Result of FASTA (omim) for pF1KB7856
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7856, 627 aa
  1>>>pF1KB7856 627 - 627 aa - 627 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2371+/-0.000781; mu= 17.8805+/- 0.048
 mean_var=347.4817+/-68.476, 0's: 0 Z-trim(112.0): 2021  B-trim: 77 in 1/53
 Lambda= 0.068803
 statistics sampled from 18507 (20787) to 18507 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.559), E-opt: 0.2 (0.244), width:  16
 Scan time:  9.440

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_005764 (OMIM: 606956) zinc finger protein 256 [ ( 627) 4467 459.1 2.1e-128
XP_016881627 (OMIM: 606956) PREDICTED: zinc finger ( 474) 3410 353.9 7.2e-97
NP_003424 (OMIM: 604074) zinc finger protein 132 [ ( 706) 2297 243.8 1.5e-63
NP_942152 (OMIM: 601856) zinc finger protein 211 i ( 564) 2259 239.8 1.9e-62
NP_006376 (OMIM: 601856) zinc finger protein 211 i ( 577) 2245 238.5 5.1e-62
NP_001252529 (OMIM: 601856) zinc finger protein 21 ( 503) 2064 220.4 1.2e-56
NP_001252528 (OMIM: 601856) zinc finger protein 21 ( 555) 2024 216.5   2e-55
NP_001252527 (OMIM: 601856) zinc finger protein 21 ( 616) 2024 216.6 2.1e-55
NP_001309235 (OMIM: 601856) zinc finger protein 21 ( 627) 2024 216.6 2.1e-55
NP_001252526 (OMIM: 601856) zinc finger protein 21 ( 629) 2024 216.6 2.1e-55
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1852 199.5 2.9e-50
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1852 199.5 2.9e-50
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1852 199.5 2.9e-50
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1852 199.6   3e-50
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1852 199.6   3e-50
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1852 199.6   3e-50
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1852 199.6   3e-50
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1852 199.6   3e-50
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1852 199.6   3e-50
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1852 199.6   3e-50
NP_009080 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 i ( 751) 1849 199.4 3.9e-50
NP_001305821 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1849 199.4 3.9e-50
NP_001305820 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1849 199.4 3.9e-50
NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 625) 1844 198.7   5e-50
XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger (1168) 1841 198.9 8.1e-50
NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 i (1280) 1841 199.0 8.4e-50
NP_001078853 (OMIM: 604085) zinc finger protein 15 ( 437) 1828 196.8 1.3e-49
XP_005272399 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 542) 1829 197.1 1.3e-49
XP_005272398 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1829 197.3 1.5e-49
NP_008889 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 [H ( 682) 1829 197.3 1.5e-49
XP_011515600 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1829 197.3 1.5e-49
NP_001025147 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 ( 682) 1829 197.3 1.5e-49
NP_001316385 (OMIM: 613840) zinc finger protein 30 ( 567) 1806 194.9 6.6e-49
NP_001277248 (OMIM: 613840) zinc finger protein 30 ( 617) 1806 194.9 6.8e-49
NP_065708 (OMIM: 613840) zinc finger protein 304 i ( 659) 1806 195.0   7e-49
XP_011525447 (OMIM: 613840) PREDICTED: zinc finger ( 664) 1806 195.0   7e-49
NP_001277247 (OMIM: 613840) zinc finger protein 30 ( 706) 1806 195.1 7.2e-49
NP_001291423 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1787 193.0 2.5e-48
NP_001291422 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1787 193.0 2.5e-48
NP_666016 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 is ( 643) 1787 193.1 2.6e-48
NP_001291421 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 643) 1787 193.1 2.6e-48
XP_016881867 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 650) 1777 192.1 5.1e-48
NP_689697 (OMIM: 613904) zinc finger protein 569 i ( 686) 1777 192.2 5.3e-48
XP_016881866 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1777 192.2 5.3e-48
XP_016881865 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1777 192.2 5.3e-48
XP_011524841 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1777 192.2 5.3e-48
XP_006723110 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1777 192.2 5.3e-48
XP_011524840 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1777 192.2 5.3e-48
XP_006723111 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1777 192.2 5.3e-48
XP_006723109 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1777 192.2 5.3e-48


