Result of FASTA (omim) for pF1KB3124
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3124, 556 aa
  1>>>pF1KB3124 556 - 556 aa - 556 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8450+/-0.000365; mu= 16.2630+/- 0.023
 mean_var=75.7812+/-15.258, 0's: 0 Z-trim(113.8): 28  B-trim: 382 in 1/54
 Lambda= 0.147331
 statistics sampled from 23348 (23376) to 23348 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.641), E-opt: 0.2 (0.274), width:  16
 Scan time:  8.900

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001439 (OMIM: 194070,300168,312870) glypican-4  ( 556) 3749 806.5       0
NP_005699 (OMIM: 258315,604404) glypican-6 precurs ( 555) 2422 524.4 3.6e-148
XP_016875787 (OMIM: 258315,604404) PREDICTED: glyp ( 485) 2219 481.3 3.1e-135
XP_016875789 (OMIM: 258315,604404) PREDICTED: glyp ( 485) 2219 481.3 3.1e-135
XP_011519346 (OMIM: 258315,604404) PREDICTED: glyp ( 485) 2219 481.3 3.1e-135
XP_016875788 (OMIM: 258315,604404) PREDICTED: glyp ( 485) 2219 481.3 3.1e-135
XP_016875790 (OMIM: 258315,604404) PREDICTED: glyp ( 433) 2013 437.4 4.2e-122
NP_002072 (OMIM: 600395) glypican-1 precursor [Hom ( 558) 1158 255.8 2.7e-67
XP_016875791 (OMIM: 258315,604404) PREDICTED: glyp ( 324) 1100 243.3 8.7e-64
XP_011509278 (OMIM: 600395) PREDICTED: glypican-1  ( 486)  932 207.7 6.9e-53
XP_016875924 (OMIM: 602446) PREDICTED: glypican-5  ( 565)  712 161.0 9.4e-39
NP_004457 (OMIM: 602446) glypican-5 precursor [Hom ( 572)  712 161.0 9.5e-39
XP_011519356 (OMIM: 602446) PREDICTED: glypican-5  ( 480)  705 159.4 2.3e-38
XP_011519362 (OMIM: 602446) PREDICTED: glypican-5  ( 443)  658 149.4 2.2e-35
XP_016875925 (OMIM: 602446) PREDICTED: glypican-5  ( 444)  658 149.4 2.2e-35
XP_011519359 (OMIM: 602446) PREDICTED: glypican-5  ( 444)  658 149.4 2.2e-35
XP_011519360 (OMIM: 602446) PREDICTED: glypican-5  ( 444)  658 149.4 2.2e-35
XP_016875926 (OMIM: 602446) PREDICTED: glypican-5  ( 444)  658 149.4 2.2e-35
XP_011519361 (OMIM: 602446) PREDICTED: glypican-5  ( 444)  658 149.4 2.2e-35
XP_011519358 (OMIM: 602446) PREDICTED: glypican-5  ( 444)  658 149.4 2.2e-35
XP_011519357 (OMIM: 602446) PREDICTED: glypican-5  ( 444)  658 149.4 2.2e-35
NP_004475 (OMIM: 194070,300037,312870) glypican-3  ( 580)  591 135.3 5.3e-31
XP_016884902 (OMIM: 194070,300037,312870) PREDICTE ( 486)  560 128.6 4.4e-29
NP_001158089 (OMIM: 194070,300037,312870) glypican ( 603)  523 120.8 1.2e-26
NP_001158091 (OMIM: 194070,300037,312870) glypican ( 526)  456 106.5 2.1e-22
NP_001158090 (OMIM: 194070,300037,312870) glypican ( 564)  453 105.9 3.5e-22


