Result of FASTA (omim) for pF1KB7754
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7754, 496 aa
  1>>>pF1KB7754 496 - 496 aa - 496 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1130+/-0.000451; mu= 2.4641+/- 0.028
 mean_var=302.9904+/-63.107, 0's: 0 Z-trim(119.8): 1912  B-trim: 135 in 1/55
 Lambda= 0.073682
 statistics sampled from 32085 (34313) to 32085 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.744), E-opt: 0.2 (0.402), width:  16
 Scan time:  8.310

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
XP_011524533 (OMIM: 609601) PREDICTED: zinc finger ( 534)  699 88.1 6.7e-17
XP_016881531 (OMIM: 609601) PREDICTED: zinc finger ( 534)  699 88.1 6.7e-17
NP_001128650 (OMIM: 609601) zinc finger protein 39 ( 534)  699 88.1 6.7e-17
XP_011520948 (OMIM: 601473) PREDICTED: zinc finger ( 500)  681 86.2 2.4e-16
XP_011529693 (OMIM: 314997) PREDICTED: zinc finger ( 510)  648 82.7 2.8e-15
XP_005262526 (OMIM: 314997) PREDICTED: zinc finger ( 510)  648 82.7 2.8e-15
NP_009062 (OMIM: 314997) zinc finger protein 75D i ( 510)  648 82.7 2.8e-15
XP_016885222 (OMIM: 300573) PREDICTED: zinc finger ( 513)  560 73.3 1.8e-12
XP_016885221 (OMIM: 300573) PREDICTED: zinc finger ( 513)  560 73.3 1.8e-12
XP_016885219 (OMIM: 300573) PREDICTED: zinc finger ( 514)  560 73.3 1.8e-12
XP_016885217 (OMIM: 300573) PREDICTED: zinc finger ( 514)  560 73.3 1.8e-12
XP_016885220 (OMIM: 300573) PREDICTED: zinc finger ( 514)  560 73.3 1.8e-12
XP_016885218 (OMIM: 300573) PREDICTED: zinc finger ( 514)  560 73.3 1.8e-12
XP_011542247 (OMIM: 300573) PREDICTED: zinc finger ( 514)  560 73.3 1.8e-12
XP_011513163 (OMIM: 602277) PREDICTED: zinc finger ( 675)  562 73.7 1.9e-12
NP_001305822 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 675)  562 73.7 1.9e-12
XP_011542246 (OMIM: 300573) PREDICTED: zinc finger ( 545)  560 73.4 1.9e-12
NP_001139763 (OMIM: 300573) zinc finger protein 67 ( 575)  560 73.4   2e-12
NP_001177346 (OMIM: 300573) zinc finger protein 67 ( 576)  560 73.4   2e-12
XP_011542245 (OMIM: 300573) PREDICTED: zinc finger ( 580)  560 73.4   2e-12
XP_011542243 (OMIM: 300573) PREDICTED: zinc finger ( 581)  560 73.4   2e-12
NP_001034980 (OMIM: 300573) zinc finger protein 67 ( 581)  560 73.4   2e-12
NP_001305821 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751)  562 73.7   2e-12
NP_001305820 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751)  562 73.7   2e-12
NP_009080 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 i ( 751)  562 73.7   2e-12
XP_006716174 (OMIM: 194510) PREDICTED: zinc finger ( 410)  556 72.8 2.1e-12
NP_001265220 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3  ( 410)  556 72.8 2.1e-12
NP_001265221 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3  ( 410)  556 72.8 2.1e-12
XP_016868071 (OMIM: 194510) PREDICTED: zinc finger ( 410)  556 72.8 2.1e-12
XP_016868072 (OMIM: 194510) PREDICTED: zinc finger ( 410)  556 72.8 2.1e-12
NP_116313 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 iso ( 446)  556 72.8 2.2e-12
NP_001265216 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3  ( 446)  556 72.8 2.2e-12
NP_001265213 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3  ( 446)  556 72.8 2.2e-12
NP_001305064 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3  ( 446)  556 72.8 2.2e-12
NP_001265219 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3  ( 446)  556 72.8 2.2e-12
NP_001311070 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693)  560 73.5 2.2e-12
NP_001311072 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693)  560 73.5 2.2e-12
NP_001311078 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693)  560 73.5 2.2e-12
NP_001311068 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693)  560 73.5 2.2e-12
NP_001311081 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693)  560 73.5 2.2e-12
NP_001311074 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693)  560 73.5 2.2e-12
NP_001305065 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3  ( 453)  556 72.8 2.3e-12
NP_001311086 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 743)  560 73.5 2.4e-12
NP_001311085 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 745)  560 73.5 2.4e-12
NP_001311069 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779)  560 73.5 2.4e-12
NP_700359 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 is ( 779)  560 73.5 2.4e-12
NP_001311073 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779)  560 73.5 2.4e-12
XP_016885306 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 779)  560 73.5 2.4e-12
NP_001311079 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779)  560 73.5 2.4e-12
NP_009061 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 is ( 779)  560 73.5 2.4e-12


