seq1 = pF1KE3946.tfa, 873 bp seq2 = pF1KE3946/gi568815596f_130243085.tfa (gi568815596f:130243085_130446465), 203381 bp >pF1KE3946 873 >gi568815596f:130243085_130446465 (Chr2) 1-112 (100000-100110) 99% -> 113-196 (101545-101628) 100% -> 197-306 (102292-102401) 100% -> 307-439 (102483-102615) 100% -> 440-594 (102695-102849) 100% -> 595-689 (102934-103028) 100% -> 690-763 (103117-103190) 100% -> 764-873 (103272-103381) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGCTGCGCCGCGAGGCCCGCCTGCGCCGCGAGTACCTGTACCGCAAGGC |-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100000 A GCTGCGCCGCGAGGCCCGCCTGCGCCGCGAGTACCTGTACCGCAAGGC 50 . : . : . : . : . : 51 CCGGGAGGAGGCGCAGCGCTCAGCCCAGGAGAGGAAGGAGCGGCTGCGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100049 CCGGGAGGAGGCGCAGCGCTCAGCCCAGGAGAGGAAGGAGCGGCTGCGGC 100 . : . : . : . : . : 101 GCGCGCTGGAAG AAAACCGCCTGATTCCCACTGAGTTACGC ||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||| 100099 GCGCGCTGGAAGGTA...CAGAAAACCGCCTGATTCCCACTGAGTTACGC 150 . : . : . : . : . : 142 CGAGAGGCTCTGGCCTTACAGGGGTCCCTGGAGTTTGATGATGCTGGAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101574 CGAGAGGCTCTGGCCTTACAGGGGTCCCTGGAGTTTGATGATGCTGGAGG 200 . : . : . : . : . : 192 TGAAG GTGTGACCAGCCACGTGGATGATGAATACCGATGGG |||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101624 TGAAGGTA...CAGGTGTGACCAGCCACGTGGATGATGAATACCGATGGG 250 . : . : . : . : . : 233 CAGGAGTCGAGGATCCCAAGGTTATGATCACTACCTCCCGAGACCCCAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102328 CAGGAGTCGAGGATCCCAAGGTTATGATCACTACCTCCCGAGACCCCAGT 300 . : . : . : . : . : 283 TCCCGCCTCAAGATGTTTGCAAAG GAGCTGAAGCTGGTGTT ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 102378 TCCCGCCTCAAGATGTTTGCAAAGGTA...CAGGAGCTGAAGCTGGTGTT 350 . : . : . : . : . : 324 CCCGGGCGCCCAGCGAATGAACCGAGGTCGACATGAAGTGGGGGCACTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102500 CCCGGGCGCCCAGCGAATGAACCGAGGTCGACATGAAGTGGGGGCACTGG 400 . : . : . : . : . : 374 TGCGAGCCTGCAAAGCCAACGGCGTCACCGATCTGCTGGTCGTTCACGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102550 TGCGAGCCTGCAAAGCCAACGGCGTCACCGATCTGCTGGTCGTTCACGAG 450 . : . : . : . : . : 424 CATCGGGGCACACCTG TGGGGCTCATCGTCAGCCACCTGCC ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 102600 CATCGGGGCACACCTGGTA...CAGTGGGGCTCATCGTCAGCCACCTGCC 500 . : . : . : . : . : 465 CTTTGGTCCTACTGCCTACTTCACGCTGTGCAATGTGGTCATGCGGCATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102720 CTTTGGTCCTACTGCCTACTTCACGCTGTGCAATGTGGTCATGCGGCATG 550 . : . : . : . : . : 515 ACATCCCAGACCTGGGCACCATGTCGGAGGCCAAGCCCCACCTCATCACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102770 ACATCCCAGACCTGGGCACCATGTCGGAGGCCAAGCCCCACCTCATCACA 600 . : . : . : . : . : 565 CACGGCTTCTCCTCCCGCCTGGGCAAGCGG GTCTCTGACAT ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 102820 CACGGCTTCTCCTCCCGCCTGGGCAAGCGGGTG...CAGGTCTCTGACAT 650 . : . : . : . : . : 606 CCTCCGATACCTATTTCCCGTGCCCAAAGATGACAGCCACCGGGTCATCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102945 CCTCCGATACCTATTTCCCGTGCCCAAAGATGACAGCCACCGGGTCATCA 700 . : . : . : . : . : 656 CCTTCGCAAACCAGGACGACTACATATCATTCCG GCACCAT ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| 102995 CCTTCGCAAACCAGGACGACTACATATCATTCCGGTG...CAGGCACCAT 750 . : . : . : . : . : 697 GTGTATAAGAAGACAGACCACCGCAACGTGGAGCTCACTGAGGTCGGGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103124 GTGTATAAGAAGACAGACCACCGCAACGTGGAGCTCACTGAGGTCGGGCC 800 . : . : . : . : . : 747 CCGCTTTGAGCTGAAGC TGTACATGATCCGTCTGGGCACGC |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| 103174 CCGCTTTGAGCTGAAGCGTG...CAGTGTACATGATCCGTCTGGGCACGC 850 . : . : . : . : . : 788 TGGAGCAGGAGGCCACAGCAGACGTGGAGTGGCGCTGGCACCCTTACACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103296 TGGAGCAGGAGGCCACAGCAGACGTGGAGTGGCGCTGGCACCCTTACACC 900 . : . : . : . 838 AATACCGCACGCAAGAGAGTCTTCCTGAGCACCGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103346 AATACCGCACGCAAGAGAGTCTTCCTGAGCACCGAG