>>NP_001439 (OMIM: 194070,300168,312870) glypican-4 prec  (556 aa)
 initn: 3749 init1: 3749 opt: 3749  Z-score: 4305.6  bits: 806.5 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3749; 100.0% identity (100.0% similar) in 556 aa overlap (1-556:1-556)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MARFGLPALLCTLAVLSAALLAAELKSKSCSEVRRLYVSKGFNKNDAPLHEINGDHLKIC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MARFGLPALLCTLAVLSAALLAAELKSKSCSEVRRLYVSKGFNKNDAPLHEINGDHLKIC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 PQGSTCCSQEMEEKYSLQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFASRYKKFDEFFKELLENAEKSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PQGSTCCSQEMEEKYSLQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFASRYKKFDEFFKELLENAEKSL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 NDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEMLNDFWARLLERMFRLVNSQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEMLNDFWARLLERMFRLVNSQY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 HFTDEYLECVSKYTEQLKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAARTFAQGLAVAGDVVSKVSVVNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HFTDEYLECVSKYTEQLKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAARTFAQGLAVAGDVVSKVSVVNP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 TAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLANQGDLDFEWNNFIDAMLMVAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLANQGDLDFEWNNFIDAMLMVAE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 RLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDNSVQVSQKVFQGCGPPKPLPAGRISRSISESA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDNSVQVSQKVFQGCGPPKPLPAGRISRSISESA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 FSARFRPHHPEERPTTAAGTSLDRLVTDVKEKLKQAKKFWSSLPSNVCNDERMAAGNGNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FSARFRPHHPEERPTTAAGTSLDRLVTDVKEKLKQAKKFWSSLPSNVCNDERMAAGNGNE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 DDCWNGKGKSRYLFAVTGNGLANQGNNPEVQVDTSKPDILILRQIMALRVMTSKMKNAYN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DDCWNGKGKSRYLFAVTGNGLANQGNNPEVQVDTSKPDILILRQIMALRVMTSKMKNAYN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 GNDVDFFDISDESSGEGSGSGCEYQQCPSEFDYNATDHAGKSANEKADSAGVRPGAQAYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GNDVDFFDISDESSGEGSGSGCEYQQCPSEFDYNATDHAGKSANEKADSAGVRPGAQAYL
              490       500       510       520       530       540

              550      
pF1KB3 LTVFCILFLVMQREWR
       ::::::::::::::::
NP_001 LTVFCILFLVMQREWR
              550      

>>NP_005699 (OMIM: 258315,604404) glypican-6 precursor [  (555 aa)
 initn: 2398 init1: 1676 opt: 2422  Z-score: 2781.2  bits: 524.4 E(85289): 3.6e-148
Smith-Waterman score: 2422; 64.8% identity (85.6% similar) in 549 aa overlap (6-553:10-552)

                   10        20        30        40        50      
pF1KB3     MARFGLPALLCTLAVLSAALLAAELKSKSCSEVRRLYVSKGFNKNDAPLHEINGDH
                :: ::  :  : :.   :..:..::.:::. : .:::.  : : .:: :.:
NP_005 MPSWIGAVILP-LLGLLLSLPAG---ADVKARSCGEVRQAYGAKGFSLADIPYQEIAGEH
               10         20           30        40        50      

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB3 LKICPQGSTCCSQEMEEKYSLQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFASRYKKFDEFFKELLENA
       :.::::  :::. :::.: : ::: .:...: :  . ....:.::.:::::::.::::::
NP_005 LRICPQEYTCCTTEMEDKLSQQSKLEFENLVEETSHFVRTTFVSRHKKFDEFFRELLENA
         60        70        80        90       100       110      

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB3 EKSLNDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEMLNDFWARLLERMFRLV
       :::::::::.::: :::::::.:.:::.::::::. :::::::::::::::::::::.:.
NP_005 EKSLNDMFVRTYGMLYMQNSEVFQDLFTELKRYYTGGNVNLEEMLNDFWARLLERMFQLI
        120       130       140       150       160       170      

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB3 NSQYHFTDEYLECVSKYTEQLKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAARTFAQGLAVAGDVVSKVS
       : ::::...:::::::::.:::::::::::::.::::::.:::::.:::.:. .:...::
NP_005 NPQYHFSEDYLECVSKYTDQLKPFGDVPRKLKIQVTRAFIAARTFVQGLTVGREVANRVS
        180       190       200       210       220       230      

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB3 VVNPTAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLANQGDLDFEWNNFIDAML
        :.::  : .::.::.:: .:::: ::.:: ::: :.:.::::::.::: ::: ::::::
NP_005 KVSPTPGCIRALMKMLYCPYCRGLPTVRPCNNYCLNVMKGCLANQADLDTEWNLFIDAML
        240       250       260       270       280       290      

