seq1 = pF1KE0500.tfa, 2175 bp seq2 = pF1KE0500/gi568815597f_44639933.tfa (gi568815597f:44639933_44867176), 227244 bp >pF1KE0500 2175 >gi568815597f:44639933_44867176 (Chr1) 1-70 (100001-100070) 100% -> 71-165 (100981-101075) 100% -> 166-267 (107452-107553) 100% -> 268-316 (107720-107768) 100% -> 317-439 (110510-110632) 100% -> 440-562 (113200-113322) 100% -> 563-663 (113801-113901) 100% -> 664-759 (114818-114913) 100% -> 760-814 (115997-116051) 100% -> 815-977 (116143-116305) 100% -> 978-1068 (117624-117714) 100% -> 1069-1132 (117976-118039) 100% -> 1133-1224 (118117-118208) 100% -> 1225-1367 (119274-119416) 100% -> 1368-1572 (120348-120552) 100% -> 1573-1683 (120660-120770) 100% -> 1684-1751 (121984-122051) 100% -> 1752-1857 (122414-122519) 100% -> 1858-1971 (122613-122726) 100% -> 1972-2095 (126894-127017) 100% -> 2096-2175 (127165-127244) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGCCATGGACTCGTCGCTTCAGGCCCGCCTGTTTCCCGGTCTCGCTAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGCCATGGACTCGTCGCTTCAGGCCCGCCTGTTTCCCGGTCTCGCTAT 50 . : . : . : . : . : 51 CAAGATCCAACGCAGTAATG GTTTAATTCACAGTGCCAATG ||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||| 100051 CAAGATCCAACGCAGTAATGGTG...TAGGTTTAATTCACAGTGCCAATG 100 . : . : . : . : . : 92 TAAGGACTGTGAACTTGGAGAAATCCTGTGTTTCAGTGGAATGGGCAGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101002 TAAGGACTGTGAACTTGGAGAAATCCTGTGTTTCAGTGGAATGGGCAGAA 150 . : . : . : . : . : 142 GGAGGTGCCACAAAGGGCAAAGAG ATTGATTTTGATGATGT ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 101052 GGAGGTGCCACAAAGGGCAAAGAGGTA...CAGATTGATTTTGATGATGT 200 . : . : . : . : . : 183 GGCTGCAATAAACCCAGAACTCTTACAGCTTCTTCCCTTACATCCGAAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107469 GGCTGCAATAAACCCAGAACTCTTACAGCTTCTTCCCTTACATCCGAAGG 250 . : . : . : . : . : 233 ACAATCTGCCCTTGCAGGAAAATGTAACAATCCAG AAACAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||| 107519 ACAATCTGCCCTTGCAGGAAAATGTAACAATCCAGGTA...CAGAAACAA 300 . : . : . : . : . : 274 AAACGGAGATCCGTCAACTCCAAAATTCCTGCTCCAAAAGAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...> 107726 AAACGGAGATCCGTCAACTCCAAAATTCCTGCTCCAAAAGAAAGTA...C 350 . : . : . : . : . : 317 GTCTTCGAAGCCGCTCCACTCGCATGTCCACTGTCTCAGAGCTTCGCA >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110508 AGGTCTTCGAAGCCGCTCCACTCGCATGTCCACTGTCTCAGAGCTTCGCA 400 . : . : . : . : . : 365 TCACGGCTCAGGAGAATGACATGGAGGTGGAGCTGCCTGCAGCTGCAAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110558 TCACGGCTCAGGAGAATGACATGGAGGTGGAGCTGCCTGCAGCTGCAAAC 450 . : . : . : . : . : 415 TCCCGCAAGCAGTTTTCAGTTCCTC CTGCCCCCACTAGGCC |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| 110608 TCCCGCAAGCAGTTTTCAGTTCCTCGTG...CAGCTGCCCCCACTAGGCC 500 . : . : . : . : . : 456 TTCCTGCCCTGCAGTGGCTGAAATACCATTGAGGATGGTCAGCGAGGAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113216 TTCCTGCCCTGCAGTGGCTGAAATACCATTGAGGATGGTCAGCGAGGAGA 550 . : . : . : . : . : 506 TGGAAGAGCAAGTCCATTCCATCCGAGGCAGCTCTTCTGCAAACCCTGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113266 TGGAAGAGCAAGTCCATTCCATCCGAGGCAGCTCTTCTGCAAACCCTGTG 600 . : . : . : . : . : 556 AACTCAG TTCGGAGGAAATCATGTCTTGTGAAGGAAGTGGA |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| 113316 