>>XP_011524533 (OMIM: 609601) PREDICTED: zinc finger pro  (534 aa)
 initn: 3366 init1: 487 opt: 699  Z-score: 424.4  bits: 88.1 E(85289): 6.7e-17
Smith-Waterman score: 723; 31.5% identity (56.7% similar) in 480 aa overlap (32-490:38-503)

              10        20        30        40        50         60
pF1KB7 AANCTSSWSLGESCNRPGLELPRSMASSETQLGNHDVDPEISHVNFRMFSCPKESD-PIQ
                                     : :. .   :. . .:: : : .:.  : .
XP_011 ISTLIPQDPPEQELILVKVEDNFSWDEKFKQNGSTQSCQELFRQQFRKF-CYQETPGPRE
        10        20        30        40        50         60      

               70        80        90       100       110          
pF1KB7 ALRKLTELCHLWLRPDLHTKEQILDMLVMEQFMISMPQELQVLVMMNGVQSCKD----LE
       :: .: :::. :: :.::::::::..::.:::.  .:.:::. :.... .: ..    ::
XP_011 ALSRLQELCYQWLMPELHTKEQILELLVLEQFLSILPEELQIWVQQHNPESGEEAVTLLE
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pF1KB7 DLLRNNRRPKKWSVVTFHGKEYIVQD----------SDIEMAEAPSSVRDDLKDVSSQRA
       :: :.   : .   .. .:     .:          .::..    .....    .: .  
XP_011 DLEREFDDPGQQVPASPQGPAVPWKDLTCLRASQESTDIHLQPLKTQLKSWKPCLSPKSD
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pF1KB7 SSVNQMRPGEGQAHRELQILPRVPALSR-RQGEDFLLHKSIDVTGDPKSLRPKQ--TLEK
          ..    :: .... : ::. :..    . :. :. :. ..::. :   :.:  .. .
XP_011 CENSETATKEGISEEKSQGLPQEPSFRGISEHESNLVWKQGSATGE-KLRSPSQGGSFSQ
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pF1KB7 DLKENREENP-GLTSPEPQLPKSPTDLVRAKEGKDPP--KIASVENVDADTPSACVVERE
        .  :.  .   : .   .     :: .  .  : ::  .    .    .  .   . ..
XP_011 VIFTNKSLGKRDLYDEAERCLILTTDSIMCQ--KVPPEERPYRCDVCGHSFKQHSSLTQH
         250       260       270         280       290       300   

