seq1 = pF1KE3685.tfa, 960 bp seq2 = pF1KE3685/gi568815597r_70966776.tfa (gi568815597r:70966776_71180995), 214220 bp >pF1KE3685 960 >gi568815597r:70966776_71180995 (Chr1) (complement) 1-56 (100001-100056) 100% -> 57-109 (102288-102340) 100% -> 110-218 (102431-102539) 100% -> 219-301 (104119-104201) 100% -> 302-378 (108448-108524) 100% -> 379-513 (108741-108875) 100% -> 514-683 (110000-110169) 99% -> 684-770 (111634-111720) 100% -> 771-929 (114062-114220) 100% -> 930-960 (115244-115274) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGTCGACCAAGAATTTCCGAGTCAGTGACGGGGACTGGATTTGCCCTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGTCGACCAAGAATTTCCGAGTCAGTGACGGGGACTGGATTTGCCCTGA 50 . : . : . : . : . : 51 CAAAAA ATGTGGAAATGTAAACTTTGCTAGAAGAACCAGCT ||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 CAAAAAGTG...TAGATGTGGAAATGTAAACTTTGCTAGAAGAACCAGCT 100 . : . : . : . : . : 92 GTAATCGATGTGGTCGGG AGAAAACAACTGAGGCCAAGATG ||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||| 102323 GTAATCGATGTGGTCGGGGTA...CAGAGAAAACAACTGAGGCCAAGATG 150 . : . : . : . : . : 133 ATGAAAGCTGGGGGCACTGAAATAGGAAAGACACTTGCAGAAAAGAGCCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102454 ATGAAAGCTGGGGGCACTGAAATAGGAAAGACACTTGCAGAAAAGAGCCG 200 . : . : . : . : . : 183 AGGCCTATTTAGTGCTAATGACTGGCAATGTAAAAC TTGCA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||| 102504 AGGCCTATTTAGTGCTAATGACTGGCAATGTAAAACGTA...AAGTTGCA 250 . : . : . : . : . : 224 GCAATGTGAATTGGGCCAGAAGATCAGAGTGTAATATGTGTAATACTCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104124 GCAATGTGAATTGGGCCAGAAGATCAGAGTGTAATATGTGTAATACTCCA 300 . : . : . : . : . : 274 AAGTATGCTAAATTAGAAGAAAGAACAG GATATGGTGGTGG ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 104174 AAGTATGCTAAATTAGAAGAAAGAACAGGTA...AAGGATATGGTGGTGG 350 . : . : . : . : . : 315 TTTTAATGAAAGAGAAAATGTTGAATATATAGAAAGAGAAGAATCTGATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108461 TTTTAATGAAAGAGAAAATGTTGAATATATAGAAAGAGAAGAATCTGATG 400 . : . : . : . : . : 365 GTGAATATGATGAG TTTGGACGTAAAAAGAAAAAATACAGA ||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||| 108511 GTGAATATGATGAGGTA...TAGTTTGGACGTAAAAAGAAAAAATACAGA 450 . : . : . : . : . : 406 GGGAAAGCAGTTGGTCCTGCATCTATATTAAAGGAAGTTGAAGATAAAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108768 GGGAAAGCAGTTGGTCCTGCATCTATATTAAAGGAAGTTGAAGATAAAGA 500 . : . : . : . : . : 456 ATCAGAGGGAGAAGAAGAGGATGAGGATGAAGATCTTTCTAAATATAAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108818 ATCAGAGGGAGAAGAAGAGGATGAGGATGAAGATCTTTCTAAATATAAGT 550 . : . : . : . : . : 506 TAGATGAG GATGAGGATGAAGATGACGCTGATCTCTCAAAA ||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||| 108868 TAGATGAGGTG...TAGGATGAGGATGAAGATGACGCTGATCTCTCAAAA 600 . : . : . : . : . : 547 TATAATCTTGATGCCAGTGAAGAAGAAGATAGTAATAAAAAGAAATCTAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 110033 TATAATCTTGATGCCAGTGAAGAAGAAGATAGTAATAAAAAGAAATCTAA 650 . : . : . : . : . : 597 TAGACGAAGTCGCTCAAAGTCTGGATCTTCACATTCACGATCTTCATCAC |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| 110083 TAGACGAAGTCGCTCAAAGTCTCGATCTTCACATTCACGATCTTCATCAC 700 . : . : . : . : . : 647 GCTCATCCTCCCCCTCAAGTTCAAGGTCTAGGTCCAG GTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||| 110133 GCTCATCCTCCCCCTCAAGTTCAAGGTCTAGGTCCAGGTA...CAGGTCC 750 . : . : . : . : . : 688 CGTTCAAGAAGTTCTTCCAGTTCGCAGTCAAGATCTCGTTCCAGTTCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 111638 CGTTCAAGAAGTTCTTCCAGTTCGCAGTCAAGATCTCGTTCCAGTTCCAG 800 . : . : . : . : . : 738 AGAACGTTCGAGATCTCGTGGGTCGAAATCAAG ATCCAGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| 111688 AGAACGTTCGAGATCTCGTGGGTCGAAATCAAGGTG...AAGATCCAGCT 850 . : . : . : . : . : 779 CCAGGTCCCACAGGGGCTCTTCTTCCCCACGAAAAAGATCTTATTCAAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114070 CCAGGTCCCACAGGGGCTCTTCTTCCCCACGAAAAAGATCTTATTCAAGT 900 . : . : . : . : . : 829 TCATCATCTTCTCCTGAGAGGAACAGAAAGAGAAGTCGTTCTAGATCTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114120 TCATCATCTTCTCCTGAGAGGAACAGAAAGAGAAGTCGTTCTAGATCTTC 950 . : . : . : . : . : 879 TTCATCTGGTGATCGCAAAAAAAGACGAACAAGATCACGGTCACCCGAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114170 TTCATCTGGTGATCGCAAAAAAAGACGAACAAGATCACGGTCACCCGAAA 1000 . : . : . : . : 929 G CCAGGTGATTGGTGAAAACACTAAACAACCC |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 114220 GGTT...AAGCCAGGTGATTGGTGAAAACACTAAACAACCC