>>NP_005764 (OMIM: 606956) zinc finger protein 256 [Homo  (627 aa)
 initn: 4467 init1: 4467 opt: 4467  Z-score: 2426.2  bits: 459.1 E(85289): 2.1e-128
Smith-Waterman score: 4467; 100.0% identity (100.0% similar) in 627 aa overlap (1-627:1-627)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAAAELTAPAQGIVTFEDVAVYFSWKEWGLLDEAQKCLYHDVMLENLTLTTSLGGSGAGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MAAAELTAPAQGIVTFEDVAVYFSWKEWGLLDEAQKCLYHDVMLENLTLTTSLGGSGAGD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 EEAPYQQSTSPQRVSQVRIPKALPSPQKTNPCEICGPVLRQILHLVEHQGTHHGQKLYTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EEAPYQQSTSPQRVSQVRIPKALPSPQKTNPCEICGPVLRQILHLVEHQGTHHGQKLYTD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 GACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHFRSNGGRDMFLSSCTFEVSGKPFTCKEVGKDFLVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHFRSNGGRDMFLSSCTFEVSGKPFTCKEVGKDFLVR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 SRFLQQQAAHTRKKSNRTKSAVAFHSVKNHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIRERSYM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SRFLQQQAAHTRKKSNRTKSAVAFHSVKNHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIRERSYM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 CSECGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEKPYTCGECGKSYRQSSSLITHRRIHTGVRPHQCDEC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CSECGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEKPYTCGECGKSYRQSSSLITHRRIHTGVRPHQCDEC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 GKLFNRKYDLLIHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSECGKSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GKLFNRKYDLLIHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSECGKSF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 IHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKLFTYRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 IHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKLFTYRS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 RFFQHQRVHTGVRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCKSYLIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RFFQHQRVHTGVRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCKSYLIS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 HWKVHTGARPYECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPYECNECGKFFSQSSSLIRHRRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 HWKVHTGARPYECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPYECNECGKFFSQSSSLIRHRRS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 HTGERPYECSECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQRIHSGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 HTGERPYECSECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQRIHSGE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       
pF1KB7 RPYECSDCGKFFTFNSNLLKHQNVHKG
       :::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RPYECSDCGKFFTFNSNLLKHQNVHKG
              610       620       

>>XP_016881627 (OMIM: 606956) PREDICTED: zinc finger pro  (474 aa)
 initn: 3410 init1: 3410 opt: 3410  Z-score: 1860.1  bits: 353.9 E(85289): 7.2e-97
Smith-Waterman score: 3410; 100.0% identity (100.0% similar) in 474 aa overlap (154-627:1-474)

           130       140       150       160       170       180   
pF1KB7 RKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHFRSNGGRDMFLSSCTFEVSGKPFTCKEVGKDFLVRSRF
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016                               MFLSSCTFEVSGKPFTCKEVGKDFLVRSRF
                                             10        20        30

           190       200       210       220       230       240   
pF1KB7 LQQQAAHTRKKSNRTKSAVAFHSVKNHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIRERSYMCSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LQQQAAHTRKKSNRTKSAVAFHSVKNHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIRERSYMCSE
               40        50        60        70        80        90

           250       260       270       280       290       300   
pF1KB7 CGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEKPYTCGECGKSYRQSSSLITHRRIHTGVRPHQCDECGKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEKPYTCGECGKSYRQSSSLITHRRIHTGVRPHQCDECGKL
              100       110       120       130       140       150

           310       320       330       340       350       360   
pF1KB7 FNRKYDLLIHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSECGKSFIHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FNRKYDLLIHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSECGKSFIHS
              160       170       180       190       200       210

           370       380       390       400       410       420   
pF1KB7 SSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKLFTYRSRFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKLFTYRSRFF
              220       230       240       250       260       270

           430       440       450       460       470       480   
pF1KB7 QHQRVHTGVRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCKSYLISHWK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QHQRVHTGVRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCKSYLISHWK
              280       290       300       310       320       330

           490       500       510       520       530       540   
pF1KB7 VHTGARPYECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPYECNECGKFFSQSSSLIRHRRSHTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VHTGARPYECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPYECNECGKFFSQSSSLIRHRRSHTG
              340       350       360       370       380       390

