Result of FASTA (ccds) for pF1KB3060
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3060, 626 aa
  1>>>pF1KB3060 626 - 626 aa - 626 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3322+/-0.000983; mu= 19.4372+/- 0.059
 mean_var=70.7211+/-13.952, 0's: 0 Z-trim(105.3): 24  B-trim: 45 in 1/45
 Lambda= 0.152511
 statistics sampled from 8355 (8369) to 8355 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.257), width:  16
 Scan time:  3.380

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5840.1 SLC13A4 gene_id:26266|Hs108|chr7        ( 626) 4143 921.1       0
CCDS5786.1 SLC13A1 gene_id:6561|Hs108|chr7         ( 595) 1405 318.7 1.4e-86
CCDS54098.1 SLC13A2 gene_id:9058|Hs108|chr17       ( 641) 1310 297.8   3e-80
CCDS67136.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17     ( 525) 1185 270.2 4.8e-72
CCDS67137.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17     ( 551) 1185 270.2   5e-72
CCDS11079.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17     ( 568) 1185 270.2 5.1e-72
CCDS11231.1 SLC13A2 gene_id:9058|Hs108|chr17       ( 592) 1126 257.3 4.3e-68
CCDS42886.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20      ( 555) 1055 241.6 2.1e-63
CCDS13400.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20      ( 602) 1055 241.7 2.2e-63
CCDS54470.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20      ( 552)  849 196.3   9e-50
CCDS54469.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20      ( 520)  654 153.4 7.1e-37
CCDS45593.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17     ( 522)  550 130.5 5.5e-30


>>CCDS5840.1 SLC13A4 gene_id:26266|Hs108|chr7             (626 aa)
 initn: 4143 init1: 4143 opt: 4143  Z-score: 4923.2  bits: 921.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4143; 99.8% identity (99.8% similar) in 626 aa overlap (1-626:1-626)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MGLLQGLLRVRKLLLVVCVPLLLLPLPVLHPSSEASCAYVLIVTAVYWVSEAVPLGAAAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MGLLQGLLRVRKLLLVVCVPLLLLPLPVLHPSSEASCAYVLIVTAVYWVSEAVPLGAAAL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 VPAFLYPFFGVLRSNEVAAEYFKNTTLLLVGVICVAAAVEKWNLHKRIALRMVLMAGAKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VPAFLYPFFGVLRSNEVAAEYFKNTTLLLVGVICVAAAVEKWNLHKRIALRMVLMAGAKP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 GMLLLCFMCCTTLLSMWLSNTSTTAMVMPIVEAVLQELVSAEDEQLVAGNSNTEEAEPIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GMLLLCFMCCTTLLSMWLSNTSTTAMVMPIVEAVLQELVSAEDEQLVAGNSNTEEAEPIS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 LDVKNSQPSLELIFVNEESNADLTTLMHNENLNGVPSITNPIKTANQHQGKKQHPSQEKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LDVKNSQPSLELIFVNEESNADLTTLMHNENLNGVPSITNPIKTANQHQGKKQHPSQEKP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 QVLTRSPRKQKLNRKYRSHHDQMICKCLSLSISYSATIGGLTTIIGTSTSLIFLEHFNNQ
       :::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QVLTPSPRKQKLNRKYRSHHDQMICKCLSLSISYSATIGGLTTIIGTSTSLIFLEHFNNQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 YPAAEVVNFGTWFLFSFPISLIMLVVSWFWMHWLFLGCNFKETCSLSKKKKTKREQLSEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YPAAEVVNFGTWFLFSFPISLIMLVVSWFWMHWLFLGCNFKETCSLSKKKKTKREQLSEK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 RIQEEYEKLGDISYPEMVTGFFFILMTVLWFTREPGFVPGWDSFFEKKGYRTDATVSVFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RIQEEYEKLGDISYPEMVTGFFFILMTVLWFTREPGFVPGWDSFFEKKGYRTDATVSVFL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 GFLLFLIPAKKPCFGKKNDGENQEHSLGTEPIITWKDFQKTMPWEIVILVGGGYALASGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GFLLFLIPAKKPCFGKKNDGENQEHSLGTEPIITWKDFQKTMPWEIVILVGGGYALASGS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 KSSGLSTWIGNQMLSLSSLPPWAVTLLACILVSIVTEFVSNPATITIFLPILCSLSETLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KSSGLSTWIGNQMLSLSSLPPWAVTLLACILVSIVTEFVSNPATITIFLPILCSLSETLH
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 INPLYTLIPVTMCISFAVMLPVGNPPNAIVFSYGHCQIKDMVKAGLGVNVIGLVIVMVAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 INPLYTLIPVTMCISFAVMLPVGNPPNAIVFSYGHCQIKDMVKAGLGVNVIGLVIVMVAI
              550       560       570       580       590       600

              610       620      
pF1KB3 NTWGVSLFHLDTYPAWARVSNITDQA
       ::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NTWGVSLFHLDTYPAWARVSNITDQA
              610       620      

