Result of FASTA (omim) for pF1KB7808
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7808, 595 aa
  1>>>pF1KB7808 595 - 595 aa - 595 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7540+/-0.000787; mu= 14.8060+/- 0.049
 mean_var=350.5758+/-68.865, 0's: 0 Z-trim(112.3): 2022  B-trim: 117 in 1/51
 Lambda= 0.068499
 statistics sampled from 18809 (21134) to 18809 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.248), width:  16
 Scan time:  8.670

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
XP_006722936 (OMIM: 194543) PREDICTED: zinc finger ( 569) 3224 334.1 7.6e-91
NP_001190179 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 ( 529) 2068 219.8 1.8e-56
NP_066966 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 is ( 532) 2061 219.1 2.9e-56
NP_660338 (OMIM: 612248) zinc finger protein 627 i ( 461) 1851 198.3 4.8e-50
NP_003428 (OMIM: 604078) zinc finger protein 136 [ ( 540) 1847 198.0 6.8e-50
NP_057348 (OMIM: 194542) zinc finger protein 44 is ( 615) 1814 194.8 6.9e-49
XP_011526366 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1807 194.2 1.1e-48
XP_011526364 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 653) 1807 194.2 1.2e-48
NP_001157748 (OMIM: 194542) zinc finger protein 44 ( 663) 1807 194.2 1.2e-48
NP_005806 (OMIM: 606697) zinc finger protein 443 [ ( 671) 1800 193.5 1.9e-48
XP_016881629 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 673) 1796 193.1 2.5e-48
XP_016881628 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 685) 1796 193.1 2.5e-48
XP_011525925 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 718) 1796 193.2 2.6e-48
NP_001277012 (OMIM: 612248) zinc finger protein 62 ( 429) 1688 182.1 3.3e-45
XP_011526082 (OMIM: 612248) PREDICTED: zinc finger ( 429) 1688 182.1 3.3e-45
XP_011526571 (OMIM: 604078) PREDICTED: zinc finger ( 508) 1682 181.6 5.4e-45
XP_011525924 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 639) 1670 180.6 1.4e-44
XP_016882359 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 583) 1657 179.3 3.2e-44
XP_011526368 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 571) 1613 174.9 6.4e-43
XP_016882732 (OMIM: 604078) PREDICTED: zinc finger ( 474) 1552 168.7 3.8e-41
NP_066358 (OMIM: 194556) zinc finger protein 14 [H ( 642) 1462 160.1 2.1e-38
XP_016882360 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 503) 1443 158.0 6.9e-38
XP_005259991 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 503) 1443 158.0 6.9e-38
NP_001277014 (OMIM: 612248) zinc finger protein 62 ( 351) 1420 155.5 2.8e-37
NP_001277013 (OMIM: 612248) zinc finger protein 62 ( 351) 1420 155.5 2.8e-37
NP_940937 (OMIM: 609571) zinc finger protein 699 [ ( 642) 1422 156.1 3.2e-37
NP_149981 (OMIM: 603983) zinc finger protein 101 i ( 436) 1370 150.7 9.6e-36
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1368 150.8 1.3e-35
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1368 150.8 1.3e-35
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1368 150.8 1.3e-35
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1368 150.8 1.3e-35
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1368 150.8 1.3e-35
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1368 150.8 1.3e-35
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1368 150.8 1.3e-35
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1368 150.8 1.3e-35
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1368 150.8 1.3e-35
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1368 150.8 1.3e-35
NP_001291423 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1320 146.0 3.4e-34
NP_001291422 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1320 146.0 3.4e-34
NP_666016 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 is ( 643) 1320 146.1 3.5e-34
NP_001291421 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 643) 1320 146.1 3.5e-34
NP_066385 (OMIM: 606954) zinc finger protein 253 i ( 499) 1314 145.3 4.7e-34
XP_016882570 (OMIM: 194551) PREDICTED: zinc finger ( 365) 1299 143.5 1.1e-33
XP_016882571 (OMIM: 194551) PREDICTED: zinc finger ( 365) 1299 143.5 1.1e-33
NP_067040 (OMIM: 194551) zinc finger protein 77 [H ( 545) 1299 143.9 1.4e-33
XP_016881871 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1290 142.9 2.5e-33
XP_016881868 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1290 142.9 2.5e-33
XP_016881869 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1290 142.9 2.5e-33
NP_001317411 (OMIM: 613904) zinc finger protein 56 ( 527) 1290 142.9 2.5e-33
XP_016881867 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 650) 1290 143.1 2.8e-33


>>XP_006722936 (OMIM: 194543) PREDICTED: zinc finger pro  (569 aa)
 initn: 3224 init1: 3224 opt: 3224  Z-score: 1752.0  bits: 334.1 E(85289): 7.6e-91
Smith-Waterman score: 3224; 90.2% identity (95.9% similar) in 489 aa overlap (2-490:25-513)

                                      10        20        30       
pF1KB7                        MDPVAFKDVAVNFTQEEWALLDISQRKLYREVMLETF
                               ::::: ::::::::::::::::::::::.:::::::
XP_006 MPCCSHRRCREDPGTSESQEMMFQDPVAFDDVAVNFTQEEWALLDISQRKLYKEVMLETF
               10        20        30        40        50        60

        40        50        60        70        80        90       
pF1KB7 RNLTSIGKRWKDQNIEYEHQNPRRNFRSLIEEKVNEIKDDSHCGETFTPVPDDRLNFQEK
       :::::.:: :::::::::.::::::::::::.:::::::::::::::: :::::::::::
XP_006 RNLTSVGKSWKDQNIEYEYQNPRRNFRSLIEKKVNEIKDDSHCGETFTQVPDDRLNFQEK
               70        80        90       100       110       120

