Result of SIM4 for pF1KB5980

seq1 = pF1KB5980.tfa, 1701 bp
seq2 = pF1KB5980/gi568815575f_153681087.tfa (gi568815575f:153681087_153885517), 204431 bp

>pF1KB5980 1701
>gi568815575f:153681087_153885517 (ChrX)

1-59  (100001-100059)   100% ->
60-190  (100130-100260)   100% ->
191-299  (100419-100527)   100% ->
300-387  (100657-100744)   100% ->
388-475  (101035-101122)   100% ->
476-582  (101686-101792)   100% ->
583-748  (101867-102032)   100% ->
749-774  (102140-102165)   100% ->
775-907  (102666-102798)   100% ->
908-1147  (102888-103127)   99% ->
1148-1248  (103208-103308)   100% ->
1249-1356  (103664-103771)   100% ->
1357-1426  (103848-103917)   100% ->
1427-1519  (103995-104087)   100% ->
1520-1701  (104250-104431)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCGCCAGCACGGGCGGTGGTGGGGACAGCGGCGGCAGCGGCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCGCCAGCACGGGCGGTGGTGGGGACAGCGGCGGCAGCGGCGGCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAGCAGCAG         CTCACAGGCCTCCTGCGGGCCCGAGTCCTCGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TAGCAGCAGGTA...CAGCTCACAGGCCTCCTGCGGGCCCGAGTCCTCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCTCCGAACTAGCCCTGGCCACACCGGTGCCTCAGATGCTGCAGGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100162 GCTCCGAACTAGCCCTGGCCACACCGGTGCCTCAGATGCTGCAGGGCCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGGGCTCCGACGACGAGGAACAGGAAGACCCCAAAGACTACTGCAAGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100212 CTGGGCTCCGACGACGAGGAACAGGAAGACCCCAAAGACTACTGCAAGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    191         GCGGCTACCACCCTGTGAAGATCGGCGACGTGTTCAATGGGC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100262 TG...CAGGCGGCTACCACCCTGTGAAGATCGGCGACGTGTTCAATGGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGTACCACGTGGTGCGCAAACTGGGCTGGGGCCACTTCTCCACCGTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100461 GGTACCACGTGGTGCGCAAACTGGGCTGGGGCCACTTCTCCACCGTCTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTCTGCTGGGACATCCA         GCGCAAGCGCTTTGTGGCCCTCAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100511 CTCTGCTGGGACATCCAGTG...CAGGCGCAAGCGCTTTGTGGCCCTCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGTGGTGAAGAGTGCGGGGCATTACACGGAGACAGCTGTGGATGAGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100681 AGTGGTGAAGAGTGCGGGGCATTACACGGAGACAGCTGTGGATGAGATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGCTCCTGAAATGT         GTCCGGGACAGCGACCCCAGTGACCCC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100731 AGCTCCTGAAATGTGTG...CAGGTCCGGGACAGCGACCCCAGTGACCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAAAGAGAGACCATTGTCCAGCTCATTGATGACTTCAGGATCTCAGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101062 AAAAGAGAGACCATTGTCCAGCTCATTGATGACTTCAGGATCTCAGGAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CAATGGAGTCC         ATGTGTGCATGGTGCTGGAGGTGCTGGGCC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101112 CAATGGAGTCCGTA...CAGATGTGTGCATGGTGCTGGAGGTGCTGGGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ACCAGCTCCTCAAATGGATCATCAAGTCCAACTACCAGGGCCTGCCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101716 ACCAGCTCCTCAAATGGATCATCAAGTCCAACTACCAGGGCCTGCCCGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CCCTGCGTGAAGAGCATCGTGAGGCAG         GTGCTGCACGGCCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 101766 CCCTGCGTGAAGAGCATCGTGAGGCAGGTG...CAGGTGCTGCACGGCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GGACTACCTCCACACCAAGTGCAAGATCATCCACACGGACATCAAGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101881 GGACTACCTCCACACCAAGTGCAAGATCATCCACACGGACATCAAGCCCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AGAACATCTTGCTGTGTGTGGGGGACGCTTACATCAGGCGCCTGGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101931 AGAACATCTTGCTGTGTGTGGGGGACGCTTACATCAGGCGCCTGGCTGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GAGGCCACGGAGTGGCAACAGGCAGGGGCGCCGCCCCCCTCCCGCTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101981 GAGGCCACGGAGTGGCAACAGGCAGGGGCGCCGCCCCCCTCCCGCTCCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AG         TCAGCACTGCCCCCCAGGAGGTCTTG         CAGA