>>CCDS5786.1 SLC13A1 gene_id:6561|Hs108|chr7              (595 aa)
 initn: 1797 init1: 763 opt: 1405  Z-score: 1667.7  bits: 318.7 E(32554): 1.4e-86
Smith-Waterman score: 1969; 48.7% identity (76.4% similar) in 618 aa overlap (1-617:1-586)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MGLLQGLLRVRKLLLVVCVPLLLLPLPVLHPSSEASCAYVLIVTAVYWVSEAVPLGAAAL
       : ... .:  :..:.:: . :.:::::..  ..:: :::.:.:.:..:..::.::...::
CCDS57 MKFFSYILVYRRFLFVVFTVLVLLPLPIVLHTKEAECAYTLFVVATFWLTEALPLSVTAL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 VPAFLYPFFGVLRSNEVAAEYFKNTTLLLVGVICVAAAVEKWNLHKRIALRMVLMAGAKP
       .:... :.::.. :..::. :::.  :::.::::.:...:::::::::::.::.:.:..:
CCDS57 LPSLMLPMFGIMPSKKVASAYFKDFHLLLIGVICLATSIEKWNLHKRIALKMVMMVGVNP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 GMLLLCFMCCTTLLSMWLSNTSTTAMVMPIVEAVLQELVSAEDEQLVAGNSNTEEAEPIS
       . : : ::  :..::::::::::.::::::.:::.:....:: :          ::  ..
CCDS57 AWLTLGFMSSTAFLSMWLSNTSTAAMVMPIAEAVVQQIINAEAE---------VEATQMT
              130       140       150       160                170 

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 LDVKNSQPSLELIFVNEESNADLTTLMHNENLNGVPSITNPIKTANQHQGKKQHPSQEKP
           ... .::.    .::       ......:     :.:.   :.  :: .   . . 
CCDS57 YFNGSTNHGLEI----DES-------VNGHEINERKEKTKPVPGYNNDTGKISSKVELE-
             180                  190       200       210          

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 QVLTRSPRKQKLNRKYRSHHDQMICKCLSLSISYSATIGGLTTIIGTSTSLIFLEHFNNQ
              ... .  :::... ..  :   : :.::.:::::::: ::::.::: :.::..
CCDS57 -------KNSGMRTKYRTKKGHVTRKLTCLCIAYSSTIGGLTTITGTSTNLIFAEYFNTR
            220       230       240       250       260       270  

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 YPAAEVVNFGTWFLFSFPISLIMLVVSWFWMHWLFLGCNFKETCSLSKKKKTKREQLSEK
       ::  . .:::.:: :::: .::.:..::.:..::::: ::::  . .: : ....  .: 
CCDS57 YPDCRCLNFGSWFTFSFPAALIILLLSWIWLQWLFLGFNFKEMFKCGKTKTVQQKACAEV
            280       290       300       310       320       330  

              370       380       390       400        410         
pF1KB3 RIQEEYEKLGDISYPEMVTGFFFILMTVLWFTREPGFVPGWDSFF-EKKGYRTDATVSVF
        :..::.::: : : :.::  .::.:..:::.:.:::::::...: :  :. ::.::...
CCDS57 -IKQEYQKLGPIRYQEIVTLVLFIIMALLWFSRDPGFVPGWSALFSEYPGFATDSTVALL
             340       350       360       370       380       390 

     420       430       440       450       460       470         
pF1KB3 LGFLLFLIPAKKPCFGKKNDGENQEHSLGTEPIITWKDFQKTMPWEIVILVGGGYALASG
       .:.:.::::::      :.   ..  ..   :.::::.::. :::.:.::::::.:::.:
CCDS57 IGLLFFLIPAKTLT---KTTPTGEIVAFDYSPLITWKEFQSFMPWDIAILVGGGFALADG
             400          410       420       430       440        

     480       490       500       510       520       530         
pF1KB3 SKSSGLSTWIGNQMLSLSSLPPWAVTLLACILVSIVTEFVSNPATITIFLPILCSLSETL
        . :::: ::::..  :.::: : . :.. ..:. .:: .:::::::.:::::  :.:..
CCDS57 CEESGLSKWIGNKLSPLGSLPAWLIILISSLMVTSLTEVASNPATITLFLPILSPLAEAI
      450       460       470       480       490       500        

     540       550       560       570       580       590         
pF1KB3 HINPLYTLIPVTMCISFAVMLPVGNPPNAIVFSYGHCQIKDMVKAGLGVNVIGLVIVMVA
       :.:::: ::: :.: ::: .:::.:::::::::::: .. ::::::::::..:...::..
CCDS57 HVNPLYILIPSTLCTSFAFLLPVANPPNAIVFSYGHLKVIDMVKAGLGVNIVGVAVVMLG
      510       520       530       540       550       560        

     600       610       620      
pF1KB3 INTWGVSLFHLDTYPAWARVSNITDQA
       : :: : .: : :::.::         
CCDS57 ICTWIVPMFDLYTYPSWAPAMSNETMP
      570       580       590     