           550       560       570       580       590       600   
pF1KB7 ERPYECSECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQRIHSGERPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ERPYECSECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQRIHSGERPY
              400       410       420       430       440       450

           610       620       
pF1KB7 ECSDCGKFFTFNSNLLKHQNVHKG
       ::::::::::::::::::::::::
XP_016 ECSDCGKFFTFNSNLLKHQNVHKG
              460       470    

>>NP_003424 (OMIM: 604074) zinc finger protein 132 [Homo  (706 aa)
 initn: 2245 init1: 2245 opt: 2297  Z-score: 1261.7  bits: 243.8 E(85289): 1.5e-63
Smith-Waterman score: 2373; 52.2% identity (76.2% similar) in 644 aa overlap (11-625:35-677)

                                   10        20        30        40
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                                     ...::::::::::: .:: ::: ::. :::
NP_003 SPQVLMGLPALLMGPAQHTSWPCGSAVPTLKSMVTFEDVAVYFSQEEWELLDAAQRHLYH
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pF1KB7 DVMLENLTLTTSLGG-SGAGDEEAPYQQSTSPQRVSQVRIPKALPSPQKTNPCEICGPVL
       .:::::: :.::::.  :.  : :  .:..: . : :::::.: :: .:.: :..::: :
NP_003 SVMLENLELVTSLGSWHGVEGEGAHPKQNVSVE-VLQVRIPNADPSTKKANSCDMCGPFL
           70        80        90        100       110       120   

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pF1KB7 RQILHLVEHQGTHHGQKLYTDGACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHFRSNGGRDMFLSSC
       ..::::.:::::.  .: :: ::: ... ..: ::::::.: : : ::    :: ...: 
NP_003 KDILHLAEHQGTQSEEKPYTCGACGRDFWLNANLHQHQKEHSGGKPFRWYKDRDALMKSS
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pF1KB7 TFEVSGKPFTCKEVGKDFLVRSRFLQQQAAHTRKKSNRTKSAVA-FHSVKNHYNWGECVK
         ..: .::::.: :: .:    .:: ::. . .:   . . .    .... .. ..: :
NP_003 KVHLSENPFTCREGGKVILGSCDLLQLQAVDSGQKPYSNLGQLPEVCTTQKLFECSNCGK
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      220            230                             240       250 
pF1KB7 AFSYK-----HVRVQHQ---------GDLIRERS-------------YMCSECGKSFSTS
       ::  .     :.:.. .         :....:.:             ..:.::::.:: :
NP_003 AFLKSSTLPNHLRTHSEEIPFTCPTGGNFLEEKSILGNKKFHTGEIPHVCKECGKAFSHS
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pF1KB7 CSLSDHLRVHTSEKPYTCGECGKSYRQSSSLITHRRIHTGVRPHQCDECGKLFNRKYDLL
        .:  : . ::  : : :  :::.. .. ... :.:::.: ::..:::::: :. .  :.
NP_003 SKLRKHQKFHTEVKYYECIACGKTFNHKLTFVHHQRIHSGERPYECDECGKAFSNRSHLI
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pF1KB7 IHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSECGKSFIHSSSLITHQR
        :..:::::::..: .::..::.::... ::..:: .::::::.::::: .::.:: : :
NP_003 RHEKVHTGERPFECLKCGRAFSQSSNFLRHQKVHTQVRPYECSQCGKSFSRSSALIQHWR
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pF1KB7 VHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKLFTYRSRFFQHQRVHTG
       :::: ::: :::::..:... .: .:...: :: :.::::::. :.  :....::.::::
NP_003 VHTGERPYECSECGRAFNNNSNLAQHQKVHTGERPFECSECGRDFSQSSHLLRHQKVHTG
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pF1KB7 VRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCKSYLISHWKVHTGARPY
        :  :: .::: :: .  :: :..::::.:::::::: :::. .: ::.::..::: .::
NP_003 ERPFECCDCGKAFSNSSTLIQHQKVHTGQRPYECSECRKSFSRSSSLIQHWRIHTGEKPY
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pF1KB7 ECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPYECNECGKFFSQSSSLIRHRRSHTGERPYECSE
       ::.::::.:.:::::..: :::: :::::::::::::::.: ::.:.. ::::.::.:::
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pF1KB7 CWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQRIHSGERPYECSDCGKF
       : : :: .:::. : :::::::::::::::..::..:.:. :::.:. :::::: .::: 
NP_003 CGKFFSRKSSLICHWRVHTGERPYECSECGRAFSSNSHLVRHQRVHTQERPYECIQCGKA
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pF1KB7 FTFNSNLLKHQNVHKG                           
       :.  :.:..::.::                             
NP_003 FSERSTLVRHQKVHTRERTYECSQCGKLFSHLCNLAQHKKIHT
           670       680       690       700      

