Result of FASTA (omim) for pF1KB7613
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7613, 303 aa
  1>>>pF1KB7613 303 - 303 aa - 303 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0851+/-0.000476; mu= -24.0563+/- 0.028
 mean_var=694.3805+/-155.966, 0's: 0 Z-trim(120.6): 845  B-trim: 1520 in 1/57
 Lambda= 0.048672
 statistics sampled from 34547 (35977) to 34547 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.751), E-opt: 0.2 (0.422), width:  16
 Scan time:  7.350

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_000066 (OMIM: 123829,609048) cyclin-dependent k ( 303) 2058 159.5 7.5e-39
NP_001138778 (OMIM: 603368,616080) cyclin-dependen ( 326) 1396 113.1 7.7e-25
XP_006715898 (OMIM: 603368,616080) PREDICTED: cycl ( 326) 1396 113.1 7.7e-25
NP_001250 (OMIM: 603368,616080) cyclin-dependent k ( 326) 1396 113.1 7.7e-25
NP_001249 (OMIM: 123828) cyclin-dependent kinase 3 ( 305)  801 71.3 2.8e-12
NP_001777 (OMIM: 116940) cyclin-dependent kinase 1 ( 297)  787 70.3 5.4e-12
XP_005270360 (OMIM: 116940) PREDICTED: cyclin-depe ( 297)  787 70.3 5.4e-12
NP_001307847 (OMIM: 116940) cyclin-dependent kinas ( 297)  787 70.3 5.4e-12
NP_001789 (OMIM: 116953) cyclin-dependent kinase 2 ( 298)  743 67.2 4.6e-11
XP_006721373 (OMIM: 603464) PREDICTED: cyclin-depe ( 343)  721 65.7 1.5e-10
NP_443714 (OMIM: 603464) cyclin-dependent kinase 1 ( 360)  721 65.7 1.5e-10
NP_277022 (OMIM: 176873) cyclin-dependent kinase 1 ( 526)  708 65.0 3.7e-10
NP_277025 (OMIM: 176873) cyclin-dependent kinase 1 ( 565)  708 65.0 3.8e-10
XP_011540798 (OMIM: 176873) PREDICTED: cyclin-depe ( 578)  708 65.1 3.9e-10
NP_277024 (OMIM: 176873) cyclin-dependent kinase 1 ( 748)  708 65.2 4.6e-10
XP_011540797 (OMIM: 176873) PREDICTED: cyclin-depe ( 760)  708 65.2 4.6e-10
XP_016858417 (OMIM: 176873) PREDICTED: cyclin-depe ( 761)  708 65.2 4.6e-10
XP_016858416 (OMIM: 176873) PREDICTED: cyclin-depe ( 770)  708 65.2 4.7e-10
XP_011540796 (OMIM: 176873) PREDICTED: cyclin-depe ( 770)  708 65.2 4.7e-10
NP_277071 (OMIM: 116951) cyclin-dependent kinase 1 ( 770)  708 65.2 4.7e-10
NP_001278274 (OMIM: 176873) cyclin-dependent kinas ( 772)  708 65.2 4.7e-10
NP_001300911 (OMIM: 116951) cyclin-dependent kinas ( 779)  708 65.2 4.7e-10
NP_076916 (OMIM: 116951) cyclin-dependent kinase 1 ( 780)  708 65.2 4.7e-10
XP_016858415 (OMIM: 176873) PREDICTED: cyclin-depe ( 781)  708 65.2 4.7e-10
NP_277021 (OMIM: 176873) cyclin-dependent kinase 1 ( 782)  708 65.2 4.7e-10
NP_001300825 (OMIM: 116951) cyclin-dependent kinas ( 783)  708 65.2 4.7e-10
XP_006711128 (OMIM: 176873) PREDICTED: cyclin-depe ( 785)  708 65.2 4.7e-10
XP_016858414 (OMIM: 176873) PREDICTED: cyclin-depe ( 791)  708 65.2 4.8e-10
XP_011540795 (OMIM: 176873) PREDICTED: cyclin-depe ( 794)  708 65.2 4.8e-10
NP_001778 (OMIM: 176873) cyclin-dependent kinase 1 ( 795)  708 65.2 4.8e-10
XP_011540794 (OMIM: 176873) PREDICTED: cyclin-depe ( 804)  708 65.2 4.8e-10
XP_011540793 (OMIM: 176873) PREDICTED: cyclin-depe ( 804)  708 65.2 4.8e-10
XP_011540792 (OMIM: 176873) PREDICTED: cyclin-depe ( 804)  708 65.2 4.8e-10
XP_016879296 (OMIM: 603464) PREDICTED: cyclin-depe ( 337)  675 62.5 1.4e-09
XP_006721371 (OMIM: 603464) PREDICTED: cyclin-depe ( 354)  675 62.5 1.4e-09
NP_004926 (OMIM: 123831,616342) cyclin-dependent-l ( 292)  651 60.7   4e-09
NP_001790 (OMIM: 601955) cyclin-dependent kinase 7 ( 346)  650 60.7 4.7e-09
NP_997667 (OMIM: 169190) cyclin-dependent kinase 1 ( 474)  639 60.1 9.9e-09
NP_002587 (OMIM: 169190) cyclin-dependent kinase 1 ( 474)  639 60.1 9.9e-09
NP_997668 (OMIM: 169190) cyclin-dependent kinase 1 ( 504)  639 60.1   1e-08
NP_443713 (OMIM: 603464) cyclin-dependent kinase 1 ( 272)  630 59.2 1.1e-08
XP_016879299 (OMIM: 603464) PREDICTED: cyclin-depe ( 272)  630 59.2 1.1e-08
XP_011507904 (OMIM: 169190) PREDICTED: cyclin-depe ( 542)  639 60.2 1.1e-08
XP_016856912 (OMIM: 169190) PREDICTED: cyclin-depe ( 572)  639 60.2 1.1e-08
NP_001153839 (OMIM: 603464) cyclin-dependent kinas ( 289)  630 59.2 1.1e-08
XP_016879297 (OMIM: 603464) PREDICTED: cyclin-depe ( 289)  630 59.2 1.1e-08
NP_002586 (OMIM: 603440) cyclin-dependent kinase 1 ( 523)  637 60.0 1.2e-08
XP_016874894 (OMIM: 603440) PREDICTED: cyclin-depe ( 523)  637 60.0 1.2e-08
XP_016874895 (OMIM: 603440) PREDICTED: cyclin-depe ( 523)  637 60.0 1.2e-08
NP_001163935 (OMIM: 603440) cyclin-dependent kinas ( 523)  637 60.0 1.2e-08