>>CCDS54098.1 SLC13A2 gene_id:9058|Hs108|chr17            (641 aa)
 initn: 1273 init1: 619 opt: 1310  Z-score: 1554.2  bits: 297.8 E(32554): 3e-80
Smith-Waterman score: 1507; 38.5% identity (68.0% similar) in 676 aa overlap (5-625:6-628)

                10        20        30        40        50         
pF1KB3  MGLLQGLLRVRKLLLVVCVPLLLLPLPVLHPSSEASCAYVLIVTAVYWVSEAVPLGAAA
            :.:   :. :.:  ::.::::::.: ::.:: :::..:. :..: .::.::...:
CCDS54 MATCWQALWAYRSYLIVFFVPILLLPLPILVPSKEAYCAYAIILMALFWCTEALPLAVTA
               10        20        30        40        50        60

      60        70                                                 
pF1KB3 LVPAFLYPFFGVLRSNE-------------------------------------------
       : : .:.:..:.. ..:                                           
CCDS54 LFPLILFPMMGIVDASEIIQRPFPSSFESPGECQSVGMSVTASHNLGGTVGDSRVFPPLS
               70        80        90       100       110       120

               80        90       100       110       120       130
pF1KB3 ------VAAEYFKNTTLLLVGVICVAAAVEKWNLHKRIALRMVLMAGAKPGMLLLCFMCC
             ::.::.:...::. : . :: :::.::::::::::..:..:..:. :.: ::  
CCDS54 HVSTCQVAVEYLKDSNLLFFGGLLVAIAVEHWNLHKRIALRVLLIVGVRPAPLILGFMLV
              130       140       150       160       170       180

              140       150       160       170       180       190
pF1KB3 TTLLSMWLSNTSTTAMVMPIVEAVLQELVSAEDEQLVAGNSNTEEAEPISLDVKNSQPSL
       :..::::.:::.:.::..::..:::..: :..      ..::.::.        ...:..
CCDS54 TAFLSMWISNTATSAMMVPIAHAVLDQLHSSQ------ASSNVEEG--------SNNPTF
              190       200       210             220              

               200       210       220       230       240         
pF1KB3 ELIFVNEES-NADLTTLMHNENLNGVPSITNPIKTANQHQGKKQHPSQEKPQVLTRSPRK
       ::   .: : . ..: : ... :        :. .:.. .:.  : ::.           
CCDS54 EL---QEPSPQKEVTKLDNGQAL--------PVTSASS-EGRA-HLSQK-----------
           230       240               250         260             

     250       260       270       280       290       300         
pF1KB3 QKLNRKYRSHHDQMICKCLSLSISYSATIGGLTTIIGTSTSLIFLEHFNNQYPA-AEVVN
                 : ..  .:.:: . :::.:::..:. ::. .:..  ..:. .:  ..:::
CCDS54 ----------HLHLT-QCMSLCVCYSASIGGIATLTGTAPNLVLQGQINSLFPQNGNVVN
                       270       280       290       300       310 

      310       320       330       340       350       360        
pF1KB3 FGTWFLFSFPISLIMLVVSWFWMHWLFLGCNFKETCSLSKKKKTKREQLSEKRIQEEYEK
       :..:: :.::  .:.:...:.:.. :::: ::... ....: . ...: .   :: :.. 
CCDS54 FASWFSFAFPTMVILLLLAWLWLQILFLGFNFRKNFGIGEKMQ-EQQQAAYCVIQTEHRL
             320       330       340       350        360       370

      370       380       390       400         410         420    
pF1KB3 LGDISYPEMVTGFFFILMTVLWFTREPGFVPGWDS--FFEKKGYR--TDATVSVFLGFLL
       :: ... : . ...:.....:::::::::  :: .  : . ::    .:.::..:.:...
CCDS54 LGPMTFAEKAISILFVILVLLWFTREPGFFLGWGNLAFPNAKGESMVSDGTVAIFIGIIM
              380       390       400       410       420       430

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pF1KB3 FLIPAKKPCFGKKNDGENQEHSLGTEPIITWKDFQKTMPWEIVILVGGGYALASGSKSSG
       :.::.: :  :  .: ::  .  .   .. ::  .. :::.::.:.:::::::.::. ::
CCDS54 FIIPSKFP--GLTQDPENPGKLKAPLGLLDWKTVNQKMPWNIVLLLGGGYALAKGSERSG
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pF1KB3 LSTWIGNQMLSLSSLPPWAVTLLACILVSIVTEFVSNPATITIFLPILCSLSETLHINPL
       :: :.::..  :.:.:  :....  .::.  :: .:: :: ::::::: :..... ..::
CCDS54 LSEWLGNKLTPLQSVPAPAIAIILSLLVATFTECTSNVATTTIFLPILASMAQAICLHPL
      490       500       510       520       530       540        