>>NP_942152 (OMIM: 601856) zinc finger protein 211 isofo  (564 aa)
 initn: 5155 init1: 1594 opt: 2259  Z-score: 1242.1  bits: 239.8 E(85289): 1.9e-62
Smith-Waterman score: 2259; 59.3% identity (78.1% similar) in 548 aa overlap (1-546:21-564)

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pF1KB7                     MAAAELTAPAQGIVTFEDVAVYFSWKEWGLLDEAQKCLYH
                           ::.: :  ::.: ::::::::::::.:: ::::::: :: 
NP_942 MLGFPPGRPQLPVQLRPQTRMATA-LRDPASGSVTFEDVAVYFSWEEWDLLDEAQKHLYF
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pF1KB7 DVMLENLTLTTSLGG-SGAGDEEAPYQQSTSPQRVSQVRIPKALPSPQKTNPCEICGPVL
       ::::::..::.:::   :.  ::.: .:  : .:: : :  :   : :... ::::  ::
NP_942 DVMLENFALTSSLGCWCGVEHEETPSEQRISGERVPQFRTSKEGSSSQNADSCEICCLVL
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pF1KB7 RQILHLVEHQGTHHGQKLYTDGACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHFRSNGGRDMFLSSC
       :.::::.:::::. ::::.:   : ::. ..: :.:::.::. .  :::      : .::
NP_942 RDILHLAEHQGTNCGQKLHT---CGKQFYISANLQQHQRQHITEAPFRSYVDTASFTQSC
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pF1KB7 TFEVSGKPFTCKEVGKDFLVRSRFLQQQAAHT-RKKSNRTKSAVAFHSVKNHYNWGECVK
         .:: :::::.:. ::::.  :::.:.:..: .: .: .: ::::.: :.:.:::.: :
NP_942 IVHVSEKPFTCREIRKDFLANMRFLHQDATQTGEKPNNSNKCAVAFYSGKSHHNWGKCSK
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pF1KB7 AFSYKHVRVQHQGDLIRERSYMCSECGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEKPYTCGECGKSYRQ
       :::.  . :: :  : ::  . ::.:::. .  :.: .: .::. :.:: :.:::: .  
NP_942 AFSHIDTLVQDQRILTREGLFECSKCGKACTRRCNLIQHQKVHSEERPYECNECGKFFTY
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pF1KB7 SSSLITHRRIHTGVRPHQCDECGKLFNRKYDLLIHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSL
        ::.: :.:.::: ::. : :::: :.. :.:  :..::::::::.:.:::::::. :.:
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pF1KB7 ITHQRIHTGMRPYECSECGKSFIHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHR
       . :.:.::: :::::::::::: .. ::: ::::::: ::. :.:::::::.:  ::.::
NP_942 MQHRRVHTGERPYECSECGKSFSQNFSLIYHQRVHTGERPHECNECGKSFSRSSSLIHHR
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pF1KB7 RLHIGEGPYECSECGKLFTYRSRFFQHQRVHTGVRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHT
       ::: :: :::::.::: :   : : .:..:::: : . : :::: ::.. .:  :.::::
NP_942 RLHTGERPYECSKCGKSFKQSSSFSSHRKVHTGERPYVCGECGKSFSHSSNLKNHQRVHT
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pF1KB7 GERPYECSECGKSFTCKSYLISHWKVHTGARPYECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERP
       :::: :::::.:::.::: ::.: .:::: :::::.::::::..::.:.::.:::::.::
NP_942 GERPVECSECSKSFSCKSNLIKHLRVHTGERPYECSECGKSFSQSSSLIQHRRVHTGKRP
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pF1KB7 YECNECGKFFSQSSSLIRHRRSHTGERPYECSECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECS
       :.:..::: :. .: ::.:.: : ::.:                                
NP_942 YQCSQCGKSFGCKSVLIQHQRVHIGEKP                                
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>>NP_006376 (OMIM: 601856) zinc finger protein 211 isofo  (577 aa)
 initn: 5155 init1: 1594 opt: 2245  Z-score: 1234.5  bits: 238.5 E(85289): 5.1e-62
Smith-Waterman score: 2245; 58.8% identity (77.7% similar) in 548 aa overlap (1-546:33-577)

