Result of SIM4 for pF1KE4474

seq1 = pF1KE4474.tfa, 1479 bp
seq2 = pF1KE4474/gi568815591f_5492937.tfa (gi568815591f:5492937_5705471), 212535 bp

>pF1KE4474 1479
>gi568815591f:5492937_5705471 (Chr7)

1-832  (100001-100832)   100% ->
833-989  (110321-110477)   100% ->
990-1111  (110560-110681)   100% ->
1112-1279  (110927-111094)   100% ->
1280-1479  (112336-112535)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCGCCAACGGCACAGCCGAGGCGGTGCAGATCCAGTTCGGCCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCGCCAACGGCACAGCCGAGGCGGTGCAGATCCAGTTCGGCCTCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAACTGCGGCAACAAGTACCTGACGGCCGAGGCGTTCGGGTTCAAGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAACTGCGGCAACAAGTACCTGACGGCCGAGGCGTTCGGGTTCAAGGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGCGTCCGCCAGCAGCCTGAAGAAGAAGCAGATCTGGACGCTGGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGCGTCCGCCAGCAGCCTGAAGAAGAAGCAGATCTGGACGCTGGAGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCCCTGACGAGGCGGGCAGCGCGGCCGTGTGCCTGCGCAGCCACCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCCCTGACGAGGCGGGCAGCGCGGCCGTGTGCCTGCGCAGCCACCTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGCTACCTGGCGGCGGACAAGGACGGCAACGTGACCTGCGAGCGCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGCTACCTGGCGGCGGACAAGGACGGCAACGTGACCTGCGAGCGCGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCCCGGTCCCGACTGCCGTTTCCTCATCGTGGCGCACGACGACGGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCCCGGTCCCGACTGCCGTTTCCTCATCGTGGCGCACGACGACGGTCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TGGTCGCTGCAGTCCGAGGCGCACCGGCGCTACTTCGGCGGCACCGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TGGTCGCTGCAGTCCGAGGCGCACCGGCGCTACTTCGGCGGCACCGAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCGCCTGTCCTGCTTCGCGCAGACGGTGTCCCCCGCCGAGAAGTGGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCGCCTGTCCTGCTTCGCGCAGACGGTGTCCCCCGCCGAGAAGTGGAGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCACATCGCCATGCACCCTCAGGTCAACATCTACAGCGTCACCCGTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGCACATCGCCATGCACCCTCAGGTCAACATCTACAGCGTCACCCGTAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGCTACGCGCACCTGAGCGCGCGGCCGGCCGACGAGATCGCCGTGGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGCTACGCGCACCTGAGCGCGCGGCCGGCCGACGAGATCGCCGTGGACCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGACGTGCCCTGGGGCGTCGACTCGCTCATCACCCTCGCCTTCCAGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CGACGTGCCCTGGGGCGTCGACTCGCTCATCACCCTCGCCTTCCAGGACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGCGCTACAGCGTGCAGACCGCCGACCACCGCTTCCTGCGCCACGACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGCGCTACAGCGTGCAGACCGCCGACCACCGCTTCCTGCGCCACGACGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CGCCTGGTGGCGCGCCCCGAGCCGGCCACTGGCTACACGCTGGAGTTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CGCCTGGTGGCGCGCCCCGAGCCGGCCACTGGCTACACGCTGGAGTTCCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTCCGGCAAGGTGGCCTTCCGCGACTGCGAGGGCCGTTACCTGGCGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTCCGGCAAGGTGGCCTTCCGCGACTGCGAGGGCCGTTACCTGGCGCCGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CGGGGCCCAGCGGCACGCTCAAGGCGGGCAAGGCCACCAAGGTGGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CGGGGCCCAGCGGCACGCTCAAGGCGGGCAAGGCCACCAAGGTGGGCAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GACGAGCTCTTTGCTCTGGAGCAGAGCTGCGCCCAGGTCGTGCTGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GACGAGCTCTTTGCTCTGGAGCAGAGCTGCGCCCAGGTCGTGCTGCAGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGCCAACGAGAGGAACGTGTCCACGCGCCAGG         GTATGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100801 GGCCAACGAGAGGAACGTGTCCACGCGCCAGGGTG...CAGGTATGGACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TGTCTGCCAATCAGGACGAGGAGACCGACCAGGAGACCTTCCAGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110330 TGTCTGCCAATCAGGACGAGGAGACCGACCAGGAGACCTTCCAGCTGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 ATCGACCGCGACACCAAAAAGTGTGCCTTCCGTACCCACACGGGCAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110380 ATCGACCGCGACACCAAAAAGTGTGCCTTCCGTACCCACACGGGCAAGTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CTGGACGCTGACGGCCACCGGGGGCGTGCAGTCCACCGCCTCCAGCAA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 110430 CTGGACGCTGACGGCCACCGGGGGCGTGCAGTCCACCGCCTCCAGCAAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    990        GAATGCCAGCTGCTACTTTGACATCGAGTGGCGTGACCGGCGC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110480 G...CAGGAATGCCAGCTGCTACTTTGACATCGAGTGGCGTGACCGGCGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 ATCACACTGAGGGCGTCCAATGGCAAGTTTGTGACCTCCAAGAAGAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110603 ATCACACTGAGGGCGTCCAATGGCAAGTTTGTGACCTCCAAGAAGAATGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 GCAGCTGGCCGCCTCGGTGGAGACAGCAG         GGGACTCAGAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 110653 GCAGCTGGCCGCCTCGGTGGAGACAGCAGGTA...CAGGGGACTCAGAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 TCTTCCTCATGAAGCTCATCAACCGCCCCATCATCGTGTTCCGCGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110939 TCTTCCTCATGAAGCTCATCAACCGCCCCATCATCGTGTTCCGCGGGGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 CATGGCTTCATCGGCTGCCGCAAGGTCACGGGCACCCTGGACGCCAACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110989 CATGGCTTCATCGGCTGCCGCAAGGTCACGGGCACCCTGGACGCCAACCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CTCCAGCTATGACGTCTTCCAGCTGGAGTTCAACGATGGCGCCTACAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111039 CTCCAGCTATGACGTCTTCCAGCTGGAGTTCAACGATGGCGCCTACAACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 TCAAAG         ACTCCACAGGCAAATACTGGACGGTGGGCAGTGAC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111089 TCAAAGGCA...CAGACTCCACAGGCAAATACTGGACGGTGGGCAGTGAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 TCCGCGGTCACCAGCAGCGGCGACACTCCTGTGGACTTCTTCTTCGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112371 TCCGCGGTCACCAGCAGCGGCGACACTCCTGTGGACTTCTTCTTCGAGTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 CTGCGACTATAACAAGGTGGCCATCAAGGTGGGCGGGCGCTACCTGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112421 CTGCGACTATAACAAGGTGGCCATCAAGGTGGGCGGGCGCTACCTGAAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 GCGACCACGCAGGCGTCCTGAAGGCCTCGGCGGAAACCGTGGACCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112471 GCGACCACGCAGGCGTCCTGAAGGCCTCGGCGGAAACCGTGGACCCCGCC

   1500     .    :    .
   1465 TCGCTCTGGGAGTAC
        |||||||||||||||
 112521 TCGCTCTGGGAGTAC

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