Result of FASTA (ccds) for pF1KB3124
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3124, 556 aa
  1>>>pF1KB3124 556 - 556 aa - 556 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8731+/-0.000864; mu= 16.1255+/- 0.052
 mean_var=75.2612+/-14.777, 0's: 0 Z-trim(106.9): 13  B-trim: 78 in 1/51
 Lambda= 0.147839
 statistics sampled from 9253 (9263) to 9253 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.655), E-opt: 0.2 (0.285), width:  16
 Scan time:  3.140

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14637.1 GPC4 gene_id:2239|Hs108|chrX           ( 556) 3749 809.1       0
CCDS9469.1 GPC6 gene_id:10082|Hs108|chr13          ( 555) 2422 526.1 4.2e-149
CCDS5689.1 GPC2 gene_id:221914|Hs108|chr7          ( 579) 1387 305.4 1.3e-82
CCDS2534.1 GPC1 gene_id:2817|Hs108|chr2            ( 558) 1158 256.5 6.1e-68
CCDS9468.1 GPC5 gene_id:2262|Hs108|chr13           ( 572)  712 161.4 2.7e-39
CCDS14638.1 GPC3 gene_id:2719|Hs108|chrX           ( 580)  591 135.6 1.6e-31
CCDS55496.1 GPC3 gene_id:2719|Hs108|chrX           ( 603)  523 121.1 3.9e-27
CCDS55495.1 GPC3 gene_id:2719|Hs108|chrX           ( 526)  456 106.8 6.9e-23


>>CCDS14637.1 GPC4 gene_id:2239|Hs108|chrX                (556 aa)
 initn: 3749 init1: 3749 opt: 3749  Z-score: 4319.9  bits: 809.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3749; 100.0% identity (100.0% similar) in 556 aa overlap (1-556:1-556)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MARFGLPALLCTLAVLSAALLAAELKSKSCSEVRRLYVSKGFNKNDAPLHEINGDHLKIC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MARFGLPALLCTLAVLSAALLAAELKSKSCSEVRRLYVSKGFNKNDAPLHEINGDHLKIC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 PQGSTCCSQEMEEKYSLQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFASRYKKFDEFFKELLENAEKSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PQGSTCCSQEMEEKYSLQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFASRYKKFDEFFKELLENAEKSL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 NDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEMLNDFWARLLERMFRLVNSQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEMLNDFWARLLERMFRLVNSQY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 HFTDEYLECVSKYTEQLKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAARTFAQGLAVAGDVVSKVSVVNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HFTDEYLECVSKYTEQLKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAARTFAQGLAVAGDVVSKVSVVNP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 TAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLANQGDLDFEWNNFIDAMLMVAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLANQGDLDFEWNNFIDAMLMVAE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 RLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDNSVQVSQKVFQGCGPPKPLPAGRISRSISESA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDNSVQVSQKVFQGCGPPKPLPAGRISRSISESA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 FSARFRPHHPEERPTTAAGTSLDRLVTDVKEKLKQAKKFWSSLPSNVCNDERMAAGNGNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FSARFRPHHPEERPTTAAGTSLDRLVTDVKEKLKQAKKFWSSLPSNVCNDERMAAGNGNE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 DDCWNGKGKSRYLFAVTGNGLANQGNNPEVQVDTSKPDILILRQIMALRVMTSKMKNAYN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DDCWNGKGKSRYLFAVTGNGLANQGNNPEVQVDTSKPDILILRQIMALRVMTSKMKNAYN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 GNDVDFFDISDESSGEGSGSGCEYQQCPSEFDYNATDHAGKSANEKADSAGVRPGAQAYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GNDVDFFDISDESSGEGSGSGCEYQQCPSEFDYNATDHAGKSANEKADSAGVRPGAQAYL
              490       500       510       520       530       540

              550      
pF1KB3 LTVFCILFLVMQREWR
       ::::::::::::::::
CCDS14 LTVFCILFLVMQREWR
              550      

>>CCDS9469.1 GPC6 gene_id:10082|Hs108|chr13               (555 aa)
 initn: 2398 init1: 1676 opt: 2422  Z-score: 2790.3  bits: 526.1 E(32554): 4.2e-149
Smith-Waterman score: 2422; 64.8% identity (85.6% similar) in 549 aa overlap (6-553:10-552)