       100       110       120       130       140       150       
pF1KB7 KASPEVKSCESFVCGEVGLGNSSFNMSIRGDIGHKAYEYQEYGPKPCKCQQPKKAFRYRP
       :::::.:::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:
XP_006 KASPEIKSCDSFVCGEVGLGNSSFNMNIRGDIGHKAYEYQEYGPKPCKCQQPKKAFRYHP
              130       140       150       160       170       180

       160       170       180       190       200       210       
pF1KB7 SFRTQERDHTGEKPNACKVCGKTFISHSSVRRHMVMHSGDGPYKCKFCGKAFHCLRLYLI
       :::: .:::::::: ::: ::::::::::..::.::::::::::::::::::::: ::::
XP_006 SFRTPQRDHTGEKPYACKECGKTFISHSSIQRHVVMHSGDGPYKCKFCGKAFHCLSLYLI
              190       200       210       220       230       240

       220       230       240       250       260       270       
pF1KB7 HERIHTGEKPCECKQCGKSFSYSATHRIHKRTHTGEKPYEYQECGKAFHSPRSYRRHERI
       :::::::::: :::::::::::::: :::.:::::::::: :.::::::::: :::::::
XP_006 HERIHTGEKPYECKQCGKSFSYSATLRIHERTHTGEKPYECQQCGKAFHSPRCYRRHERI
              250       260       270       280       290       300

       280       290       300       310       320       330       
pF1KB7 HMGEKAYQCKECGKAFTCPRYVRIHERTHSRKNLYECKQCGKALSSLTSFQTHVRLHSGE
       : :::::::::::::::::.::::::::::::. ::: :::::::::::::::.:.::::
XP_006 HTGEKAYQCKECGKAFTCPQYVRIHERTHSRKKPYECTQCGKALSSLTSFQTHIRMHSGE
              310       320       330       340       350       360

       340       350       360       370       380       390       
pF1KB7 RPYECKICGKDFCSVNSFQRHEKIHSGEKPYKCKQCGKAFPHSSSLRYHERTHTGEKPYE
       :::::::::: :::.:::::::: :::::::::::::::: :::::::::: ::::::::
XP_006 RPYECKICGKGFCSANSFQRHEKTHSGEKPYKCKQCGKAFIHSSSLRYHERIHTGEKPYE
              370       380       390       400       410       420

       400       410       420       430       440       450       
pF1KB7 CKQCGKAFRSASHLRVHGRTHTGEKPYECKECGKAFRYVNNLQSHERTQTHIRIHSGERR
       ::::::::::.:::..:::::::::::::.::::::: ..:::::::::::.::::::: 
XP_006 CKQCGKAFRSSSHLQLHGRTHTGEKPYECQECGKAFRSMKNLQSHERTQTHVRIHSGERP
              430       440       450       460       470       480

       460       470       480       490       500       510       
pF1KB7 YKCKICGKGFYCPKSFQRHEKTHTGEKLYECKQRSVVPSVVPVPFDIMKGLTLERSPINA
       ::::.::::::::::.:::::::::::::::::                           
XP_006 YKCKLCGKGFYCPKSLQRHEKTHTGEKLYECKQCGEAFSSSSSFRYHERTHTGEKPYKCK
              490       500       510       520       530       540

       520       530       540       550       560       570       
pF1KB7 SNVGKPSELCQSFECMVGLTLKRNPMSVSNDGKPSDLPHTFEYVVGHTMERNPMHVRNVG
                                                                   
XP_006 QCGKAFRAASVLRMHGRTHPEDKPYECKQ                               
              550       560                                        

>--
 initn: 328 init1: 328 opt: 328  Z-score: 205.3  bits: 47.9 E(85289): 0.00011
Smith-Waterman score: 328; 78.6% identity (91.1% similar) in 56 aa overlap (373-428:514-569)

            350       360       370       380       390       400  
pF1KB7 KICGKDFCSVNSFQRHEKIHSGEKPYKCKQCGKAFPHSSSLRYHERTHTGEKPYECKQCG
                                     ::.::  :::.:::::::::::::.:::::
XP_006 KLCGKGFYCPKSLQRHEKTHTGEKLYECKQCGEAFSSSSSFRYHERTHTGEKPYKCKQCG
           490       500       510       520       530       540   

            410       420       430       440       450       460  
pF1KB7 KAFRSASHLRVHGRTHTGEKPYECKECGKAFRYVNNLQSHERTQTHIRIHSGERRYKCKI
       ::::.:: ::.:::::  .::::::.                                  
XP_006 KAFRAASVLRMHGRTHPEDKPYECKQ                                  
           550       560                                           

>>NP_001190179 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 iso  (529 aa)
 initn: 1503 init1: 1503 opt: 2068  Z-score: 1134.8  bits: 219.8 E(85289): 1.8e-56
Smith-Waterman score: 2068; 59.0% identity (78.4% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-480)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDPVAFKDVAVNFTQEEWALLDISQRKLYREVMLETFRNLTSIGKRWKDQNIEYEHQNPR
       :: :::.::::.:::::::::: ::..:::.:: :::.::::.:: :: :::: :..:::
NP_001 MDSVAFEDVAVSFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMQETFKNLTSVGKTWKVQNIEDEYKNPR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 RNFRSLIEEKVNEIKDDSHCGETFTPVPDDRLNFQEKKASPEVKSCESFVCGEVGLGNSS
       ::. ::..::. : :.. ::::.:. . :: ::   .:. : .  ::: :::::: :.::
NP_001 RNL-SLMREKLCESKESHHCGESFNQIADDMLN---RKTLPGITPCESSVCGEVGTGHSS
                70        80        90          100       110      

