Result of SIM4 for pF1KB9453

seq1 = pF1KB9453.tfa, 1917 bp
seq2 = pF1KB9453/gi568815587r_64665821.tfa (gi568815587r:64665821_64876627), 210807 bp

>pF1KB9453 1917
>gi568815587r:64665821_64876627 (Chr11)

(complement)

1-31  (98236-98266)   100% ->
32-160  (100002-100130)   100% ->
161-236  (103123-103198)   100% ->
237-389  (106220-106372)   100% ->
390-479  (106575-106664)   100% ->
480-663  (107019-107202)   100% ->
664-779  (107290-107405)   100% ->
780-887  (107499-107606)   100% ->
888-1068  (108342-108522)   100% ->
1069-1342  (108784-109057)   100% ->
1343-1402  (109377-109436)   100% ->
1403-1582  (109549-109728)   100% ->
1583-1917  (110473-110807)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGACCGGAGCGAACGCCACGCCGTTGG         ACTTCCCAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
  98236 ATGGCGACCGGAGCGAACGCCACGCCGTTGGGTA...TAGACTTCCCAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TAAGAAGCGGAAGAGGAGCCGCTGGAACCAAGACACAATGGAACAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100012 TAAGAAGCGGAAGAGGAGCCGCTGGAACCAAGACACAATGGAACAGAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAGTGATTCCAGGAATGCCTACAGTTATTCCCCCTGGACTTACTCGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100062 CAGTGATTCCAGGAATGCCTACAGTTATTCCCCCTGGACTTACTCGAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAAGAAAGAGCTTATATAG         TGCAACTGCAGATAGAAGACCT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100112 CAAGAAAGAGCTTATATAGGTA...CAGTGCAACTGCAGATAGAAGACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GACTCGTAAACTGCGCACAGGAGACCTGGGCATCCCCCCTAACCCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103145 GACTCGTAAACTGCGCACAGGAGACCTGGGCATCCCCCCTAACCCTGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACAG         GTCCCCTTCCCCTGAGCCCATCTACAATAGCGAGGGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103195 ACAGGTT...CAGGTCCCCTTCCCCTGAGCCCATCTACAATAGCGAGGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAGCGGCTTAACACCCGAGAGTTCCGCACCCGCAAAAAGCTGGAAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106257 AAGCGGCTTAACACCCGAGAGTTCCGCACCCGCAAAAAGCTGGAAGAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCGGCACAACCTCATCACAGAGATGGTTGCACTCAATCCGGATTTCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106307 GCGGCACAACCTCATCACAGAGATGGTTGCACTCAATCCGGATTTCAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CACCTGCAGATTACAA         ACCTCCAGCAACACGTGTGAGTGAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 106357 CACCTGCAGATTACAAGTA...TAGACCTCCAGCAACACGTGTGAGTGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAAGTCATGATTCCACAAGATGAGTACCCAGAAATCAACTTTGTGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106600 AAAGTCATGATTCCACAAGATGAGTACCCAGAAATCAACTTTGTGGGGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GCTCATCGGGCCCAG         AGGGAACACCCTGAAGAACATAGAGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 106650 GCTCATCGGGCCCAGGTG...TAGAGGGAACACCCTGAAGAACATAGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGGAGTGCAATGCCAAGATTATGATCCGGGGGAAAGGGTCTGTGAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107045 AGGAGTGCAATGCCAAGATTATGATCCGGGGGAAAGGGTCTGTGAAAGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GGGAAGGTTGGGCGCAAAGATGGCCAGATGTTGCCAGGAGAAGATGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107095 GGGAAGGTTGGGCGCAAAGATGGCCAGATGTTGCCAGGAGAAGATGAGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ACTTCATGCCCTGGTTACTGCCAATACAATGGAGAACGTCAAAAAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107145 ACTTCATGCCCTGGTTACTGCCAATACAATGGAGAACGTCAAAAAGGCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGAACAG         ATAAGAAACATCCTGAAGCAGGGTATCGAGACT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 107195 TGGAACAGGTG...TAGATAAGAAACATCCTGAAGCAGGGTATCGAGACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CCAGAGGACCAGAATGATCTACGGAAGATGCAGCTTCGGGAGTTGGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107323 CCAGAGGACCAGAATGATCTACGGAAGATGCAGCTTCGGGAGTTGGCTCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CTTAAATGGGACCCTTCGGGAAGACGATAACAG         GATCTTAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 107373 CTTAAATGGGACCCTTCGGGAAGACGATAACAGGTA...TAGGATCTTAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GACCCTGGCAGAGCTCAGAGACCCGCAGCATTACCAACACCACAGTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107507 GACCCTGGCAGAGCTCAGAGACCCGCAGCATTACCAACACCACAGTGTGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 ACCAAGTGTGGAGGGGCTGGCCACATTGCTTCAGACTGTAAATTCCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107557 