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pF1KB3 YTLIPVTMCISFAVMLPVGNPPNAIVFSYGHCQIKDMVKAGLGVNVIGLVIVMVAINTWG
       :...: :.  :.: ::::..::::::::.:  .. ::..::. .:.::..:. .:::.::
CCDS54 YVMLPCTLATSLAFMLPVATPPNAIVFSFGDLKVLDMARAGFLLNIIGVLIIALAINSWG
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          610       620                  
pF1KB3 VSLFHLDTYPAWARVSNITDQA            
       . :: : ..:.::. :: : :             
CCDS54 IPLFSLHSFPSWAQ-SNTTAQCLPSLANTTTPSP
      610       620        630       640 

>>CCDS67136.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17          (525 aa)
 initn: 1295 init1: 655 opt: 1185  Z-score: 1406.9  bits: 270.2 E(32554): 4.8e-72
Smith-Waterman score: 1435; 40.1% identity (69.6% similar) in 589 aa overlap (42-622:1-523)

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pF1KB3 KLLLVVCVPLLLLPLPVLHPSSEASCAYVLIVTAVYWVSEAVPLGAAALVPAFLYPFFGV
                                     ...:. .::.   .    ..: .: :.  .
CCDS67                               MASALSYVSKFKSFVILFVTPLLLLPLV-I
                                             10        20          

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pF1KB3 LRSNEVAAEYFKNTTLLLVGVICVAAAVEKWNLHKRIALRMVLMAGAKPGMLLLCFMCCT
       :   .: ..:.:.:..:..: . ::.:::.:::::::::: .: .::::. :.: ::  :
CCDS67 LMPAKVCVQYMKDTNMLFLGGLIVAVAVERWNLHKRIALRTLLWVGAKPARLMLGFMGVT
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pF1KB3 TLLSMWLSNTSTTAMVMPIVEAVLQELVSAEDEQLVAGNSNTEEAEPISLDVKNSQPSLE
       .:::::.:::.::::..:::::.::        :. : .. :: .             ::
CCDS67 ALLSMWISNTATTAMMVPIVEAILQ--------QMEATSAATEAG-------------LE
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pF1KB3 LIFVNEESNADLTTLMHNENLNGVPSITNPIKTANQHQGK-KQHPSQEKPQVLTRSPRKQ
       :.                                   .:: :. :..   ::. ..:   
CCDS67 LV----------------------------------DKGKAKELPGS---QVIFEGPTLG
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pF1KB3 KLNRKYRSHHDQMICKCLSLSISYSATIGGLTTIIGTSTSLIFLEHFNNQYP-AAEVVNF
       . . . :..    .:: ..: : :.:.::: .:. ::. ....: ..:. .: . ..:::
CCDS67 QQEDQERKR----LCKAMTLCICYAASIGGTATLTGTGPNVVLLGQMNELFPDSKDLVNF
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pF1KB3 GTWFLFSFPISLIMLVVSWFWMHWLFLGCNFKET--CSLSKKKKTKREQLSEKRIQEEYE
       ..:: :.::  :.::. .:.:......  :::..  :.: .::.   :. . : .::::.
CCDS67 ASWFAFAFPNMLVMLLFAWLWLQFVYMRFNFKKSWGCGLESKKN---EKAALKVLQEEYR
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pF1KB3 KLGDISYPEMVTGFFFILMTVLWFTREPGFVPGWDSFFEKKG---YRTDATVSVFLGFLL
       ::: .:. :. . . :.:...:::.:.:::.::: .    .:   : .::::..:.. ::
CCDS67 KLGPLSFAEINVLICFFLLVILWFSRDPGFMPGWLTVAWVEGETKYVSDATVAIFVATLL
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pF1KB3 FLIPAKKPCFGKKNDGENQEHS-LGTEPIITWKDFQKTMPWEIVILVGGGYALASGSKSS
       :..:..:: :. ... :..... .   :.. ::  :. .:: ::.:.:::.:::.::..:
CCDS67 FIVPSQKPKFNFRSQTEEERKTPFYPPPLLDWKVTQEKVPWGIVLLLGGGFALAKGSEAS
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pF1KB3 GLSTWIGNQMLSLSSLPPWAVTLLACILVSIVTEFVSNPATITIFLPILCSLSETLHINP
       :::.:.:.::  : ..:: :.::.  .::.. :: .:: :: :.::::. :.:... .::
CCDS67 GLSVWMGKQMEPLHAVPPAAITLILSLLVAVFTECTSNVATTTLFLPIFASMSRSIGLNP
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pF1KB3 LYTLIPVTMCISFAVMLPVGNPPNAIVFSYGHCQIKDMVKAGLGVNVIGLVIVMVAINTW
       :: ..: :.  ::: ::::..:::::::.::: .. ::::.:. .:.::.  :..:.:::
CCDS67 LYIMLPCTLSASFAFMLPVATPPNAIVFTYGHLKVADMVKTGVIMNIIGVFCVFLAVNTW
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           610       620      
pF1KB3 GVSLFHLDTYPAWARVSNITDQA
       : ..: :: .: :: :..:    
CCDS67 GRAIFDLDHFPDWANVTHIET  
          510       520       

>>CCDS67137.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17          (551 aa)
 initn: 1425 init1: 655 opt: 1185  Z-score: 1406.6  bits: 270.2 E(32554): 5e-72
Smith-Waterman score: 1517; 39.4% identity (69.5% similar) in 622 aa overlap (9-622:10-549)