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 FNMSIRGDIGHKAYEYQEYGPKPCKCQQPKKAFRYRPSFRTQERDHTGEKPNACKVCGKT
       .:  ::.: :::. :::::: .: . .. :::: :  ::.....  : :::   : : .:
NP_001 LNTHIRADTGHKSSEYQEYGENPYRNKECKKAFSYLDSFQSHDKACTKEKPYDGKECTET
        120       130       140       150       160       170      

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 FISHSSVRRHMVMHSGDGPYKCKFCGKAFHCLRLYLIHERIHTGEKPCECKQCGKSFSYS
       ::::: ..:: ::::::::::::::::::. : : ::::::::: :: .::::::.:. :
NP_001 FISHSCIQRHRVMHSGDGPYKCKFCGKAFYFLNLCLIHERIHTGVKPYKCKQCGKAFTRS
        180       190       200       210       220       230      

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 ATHRIHKRTHTGEKPYEYQECGKAFHSPRSYRRHERIHMGEKAYQCKECGKAFTCPRYVR
       .:  .:.::::: .  : .:::.::  :   :::.: : ::: :.::.:::.:     ..
NP_001 TTLPVHERTHTGVNADECKECGNAFSFPSEIRRHKRSHTGEKPYECKQCGKVFISFSSIQ
        240       250       260       270       280       290      

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 IHERTHSRKNLYECKQCGKALSSLTSFQTHVRLHSGERPYECKICGKDFCSVNSFQRHEK
        :. ::. .. :::::::::.   . .: : : :.::.::::. ::: :  ....:::::
NP_001 YHKMTHTGEKPYECKQCGKAFRCGSHLQKHGRTHTGEKPYECRQCGKAFRCTSDLQRHEK
        300       310       320       330       340       350      

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pF1KB7 IHSGEKPYKCKQCGKAFPHSSSLRYHERTHTGEKPYECKQCGKAFRSASHLRVHGRTHTG
        :. .::: ::::::.:  .:.:. :::::.::::.:::.:::.:.  : ::.: :::::
NP_001 THTEDKPYGCKQCGKGFRCASQLQIHERTHSGEKPHECKECGKVFKYFSSLRIHERTHTG
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pF1KB7 EKPYECKECGKAFRYVNNLQSHERTQTHIRIHSGERRYKCKICGKGFYCPKSFQRHEKTH
       :::.:::.::::::: ..:. ::::      :.:.. :.::.:::.: : .:.. ::.::
NP_001 EKPHECKQCGKAFRYFSSLHIHERT------HTGDKPYECKVCGKAFTCSSSIRYHERTH
        420       430       440             450       460       470

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pF1KB7 TGEKLYECKQRSVVPSVVPVPFDIMKGLTLERSPINASNVGKPSELCQSFECMVGLTLKR
       :::: ::::.                                                  
NP_001 TGEKPYECKHCGKAFISNYIRYHERTHTGEKPYQCKQCGKAFIRASSCREHERTHTINR 
              480       490       500       510       520          

>>NP_066966 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 isofor  (532 aa)
 initn: 1503 init1: 1503 opt: 2061  Z-score: 1131.1  bits: 219.1 E(85289): 2.9e-56
Smith-Waterman score: 2061; 58.9% identity (78.3% similar) in 489 aa overlap (2-490:5-483)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB7    MDPVAFKDVAVNFTQEEWALLDISQRKLYREVMLETFRNLTSIGKRWKDQNIEYEHQ
           : :::.::::.:::::::::: ::..:::.:: :::.::::.:: :: :::: :..
NP_066 MMFQDSVAFEDVAVSFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMQETFKNLTSVGKTWKVQNIEDEYK
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB7 NPRRNFRSLIEEKVNEIKDDSHCGETFTPVPDDRLNFQEKKASPEVKSCESFVCGEVGLG
       :::::. ::..::. : :.. ::::.:. . :: ::   .:. : .  ::: :::::: :
NP_066 NPRRNL-SLMREKLCESKESHHCGESFNQIADDMLN---RKTLPGITPCESSVCGEVGTG
                70        80        90          100       110      

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pF1KB7 NSSFNMSIRGDIGHKAYEYQEYGPKPCKCQQPKKAFRYRPSFRTQERDHTGEKPNACKVC
       .::.:  ::.: :::. :::::: .: . .. :::: :  ::.....  : :::   : :
NP_066 HSSLNTHIRADTGHKSSEYQEYGENPYRNKECKKAFSYLDSFQSHDKACTKEKPYDGKEC
        120       130       140       150       160       170      

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pF1KB7 GKTFISHSSVRRHMVMHSGDGPYKCKFCGKAFHCLRLYLIHERIHTGEKPCECKQCGKSF
        .:::::: ..:: ::::::::::::::::::. : : ::::::::: :: .::::::.:
NP_066 TETFISHSCIQRHRVMHSGDGPYKCKFCGKAFYFLNLCLIHERIHTGVKPYKCKQCGKAF
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pF1KB7 SYSATHRIHKRTHTGEKPYEYQECGKAFHSPRSYRRHERIHMGEKAYQCKECGKAFTCPR
       . :.:  .:.::::: .  : .:::.::  :   :::.: : ::: :.::.:::.:    
NP_066 TRSTTLPVHERTHTGVNADECKECGNAFSFPSEIRRHKRSHTGEKPYECKQCGKVFISFS
        240       250       260       270       280       290      

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pF1KB7 YVRIHERTHSRKNLYECKQCGKALSSLTSFQTHVRLHSGERPYECKICGKDFCSVNSFQR
        .. :. ::. .. :::::::::.   . .: : : :.::.::::. ::: :  ....::
NP_066 SIQYHKMTHTGEKPYECKQCGKAFRCGSHLQKHGRTHTGEKPYECRQCGKAFRCTSDLQR
        300       310       320       330       340       350      