                   10        20        30        40        50      
pF1KB3     MARFGLPALLCTLAVLSAALLAAELKSKSCSEVRRLYVSKGFNKNDAPLHEINGDH
                :: ::  :  : :.   :..:..::.:::. : .:::.  : : .:: :.:
CCDS94 MPSWIGAVILP-LLGLLLSLPAG---ADVKARSCGEVRQAYGAKGFSLADIPYQEIAGEH
               10         20           30        40        50      

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB3 LKICPQGSTCCSQEMEEKYSLQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFASRYKKFDEFFKELLENA
       :.::::  :::. :::.: : ::: .:...: :  . ....:.::.:::::::.::::::
CCDS94 LRICPQEYTCCTTEMEDKLSQQSKLEFENLVEETSHFVRTTFVSRHKKFDEFFRELLENA
         60        70        80        90       100       110      

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB3 EKSLNDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEMLNDFWARLLERMFRLV
       :::::::::.::: :::::::.:.:::.::::::. :::::::::::::::::::::.:.
CCDS94 EKSLNDMFVRTYGMLYMQNSEVFQDLFTELKRYYTGGNVNLEEMLNDFWARLLERMFQLI
        120       130       140       150       160       170      

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB3 NSQYHFTDEYLECVSKYTEQLKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAARTFAQGLAVAGDVVSKVS
       : ::::...:::::::::.:::::::::::::.::::::.:::::.:::.:. .:...::
CCDS94 NPQYHFSEDYLECVSKYTDQLKPFGDVPRKLKIQVTRAFIAARTFVQGLTVGREVANRVS
        180       190       200       210       220       230      

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB3 VVNPTAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLANQGDLDFEWNNFIDAML
        :.::  : .::.::.:: .:::: ::.:: ::: :.:.::::::.::: ::: ::::::
CCDS94 KVSPTPGCIRALMKMLYCPYCRGLPTVRPCNNYCLNVMKGCLANQADLDTEWNLFIDAML
        240       250       260       270       280       290      

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB3 MVAERLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDNSVQVSQKVFQGCGPPKPLPAGRISRSI
       .:::::::::::::::::::::::.::::::.::.::: ::::::: ::: :: : .:: 
CCDS94 LVAERLEGPFNIESVMDPIDVKISEAIMNMQENSMQVSAKVFQGCGQPKPAPALRSARSA
        300       310       320       330       340       350      

        360       370       380       390       400       410      
pF1KB3 SESAFSARFRPHHPEERPTTAAGTSLDRLVTDVKEKLKQAKKFWSSLPSNVCNDERMAAG
        :. :..::::..:::::::::::::::::::.::::: .:: ::.:: ..:.:: ..::
CCDS94 PEN-FNTRFRPYNPEERPTTAAGTSLDRLVTDIKEKLKLSKKVWSALPYTICKDESVTAG
         360       370       380       390       400       410     

        420       430       440       450       460       470      
pF1KB3 NGNEDDCWNGKGKSRYLFAVTGNGLANQGNNPEVQVDTSKPDILILRQIMALRVMTSKMK
       ..::..::::..:.:::  . ..::.:: :::::.:: ..:: .: .:::::::::.:.:
CCDS94 TSNEEECWNGHSKARYLPEIMNDGLTNQINNPEVDVDITRPDTFIRQQIMALRVMTNKLK
         420       430       440       450       460       470     

        480       490       500       510       520        530     
pF1KB3 NAYNGNDVDFFDISDESSGEGSGSGCEYQQCPSEFDYNATDHAGKSANEK-ADSAGVRPG
       ::::::::.: : :::::: ::::::  . ::.::.. .:.  . . ... .::.... :
CCDS94 NAYNGNDVNFQDTSDESSGSGSGSGCMDDVCPTEFEFVTTEAPAVDPDRREVDSSAAQRG
         480       490       500       510       520       530     

         540       550      
pF1KB3 AQAYLLTVFCILFLVMQREWR
        .    .. ::. :..::   
CCDS94 HSLLSWSLTCIV-LALQRLCR
         540        550     