>>NP_000066 (OMIM: 123829,609048) cyclin-dependent kinas  (303 aa)
 initn: 2058 init1: 2058 opt: 2058  Z-score: 818.5  bits: 159.5 E(85289): 7.5e-39
Smith-Waterman score: 2058; 100.0% identity (100.0% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-303)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MATSRYEPVAEIGVGAYGTVYKARDPHSGHFVALKSVRVPNGGGGGGGLPISTVREVALL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MATSRYEPVAEIGVGAYGTVYKARDPHSGHFVALKSVRVPNGGGGGGGLPISTVREVALL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 RRLEAFEHPNVVRLMDVCATSRTDREIKVTLVFEHVDQDLRTYLDKAPPPGLPAETIKDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RRLEAFEHPNVVRLMDVCATSRTDREIKVTLVFEHVDQDLRTYLDKAPPPGLPAETIKDL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 MRQFLRGLDFLHANCIVHRDLKPENILVTSGGTVKLADFGLARIYSYQMALTPVVVTLWY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MRQFLRGLDFLHANCIVHRDLKPENILVTSGGTVKLADFGLARIYSYQMALTPVVVTLWY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 RAPEVLLQSTYATPVDMWSVGCIFAEMFRRKPLFCGNSEADQLGKIFDLIGLPPEDDWPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RAPEVLLQSTYATPVDMWSVGCIFAEMFRRKPLFCGNSEADQLGKIFDLIGLPPEDDWPR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 DVSLPRGAFPPRGPRPVQSVVPEMEESGAQLLLEMLTFNPHKRISAFRALQHSYLHKDEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DVSLPRGAFPPRGPRPVQSVVPEMEESGAQLLLEMLTFNPHKRISAFRALQHSYLHKDEG
              250       260       270       280       290       300

          
pF1KB7 NPE
       :::
NP_000 NPE
          

>>NP_001138778 (OMIM: 603368,616080) cyclin-dependent ki  (326 aa)
 initn: 1370 init1: 1242 opt: 1396  Z-score: 566.9  bits: 113.1 E(85289): 7.7e-25
Smith-Waterman score: 1396; 70.2% identity (88.0% similar) in 299 aa overlap (2-299:9-304)