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pF1KB7 ASTHSGNRGDALNLSSPKRSKPDASSISQEEPQGEATPVGNRESPGQAGMNSIHSPGPAS
          :.:..    :  .   :  .   : :.  .:: .     :  .. :    .: .   
XP_011 QRIHTGEKPYKCNQCGKAFSLRSYLIIHQRIHSGEKA----YEC-SECGKAFNQSSALIR
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pF1KB7 PVSHPDGQEAKALPPFACDVCEKRFTCNSKLVIHKRSHTGERLFQCNLCGKRFMQLISLQ
         .   :..:       :. : : :. .: :.::.: ::::. ..:: ::: : :  .: 
XP_011 HRKIHTGEKA-----CKCNECGKAFSQSSYLIIHQRIHTGEKPYECNECGKTFSQSSKLI
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pF1KB7 FHQRTHTGERPYTCDVCQKQFTQKSYLKCHKRSHTGEKPFECKDCKKVFTYRGSLKEHQR
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pF1KB7 IHSGEKPYKCSKCPRAFSRLKLLRRHQKTHPEATSQ                        
       :::::.::.:..: ..:.: . : .::. :                              
XP_011 IHSGEEPYQCNECGKTFKRSSALVQHQRIHSGDEAYICNECGKAFRHRSVLMRHQRVHTI
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>>XP_016881531 (OMIM: 609601) PREDICTED: zinc finger pro  (534 aa)
 initn: 3366 init1: 487 opt: 699  Z-score: 424.4  bits: 88.1 E(85289): 6.7e-17
Smith-Waterman score: 723; 31.5% identity (56.7% similar) in 480 aa overlap (32-490:38-503)

              10        20        30        40        50         60
pF1KB7 AANCTSSWSLGESCNRPGLELPRSMASSETQLGNHDVDPEISHVNFRMFSCPKESD-PIQ
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XP_016 ISTLIPQDPPEQELILVKVEDNFSWDEKFKQNGSTQSCQELFRQQFRKF-CYQETPGPRE
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pF1KB7 ALRKLTELCHLWLRPDLHTKEQILDMLVMEQFMISMPQELQVLVMMNGVQSCKD----LE
       :: .: :::. :: :.::::::::..::.:::.  .:.:::. :.... .: ..    ::
XP_016 ALSRLQELCYQWLMPELHTKEQILELLVLEQFLSILPEELQIWVQQHNPESGEEAVTLLE
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pF1KB7 DLLRNNRRPKKWSVVTFHGKEYIVQD----------SDIEMAEAPSSVRDDLKDVSSQRA
       :: :.   : .   .. .:     .:          .::..    .....    .: .  
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pF1KB7 SSVNQMRPGEGQAHRELQILPRVPALSR-RQGEDFLLHKSIDVTGDPKSLRPKQ--TLEK
          ..    :: .... : ::. :..    . :. :. :. ..::. :   :.:  .. .
XP_016 CENSETATKEGISEEKSQGLPQEPSFRGISEHESNLVWKQGSATGE-KLRSPSQGGSFSQ
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pF1KB7 DLKENREENP-GLTSPEPQLPKSPTDLVRAKEGKDPP--KIASVENVDADTPSACVVERE
        .  :.  .   : .   .     :: .  .  : ::  .    .    .  .   . ..
XP_016 VIFTNKSLGKRDLYDEAERCLILTTDSIMCQ--KVPPEERPYRCDVCGHSFKQHSSLTQH
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pF1KB7 ASTHSGNRGDALNLSSPKRSKPDASSISQEEPQGEATPVGNRESPGQAGMNSIHSPGPAS
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pF1KB7 PVSHPDGQEAKALPPFACDVCEKRFTCNSKLVIHKRSHTGERLFQCNLCGKRFMQLISLQ
         .   :..:       :. : : :. .: :.::.: ::::. ..:: ::: : :  .: 
XP_016 HRKIHTGEKA-----CKCNECGKAFSQSSYLIIHQRIHTGEKPYECNECGKTFSQSSKLI
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pF1KB7 FHQRTHTGERPYTCDVCQKQFTQKSYLKCHKRSHTGEKPFECKDCKKVFTYRGSLKEHQR
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XP_016 RHQRIHTGERPYECNECGKAFRQSSELITHQRIHSGEKPYECSECGKAFSLSSNLIRHQR
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pF1KB7 IHSGEKPYKCSKCPRAFSRLKLLRRHQKTHPEATSQ                        
       :::::.::.:..: ..:.: . : .::. :                              
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        .  :.  .   : .   .     :: .  .  : ::  .    .    .  .   . ..
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NP_001 IHSGEEPYQCNECGKTFKRSSALVQHQRIHSGDEAYICNECGKAFRHRSVLMRHQRVHTI
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XP_011 QTWNGVAVHELGKEAVLLG---ETAEASSF---GLKPTESQPVG-VSQDEE-FWNTYEGL
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XP_011 Q-----EQLSRNT------HKETEPVYE-RAVPTQQILA--FPEQTNTKDWTVTPEHVLP
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       .: . :.     ..     : :. .   :.  ..  ..  .. .   .:.:.  . ..  
XP_011 ESQSLLTF----EEVAMYFSQEEWELLDPTQKALYNDVMQENYETVISLGLKLKNDTENH
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XP_011 QPVSLSDLEIQASAGVISKKAKVKVPQKTAGKENHFDMHRVGKWHQDFPVKKRKKLSTWK
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        .:. :  :: : .:: :. : :.:.:.. :. :.:.::::::: :..: : :.  . : 
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       .:.: :.::.:: :: : : ::: . : :::: :      
XP_011 KHRRTHTGEQPYTCSICRRNFSRRSSLLRHQKLHL     
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       .    :. ..  .  : :: .     .     .:  . . :.     ...  : : :. .
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pF1KB7 VEREASTHSGNRGDALNLSSPKRSKPDASSISQEEPQGEATPVGNRESPGQAG-----MN
        : ..:    ..   .....   .. . ..  . .   .: :  .:..:.        . 
XP_011 SEIQTSGCEVSKKTRMKIAQKTMGRENPGDTHSVQKWHRAFPRKKRKKPATCKQELPKLM
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pF1KB7 SIHSPGPASPVSHPDGQEAKALPPFACDVCEKRFTCNSKLVIHKRSHTGERLFQCNLCGK
       ..:. ::.       :..     :: :. : : :  .: :. :.: ::::. ..:. : .
XP_011 DLHGKGPT-------GEK-----PFKCQECGKSFRVSSDLIKHHRIHTGEKPYKCQQCDR
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pF1KB7 RFMQLISLQFHQRTHTGERPYTCDVCQKQFTQKSYLKCHKRSHTGEKPFECKDCKKVFTY
       ::    .:. :  :: : .:: :. : :.:.... :. :.: :::::::.: .: : :  
XP_011 RFRWSSDLNKHFMTHQGIKPYRCSWCGKSFSHNTNLHTHQRIHTGEKPFKCDECGKRFIQ
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pF1KB7 RGSLKEHQRIHSGEKPYKCSKCPRAFSRLKLLRRHQKTHPEATSQ     
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XP_011 NSHLIKHQRTHTGEQPYTCSLCKRNFSRRSSLLRHQKLHRRREACLVSPN
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Smith-Waterman score: 651; 28.2% identity (54.5% similar) in 514 aa overlap (1-490:6-499)

