Result of FASTA (ccds) for pF1KE0195
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0195, 410 aa
  1>>>pF1KE0195 410 - 410 aa - 410 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9888+/-0.000727; mu= 10.7978+/- 0.044
 mean_var=125.0369+/-25.214, 0's: 0 Z-trim(113.3): 24  B-trim: 85 in 1/53
 Lambda= 0.114698
 statistics sampled from 13960 (13972) to 13960 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.773), E-opt: 0.2 (0.429), width:  16
 Scan time:  3.540

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14744.2 TEX28 gene_id:1527|Hs108|chrX          ( 410) 2729 462.2 3.9e-130
CCDS33855.1 TMCC1 gene_id:23023|Hs108|chr3         ( 653)  409 78.5 2.1e-14
CCDS73010.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1          ( 469)  376 72.9   7e-13
CCDS76257.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1          ( 484)  376 72.9 7.2e-13
CCDS81418.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1          ( 514)  376 73.0 7.5e-13
CCDS55676.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1          ( 631)  376 73.0 8.9e-13
CCDS30984.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1          ( 709)  376 73.0 9.7e-13


>>CCDS14744.2 TEX28 gene_id:1527|Hs108|chrX               (410 aa)
 initn: 2729 init1: 2729 opt: 2729  Z-score: 2449.9  bits: 462.2 E(32554): 3.9e-130
Smith-Waterman score: 2729; 100.0% identity (100.0% similar) in 410 aa overlap (1-410:1-410)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MVLKAEHTRSPSATLPSNVPSCRSLSSSEDGPSGPSSLADGGLAHNLQDSVRHRILYLSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MVLKAEHTRSPSATLPSNVPSCRSLSSSEDGPSGPSSLADGGLAHNLQDSVRHRILYLSE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 QLRVEKASRDGNTVSYLKLVSKADRHQVPHIQQAFEKVNQRASATIAQIEHRLHQCHQQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QLRVEKASRDGNTVSYLKLVSKADRHQVPHIQQAFEKVNQRASATIAQIEHRLHQCHQQL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 QELEEGCRPEGLLLMAESDPANCEPPSEKALLSEPPEPGGEDGPVNLPHASRPFILESRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QELEEGCRPEGLLLMAESDPANCEPPSEKALLSEPPEPGGEDGPVNLPHASRPFILESRF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 QSLQQGTCLETEDVAQQQNLLLQKVKAELEEAKRFHISLQESYHSLKERSLTDLQLLLES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QSLQQGTCLETEDVAQQQNLLLQKVKAELEEAKRFHISLQESYHSLKERSLTDLQLLLES
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 LQEEKCRQALMEEQVNGRLQGQLNEIYNLKHNLACSEERMAYLSYERAKEIWEITETFKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LQEEKCRQALMEEQVNGRLQGQLNEIYNLKHNLACSEERMAYLSYERAKEIWEITETFKS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 RISKLEMLQQVTQLEAAEHLQSRPPQMLFKFLSPRLSLATVLLVFVSTLCACPSSLISSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RISKLEMLQQVTQLEAAEHLQSRPPQMLFKFLSPRLSLATVLLVFVSTLCACPSSLISSR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410
pF1KE0 LCTCTMLMLIGLGVLAWQRWRAIPATDWQEWVPSRCRLYSKDSGPPADGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LCTCTMLMLIGLGVLAWQRWRAIPATDWQEWVPSRCRLYSKDSGPPADGP
              370       380       390       400       410

>>CCDS33855.1 TMCC1 gene_id:23023|Hs108|chr3              (653 aa)
 initn: 574 init1: 270 opt: 409  Z-score: 372.2  bits: 78.5 E(32554): 2.1e-14
Smith-Waterman score: 512; 30.5% identity (59.7% similar) in 407 aa overlap (51-383:237-641)

               30        40        50        60        70        80
pF1KE0 SCRSLSSSEDGPSGPSSLADGGLAHNLQDSVRHRILYLSEQLRVEKASRDGNTVSYLKLV
                                     ....:: :.::... ...:: :.. ::::.
CCDS33 AVASSTDGSIHTDSVDGTPDPQRTKAAIAHLQQKILKLTEQIKIAQTARDDNVAEYLKLA
        210       220       230       240       250       260      

