seq1 = pF1KE4392.tfa, 1245 bp
seq2 = pF1KE4392/gi568815592r_31759722.tfa (gi568815592r:31759722_31962776), 203055 bp

>pF1KE4392 1245
>gi568815592r:31759722_31962776 (Chr6)

(complement)

1-159  (100001-100159)   100% ->
160-352  (100586-100778)   100% ->
353-615  (101327-101589)   100% ->
616-798  (102156-102338)   100% ->
799-1021  (102513-102735)   100% ->
1022-1245  (102832-103055)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTGGGGAGCGACCCAGCACGGCGCTCCCGGACAGACGCTGGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTGGGGAGCGACCCAGCACGGCGCTCCCGGACAGACGCTGGGGGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGGATTCTGGGCTTCTGGGGAGGCTGTAGGGTTTGGGTGTTTGCCGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGGATTCTGGGCTTCTGGGGAGGCTGTAGGGTTTGGGTGTTTGCCGCGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTTCCTGCTGCTGTCTCTGGCAGCCTCCTGGTCCAAGGCTGAGAACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTTCCTGCTGCTGTCTCTGGCAGCCTCCTGGTCCAAGGCTGAGAACGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCGGTCTG         GTGCAGCCGCTGGTGACCATGGAGCAACTGCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCGGTCTGGTG...CAGGTGCAGCCGCTGGTGACCATGGAGCAACTGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTGGGTGAGCGGGAGACAGATCGGCTCAGTGGACACCTTCCGCATCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100618 GTGGGTGAGCGGGAGACAGATCGGCTCAGTGGACACCTTCCGCATCCCGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCATCACAGCCACTCCGCGGGGCACTCTTCTCGCCTTTGCTGAGGCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100668 TCATCACAGCCACTCCGCGGGGCACTCTTCTCGCCTTTGCTGAGGCGAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAAATGTCCTCATCCGATGAGGGGGCCAAGTTCATCGCCCTGCGGAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100718 AAAATGTCCTCATCCGATGAGGGGGCCAAGTTCATCGCCCTGCGGAGGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CATGGACCAGG         GCAGCACATGGTCTCCTACAGCGTTCATTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100768 CATGGACCAGGGTA...CAGGCAGCACATGGTCTCCTACAGCGTTCATTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCAATGATGGGGATGTCCCCGATGGGCTGAACCTTGGGGCAGTAGTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101357 TCAATGATGGGGATGTCCCCGATGGGCTGAACCTTGGGGCAGTAGTGAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GATGTTGAGACAGGAGTAGTATTTCTTTTCTACTCCCTTTGTGCTCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101407 GATGTTGAGACAGGAGTAGTATTTCTTTTCTACTCCCTTTGTGCTCACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGCCGGCTGCCAGGTGGCCTCTACCATGTTGGTATGGAGCAAGGATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101457 GGCCGGCTGCCAGGTGGCCTCTACCATGTTGGTATGGAGCAAGGATGATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GTGTTTCCTGGAGCACACCCCGGAATCTCTCCCTGGATATTGGCACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101507 GTGTTTCCTGGAGCACACCCCGGAATCTCTCCCTGGATATTGGCACTGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GTGTTTGCCCCTGGACCGGGCTCTGGTATTCAG         AAACAGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 101557 GTGTTTGCCCCTGGACCGGGCTCTGGTATTCAGGTC...CAGAAACAGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGAGCCACGGAAGGGCCGCCTCATCGTGTGTGGCCATGGGACGCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102164 GGAGCCACGGAAGGGCCGCCTCATCGTGTGTGGCCATGGGACGCTGGAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GGGACGGAGTCTTCTGTCTCCTCAGCGATGATCATGGTGCCTCCTGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102214 GGGACGGAGTCTTCTGTCTCCTCAGCGATGATCATGGTGCCTCCTGGCGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TACGGAAGTGGGGTCAGCGGCATCCCCTACGGTCAGCCCAAGCAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102264 TACGGAAGTGGGGTCAGCGGCATCCCCTACGGTCAGCCCAAGCAGGAAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TGATTTCAATCCTGATGAATGCCAG         CCCTATGAGCTCCCAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 102314 TGATTTCAATCCTGATGAATGCCAGGTC...CAGCCCTATGAGCTCCCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ATGGCTCAGTCGTCATCAATGCCCGAAACCAGAACAACTACCACTGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102529 ATGGCTCAGTCGTCATCAATGCCCGAAACCAGAACAACTACCACTGCCAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 TGCCGAATTGTCCTCCGCAGCTATGATGCCTGTGATACACTAAGGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102579 TGCCGAATTGTCCTCCGCAGCTATGATGCCTGTGATACACTAAGGCCCCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TGATGTGACCTTCGACCCTGAGCTCGTGGACCCTGTGGTAGCTGCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102629 TGATGTGACCTTCGACCCTGAGCTCGTGGACCCTGTGGTAGCTGCAGGAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CTGTAGTCACCAGCTCCGGCATTGTCTTCTTCTCCAACCCAGCACATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102679 CTGTAGTCACCAGCTCCGGCATTGTCTTCTTCTCCAACCCAGCACATCCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GAGTTCC         GAGTGAACCTGACCCTGCGATGGAGCTTCAGCAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102729 GAGTTCCGTG...CAGGAGTGAACCTGACCCTGCGATGGAGCTTCAGCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TGGTACCTCATGGCGGAAAGAGACAGTCCAGCTATGGCCAGGCCCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102866 TGGTACCTCATGGCGGAAAGAGACAGTCCAGCTATGGCCAGGCCCCAGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 GCTATTCATCCCTGGCAACCCTGGAGGGCAGCATGGATGGAGAGGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102916 GCTATTCATCCCTGGCAACCCTGGAGGGCAGCATGGATGGAGAGGAGCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GCCCCCCAGCTCTACGTCCTGTATGAGAAAGGCCGGAACCACTACACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102966 GCCCCCCAGCTCTACGTCCTGTATGAGAAAGGCCGGAACCACTACACAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 GAGCATCTCCGTGGCCAAAATCAGTGTCTATGGGACACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103016 GAGCATCTCCGTGGCCAAAATCAGTGTCTATGGGACACTC