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pF1KB7      MAANCTSSWSLGESCNRPGLELPRSMASSETQLGNHDVDPEISHVNFRMFSCPKE
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XP_005 MAMRELNADSCSSPQMGAMWETSGSVKENSSQSKKYSTKIENLGPESACRHFWSFRYHEA
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pF1KB7 SDPIQALRKLTELCHLWLRPDLHTKEQILDMLVMEQFMISMPQELQVLVMMNGVQSCKDL
       . :.... .: .::: ::::..:.:::::.:::.:::.  .:.: :  :. .  :. :. 
XP_005 TGPLETISQLQKLCHQWLRPEIHSKEQILEMLVLEQFLSILPKETQNWVQKHHPQNVKQA
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         120         130         140       150            160      
pF1KB7 EDLLRN-NRRPK-KWSVVTFH--GKEYIVQDSDIEMAEAPS-----SVRDDLKDVSSQRA
         :..  .:.:    . :: :  ::: ..  .    : ::.     .  . .   ...  
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       ..   ..   : ..:.: :     :.  :   .. .:  : .      ..  :  : ..:
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       .    :. ..  .  : :: .     .     .:  . . :.     ...  : : :. .
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        : ..:    ..   .....   .. . ..  . .   .: :  .:..:.        . 
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pF1KB7 SIHSPGPASPVSHPDGQEAKALPPFACDVCEKRFTCNSKLVIHKRSHTGERLFQCNLCGK
       ..:. ::.       :..     :: :. : : :  .: :. :.: ::::. ..:. : .
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pF1KB7 RFMQLISLQFHQRTHTGERPYTCDVCQKQFTQKSYLKCHKRSHTGEKPFECKDCKKVFTY
       ::    .:. :  :: : .:: :. : :.:.... :. :.: :::::::.: .: : :  
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>>NP_009062 (OMIM: 314997) zinc finger protein 75D isofo  (510 aa)
 initn: 994 init1: 485 opt: 648  Z-score: 395.3  bits: 82.7 E(85289): 2.8e-15
Smith-Waterman score: 651; 28.2% identity (54.5% similar) in 514 aa overlap (1-490:6-499)