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB3 MVAERLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDNSVQVSQKVFQGCGPPKPLPAGRISRSI
       .:::::::::::::::::::::::.::::::.::.::: ::::::: ::: :: : .:: 
NP_005 LVAERLEGPFNIESVMDPIDVKISEAIMNMQENSMQVSAKVFQGCGQPKPAPALRSARSA
        300       310       320       330       340       350      

        360       370       380       390       400       410      
pF1KB3 SESAFSARFRPHHPEERPTTAAGTSLDRLVTDVKEKLKQAKKFWSSLPSNVCNDERMAAG
        :. :..::::..:::::::::::::::::::.::::: .:: ::.:: ..:.:: ..::
NP_005 PEN-FNTRFRPYNPEERPTTAAGTSLDRLVTDIKEKLKLSKKVWSALPYTICKDESVTAG
         360       370       380       390       400       410     

        420       430       440       450       460       470      
pF1KB3 NGNEDDCWNGKGKSRYLFAVTGNGLANQGNNPEVQVDTSKPDILILRQIMALRVMTSKMK
       ..::..::::..:.:::  . ..::.:: :::::.:: ..:: .: .:::::::::.:.:
NP_005 TSNEEECWNGHSKARYLPEIMNDGLTNQINNPEVDVDITRPDTFIRQQIMALRVMTNKLK
         420       430       440       450       460       470     

        480       490       500       510       520        530     
pF1KB3 NAYNGNDVDFFDISDESSGEGSGSGCEYQQCPSEFDYNATDHAGKSANEK-ADSAGVRPG
       ::::::::.: : :::::: ::::::  . ::.::.. .:.  . . ... .::.... :
NP_005 NAYNGNDVNFQDTSDESSGSGSGSGCMDDVCPTEFEFVTTEAPAVDPDRREVDSSAAQRG
         480       490       500       510       520       530     

         540       550      
pF1KB3 AQAYLLTVFCILFLVMQREWR
        .    .. ::. :..::   
NP_005 HSLLSWSLTCIV-LALQRLCR
         540        550     

>>XP_016875787 (OMIM: 258315,604404) PREDICTED: glypican  (485 aa)
 initn: 2198 init1: 1476 opt: 2219  Z-score: 2548.9  bits: 481.3 E(85289): 3.1e-135
Smith-Waterman score: 2219; 66.7% identity (87.6% similar) in 484 aa overlap (71-553:1-482)

               50        60        70        80        90       100
pF1KB3 GFNKNDAPLHEINGDHLKICPQGSTCCSQEMEEKYSLQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFAS
                                     ::.: : ::: .:...: :  . ....:.:
XP_016                               MEDKLSQQSKLEFENLVEETSHFVRTTFVS
                                             10        20        30

              110       120       130       140       150       160
pF1KB3 RYKKFDEFFKELLENAEKSLNDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEM
       :.:::::::.:::::::::::::::.::: :::::::.:.:::.::::::. ::::::::
XP_016 RHKKFDEFFRELLENAEKSLNDMFVRTYGMLYMQNSEVFQDLFTELKRYYTGGNVNLEEM
               40        50        60        70        80        90

              170       180       190       200       210       220
pF1KB3 LNDFWARLLERMFRLVNSQYHFTDEYLECVSKYTEQLKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAART
       :::::::::::::.:.: ::::...:::::::::.:::::::::::::.::::::.::::
XP_016 LNDFWARLLERMFQLINPQYHFSEDYLECVSKYTDQLKPFGDVPRKLKIQVTRAFIAART
              100       110       120       130       140       150

              230       240       250       260       270       280
pF1KB3 FAQGLAVAGDVVSKVSVVNPTAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLAN
       :.:::.:. .:...:: :.::  : .::.::.:: .:::: ::.:: ::: :.:.:::::
XP_016 FVQGLTVGREVANRVSKVSPTPGCIRALMKMLYCPYCRGLPTVRPCNNYCLNVMKGCLAN
              160       170       180       190       200       210

              290       300       310       320       330       340
pF1KB3 QGDLDFEWNNFIDAMLMVAERLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDNSVQVSQKVFQG
       :.::: ::: ::::::.:::::::::::::::::::::::.::::::.::.::: :::::
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            100       110       120       130       140       150  
pF1KB3 HLQAVFASRYKKFDEFFKELLENAEKSLNDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVV
                                     :::.::: :::::::.:.:::.::::::. 
XP_016                               MFVRTYGMLYMQNSEVFQDLFTELKRYYTG
                                             10        20        30