                      10        20         30        40        50  
pF1KB7        MATSRYEPVAEIGVGAYGTVYKARD-PHSGHFVALKSVRVPNGGGGGGGLPIS
               : ..:: ::::: :::: :.::::  ..:.::::: ::: .:     :.:.:
NP_001 MEKDGLCRADQQYECVAEIGEGAYGKVFKARDLKNGGRFVALKRVRVQTGEE---GMPLS
               10        20        30        40        50          

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB7 TVREVALLRRLEAFEHPNVVRLMDVCATSRTDREIKVTLVFEHVDQDLRTYLDKAPPPGL
       :.::::.::.::.:::::::::.:::..:::::: :.::::::::::: :::::.: ::.
NP_001 TIREVAVLRHLETFEHPNVVRLFDVCTVSRTDRETKLTLVFEHVDQDLTTYLDKVPEPGV
        60        70        80        90       100       110       

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB7 PAETIKDLMRQFLRGLDFLHANCIVHRDLKPENILVTSGGTVKLADFGLARIYSYQMALT
       :.:::::.: :.::::::::.. .:::::::.::::::.: .::::::::::::.:::::
NP_001 PTETIKDMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQNILVTSSGQIKLADFGLARIYSFQMALT
       120       130       140       150       160       170       

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB7 PVVVTLWYRAPEVLLQSTYATPVDMWSVGCIFAEMFRRKPLFCGNSEADQLGKIFDLIGL
        ::::::::::::::::.::::::.::::::::::::::::: :.:..::::::.:.:::
NP_001 SVVVTLWYRAPEVLLQSSYATPVDLWSVGCIFAEMFRRKPLFRGSSDVDQLGKILDVIGL
       180       190       200       210       220       230       

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB7 PPEDDWPRDVSLPRGAFPPRGPRPVQSVVPEMEESGAQLLLEMLTFNPHKRISAFRALQH
       : :.::::::.::: ::  .. .:... : ...: : .:::. ::::: :::::. ::.:
NP_001 PGEEDWPRDVALPRQAFHSKSAQPIEKFVTDIDELGKDLLLKCLTFNPAKRISAYSALSH
       240       250       260       270       280       290       

            300                     
pF1KB7 SYLHKDEGNPE                  
        :..  :                      
NP_001 PYFQDLERCKENLDSHLPPSQNTSELNTA
       300       310       320      

>>XP_006715898 (OMIM: 603368,616080) PREDICTED: cyclin-d  (326 aa)
 initn: 1370 init1: 1242 opt: 1396  Z-score: 566.9  bits: 113.1 E(85289): 7.7e-25
Smith-Waterman score: 1396; 70.2% identity (88.0% similar) in 299 aa overlap (2-299:9-304)

                      10        20         30        40        50  
pF1KB7        MATSRYEPVAEIGVGAYGTVYKARD-PHSGHFVALKSVRVPNGGGGGGGLPIS
               : ..:: ::::: :::: :.::::  ..:.::::: ::: .:     :.:.:
XP_006 MEKDGLCRADQQYECVAEIGEGAYGKVFKARDLKNGGRFVALKRVRVQTGEE---GMPLS
               10        20        30        40        50          

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB7 TVREVALLRRLEAFEHPNVVRLMDVCATSRTDREIKVTLVFEHVDQDLRTYLDKAPPPGL
       :.::::.::.::.:::::::::.:::..:::::: :.::::::::::: :::::.: ::.
XP_006 TIREVAVLRHLETFEHPNVVRLFDVCTVSRTDRETKLTLVFEHVDQDLTTYLDKVPEPGV
        60        70        80        90       100       110       