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pF1KB7 HEKIHSGEKPYKCKQCGKAFPHSSSLRYHERTHTGEKPYECKQCGKAFRSASHLRVHGRT
       ::: :. .::: ::::::.:  .:.:. :::::.::::.:::.:::.:.  : ::.: ::
NP_066 HEKTHTEDKPYGCKQCGKGFRCASQLQIHERTHSGEKPHECKECGKVFKYFSSLRIHERT
        360       370       380       390       400       410      

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pF1KB7 HTGEKPYECKECGKAFRYVNNLQSHERTQTHIRIHSGERRYKCKICGKGFYCPKSFQRHE
       ::::::.:::.::::::: ..:. ::::      :.:.. :.::.:::.: : .:.. ::
NP_066 HTGEKPHECKQCGKAFRYFSSLHIHERT------HTGDKPYECKVCGKAFTCSSSIRYHE
        420       430       440             450       460       470

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pF1KB7 KTHTGEKLYECKQRSVVPSVVPVPFDIMKGLTLERSPINASNVGKPSELCQSFECMVGLT
       .:::::: ::::.                                               
NP_066 RTHTGEKPYECKHCGKAFISNYIRYHERTHTGEKPYQCKQCGKAFIRASSCREHERTHTI
              480       490       500       510       520       530

>>NP_660338 (OMIM: 612248) zinc finger protein 627 isofo  (461 aa)
 initn: 2223 init1: 1483 opt: 1851  Z-score: 1019.4  bits: 198.3 E(85289): 4.8e-50
Smith-Waterman score: 1851; 58.6% identity (74.5% similar) in 459 aa overlap (1-459:1-448)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDPVAFKDVAVNFTQEEWALLDISQRKLYREVMLETFRNLTSIGKRWKDQNIEYEHQNPR
       :: :::.::::::: ::::::: ::..:::.:: ::::::.:.::.:.:::::   . ::
NP_660 MDSVAFEDVAVNFTLEEWALLDPSQKNLYRDVMRETFRNLASVGKQWEDQNIEDPFKIPR
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB7 RNFRSLIEEKVNEIKDDSHCGETFTPVPDDRLNFQEKKASPEVKSCESFVCGEVGLGNSS
       ::. : : :.. : :. ..  :::. .::  ::    : .: :: ::: ::::::.: ::
NP_660 RNI-SHIPERLCESKEGGQGEETFSQIPDGILN----KKTPGVKPCESSVCGEVGMGPSS
                70        80        90           100       110     

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pF1KB7 FNMSIRGDIGHKAYEYQEYGPKPCKCQQPKKAFRYRPSFRTQERDHTGEKPNACKVCGKT
       .:  ::   :..  :::::: :    .:  .:. :. :: ..:: : : ::  :: ::.:
NP_660 LNRHIRDHTGREPNEYQEYGKKSYTRNQCGRALSYHRSFPVRERTHPGGKPYDCKECGET
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pF1KB7 FISHSSVRRHMVMHSGDGPYKCKFCGKAFHCLRLYLIHERIHTGEKPCECKQCGKSFSYS
       :::  :.::::. : :  ::::: :::::    :. :::: :::::: :::::::.:: :
NP_660 FISLVSIRRHMLTHRGGVPYKCKVCGKAFDYPSLFRIHERSHTGEKPYECKQCGKAFSCS
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pF1KB7 ATHRIHKRTHTGEKPYEYQECGKAFHSPRSYRRHERIHMGEKAYQCKECGKAFTCPRYVR
       .  :::.:::::.:::: ..:::::   .  : ::: : ::: :.::.::::: :   ::
NP_660 SYIRIHERTHTGDKPYECKQCGKAFSCSKYIRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFRCASSVR
         240       250       260       270       280       290     

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pF1KB7 IHERTHSRKNLYECKQCGKALSSLTSFQTHVRLHSGERPYECKICGKDFCSVNSFQRHEK
        :::::. ..:.:::.:::::. :.: . :.  :.:. ::.::.::: :   .::. ::.
NP_660 SHERTHTGEKLFECKECGKALTCLASVRRHMIKHTGNGPYKCKVCGKAFDFPSSFRIHER
         300       310       320       330       340       350     

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pF1KB7 IHSGEKPYKCKQCGKAFPHSSSLRYHERTHTGEKPYECKQCGKAFRSASHLRVHGRTHTG
        :.::::: ::::::::  :::.: ::: :::::::.: .:::::  .:..:.: :::::
NP_660 THTGEKPYDCKQCGKAFSCSSSFRKHERIHTGEKPYKCTKCGKAFSRSSYFRIHERTHTG
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pF1KB7 EKPYECKECGKAFRYVNNLQSHERTQTHIRIHSGERRYKCKICGKGFYCPKSFQRHEKTH
       :::::::.:::::   . .. ::.      ::.::. :.                     
NP_660 EKPYECKQCGKAFSRSTYFRVHEK------IHTGEKPYENPNPNASVVPVLS        
         420       430             440       450       460         

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pF1KB7 TGEKLYECKQRSVVPSVVPVPFDIMKGLTLERSPINASNVGKPSELCQSFECMVGLTLKR

>>NP_003428 (OMIM: 604078) zinc finger protein 136 [Homo  (540 aa)
 initn: 1392 init1: 1392 opt: 1847  Z-score: 1016.7  bits: 198.0 E(85289): 6.8e-50
Smith-Waterman score: 1862; 53.5% identity (71.8% similar) in 518 aa overlap (1-490:1-508)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDPVAFKDVAVNFTQEEWALLDISQRKLYREVMLETFRNLTSIGKRWKDQNIEYEHQNPR
       :: :::.:: :::::::::::: ::..:::.:: ::.:::.::::.::::::. ....  
NP_003 MDSVAFEDVDVNFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMWETMRNLASIGKKWKDQNIKDHYKHRG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 RNFRSLIEEKVNEIKDDSHCGETFTPVPDDRLNFQEKKASPEVKSCESFVCGEVGLGNSS
       ::.:: . :.. . :: :. :  :.   .. :.    :  : :: :::.: :::..:.::
NP_003 RNLRSHMLERLYQTKDGSQRGGIFSQFANQNLS----KKIPGVKLCESIVYGEVSMGQSS
               70        80        90           100       110      