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pF1KB7      MAANCTSSWSLGESCNRPGLELPRSMASSETQLGNHDVDPEISHVNFRMFSCPKE
            . :.  :: ..:   .  :     :  :.. .   ... :: .  .:  :   . 
NP_009 MAMRELNADSCSSPQMGAMWETSGSVKENSSQSKKYSTKIENLGPESACRHFWSFRYHEA
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pF1KB7 SDPIQALRKLTELCHLWLRPDLHTKEQILDMLVMEQFMISMPQELQVLVMMNGVQSCKDL
       . :.... .: .::: ::::..:.:::::.:::.:::.  .:.: :  :. .  :. :. 
NP_009 TGPLETISQLQKLCHQWLRPEIHSKEQILEMLVLEQFLSILPKETQNWVQKHHPQNVKQA
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pF1KB7 EDLLRN-NRRPK-KWSVVTFH--GKEYIVQDSDIEMAEAPS-----SVRDDLKDVSSQRA
         :..  .:.:    . :: :  ::: ..  .    : ::.     .  . .   ...  
NP_009 LVLVEFLQREPDGTKNEVTAHELGKEAVLLGGT---AVAPGFKWKPAEPQPMGVFQKEYW
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pF1KB7 SSVNQMRPGEG-QAHRELQILPRVPALSRRQGEDFLLHKSIDVTGDPKSLRPKQTLEKDL
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pF1KB7 KENREENPGL--TSPEPQLPKSPTDLVRAKEGKDPPK-IASV-----ENVDADTP-SACV
       .    :. ..  .  : :: .     .     .:  . . :.     ...  : : :. .
NP_009 SLLTFEDVAVYFSEEEWQLLNPLEKTLYNDVMQDIYETVISLGLKLKNDTGNDHPISVST
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pF1KB7 VEREASTHSGNRGDALNLSSPKRSKPDASSISQEEPQGEATPVGNRESPGQAG-----MN
        : ..:    ..   .....   .. . ..  . .   .: :  .:..:.        . 
NP_009 SEIQTSGCEVSKKTRMKIAQKTMGRENPGDTHSVQKWHRAFPRKKRKKPATCKQELPKLM
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pF1KB7 RFMQLISLQFHQRTHTGERPYTCDVCQKQFTQKSYLKCHKRSHTGEKPFECKDCKKVFTY
       ::    .:. :  :: : .:: :. : :.:.... :. :.: :::::::.: .: : :  
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pF1KB7 RGSLKEHQRIHSGEKPYKCSKCPRAFSRLKLLRRHQKTHPEATSQ     
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NP_009 NSHLIKHQRTHTGEQPYTCSLCKRNFSRRSSLLRHQKLHRRREACLVSPN
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>>XP_016885222 (OMIM: 300573) PREDICTED: zinc finger pro  (513 aa)
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        ::   :.: .  :   . :  ...   : :. . .:  .... . ..  . :. : :  
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pF1KB7 DASSISQEEPQGEATPVGNRESPGQAGMNSIHSPGPASPVSHPDGQEAKALPPFACDVCE
              .:   : .  : .   :.. . :.:.        :  :..     :. :..: 
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pF1KB7 KRFTCNSKLVIHKRSHTGERLFQCNLCGKRFMQLISLQFHQRTHTGERPYTCDVCQKQFT
       : :. .:.: .:.:.::::. ..:  ::: : .  .:  ::: ::::.:: :. : : :.
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       .:: :  :.: ::::.:.:: ::::.:. ...: .:::::.::::::::.: .:::  . 
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pF1KB7 LRRHQKTHPEATSQ                            
       :  :..::                                  
XP_016 LIVHHRTHTGEKPYECRDCGKAFSGKSTLIKHQRSHTGDKNL
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>--
 initn: 516 init1: 346 opt: 359  Z-score: 229.3  bits: 52.0 E(85289): 5e-06
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pF1KB7 GMNSIHSPGPASPVSHPDGQEAKALPPFACDVCEKRFTCNSKLVIHKRSHTGERLFQCNL
                                     : :.  .    .  .:: .. .::.:. : 
XP_016 RLPKYYSWERCSKHHLNFLGQNRSYVRKKDDGCKAYWKVCLHYNLHK-AQPAERFFDPNQ
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pF1KB7 CGKRFMQLISLQFHQRTHTGERPYTCDVCQKQFTQKSYLKCHKRSHTGEKPFECKDCKKV
        :: . :  .:.  ::..:::. : :  : : : ::. :  :.:.::::::.:: .: :.
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pF1KB7 FTYRGSLKEHQRIHSGEKPYKCSKCPRAFSRLKLLRRHQKTHPEATSQ            
       :. ...:  ::: :.:::::.::.:                                   
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>>XP_016885221 (OMIM: 300573) PREDICTED: zinc finger pro  (513 aa)
 initn: 2065 init1: 560 opt: 560  Z-score: 344.7  bits: 73.3 E(85289): 1.8e-12
Smith-Waterman score: 572; 35.6% identity (60.8% similar) in 278 aa overlap (213-490:219-479)