               90       100       110       120                    
pF1KE0 SKADRHQVPHIQQAFEKVNQRASATIAQIEHRLHQCHQQLQELEEGCRP-----------
       ..::..:. .:.:.::: ::... :: :....:.. :..:.:.:..  :           
CCDS33 NSADKQQAARIKQVFEKKNQKSAQTILQLQKKLEHYHRKLREVEQNGIPRQPKDVFRDMH
        270       280       290       300       310       320      

                   130          140       150               160    
pF1KE0 --------------EGLLLMAE---SDPANCEPPSEKALLSEPPEP--------GGEDGP
                     ::..  ..   :. ..    .  :..:.: :         :. :. 
CCDS33 QGLKDVGAKVTGFSEGVVDSVKGGFSSFSQATHSAAGAVVSKPREIASLIRNKFGSADNI
        330       340       350       360       370       380      

                   170       180                      190          
pF1KE0 VNLPH---------ASRPFILESRFQSLQQ---------------GTCLETEDVA-----
        ::           :.. . . : :::  .               :.   :  .:     
CCDS33 PNLKDSLEEGQVDDAGKALGVISNFQSSPKYGSEEDCSSATSGSVGANSTTGGIAVGASS
        390       400       410       420       430       440      

         200             210       220       230       240         
pF1KE0 QQQNLLLQKVKA------ELEEAKRFHISLQESYHSLKERSLTDLQLLLESLQEEKCRQA
       .. : : .. ..      :..: .. .  :.::...:::.   : .:....::::. :  
CCDS33 SKTNTLDMQSSGFDALLHEIQEIRETQARLEESFETLKEHYQRDYSLIMQTLQEERYRCE
        450       460       470       480       490       500      

     250       260       270       280       290       300         
pF1KE0 LMEEQVNGRLQGQLNEIYNLKHNLACSEERMAYLSYERAKEIWEITETFKSRISKLEMLQ
        .:::.:   . . ::: :::..::  ::..:: :::::..: :  :. ..::::.:. :
CCDS33 RLEEQLNDLTELHQNEILNLKQELASMEEKIAYQSYERARDIQEALEACQTRISKMELQQ
        510       520       530       540       550       560      

     310          320       330       340       350       360      
pF1KE0 Q---VTQLEAAEHLQSRPPQMLFKFLSPRLSLATVLLVFVSTLCACPSSLISSRLCTCTM
       :   :.:::. :.  .:  ..: :...  :.. .::::::::.  :   :...:  : . 
CCDS33 QQQQVVQLEGLENATAR--NLLGKLINILLAVMAVLLVFVSTVANCVVPLMKTRNRTFST
        570       580         590       600       610       620    

        370       380       390       400       410
pF1KE0 LMLIGLGVLAWQRWRAIPATDWQEWVPSRCRLYSKDSGPPADGP
       :.:. . .. :..: :.                           
CCDS33 LFLVVFIAFLWKHWDALFSYVERFFSSPR               
          630       640       650                  

>>CCDS73010.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1               (469 aa)
 initn: 668 init1: 255 opt: 376  Z-score: 344.8  bits: 72.9 E(32554): 7e-13
Smith-Waterman score: 470; 28.0% identity (57.8% similar) in 422 aa overlap (49-394:50-469)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KE0 VPSCRSLSSSEDGPSGPSSLADGGLAHNLQDSVRHRILYLSEQLRVEKASRDGNTVSYLK
                                     : ....:: ..::...:. .:: :.. :::
CCDS73 LPAGHGDTDGPISLDVPDGAPDPQRTKAAIDHLHQKILKITEQIKIEQEARDDNVAEYLK
      20        30        40        50        60        70         

       80        90       100       110       120          130     
pF1KE0 LVSKADRHQVPHIQQAFEKVNQRASATIAQIEHRLHQCHQQLQELEEGC---RPE-----
       :...::..:: .:.:.::: ::... ::::....:.. ...:.:.:..    .:.     
CCDS73 LANNADKQQVSRIKQVFEKKNQKSAQTIAQLHKKLEHYRRRLKEIEQNGPSRQPKDVLRD
      80        90       100       110       120       130         