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB7 PAETIKDLMRQFLRGLDFLHANCIVHRDLKPENILVTSGGTVKLADFGLARIYSYQMALT
       :.:::::.: :.::::::::.. .:::::::.::::::.: .::::::::::::.:::::
XP_006 PTETIKDMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQNILVTSSGQIKLADFGLARIYSFQMALT
       120       130       140       150       160       170       

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB7 PVVVTLWYRAPEVLLQSTYATPVDMWSVGCIFAEMFRRKPLFCGNSEADQLGKIFDLIGL
        ::::::::::::::::.::::::.::::::::::::::::: :.:..::::::.:.:::
XP_006 SVVVTLWYRAPEVLLQSSYATPVDLWSVGCIFAEMFRRKPLFRGSSDVDQLGKILDVIGL
       180       190       200       210       220       230       

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB7 PPEDDWPRDVSLPRGAFPPRGPRPVQSVVPEMEESGAQLLLEMLTFNPHKRISAFRALQH
       : :.::::::.::: ::  .. .:... : ...: : .:::. ::::: :::::. ::.:
XP_006 PGEEDWPRDVALPRQAFHSKSAQPIEKFVTDIDELGKDLLLKCLTFNPAKRISAYSALSH
       240       250       260       270       280       290       

            300                     
pF1KB7 SYLHKDEGNPE                  
        :..  :                      
XP_006 PYFQDLERCKENLDSHLPPSQNTSELNTA
       300       310       320      

>>NP_001250 (OMIM: 603368,616080) cyclin-dependent kinas  (326 aa)
 initn: 1370 init1: 1242 opt: 1396  Z-score: 566.9  bits: 113.1 E(85289): 7.7e-25
Smith-Waterman score: 1396; 70.2% identity (88.0% similar) in 299 aa overlap (2-299:9-304)

                      10        20         30        40        50  
pF1KB7        MATSRYEPVAEIGVGAYGTVYKARD-PHSGHFVALKSVRVPNGGGGGGGLPIS
               : ..:: ::::: :::: :.::::  ..:.::::: ::: .:     :.:.:
NP_001 MEKDGLCRADQQYECVAEIGEGAYGKVFKARDLKNGGRFVALKRVRVQTGEE---GMPLS
               10        20        30        40        50          

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB7 TVREVALLRRLEAFEHPNVVRLMDVCATSRTDREIKVTLVFEHVDQDLRTYLDKAPPPGL
       :.::::.::.::.:::::::::.:::..:::::: :.::::::::::: :::::.: ::.
NP_001 TIREVAVLRHLETFEHPNVVRLFDVCTVSRTDRETKLTLVFEHVDQDLTTYLDKVPEPGV
        60        70        80        90       100       110       

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB7 PAETIKDLMRQFLRGLDFLHANCIVHRDLKPENILVTSGGTVKLADFGLARIYSYQMALT
       :.:::::.: :.::::::::.. .:::::::.::::::.: .::::::::::::.:::::
NP_001 PTETIKDMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQNILVTSSGQIKLADFGLARIYSFQMALT
       120       130       140       150       160       170       

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB7 PVVVTLWYRAPEVLLQSTYATPVDMWSVGCIFAEMFRRKPLFCGNSEADQLGKIFDLIGL
        ::::::::::::::::.::::::.::::::::::::::::: :.:..::::::.:.:::
NP_001 SVVVTLWYRAPEVLLQSSYATPVDLWSVGCIFAEMFRRKPLFRGSSDVDQLGKILDVIGL
       180       190       200       210       220       230       

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB7 PPEDDWPRDVSLPRGAFPPRGPRPVQSVVPEMEESGAQLLLEMLTFNPHKRISAFRALQH
       : :.::::::.::: ::  .. .:... : ...: : .:::. ::::: :::::. ::.:
NP_001 PGEEDWPRDVALPRQAFHSKSAQPIEKFVTDIDELGKDLLLKCLTFNPAKRISAYSALSH
       240       250       260       270       280       290       

            300                     
pF1KB7 SYLHKDEGNPE                  
        :..  :                      
NP_001 PYFQDLERCKENLDSHLPPSQNTSELNTA
       300       310       320      

