seq1 = pF1KE6328.tfa, 1320 bp
seq2 = pF1KE6328/gi568815581r_31195012.tfa (gi568815581r:31195012_31396331), 201320 bp

>pF1KE6328 1320
>gi568815581r:31195012_31396331 (Chr17)

(complement)

1-1320  (100001-101320)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAATATCAGATATTGAAAATGTCTCTCTGCCTGTTCATCCTTCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAATATCAGATATTGAAAATGTCTCTCTGCCTGTTCATCCTTCTGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTCACACCTGGTATTTTATGCATTTGTCCTCTCCAATGTATATGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTCACACCTGGTATTTTATGCATTTGTCCTCTCCAATGTATATGCACAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAGGCACAGGCATGTGGACTGTTCAGGCAGAAACTTGTCTACATTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAGGCACAGGCATGTGGACTGTTCAGGCAGAAACTTGTCTACATTACCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCTGGACTGCAAGAGAATATTATACATTTAAACCTGTCTTATAACCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCTGGACTGCAAGAGAATATTATACATTTAAACCTGTCTTATAACCACTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TACTGATCTGCATAACCAGTTAACCCAATATACCAATCTGAGGACCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TACTGATCTGCATAACCAGTTAACCCAATATACCAATCTGAGGACCCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACATTTCAAACAACAGGCTTGAAAGCCTGCCTGCTCACTTACCTCGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACATTTCAAACAACAGGCTTGAAAGCCTGCCTGCTCACTTACCTCGGTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGTGGAACATGTCTGCTGCTAACAACAACATTAAACTTCTTGACAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGTGGAACATGTCTGCTGCTAACAACAACATTAAACTTCTTGACAAATC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGATACTGCTTATCAGTGGAATCTTAAATATCTGGATGTTTCTAAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGATACTGCTTATCAGTGGAATCTTAAATATCTGGATGTTTCTAAGAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCTGGAAAAGGTTGTCCTCATTAAAAATACACTAAGAAGTCTCGAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGCTGGAAAAGGTTGTCCTCATTAAAAATACACTAAGAAGTCTCGAGGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTCAACCTCAGTAGTAACAAACTTTGGACAGTTCCAACCAACATGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTCAACCTCAGTAGTAACAAACTTTGGACAGTTCCAACCAACATGCCCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAAACTACATATCGTGGACCTGTCTAATAATTCTTTGACACAAATTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CAAACTACATATCGTGGACCTGTCTAATAATTCTTTGACACAAATTCTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CAGGTACATTAATAAACCTGACAAATCTCACACATCTTTACCTGCACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CAGGTACATTAATAAACCTGACAAATCTCACACATCTTTACCTGCACAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AATAAGTTCACATTCATTCCAGACCAATCTTTTGACCAACTCTTTCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AATAAGTTCACATTCATTCCAGACCAATCTTTTGACCAACTCTTTCAGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCAAGAGATAACCCTTTACAATAACAGGTGGTCATGTGACCACAAACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCAAGAGATAACCCTTTACAATAACAGGTGGTCATGTGACCACAAACAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACATTACTTACTTACTGAAGTGGATGATGGAAACAAAAGCCCATGTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACATTACTTACTTACTGAAGTGGATGATGGAAACAAAAGCCCATGTGATA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGGACTCCATGTTCTACCCAAATATCATCTTTAAAGGAACATAACATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGGACTCCATGTTCTACCCAAATATCATCTTTAAAGGAACATAACATGTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TCCCACACCTTCTGGATTTACCTCAAGCTTATTCACTGTAAGTGGGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TCCCACACCTTCTGGATTTACCTCAAGCTTATTCACTGTAAGTGGGATGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGACAGTGGACACCATTAACTCTCTGAGTGTGGTAACTCAACCCAAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGACAGTGGACACCATTAACTCTCTGAGTGTGGTAACTCAACCCAAAGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ACCAAAATACCCAAACAATATCGAACAAAGGAAACAACGTTTGGTGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ACCAAAATACCCAAACAATATCGAACAAAGGAAACAACGTTTGGTGCCAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TCTAAGCAAAGACACCACCTTTACTAGCACTGATAAGGCTTTTGTGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TCTAAGCAAAGACACCACCTTTACTAGCACTGATAAGGCTTTTGTGCCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ATCCAGAAGATACATCCACAGAGACTATCAATTCACATGAAGCAGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ATCCAGAAGATACATCCACAGAGACTATCAATTCACATGAAGCAGCAGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GCAACTCTAACTATTCATCTCCAAGATGGAATGGTCACAAACACAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GCAACTCTAACTATTCATCTCCAAGATGGAATGGTCACAAACACAAGCCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CACTAGCTCAACAAAATCATCCCCAACACCCATGACCCTAAGTATCACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CACTAGCTCAACAAAATCATCCCCAACACCCATGACCCTAAGTATCACTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GTGGCATGCCAAATAATTTCTCTGAAATGCCTCAACAAAGCACAACCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GTGGCATGCCAAATAATTTCTCTGAAATGCCTCAACAAAGCACAACCCTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AACTTATGGAGGGAAGAGACAACCACAAATGTAAAGACTCCATTACCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AACTTATGGAGGGAAGAGACAACCACAAATGTAAAGACTCCATTACCTTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TGTGGCAAATGCTTGGAAAGTAAATGCTTCATTTCTCTTATTGCTCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TGTGGCAAATGCTTGGAAAGTAAATGCTTCATTTCTCTTATTGCTCAATG

   1300     .    :    .    :
   1301 TTGTGGTCATGCTGGCTGTC
        ||||||||||||||||||||
 101301 TTGTGGTCATGCTGGCTGTC