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pF1KB3  MGLLQGLLRVRKLLLVVCVPLLLLPLPVLHPSSEASCAYVLIVTAVYWVSEAVPLGAAA
                . ......  .::::::: .: :.. . ::::.:. :.:: .:..::....
CCDS67 MASALSYVSKFKSFVILFVTPLLLLPLVILMPAKFVRCAYVIILMAIYWCTEVIPLAVTS
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pF1KB3 LVPAFLYPFFGVLRSNEVAAEYFKNTTLLLVGVICVAAAVEKWNLHKRIALRMVLMAGAK
       :.:..:.:.: .: : .: ..:.:.:..:..: . ::.:::.:::::::::: .: .:::
CCDS67 LMPVLLFPLFQILDSRQVCVQYMKDTNMLFLGGLIVAVAVERWNLHKRIALRTLLWVGAK
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pF1KB3 PGMLLLCFMCCTTLLSMWLSNTSTTAMVMPIVEAVLQELVSAEDEQLVAGNSNTEEAEPI
       :.                  ::.::::..:::::.::        :. : .. :: .   
CCDS67 PA-----------------RNTATTAMMVPIVEAILQ--------QMEATSAATEAG---
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pF1KB3 SLDVKNSQPSLELIFVNEESNADLTTLMHNENLNGVPSITNPIKTANQHQGK-KQHPSQE
                 :::.                                   .:: :. :.. 
CCDS67 ----------LELV----------------------------------DKGKAKELPGS-
                                                        160        

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB3 KPQVLTRSPRKQKLNRKYRSHHDQMICKCLSLSISYSATIGGLTTIIGTSTSLIFLEHFN
         ::. ..:   . . . :..    .:: ..: : :.:.::: .:. ::. ....: ..:
CCDS67 --QVIFEGPTLGQQEDQERKR----LCKAMTLCICYAASIGGTATLTGTGPNVVLLGQMN
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pF1KB3 NQYP-AAEVVNFGTWFLFSFPISLIMLVVSWFWMHWLFLGCNFKET--CSLSKKKKTKRE
       . .: . ..:::..:: :.::  :.::. .:.:......  :::..  :.: .::.   :
CCDS67 ELFPDSKDLVNFASWFAFAFPNMLVMLLFAWLWLQFVYMRFNFKKSWGCGLESKKN---E
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pF1KB3 QLSEKRIQEEYEKLGDISYPEMVTGFFFILMTVLWFTREPGFVPGWDSFFEKKG---YRT
       . . : .::::.::: .:. :. . . :.:...:::.:.:::.::: .    .:   : .
CCDS67 KAALKVLQEEYRKLGPLSFAEINVLICFFLLVILWFSRDPGFMPGWLTVAWVEGETKYVS
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pF1KB3 DATVSVFLGFLLFLIPAKKPCFGKKNDGENQEHS-LGTEPIITWKDFQKTMPWEIVILVG
       ::::..:.. :::..:..:: :. ... :..... .   :.. ::  :. .:: ::.:.:
CCDS67 DATVAIFVATLLFIVPSQKPKFNFRSQTEEERKTPFYPPPLLDWKVTQEKVPWGIVLLLG
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pF1KB3 GGYALASGSKSSGLSTWIGNQMLSLSSLPPWAVTLLACILVSIVTEFVSNPATITIFLPI
       ::.:::.::..::::.:.:.::  : ..:: :.::.  .::.. :: .:: :: :.::::
CCDS67 GGFALAKGSEASGLSVWMGKQMEPLHAVPPAAITLILSLLVAVFTECTSNVATTTLFLPI
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pF1KB3 LCSLSETLHINPLYTLIPVTMCISFAVMLPVGNPPNAIVFSYGHCQIKDMVKAGLGVNVI
       . :.:... .:::: ..: :.  ::: ::::..:::::::.::: .. ::::.:. .:.:
CCDS67 FASMSRSIGLNPLYIMLPCTLSASFAFMLPVATPPNAIVFTYGHLKVADMVKTGVIMNII
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pF1KB3 GLVIVMVAINTWGVSLFHLDTYPAWARVSNITDQA
       :.  :..:.:::: ..: :: .: :: :..:    
CCDS67 GVFCVFLAVNTWGRAIFDLDHFPDWANVTHIET  
      520       530       540       550   

>>CCDS11079.1 SLC13A5 gene_id:284111|Hs108|chr17          (568 aa)
 initn: 1524 init1: 655 opt: 1185  Z-score: 1406.4  bits: 270.2 E(32554): 5.1e-72
Smith-Waterman score: 1630; 41.2% identity (71.7% similar) in 622 aa overlap (9-622:10-566)