>>NP_001249 (OMIM: 123828) cyclin-dependent kinase 3 [Ho  (305 aa)
 initn: 726 init1: 277 opt: 801  Z-score: 341.4  bits: 71.3 E(85289): 2.8e-12
Smith-Waterman score: 886; 45.5% identity (73.1% similar) in 301 aa overlap (6-302:4-293)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MATSRYEPVAEIGVGAYGTVYKARDPHSGHFVALKSVRVPNGGGGGGGLPISTVREVALL
            .. : .:: :.::.::::.. ..:..::::..:.        :.: ...::..::
NP_001   MDMFQKVEKIGEGTYGVVYKAKNRETGQLVALKKIRLDLEM---EGVPSTAIREISLL
                 10        20        30        40           50     

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 RRLEAFEHPNVVRLMDVCATSRTDREIKVTLVFEHVDQDLRTYLDKAPPPGLPAETIKDL
       ..:.   :::.:::.::  . :     :. :::: ..:::. :.:..:   :: . ::. 
NP_001 KELK---HPNIVRLLDVVHNER-----KLYLVFEFLSQDLKKYMDSTPGSELPLHLIKSY
             60        70             80        90       100       

              130       140       150       160        170         
pF1KB7 MRQFLRGLDFLHANCIVHRDLKPENILVTSGGTVKLADFGLARIYSYQM-ALTPVVVTLW
       . :.:.:..: :.. ..::::::.:.:..  :..::::::::: ..  . . :  :::::
NP_001 LFQLLQGVSFCHSHRVIHRDLKPQNLLINELGAIKLADFGLARAFGVPLRTYTHEVVTLW
       110       120       130       140       150       160       

     180       190        200       210       220       230        
pF1KB7 YRAPEVLLQST-YATPVDMWSVGCIFAEMFRRKPLFCGNSEADQLGKIFDLIGLPPEDDW
       :::::.:: :  :.: ::.::.:::::::  :: :: :.:: ::: .:: ..: : :: :
NP_001 YRAPEILLGSKFYTTAVDIWSIGCIFAEMVTRKALFPGDSEIDQLFRIFRMLGTPSEDTW
       170       180       190       200       210       220       

      240         250       260       270       280       290      
pF1KB7 PRDVSLP--RGAFPPRGPRPVQSVVPEMEESGAQLLLEMLTFNPHKRISAFRALQHSYLH
       :  ..::  .:.::    . .. .::..:  : .::...: ..: .::.:  :: : :. 
NP_001 PGVTQLPDYKGSFPKWTRKGLEEIVPNLEPEGRDLLMQLLQYDPSQRITAKTALAHPYFS
       230       240       250       260       270       280       

        300              
pF1KB7 KDEGNPE           
       . : .:            
NP_001 SPEPSPAARQYVLQRFRH
       290       300     

>>NP_001777 (OMIM: 116940) cyclin-dependent kinase 1 iso  (297 aa)
 initn: 611 init1: 217 opt: 787  Z-score: 336.2  bits: 70.3 E(85289): 5.4e-12
Smith-Waterman score: 787; 43.2% identity (70.9% similar) in 296 aa overlap (6-296:4-288)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MATSRYEPVAEIGVGAYGTVYKARDPHSGHFVALKSVRVPNGGGGGGGLPISTVREVALL
            :  . .:: :.::.:::.:   .:. ::.:..:. .   :   .: ...::..::
NP_001   MEDYTKIEKIGEGTYGVVYKGRHKTTGQVVAMKKIRLESEEEG---VPSTAIREISLL
                 10        20        30        40           50     

               70        80        90       100       110          
pF1KB7 RRLEAFEHPNVVRLMDVCATSRTDREIKVTLVFEHVDQDLRTYLDKAPPPG-LPAETIKD
       ..:.   :::.: :.::       .. .. :.:: ...::. :::. ::   . .  .:.
NP_001 KELR---HPNIVSLQDVLM-----QDSRLYLIFEFLSMDLKKYLDSIPPGQYMDSSLVKS
             60        70             80        90       100       

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 LMRQFLRGLDFLHANCIVHRDLKPENILVTSGGTVKLADFGLARIYSYQMAL-TPVVVTL
        . :.:.:. : :.  ..::::::.:.:. . ::.::::::::: ..  . . :  ::::
NP_001 YLYQILQGIVFCHSRRVLHRDLKPQNLLIDDKGTIKLADFGLARAFGIPIRVYTHEVVTL
       110       120       130       140       150       160       