                                             10        20        30
pF1KB7                               MAAAELTAPAQGIVTFEDVAVYFSWKEWGL
                                     .:.  :   .:: ::::::::::::.:: :
NP_006 GFPPGRPQLPVQLRPQTRMATALRDPASVPIATEVLFKLTQGSVTFEDVAVYFSWEEWDL
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pF1KB7 LDEAQKCLYHDVMLENLTLTTSLGG-SGAGDEEAPYQQSTSPQRVSQVRIPKALPSPQKT
       :::::: :: ::::::..::.:::   :.  ::.: .:  : .:: : :  :   : :..
NP_006 LDEAQKHLYFDVMLENFALTSSLGCWCGVEHEETPSEQRISGERVPQFRTSKEGSSSQNA
             70        80        90       100       110       120  

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pF1KB7 NPCEICGPVLRQILHLVEHQGTHHGQKLYTDGACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHFRSN
       . ::::  :::.::::.:::::. ::::.:   : ::. ..: :.:::.::. .  ::: 
NP_006 DSCEICCLVLRDILHLAEHQGTNCGQKLHT---CGKQFYISANLQQHQRQHITEAPFRSY
            130       140       150          160       170         

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pF1KB7 GGRDMFLSSCTFEVSGKPFTCKEVGKDFLVRSRFLQQQAAHT-RKKSNRTKSAVAFHSVK
            : .::  .:: :::::.:. ::::.  :::.:.:..: .: .: .: ::::.: :
NP_006 VDTASFTQSCIVHVSEKPFTCREIRKDFLANMRFLHQDATQTGEKPNNSNKCAVAFYSGK
     180       190       200       210       220       230         

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pF1KB7 NHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIRERSYMCSECGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEKPYT
       .:.:::.: ::::.  . :: :  : ::  . ::.:::. .  :.: .: .::. :.:: 
NP_006 SHHNWGKCSKAFSHIDTLVQDQRILTREGLFECSKCGKACTRRCNLIQHQKVHSEERPYE
     240       250       260       270       280       290         

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pF1KB7 CGECGKSYRQSSSLITHRRIHTGVRPHQCDECGKLFNRKYDLLIHQRVHTGERPYKCSEC
       :.:::: .   ::.: :.:.::: ::. : :::: :.. :.:  :..::::::::.:.::
NP_006 CNECGKFFTYYSSFIIHQRVHTGERPYACPECGKSFSQIYSLNSHRKVHTGERPYECGEC
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pF1KB7 GKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSECGKSFIHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSF
       :::::. :.:. :.:.::: :::::::::::: .. ::: ::::::: ::. :.::::::
NP_006 GKSFSQRSNLMQHRRVHTGERPYECSECGKSFSQNFSLIYHQRVHTGERPHECNECGKSF
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pF1KB7 SQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKLFTYRSRFFQHQRVHTGVRSHECHECGKLFSRKF
       :.:  ::.::::: :: :::::.::: :   : : .:..:::: : . : :::: ::.. 
NP_006 SRSSSLIHHRRLHTGERPYECSKCGKSFKQSSSFSSHRKVHTGERPYVCGECGKSFSHSS
     420       430       440       450       460       470         

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pF1KB7 DLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCKSYLISHWKVHTGARPYECGECGKSFTHSSTLLQ
       .:  :.:::::::: :::::.:::.::: ::.: .:::: :::::.::::::..::.:.:
NP_006 NLKNHQRVHTGERPVECSECSKSFSCKSNLIKHLRVHTGERPYECSECGKSFSQSSSLIQ
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       :.:::::.:::.:..::: :. .: ::.:.: : ::.:                      
NP_006 HRRVHTGKRPYQCSQCGKSFGCKSVLIQHQRVHIGEKP                      
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pF1KB7 HTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQRIHSGERPYECSDCGKFFTFNSNLLKHQNVHKG