                                   140       150       160         
pF1KE0 ---------------------GLLLMAESDPANCEPPSEKALLSEPPEPGG---------
                            :..  .... ..    .. :..:.: : ..         
CCDS73 MQQGLKDVGANVRAGISGFGGGVVEGVKGSLSGLSQATHTAVVSKPREFASLIRNKFGSA
     140       150       160       170       180       190         

                            170       180       190                
pF1KE0 ----------EDGPVNLP----HASRPFILESRFQSLQQGTCLETEDV------------
                 :::: .       .:  ..   .. : .. .   . ..            
CCDS73 DNIAHLKDPLEDGPPEEAARALSGSATLVSSPKYGSDDECSSASASSAGAGSNSGAGPGG
     200       210       220       230       240       250         

             200             210       220       230       240     
pF1KE0 ---AQQQNLL------LQKVKAELEEAKRFHISLQESYHSLKERSLTDLQLLLESLQEEK
          . ..: :      :. .  ::.: :. .  :..:...:: .   :   . . ::::.
CCDS73 ALGSPKSNALYGAPGNLDALLEELREIKEGQSHLEDSMEDLKTQLQRDYTYMTQCLQEER
     260       270       280       290       300       310         

         250       260       270       280       290       300     
pF1KE0 CRQALMEEQVNGRLQGQLNEIYNLKHNLACSEERMAYLSYERAKEIWEITETFKSRISKL
        :   .:::.:   . . ::. :::..::  ::..:: :::::..: : .:.  .:..::
CCDS73 YRYERLEEQLNDLTELHQNEMTNLKQELASMEEKVAYQSYERARDIQEAVESCLTRVTKL
     320       330       340       350       360       370         

         310          320       330       340       350       360  
pF1KE0 EMLQQ---VTQLEAAEHLQSRPPQMLFKFLSPRLSLATVLLVFVSTLCACPSSLISSRLC
       :. ::   :.:::..:. ..:   .: ::..  :.: .::::::::.    . :...:: 
CCDS73 ELQQQQQQVVQLEGVENANAR--ALLGKFINVILALMAVLLVFVSTIANFITPLMKTRLR
     380       390       400         410       420       430       

            370       380       390       400       410
pF1KE0 TCTMLMLIGLGVLAWQRWRAIPATDWQEWVPSRCRLYSKDSGPPADGP
         .  .:. .  : :..: ..     .  .::                
CCDS73 ITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLTYLLEHVLLPS                
       440       450       460                         

>>CCDS76257.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1               (484 aa)
 initn: 637 init1: 255 opt: 376  Z-score: 344.6  bits: 72.9 E(32554): 7.2e-13
Smith-Waterman score: 470; 28.0% identity (57.8% similar) in 422 aa overlap (49-394:65-484)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KE0 VPSCRSLSSSEDGPSGPSSLADGGLAHNLQDSVRHRILYLSEQLRVEKASRDGNTVSYLK
                                     : ....:: ..::...:. .:: :.. :::
CCDS76 LPAGHGDTDGPISLDVPDGAPDPQRTKAAIDHLHQKILKITEQIKIEQEARDDNVAEYLK
           40        50        60        70        80        90    

       80        90       100       110       120          130     
pF1KE0 LVSKADRHQVPHIQQAFEKVNQRASATIAQIEHRLHQCHQQLQELEEGC---RPE-----
       :...::..:: .:.:.::: ::... ::::....:.. ...:.:.:..    .:.     
CCDS76 LANNADKQQVSRIKQVFEKKNQKSAQTIAQLHKKLEHYRRRLKEIEQNGPSRQPKDVLRD
          100       110       120       130       140       150    

                                   140       150       160         
pF1KE0 ---------------------GLLLMAESDPANCEPPSEKALLSEPPEPGG---------
                            :..  .... ..    .. :..:.: : ..         
CCDS76 MQQGLKDVGANVRAGISGFGGGVVEGVKGSLSGLSQATHTAVVSKPREFASLIRNKFGSA
          160       170       180       190       200       210    

                            170       180       190                
pF1KE0 ----------EDGPVNLP----HASRPFILESRFQSLQQGTCLETEDV------------
                 :::: .       .:  ..   .. : .. .   . ..            
CCDS76 DNIAHLKDPLEDGPPEEAARALSGSATLVSSPKYGSDDECSSASASSAGAGSNSGAGPGG
          220       230       240       250       260       270    