      180       190        200       210       220       230       
pF1KB7 WYRAPEVLLQST-YATPVDMWSVGCIFAEMFRRKPLFCGNSEADQLGKIFDLIGLPPEDD
       :::.::::: :. :.::::.::.: ::::.  .:::: :.:: ::: .::  .: : .. 
NP_001 WYRSPEVLLGSARYSTPVDIWSIGTIFAELATKKPLFHGDSEIDQLFRIFRALGTPNNEV
       170       180       190       200       210       220       

       240         250       260       270       280       290     
pF1KB7 WPRDVSLP--RGAFPPRGPRPVQSVVPEMEESGAQLLLEMLTFNPHKRISAFRALQHSYL
       ::.  ::   ...::   :  . : : ...:.: .:: .:: ..: ::::.  ::.: :.
NP_001 WPEVESLQDYKNTFPKWKPGSLASHVKNLDENGLDLLSKMLIYDPAKRISGKMALNHPYF
       230       240       250       260       270       280       

         300     
pF1KB7 HKDEGNPE  
       .         
NP_001 NDLDNQIKKM
       290       

>>XP_005270360 (OMIM: 116940) PREDICTED: cyclin-dependen  (297 aa)
 initn: 611 init1: 217 opt: 787  Z-score: 336.2  bits: 70.3 E(85289): 5.4e-12
Smith-Waterman score: 787; 43.2% identity (70.9% similar) in 296 aa overlap (6-296:4-288)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MATSRYEPVAEIGVGAYGTVYKARDPHSGHFVALKSVRVPNGGGGGGGLPISTVREVALL
            :  . .:: :.::.:::.:   .:. ::.:..:. .   :   .: ...::..::
XP_005   MEDYTKIEKIGEGTYGVVYKGRHKTTGQVVAMKKIRLESEEEG---VPSTAIREISLL
                 10        20        30        40           50     

               70        80        90       100       110          
pF1KB7 RRLEAFEHPNVVRLMDVCATSRTDREIKVTLVFEHVDQDLRTYLDKAPPPG-LPAETIKD
       ..:.   :::.: :.::       .. .. :.:: ...::. :::. ::   . .  .:.
XP_005 KELR---HPNIVSLQDVLM-----QDSRLYLIFEFLSMDLKKYLDSIPPGQYMDSSLVKS
             60        70             80        90       100       

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 LMRQFLRGLDFLHANCIVHRDLKPENILVTSGGTVKLADFGLARIYSYQMAL-TPVVVTL
        . :.:.:. : :.  ..::::::.:.:. . ::.::::::::: ..  . . :  ::::
XP_005 YLYQILQGIVFCHSRRVLHRDLKPQNLLIDDKGTIKLADFGLARAFGIPIRVYTHEVVTL
       110       120       130       140       150       160       

      180       190        200       210       220       230       
pF1KB7 WYRAPEVLLQST-YATPVDMWSVGCIFAEMFRRKPLFCGNSEADQLGKIFDLIGLPPEDD
       :::.::::: :. :.::::.::.: ::::.  .:::: :.:: ::: .::  .: : .. 
XP_005 WYRSPEVLLGSARYSTPVDIWSIGTIFAELATKKPLFHGDSEIDQLFRIFRALGTPNNEV
       170       180       190       200       210       220       

       240         250       260       270       280       290     
pF1KB7 WPRDVSLP--RGAFPPRGPRPVQSVVPEMEESGAQLLLEMLTFNPHKRISAFRALQHSYL
       ::.  ::   ...::   :  . : : ...:.: .:: .:: ..: ::::.  ::.: :.
XP_005 WPEVESLQDYKNTFPKWKPGSLASHVKNLDENGLDLLSKMLIYDPAKRISGKMALNHPYF
       230       240       250       260       270       280       