                10        20        30        40        50         
pF1KB3  MGLLQGLLRVRKLLLVVCVPLLLLPLPVLHPSSEASCAYVLIVTAVYWVSEAVPLGAAA
                . ......  .::::::: .: :.. . ::::.:. :.:: .:..::....
CCDS11 MASALSYVSKFKSFVILFVTPLLLLPLVILMPAKFVRCAYVIILMAIYWCTEVIPLAVTS
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB3 LVPAFLYPFFGVLRSNEVAAEYFKNTTLLLVGVICVAAAVEKWNLHKRIALRMVLMAGAK
       :.:..:.:.: .: : .: ..:.:.:..:..: . ::.:::.:::::::::: .: .:::
CCDS11 LMPVLLFPLFQILDSRQVCVQYMKDTNMLFLGGLIVAVAVERWNLHKRIALRTLLWVGAK
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB3 PGMLLLCFMCCTTLLSMWLSNTSTTAMVMPIVEAVLQELVSAEDEQLVAGNSNTEEAEPI
       :. :.: ::  :.:::::.:::.::::..:::::.::        :. : .. :: .   
CCDS11 PARLMLGFMGVTALLSMWISNTATTAMMVPIVEAILQ--------QMEATSAATEAG---
              130       140       150               160            

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB3 SLDVKNSQPSLELIFVNEESNADLTTLMHNENLNGVPSITNPIKTANQHQGK-KQHPSQE
                 :::.                                   .:: :. :.. 
CCDS11 ----------LELV----------------------------------DKGKAKELPGS-
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pF1KB3 KPQVLTRSPRKQKLNRKYRSHHDQMICKCLSLSISYSATIGGLTTIIGTSTSLIFLEHFN
         ::. ..:   . . . :..    .:: ..: : :.:.::: .:. ::. ....: ..:
CCDS11 --QVIFEGPTLGQQEDQERKR----LCKAMTLCICYAASIGGTATLTGTGPNVVLLGQMN
            190       200           210       220       230        

      300        310       320       330       340         350     
pF1KB3 NQYP-AAEVVNFGTWFLFSFPISLIMLVVSWFWMHWLFLGCNFKET--CSLSKKKKTKRE
       . .: . ..:::..:: :.::  :.::. .:.:......  :::..  :.: .::.   :
CCDS11 ELFPDSKDLVNFASWFAFAFPNMLVMLLFAWLWLQFVYMRFNFKKSWGCGLESKKN---E
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pF1KB3 QLSEKRIQEEYEKLGDISYPEMVTGFFFILMTVLWFTREPGFVPGWDSFFEKKG---YRT
       . . : .::::.::: .:. :. . . :.:...:::.:.:::.::: .    .:   : .
CCDS11 KAALKVLQEEYRKLGPLSFAEINVLICFFLLVILWFSRDPGFMPGWLTVAWVEGETKYVS
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pF1KB3 DATVSVFLGFLLFLIPAKKPCFGKKNDGENQEHS-LGTEPIITWKDFQKTMPWEIVILVG
       ::::..:.. :::..:..:: :. ... :..... .   :.. ::  :. .:: ::.:.:
CCDS11 DATVAIFVATLLFIVPSQKPKFNFRSQTEEERKTPFYPPPLLDWKVTQEKVPWGIVLLLG
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pF1KB3 GGYALASGSKSSGLSTWIGNQMLSLSSLPPWAVTLLACILVSIVTEFVSNPATITIFLPI
       ::.:::.::..::::.:.:.::  : ..:: :.::.  .::.. :: .:: :: :.::::
CCDS11 GGFALAKGSEASGLSVWMGKQMEPLHAVPPAAITLILSLLVAVFTECTSNVATTTLFLPI
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pF1KB3 LCSLSETLHINPLYTLIPVTMCISFAVMLPVGNPPNAIVFSYGHCQIKDMVKAGLGVNVI
       . :.:... .:::: ..: :.  ::: ::::..:::::::.::: .. ::::.:. .:.:
CCDS11 FASMSRSIGLNPLYIMLPCTLSASFAFMLPVATPPNAIVFTYGHLKVADMVKTGVIMNII
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pF1KB3 GLVIVMVAINTWGVSLFHLDTYPAWARVSNITDQA
       :.  :..:.:::: ..: :: .: :: :..:    
CCDS11 GVFCVFLAVNTWGRAIFDLDHFPDWANVTHIET  
         540       550       560          

>>CCDS11231.1 SLC13A2 gene_id:9058|Hs108|chr17            (592 aa)
 initn: 1513 init1: 619 opt: 1126  Z-score: 1336.0  bits: 257.3 E(32554): 4.3e-68
Smith-Waterman score: 1615; 41.5% identity (73.4% similar) in 627 aa overlap (5-625:6-579)