             200             210       220       230       240     
pF1KE0 ---AQQQNLL------LQKVKAELEEAKRFHISLQESYHSLKERSLTDLQLLLESLQEEK
          . ..: :      :. .  ::.: :. .  :..:...:: .   :   . . ::::.
CCDS76 ALGSPKSNALYGAPGNLDALLEELREIKEGQSHLEDSMEDLKTQLQRDYTYMTQCLQEER
          280       290       300       310       320       330    

         250       260       270       280       290       300     
pF1KE0 CRQALMEEQVNGRLQGQLNEIYNLKHNLACSEERMAYLSYERAKEIWEITETFKSRISKL
        :   .:::.:   . . ::. :::..::  ::..:: :::::..: : .:.  .:..::
CCDS76 YRYERLEEQLNDLTELHQNEMTNLKQELASMEEKVAYQSYERARDIQEAVESCLTRVTKL
          340       350       360       370       380       390    

         310          320       330       340       350       360  
pF1KE0 EMLQQ---VTQLEAAEHLQSRPPQMLFKFLSPRLSLATVLLVFVSTLCACPSSLISSRLC
       :. ::   :.:::..:. ..:   .: ::..  :.: .::::::::.    . :...:: 
CCDS76 ELQQQQQQVVQLEGVENANAR--ALLGKFINVILALMAVLLVFVSTIANFITPLMKTRLR
          400       410         420       430       440       450  

            370       380       390       400       410
pF1KE0 TCTMLMLIGLGVLAWQRWRAIPATDWQEWVPSRCRLYSKDSGPPADGP
         .  .:. .  : :..: ..     .  .::                
CCDS76 ITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLTYLLEHVLLPS                
            460       470       480                    

>>CCDS81418.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1               (514 aa)
 initn: 668 init1: 255 opt: 376  Z-score: 344.2  bits: 73.0 E(32554): 7.5e-13
Smith-Waterman score: 470; 28.0% identity (57.8% similar) in 422 aa overlap (49-394:95-514)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KE0 VPSCRSLSSSEDGPSGPSSLADGGLAHNLQDSVRHRILYLSEQLRVEKASRDGNTVSYLK
                                     : ....:: ..::...:. .:: :.. :::
CCDS81 LPAGHGDTDGPISLDVPDGAPDPQRTKAAIDHLHQKILKITEQIKIEQEARDDNVAEYLK
           70        80        90       100       110       120    

       80        90       100       110       120          130     
pF1KE0 LVSKADRHQVPHIQQAFEKVNQRASATIAQIEHRLHQCHQQLQELEEGC---RPE-----
       :...::..:: .:.:.::: ::... ::::....:.. ...:.:.:..    .:.     
CCDS81 LANNADKQQVSRIKQVFEKKNQKSAQTIAQLHKKLEHYRRRLKEIEQNGPSRQPKDVLRD
          130       140       150       160       170       180    

                                   140       150       160         
pF1KE0 ---------------------GLLLMAESDPANCEPPSEKALLSEPPEPGG---------
                            :..  .... ..    .. :..:.: : ..         
CCDS81 MQQGLKDVGANVRAGISGFGGGVVEGVKGSLSGLSQATHTAVVSKPREFASLIRNKFGSA
          190       200       210       220       230       240    

                            170       180       190                
pF1KE0 ----------EDGPVNLP----HASRPFILESRFQSLQQGTCLETEDV------------
                 :::: .       .:  ..   .. : .. .   . ..            
CCDS81 DNIAHLKDPLEDGPPEEAARALSGSATLVSSPKYGSDDECSSASASSAGAGSNSGAGPGG
          250       260       270       280       290       300    

             200             210       220       230       240     
pF1KE0 ---AQQQNLL------LQKVKAELEEAKRFHISLQESYHSLKERSLTDLQLLLESLQEEK
          . ..: :      :. .  ::.: :. .  :..:...:: .   :   . . ::::.
CCDS81 ALGSPKSNALYGAPGNLDALLEELREIKEGQSHLEDSMEDLKTQLQRDYTYMTQCLQEER
          310       320       330       340       350       360    

