seq1 = pF1KB8012.tfa, 2124 bp
seq2 = pF1KB8012/gi568815587r_6295537.tfa (gi568815587r:6295537_6511347), 215811 bp

>pF1KB8012 2124
>gi568815587r:6295537_6511347 (Chr11)

(complement)

1-721  (100001-100721)   100% ->
722-897  (107526-107701)   100% ->
898-954  (107804-107860)   100% ->
955-1040  (107944-108029)   100% ->
1041-1104  (108140-108203)   100% ->
1105-1254  (108623-108772)   100% ->
1255-1382  (109139-109266)   100% ->
1383-1497  (109660-109774)   100% ->
1498-1582  (109919-110003)   100% ->
1583-1666  (110276-110359)   100% ->
1667-1782  (115133-115248)   100% ->
1783-1959  (115386-115562)   100% ->
1960-2124  (115647-115811)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGTTCCATCATCACTGAGCCAGTCGGCCATTAATGCCAACAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGTTCCATCATCACTGAGCCAGTCGGCCATTAATGCCAACAGCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGAGGCCCCGCACTGAGCCTACCCCTGCCTCTGCACGCTGCCCACAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGAGGCCCCGCACTGAGCCTACCCCTGCCTCTGCACGCTGCCCACAACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCTGCTCAACGCCAAGCTGCAGGCCACAGCTGTGGGACCCAAGGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCTGCTCAACGCCAAGCTGCAGGCCACAGCTGTGGGACCCAAGGACCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCAGCGCCATGGGGGAGGGTGGTGGGCCTGAGCCAGGCCCTGCCAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGCAGCGCCATGGGGGAGGGTGGTGGGCCTGAGCCAGGCCCTGCCAATGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAAGTGGCTAAAAGAGGGCCAGAACCAGCTCCGGCGGGCCGCCACGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAAGTGGCTAAAAGAGGGCCAGAACCAGCTCCGGCGGGCCGCCACGGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCGTGACCAGAATCGCAATGTGACCTTGACCTTGGCGGAGGAGGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCGTGACCAGAATCGCAATGTGACCTTGACCTTGGCGGAGGAGGCCAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGGAGCCTGAGATGGCACCCTTGGGCCCCAAAGGCCTGATACACCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGGAGCCTGAGATGGCACCCTTGGGCCCCAAAGGCCTGATACACCTGTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTCTGAGCTGGAGCTCTCAGCTCACAACGCAGCCAACCGAGGCCTACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTCTGAGCTGGAGCTCTCAGCTCACAACGCAGCCAACCGAGGCCTACGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GACCTGGCCTGATCATCAGCACTCAAGAGCAGGGGCCAGATGAGGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GACCTGGCCTGATCATCAGCACTCAAGAGCAGGGGCCAGATGAGGGAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAGAAGGCGGCCGGGGAGGCCGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAGAAGGCGGCCGGGGAGGCCGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGAGGAGGAGGAGGACTTATCTTCTCCCCCAGGGCTGCCTGAGCCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGAGGAGGAGGAGGACTTATCTTCTCCCCCAGGGCTGCCTGAGCCCCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGAGTGTGGAGGCCCCTCCCAGGCCCCAAGCCCTTACAGATGGCCCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGAGTGTGGAGGCCCCTCCCAGGCCCCAAGCCCTTACAGATGGCCCCCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAACACAGCAAGAGTGCCAGCCTCCTGTTTGGCATGCGGAACAGTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GAACACAGCAAGAGTGCCAGCCTCCTGTTTGGCATGCGGAACAGTGCAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CAGTGATGAGGACTCAAGCTGGGCTACCTTATCCCAGGGCAGCCCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CAGTGATGAGGACTCAAGCTGGGCTACCTTATCCCAGGGCAGCCCCTCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATGGCTCCCCAGAGGACACAG         ATTCCTTCTGGAACCCCAAC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100701 ATGGCTCCCCAGAGGACACAGGTA...CAGATTCCTTCTGGAACCCCAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GCCTTCGAGACGGATTCCGACCTGCCGGCTGGATGGATGAGGGTCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107546 GCCTTCGAGACGGATTCCGACCTGCCGGCTGGATGGATGAGGGTCCAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CACCTCAGGGACCTATTACTGGCACATCCCAACAGGGACCACCCAGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107596 CACCTCAGGGACCTATTACTGGCACATCCCAACAGGGACCACCCAGTGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AACCCCCCGGCCGGGCCTCCCCCTCACAGGGGAGCAGCCCCCAAGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107646 AACCCCCCGGCCGGGCCTCCCCCTCACAGGGGAGCAGCCCCCAAGAGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TCCCAG         CTCACCTGGACAGGTTTTGCTCATGGAGAAGGCTT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107696 TCCCAGGTG...TAGCTCACCTGGACAGGTTTTGCTCATGGAGAAGGCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 TGAGGATGGAGAATTTTGGAAG         GATGAACCCAGTGATGAGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 107839 TGAGGATGGAGAATTTTGGAAGGTG...AAGGATGAACCCAGTGATGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CCCCAATGGAGCTGGGACTGAAGGAACCTGAGGAGGGGACGTTGACCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107963 CCCCAATGGAGCTGGGACTGAAGGAACCTGAGGAGGGGACGTTGACCTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 CCAGCTCAGAGCCTCAG         