>>CCDS5689.1 GPC2 gene_id:221914|Hs108|chr7               (579 aa)
 initn: 1250 init1: 474 opt: 1387  Z-score: 1596.9  bits: 305.4 E(32554): 1.3e-82
Smith-Waterman score: 1387; 42.6% identity (74.7% similar) in 479 aa overlap (27-499:29-505)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB3   MARFGLPALLCTLAVLSAALLAAELKSKSCSEVRRLYVSKGFNKNDAPLHEINGDHLK
                                   ..::.:.:..  ..:.. :  :   :.:.::.
CCDS56 MSALRPLLLLLLPLCPGPGPGPGSEAKVTRSCAETRQVLGARGYSLNLIPPALISGEHLR
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB3 ICPQGSTCCSQEMEEKYSLQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFASRYKKFDEFFKELLENAEK
       .:::  ::::.: :..   ...  :...: .. . :  ..:.:..:::::: :.:  :..
CCDS56 VCPQEYTCCSSETEQRLIRETEATFRGLVEDSGSFLVHTLAARHRKFDEFFLEMLSVAQH
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB3 SLNDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEMLNDFWARLLERMFRLVNS
       ::...: ..::.:: :.. .:. :: .:. .:  .. .:.. : ::::.::::.: :.. 
CCDS56 SLTQLFSHSYGRLYAQHALIFNGLFSRLRDFYGESGEGLDDTLADFWAQLLERVFPLLHP
              130       140       150       160       170       180

      180       190           200       210       220       230    
pF1KB3 QYHFTDEYLECVSKYTEQ----LKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAARTFAQGLAVAGDVVSK
       :: :  .:: :.:. . .    :.:::: ::.:.::.::..::::.:.::: .. .:::.
CCDS56 QYSFPPDYLLCLSRLASSTDGSLQPFGDSPRRLRLQITRTLVAARAFVQGLETGRNVVSE
              190       200       210       220       230       240

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB3 VSVVNPTAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLANQGDLDFEWNNFIDA
       .  :  .  :..::...: :  :::. .. :: ..: :..::::...: :. .:.:..:.
CCDS56 ALKVPVSEGCSQALMRLIGCPLCRGVPSLMPCQGFCLNVVRGCLSSRG-LEPDWGNYLDG
              250       260       270       280        290         

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB3 MLMVAERLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDNSVQVSQKVFQGCGPPKPLPAGRISR
       .:..:..:.:::..: . . : ::::...: .:.::..:: .::: :::: :.:: :  :
CCDS56 LLILADKLQGPFSFELTAESIGVKISEGLMYLQENSAKVSAQVFQECGPPDPVPA-RNRR
     300       310       320       330       340       350         

          360        370       380       390       400       410   
pF1KB3 SISESAFSARFRPH-HPEERPTTAAGTSLDRLVTDVKEKLKQAKKFWSSLPSNVCNDERM
       .      ..:.      ::::::::::.: ::: ...:.: . . ::. :  .::.: ::
CCDS56 APPPREEAGRLWSMVTEEERPTTAAGTNLHRLVWELRERLARMRGFWARLSLTVCGDSRM
      360       370       380       390       400       410        

           420        430       440       450       460       470  
pF1KB3 AAGNGNED-DCWNGKGKSRYLFAVTGNGLANQGNNPEVQVDTSKPDILILRQIMALRVMT
       ::  . :   ::.: :..:::  :.:.. :.: ::::..::.: ::.   :. . ::. :
CCDS56 AADASLEAAPCWTGAGRGRYLPPVVGGSPAEQVNNPELKVDASGPDVPTRRRRLQLRAAT
      420       430       440       450       460       470        

            480       490       500       510       520       530  
pF1KB3 SKMKNAYNGNDVDFFDISDESSGEGSGSGCEYQQCPSEFDYNATDHAGKSANEKADSAGV
       ..::.:  :.:.:  : ....:: :.:                                 
CCDS56 ARMKTAALGHDLDGQDADEDASGSGGGQQYADDWMAGAVAPPARPPRPPYPPRRDGSGGK
      480       490       500       510       520       530        