         300     
pF1KB7 HKDEGNPE  
       .         
XP_005 NDLDNQIKKM
       290       

>>NP_001307847 (OMIM: 116940) cyclin-dependent kinase 1   (297 aa)
 initn: 611 init1: 217 opt: 787  Z-score: 336.2  bits: 70.3 E(85289): 5.4e-12
Smith-Waterman score: 787; 43.2% identity (70.9% similar) in 296 aa overlap (6-296:4-288)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MATSRYEPVAEIGVGAYGTVYKARDPHSGHFVALKSVRVPNGGGGGGGLPISTVREVALL
            :  . .:: :.::.:::.:   .:. ::.:..:. .   :   .: ...::..::
NP_001   MEDYTKIEKIGEGTYGVVYKGRHKTTGQVVAMKKIRLESEEEG---VPSTAIREISLL
                 10        20        30        40           50     

               70        80        90       100       110          
pF1KB7 RRLEAFEHPNVVRLMDVCATSRTDREIKVTLVFEHVDQDLRTYLDKAPPPG-LPAETIKD
       ..:.   :::.: :.::       .. .. :.:: ...::. :::. ::   . .  .:.
NP_001 KELR---HPNIVSLQDVLM-----QDSRLYLIFEFLSMDLKKYLDSIPPGQYMDSSLVKS
             60        70             80        90       100       

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 LMRQFLRGLDFLHANCIVHRDLKPENILVTSGGTVKLADFGLARIYSYQMAL-TPVVVTL
        . :.:.:. : :.  ..::::::.:.:. . ::.::::::::: ..  . . :  ::::
NP_001 YLYQILQGIVFCHSRRVLHRDLKPQNLLIDDKGTIKLADFGLARAFGIPIRVYTHEVVTL
       110       120       130       140       150       160       

      180       190        200       210       220       230       
pF1KB7 WYRAPEVLLQST-YATPVDMWSVGCIFAEMFRRKPLFCGNSEADQLGKIFDLIGLPPEDD
       :::.::::: :. :.::::.::.: ::::.  .:::: :.:: ::: .::  .: : .. 
NP_001 WYRSPEVLLGSARYSTPVDIWSIGTIFAELATKKPLFHGDSEIDQLFRIFRALGTPNNEV
       170       180       190       200       210       220       

       240         250       260       270       280       290     
pF1KB7 WPRDVSLP--RGAFPPRGPRPVQSVVPEMEESGAQLLLEMLTFNPHKRISAFRALQHSYL
       ::.  ::   ...::   :  . : : ...:.: .:: .:: ..: ::::.  ::.: :.
NP_001 WPEVESLQDYKNTFPKWKPGSLASHVKNLDENGLDLLSKMLIYDPAKRISGKMALNHPYF
       230       240       250       260       270       280       

         300     
pF1KB7 HKDEGNPE  
       .         
NP_001 NDLDNQIKKM
       290       

>>NP_001789 (OMIM: 116953) cyclin-dependent kinase 2 iso  (298 aa)
 initn: 781 init1: 261 opt: 743  Z-score: 319.5  bits: 67.2 E(85289): 4.6e-11
Smith-Waterman score: 833; 45.2% identity (71.1% similar) in 301 aa overlap (6-302:4-292)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MATSRYEPVAEIGVGAYGTVYKARDPHSGHFVALKSVRVPNGGGGGGGLPISTVREVALL
            .. : .:: :.::.:::::.  .:. ::::..:. .      :.: ...::..::
NP_001   MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTET---EGVPSTAIREISLL
                 10        20        30        40           50     

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 RRLEAFEHPNVVRLMDVCATSRTDREIKVTLVFEHVDQDLRTYLDKAPPPGLPAETIKDL
       ..:.   :::.:.:.::  :     : :. :::: . :::. ..: .   :.:   ::. 
NP_001 KELN---HPNIVKLLDVIHT-----ENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSY
             60        70             80        90       100       

              130       140       150       160        170         
pF1KB7 MRQFLRGLDFLHANCIVHRDLKPENILVTSGGTVKLADFGLARIYSYQM-ALTPVVVTLW
       . :.:.:: : :.. ..::::::.:.:... :..::::::::: ..  . . :  :::::
NP_001 LFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLW
       110       120       130       140       150       160       

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pF1KB7 YRAPEVLLQSTY-ATPVDMWSVGCIFAEMFRRKPLFCGNSEADQLGKIFDLIGLPPEDDW
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