CCCAGAGCCGTTGCCCCAAGAGGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 108013 CCAGCTCAGAGCCTCAGGTG...CAGCCCAGAGCCGTTGCCCCAAGAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 GGAGAAGCTTCCCCCACGGAATACCAACCCAGGGATCAAG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 108164 GGAGAAGCTTCCCCCACGGAATACCAACCCAGGGATCAAGGTT...CAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 GTTTCGCCGTGCGCTCCCTAGGCTGGGTAGAGATGACCGAGGAGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108624 GTTTCGCCGTGCGCTCCCTAGGCTGGGTAGAGATGACCGAGGAGGAGCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GCCCCTGGACGCAGCAGTGTGGCAGTCAACAATTGCATCCGTCAGCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108674 GCCCCTGGACGCAGCAGTGTGGCAGTCAACAATTGCATCCGTCAGCTCTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 TTACCACAAAAACAACCTGCATGACCCCATGTCTGGGGGCTGGGGGGAA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 108724 TTACCACAAAAACAACCTGCATGACCCCATGTCTGGGGGCTGGGGGGAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1255         GGAAAGGATCTGCTACTGCAGCTGGAGGATGAGACACTAAAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108774 TA...CAGGGAAAGGATCTGCTACTGCAGCTGGAGGATGAGACACTAAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 CTAGTGGAGCCACAGAGCCAGGCACTGCTGCACGCCCAACCCATCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109181 CTAGTGGAGCCACAGAGCCAGGCACTGCTGCACGCCCAACCCATCATCAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 CATCCGCGTGTGGGGCGTCGGGCGGGACAGTGGAAG         GGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 109231 CATCCGCGTGTGGGGCGTCGGGCGGGACAGTGGAAGGTG...CAGGGACT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 TTGCCTACGTAGCTCGTGATAAGCTGACCCAGATGCTCAAGTGCCACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109665 TTGCCTACGTAGCTCGTGATAAGCTGACCCAGATGCTCAAGTGCCACGTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 TTTCGCTGTGAGGCACCTGCCAAGAACATCGCCACCAGCCTGCATGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109715 TTTCGCTGTGAGGCACCTGCCAAGAACATCGCCACCAGCCTGCATGAGAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 CTGCTCTAAG         ATCATGGCCGAACGGCGTAATGCCCGCTGCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 109765 CTGCTCTAAGGCA...CAGATCATGGCCGAACGGCGTAATGCCCGCTGCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 TGGTAAATGGACTCTCCCTGGACCACTCTAAACTTGTGGATGTCCCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109950 TGGTAAATGGACTCTCCCTGGACCACTCTAAACTTGTGGATGTCCCTTTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 CAAG         TGGAATTCCCAGCGCCTAAGAATGAGTTGGTCCAGAA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110000 CAAGGTC...TAGTGGAATTCCCAGCGCCTAAGAATGAGTTGGTCCAGAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 GTTCCAAGTCTATTACCTGGGGAATGTACCTGTTGCTAAACCTGTTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 110313 GTTCCAAGTCTATTACCTGGGGAATGTACCTGTTGCTAAACCTGTTGGTA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1667       GGGTAGATGTGATTAATGGGGCCCTCGAGTCAGTCCTGTCCTCC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110363 ...TAGGGGTAGATGTGATTAATGGGGCCCTCGAGTCAGTCCTGTCCTCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 AGCAGCCGTGAACAATGGACCCCAAGTCATGTCAGTGTGGCCCCTGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115177 AGCAGCCGTGAACAATGGACCCCAAGTCATGTCAGTGTGGCCCCTGCTAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 CCTCACCATCTTGCACCAGCAG         ACAGAGGCAGTGCTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 115227 CCTCACCATCTTGCACCAGCAGGTA...CAGACAGAGGCAGTGCTGGGAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 AGTGTCGGGTGCGTTTCCTCTCCTTCCTGGCCGTGGGCAGAGATGTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115405 AGTGTCGGGTGCGTTTCCTCTCCTTCCTGGCCGTGGGCAGAGATGTCCAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 ACGTTTGCATTCATCATGGCTGCCGGCCCAGCCTCCTTCTGCTGCCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115455 ACGTTTGCATTCATCATGGCTGCCGGCCCAGCCTCCTTCTGCTGCCACAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 GTTCTGGTGCGAGCCCAATGCTGCCAGCCTCTCAGAGGCTGTGCAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115505 GTTCTGGTGCGAGCCCAATGCTGCCAGCCTCTCAGAGGCTGTGCAGGCTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 CGTGCATG         CTTCGCTACCAGAAGTGTCTGGATGCCCGTTCC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 115555 CGTGCATGGTA...CAGCTTCGCTACCAGAAGTGTCTGGATGCCCGTTCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 CAGGCCTCCACCTCCTGCCTCCCAGCACCCCCTGCTGAGTCTGTGGCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115680 CAGGCCTCCACCTCCTGCCTCCCAGCACCCCCTGCTGAGTCTGTGGCACG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 GCGTGTAGGGTGGACTGTCCGCAGGGGTGTTCAGTCGCTGTGGGGCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115730 GCGTGTAGGGTGGACTGTCCGCAGGGGTGTTCAGTCGCTGTGGGGCTCCC

   2200     .    :    .    :    .    :
   2093 TGAAGCCCAAACGGCTGGGGGCCCATACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 115780 TGAAGCCCAAACGGCTGGGGGCCCATACCCCA