>>CCDS2534.1 GPC1 gene_id:2817|Hs108|chr2                 (558 aa)
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pF1KB3  MARFGLPALLCTLAVLSA-ALLAAELKSKSCSEVRRLYVSKGFNKNDAPLHEINGDHLK
                :::. :.: : :      ::.::.:::..: .:::. .:.:  ::.:.::.
CCDS25 MELRARGWWLLCAAAALVACARGDPASKSRSCGEVRQIYGAKGFSLSDVPQAEISGEHLR
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB3 ICPQGSTCCSQEMEEKYSLQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFASRYKKFDEFFKELLENAEK
       ::::: :::..::::. . .:. ...... ..   :::..:.. ..::. :..::...:.
CCDS25 ICPQGYTCCTSEMEENLANRSHAELETALRDSSRVLQAMLATQLRSFDDHFQHLLNDSER
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pF1KB3 SLNDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEMLNDFWARLLERMFRLVNS
       .:.  :  ..:.:: ::.. :.::. ::. ::  .:..::: : .::::::::.:. .. 
CCDS25 TLQATFPGAFGELYTQNARAFRDLYSELRLYYRGANLHLEETLAEFWARLLERLFKQLHP
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB3 QYHFTDEYLECVSKYTEQLKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAARTFAQGLAVAGDVVSKVSVV
       :  . :.::.:..: .: :.:::..::.:.:..::::::::.:.:::.::.::: ::. :
CCDS25 QLLLPDDYLDCLGKQAEALRPFGEAPRELRLRATRAFVAARSFVQGLGVASDVVRKVAQV
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pF1KB3 NPTAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLANQGDLDFEWNNFIDAMLMV
           .:..:..:..::.:: :.  ..:: .:: :...::::::.::: :: :..:.:...
CCDS25 PLGPECSRAVMKLVYCAHCLGVPGARPCPDYCRNVLKGCLANQADLDAEWRNLLDSMVLI
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pF1KB3 AERLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDNSVQVSQKVFQGCGPPKPLPAGRISRSISE
       .... :  ..:::.  . . ...::  .:::   .. ::.:::: ::  : :        
CCDS25 TDKFWGTSGVESVIGSVHTWLAEAINALQDNRDTLTAKVIQGCGNPKVNPQG-------P
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pF1KB3 SAFSARFRPH-HPEERPTTAAGTSLDRLVTDVKEKLKQAKKFWSSLPSNVCNDERMAAGN
       .    : : .  :.::: .  :: :..::...: .:.... :: :::...:. :.:: ..
CCDS25 GPEEKRRRGKLAPRERPPS--GT-LEKLVSEAKAQLRDVQDFWISLPGTLCS-EKMALST
           360       370          380       390       400          

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pF1KB3 GNEDDCWNGKGKSRYLFAVTGNGLANQGNNPEVQVDTSKPDILILRQIMALRVMTSKMKN
       ...: :::: ...:::  : :.::::: :::::.:: .:::. : .::: :..::.....
CCDS25 ASDDRCWNGMARGRYLPEVMGDGLANQINNPEVEVDITKPDMTIRQQIMQLKIMTNRLRS
     410       420       430       440       450       460         

       480       490       500       510               520         
pF1KB3 AYNGNDVDFFDISDESSGEGSGSGCEYQQCPSEFDYNATD------HA--GKSANE-KAD
       ::::::::: : ::..:: :::.::  . :  . . ....      ::  : : .: .  
CCDS25 AYNGNDVDFQDASDDGSGSGSGDGCLDDLCSRKVSRKSSSSRTPLTHALPGLSEQEGQKT
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      530       540       550       
pF1KB3 SAGVRPGAQAYLLTVFCILFLVMQR-EWR
       ::.  :   ..:: .. .: :.. : .::
CCDS25 SAASCPQPPTFLLPLLLFLALTVARPRWR
     530       540       550        

>>CCDS9468.1 GPC5 gene_id:2262|Hs108|chr13                (572 aa)
 initn: 706 init1: 426 opt: 712  Z-score: 818.9  bits: 161.4 E(32554): 2.7e-39
Smith-Waterman score: 750; 27.7% identity (62.8% similar) in 494 aa overlap (28-501:28-510)

               10        20        30        40         50         
pF1KB3 MARFGLPALLCTLAVLSAALLAAELKSKSCSEVRRLYVSKGFNK-NDAPLHEINGDHLKI
                                  ..: :::.:.  . ..     :     :  :..
CCDS94 MDAQTWPVGFRCLLLLALVGSARSEGVQTCEEVRKLFQWRLLGAVRGLPDSPRAGPDLQV
               10        20        30        40        50        60