ACCAAGTGTGGAGGGGCTGGCCACATTGCTTCAGACTGTAAATTCCAAAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888          GCCTGGTGATCCTCAGTCAGCTCAGGATAAAGCACGGATGG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107607 GTG...CAGGCCTGGTGATCCTCAGTCAGCTCAGGATAAAGCACGGATGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ATAAAGAATATTTGTCCCTCATGGCTGAACTGGGTGAAGCACCTGTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108383 ATAAAGAATATTTGTCCCTCATGGCTGAACTGGGTGAAGCACCTGTCCCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GCATCTGTGGGCTCCACCTCTGGGCCTGCCACCACACCCCTGGCCAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108433 GCATCTGTGGGCTCCACCTCTGGGCCTGCCACCACACCCCTGGCCAGCGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 ACCTCGTCCTGCTGCTCCCGCCAACAACCCACCTCCACCG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 108483 ACCTCGTCCTGCTGCTCCCGCCAACAACCCACCTCCACCGGTG...TAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CTCTCATGTCTACCACCCAGAGCCGCCCACCCTGGATGAATTCTGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108785 CTCTCATGTCTACCACCCAGAGCCGCCCACCCTGGATGAATTCTGGCCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 TCAGAGAGTCGGCCCTACCACGGCATGCATGGAGGTGGTCCTGGTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108835 TCAGAGAGTCGGCCCTACCACGGCATGCATGGAGGTGGTCCTGGTGGGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CGGAGGTGGCCCCCACAGCTTCCCACACCCATTACCCAGCCTGACAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108885 CGGAGGTGGCCCCCACAGCTTCCCACACCCATTACCCAGCCTGACAGGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GGCATGGTGGACATCCCATGCAGCACAACCCCAATGGACCCCCACCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108935 GGCATGGTGGACATCCCATGCAGCACAACCCCAATGGACCCCCACCCCCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TGGATGCAGCCACCACCACCACCGATGAACCAGGGCCCCCACCCTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108985 TGGATGCAGCCACCACCACCACCGATGAACCAGGGCCCCCACCCTCCTGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GCACCATGGCCCTCCTCCAATGG         ATCAGTACCTGGGAAGTA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 109035 GCACCATGGCCCTCCTCCAATGGGTA...AAGATCAGTACCTGGGAAGTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 CGCCTGTGGGCTCTGGGGTCTATCGCCTGCATCAAGGAAAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 109395 CGCCTGTGGGCTCTGGGGTCTATCGCCTGCATCAAGGAAAAGGTA...CA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1403  GTATGATGCCGCCACCACCTATGGGCATGATGCCGCCGCCGCCGCCGCC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109548 GGTATGATGCCGCCACCACCTATGGGCATGATGCCGCCGCCGCCGCCGCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 TCCCAGTGGGCAGCCCCCACCCCCTCCCTCTGGTCCTCTTCCCCCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109598 TCCCAGTGGGCAGCCCCCACCCCCTCCCTCTGGTCCTCTTCCCCCATGGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 AACAACAGCAGCAGCAGCCTCCGCCACCCCCTCCGCCCAGCAGCAGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109648 AACAACAGCAGCAGCAGCCTCCGCCACCCCCTCCGCCCAGCAGCAGTATG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 GCTTCCAGTACCCCCTTGCCATGGCAGCAAA         ATACGACGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 109698 GCTTCCAGTACCCCCTTGCCATGGCAGCAAAGTG...CAGATACGACGAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 TACCACCACGAGCGCTGGCACAGGGTCCATCCCGCCATGGCAACAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110483 TACCACCACGAGCGCTGGCACAGGGTCCATCCCGCCATGGCAACAGCAGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 AGGCGGCTGCCGCAGCTTCTCCAGGAGCCCCTCAGATGCAAGGCAACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110533 AGGCGGCTGCCGCAGCTTCTCCAGGAGCCCCTCAGATGCAAGGCAACCCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 ACTATGGTGCCCCTGCCCCCCGGGGTCCAGCCGCCTCTGCCGCCTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110583 ACTATGGTGCCCCTGCCCCCCGGGGTCCAGCCGCCTCTGCCGCCTGGGGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 CCCTCCCCCTCCGCCGCCTCCACCGCCTGGTTCCGCCGGCATGATGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110633 CCCTCCCCCTCCGCCGCCTCCACCGCCTGGTTCCGCCGGCATGATGTATG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 CCCCGCCCCCTCCTCCTCCGCCTCCCATGGACCCTTCTAACTTTGTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110683 CCCCGCCCCCTCCTCCTCCGCCTCCCATGGACCCTTCTAACTTTGTCACC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 ATGATGGGCATGGGGGTGGCGGGCATGCCGCCCTTCGGGATGCCTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110733 ATGATGGGCATGGGGGTGGCGGGCATGCCGCCCTTCGGGATGCCTCCAGC

   2000     .    :    .    :    .
   1893 TCCCCCACCGCCTCCACCACAGAAC
        |||||||||||||||||||||||||
 110783 TCCCCCACCGCCTCCACCACAGAAC

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