Result of FASTA (omim) for pF1KB7876
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7876, 638 aa
  1>>>pF1KB7876 638 - 638 aa - 638 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4493+/-0.000848; mu= 16.6574+/- 0.052
 mean_var=343.4071+/-70.333, 0's: 0 Z-trim(109.6): 2111  B-trim: 89 in 1/52
 Lambda= 0.069210
 statistics sampled from 15499 (17823) to 15499 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.49), E-opt: 0.2 (0.209), width:  16
 Scan time:  9.870

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_005806 (OMIM: 606697) zinc finger protein 443 [ ( 671) 2537 269.3 3.2e-71
XP_011525924 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 639) 2527 268.2 6.3e-71
XP_016881629 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 673) 2527 268.3 6.4e-71
XP_011525925 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 718) 2527 268.3 6.6e-71
XP_016881628 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 685) 2436 259.2 3.5e-68
NP_066358 (OMIM: 194556) zinc finger protein 14 [H ( 642) 2333 248.9 4.3e-65
XP_016882359 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 583) 2275 243.0 2.3e-63
NP_057348 (OMIM: 194542) zinc finger protein 44 is ( 615) 2275 243.0 2.3e-63
XP_011526366 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 616) 2275 243.0 2.3e-63
XP_011526364 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 653) 2275 243.1 2.4e-63
NP_001157748 (OMIM: 194542) zinc finger protein 44 ( 663) 2275 243.1 2.4e-63
XP_011526368 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 571) 2228 238.3 5.8e-62
XP_006722936 (OMIM: 194543) PREDICTED: zinc finger ( 569) 2199 235.4 4.3e-61
NP_001190179 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 ( 529) 2161 231.5 5.8e-60
NP_066966 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 is ( 532) 2161 231.5 5.8e-60
XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 2126 228.6 8.9e-59
NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 65 (1059) 2126 228.6 8.9e-59
XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 2126 228.6 8.9e-59
XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 2126 228.6 8.9e-59
NP_149350 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [ (1059) 2126 228.6 8.9e-59
XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2106 226.6 3.6e-58
XP_006722943 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2106 226.6 3.6e-58
XP_016882725 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1118) 2106 226.6 3.6e-58
XP_016882724 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2106 226.7 3.7e-58
XP_011526567 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2106 226.7 3.7e-58
NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 (1159) 2106 226.7 3.7e-58
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 2106 226.7 3.7e-58
XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger (1168) 2104 226.5 4.3e-58
NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 i (1280) 2104 226.5 4.4e-58
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2097 225.5 5.8e-58
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2097 225.5 5.8e-58
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2097 225.5 5.8e-58
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2097 225.5 5.9e-58
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 2097 225.5 5.9e-58
NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2097 225.5 5.9e-58
NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2097 225.5 5.9e-58
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2097 225.5 5.9e-58
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2097 225.5 5.9e-58
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2097 225.5 5.9e-58
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2097 225.5 5.9e-58
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 2097 225.5 5.9e-58
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2097 225.5 5.9e-58
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2097 225.5 5.9e-58
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2097 225.5 5.9e-58
NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 2097 225.5 5.9e-58
XP_016882934 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 837) 2097 225.5   6e-58
NP_001159354 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 864) 2081 223.9 1.8e-57
NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 947) 2081 224.0 1.9e-57
NP_003406 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 i ( 947) 2081 224.0 1.9e-57
NP_001243583 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2068 222.5 4.2e-57


>>NP_005806 (OMIM: 606697) zinc finger protein 443 [Homo  (671 aa)
 initn: 1670 init1: 1670 opt: 2537  Z-score: 1399.6  bits: 269.3 E(85289): 3.2e-71
Smith-Waterman score: 2537; 57.2% identity (74.7% similar) in 643 aa overlap (1-633:33-671)

                                             10        20        30
pF1KB7                               MQETFRNLASIGKKWKPQNIYVEYENLRRN
                                     ::::.:::  .  ::: :::  .:.  :.:
NP_005 SVALEDVAVNFTREEWALLGPCQKNLYKDVMQETIRNLDCVVMKWKDQNIEDQYRYPRKN
             10        20        30        40        50        60  