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB3 GNVNLEEMLNDFWARLLERMFRLVNSQYHFTDEYLECVSKYTEQLKPFGDVPRKLKLQVT
       :::::::::::::::::::::.:.: ::::...:::::::::.:::::::::::::.:::
XP_016 GNVNLEEMLNDFWARLLERMFQLINPQYHFSEDYLECVSKYTDQLKPFGDVPRKLKIQVT
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pF1KB3 RAFVAARTFAQGLAVAGDVVSKVSVVNPTAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSN
       :::.:::::.:::.:. .:...:: :.::  : .::.::.:: .:::: ::.:: ::: :
XP_016 RAFIAARTFVQGLTVGREVANRVSKVSPTPGCIRALMKMLYCPYCRGLPTVRPCNNYCLN
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pF1KB3 IMRGCLANQGDLDFEWNNFIDAMLMVAERLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDNSVQ
       .:.::::::.::: ::: ::::::.:::::::::::::::::::::::.::::::.::.:
XP_016 VMKGCLANQADLDTEWNLFIDAMLLVAERLEGPFNIESVMDPIDVKISEAIMNMQENSMQ
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pF1KB3 VSQKVFQGCGPPKPLPAGRISRSISESAFSARFRPHHPEERPTTAAGTSLDRLVTDVKEK
       :: ::::::: ::: :: : .::  :. :..::::..:::::::::::::::::::.:::
XP_016 VSAKVFQGCGQPKPAPALRSARSAPEN-FNTRFRPYNPEERPTTAAGTSLDRLVTDIKEK
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pF1KB3 LKQAKKFWSSLPSNVCNDERMAAGNGNEDDCWNGKGKSRYLFAVTGNGLANQGNNPEVQV
       :: .:: ::.:: ..:.:: ..::..::..::::..:.:::  . ..::.:: :::::.:
XP_016 LKLSKKVWSALPYTICKDESVTAGTSNEEECWNGHSKARYLPEIMNDGLTNQINNPEVDV
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pF1KB3 DTSKPDILILRQIMALRVMTSKMKNAYNGNDVDFFDISDESSGEGSGSGCEYQQCPSEFD
       : ..:: .: .:::::::::.:.:::::::::.: : :::::: ::::::  . ::.::.
XP_016 DITRPDTFIRQQIMALRVMTNKLKNAYNGNDVNFQDTSDESSGSGSGSGCMDDVCPTEFE
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pF1KB3 YNATDHAGKSANEK-ADSAGVRPGAQAYLLTVFCILFLVMQREWR
       . .:.  . . ... .::.... : .    .. ::. :..::   
XP_016 FVTTEAPAVDPDRREVDSSAAQRGHSLLSWSLTCIV-LALQRLCR
     390       400       410       420        430   

>>NP_002072 (OMIM: 600395) glypican-1 precursor [Homo sa  (558 aa)
 initn: 1516 init1: 1128 opt: 1158  Z-score: 1329.2  bits: 255.8 E(85289): 2.7e-67
Smith-Waterman score: 1640; 43.9% identity (75.0% similar) in 560 aa overlap (9-556:10-558)

                10         20        30        40        50        
pF1KB3  MARFGLPALLCTLAVLSA-ALLAAELKSKSCSEVRRLYVSKGFNKNDAPLHEINGDHLK
                :::. :.: : :      ::.::.:::..: .:::. .:.:  ::.:.::.
NP_002 MELRARGWWLLCAAAALVACARGDPASKSRSCGEVRQIYGAKGFSLSDVPQAEISGEHLR
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB3 ICPQGSTCCSQEMEEKYSLQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFASRYKKFDEFFKELLENAEK
       ::::: :::..::::. . .:. ...... ..   :::..:.. ..::. :..::...:.
NP_002 ICPQGYTCCTSEMEENLANRSHAELETALRDSSRVLQAMLATQLRSFDDHFQHLLNDSER
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pF1KB3 SLNDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEMLNDFWARLLERMFRLVNS
       .:.  :  ..:.:: ::.. :.::. ::. ::  .:..::: : .::::::::.:. .. 
NP_002 TLQATFPGAFGELYTQNARAFRDLYSELRLYYRGANLHLEETLAEFWARLLERLFKQLHP
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pF1KB3 QYHFTDEYLECVSKYTEQLKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAARTFAQGLAVAGDVVSKVSVV
       :  . :.::.:..: .: :.:::..::.:.:..::::::::.:.:::.::.::: ::. :
NP_002 QLLLPDDYLDCLGKQAEALRPFGEAPRELRLRATRAFVAARSFVQGLGVASDVVRKVAQV
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      240       250       260       270       280       290        
pF1KB3 NPTAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLANQGDLDFEWNNFIDAMLMV
           .:..:..:..::.:: :.  ..:: .:: :...::::::.::: :: :..:.:...
NP_002 PLGPECSRAVMKLVYCAHCLGVPGARPCPDYCRNVLKGCLANQADLDAEWRNLLDSMVLI
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pF1KB3 AERLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDNSVQVSQKVFQGCGPPKPLPAGRISRSISE
       .... :  ..:::.  . . ...::  .:::   .. ::.:::: ::  : :        
NP_002 TDKFWGTSGVESVIGSVHTWLAEAINALQDNRDTLTAKVIQGCGNPKVNPQG-------P
              310       320       330       340       350          