      60         70        80        90       100       110        
pF1KB3 C-PQGSTCCSQEMEEKYSLQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFASRYKKFDEFFKELLENAEK
       :  .  :::...:::.:.. ...:... .. . . :. ...     :.: .. :...::.
CCDS94 CISKKPTCCTRKMEERYQIAARQDMQQFLQTSSSTLKFLISRNAAAFQETLETLIKQAEN
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pF1KB3 SLNDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEMLNDFWARLLERMF-RLVN
         . .: .:: .. .. .   ...:...  :   ..:: ::..: :.  :.  .. .:.:
CCDS94 YTSILFCSTYRNMALEAAASVQEFFTDVGLYLFGADVNPEEFVNRFFDSLFPLVYNHLIN
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB3 SQYHFTD---EYLECVSKYTEQLKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAARTFAQGLAVAGDVVSK
            ::   :: ::.    ....:::..:...  :. :... .::: :.: .. .:.. 
CCDS94 PG--VTDSSLEYSECIRMARRDVSPFGNIPQRVMGQMGRSLLPSRTFLQALNLGIEVINT
                190       200       210       220       230        

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pF1KB3 VSVVNPTAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLANQGDLDFEWNNFIDA
       .. .. . .:..::::: :: ::.::. .:::..:: :.::::::....:. .:. .: .
CCDS94 TDYLHFSKECSRALLKMQYCPHCQGLALTKPCMGYCLNVMRGCLAHMAELNPHWHAYIRS
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pF1KB3 MLMVAERLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDNSVQVSQKVFQGCGPPKPLPAGRISR
       .  ... ..: ..:  :.  . . ..::... . :. .. ..: . :: :   :.     
CCDS94 LEELSDAMHGTYDIGHVLLNFHLLVNDAVLQAHLNGQKLLEQVNRICGRPVRTPTQSPRC
      300       310       320       330       340       350        

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pF1KB3 SISESAFSARFRPHHPEERPTTAAGTSLDRLVTDVKEKLKQAKKFWSSLPSNVCNDERMA
       :...:      . .:  .  :  .  .:     .  ..:.  ..:...: ...: .: .:
CCDS94 SFDQS------KEKHGMKTTTRNSEETLANRRKEFINSLRLYRSFYGGLADQLCANE-LA
      360             370       380       390       400        410 

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pF1KB3 AGNGNEDDCWNGKGKSR-YLFAVTGNGLANQGNNPEVQVDTSKPDI--LI--LRQIMALR
       :..:    ::::.   . :   :.:::.  :..::::.:    : :  .:  :.... : 
CCDS94 AADGLP--CWNGEDIVKSYTQRVVGNGIKAQSGNPEVKVKGIDPVINQIIDKLKHVVQLL
               420       430       440       450       460         

     470       480                490       500       510       520
pF1KB3 VMTSKMKNAYN-------GNDVDFF--DISDESSGEGSGSGCEYQQCPSEFDYNATDHAG
          :   . ..       :. :.    : .::..  :::::                   
CCDS94 QGRSPKPDKWELLQLGSGGGMVEQVSGDCDDEDGCGGSGSGEVKRTLKITDWMPDDMNFS
     470       480       490       500       510       520         

              530       540       550             
pF1KB3 KSANEKADSAGVRPGAQAYLLTVFCILFLVMQREWR       
                                                  
CCDS94 DVKQIHQTDTGSTLDTTGAGCAVATESMTFTLISVVMLLPGIW
     530       540       550       560       570  

>>CCDS14638.1 GPC3 gene_id:2719|Hs108|chrX                (580 aa)
 initn: 465 init1: 256 opt: 591  Z-score: 679.4  bits: 135.6 E(32554): 1.6e-31
Smith-Waterman score: 636; 26.9% identity (60.7% similar) in 494 aa overlap (29-501:34-512)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB3   MARFGLPALLCTLAVLSAALLAAELKSKSCSEVRRLYVSKGFNKNDAPLHEINGDHLK
                                     .: .:: ..     . . .:   . :. :.
CCDS14 TVRTACLVVAMLLSLDFPGQAQPPPPPPDATCHQVRSFFQRLQPGLKWVPETPVPGSDLQ
            10        20        30        40        50        60   

       60         70        80        90       100       110       
pF1KB3 IC-PQGSTCCSQEMEEKYSLQSKDDFKSVVSEQCNHLQAVFASRYKKFDEFFKELLENAE
       .: :.: ::::..:::::.: .. .......    .:. .. .    :.: :. ....:.
CCDS14 VCLPKGPTCCSRKMEEKYQLTARLNMEQLLQSASMELKFLIIQNAAVFQEAFEIVVRHAK
            70        80        90       100       110       120   