                40        50        60         70        80        
pF1KB7 LRI-VGERLFESKEGHQHGEILTQVPDDMLKKTTT-GVKSCESSVYGEVGSAHSSLNRHI
       ::  . ::. :::.: : ::  .:. :... :.:  ::  ::::. ::   .::::: .:
NP_005 LRCRMLERFVESKDGTQCGETSSQIQDSIVTKNTLPGVGPCESSMRGEKVMGHSSLNCYI
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pF1KB7 RDDTGHKAYEYQEYGQKPYKCKYCKKPFNCLSSVQTHERAHSGRKLYVCEECGKTFISHS
       :  .::: .::.: :.::   :   : :.  .: ::::: :.:.: : :.::::.: : .
NP_005 RVGAGHKPHEYHECGEKPDTHKQRGKAFSYHNSFQTHERLHTGKKPYDCKECGKSFSSLG
            130       140       150       160       170       180  

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pF1KB7 NLQRHRIMHRGDGPYKCKFCGKALMFLSLYLIHKRTHTGEKPYQCKQCGKAFSHSSSLRI
       :::::  ..:::::::::.::::... ::  .:.:::::::::.::::.::::  ::   
NP_005 NLQRHMAVQRGDGPYKCKLCGKAFFWPSLLHMHERTHTGEKPYECKQCSKAFSFYSSYLR
            190       200       210       220       230       240  

      210       220       230       240       250       260        
pF1KB7 HERTHTGEKPYKCNECGKAFHSSTCLHAHKRTHTGEKPYECKQCGKAFSSSHSFQIHERT
       :::::::::::.:..:.:::   .    :.:::::::::.::::.::: .: :  :::::
NP_005 HERTHTGEKPYECKQCSKAFPFYSSYLRHERTHTGEKPYKCKQCSKAFPDSSSCLIHERT
            250       260       270       280       290       300  

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB7 HTGEKPYECKECGKAFKCPSSVRRHERTHSRKKPYECKHCGKVLSYLTSFQNHLGMHTGE
       ::::::: ::.:::::.  .:..::: ::: .::: :..:::.. .: ::: :.  :::.
NP_005 HTGEKPYTCKQCGKAFSVSGSLQRHETTHSAEKPYACQQCGKAFHHLGSFQRHMIRHTGN
            310       320       330       340       350       360  

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pF1KB7 ISHKCKICGKAFYSPSSLQTHEKTHTGEKPYKCNQCGKAFNSSSSFRYHERTHTGEKPYE
         ::::::::.:  :::::.::.::::::::.:.:::::..  :::: :   :::. :..
NP_005 GPHKCKICGKGFDCPSSLQSHERTHTGEKPYECKQCGKALSHRSSFRSHMIMHTGDGPHK
            370       380       390       400       410       420  

      390       400       410       420       430       440        
pF1KB7 CKQCGKAFRSASLLQTHGRTHTGEKPYACKECGKPFSNFSFFQIHERMHREEKPYECKGY
       :: :::::   :..: : ::::.:::: ::.::: .   : .. ::  :  ::::.::  
NP_005 CKVCGKAFVYPSVFQRHERTHTAEKPYKCKQCGKAYRISSSLRRHETTHTGEKPYKCK-L
            430       440       450       460       470       480  

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pF1KB7 GKTFSLPSLFHRHERTHTGGKTYECKQCGRSFNCSSSFRY---HGRTHTGEKPYECKQCG
       ::.:     :. :. :::: : ::::.::..:   : :::   : :::::::::::: : 
NP_005 GKAFIDFCSFQNHKTTHTGEKPYECKECGKAF---SRFRYLSRHKRTHTGEKPYECKTCR
             490       500       510          520       530        

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pF1KB7 KAFRSASQLQIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFGSASHLQMHGRTHTGEKPYECKQCGKSFG
       :::   ..:..: : :.::::::::.:::::.  . .  : : :  :: ::: ::::.: 
NP_005 KAFGHYDNLKVHERIHSGEKPYECKECGKAFSWLTCFLRHERIHMREKSYECPQCGKAFT
      540       550       560       570       580       590        

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pF1KB7 CASRLQMHGRTHTGEKPYKCKQCGKAFGCPSNLRRHGRTH-----TGEKPYKCNQCGKVF
        .  :: : .:::::.::.::.:::::.  :.:.:: .::     :::.::.:..:::.:
NP_005 HSRFLQGHEKTHTGENPYECKECGKAFASLSSLHRHKKTHWKKTHTGENPYECKECGKAF
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              630        
pF1KB7 RCSSQLQVHGRAHCIDTP
          :.:. : ..:     
NP_005 ASLSSLHRHKKTH     
      660       670      