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pF1KB3 SAFSARFRPH-HPEERPTTAAGTSLDRLVTDVKEKLKQAKKFWSSLPSNVCNDERMAAGN
       .    : : .  :.::: .  :: :..::...: .:.... :: :::...:. :.:: ..
NP_002 GPEEKRRRGKLAPRERPPS--GT-LEKLVSEAKAQLRDVQDFWISLPGTLCS-EKMALST
           360       370          380       390       400          

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pF1KB3 GNEDDCWNGKGKSRYLFAVTGNGLANQGNNPEVQVDTSKPDILILRQIMALRVMTSKMKN
       ...: :::: ...:::  : :.::::: :::::.:: .:::. : .::: :..::.....
NP_002 ASDDRCWNGMARGRYLPEVMGDGLANQINNPEVEVDITKPDMTIRQQIMQLKIMTNRLRS
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pF1KB3 AYNGNDVDFFDISDESSGEGSGSGCEYQQCPSEFDYNATD------HA--GKSANE-KAD
       ::::::::: : ::..:: :::.::  . :  . . ....      ::  : : .: .  
NP_002 AYNGNDVDFQDASDDGSGSGSGDGCLDDLCSRKVSRKSSSSRTPLTHALPGLSEQEGQKT
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      530       540       550       
pF1KB3 SAGVRPGAQAYLLTVFCILFLVMQR-EWR
       ::.  :   ..:: .. .: :.. : .::
NP_002 SAASCPQPPTFLLPLLLFLALTVARPRWR
     530       540       550        

>>XP_016875791 (OMIM: 258315,604404) PREDICTED: glypican  (324 aa)
 initn: 1079 init1: 736 opt: 1100  Z-score: 1266.2  bits: 243.3 E(85289): 8.7e-64
Smith-Waterman score: 1100; 62.6% identity (85.1% similar) in 262 aa overlap (293-553:62-321)

            270       280       290       300       310       320  
pF1KB3 VKPCYNYCSNIMRGCLANQGDLDFEWNNFIDAMLMVAERLEGPFNIESVMDPIDVKISDA
                                     ::::.:::::::::::::::::::::::.:
XP_016 QGLWGNSITGRRNSRCKAWRQDCIWLCPDPDAMLLVAERLEGPFNIESVMDPIDVKISEA
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pF1KB3 IMNMQDNSVQVSQKVFQGCGPPKPLPAGRISRSISESAFSARFRPHHPEERPTTAAGTSL
       :::::.::.::: ::::::: ::: :: : .::  :. :..::::..:::::::::::::
XP_016 IMNMQENSMQVSAKVFQGCGQPKPAPALRSARSAPEN-FNTRFRPYNPEERPTTAAGTSL
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pF1KB3 DRLVTDVKEKLKQAKKFWSSLPSNVCNDERMAAGNGNEDDCWNGKGKSRYLFAVTGNGLA
       ::::::.::::: .:: ::.:: ..:.:: ..::..::..::::..:.:::  . ..::.
XP_016 DRLVTDIKEKLKLSKKVWSALPYTICKDESVTAGTSNEEECWNGHSKARYLPEIMNDGLT
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pF1KB3 NQGNNPEVQVDTSKPDILILRQIMALRVMTSKMKNAYNGNDVDFFDISDESSGEGSGSGC
       :: :::::.:: ..:: .: .:::::::::.:.:::::::::.: : :::::: ::::::
XP_016 NQINNPEVDVDITRPDTFIRQQIMALRVMTNKLKNAYNGNDVNFQDTSDESSGSGSGSGC
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pF1KB3 EYQQCPSEFDYNATDHAGKSANEK-ADSAGVRPGAQAYLLTVFCILFLVMQREWR
         . ::.::.. .:.  . . ... .::.... : .    .. ::. :..::   
XP_016 MDDVCPTEFEFVTTEAPAVDPDRREVDSSAAQRGHSLLSWSLTCIV-LALQRLCR
              280       290       300       310        320    