                10        20        30        40        50         
pF1KB3  MGLLQGLLRVRKLLLVVCVPLLLLPLPVLHPSSEASCAYVLIVTAVYWVSEAVPLGAAA
            :.:   :. :.:  ::.::::::.: ::.:: :::..:. :..: .::.::...:
CCDS11 MATCWQALWAYRSYLIVFFVPILLLPLPILVPSKEAYCAYAIILMALFWCTEALPLAVTA
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB3 LVPAFLYPFFGVLRSNEVAAEYFKNTTLLLVGVICVAAAVEKWNLHKRIALRMVLMAGAK
       : : .:.:..:.. ..:::.::.:...::. : . :: :::.::::::::::..:..:..
CCDS11 LFPLILFPMMGIVDASEVAVEYLKDSNLLFFGGLLVAIAVEHWNLHKRIALRVLLIVGVR
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pF1KB3 PGMLLLCFMCCTTLLSMWLSNTSTTAMVMPIVEAVLQELVSAEDEQLVAGNSNTEEAEPI
       :. :.: ::  :..::::.:::.:.::..::..:::..: :..      ..::.::.   
CCDS11 PAPLILGFMLVTAFLSMWISNTATSAMMVPIAHAVLDQLHSSQ------ASSNVEEG---
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pF1KB3 SLDVKNSQPSLELIFVNEES-NADLTTLMHNENLNGVPSITNPIKTANQHQGKKQHPSQE
            ...:..::   .: : . ..: : ... :        :. .:.. .:.  : ::.
CCDS11 -----SNNPTFEL---QEPSPQKEVTKLDNGQAL--------PVTSASS-EGRA-HLSQK
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pF1KB3 KPQVLTRSPRKQKLNRKYRSHHDQMICKCLSLSISYSATIGGLTTIIGTSTSLIFLEHFN
                            : ..  .:.:: . :::.:::..:. ::. .:..  ..:
CCDS11 ---------------------HLHLT-QCMSLCVCYSASIGGIATLTGTAPNLVLQGQIN
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pF1KB3 NQYPA-AEVVNFGTWFLFSFPISLIMLVVSWFWMHWLFLGCNFKETCSLSKKKKTKREQL
       . .:  ..::::..:: :.::  .:.:...:.:.. :::: ::... ....: . ...: 
CCDS11 SLFPQNGNVVNFASWFSFAFPTMVILLLLAWLWLQILFLGFNFRKNFGIGEKMQ-EQQQA
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pF1KB3 SEKRIQEEYEKLGDISYPEMVTGFFFILMTVLWFTREPGFVPGWDS--FFEKKGYR--TD
       .   :: :.. :: ... : . ...:.....:::::::::  :: .  : . ::    .:
CCDS11 AYCVIQTEHRLLGPMTFAEKAISILFVILVLLWFTREPGFFLGWGNLAFPNAKGESMVSD
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pF1KB3 ATVSVFLGFLLFLIPAKKPCFGKKNDGENQEHSLGTEPIITWKDFQKTMPWEIVILVGGG
       .::..:.:...:.::.: :  :  .: ::  .  .   .. ::  .. :::.::.:.:::
CCDS11 GTVAIFIGIIMFIIPSKFP--GLTQDPENPGKLKAPLGLLDWKTVNQKMPWNIVLLLGGG
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pF1KB3 YALASGSKSSGLSTWIGNQMLSLSSLPPWAVTLLACILVSIVTEFVSNPATITIFLPILC
       ::::.::. :::: :.::..  :.:.:  :....  .::.  :: .:: :: ::::::: 
CCDS11 YALAKGSERSGLSEWLGNKLTPLQSVPAPAIAIILSLLVATFTECTSNVATTTIFLPILA
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pF1KB3 SLSETLHINPLYTLIPVTMCISFAVMLPVGNPPNAIVFSYGHCQIKDMVKAGLGVNVIGL
       :..... ..:::...: :.  :.: ::::..::::::::.:  .. ::..::. .:.::.
CCDS11 SMAQAICLHPLYVMLPCTLATSLAFMLPVATPPNAIVFSFGDLKVLDMARAGFLLNIIGV
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pF1KB3 VIVMVAINTWGVSLFHLDTYPAWARVSNITDQA            
       .:. .:::.::. :: : ..:.::. :: : :             
CCDS11 LIIALAINSWGIPLFSLHSFPSWAQ-SNTTAQCLPSLANTTTPSP
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>>CCDS42886.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20           (555 aa)
 initn: 1405 init1: 623 opt: 1055  Z-score: 1251.9  bits: 241.6 E(32554): 2.1e-63
Smith-Waterman score: 1427; 38.7% identity (72.6% similar) in 581 aa overlap (45-622:2-538)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KB3 LVVCVPLLLLPLPVLHPSSEASCAYVLIVTAVYWVSEAVPLGAAALVPAFLYPFFGVLRS
                                     :::: .::.::...::.:  :.::.:.: :
CCDS42                              MAVYWCTEALPLSVTALLPIVLFPFMGILPS
                                            10        20        30 