            190       200       210       220       230       240  
pF1KB7 LQILPRVPALSRRQGEDFLLHKSIDVTGDPKSLRPKQTLEKDLKENREENPGLTSPEPQL
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XP_016 CAKAFSQKSTLIAHQRTHTGEKPYECSECGKTFIQKSTLIKHQRTHTGEKPFVCDKCPKA
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pF1KB7 PKSPTDLVRAKEGKDPPKIASVENVDADTPSACVVEREASTHSGNRGDALNLSSPKRSKP
        ::   :.: .  :   . :  ...   : :. . .:  .... . ..  . :. : :  
XP_016 FKSSYHLIRHE--KTHIRQAFYKGIKC-TTSSLIYQRIHTSEKPQCSEHGKASDEKPSPT
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            310       320       330       340       350       360  
pF1KB7 DASSISQEEPQGEATPVGNRESPGQAGMNSIHSPGPASPVSHPDGQEAKALPPFACDVCE
              .:   : .  : .   :.. . :.:.        :  :..     :. :..: 
XP_016 KHWRTHTKENIYECSKCG-KSFRGKSHL-SVHQ------RIHT-GEK-----PYECSICG
         310       320        330              340             350 

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pF1KB7 KRFTCNSKLVIHKRSHTGERLFQCNLCGKRFMQLISLQFHQRTHTGERPYTCDVCQKQFT
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XP_016 KTFSGKSHLSVHHRTHTGEKPYECRRCGKAFGEKSTLIVHQRMHTGEKPYKCNECGKAFS
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pF1KB7 QKSYLKCHKRSHTGEKPFECKDCKKVFTYRGSLKEHQRIHSGEKPYKCSKCPRAFSRLKL
       .:: :  :.: ::::.:.:: ::::.:. ...: .:::::.::::::::.: .:::  . 
XP_016 EKSPLIKHQRIHTGERPYECTDCKKAFSRKSTLIKHQRIHTGEKPYKCSECGKAFSVKST
             420       430       440       450       460       470 

            490                                  
pF1KB7 LRRHQKTHPEATSQ                            
       :  :..::                                  
XP_016 LIVHHRTHTGEKPYECRDCGKAFSGKSTLIKHQRSHTGDKNL
             480       490       500       510   