>>XP_011525924 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger pro  (639 aa)
 initn: 1670 init1: 1670 opt: 2527  Z-score: 1394.4  bits: 268.2 E(85289): 6.3e-71
Smith-Waterman score: 2527; 57.1% identity (74.5% similar) in 643 aa overlap (1-633:1-639)

               10        20        30         40        50         
pF1KB7 MQETFRNLASIGKKWKPQNIYVEYENLRRNLRI-VGERLFESKEGHQHGEILTQVPDDML
       ::::.:::  .  ::: :::  .:.  :.:::  . ::. :::.: : ::  .:. :...
XP_011 MQETIRNLDCVVMKWKDQNIEDQYRYPRKNLRCRMLERFVESKDGTQCGETSSQIQDSIV
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      60         70        80        90       100       110        
pF1KB7 KKTTT-GVKSCESSVYGEVGSAHSSLNRHIRDDTGHKAYEYQEYGQKPYKCKYCKKPFNC
        :.:  ::  ::::. ::   .::::: .::  .::: .::.: :.::   :   : :. 
XP_011 TKNTLPGVGPCESSMRGEKVMGHSSLNCYIRVGAGHKPHEYHECGEKPDTHKQRGKAFSY
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB7 LSSVQTHERAHSGRKLYVCEECGKTFISHSNLQRHRIMHRGDGPYKCKFCGKALMFLSLY
        .: ::::: :.:.: : :.::::.: : .:::::  ..:::::::::.::::... :: 
XP_011 HNSFQTHERLHTGKKPYDCKECGKSFSSLGNLQRHMAVQRGDGPYKCKLCGKAFFWPSLL
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pF1KB7 LIHKRTHTGEKPYQCKQCGKAFSHSSSLRIHERTHTGEKPYKCNECGKAFHSSTCLHAHK
        .:.:::::::::.::::.::::  ::   :::::::::::.:..:.:::   .    :.
XP_011 HMHERTHTGEKPYECKQCSKAFSFYSSYLRHERTHTGEKPYECKQCSKAFPFYSSYLRHE
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      240       250       260       270       280       290        
pF1KB7 RTHTGEKPYECKQCGKAFSSSHSFQIHERTHTGEKPYECKECGKAFKCPSSVRRHERTHS
       :::::::::.::::.::: .: :  :::::::::::: ::.:::::.  .:..::: :::
XP_011 RTHTGEKPYKCKQCSKAFPDSSSCLIHERTHTGEKPYTCKQCGKAFSVSGSLQRHETTHS
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pF1KB7 RKKPYECKHCGKVLSYLTSFQNHLGMHTGEISHKCKICGKAFYSPSSLQTHEKTHTGEKP
        .::: :..:::.. .: ::: :.  :::.  ::::::::.:  :::::.::.:::::::
XP_011 AEKPYACQQCGKAFHHLGSFQRHMIRHTGNGPHKCKICGKGFDCPSSLQSHERTHTGEKP
              310       320       330       340       350       360

