Result of FASTA (ccds) for pF1KB3384
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3384, 699 aa
  1>>>pF1KB3384 699 - 699 aa - 699 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.6682+/-0.00105; mu= -5.0953+/- 0.065
 mean_var=445.5264+/-90.334, 0's: 0 Z-trim(116.5): 38  B-trim: 58 in 1/52
 Lambda= 0.060763
 statistics sampled from 17088 (17126) to 17088 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.791), E-opt: 0.2 (0.526), width:  16
 Scan time:  3.710

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS34724.1 SRPK2 gene_id:6733|Hs108|chr7          ( 699) 4804 435.5 1.2e-121
CCDS5735.1 SRPK2 gene_id:6733|Hs108|chr7           ( 688) 4653 422.3 1.2e-117
CCDS47415.1 SRPK1 gene_id:6732|Hs108|chr6          ( 655) 1527 148.2 3.5e-35
CCDS55537.1 SRPK3 gene_id:26576|Hs108|chrX         ( 533) 1434 140.0 8.7e-33
CCDS55538.1 SRPK3 gene_id:26576|Hs108|chrX         ( 566) 1434 140.0 9.1e-33
CCDS35441.1 SRPK3 gene_id:26576|Hs108|chrX         ( 567) 1425 139.2 1.6e-32


>>CCDS34724.1 SRPK2 gene_id:6733|Hs108|chr7               (699 aa)
 initn: 4804 init1: 4804 opt: 4804  Z-score: 2297.2  bits: 435.5 E(32554): 1.2e-121
Smith-Waterman score: 4804; 100.0% identity (100.0% similar) in 699 aa overlap (1-699:1-699)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MSSRKVLAIQARKRRPKREKHPKKPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEEEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MSSRKVLAIQARKRRPKREKHPKKPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEEEI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 LGSDDEEQEDPADYCKGGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LGSDDEEQEDPADYCKGGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 KVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 GHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 RRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQQKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQQKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 IEELEREAERKIIEENITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IEELEREAERKIIEENITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 EKEDAEKENIEKDEDDVDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDEDDDEEDCP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EKEDAEKENIEKDEDDVDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDEDDDEEDCP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 NPEEYNLDEPNAESDYTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NPEEYNLDEPNAESDYTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 VLSEGSPLTEQEESSPSHDRSRTVSASSTGDLPKAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VLSEGSPLTEQEESSPSHDRSRTVSASSTGDLPKAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 DLGNACWVHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DLGNACWVHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 EDYSRDEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELRHITKLKPWSLFDVLVEKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EDYSRDEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELRHITKLKPWSLFDVLVEKY
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690         
pF1KB3 GWPHEDAAQFTDFLIPMLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GWPHEDAAQFTDFLIPMLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS
              670       680       690         

>>CCDS5735.1 SRPK2 gene_id:6733|Hs108|chr7                (688 aa)
 initn: 4653 init1: 4653 opt: 4653  Z-score: 2225.7  bits: 422.3 E(32554): 1.2e-117
Smith-Waterman score: 4653; 98.8% identity (99.6% similar) in 683 aa overlap (17-699:6-688)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MSSRKVLAIQARKRRPKREKHPKKPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEEEI
                       .. .  ..::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57            MSVNSEKSSSSERPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEEEI
                          10        20        30        40         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 LGSDDEEQEDPADYCKGGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LGSDDEEQEDPADYCKGGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAM
      50        60        70        80        90       100         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 KVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVL
     110       120       130       140       150       160         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 GHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 GHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYV
     170       180       190       200       210       220         

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 RRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQQKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 RRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQQKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQE
     230       240       250       260       270       280         

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 IEELEREAERKIIEENITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 IEELEREAERKIIEENITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQE
     290       300       310       320       330       340         

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 EKEDAEKENIEKDEDDVDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDEDDDEEDCP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 EKEDAEKENIEKDEDDVDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDEDDDEEDCP
     350       360       370       380       390       400         