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 FNMSIRGDIGHKAYEYQEYGPKPCKCQQPKKAFRYRPSFRTQERDHTGEKPNACKVCGKT
       .:  :.   ::.  :::::: ::   .:  : :  . ::::.:  :::::   :: ::::
NP_003 LNRHIKDHSGHEPKEYQEYGEKPDTRNQCWKPFSSHHSFRTHEIIHTGEKLYDCKECGKT
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pF1KB7 FISHSSVRRHMVMHSGDGPYKCKFCGKAFHCLRLYLIHERIHTGEKPCECKQCGKSFSYS
       :.: . .:::.. :::  ::::: :::::     .  ::: :::::: ::..:::.:.  
NP_003 FFSLKRIRRHIITHSGYTPYKCKVCGKAFDYPSRFRTHERSHTGEKPYECQECGKAFTCI
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pF1KB7 ATHRIHKRTHTGEKPYEYQECGKAFHSPRSYRRHERIHMGEKAYQCKECGKAFTCPRYVR
       .. : :   :::. ::. . ::: :::  :.. ::::: ::: ..::.:::::.:   .:
NP_003 TSVRRHMIKHTGDGPYKCKVCGKPFHSLSSFQVHERIHTGEKPFKCKQCGKAFSCSPTLR
        240       250       260       270       280       290      

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pF1KB7 IHERTHSRKNLYECKQCGKALSSLTSFQTHVRLHSGERPYECKICGKDFCSVNSFQRHEK
       ::::::. .. :::::::::.: : :.. : :.:.::.:. :: ::: : :...:: ::.
NP_003 IHERTHTGEKPYECKQCGKAFSYLPSLRLHERIHTGEKPFVCKQCGKAFRSASTFQIHER
        300       310       320       330       340       350      

              370                                  380        390  
pF1KB7 IHSGEKPYKCKQCGKAF---P------------------------HS-SSLRYHERTHTG
        :.:::::.::.::.::   :                        :: : .: :::::::
NP_003 THTGEKPYECKECGEAFSCIPSMRRHMIKHTGEGPYKCKVCGKPFHSLSPFRIHERTHTG
        360       370       380       390       400       410      

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pF1KB7 EKPYECKQCGKAFRSASHLRVHGRTHTGEKPYECKECGKAFRYVNNLQSHERTQTHIRIH
       :::: ::.::::: :.. .:.: ::::::::::::.::::: :.:....::       ::
NP_003 EKPYVCKHCGKAFVSSTSIRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFSYLNSFRTHEM------IH
        420       430       440       450       460             470

            460       470       480       490       500       510  
pF1KB7 SGERRYKCKICGKGFYCPKSFQRHEKTHTGEKLYECKQRSVVPSVVPVPFDIMKGLTLER
       .::. ..:: :::.:   .::. ::.::::.: :.::.                      
NP_003 TGEKPFECKRCGKAFRSSSSFRLHERTHTGQKPYHCKECGKAYSCRASFQRHMLTHAEDG
              480       490       500       510       520       530

            520       530       540       550       560       570  
pF1KB7 SPINASNVGKPSELCQSFECMVGLTLKRNPMSVSNDGKPSDLPHTFEYVVGHTMERNPMH
                                                                   
NP_003 PPYKCMWESL                                                  
              540                                                  

>>NP_057348 (OMIM: 194542) zinc finger protein 44 isofor  (615 aa)
 initn: 4576 init1: 1334 opt: 1814  Z-score: 998.6  bits: 194.8 E(85289): 6.9e-49
Smith-Waterman score: 1814; 54.5% identity (73.7% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-480)

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       :: :::.:::::::.::::::  ::..:::.:: ::.:::. :: .:..:::. .::: :
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       :: :  . :. .. :: :.::::.. . .. .:   :..  .: .: : : ::: .:.::
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       .:  :: : :::  : .::. :    .:  :.. :: ::.: :: :::.::  :: ::::
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       : : ...:::::...:::::::..:::::    :  .::: :::::: :::::.:.:   
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       ...  :.. :::::::: ..:.::: .  :: :::: : ::: :.::.:::::.    .:
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       .::: :. .. : :::::::.  : ::: :. .:::. :..:::::: :   .: . :: 
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        :. ::::.:::::: . : ::.: :  .:::. :..:  ::::: : : .. : :::::
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       :::::::.::::::  ..:..:: :      :.::. :::: :::.:    ::: :: ::
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pF1KB7 TGEKLYECKQRSVVPSVVPVPFDIMKGLTLERSPINASNVGKPSELCQSFECMVGLTLKR
       . :. ::::.                                                  
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>--
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pF1KB7 KDFCSVNSFQRHEKIHSGEKPYKCKQCGKAFPHSSSLRYHERTHTGEKPYECKQCGKAFR
       : :   . .. ::. :..::::.:::: :::   : :  ::::::::.:::::.::::: 
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        .:  : : ::::::::::::::::::  ..... :.::.                    
NP_057 RSSFCREHERTHTGEKPYECKECGKAFSSLSSFNRHKRTHWKDIL               
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pF1KB7 FYCPKSFQRHEKTHTGEKLYECKQRSVVPSVVPVPFDIMKGLTLERSPINASNVGKPSEL