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pF1KB7 YKCNQCGKAFNSSSSFRYHERTHTGEKPYECKQCGKAFRSASLLQTHGRTHTGEKPYACK
       :.:.:::::..  :::: :   :::. :..:: :::::   :..: : ::::.:::: ::
XP_011 YECKQCGKALSHRSSFRSHMIMHTGDGPHKCKVCGKAFVYPSVFQRHERTHTAEKPYKCK
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       .:   : :::   : :::::::::::: : :::   ..:..: : :.::::::::.::::
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>>XP_011525925 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger pro  (718 aa)
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XP_011 ASLSSLHRHKKTH     
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>>XP_016881628 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger pro  (685 aa)
 initn: 1670 init1: 1670 opt: 2436  Z-score: 1345.0  bits: 259.2 E(85289): 3.5e-68
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pF1KB7                               MQETFRNLASIGKKWKPQNIYVEYENLRRN
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XP_016 LRCRMLERFVESKDGTQCGETSSQIQDSIVTKNTLPGVGPCESSMRGEKVMGHSSLNCYI
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       :  .::: .::.: :.::   :   : :.  .: ::::: :.:.: : :.::::.: : .
XP_016 RVGAGHKPHEYHECGEKPDTHKQRGKAFSYHNSFQTHERLHTGKKPYDCKECGKSFSSLG
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pF1KB7 NLQRHRIMHRGDGPYKCKFCGKALMFLSLYLIHKRTHTGEKPYQCKQCGKAFSHSSSLRI
       :::::  ..:::::::::.::::... ::  .:.:::::::::.::::.::::  ::   
XP_016 NLQRHMAVQRGDGPYKCKLCGKAFFWPSLLHMHERTHTGEKPYECKQCSKAFSFYSSYLR
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pF1KB7 HERTHTGEKPYKCNECGKAFHSSTCLHAHKRTHTGEKPYECKQCGKAFSSSHSFQIHERT
       :::::::::::.:..:.:::   .    :.:::::::::.::::.::: .: :  :::::
XP_016 HERTHTGEKPYECKQCSKAFPFYSSYLRHERTHTGEKPYKCKQCSKAFPDSSSCLIHERT
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pF1KB7 HTGEKPYECKECGKAFKCPSSVRRHERTHSRKKPYECKHCGKVLSYLTSFQNHLGMHTGE
       ::::::: ::.:::::.  .:..::: ::: .::: :..:::.. .: ::: :.  :::.
XP_016 HTGEKPYTCKQCGKAFSVSGSLQRHETTHSAEKPYACQQCGKAFHHLGSFQRHMIRHTGN
     350       360       370       380       390       400         

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pF1KB7 ISHKCKICGKAFYSPSSLQTHEKTHTGEKPYKCNQCGKAFNSSSSFRYHERTHTGEKPYE
         ::::::::.:  :::::.::.::::::::.:.:::::..  :::: :   :::. :..
XP_016 GPHKCKICGKGFDCPSSLQSHERTHTGEKPYECKQCGKALSHRSSFRSHMIMHTGDGPHK
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pF1KB7 CKQCGKAFRSASLLQTHGRTHTGEKPYACKECGKPFSNFSFFQIHERMHREEKPYECKGY
       :: :::::   :..: : ::::.:::: ::.::: .   : .. ::  :  ::::.::  
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pF1KB7 GKTFSLPSLFHRHERTHTGGKTYECKQCGRSFNCSSSFRY---HGRTHTGEKPYECKQCG
       ::.      :. :. :::: : ::::.::..:   : :::   : :::::::::::: : 
XP_016 GKACIDFCSFQNHKTTHTGEKPYECKECGKAF---SRFRYLSRHKRTHTGEKPYECKTCR
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pF1KB7 KAFRSASQLQIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFGSASHLQMHGRTHTGEKPYECKQCGKSFG
       :::   ..:..: : :.::::::::.:::::.  . .  : : :  :: ::: ::::.: 
XP_016 KAFGHYDNLKVHERIHSGEKPYECKECGKAFSWLTCFLRHERIHMREKSYECPQCGKAFT
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pF1KB7 CASRLQMHGRTHTGEKPYKCKQCGKAFGCPSNLRRHGRTHTGEKPYKCNQCGKVFRCSSQ
        .  :: : .:::::.::.::.:::::.  :.:.:: .::                    
XP_016 HSRFLQGHEKTHTGENPYECKECGKAFASLSSLHRHKKTH                    
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         630        
pF1KB7 LQVHGRAHCIDTP

>>NP_066358 (OMIM: 194556) zinc finger protein 14 [Homo   (642 aa)
 initn: 2006 init1: 2006 opt: 2333  Z-score: 1289.7  bits: 248.9 E(85289): 4.3e-65
Smith-Waterman score: 2504; 56.9% identity (74.8% similar) in 635 aa overlap (1-633:33-637)