AACTCAGGTA...TAGTTCGGAGGAAATCATGTCTTGTGAAGGAAGTGGA 650 . : . : . : . : . : 597 AAAAATGAAGAACAAGCGAGAAGAGAAGAAGGCCCAGAACTCTGAAATGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 113835 AAAAATGAAGAACAAGCGAGAAGAGAAGAAGGCCCAGAACTCTGAAATGA 700 . : . : . : . : . : 647 GAATGAAGAGAGCTCAG GAGTATGACAGTAGTTTTCCAAAC |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| 113885 GAATGAAGAGAGCTCAGGTA...CAGGAGTATGACAGTAGTTTTCCAAAC 750 . : . : . : . : . : 688 TGGGAATTTGCCCGAATGATTAAAGAATTTCGGGCTACTTTGGAATGTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114842 TGGGAATTTGCCCGAATGATTAAAGAATTTCGGGCTACTTTGGAATGTCA 800 . : . : . : . : . : 738 TCCACTTACTATGACTGATCCT ATCGAAGAGCACAGAATAT ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 114892 TCCACTTACTATGACTGATCCTGTA...CAGATCGAAGAGCACAGAATAT 850 . : . : . : . : . : 779 GTGTCTGTGTTAGGAAACGCCCACTGAATAAGCAAG AATTG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||| 116016 GTGTCTGTGTTAGGAAACGCCCACTGAATAAGCAAGGTA...CAGAATTG 900 . : . : . : . : . : 820 GCCAAGAAAGAAATTGATGTGATTTCCATTCCTAGCAAGTGTCTCCTCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116148 GCCAAGAAAGAAATTGATGTGATTTCCATTCCTAGCAAGTGTCTCCTCTT 950 . : . : . : . : . : 870 GGTACATGAACCCAAGTTGAAAGTGGACTTAACAAAGTATCTGGAGAACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116198 GGTACATGAACCCAAGTTGAAAGTGGACTTAACAAAGTATCTGGAGAACC 1000 . : . : . : . : . : 920 AAGCATTCTGCTTTGACTTTGCATTTGATGAAACAGCTTCGAATGAAGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116248 AAGCATTCTGCTTTGACTTTGCATTTGATGAAACAGCTTCGAATGAAGTT 1050 . : . : . : . : . : 970 GTCTACAG GTTCACAGCAAGGCCACTGGTACAGACAATCTT ||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||| 116298 GTCTACAGGTT...TAGGTTCACAGCAAGGCCACTGGTACAGACAATCTT 1100 . : . : . : . : . : 1011 TGAAGGTGGAAAAGCAACTTGTTTTGCATATGGCCAGACAGGAAGTGGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117657 TGAAGGTGGAAAAGCAACTTGTTTTGCATATGGCCAGACAGGAAGTGGCA 1150 . : . : . : . : . : 1061 AGACACAT ACTATGGGCGGAGACCTCTCTGGGAAAGCCCAG ||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||| 117707 AGACACATGTG...CAGACTATGGGCGGAGACCTCTCTGGGAAAGCCCAG 1200 . : . : . : . : . : 1102 AATGCATCCAAAGGGATCTATGCCATGGCCT CCCGGGACGT |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| 118009 AATGCATCCAAAGGGATCTATGCCATGGCCTGTA...CAGCCCGGGACGT 1250 . : . : . : . : . : 1143 CTTCCTCCTGAAGAATCAACCCTGCTACCGGAAGTTGGGCCTGGAAGTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118127 CTTCCTCCTGAAGAATCAACCCTGCTACCGGAAGTTGGGCCTGGAAGTCT 1300 . : . : . : . : . : 1193 ATGTGACATTCTTCGAGATCTACAATGGGAAG CTGTTTGAC ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| 118177 ATGTGACATTCTTCGAGATCTACAATGGGAAGGTA...CAGCTGTTTGAC 1350 . : . : . : . : . : 1234 CTGCTCAACAAGAAGGCCAAGCTGCGCGTGCTGGAGGACGGCAAGCAACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 119283 CTGCTCAACAAGAAGGCCAAGCTGCGCGTGCTGGAGGACGGCAAGCAACA 1400 . : . : . : . : . : 1284 GGTGCAAGTGGTGGGGCTGCAGGAGCATCTGGTTAACTCTGCTGATGATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 119333 GGTGCAAGTGGTGGGGCTGCAGGAGCATCTGGTTAACTCTGCTGATGATG 1450 . : . : . : . : . : 1334 TCATCAAGATGATCGACATGGGCAGCGCCTGCAG AACCTCT ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| 119383 TCATCAAGATGATCGACATGGGCAGCGCCTGCAGGTG...CAGAACCTCT 