCCCACCGACAGCAGTGGCAGGA 1350 . : . : . : . 1234 AGTGGACAGCGACTGTGCAGGTGCTGTGTCATTCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||| 187908 AGTGGACAGCGACTGTGCAGGTGCTGTGTCATTCTC