>>NP_001252529 (OMIM: 601856) zinc finger protein 211 is  (503 aa)
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                                     ::::..::.:::   :.  ::.: .:  : 
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       .:: : :  :   : :... ::::  :::.::::.:::::. ::::.:   : ::. ..:
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        :.:::.::. .  :::      : .::  .:: :::::.:. ::::.  :::.:.:..:
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pF1KB7 -RKKSNRTKSAVAFHSVKNHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIRERSYMCSECGKSFST
        .: .: .: ::::.: :.:.:::.: ::::.  . :: :  : ::  . ::.:::. . 
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        :.: .: .::. :.:: :.:::: .   ::.: :.:.::: ::. : :::: :.. :.:
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         :..::::::::.:.:::::::. :.:. :.:.::: :::::::::::: .. ::: ::
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       ::::: ::. :.:::::::.:  ::.::::: :: :::::.::: :   : : .:..:::
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       : : . : :::: ::.. .:  :.:::::::: :::::.:::.::: ::.: .:::: ::
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       :::.::::::..::.:.::.:::::.:::.:..::: :. .: ::.:.: : ::.:    
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pF1KB7 ECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQRIHSGERPYECSDCGK

>>NP_001252528 (OMIM: 601856) zinc finger protein 211 is  (555 aa)
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Smith-Waterman score: 2024; 57.8% identity (77.6% similar) in 491 aa overlap (57-546:68-555)

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NP_001 MTPASARWDQRGPGLHEWHLGKGMSSGCWCGVEHEETPSEQRISGERVPQFRTSKEGSSS
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pF1KB7 QKTNPCEICGPVLRQILHLVEHQGTHHGQKLYTDGACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHF
       :... ::::  :::.::::.:::::. ::::.:   : ::. ..: :.:::.::. .  :
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pF1KB7 RSNGGRDMFLSSCTFEVSGKPFTCKEVGKDFLVRSRFLQQQAAHT-RKKSNRTKSAVAFH
       ::      : .::  .:: :::::.:. ::::.  :::.:.:..: .: .: .: ::::.
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pF1KB7 SVKNHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIRERSYMCSECGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEK
       : :.:.:::.: ::::.  . :: :  : ::  . ::.:::. .  :.: .: .::. :.
NP_001 SGKSHHNWGKCSKAFSHIDTLVQDQRILTREGLFECSKCGKACTRRCNLIQHQKVHSEER
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pF1KB7 PYTCGECGKSYRQSSSLITHRRIHTGVRPHQCDECGKLFNRKYDLLIHQRVHTGERPYKC
       :: :.:::: .   ::.: :.:.::: ::. : :::: :.. :.:  :..::::::::.:
NP_001 PYECNECGKFFTYYSSFIIHQRVHTGERPYACPECGKSFSQIYSLNSHRKVHTGERPYEC
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pF1KB7 SECGKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSECGKSFIHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECG
       .:::::::. :.:. :.:.::: :::::::::::: .. ::: ::::::: ::. :.:::
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pF1KB7 KSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKLFTYRSRFFQHQRVHTGVRSHECHECGKLFS
       ::::.:  ::.::::: :: :::::.::: :   : : .:..:::: : . : :::: ::
NP_001 KSFSRSSSLIHHRRLHTGERPYECSKCGKSFKQSSSFSSHRKVHTGERPYVCGECGKSFS
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pF1KB7 RKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCKSYLISHWKVHTGARPYECGECGKSFTHSST
       .. .:  :.:::::::: :::::.:::.::: ::.: .:::: :::::.::::::..::.
NP_001 HSSNLKNHQRVHTGERPVECSECSKSFSCKSNLIKHLRVHTGERPYECSECGKSFSQSSS
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pF1KB7 LLQHQRVHTGERPYECNECGKFFSQSSSLIRHRRSHTGERPYECSECWKSFSNHSSLVKH
       :.::.:::::.:::.:..::: :. .: ::.:.: : ::.:                   
NP_001 LIQHRRVHTGKRPYQCSQCGKSFGCKSVLIQHQRVHIGEKP                   
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pF1KB7 RRVHTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQRIHSGERPYECSDCGKFFTFNSNLLKHQNVH