         250       260       270       280       290       300     
pF1KE0 CRQALMEEQVNGRLQGQLNEIYNLKHNLACSEERMAYLSYERAKEIWEITETFKSRISKL
        :   .:::.:   . . ::. :::..::  ::..:: :::::..: : .:.  .:..::
CCDS81 YRYERLEEQLNDLTELHQNEMTNLKQELASMEEKVAYQSYERARDIQEAVESCLTRVTKL
          370       380       390       400       410       420    

         310          320       330       340       350       360  
pF1KE0 EMLQQ---VTQLEAAEHLQSRPPQMLFKFLSPRLSLATVLLVFVSTLCACPSSLISSRLC
       :. ::   :.:::..:. ..:   .: ::..  :.: .::::::::.    . :...:: 
CCDS81 ELQQQQQQVVQLEGVENANAR--ALLGKFINVILALMAVLLVFVSTIANFITPLMKTRLR
          430       440         450       460       470       480  

            370       380       390       400       410
pF1KE0 TCTMLMLIGLGVLAWQRWRAIPATDWQEWVPSRCRLYSKDSGPPADGP
         .  .:. .  : :..: ..     .  .::                
CCDS81 ITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLTYLLEHVLLPS                
            490       500       510                    

>>CCDS55676.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1               (631 aa)
 initn: 663 init1: 255 opt: 376  Z-score: 342.9  bits: 73.0 E(32554): 8.9e-13
Smith-Waterman score: 470; 28.0% identity (57.8% similar) in 422 aa overlap (49-394:212-631)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KE0 VPSCRSLSSSEDGPSGPSSLADGGLAHNLQDSVRHRILYLSEQLRVEKASRDGNTVSYLK
                                     : ....:: ..::...:. .:: :.. :::
CCDS55 LPAGHGDTDGPISLDVPDGAPDPQRTKAAIDHLHQKILKITEQIKIEQEARDDNVAEYLK
             190       200       210       220       230       240 

       80        90       100       110       120          130     
pF1KE0 LVSKADRHQVPHIQQAFEKVNQRASATIAQIEHRLHQCHQQLQELEEGC---RPE-----
       :...::..:: .:.:.::: ::... ::::....:.. ...:.:.:..    .:.     
CCDS55 LANNADKQQVSRIKQVFEKKNQKSAQTIAQLHKKLEHYRRRLKEIEQNGPSRQPKDVLRD
             250       260       270       280       290       300 

                                   140       150       160         
pF1KE0 ---------------------GLLLMAESDPANCEPPSEKALLSEPPEPGG---------
                            :..  .... ..    .. :..:.: : ..         
CCDS55 MQQGLKDVGANVRAGISGFGGGVVEGVKGSLSGLSQATHTAVVSKPREFASLIRNKFGSA
             310       320       330       340       350       360 

                            170       180       190                
pF1KE0 ----------EDGPVNLP----HASRPFILESRFQSLQQGTCLETEDV------------
                 :::: .       .:  ..   .. : .. .   . ..            
CCDS55 DNIAHLKDPLEDGPPEEAARALSGSATLVSSPKYGSDDECSSASASSAGAGSNSGAGPGG
             370       380       390       400       410       420 

             200             210       220       230       240     
pF1KE0 ---AQQQNLL------LQKVKAELEEAKRFHISLQESYHSLKERSLTDLQLLLESLQEEK
          . ..: :      :. .  ::.: :. .  :..:...:: .   :   . . ::::.
CCDS55 ALGSPKSNALYGAPGNLDALLEELREIKEGQSHLEDSMEDLKTQLQRDYTYMTQCLQEER
             430       440       450       460       470       480 

         250       260       270       280       290       300     
pF1KE0 CRQALMEEQVNGRLQGQLNEIYNLKHNLACSEERMAYLSYERAKEIWEITETFKSRISKL
        :   .:::.:   . . ::. :::..::  ::..:: :::::..: : .:.  .:..::
CCDS55 YRYERLEEQLNDLTELHQNEMTNLKQELASMEEKVAYQSYERARDIQEAVESCLTRVTKL
             490       500       510       520       530       540 

         310          320       330       340       350       360  
pF1KE0 EMLQQ---VTQLEAAEHLQSRPPQMLFKFLSPRLSLATVLLVFVSTLCACPSSLISSRLC
       :. ::   :.:::..:. ..:   .: ::..  :.: .::::::::.    . :...:: 
CCDS55 ELQQQQQQVVQLEGVENANAR--ALLGKFINVILALMAVLLVFVSTIANFITPLMKTRLR
             550       560         570       580       590         