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pF1KB3 KSLNDMFVKTYGHLYMQNSELFKDLFVELKRYYVVGNVNLEEMLNDFWARLLERMF-RLV
       .  : :: ..:  :  :  :.  ..:.... : . ...:...:.:...  :.  .. .:.
CCDS14 NYTNAMFKNNYPSLTPQAFEFVGEFFTDVSLYILGSDINVDDMVNELFDSLFPVIYTQLM
           130       140       150       160       170       180   

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pF1KB3 NSQYHFTDEYL---ECVSKYTEQLKPFGDVPRKLKLQVTRAFVAARTFAQGLAVAGDVVS
       :    . :  :   ::.    ..:: ::. :. .  ::.... ..: : :.: .. .:..
CCDS14 NP--GLPDSALDINECLRGARRDLKVFGNFPKLIMTQVSKSLQVTRIFLQALNLGIEVIN
             190       200       210       220       230       240 

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pF1KB3 KVSVVNPTAQCTHALLKMIYCSHCRGLVTVKPCYNYCSNIMRGCLANQGDLDFEWNNFID
        .. .. . .: . : .: :::.:.::. :::: .::. .:.::.:.  ..:  : ..: 
CCDS14 TTDHLKFSKDCGRMLTRMWYCSYCQGLMMVKPCGGYCNVVMQGCMAGVVEIDKYWREYIL
             250       260       270       280       290       300 

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pF1KB3 AMLMVAERLEGPFNIESVMDPIDVKISDAIMNMQDNSVQVSQKVFQGCGPPKPLPAGRIS
       ..  ... .   ...:.:.  .   : :.:. .: :. ...  . . :.  .     :  
CCDS14 SLEELVNGMYRIYDMENVLLGLFSTIHDSIQYVQKNAGKLTTTIGKLCAHSQQ----RQY
             310       320       330       340       350           

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pF1KB3 RSI--SESAFSAR--FRPHHPEERPTTAAGTSLDRLVTDVKEKLKQAKKFWSSLPSNVCN
       ::    :. :  .  ..  : :.. :    .:  :   .. .:::.  .:.:.::. .:.
CCDS14 RSAYYPEDLFIDKKVLKVAHVEHEETL---SSRRR---ELIQKLKSFISFYSALPGYICS
       360       370       380             390       400       410 

     410       420        430       440       450         460      
pF1KB3 DERMAAGNGNEDDCWNGKGK-SRYLFAVTGNGLANQGNNPEVQVDTSKPDI--LI--LRQ
          .:    :.  ::::.    ::   .. ::. :: :  :...   .: .  .:  :..
CCDS14 HSPVAE---NDTLCWNGQELVERYSQKAARNGMKNQFNLHELKMKGPEPVVSQIIDKLKH
                420       430       440       450       460        

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pF1KB3 I-MALRVMTSKMKNAYNGN-DVDFFDISDESSGE-----GSGSGCEYQQCPSEFDYNATD
       : . ::.:.     . . : : . :. .: .. :     :::.:                
CCDS14 INQLLRTMSMPKGRVLDKNLDEEGFESGDCGDDEDECIGGSGDGMIKVKNQLRFLAELAY
      470       480       490       500       510       520        

       520       530       540       550                   
pF1KB3 HAGKSANEKADSAGVRPGAQAYLLTVFCILFLVMQREWR             
                                                           
CCDS14 DLDVDDAPGNSQQATPKDNEISTFHNLGNVHSPLKLLTSMAISVVCFFFLVH
      530       540       550       560       570       580

>>CCDS55496.1 GPC3 gene_id:2719|Hs108|chrX                (603 aa)
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Smith-Waterman score: 620; 25.2% identity (60.2% similar) in 507 aa overlap (29-501:34-535)

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       .: :.: ::::..:::::.: .. .......    .:. .. .    :.: :. ....:.
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        .. .. . .: . : .: :::.:.::. :::: .::. .:.::.:.  ..:  : ..: 
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       ..  ... .   ...:.:.  .   : :.:. .: :     .... .:...   :     
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        .:.:.::. .:.   .:    :.  ::::.    ::   .. ::. :: :  :...   
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       .: .  .:  :..: . ::.:.     . . : : . :. .: .. :     :::.:   
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>>CCDS55495.1 GPC3 gene_id:2719|Hs108|chrX                (526 aa)
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         .   : :.:. .: :. ...  . . :.  .     :  ::    :. :  .  ..  
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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