>>XP_011509278 (OMIM: 600395) PREDICTED: glypican-1 isof  (486 aa)
 initn: 1303 init1: 915 opt: 932  Z-score: 1070.5  bits: 207.7 E(85289): 6.9e-53
Smith-Waterman score: 1414; 42.7% identity (74.6% similar) in 497 aa overlap (71-556:1-486)

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pF1KB3 GFNKNDAPLHEINGDHLKICPQGSTCCSQEMEEKYSLQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFAS
                                     :::. . .:. ...... ..   :::..:.
XP_011                               MEENLANRSHAELETALRDSSRVLQAMLAT
                                             10        20        30

              110       120       130       140       150       160
pF1KB3 RYKKFDEFFKELLENAEKSLNDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEM
       . ..::. :..::...:..:.  :  ..:.:: ::.. :.::. ::. ::  .:..::: 
XP_011 QLRSFDDHFQHLLNDSERTLQATFPGAFGELYTQNARAFRDLYSELRLYYRGANLHLEET
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pF1KB3 LNDFWARLLERMFRLVNSQYHFTDEYLECVSKYTEQLKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAART
       : .::::::::.:. .. :  . :.::.:..: .: :.:::..::.:.:..::::::::.
XP_011 LAEFWARLLERLFKQLHPQLLLPDDYLDCLGKQAEALRPFGEAPRELRLRATRAFVAARS
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pF1KB3 FAQGLAVAGDVVSKVSVVNPTAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLAN
       :.:::.::.::: ::. :    .:..:..:..::.:: :.  ..:: .:: :...:::::
XP_011 FVQGLGVASDVVRKVAQVPLGPECSRAVMKLVYCAHCLGVPGARPCPDYCRNVLKGCLAN
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pF1KB3 QGDLDFEWNNFIDAMLMVAERLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDNSVQVSQKVFQG
       :.::: :: :..:.:....... :  ..:::.  . . ...::  .:::   .. ::.::
XP_011 QADLDAEWRNLLDSMVLITDKFWGTSGVESVIGSVHTWLAEAINALQDNRDTLTAKVIQG
              220       230       240       250       260       270

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pF1KB3 CGPPKPLPAGRISRSISESAFSARFRPH-HPEERPTTAAGTSLDRLVTDVKEKLKQAKKF
       :: ::  : :        .    : : .  :.::: .  :: :..::...: .:.... :
XP_011 CGNPKVNPQG-------PGPEEKRRRGKLAPRERPPS--GT-LEKLVSEAKAQLRDVQDF
              280              290       300          310       320

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pF1KB3 WSSLPSNVCNDERMAAGNGNEDDCWNGKGKSRYLFAVTGNGLANQGNNPEVQVDTSKPDI
       : :::...:. :.:: .....: :::: ...:::  : :.::::: :::::.:: .:::.
XP_011 WISLPGTLCS-EKMALSTASDDRCWNGMARGRYLPEVMGDGLANQINNPEVEVDITKPDM
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pF1KB3 LILRQIMALRVMTSKMKNAYNGNDVDFFDISDESSGEGSGSGCEYQQCPSEFDYNATD--
        : .::: :..::.....::::::::: : ::..:: :::.::  . :  . . ....  
XP_011 TIRQQIMQLKIMTNRLRSAYNGNDVDFQDASDDGSGSGSGDGCLDDLCSRKVSRKSSSSR
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           ::  : : .: .  ::.  :   ..:: .. .: :.. : .::
XP_011 TPLTHALPGLSEQEGQKTSAASCPQPPTFLLPLLLFLALTVARPRWR
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