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 NPEEYNLDEPNAESDYTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 NPEEYNLDEPNAESDYTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGS
     410       420       430       440       450       460         

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 VLSEGSPLTEQEESSPSHDRSRTVSASSTGDLPKAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 VLSEGSPLTEQEESSPSHDRSRTVSASSTGDLPKAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIA
     470       480       490       500       510       520         

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 DLGNACWVHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 DLGNACWVHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSG
     530       540       550       560       570       580         

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 EDYSRDEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELRHITKLKPWSLFDVLVEKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 EDYSRDEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELRHITKLKPWSLFDVLVEKY
     590       600       610       620       630       640         

              670       680       690         
pF1KB3 GWPHEDAAQFTDFLIPMLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 GWPHEDAAQFTDFLIPMLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS
     650       660       670       680        

>>CCDS47415.1 SRPK1 gene_id:6732|Hs108|chr6               (655 aa)
 initn: 2620 init1: 1515 opt: 1527  Z-score: 745.0  bits: 148.2 E(32554): 3.5e-35
Smith-Waterman score: 2603; 58.3% identity (76.7% similar) in 709 aa overlap (4-699:3-655)

               10          20        30        40        50        
pF1KB3 MSSRKVLAIQARKRRPK--REKHPKKPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEE
          :::::.::::.: :  ..:  .: : :...               :  .   :: ::
CCDS47  MERKVLALQARKKRTKAKKDKAQRKSETQHRGS-------------APHSESDLPEQEE
                10        20        30                     40      

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB3 EILGSDDEEQEDPADYCKGGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFV
       :::::::.::::: :::::::: ::::::::::::::::::::::::::: ::.:::.::
CCDS47 EILGSDDDEQEDPNDYCKGGYHLVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLSWDIQGKKFV
         50        60        70        80        90       100      

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB3 AMKVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFE
       ::::::::.::::::::::.::: ::.:::.:::..:::::.:::::::.:: :.:::::
CCDS47 AMKVVKSAEHYTETALDEIRLLKSVRNSDPNDPNREMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFE
        110       120       130       140       150       160      

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB3 VLGHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDA
       :::::::::::::::::::. :::.::.::::::::::.::.::::::::::::. :.. 
CCDS47 VLGHHLLKWIIKSNYQGLPLPCVKKIIQQVLQGLDYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQ
        170       180       190       200       210       220      

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB3 YVRRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQQKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRL
       :.::.::::::::..::::::::::::::: ::  :.::::::::::::::::::::::.
CCDS47 YIRRLAAEATEWQRSGAPPPSGSAVSTAPQPKPADKMSKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRM
        230       240       250       260       270       280      

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB3 QEIEELEREAERKIIEENITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAED
       :::::.:.:.       .  .  :......:   :  :: .  .. .. .  ...  ..:
CCDS47 QEIEEMEKES-------GPGQKRPNKQEESESPVERPLKENPPNKMTQEKLEESSTIGQD
        290              300       310       320       330         

      360       370       380       390       400       410        
pF1KB3 QEEKEDAEKENIEKDEDDVDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDED-DDEE
       :          .:.: .    :.           . :: ::   ..  :. ..:    .:
CCDS47 QTL--------MERDTEGGAAEI-----------NCNGVIEVINYT--QNSNNETLRHKE
     340               350                  360         370        

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pF1KB3 DCPNPEEYNLDEPNAESDYTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVA
       :  : .. .... : ::..  :.     ::.  .       ::  .  : . :   . ..
CCDS47 DLHNANDCDVQNLNQESSFLSSQ-----NGDSST-------SQETDSCTPITSEVSDTMV
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pF1KB3 CGSVLSEGSPLTEQEESS---------PSHDRSRTVSASSTGDLP-KAKTRAADLLVNPL
       : :  . :. ..::. :.         : .:...      .: :  :.:. :...:::::
CCDS47 CQSSSTVGQSFSEQHISQLQESIRAEIPCEDEQEQ---EHNGPLDNKGKSTAGNFLVNPL
        430       440       450       460          470       480   