>>XP_011526366 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger pro  (616 aa)
 initn: 4576 init1: 1334 opt: 1807  Z-score: 994.9  bits: 194.2 E(85289): 1.1e-48
Smith-Waterman score: 1807; 54.4% identity (73.6% similar) in 489 aa overlap (2-490:3-481)

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pF1KB7 RRNFRSLIEEKVNEIKDDSHCGETFTPVPDDRLNFQEKKASPEVKSCESFVCGEVGLGNS
       ::: :  . :. .. :: :.::::.. . .. .:   :..  .: .: : : ::: .:.:
XP_011 RRNPRCDVVERFGKSKDGSQCGETLSQIRNSIVN---KNTPARVDACGSSVNGEVIMGHS
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pF1KB7 SFNMSIRGDIGHKAYEYQEYGPKPCKCQQPKKAFRYRPSFRTQERDHTGEKPNACKVCGK
       :.:  :: : :::  : .::. :    .:  :.. :: ::.: :: :::.::  :: :::
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pF1KB7 SATHRIHKRTHTGEKPYEYQECGKAFHSPRSYRRHERIHMGEKAYQCKECGKAFTCPRYV
        ...  :.. :::::::: ..:.::: .  :: :::: : ::: :.::.:::::.    .
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pF1KB7 RIHERTHSRKNLYECKQCGKALSSLTSFQTHVRLHSGERPYECKICGKDFCSVNSFQRHE
       :.::: :. .. : :::::::.  : ::: :. .:::. :..:::::: :   .: . ::
XP_011 RVHERIHTGEKPYTCKQCGKAFCHLGSFQRHMIMHSGDGPHKCKICGKGFDFPGSARIHE
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pF1KB7 KIHSGEKPYKCKQCGKAFPHSSSLRYHERTHTGEKPYECKQCGKAFRSASHLRVHGRTHT
         :. ::::.:::::: . : ::.: :  .:::. :..:  ::::: : : .. : ::::
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       ::::::::.::::::  ..:..:: :      :.::. :::: :::.:    ::: :: :
XP_011 GEKPYECKQCGKAFRTSSSLRKHETT------HTGEQPYKCK-CGKAFSDLFSFQSHETT
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pF1KB7 HTGEKLYECKQRSVVPSVVPVPFDIMKGLTLERSPINASNVGKPSELCQSFECMVGLTLK
       :. :. ::::.                                                 
XP_011 HSEEEPYECKECGKAFSSFKYFCRHERTHSEEKSYECQICGKAFSRFSYLKTHERTHTAE
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>--
 initn: 570 init1: 570 opt: 570  Z-score: 334.2  bits: 71.9 E(85289): 7.1e-12
Smith-Waterman score: 570; 60.0% identity (76.2% similar) in 130 aa overlap (317-446:482-611)

        290       300       310       320       330       340      
pF1KB7 KECGKAFTCPRYVRIHERTHSRKNLYECKQCGKALSSLTSFQTHVRLHSGERPYECKICG
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        .:  : : ::::::::::::::::::  ..... :.::.                    
XP_011 RSSFCREHERTHTGEKPYECKECGKAFSSLSSFNRHKRTHWKDIL               
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pF1KB7 FYCPKSFQRHEKTHTGEKLYECKQRSVVPSVVPVPFDIMKGLTLERSPINASNVGKPSEL

>>XP_011526364 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger pro  (653 aa)
 initn: 4576 init1: 1334 opt: 1807  Z-score: 994.7  bits: 194.2 E(85289): 1.2e-48
Smith-Waterman score: 1807; 54.4% identity (73.6% similar) in 489 aa overlap (2-490:40-518)

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pF1KB7                              MDPVAFKDVAVNFTQEEWALLDISQRKLYRE
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XP_011 GYPKMLEAANLMEGLVDIGPWVTLPRGQPEDSVAFEDVAVNFTHEEWALLGPSQKNLYRD
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       :: ::.:::. :: .:..:::. .::: ::: :  . :. .. :: :.::::.. . .. 
XP_011 VMRETIRNLNCIGMKWENQNIDDQHQNLRRNPRCDVVERFGKSKDGSQCGETLSQIRNSI
      70        80        90       100       110       120         

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pF1KB7 LNFQEKKASPEVKSCESFVCGEVGLGNSSFNMSIRGDIGHKAYEYQEYGPKPCKCQQPKK
       .:   :..  .: .: : : ::: .:.::.:  :: : :::  : .::. :    .:  :
XP_011 VN---KNTPARVDACGSSVNGEVIMGHSSLNCYIRVDTGHKHRECHEYAEKSYTHKQCGK
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pF1KB7 AFRYRPSFRTQERDHTGEKPNACKVCGKTFISHSSVRRHMVMHSGDGPYKCKFCGKAFHC
       .. :: ::.: :: :::.::  :: ::::: : ...:::::...:::::::..:::::  
XP_011 GLSYRHSFQTCERPHTGKKPYDCKECGKTFSSPGNLRRHMVVKGGDGPYKCELCGKAFFW
        190       200       210       220       230       240      