>--
 initn: 516 init1: 346 opt: 359  Z-score: 229.3  bits: 52.0 E(85289): 5e-06
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      330       340       350       360       370       380        
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                                     : :.  .    .  .:: .. .::.:. : 
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pF1KB7 CGKRFMQLISLQFHQRTHTGERPYTCDVCQKQFTQKSYLKCHKRSHTGEKPFECKDCKKV
        :: . :  .:.  ::..:::. : :  : : : ::. :  :.:.::::::.:: .: :.
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pF1KB7 FTYRGSLKEHQRIHSGEKPYKCSKCPRAFSRLKLLRRHQKTHPEATSQ            
       :. ...:  ::: :.:::::.::.:                                   
XP_016 FSQKSTLIAHQRTHTGEKPYECSECGKTFIQKSTLIKHQRTHTGEKPFVCDKCPKAFKSS
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>>XP_016885219 (OMIM: 300573) PREDICTED: zinc finger pro  (514 aa)
 initn: 2065 init1: 560 opt: 560  Z-score: 344.7  bits: 73.3 E(85289): 1.8e-12
Smith-Waterman score: 572; 35.6% identity (60.8% similar) in 278 aa overlap (213-490:220-480)

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                                     :..  :.:: :  . .  :.: . .  :. 
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pF1KB7 PKSPTDLVRAKEGKDPPKIASVENVDADTPSACVVEREASTHSGNRGDALNLSSPKRSKP
        ::   :.: .  :   . :  ...   : :. . .:  .... . ..  . :. : :  
XP_016 FKSSYHLIRHE--KTHIRQAFYKGIKC-TTSSLIYQRIHTSEKPQCSEHGKASDEKPSPT
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              .:   : .  : .   :.. . :.:.        :  :..     :. :..: 
XP_016 KHWRTHTKENIYECSKCG-KSFRGKSHL-SVHQ------RIHT-GEK-----PYECSICG
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pF1KB7 KRFTCNSKLVIHKRSHTGERLFQCNLCGKRFMQLISLQFHQRTHTGERPYTCDVCQKQFT
       : :. .:.: .:.:.::::. ..:  ::: : .  .:  ::: ::::.:: :. : : :.
XP_016 KTFSGKSHLSVHHRTHTGEKPYECRRCGKAFGEKSTLIVHQRMHTGEKPYKCNECGKAFS
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       .:: :  :.: ::::.:.:: ::::.:. ...: .:::::.::::::::.: .:::  . 
XP_016 EKSPLIKHQRIHTGERPYECTDCKKAFSRKSTLIKHQRIHTGEKPYKCSECGKAFSVKST
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pF1KB7 LRRHQKTHPEATSQ                            
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XP_016 LIVHHRTHTGEKPYECRDCGKAFSGKSTLIKHQRSHTGDKNL
            480       490       500       510    

>--
 initn: 659 init1: 346 opt: 359  Z-score: 229.2  bits: 52.0 E(85289): 5e-06
Smith-Waterman score: 359; 44.3% identity (68.7% similar) in 115 aa overlap (359-473:105-218)

      330       340       350       360       370       380        
pF1KB7 GMNSIHSPGPASPVSHPDGQEAKALPPFACDVCEKRFTCNSKLVIHKRSHTGERLFQCNL
                                     : :.  .    .  .:: .. .::.:. : 
XP_016 RLPKYYSWERCSKHHLNFLGQNRSYVRKKDDGCKAYWKVCLHYNLHK-AQPAERFFDPNQ
           80        90       100       110       120        130   

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        :: . :  .:.  ::..:::. : :  : : : ::. :  :.:.::::::.:: .: :.
XP_016 RGKALHQKQALRKSQRSQTGEKLYKCTECGKVFIQKANLVVHQRTHTGEKPYECCECAKA
           140       150       160       170       180       190   

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pF1KB7 FTYRGSLKEHQRIHSGEKPYKCSKCPRAFSRLKLLRRHQKTHPEATSQ            
       :. ...:  ::: :.:::::.::.:                                   
XP_016 FSQKSTLIAHQRTHTGEKPYECSECGKTFIQKSTLIKHQRTHTGEKPFVCDKCPKAFKSS
           200       210       220       230       240       250   




496 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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 Total Scan time:  8.310 Total Display time:  0.060

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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