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pF1KB3 DPRNADKIRVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFE
       .:.::.:..:::::::::::::::::::::::::::.:::::.::.::::::::::::::
CCDS47 EPKNAEKLKVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQYRSLEVLIGSGYNTPADIWSTACMAFE
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pF1KB3 LATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELRHITKL
       ::::::::::::::.:.::::::: ::::::..::.. ..::::.:::...:.:.:::::
CCDS47 LATGDYLFEPHSGEEYTRDEDHIALIIELLGKVPRKLIVAGKYSKEFFTKKGDLKHITKL
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pF1KB3 KPWSLFDVLVEKYGWPHEDAAQFTDFLIPMLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS
       :::.::.:::::: : .:.:: :::::.::::..:::::.:.::::::::::
CCDS47 KPWGLFEVLVEKYEWSQEEAAGFTDFLLPMLELIPEKRATAAECLRHPWLNS
           610       620       630       640       650     

>>CCDS55537.1 SRPK3 gene_id:26576|Hs108|chrX              (533 aa)
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       :: ::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::.: :::::.:::::: ::
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       ::::.::::::::::.::::::... .:::::::.:::.::.:::::.:::::.::::::
CCDS55 TETAVDEIKLLKCVRDSDPSDPKRETIVQLIDDFRISGVNGVHVCMVLEVLGHQLLKWII
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pF1KB3 KSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATE
       ::::::::: :::::.::::.::::::.:::::::::::::::.:: :::.::.::::::
CCDS55 KSNYQGLPVPCVKSIVRQVLHGLDYLHTKCKIIHTDIKPENILLCVGDAYIRRLAAEATE
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       ::.::::::: : ::::::.   ::.::::.::...:.:.: .:::.::.....::    
CCDS55 WQQAGAPPPSRSIVSTAPQEVLTGKLSKNKRKKMRRKRKQQKRLLEERLRDLQRLE----
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pF1KB3 RKIIEENITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQEEKEDAEKEN
                                     ..: :..::   :.:               
CCDS55 ------------------------------AMEAATQAE---DSGL--------------
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                                  ....:                            
CCDS55 ---------------------------RLDGG----------------------------
                                    310                            

     430       440       450       460       470       480         
pF1KB3 PNAESDYTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGSVLSEGSPLT
           :  : ::.                      :: ::::    :..: :.:: ::  .
CCDS55 ----SGSTSSSG----------------------FSGSLFS----PASC-SILS-GS--S
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pF1KB3 EQEESSPSHDRSRTVSASSTGDL--PKAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNACW
       .:.:               :: :  :..   :..::::::.:.:::::..::::::::::
CCDS55 NQRE---------------TGGLLSPSTPFGASNLLVNPLEPQNADKIKIKIADLGNACW
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pF1KB3 VHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDE
       :::::::::::::::..:::::: :. :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VHKHFTEDIQTRQYRAVEVLIGAEYGPPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDE
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pF1KB3 DHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELRHITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHEDA
       ::::::.::::.::  :::::.::::::::::::::: .:: :.:..::.::: :: :.:
CCDS55 DHIAHIVELLGDIPPAFALSGRYSREFFNRRGELRHIHNLKHWGLYEVLMEKYEWPLEQA
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       .::. ::.::.:..:::::::..::.::::: 
CCDS55 TQFSAFLLPMMEYIPEKRASAADCLQHPWLNP
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 initn: 2525 init1: 1424 opt: 1434  Z-score: 701.8  bits: 140.0 E(32554): 9.1e-33
Smith-Waterman score: 2323; 57.8% identity (71.4% similar) in 661 aa overlap (41-698:27-565)