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pF1KB7 LRLYLIHERIHTGEKPCECKQCGKSFSYSATHRIHKRTHTGEKPYEYQECGKAFHSPRSY
         :  .::: :::::: :::::.:.:   ...  :.. :::::::: ..:.::: .  ::
XP_011 PSLLRMHERTHTGEKPYECKQCSKAFPVYSSYLRHEKIHTGEKPYECKQCSKAFPDYSSY
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pF1KB7 RRHERIHMGEKAYQCKECGKAFTCPRYVRIHERTHSRKNLYECKQCGKALSSLTSFQTHV
        :::: : ::: :.::.:::::.    .:.::: :. .. : :::::::.  : ::: :.
XP_011 LRHERTHTGEKPYKCKQCGKAFSVSGSLRVHERIHTGEKPYTCKQCGKAFCHLGSFQRHM
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pF1KB7 RLHSGERPYECKICGKDFCSVNSFQRHEKIHSGEKPYKCKQCGKAFPHSSSLRYHERTHT
        .:::. :..:::::: :   .: . ::  :. ::::.:::::: . : ::.: :  .::
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pF1KB7 GEKPYECKQCGKAFRSASHLRVHGRTHTGEKPYECKECGKAFRYVNNLQSHERTQTHIRI
       :. :..:  ::::: : : .. : ::::::::::::.::::::  ..:..:: :      
XP_011 GDGPHKCTVCGKAFDSPSVFQRHERTHTGEKPYECKQCGKAFRTSSSLRKHETT------
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pF1KB7 HSGERRYKCKICGKGFYCPKSFQRHEKTHTGEKLYECKQRSVVPSVVPVPFDIMKGLTLE
       :.::. :::: :::.:    ::: :: ::. :. ::::.                     
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XP_011 KSYECQICGKAFSRFSYLKTHERTHTAEKPYECKQCRKAFFWPSFLLRHERTHTGERPYE
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>--
 initn: 570 init1: 570 opt: 570  Z-score: 334.0  bits: 72.0 E(85289): 7.2e-12
Smith-Waterman score: 570; 60.0% identity (76.2% similar) in 130 aa overlap (317-446:519-648)

        290       300       310       320       330       340      
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                                     ::::.::.  :  : : :: :. :::.:::
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pF1KB7 KDFCSVNSFQRHEKIHSGEKPYKCKQCGKAFPHSSSLRYHERTHTGEKPYECKQCGKAFR
       : :   . .. ::. :..::::.:::: :::   : :  ::::::::.:::::.::::: 
XP_011 KAFSRFSYLKTHERTHTAEKPYECKQCRKAFFWPSFLLRHERTHTGERPYECKHCGKAFS
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pF1KB7 SASHLRVHGRTHTGEKPYECKECGKAFRYVNNLQSHERTQTHIRIHSGERRYKCKICGKG
        .:  : : ::::::::::::::::::  ..... :.::.                    
XP_011 RSSFCREHERTHTGEKPYECKECGKAFSSLSSFNRHKRTHWKDIL               
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pF1KB7 FYCPKSFQRHEKTHTGEKLYECKQRSVVPSVVPVPFDIMKGLTLERSPINASNVGKPSEL

>>NP_001157748 (OMIM: 194542) zinc finger protein 44 iso  (663 aa)
 initn: 4576 init1: 1334 opt: 1807  Z-score: 994.6  bits: 194.2 E(85289): 1.2e-48
Smith-Waterman score: 1807; 54.4% identity (73.6% similar) in 489 aa overlap (2-490:50-528)

                                            10        20        30 
pF1KB7                              MDPVAFKDVAVNFTQEEWALLDISQRKLYRE
                                     : :::.:::::::.::::::  ::..:::.
NP_001 LMEGLVDIGPWVTLPRGQPEVLEWGLPKDQDSVAFEDVAVNFTHEEWALLGPSQKNLYRD
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pF1KB7 VMLETFRNLTSIGKRWKDQNIEYEHQNPRRNFRSLIEEKVNEIKDDSHCGETFTPVPDDR
       :: ::.:::. :: .:..:::. .::: ::: :  . :. .. :: :.::::.. . .. 
NP_001 VMRETIRNLNCIGMKWENQNIDDQHQNLRRNPRCDVVERFGKSKDGSQCGETLSQIRNSI
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pF1KB7 LNFQEKKASPEVKSCESFVCGEVGLGNSSFNMSIRGDIGHKAYEYQEYGPKPCKCQQPKK
       .:   :..  .: .: : : ::: .:.::.:  :: : :::  : .::. :    .:  :
NP_001 VN---KNTPARVDACGSSVNGEVIMGHSSLNCYIRVDTGHKHRECHEYAEKSYTHKQCGK
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pF1KB7 AFRYRPSFRTQERDHTGEKPNACKVCGKTFISHSSVRRHMVMHSGDGPYKCKFCGKAFHC
       .. :: ::.: :: :::.::  :: ::::: : ...:::::...:::::::..:::::  
NP_001 GLSYRHSFQTCERPHTGKKPYDCKECGKTFSSPGNLRRHMVVKGGDGPYKCELCGKAFFW
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pF1KB7 LRLYLIHERIHTGEKPCECKQCGKSFSYSATHRIHKRTHTGEKPYEYQECGKAFHSPRSY
         :  .::: :::::: :::::.:.:   ...  :.. :::::::: ..:.::: .  ::
NP_001 PSLLRMHERTHTGEKPYECKQCSKAFPVYSSYLRHEKIHTGEKPYECKQCSKAFPDYSSY
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pF1KB7 RRHERIHMGEKAYQCKECGKAFTCPRYVRIHERTHSRKNLYECKQCGKALSSLTSFQTHV
        :::: : ::: :.::.:::::.    .:.::: :. .. : :::::::.  : ::: :.
NP_001 LRHERTHTGEKPYKCKQCGKAFSVSGSLRVHERIHTGEKPYTCKQCGKAFCHLGSFQRHM
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pF1KB7 RLHSGERPYECKICGKDFCSVNSFQRHEKIHSGEKPYKCKQCGKAFPHSSSLRYHERTHT
        .:::. :..:::::: :   .: . ::  :. ::::.:::::: . : ::.: :  .::
NP_001 IMHSGDGPHKCKICGKGFDFPGSARIHEGTHTLEKPYECKQCGKLLSHRSSFRRHMMAHT
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pF1KB7 GEKPYECKQCGKAFRSASHLRVHGRTHTGEKPYECKECGKAFRYVNNLQSHERTQTHIRI
       :. :..:  ::::: : : .. : ::::::::::::.::::::  ..:..:: :      
NP_001 GDGPHKCTVCGKAFDSPSVFQRHERTHTGEKPYECKQCGKAFRTSSSLRKHETT------
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pF1KB7 HSGERRYKCKICGKGFYCPKSFQRHEKTHTGEKLYECKQRSVVPSVVPVPFDIMKGLTLE
       :.::. :::: :::.:    ::: :: ::. :. ::::.                     
NP_001 HTGEQPYKCK-CGKAFSDLFSFQSHETTHSEEEPYECKECGKAFSSFKYFCRHERTHSEE
              500        510       520       530       540         