            370       380       390       400       410
pF1KE0 TCTMLMLIGLGVLAWQRWRAIPATDWQEWVPSRCRLYSKDSGPPADGP
         .  .:. .  : :..: ..     .  .::                
CCDS55 ITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLTYLLEHVLLPS                
     600       610       620       630                 

>>CCDS30984.1 TMCC2 gene_id:9911|Hs108|chr1               (709 aa)
 initn: 663 init1: 255 opt: 376  Z-score: 342.2  bits: 73.0 E(32554): 9.7e-13
Smith-Waterman score: 470; 28.0% identity (57.8% similar) in 422 aa overlap (49-394:290-709)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KE0 VPSCRSLSSSEDGPSGPSSLADGGLAHNLQDSVRHRILYLSEQLRVEKASRDGNTVSYLK
                                     : ....:: ..::...:. .:: :.. :::
CCDS30 LPAGHGDTDGPISLDVPDGAPDPQRTKAAIDHLHQKILKITEQIKIEQEARDDNVAEYLK
     260       270       280       290       300       310         

       80        90       100       110       120          130     
pF1KE0 LVSKADRHQVPHIQQAFEKVNQRASATIAQIEHRLHQCHQQLQELEEGC---RPE-----
       :...::..:: .:.:.::: ::... ::::....:.. ...:.:.:..    .:.     
CCDS30 LANNADKQQVSRIKQVFEKKNQKSAQTIAQLHKKLEHYRRRLKEIEQNGPSRQPKDVLRD
     320       330       340       350       360       370         

                                   140       150       160         
pF1KE0 ---------------------GLLLMAESDPANCEPPSEKALLSEPPEPGG---------
                            :..  .... ..    .. :..:.: : ..         
CCDS30 MQQGLKDVGANVRAGISGFGGGVVEGVKGSLSGLSQATHTAVVSKPREFASLIRNKFGSA
     380       390       400       410       420       430         

                            170       180       190                
pF1KE0 ----------EDGPVNLP----HASRPFILESRFQSLQQGTCLETEDV------------
                 :::: .       .:  ..   .. : .. .   . ..            
CCDS30 DNIAHLKDPLEDGPPEEAARALSGSATLVSSPKYGSDDECSSASASSAGAGSNSGAGPGG
     440       450       460       470       480       490         

             200             210       220       230       240     
pF1KE0 ---AQQQNLL------LQKVKAELEEAKRFHISLQESYHSLKERSLTDLQLLLESLQEEK
          . ..: :      :. .  ::.: :. .  :..:...:: .   :   . . ::::.
CCDS30 ALGSPKSNALYGAPGNLDALLEELREIKEGQSHLEDSMEDLKTQLQRDYTYMTQCLQEER
     500       510       520       530       540       550         

         250       260       270       280       290       300     
pF1KE0 CRQALMEEQVNGRLQGQLNEIYNLKHNLACSEERMAYLSYERAKEIWEITETFKSRISKL
        :   .:::.:   . . ::. :::..::  ::..:: :::::..: : .:.  .:..::
CCDS30 YRYERLEEQLNDLTELHQNEMTNLKQELASMEEKVAYQSYERARDIQEAVESCLTRVTKL
     560       570       580       590       600       610         

         310          320       330       340       350       360  
pF1KE0 EMLQQ---VTQLEAAEHLQSRPPQMLFKFLSPRLSLATVLLVFVSTLCACPSSLISSRLC
       :. ::   :.:::..:. ..:   .: ::..  :.: .::::::::.    . :...:: 
CCDS30 ELQQQQQQVVQLEGVENANAR--ALLGKFINVILALMAVLLVFVSTIANFITPLMKTRLR
     620       630       640         650       660       670       

            370       380       390       400       410
pF1KE0 TCTMLMLIGLGVLAWQRWRAIPATDWQEWVPSRCRLYSKDSGPPADGP
         .  .:. .  : :..: ..     .  .::                
CCDS30 ITSTTLLVLVLFLLWKHWDSLTYLLEHVLLPS                
       680       690       700                         




410 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 21:40:08 2016 done: Thu Nov  3 21:40:09 2016
 Total Scan time:  3.540 Total Display time:  0.040

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com