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CCDS55     MSASTGGGGDSGGSGGSSSSSQASCGPESSGSELALATPVPQMLQGLLGSDDEEQE
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pF1KB3 DPADYCKGGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHY
       :: ::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::.: :::::.:::::: ::
CCDS55 DPKDYCKGGYHPVKIGDVFNGRYHVVRKLGWGHFSTVWLCWDIQRKRFVALKVVKSAGHY
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pF1KB3 TETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWII
       ::::.::::::::::.::::::... .:::::::.:::.::.:::::.:::::.::::::
CCDS55 TETAVDEIKLLKCVRDSDPSDPKRETIVQLIDDFRISGVNGVHVCMVLEVLGHQLLKWII
        120       130       140       150       160       170      

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pF1KB3 KSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATE
       ::::::::: :::::.::::.::::::.:::::::::::::::.:: :::.::.::::::
CCDS55 KSNYQGLPVPCVKSIVRQVLHGLDYLHTKCKIIHTDIKPENILLCVGDAYIRRLAAEATE
        180       190       200       210       220       230      

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pF1KB3 WQKAGAPPPSGSAVSTAPQQKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAE
       ::.::::::: : ::::::.   ::.::::.::...:.:.: .:::.::.....::    
CCDS55 WQQAGAPPPSRSIVSTAPQEVLTGKLSKNKRKKMRRKRKQQKRLLEERLRDLQRLE----
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pF1KB3 RKIIEENITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQEEKEDAEKEN
                                     ..: :..::   :.:               
CCDS55 ------------------------------AMEAATQAE---DSG---------------
                                          300                      

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pF1KB3 IEKDEDDVDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDEDDDEEDCPNPEEYNLDE
       .. :  . .   ..  :         :  . ::           .   . : :       
CCDS55 LRLDGGSGSTSSSGCHP---------GGARAGP-----------SPASSSPAP-------
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pF1KB3 PNAESDYTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGSVLSEGSPLT
                        :   .::     ::   :: ::::    :..: :.:: ::  .
CCDS55 -----------------G---GGRSLSAGSQTSGFSGSLFS----PASC-SILS-GS--S
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     490       500       510         520       530       540       
pF1KB3 EQEESSPSHDRSRTVSASSTGDL--PKAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNACW
       .:.:               :: :  :..   :..::::::.:.:::::..::::::::::
CCDS55 NQRE---------------TGGLLSPSTPFGASNLLVNPLEPQNADKIKIKIADLGNACW
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pF1KB3 VHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDE
       :::::::::::::::..:::::: :. :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VHKHFTEDIQTRQYRAVEVLIGAEYGPPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDE
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pF1KB3 DHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELRHITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHEDA
       ::::::.::::.::  :::::.::::::::::::::: .:: :.:..::.::: :: :.:
CCDS55 DHIAHIVELLGDIPPAFALSGRYSREFFNRRGELRHIHNLKHWGLYEVLMEKYEWPLEQA
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pF1KB3 AQFTDFLIPMLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS
       .::. ::.::.:..:::::::..::.::::: 
CCDS55 TQFSAFLLPMMEYIPEKRASAADCLQHPWLNP
          540       550       560      

>>CCDS35441.1 SRPK3 gene_id:26576|Hs108|chrX              (567 aa)
 initn: 2400 init1: 1299 opt: 1425  Z-score: 697.5  bits: 139.2 E(32554): 1.6e-32
Smith-Waterman score: 2314; 57.7% identity (71.3% similar) in 662 aa overlap (41-698:27-566)

               20        30        40        50         60         
pF1KB3 ARKRRPKREKHPKKPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPPPLPDPTP-PEPEEEILGSDDEEQE
                                     :      :   :: :.  . .:::::::::
CCDS35     MSASTGGGGDSGGSGGSSSSSQASCGPESSGSELALATPVPQMLQGLLGSDDEEQE
                   10        20        30        40        50      

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pF1KB3 DPADYCKGGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHY
       :: ::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::.: :::::.:::::: ::
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