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pF1KB7 RSPINASNVGKPSELCQSFECMVGLTLKRNPMSVSNDGKPSDLPHTFEYVVGHTMERNPM
                                                                   
NP_001 KSYECQICGKAFSRFSYLKTHERTHTAEKPYECKQCRKAFFWPSFLLRHERTHTGERPYE
     550       560       570       580       590       600         

>--
 initn: 570 init1: 570 opt: 570  Z-score: 334.0  bits: 72.0 E(85289): 7.3e-12
Smith-Waterman score: 570; 60.0% identity (76.2% similar) in 130 aa overlap (317-446:529-658)

        290       300       310       320       330       340      
pF1KB7 KECGKAFTCPRYVRIHERTHSRKNLYECKQCGKALSSLTSFQTHVRLHSGERPYECKICG
                                     ::::.::.  :  : : :: :. :::.:::
NP_001 CKCGKAFSDLFSFQSHETTHSEEEPYECKECGKAFSSFKYFCRHERTHSEEKSYECQICG
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pF1KB7 KDFCSVNSFQRHEKIHSGEKPYKCKQCGKAFPHSSSLRYHERTHTGEKPYECKQCGKAFR
       : :   . .. ::. :..::::.:::: :::   : :  ::::::::.:::::.::::: 
NP_001 KAFSRFSYLKTHERTHTAEKPYECKQCRKAFFWPSFLLRHERTHTGERPYECKHCGKAFS
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pF1KB7 SASHLRVHGRTHTGEKPYECKECGKAFRYVNNLQSHERTQTHIRIHSGERRYKCKICGKG
        .:  : : ::::::::::::::::::  ..... :.::.                    
NP_001 RSSFCREHERTHTGEKPYECKECGKAFSSLSSFNRHKRTHWKDIL               
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pF1KB7 FYCPKSFQRHEKTHTGEKLYECKQRSVVPSVVPVPFDIMKGLTLERSPINASNVGKPSEL

>>NP_005806 (OMIM: 606697) zinc finger protein 443 [Homo  (671 aa)
 initn: 1366 init1: 1366 opt: 1800  Z-score: 990.8  bits: 193.5 E(85289): 1.9e-48
Smith-Waterman score: 1800; 54.0% identity (72.6% similar) in 489 aa overlap (1-489:1-480)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDPVAFKDVAVNFTQEEWALLDISQRKLYREVMLETFRNLTSIGKRWKDQNIEYEHQNPR
       :  ::..:::::::.::::::   :..::..:: ::.:::  .  .::::::: ... ::
NP_005 MASVALEDVAVNFTREEWALLGPCQKNLYKDVMQETIRNLDCVVMKWKDQNIEDQYRYPR
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB7 RNFRSLIEEKVNEIKDDSHCGETFTPVPDDRLNFQEKKASPEVKSCESFVCGEVGLGNSS
       .:.:  . :.  : :: ..:::: . . :. ..   :.. : :  ::: . ::  .:.::
NP_005 KNLRCRMLERFVESKDGTQCGETSSQIQDSIVT---KNTLPGVGPCESSMRGEKVMGHSS
               70        80        90          100       110       

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pF1KB7 FNMSIRGDIGHKAYEYQEYGPKPCKCQQPKKAFRYRPSFRTQERDHTGEKPNACKVCGKT
       .:  ::   ::: .::.: : ::   .:  ::: :. ::.:.:: :::.::  :: :::.
NP_005 LNCYIRVGAGHKPHEYHECGEKPDTHKQRGKAFSYHNSFQTHERLHTGKKPYDCKECGKS
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pF1KB7 FISHSSVRRHMVMHSGDGPYKCKFCGKAFHCLRLYLIHERIHTGEKPCECKQCGKSFSYS
       : : ....:::... ::::::::.:::::    :  .::: :::::: :::::.:.::. 
NP_005 FSSLGNLQRHMAVQRGDGPYKCKLCGKAFFWPSLLHMHERTHTGEKPYECKQCSKAFSFY
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pF1KB7 ATHRIHKRTHTGEKPYEYQECGKAFHSPRSYRRHERIHMGEKAYQCKECGKAFTCPRYVR
       ...  :.:::::::::: ..:.:::    :: :::: : ::: :.::.:.:::       
NP_005 SSYLRHERTHTGEKPYECKQCSKAFPFYSSYLRHERTHTGEKPYKCKQCSKAFPDSSSCL
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pF1KB7 IHERTHSRKNLYECKQCGKALSSLTSFQTHVRLHSGERPYECKICGKDFCSVNSFQRHEK
       ::::::. .. : :::::::.:   :.: :   ::.:.:: :. ::: :  ..:::::  
NP_005 IHERTHTGEKPYTCKQCGKAFSVSGSLQRHETTHSAEKPYACQQCGKAFHHLGSFQRHMI
       300       310       320       330       340       350       

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