1500 . : . : . : . : . : 1375 GGGCAGACATTTGCCAACTCCAATTCCTCCCGCTCCCACGCGTGCTTCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120355 GGGCAGACATTTGCCAACTCCAATTCCTCCCGCTCCCACGCGTGCTTCCA 1550 . : . : . : . : . : 1425 AATTATTCTTCGAGCTAAAGGGAGAATGCATGGCAAGTTCTCTTTGGTAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120405 AATTATTCTTCGAGCTAAAGGGAGAATGCATGGCAAGTTCTCTTTGGTAG 1600 . : . : . : . : . : 1475 ATCTGGCAGGGAATGAGCGAGGCGCGGACACTTCCAGTGCTGACCGGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120455 ATCTGGCAGGGAATGAGCGAGGCGCGGACACTTCCAGTGCTGACCGGCAG 1650 . : . : . : . : . : 1525 ACCCGCATGGAGGGCGCAGAAATCAACAAGAGTCTCTTAGCCCTGAAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>> 120505 ACCCGCATGGAGGGCGCAGAAATCAACAAGAGTCTCTTAGCCCTGAAGGT 1700 . : . : . : . : . : 1573 GAGTGCATCAGGGCCCTGGGACAGAACAAGGCTCACACCCCGT >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120555 A...CAGGAGTGCATCAGGGCCCTGGGACAGAACAAGGCTCACACCCCGT 1750 . : . : . : . : . : 1616 TCCGTGAGAGCAAGCTGACACAGGTGCTGAGGGACTCCTTCATTGGGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120703 TCCGTGAGAGCAAGCTGACACAGGTGCTGAGGGACTCCTTCATTGGGGAG 1800 . : . : . : . : . : 1666 AACTCTAGGACTTGCATG ATTGCCACGATCTCACCAGGCAT ||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||| 120753 AACTCTAGGACTTGCATGGTG...CAGATTGCCACGATCTCACCAGGCAT 1850 . : . : . : . : . : 1707 AAGCTCCTGTGAATATACTTTAAACACCCTGAGATATGCAGACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 122007 AAGCTCCTGTGAATATACTTTAAACACCCTGAGATATGCAGACAGGTA.. 1900 . : . : . : . : . : 1752 GGTCAAGGAGCTGAGCCCCCACAGTGGGCCCAGTGGAGAGCAGTTG .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122057 .CAGGGTCAAGGAGCTGAGCCCCCACAGTGGGCCCAGTGGAGAGCAGTTG 1950 . : . : . : . : . : 1798 ATTCAAATGGAAACAGAAGAGATGGAAGCCTGCTCTAACGGGGCGCTGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122460 ATTCAAATGGAAACAGAAGAGATGGAAGCCTGCTCTAACGGGGCGCTGAT 2000 . : . : . : . : . : 1848 TCCAGGCAAT TTATCCAAGGAAGAGGAGGAACTGTCTTCCC ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 122510 TCCAGGCAATGTA...CAGTTATCCAAGGAAGAGGAGGAACTGTCTTCCC 2050 . : . : . : . : . : 1889 AGATGTCCAGCTTTAACGAAGCCATGACTCAGATCAGGGAGCTGGAGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122644 AGATGTCCAGCTTTAACGAAGCCATGACTCAGATCAGGGAGCTGGAGGAG 2100 . : . : . : . : . : 1939 AAGGCTATGGAAGAGCTCAAGGAGATCATACAG CAAGGACC |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| 122694 AAGGCTATGGAAGAGCTCAAGGAGATCATACAGGTA...TAGCAAGGACC 2150 . : . : . : . : . : 1980 AGACTGGCTTGAGCTCTCTGAGATGACCGAGCAGCCAGACTATGACCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126902 AGACTGGCTTGAGCTCTCTGAGATGACCGAGCAGCCAGACTATGACCTGG 2200 . : . : . : . : . : 2030 AGACCTTTGTGAACAAAGCGGAATCTGCTCTGGCCCAGCAAGCCAAGCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126952 AGACCTTTGTGAACAAAGCGGAATCTGCTCTGGCCCAGCAAGCCAAGCAT 2250 . : . : . : . : . : 2080 TTCTCAGCCCTGCGAG ATGTCATCAAGGCCTTGCGCCTGGC ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 127002 TTCTCAGCCCTGCGAGGTG...CAGATGTCATCAAGGCCTTGCGCCTGGC 2300 . : . : . : . : . : 2121 CATGCAGCTGGAAGAGCAGGCTAGCAGACAAATAAGCAGCAAGAAACGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127190 CATGCAGCTGGAAGAGCAGGCTAGCAGACAAATAAGCAGCAAGAAACGGC 2350 . 2171 CCCAG ||||| 127240 CCCAG