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pF1KB3 NEVAAEYFKNTTLLLVGVICVAAAVEKWNLHKRIALRMVLMAGAKPGMLLLCFMCCTTLL
       :.:  .:: .:..:... . .:.:.:.::::.::::......:..:. :.: .:  :..:
CCDS42 NKVCPQYFLDTNFLFLSGLIMASAIEEWNLHRRIALKILMLVGVQPARLILGMMVTTSFL
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pF1KB3 SMWLSNTSTTAMVMPIVEAVLQELVSAEDEQLVAGNSNTEEAEPISLDVKNSQPSLELIF
       :::::::..:::..::..:.:. : . .. .                    ..:: :   
CCDS42 SMWLSNTASTAMMLPIANAILKSLFGQKEVR--------------------KDPSQE---
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pF1KB3 VNEESNADLTTLMHNENLNGVPSITNPIKTANQHQGKKQHPSQ-EKPQVLTRSPRKQKLN
        .::..: .         ::. .. . ..   . ..: .::.. : :  :  . ::.   
CCDS42 -SEENTAAVRR-------NGLHTVPTEMQFLASTEAK-DHPGETEVPLDLPADSRKED--
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pF1KB3 RKYRSHHDQMICKCLSLSISYSATIGGLTTIIGTSTSLIFLEHFNNQYPAAEVVNFGTWF
        .:: .    : : . .:: :::.::: .:. ::. .::.: .... .:  .:::::.::
CCDS42 -EYRRN----IWKGFLISIPYSASIGGTATLTGTAPNLILLGQLKSFFPQCDVVNFGSWF
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pF1KB3 LFSFPISLIMLVVSWFWMHWLFLGCNFKETCSLSKKKKTKREQLSEKRIQEEYEKLGDIS
       .:.::. :..:...:.:. .:. : .:.   . ... .:. :. ..  :.:::..:: :.
CCDS42 IFAFPLMLLFLLAGWLWISFLYGGLSFRGWRKNKSEIRTNAEDRARAVIREEYQNLGPIK
            240       250       260       270       280       290  

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pF1KB3 YPEMVTGFFFILMTVLWFTREPGFVPGWDSFFEKKGYRTDATVSVFLGFLLFLIPAKKPC
       . :... ..: ....: :::.: :.::: :.:.  :. .::...: .  .::..:...: 
CCDS42 FAEQAVFILFCMFAILLFTRDPKFIPGWASLFNP-GFLSDAVTGVAIVTILFFFPSQRPS
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pF1KB3 FGKKND--GENQEHSLGTEPIITWKDFQKTMPWEIVILVGGGYALASGSKSSGLSTWIGN
       .    :  . : :    :::..:::  :.:.::.:..:.:::.:.:.: . ::::.:::.
CCDS42 LKWWFDFKAPNTE----TEPLLTWKKAQETVPWNIILLLGGGFAMAKGCEESGLSVWIGG
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pF1KB3 QMLSLSSLPPWAVTLLACILVSIVTEFVSNPATITIFLPILCSLSETLHINPLYTLIPVT
       :.  : ..::  ..::  ..... :::.:: ::: ::::.:  :.  :...::: .:: :
CCDS42 QLHPLENVPPALAVLLITVVIAFFTEFASNTATIIIFLPVLAELAIRLRVHPLYLMIPGT
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pF1KB3 MCISFAVMLPVGNPPNAIVFSYGHCQIKDMVKAGLGVNVIGLVIVMVAINTWGVSLFHLD
       .  ::: ::::..:::.:.:. ::  .::::..:: .:..:.... .:.:::. ..:.: 
CCDS42 VGCSFAFMLPVSTPPNSIAFASGHLLVKDMVRTGLLMNLMGVLLLSLAMNTWAQTIFQLG
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pF1KB3 TYPAWARVSNITDQA             
       :.: :: . ..                 
CCDS42 TFPDWADMYSVNVTALPPTLANDTFRTL
       530       540       550     

>>CCDS13400.1 SLC13A3 gene_id:64849|Hs108|chr20           (602 aa)
 initn: 1489 init1: 623 opt: 1055  Z-score: 1251.4  bits: 241.7 E(32554): 2.2e-63
Smith-Waterman score: 1511; 38.7% identity (72.4% similar) in 615 aa overlap (11-622:15-585)

                   10        20        30        40        50      
pF1KB3     MGLLQGLLRVRKLLLVVCVPLLLLPLPVLHPSSEASCAYVLIVTAVYWVSEAVPLG
                     :.::... .:: :::.    : .:. : .:... :::: .::.::.
CCDS13 MAALAAAAKKVWSARRLLVLLFTPLALLPVVFALPPKEGRCLFVILLMAVYWCTEALPLS
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB3 AAALVPAFLYPFFGVLRSNEVAAEYFKNTTLLLVGVICVAAAVEKWNLHKRIALRMVLMA
       ..::.:  :.::.:.: ::.:  .:: .:..:... . .:.:.:.::::.::::......
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         .  :     :: :    .::..: .         ::. .. . ..   . ..: .::.
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CCDS13 ETEVPLDLPADSRKED---EYRRN----IWKGFLISIPYSASIGGTATLTGTAPNLILLG
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       .... .:  .:::::.::.:.::. :..:...:.:. .:. : .:.   . ... .:. :
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       . ..  :.:::..:: :.. :... ..: ....: :::.: :.::: :.:.  :. .::.
CCDS13 DRARAVIREEYQNLGPIKFAEQAVFILFCMFAILLFTRDPKFIPGWASLFNP-GFLSDAV
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       ..: .  .::..:...: .    :  . : :    :::..:::  :.:.::.:..:.:::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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