>>NP_001252527 (OMIM: 601856) zinc finger protein 211 is  (616 aa)
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                                     ::::::.:: ::::::: :: ::::::..:
NP_001 PQLPVQLRPQTRMATALRDPASGSVTFEDVAVYFSWEEWDLLDEAQKHLYFDVMLENFAL
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      50                                                     60    
pF1KB7 TTSLG---------------------------------------------GSGAGD----
       :.:::                                             :.: ..    
NP_001 TSSLGLISSWSHVVAQLGLGEVPSVLHRMFMTPASARWDQRGPGLHEWHLGKGMSSGCWC
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pF1KB7 ----EEAPYQQSTSPQRVSQVRIPKALPSPQKTNPCEICGPVLRQILHLVEHQGTHHGQK
           ::.: .:  : .:: : :  :   : :... ::::  :::.::::.:::::. :::
NP_001 GVEHEETPSEQRISGERVPQFRTSKEGSSSQNADSCEICCLVLRDILHLAEHQGTNCGQK
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pF1KB7 LYTDGACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHFRSNGGRDMFLSSCTFEVSGKPFTCKEVGKD
       :.:   : ::. ..: :.:::.::. .  :::      : .::  .:: :::::.:. ::
NP_001 LHT---CGKQFYISANLQQHQRQHITEAPFRSYVDTASFTQSCIVHVSEKPFTCREIRKD
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pF1KB7 FLVRSRFLQQQAAHT-RKKSNRTKSAVAFHSVKNHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIR
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NP_001 FLANMRFLHQDATQTGEKPNNSNKCAVAFYSGKSHHNWGKCSKAFSHIDTLVQDQRILTR
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pF1KB7 ERSYMCSECGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEKPYTCGECGKSYRQSSSLITHRRIHTGVRPH
       :  . ::.:::. .  :.: .: .::. :.:: :.:::: .   ::.: :.:.::: ::.
NP_001 EGLFECSKCGKACTRRCNLIQHQKVHSEERPYECNECGKFFTYYSSFIIHQRVHTGERPY
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pF1KB7 QCDECGKLFNRKYDLLIHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSE
        : :::: :.. :.:  :..::::::::.:.:::::::. :.:. :.:.::: :::::::
NP_001 ACPECGKSFSQIYSLNSHRKVHTGERPYECGECGKSFSQRSNLMQHRRVHTGERPYECSE
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pF1KB7 CGKSFIHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKL
       ::::: .. ::: ::::::: ::. :.:::::::.:  ::.::::: :: :::::.::: 
NP_001 CGKSFSQNFSLIYHQRVHTGERPHECNECGKSFSRSSSLIHHRRLHTGERPYECSKCGKS
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pF1KB7 FTYRSRFFQHQRVHTGVRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCK
       :   : : .:..:::: : . : :::: ::.. .:  :.:::::::: :::::.:::.::
NP_001 FKQSSSFSSHRKVHTGERPYVCGECGKSFSHSSNLKNHQRVHTGERPVECSECSKSFSCK
         490       500       510       520       530       540     

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pF1KB7 SYLISHWKVHTGARPYECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPYECNECGKFFSQSSSLI
       : ::.: .:::: :::::.::::::..::.:.::.:::::.:::.:..::: :. .: ::
NP_001 SNLIKHLRVHTGERPYECSECGKSFSQSSSLIQHRRVHTGKRPYQCSQCGKSFGCKSVLI
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pF1KB7 RHRRSHTGERPYECSECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQR
       .:.: : ::.:                                                 
NP_001 QHQRVHIGEKP                                                 
         610                                                       