        ||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 102031 AGGTA...CAGTCAGCACTGCCCCCCAGGAGGTCTTGGTA...CAGCAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CCGGTAAGCTGTCCAAAAACAAGAGGAAGAAGATGAGGCGCAAACGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102670 CCGGTAAGCTGTCCAAAAACAAGAGGAAGAAGATGAGGCGCAAACGGAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 CAGCAGAAGCGGCTGCTGGAGGAGCGGCTGCGGGACCTGCAGAGGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102720 CAGCAGAAGCGGCTGCTGGAGGAGCGGCTGCGGGACCTGCAGAGGCTGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GGCCATGGAGGCTGCCACCCAGGCTGAGG         ACTCTGGCTTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 102770 GGCCATGGAGGCTGCCACCCAGGCTGAGGGTG...CAGACTCTGGCTTGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 GACTAGACGGGGGCAGCGGCTCCACATCCTCTTCAGGCTGTCACCCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102900 GACTAGACGGGGGCAGCGGCTCCACATCCTCTTCAGGCTGTCACCCCGGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GGCGCCAGAGCAGGTCCCTCCCCAGCCTCTTCCTCCCCCGCCCCGGGGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 102950 GGCGCCAGAGCAGGTCCCTCCCCAGCCTCTTCCTCCCCCGCCCCAGGGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CGGCCGTAGCCTCAGCGCGGGCTCACAGACCTCAGGCTTCTCCGGCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103000 CGGCCGTAGCCTCAGCGCGGGCTCACAGACCTCAGGCTTCTCCGGCTCCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TCTTCTCTCCTGCCTCCTGCTCCATCCTCTCCGGCTCGTCCAATCAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103050 TCTTCTCTCCTGCCTCCTGCTCCATCCTCTCCGGCTCGTCCAATCAGCGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GAGACCGGGGGCCTCCTGTCGCCTAGCA         CACCATTCGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 103100 GAGACCGGGGGCCTCCTGTCGCCTAGCAGTA...CAGCACCATTCGGTGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 CTCGAACCTCCTGGTGAACCCCCTGGAGCCCCAAAATGCAGATAAGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103221 CTCGAACCTCCTGGTGAACCCCCTGGAGCCCCAAAATGCAGATAAGATCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AGATCAAGATCGCAGACCTGGGCAACGCCTGCTGGGTG         CAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 103271 AGATCAAGATCGCAGACCTGGGCAACGCCTGCTGGGTGGTA...CAGCAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 AAGCACTTCACGGAAGACATCCAGACTCGGCAGTACCGGGCCGTCGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103667 AAGCACTTCACGGAAGACATCCAGACTCGGCAGTACCGGGCCGTCGAGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 GCTGATCGGCGCCGAATACGGCCCCCCGGCAGACATCTGGAGCACAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103717 GCTGATCGGCGCCGAATACGGCCCCCCGGCAGACATCTGGAGCACAGCCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 GCATG         GCCTTCGAGCTGGCCACTGGTGACTACCTGTTCGAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103767 GCATGGTA...CAGGCCTTCGAGCTGGCCACTGGTGACTACCTGTTCGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 CCGCATTCTGGAGAAGACTACAGTCGTGATGAGG         ACCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 103884 CCGCATTCTGGAGAAGACTACAGTCGTGATGAGGGTA...CAGACCACAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 CGCTCACATAGTGGAGCTTCTGGGGGACATCCCCCCAGCCTTCGCCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104002 CGCTCACATAGTGGAGCTTCTGGGGGACATCCCCCCAGCCTTCGCCCTCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 CAGGCCGCTATTCCCGGGAGTTCTTCAACCGGAGAG         GAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 104052 CAGGCCGCTATTCCCGGGAGTTCTTCAACCGGAGAGGTG...CAGGAGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 CTGCGGCACATCCACAATCTCAAGCACTGGGGCCTGTACGAGGTACTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104255 CTGCGGCACATCCACAATCTCAAGCACTGGGGCCTGTACGAGGTACTCAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 GGAAAAGTACGAGTGGCCCCTAGAGCAGGCCACACAGTTCAGCGCCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104305 GGAAAAGTACGAGTGGCCCCTAGAGCAGGCCACACAGTTCAGCGCCTTTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 TGCTGCCCATGATGGAGTACATCCCCGAAAAGCGGGCCAGTGCCGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104355 TGCTGCCCATGATGGAGTACATCCCCGAAAAGCGGGCCAGTGCCGCTGAC

   1800     .    :    .    :    .
   1675 TGCCTCCAGCACCCCTGGCTCAACCCC
        |||||||||||||||||||||||||||
 104405 TGCCTCCAGCACCCCTGGCTCAACCCC

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