                                             10        20        30
pF1KB7                               MQETFRNLASIGKKWKPQNIYVEYENLRRN
                                     :::::.::. .::::. :.:  ...:  .:
NP_066 SVSFEDVAVNFTLEEWALLDSSQKKLYEDVMQETFKNLVCLGKKWEDQDIEDDHRNQGKN
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pF1KB7 LRI-VGERLFESKEGHQHGEILTQVPD-DMLKKTTTGVKSCESSVYGEVGSAHSSLNRHI
        :  . ::: ::..: . ::  .:.:. .. :.: ::.:  : :  :.    :::::::.
NP_066 RRCHMVERLCESRRGSKCGETTSQMPNVNINKETFTGAKPHECSFCGRDFIHHSSLNRHM
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pF1KB7 RDDTGHKAYEYQEYGQKPYKCKYCKKPFNCLSSVQTHERAHSGRKLYVCEECGKTFISHS
       :. ::.:  ::::: ..: :::   : :.     . :::.:.: : : :..:::.:: ..
NP_066 RSHTGQKPNEYQEYEKQPCKCKAVGKTFSYHHCFRKHERTHTGVKPYECKQCGKAFIYYQ
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pF1KB7 NLQRHRIMHRGDGPYKCKFCGKALMFLSLYLIHKRTHTGEKPYQCKQCGKAFSHSSSLRI
        .:::                            .:::.:.:::.::::::.: . .:.. 
NP_066 PFQRH----------------------------ERTHAGQKPYECKQCGKTFIYYQSFQK
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pF1KB7 HERTHTGEKPYKCNECGKAFHSSTCLHAHKRTHTGEKPYECKQCGKAFSSSHSFQIHERT
       :  .:::.:::.:..:::::     .. :::::::::::::::::::::    :. ::::
NP_066 H--AHTGKKPYECKQCGKAFICYQSFQRHKRTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYFRTHERT
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pF1KB7 HTGEKPYECKECGKAFKCPSSVRRHERTHSRKKPYECKHCGKVLSYLTSFQNHLGMHTGE
       :::::::.::::::::.  :: :::.:::: .::::::.:::.. : .::. :. .::: 
NP_066 HTGEKPYKCKECGKAFSFLSSFRRHKRTHSGEKPYECKECGKAFFYSASFRAHVIIHTGA
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pF1KB7 ISHKCKICGKAFYSPSSLQTHEKTHTGEKPYKCNQCGKAFNSSSSFRYHERTHTGEKPYE
         .::: ::::: : .: ..::.:: :::::.:..:::.:. : :.: ::::::::::::
NP_066 RPYKCKECGKAFNSSNSCRVHERTHIGEKPYECKRCGKSFSWSISLRLHERTHTGEKPYE
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pF1KB7 CKQCGKAFRSASLLQTHGRTHTGEKPYACKECGKPFSNFSFFQIHERMHREEKPYECKGY
       :::: :.:  .: :. :  :::::::: ::.::: ::  : .: ::: :  :::::::  
NP_066 CKQCHKTFSFSSSLREHETTHTGEKPYECKQCGKTFSFSSSLQRHERTHNAEKPYECKQC
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pF1KB7 GKTFSLPSLFHRHERTHTGGKTYECKQCGRSFNCSSSFRYHGRTHTGEKPYECKQCGKAF
       ::.:   : :. :::.::: : :::::::. :  ::::: : :::::::::::: :::.:
NP_066 GKAFRCSSYFRIHERSHTGEKPYECKQCGKVFIRSSSFRLHERTHTGEKPYECKLCGKTF
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pF1KB7 RSASQLQIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFGSASHLQMHGRTHTGEKPYECKQCGKSFGCAS
         .:.:. : . :::.::.:::::::::  .:....: :::::::::.::::::.:  .:
NP_066 SFSSSLREHEKIHTGNKPFECKQCGKAFLRSSQIRLHERTHTGEKPYQCKQCGKAFISSS
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pF1KB7 RLQMHGRTHTGEKPYKCKQCGKAFGCPSNLRRHGRTHTGEKPYKCNQCGKVFRCSSQLQV
       ...:: :::::::::.::::::::   :..: : :.:::::::.:.::::.:  ::....
NP_066 KFRMHERTHTGEKPYRCKQCGKAFRFSSSVRIHERSHTGEKPYECKQCGKAFISSSHFRL
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      630        
pF1KB7 HGRAHCIDTP
       : :.:     
NP_066 HERTHMGEKV
            640  

>>XP_016882359 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger pro  (583 aa)
 initn: 1449 init1: 1449 opt: 2275  Z-score: 1258.7  bits: 243.0 E(85289): 2.3e-63
Smith-Waterman score: 2275; 57.6% identity (75.5% similar) in 580 aa overlap (1-577:1-578)

               10        20        30         40        50         
pF1KB7 MQETFRNLASIGKKWKPQNIYVEYENLRRNLRI-VGERLFESKEGHQHGEILTQVPDDML
       :.::.:::  :: ::. :::  ...::::: :  : ::. .::.: : :: :.:. ....
XP_016 MRETIRNLNCIGMKWENQNIDDQHQNLRRNPRCDVVERFGKSKDGSQCGETLSQIRNSIV
               10        20        30        40        50        60