>>NP_001309235 (OMIM: 601856) zinc finger protein 211 [H  (627 aa)
 initn: 5155 init1: 1594 opt: 2024  Z-score: 1115.7  bits: 216.6 E(85289): 2.1e-55
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                                     :.  ::.: .:  : .:: : :  :   : 
NP_001 MTPASARWDQRGPGLHEWHLGKGMSSGCWCGVEHEETPSEQRISGERVPQFRTSKEGSSS
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pF1KB7 QKTNPCEICGPVLRQILHLVEHQGTHHGQKLYTDGACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHF
       :... ::::  :::.::::.:::::. ::::.:   : ::. ..: :.:::.::. .  :
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       ::      : .::  .:: :::::.:. ::::.  :::.:.:..: .: .: .: ::::.
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       : :.:.:::.: ::::.  . :: :  : ::  . ::.:::. .  :.: .: .::. :.
NP_001 SGKSHHNWGKCSKAFSHIDTLVQDQRILTREGLFECSKCGKACTRRCNLIQHQKVHSEER
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       :: :.:::: .   ::.: :.:.::: ::. : :::: :.. :.:  :..::::::::.:
NP_001 PYECNECGKFFTYYSSFIIHQRVHTGERPYACPECGKSFSQIYSLNSHRKVHTGERPYEC
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pF1KB7 SECGKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSECGKSFIHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECG
       .:::::::. :.:. :.:.::: :::::::::::: .. ::: ::::::: ::. :.:::
NP_001 GECGKSFSQRSNLMQHRRVHTGERPYECSECGKSFSQNFSLIYHQRVHTGERPHECNECG
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       ::::.:  ::.::::: :: :::::.::: :   : : .:..:::: : . : :::: ::
NP_001 KSFSRSSSLIHHRRLHTGERPYECSKCGKSFKQSSSFSSHRKVHTGERPYVCGECGKSFS
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pF1KB7 RKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCKSYLISHWKVHTGARPYECGECGKSFTHSST
       .. .:  :.:::::::: :::::.:::.::: ::.: .:::: :::::.::::::..::.
NP_001 HSSNLKNHQRVHTGERPVECSECSKSFSCKSNLIKHLRVHTGERPYECSECGKSFSQSSS
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       :.::.:::::.:::.:..::: :. .: ::.:.: : ::.:                   
NP_001 LIQHRRVHTGKRPYQCSQCGKSFGCKSVLIQHQRVHIGEKP                   
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pF1KB7 RRVHTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQRIHSGERPYECSDCGKFFTFNSNLLKHQNVH

>>NP_001252526 (OMIM: 601856) zinc finger protein 211 is  (629 aa)
 initn: 5155 init1: 1594 opt: 2024  Z-score: 1115.6  bits: 216.6 E(85289): 2.1e-55
Smith-Waterman score: 2096; 53.9% identity (71.6% similar) in 581 aa overlap (20-546:52-629)

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                                     ::::::.:: ::::::: :: ::::::..:
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pF1KB7 TTSLG---------------------------------------------GSGAGD----
       :.:::                                             :.: ..    
NP_001 TSSLGLISSWSHVVAQLGLGEVPSVLHRMFMTPASARWDQRGPGLHEWHLGKGMSSGCWC
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           ::.: .:  : .:: : :  :   : :... ::::  :::.::::.:::::. :::
NP_001 GVEHEETPSEQRISGERVPQFRTSKEGSSSQNADSCEICCLVLRDILHLAEHQGTNCGQK
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pF1KB7 LYTDGACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHFRSNGGRDMFLSSCTFEVSGKPFTCKEVGKD
       :.:   : ::. ..: :.:::.::. .  :::      : .::  .:: :::::.:. ::
NP_001 LHT---CGKQFYISANLQQHQRQHITEAPFRSYVDTASFTQSCIVHVSEKPFTCREIRKD
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pF1KB7 FLVRSRFLQQQAAHT-RKKSNRTKSAVAFHSVKNHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIR
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NP_001 FLANMRFLHQDATQTGEKPNNSNKCAVAFYSGKSHHNWGKCSKAFSHIDTLVQDQRILTR
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pF1KB7 QCDECGKLFNRKYDLLIHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSE
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pF1KB7 CGKSFIHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKL
       ::::: .. ::: ::::::: ::. :.:::::::.:  ::.::::: :: :::::.::: 
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pF1KB7 FTYRSRFFQHQRVHTGVRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCK
       :   : : .:..:::: : . : :::: ::.. .:  :.:::::::: :::::.:::.::
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pF1KB7 SYLISHWKVHTGARPYECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPYECNECGKFFSQSSSLI
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NP_001 SNLIKHLRVHTGERPYECSECGKSFSQSSSLIQHRRVHTGKRPYQCSQCGKSFGCKSVLI
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       .:.: : ::.:                                                 
NP_001 QHQRVHIGEKP                                                 
      620                                                          




627 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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