      60         70        80        90       100       110        
pF1KB7 KKTTTG-VKSCESSVYGEVGSAHSSLNRHIRDDTGHKAYEYQEYGQKPYKCKYCKKPFNC
       .:.: . : .: ::: :::  .::::: .:: :::::  : .::..: :  : : : .. 
XP_016 NKNTPARVDACGSSVNGEVIMGHSSLNCYIRVDTGHKHRECHEYAEKSYTHKQCGKGLSY
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB7 LSSVQTHERAHSGRKLYVCEECGKTFISHSNLQRHRIMHRGDGPYKCKFCGKALMFLSLY
         : :: :: :.:.: : :.:::::: : .::.:: ... :::::::..::::... :: 
XP_016 RHSFQTCERPHTGKKPYDCKECGKTFSSPGNLRRHMVVKGGDGPYKCELCGKAFFWPSLL
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pF1KB7 LIHKRTHTGEKPYQCKQCGKAFS-HSSSLRIHERTHTGEKPYKCNECGKAFHSSTCLHAH
        .:.:::::::::.::::.:::  .:: :: ::. :::::::.:..:.::: . .    :
XP_016 RMHERTHTGEKPYECKQCSKAFPVYSSYLR-HEKIHTGEKPYECKQCSKAFPDYSSYLRH
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pF1KB7 KRTHTGEKPYECKQCGKAFSSSHSFQIHERTHTGEKPYECKECGKAFKCPSSVRRHERTH
       .:::::::::.::::::::: : :...::: ::::::: ::.:::::   .: .::   :
XP_016 ERTHTGEKPYKCKQCGKAFSVSGSLRVHERIHTGEKPYTCKQCGKAFCHLGSFQRHMIMH
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pF1KB7 SRKKPYECKHCGKVLSYLTSFQNHLGMHTGEISHKCKICGKAFYSPSSLQTHEKTHTGEK
       :   :..:: ::: ...  : . : : :: :  ..:: ::: .   ::.. :  .:::. 
XP_016 SGDGPHKCKICGKGFDFPGSARIHEGTHTLEKPYECKQCGKLLSHRSSFRRHMMAHTGDG
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pF1KB7 PYKCNQCGKAFNSSSSFRYHERTHTGEKPYECKQCGKAFRSASLLQTHGRTHTGEKPYAC
       :.::. :::::.: : :. :::::::::::::::::::::..: :. :  :::::.:: :
XP_016 PHKCTVCGKAFDSPSVFQRHERTHTGEKPYECKQCGKAFRTSSSLRKHETTHTGEQPYKC
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pF1KB7 KECGKPFSNFSFFQIHERMHREEKPYECKGYGKTFSLPSLFHRHERTHTGGKTYECKQCG
       : ::: ::..  :: ::  : ::.:::::  ::.::  . : ::::::.  :.:::. ::
XP_016 K-CGKAFSDLFSFQSHETTHSEEEPYECKECGKAFSSFKYFCRHERTHSEEKSYECQICG
     420        430       440       450       460       470        

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pF1KB7 RSFNCSSSFRYHGRTHTGEKPYECKQCGKAFRSASQLQIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFG
       ..:.  : .. : ::::.::::::::: :::   : :  : ::::::.:::::.:::::.
XP_016 KAFSRFSYLKTHERTHTAEKPYECKQCRKAFFWPSFLLRHERTHTGERPYECKHCGKAFS
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pF1KB7 SASHLQMHGRTHTGEKPYECKQCGKSFGCASRLQMHGRTHTGEKPYKCKQCGKAFGCPSN
        .:  . : ::::::::::::.:::.:.  : .. : :::                    
XP_016 RSSFCREHERTHTGEKPYECKECGKAFSSLSSFNRHKRTHWKDIL               
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pF1KB7 LRRHGRTHTGEKPYKCNQCGKVFRCSSQLQVHGRAHCIDTP

>>NP_057348 (OMIM: 194542) zinc finger protein 44 isofor  (615 aa)
 initn: 1449 init1: 1449 opt: 2275  Z-score: 1258.5  bits: 243.0 E(85289): 2.3e-63
Smith-Waterman score: 2275; 57.6% identity (75.5% similar) in 580 aa overlap (1-577:33-610)

                                             10        20        30
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